sp|Q9XID5|PSI1_ARATH ----> Protein PSK SIMULATOR 1


Intron 1 GTGCAGATTT ... AGTAACCAAG

SampleRetention score (%)Exon junction reads5'ss reads3'ss reads
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A224.86652221
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A828.42341512
A932.38714127
A1025.82793619



>TRINITY_DN118842_c1_g7_i1 from sample A2 / Example spliced isoform
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CAAGCGACTCTGGAGCGATCAAATCTCCTGGGAGGACAGAGGAGTATCGCACTTACAATTCTTTGGCTTTGCTGCTCATGCTTTTCGTTGCTGGCTTGTTGTTGGATACATTATTGCAGCACTTGTTGTAATAATAATCACAGTAATAATAGAAACTAGGTAGATGGAGCAAATACGGAAAAGGATTTCCACGAGGCGAC
GGAGGGACAAATCCAAGCAGATCACCGCAACTAGCATGGTTTCAGAAGTGGGATCACTTTTAGGGAGAGCTGGCACAGTGGGATTTGGCAAAGCAGTCGAGGTGCTGGATACACTTGGCAGTAGTATGACAAGCTTAAATCCTAGTAGTGGATTTGCATCTGGAGTGACGTCCAAAGGCAACAAGATAGATATTTTGGCA
TTTGAAGTTGCAAATACTATTGTTAAGGGTTCCAACCTTAAGCAATCACTTTCTGAAGAAAGTATAAAGTTCTTGATGGAAGAGGTTCTTCGTTCAGAAGGTGTCCAACGGCTTGTGTCTAATGACATGGATGAGTTATTGAAAATTGCAGCAGCAGACAAAAGGAATGAGTTGAAGATTTTTGCAGGGGAGGTGGTCCG
ATTTGGAAACCACTGTAAAGATCCTCAATGGCATCAATTGGACCGCTATTTTGAGAAATTGGGTACAGAGCTTCCTGTGCAAAAGCAATCAAAGGGAGAGGCAGAAGCAGTGATGCAACATTTGATGACATTGGCACAAAATACAGCTGAATTATACCATGAATTACATGCCTTGGATAGATTTGAACAAGACTATCGAC
GCAAGCTTCAGGAGGAAGAATCATTAAATGTACCTCAGAGAGGAGACAGTGTTACAATTTTAAAGAATGAATTGAAGAGCCAGAGAAAGCATGTGAGAAATTTGAAGAAGAAATCACTTTGGTCTAAATTTCTGGAAGAGGTCATGGAGAAACTTGTAGATATTGTATATTTCCTACATCAAGAGATCCAGGAGAACTTT
AAGGATGCTGATTCGGAAAGTGAAAAAATTCTCAACAAAAAGAATGCACAGGGAAGTCCTCAGAGGCTAGGTCCTGCTGGTCTTTCCTTGCACTACGCAAATATTGTCAGCCAAATTGATAGTCTTGTTTCACGTCCAAGTTCTGTTCCTCCCAACACCAGGGATACACTGTATCGAGGATTGCCTCCAAGTATGAAGTC
AGCTTTACGATCCAAGCTACAATCATATCCTGCCAAAGATTTTACTGTCCCACAGATCAAAGCAGAGATGGAGAAAATTTTAGCGTGGCTTGTTCCAGTTGCTACCAATACAACCAAAGCACATCATGGGTTTGGATGGGTTGGAGAGTGGGCAAACACAGGATCTGCCTTGGATCGAAGGTTACCTGGACACAACGAGT
TGACACTCGTTCAAACTTTTCACTATGCAGAGAAGGAGAAGACGGAATTTTACATTTTTGAACTGGTTGTGTGGCTTCATCATCTTGTGAGCCGGGCCAAAAACAGCCTCAATGGCAACAAGTCTCCAATTAAATCACCTGTTCGTTCTCCAGTAAAAAAGACTGCAACTCTCTCAGTGACAACTCCAGATAAGCCAAGT
CCGACAGGAAATGGACATGATAAACCTCTTCTCGAGCTTTCTCAGGCAGACAAAGATATGTTAAAAGAAGTAAATTTCAGAAAATTGACACCAGGGATAAGTAAAAGTCAAGAGTTTGATACAGCTAAGTTGAGATCTGCTGATGAGTCTTCTTGTAAGCTGATCAAGAGCAATAGTCACTCTCCCACTACCGACACGAA
GAATGAGTTTAATGGACTGAGGCGACATACAACACTACCAAACATAGACTTTGACATCGACAGGACTAAAGCTCTAGATGTGATGGATAGGGTTGATAATCTTAGCCTTTTGTAACAGTTATTGTTCTCTTGTTCACATTATGTCTTTTCTACAAGTTAAGATAGATTATTTTCATATTTAGTTAAAATTGTATGCTATG
TCTCTTCTTGCATTATGCGTAGGCTTTCATGTTAAAGTGTTATGTAGTATCGAATATGTAAGAGTTCAATTTTTTGGTTCCTGTATATACACACACATTAGCCAAAGATGGGCTGCATGTGGAATGTATTCAGTATTTTGCAAGATAAAATGGAAGGTTGAAGC


>TRINITY_DN118842_c1_g7_i3 from sample A2 / Example unspliced isoform:
CGTTGGGGACCCTCACCCCGGGGGTGTTTTGGTTCTAAGAGTCAAAGGAAAGAAGTACAGTCGTTGCGGGGCTGCTACGGCAAGCGCCGCCGATCATAAGGTCGGGAAGAGGAGAGAGAAAGTGTGAGTGGTTATTACGATGGATATTCATTGCATTAACCCCGGAGGCGGGTTACAATTGAACCGCGGTCAGCTTTGAC
CAAGCGACTCTGGAGCGATCAAATCTCCTGGGAGGACAGAGGAGTATCGCACTTACAATTCTTTGGCTTTGCTGCTCATGCTTTTCGTTGCTGGCTTGTTGTTGGATACATTATTGCAGCACTTGTTGTAATAATAATCACAGTAATAATAGAAACTAGGTAGATGGAGCAAATACGGAAAAGGATTTCCACGAGGCGAC
GGAGGGACAAATCCAAGCAGATCACCGCAACTAGCATGgtgcagatttgtttttccagtttctgaatttcgttttctgatgaacaattaattaaggtttcacgttctttgtttaatttcgctttattttaatgtctaaatcccgctcccctgtaaattgttcctaaaaccctacgccactgtgattataaacaaataaat
tgaataaataaaagaaatagcttggactctttatttgttttagctaaagaattctggtttctttgctatgcgatgcgatatgacacgatgatttcaaaagccttcaaggtttgagaagagagttttgtgttaatccttggatttttgtgggcgtgccttcttttgatcacagtttgattctatgccctctcgactgcttt
gattacttccttgtgttgtttccagtgaaattggttcatccttcaatatcttatcaaacttcacggggcaaatcaacacatttgtctaaattgcttgtttttctattttaattgaaatcgagtggaagaatgaaatacaaggctttggaatgatctatctatttactgatgtacctcgtcaaaatattcaaaacaactga
gggcacacaagatattgttgaatcttttttgaaattccaatcaacatgagaggttgaggaagttttgtatatttcccaaaagtcacacaggatttccaggttcaatcacggcacatagtttaatgaaaagattaagcgttggacacgagagaggcgtaaaaagtgtttcttcggtttgtgtgtagttattttcttccaaa
ttgagtgaaagtgacagggacatgccgttgcatttggtctatgcatgaaaggcgaatgcatcctgatgatttaaaattgttgaaagattacagcccagtgcattgatattgattgacactgccccagcttcatgatgaaaataatttgaaatctggctattggggttctttactagtagtacatgattgcaaagggaaga
ctttatttttgtattggataatgcccatgcccacgaaataagcaaagagaagatgcttttgcagatgaatactgtgagagctcagttatatgtcaaaattgaaaagagaaataaaaaatgggcatgacacccagcatttcagtcaagagctcatgtacacttctttcatcatctccatccattggctcatttaccggctt
tattttcttgtggctttctctactttttgccttgtatcttcaaagcaaagtacaaacagaattcaactgcagattttccgtcctcatcttctcatctatattccatcttttattttattgagcgctccatttatgggtaattttaggttagcattatcccagctttgtcacaatcttaaaatctcattggcaaataaaga
gtaaggtgatttgtacatcacataccgacctcagcaacgaattgggtatgtaacaggctgcaaaaataattcttgacagaatgggggcaatttgttctaggggatcaactattgacagctcccctgatagcaactcaattgacatgaatatgcatgaccactctgcatttactccattaccaggagcaggggttcaattg
actgggtttccatcaaaagttccaagcaatattacatctcctatgaatatggagaaaatggagaaagagctgcaagagcagaattcattttcatatcaagagatgttagtttatgagaacatgcattctaggaatgcccaaggagaaccagagcagttatcaagggtcccttcaagtaagtccaacactgcaaagtcaaa
gcctatggcagtgaccaaaataggagtaaccaagGTTTCAGAAGTGGGATCACTTTTAGGGAGAGCTGGCACAGTGGGATTTGGCAAAGCAGTCGAGGTGCTGGATACACTTGGCAGTAGTATGACAAGCTTAAATCCTAGTAGTGGATTTGCATCTGGAGTGACGTCCAAAGGCAACAAGATAGATATTTTGGCATTTG
AAGTTGCAAATACTATTGTTAAGGGTTCCAACCTTAAGCAATCACTTTCTGAAGAAAGTATAAAGTTCTTGATGGAAGAGGTTCTTCGTTCAGAAGGTGTCCAACGGCTTGTGTCTAATGACATGGATGAGTTATTGAAAATTGCAGCAGCAGACAAAAGGAATGAGTTGAAGATTTTTGCAGGGGAGGTGGTCCGATTT
GGAAACCACTGTAAAGATCCTCAATGGCATCAATTGGACCGCTATTTTGAGAAATTGGGTACAGAGCTTCCTGTGCAAAAGCAATCAAAGGGAGAGGCAGAAGCAGTGATGCAACATTTGATGACATTGGCACAAAATACAGCTGAATTATACCATGAATTACATGCCTTGGATAGATTTGAACAAGACTATCGACGCAA
GCTTCAGGAGGAAGAATCATTAAATGTACCTCAGAGAGGAGACAGTGTTACAATTTTAAAGAATGAATTGAAGAGCCAGAGAAAGCATGTGAGAAATTTGAAGAAGAAATCACTTTGGTCTAAATTTCTGGAAGAGGTCATGGAGAAACTTGTAGATATTGTATATTTCCTACATCAAGAGATCCAGGAGAACTTTAAGG
ATGCTGATTCGGAAAGTGAAAAAATTCTCAACAAAAAGAATGCACAGGGAAGTCCTCAGAGGCTAGGTCCTGCTGGTCTTTCCTTGCACTACGCAAATATTGTCAGCCAAATTGATAGTCTTGTTTCACGTCCAAGTTCTGTTCCTCCCAACACCAGGGATACACTGTATCGAGGATTGCCTCCAAGTATGAAGTCAGCT
TTACGATCCAAGCTACAATCATATCCTGCCAAAGATTTTACTGTCCCACAGATCAAAGCAGAGATGGAGAAAATTTTAGCGTGGCTTGTTCCAGTTGCTACCAATACAACCAAAGCACATCATGGGTTTGGATGGGTTGGAGAGTGGGCAAACACAGGATCTGCCTTGGATCGAAGGTTACCTGGACACAACGAGTTGAC
ACTCGTTCAAACTTTTCACTATGCAGAGAAGGAGAAGACGGAATTTTACATTTTTGAACTGGTTGTGTGGCTTCATCATCTTGTGAGCCGGGCCAAAAACAGCCTCAATGGCAACAAGTCTCCAATTAAATCACCTGTTCGTTCTCCAGTAAAAAAGACTGCAACTCTCTCAGTGACAACTCCAGATAAGCCAAGTCCGA
CAGGAAATGGACATGATAAACCTCTTCTCGAGCTTTCTCAGGCAGACAAAGATATGTTAAAAGAAGTAAATTTCAGAAAATTGACACCAGGGATAAGTAAAAGTCAAGAGTTTGATACAGCTAAGTTGAGATCTGCTGATGAGTCTTCTTGTAAGCTGATCAAGAGCAATAGTCACTCTCCCACTACCGACACGAAGAAT
GAGTTTAATGGACTGAGGCGACATACAACACTACCAAACATAGACTTTGACATCGACAGGACTAAAGCTCTAGATGTGATGGATAGGGTTGATAATCTTAGCCTTTTGTAACAGTTATTGTTCTCTTGTTCACATTATGTCTTTTCTACAAGTTAAGATAGATTATTTTCATATTTAGTTAAAATTGTATGCTATGTCTC
TTCTTGCATTATGCGTAGGCTTTCATGTTAAAGTGTTATGTAGTATCGAATATGTAAGAGTTCAATTTTTTGGTTCCTGTATATACACACACATTAGCCAAAGATGGGCTGCATGTGGAATGTATTCAGTATTTTGCAAGATAAAATGGAAGGTTGAAGC



Intron 2 GTGCAGATTT ... ATTAATTAAG

SampleRetention score (%)Exon junction reads5'ss reads3'ss reads
A119.51661715
A220.73652014
A320.63751623
A420.75631320
A527.87442311
A630.9529179
A722.12882525
A827.66341511
A930.73713429
A1020.6792516



>TRINITY_DN42285_c1_g2_i4 from sample A9 / Example spliced isoform
CTTTGTATACGCATTTTGGCATATTCTTGTCTACCTAGGTAGTGTTGTGTGTTGACCCAATTATGCTGCTGGCCTTCCCGTTCCGACCCGAACTCCTCCCGACATTAAATGCTTGGCTTGCCTTCCCTTTCCGTTCCGACCCTAACTCTTTACGACATTGACATTAAATGTGCATGTCCGCGTTTTCCCCCAAAGGTTCT
TTACTACTGGGCTGGACTGGACTGAATTGAATATAATAGTTTCATTTGACGGATTCTTCGTTCCATCCGCTATTTTGTCGCGTGAACCGCCGCAATTGGGCCCCGGGCGACGCAATTTAGATCACGTGATGATGATTACGATGGCATTACATTTTAAATTGAAACTGGCAATTAGGTATAACAGTAACAGTAACAGTAAT
AGTGTGTAGACGACTAGACTTGGCGTTGGGGACCCTCACCCCGGGGGTGTTTTGGTTCTAAGAGTCAAAGGAAAGAAGTACAGTCGTTGCGGGGCTGCTACGGCAAGCGCCGCCGATCATAAGGTCGGGAAGAGGAGAGAGAAAGTGTGAGTGGTTATTACGATGGATATTCATTGCATTAACCCCGGAGGCGGGTTACA
ATTGAACCGCGGTCAGCTTTGACCAAGCGACTCTGGAGCGATCAAATCTCCTGGGAGGACAGAGGAGTATCGCACTTACAATTCTTTGGCTTTGCTGCTCATGCTTTTCGTTGCTGGCTTGTTGTTGGATACATTATTGCAGCACTTGTTGTAATAATAATCACAGTAATAATAGAAACTAGGTAGATGGAGCAAATACG
GAAAAGGATTTCCACGAGGCGACGGAGGGACAAATCCAAGCAGATCACCGCAACTAGCATGGTTTCAGAAGTGGGATCACTTTTAGGGAGAGCTGGCACAGTGGGATTTGGCAAAGCAGTCGAGGTGCTGGATACACTTGGCAGTAGTATGACAAGCTTAAATCCTAGTAGTGGATTTGCATCTGGAGTGACGTCCAAAG
GCAACAAGATAGATATTTTGGCATTTGAAGTTGCAAATACTATTGTTAAGGGTTCCAACCTTAAGCAATCACTTTCTGAAGAAAGTATAAAGTTCTTGATGGAAGAGGTTCTTCGTTCAGAAGGTGTCCAACGGCTTGTGTCTAATGACATGGATGAGTTATTGAAAATTGCAGCAGCAGACAAAAGGAATGAGTTGAAG
ATTTTTGCAGGGGAGGTGGTCCGATTTGGAAACCACTGTAAAGATCCTCAATGGCATCAATTGGACCGCTATTTTGAGAAATTGGGTACAGAGCTTCCTGTGCAAAAGCAATCAAAGGGAGAGGCAGAAGCAGTGATGCAACATTTGATGACATTGGCACAAAATACAGCTGAATTATACCATGAATTACATGCCTTGGA
TAGATTTGAACAAGACTATCGACGCAAGCTTCAGGAGGAAGAATCATTAAATGTACCTCAGAGAGGAGACAGTGTTACAATTTTAAAGAATGAATTGAAGAGCCAGAGAAAGCATGTGAGAAATTTGAAGAAGAAATCACTTTGGTCTAAATTTCTGGAAGAGGTCATGGAGAAACTTGTAGATATTGTATATTTCCTAC
ATCAAGAGATCCAGGAGAACTTTAAGGATGCTGATTCGGAAAGTGAAAAAATTCTCAACAAAAAGAATGCACAGGGAAGTCCTCAGAGGCTAGGTCCTGCTGGTCTTTCCTTGCACTACGCAAATATTGTCAGCCAAATTGATAGTCTTGTTTCACGTCCAAGTTCTGTTCCTCCCAACACCAGGGATACACTGTATCGA
GGATTGCCTCCAAGTATGAAGTCAGCTTTACGATCCAAGCTACAATCATATCCTGCCAAAGATTTTACTGTCCCACAGATCAAAGCAGAGATGGAGAAAATTTTAGCGTGGCTTGTTCCAGTTGCTACCAATACAACCAAAGCACATCATGGGTTTGGATGGGTTGGAGAGTGGGCAAACACAGGATCTGCCTTGGATCG
AAGGTTACCTGGACACAACGAGTTGACACTCGTTCAAACTTTTCACTATGCAGAGAAGGAGAAGACGGAATTTTACATTTTTGAACTGGTTGTGTGGCTTCATCATCTTGTGAGCCGGGCCAAAAACAGCCTCAATGGCAACAAGTCTCCAATTAAATCACCTGTTCGTTCTCCAGTAAAAAAGACTGCAACTCTCTCAG
TGACAACTCCAGATAAGCCAAGTCCGACAGGAAATGGACATGATAAACCTCTTCTCGAGCTTTCTCAGGCAGACAAAGATATGTTAAAAGAAGTAAATTTCAGAAAATTGACACCAGGGATAAGTAAAAGTCAAGAGTTTGATACAGCTAAGTTGAGATCTGCTGATGAGTCTTCTTGTAAGCTGATCAAGAGCAATAGT
CACTCTCCCACTACCGACACGAAGAATGAGTTTAATGGACTGAGGCGACATACAACACTACCAAACATAGACTTTGACATCGACAGGACTAAAGCTCTAGATGTGATGGATAGGGTTGATAATCTTAGCCTTTTGTAACAGTTATTGTTCTCTTGTTCACATTATGTCTTTTCTACAAGTTAAGATAGATTATTTTCATA
TTTAGTTAAAATTGTATGCTATGTCTCTTCTTGCATTATGCGTAGGCTTTCATGTTAAAGTGTTATGTAGTATCGAATATGTAAGAGTTCAATTTTTTGGTTCCTGTATATACACACACATTAGCCAAAGATGGGCTGCATGTGGAATGTATTCAGTATTTTGCAAGATAAAATGGAAGGTTGAAGCATGCGTGTCATTT
AGCCGCACTATGCATTTTTTAGTAATTTTTTCC


>TRINITY_DN42285_c1_g2_i3 from sample A9 / Example unspliced isoform:
CTTTGTATACGCATTTTGGCATATTCTTGTCTACCTAGGTAGTGTTGTGTGTTGACCCAATTATGCTGCTGGCCTTCCCGTTCCGACCCGAACTCCTCCCGACATTAAATGCTTGGCTTGCCTTCCCTTTCCGTTCCGACCCTAACTCTTTACGACATTGACATTAAATGTGCATGTCCGCGTTTTCCCCCAAAGGTTCT
TTACTACTGGGCTGGACTGGACTGAATTGAATATAATAGTTTCATTTGACGGATTCTTCGTTCCATCCGCTATTTTGTCGCGTGAACCGCCGCAATTGGGCCCCGGGCGACGCAATTTAGATCACGTGATGATGATTACGATGGCATTACATTTTAAATTGAAACTGGCAATTAGGTATAACAGTAACAGTAACAGTAAT
AGTGTGTAGACGACTAGACTTGGCGTTGGGGACCCTCACCCCGGGGGTGTTTTGGTTCTAAGAGTCAAAGGAAAGAAGTACAGTCGTTGCGGGGCTGCTACGGCAAGCGCCGCCGATCATAAGGTCGGGAAGAGGAGAGAGAAAGTGTGAGTGGTTATTACGATGGATATTCATTGCATTAACCCCGGAGGCGGGTTACA
ATTGAACCGCGGTCAGCTTTGACCAAGCGACTCTGGAGCGATCAAATCTCCTGGGAGGACAGAGGAGTATCGCACTTACAATTCTTTGGCTTTGCTGCTCATGCTTTTCGTTGCTGGCTTGTTGTTGGATACATTATTGCAGCACTTGTTGTAATAATAATCACAGTAATAATAGAAACTAGGTAGATGGAGCAAATACG
GAAAAGGATTTCCACGAGGCGACGGAGGGACAAATCCAAGCAGATCACCGCAACTAGCATGgtgcagatttgtttttccagtttctgaatttcgttttctgatgaacaattaattaagGTTTCAGAAGTGGGATCACTTTTAGGGAGAGCTGGCACAGTGGGATTTGGCAAAGCAGTCGAGGTGCTGGATACACTTGGCA
GTAGTATGACAAGCTTAAATCCTAGTAGTGGATTTGCATCTGGAGTGACGTCCAAAGGCAACAAGATAGATATTTTGGCATTTGAAGTTGCAAATACTATTGTTAAGGGTTCCAACCTTAAGCAATCACTTTCTGAAGAAAGTATAAAGTTCTTGATGGAAGAGGTTCTTCGTTCAGAAGGTGTCCAACGGCTTGTGTCT
AATGACATGGATGAGTTATTGAAAATTGCAGCAGCAGACAAAAGGAATGAGTTGAAGATTTTTGCAGGGGAGGTGGTCCGATTTGGAAACCACTGTAAAGATCCTCAATGGCATCAATTGGACCGCTATTTTGAGAAATTGGGTACAGAGCTTCCTGTGCAAAAGCAATCAAAGGGAGAGGCAGAAGCAGTGATGCAACA
TTTGATGACATTGGCACAAAATACAGCTGAATTATACCATGAATTACATGCCTTGGATAGATTTGAACAAGACTATCGACGCAAGCTTCAGGAGGAAGAATCATTAAATGTACCTCAGAGAGGAGACAGTGTTACAATTTTAAAGAATGAATTGAAGAGCCAGAGAAAGCATGTGAGAAATTTGAAGAAGAAATCACTTT
GGTCTAAATTTCTGGAAGAGGTCATGGAGAAACTTGTAGATATTGTATATTTCCTACATCAAGAGATCCAGGAGAACTTTAAGGATGCTGATTCGGAAAGTGAAAAAATTCTCAACAAAAAGAATGCACAGGGAAGTCCTCAGAGGCTAGGTCCTGCTGGTCTTTCCTTGCACTACGCAAATATTGTCAGCCAAATTGAT
AGTCTTGTTTCACGTCCAAGTTCTGTTCCTCCCAACACCAGGGATACACTGTATCGAGGATTGCCTCCAAGTATGAAGTCAGCTTTACGATCCAAGCTACAATCATATCCTGCCAAAGATTTTACTGTCCCACAGATCAAAGCAGAGATGGAGAAAATTTTAGCGTGGCTTGTTCCAGTTGCTACCAATACAACCAAAGC
ACATCATGGGTTTGGATGGGTTGGAGAGTGGGCAAACACAGGATCTGCCTTGGATCGAAGGTTACCTGGACACAACGAGTTGACACTCGTTCAAACTTTTCACTATGCAGAGAAGGAGAAGACGGAATTTTACATTTTTGAACTGGTTGTGTGGCTTCATCATCTTGTGAGCCGGGCCAAAAACAGCCTCAATGGCAACA
AGTCTCCAATTAAATCACCTGTTCGTTCTCCAGTAAAAAAGACTGCAACTCTCTCAGTGACAACTCCAGATAAGCCAAGTCCGACAGGAAATGGACATGATAAACCTCTTCTCGAGCTTTCTCAGGCAGACAAAGATATGTTAAAAGAAGTAAATTTCAGAAAATTGACACCAGGGATAAGTAAAAGTCAAGAGTTTGAT
ACAGCTAAGTTGAGATCTGCTGATGAGTCTTCTTGTAAGCTGATCAAGAGCAATAGTCACTCTCCCACTACCGACACGAAGAATGAGTTTAATGGACTGAGGCGACATACAACACTACCAAACATAGACTTTGACATCGACAGGACTAAAGCTCTAGATGTGATGGATAGGGTTGATAATCTTAGCCTTTTGTAACAGTT
ATTGTTCTCTTGTTCACATTATGTCTTTTCTACAAGTTAAGATAGATTATTTTCATATTTAGTTAAAATTGTATGCTATGTCTCTTCTTGCATTATGCGTAGGCTTTCATGTTAAAGTGTTATGTAGTATCGAATATGTAAGAGTTCAATTTTTTGGTTCCTGTATATACACACACATTAGCCAAAGATGGGCTGCATGT
GGAATGTATTCAGTATTTTGCAAGATAAAATGGAAGGTTGAAGCATGCGTGTCATTTAGCCGCACTATGCATTTTTTAGTAATTTTTTCC



Intron 3 GTAATTTGGA ... CTGTGTCCAG

SampleRetention score (%)Exon junction reads5'ss reads3'ss reads
A112.828710.514
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A98.291821317.5
A107.31185615.5



>TRINITY_DN118327_c1_g3_i5 from sample A1 / Example spliced isoform
TGACGGATTCTTCGTTCCATCCGCTATTTTGTCGCGTGAACCGCCGCAATTGGGCCCCGGGCGACGCAATTTAGATCACGTGATGATGATTACGATGGCATTACATTTTAAATTGAAACTGGCAATTAGGTATAACAGTAACAGTAACAGTAATAGTGTGTAGACGACTAGACTTGGCGTTGGGGACCCTCACCCCGGGG
GTGTTTTGGTTCTAAGAGTCAAAGGAAAGAAGTACAGTCGTTGCGGGGCTGCTACGGCAAGCGCCGCCGATCATAAGGTCGGGAAGAGGAGAGAGAAAGTGTGAGTGGTTATTACGATGGATATTCATTGCATTAACCCCGGAGGCGGGTTACAATTGAACCGCGGTCAGCTTTGACCAAGCGACTCTGGAGCGATCAAA
TCTCCTGGGAGGACAGAGGAGTATCGCACTTACAATTCTTTGGCTTTGCTGCTCATGCTTTTCGTTGCTGGCTTGTTGTTGGATACATTATTGCAGCACTTGTTGTAATAATAATCACAGTAATAATAGAAACTAGGTAGATGGAGCAAATACGGAAAAGGATTTCCACGAGGCGACGGAGGGACAAATCCAAGCAGATC
ACCGCAACTAGCATGGTTTCAGAAGTGGGATCACTTTTAGGGAGAGCTGGCACAGTGGGATTTGGCAAAGCAGTCGAGGTGCTGGATACACTTGGCAGTAGTATGACAAGCTTAAATCCTAGTAGTGGATTTGCATCTGGAGTGACGTCCAAAGGCAACAAGATAGATATTTTGGCATTTGAAGTTGCAAATACTATTGT
TAAGGGTTCCAACCTTAAGCAATCACTTTCTGAAGAAAGTATAAAGTTCTTGATGGAAGAGGTTCTTCGTTCAGAAGGTGTCCAACGGCTTGTGTCTAATGACATGGATGAGTTATTGAAAATTGCAGCAGCAGACAAAAGGAATGAGTTGAAGATTTTTGCAGGGGAGGTGGTCCGATTTGGAAACCACTGTAAAGATC
CTCAATGGCATCAATTGGACCGCTATTTTGAGAAATTGGGTACAGAGCTTCCTGTGCAAAAGCAATCAAAGGGAGAGGCAGAAGCAGTGATGCAACATTTGATGACATTGGCACAAAATACAGCTGAATTATACCATGAATTACATGCCTTGGATAGATTTGAACAAGACTATCGACGCAAGCTTCAGGAGGAAGAATCA
TTAAATGTACCTCAGAGAGGAGACAGTGTTACAATTTTAAAGAATGAATTGAAGAGCCAGAGAAAGCATGTGAGAAATTTGAAGAAGAAATCACTTTGGTCTAAATTTCTGGAAGAGGTCATGGAGAAACTTGTAGATATTGTATATTTCCTACATCAAGAGATCCAGGAGAACTTTAAGGATGCTGATTCGGAAAGTGA
AAAAATTCTCAACAAAAAGAATGCACAGGGAAGTCCTCAGAGGCTAGGTCCTGCTGGTCTTTCCTTGCACTACGCAAATATTGTCAGCCAAATTGATAGTCTTGTTTCACGTCCAAGTTCTGTTCCTCCCAACACCAGGGATACACTGTATCGAGGATTGCCTCCAAGTATGAAGTCAGCTTTACGATCCAAGCTACAAT
CATATCCTGCCAAAGATTTTACTGTCCCACAGATCAAAGCAGAGATGGAGAAAATTTTAGCGTGGCTTGTTCCAGTTGCTACCAATACAACCAAAGCACATCATGGGTTTGGATGGGTTGGAGAGTGGGCAAACACAGGATCTGCCTTGGATCGAAGGTTACCTGGACACAACGAGTTGACACTCGTTCAAACTTTTCAC
TATGCAGAGAAGGAGAAGACGGAATTTTACATTTTTGAACTGGTTGTGTGGCTTCATCATCTTGTGAGCCGGGCCAAAAACAGCCTCAATGGCAACAAGTCTCCAATTAAATCACCTGTTCGTTCTCCAGTAAAAAAGACTGCAACTCTCTCAGTGACAACTCCAGATAAGCCAAGTCCGACAGGAAATGGACATGATAA
ACCTCTTCTCGAGCTTTCTCAGGCAGACAAAGATATGTTAAAAGAAGTAAATTTCAGAAAATTGACACCAGGGATAAGTAAAAGTCAAGAGTTTGATACAGCTAAGTTGAGATCTGCTGATGAGTCTTCTTGTAAGCTGATCAAGAGCAATAGTCACTCTCCCACTACCGACACGAAGAATGAGTTTAATGGACTGAGGC
GACATACAACACTACCAAACATAGACTTTGACATCGACAGGACTAAAGCTCTAGATGTGATGGATAGGGTTGATAATCTTAGCCTTTTGTAACAGTTATTGTTCTCTTGTTCACATTATGTCTTTTCTACAAGTTAAGATAGATTATTTTCATATTTAGTTAAAATTGTATGCTATGTCTCTTCTTGCATTATGCGTAGG
CTTTCATGTTAAAGTGTTATGTAGTATCGAATATGTAAGAGTTCAATTTTTTGGTTCCTGTATATACACACACATTAGCCAAAGATGGGCTGCATGTGGAATGTATTCAGTATTTTGCAAGATAAAATGGAAGGTTGAAGCATGCGTGTCATTTAGCCGCACTATGCATTTTTTAGTAATTTTTTCCCAATTGCTGTTTT
TCTTTTCTGTTGTTTA


>TRINITY_DN118327_c1_g3_i1 from sample A1 / Example unspliced isoform:
CAATTGGACCGCTATTTTGAGAAgtaatttggagaaattttaaagttttatctggtgctatttgtcagcataatatcttctatgctaacatttctctgtgtccagATTGGGTACAGAGCTTCCTGTGCAAAAGCAATCAAAGGGAGAGGCAGAAGCAGTGATGCAACATTTGATGACATTGGCACAAAATACAGCTGTAA
GTGCCCTTGATAATAGAATTGTATTCATTTACATGTGGAATATTCACTGGTAGCTAAAAACTGTCCTTCATTATATACAACCACCCTTTGAATACACGTTGAAG