sp|Q94BY9|GAP22_ARATH ----> Rab GTPase-activating protein 22


Intron 1 GTAGCATTTG ... TAAAAAGCAG

SampleRetention score (%)Exon junction reads5'ss reads3'ss reads
A17551515
A2100032
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A450333
A5100021
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A1090.9122218



>TRINITY_DN39960_c0_g1_i3 from sample A9 / Example spliced isoform
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AAGGAAACCAGTAGATGGGAATTTTCCTCAAGACAGATGGGGAATGCAGAGAGCGTGTTGGAAGGGGAGCGTGAAGTTTGTGGATATGTACTCTTTCACGGTGGAAGGTTCCATTGAGGAGGCAAATATAATGAATGAGGTTAGACGGAGGGTAAAAGAACAGGGCTGTGTTTGGTGGGAGACAGAGGTCTCCAAAGGGG
TAGATTGGTATCTGCAGCCTCATTATCATTATCATTACTATTACCACTGGGACGGAGGAAGCTTTGTGTCTTCCTTTTCTATTTCAACTCTAACTAATACTCTTCTTCTCAAGAGGCTCATAAGGCAGGGGATTCCGTCAGTGTTGAGGCCCAAGTTATGGCTCTCTGCATCTGGGGCTGCTAAAAAGCGTTCTACTGTC
CCGCACAGCTACTATCAGGATCTCATTCAGGCAGTTGAAGGCATGGTCACCCCTGCTACTCTCCAGATTGATCAAGATCTTGCTCGTACTTTTCCAACCCACCCGTGGTTGGATACTGAAGAGGGACATTCTTCTCTGCGAAGAGTGCTTGTTGCTTACTCTTTTCGTGACTCTCGTGTTGGGTATTGTCAAGGGCTAAA
TTATTGCTGCATTATTATTGTTAGTCATGAAAACTGAAGAGGATGCATTTTGGATGCTGGCTGTGCTTTTGGAGAATGTTTTGTTTAAAGACTGTTATGCAGACAATTTGTCTGGATGCCATGTTGAACAAAGGGTCCTTAAGGACTTCCTTGCAAAAATGTGGCCTAGTATTGCTACTCATTTGGAGAGTATAAATTTT
GATGTCTCTATTGTGGCAACAGAATGGTTTCTCTGTCTGTTTGCAAAGAGCTTGCCATCCGAGACTGCGATGCGCATATGGGATATCCTTTTCAATGAGGGTGCCCATATTCTATTTAGGGTCGCCTTAGCTATATTCAAGATAAATGAGGACCAGCTGCTGGCTGCCAACCACGTTGGGGATATTATTAGAATTTTGCA
TCATACTACACATCATGCATTTGACCCAGATGCACTGTTGAAGCAAGCTGCAGTCATGGCAGAGTTGGAGCAGAGATCAAGGCGACTTAACTCATTGGATAGGGGGCAGCCACGCCCATGTTAAAATTAATAATTTTTTAACAAAGATGTATATCTATGTATGCTTTTTTGTGTTTGCAAGGCGTGATAATTGATGCGTC
CCGTCCTCGAAGAGGCACTATAAATCAAATTGTAGTATTGTTCAAACATAAAGCATGCCCTCTCATGTTTTCTACTTCTAGCCTTCTGCTTAAGGCTATCAAGAGGGAAAAGCACAGTTTTTTTATCTCATGTAAATCTACTTCTAAGTTCTGGGGCGAAGCTGAGTTTAGTCACACTCATATTTGGTAGAAGCTGAGTT
TAGTCTCACTCATATTTGGTAACATGTATTTGGCCATCGCTCTCAGAGATGGTATGGAAATAAAGTTGAGAAACGAAAGTGTAGACTAAGCTTATTGTATTGGCTTTGTTTTTAGCATTGTGTGCACATGTATTGTTCAAACATAAAGCATGCCCTTTCATATTTTCTACTTGTAGCCTTCTGCTTAAGGCTATCAAGAG
GGAAAAGCACAGTTTTTTTATCTCATGTAAATCTACTTCTAAGTTCTGGGGCGAAGCTGAGTTTAGTCACACTCATATTTGGTAGAAGCTGAGTTTAGTCTCACTCATATTTGGTAACATGTATTTGGCCATCGCTCTCAGAGATGGTATGGAAATAAAGTTGAGAAACGAAAGTGTAGACTAAGCTTATTGTATTGGCT
TTGCTTTTAGCATTGTGTGCACATGTGAACAATAAATAGTATGGTATATTG


>TRINITY_DN39960_c0_g1_i5 from sample A9 / Example unspliced isoform:
GAAAGATATAAATTTAATTTATTAAAGTGAAGTCATGCTCCAAACTTCAACGAGTGGATGTGGAAATATATAAATTTCGAACGGCTAGTTGAAACGGCCGGCTACTATGAGAGCAAGCCCTTTGTTTGCCAAGAACACTCCGTAACATTATTCCGGGTTCCACTTGATGGTCTGTGTGATGTAATGACAATGTTGGGAAC
AAGGAAACCAGTAGATGGGAATTTTCCTCAAGACAGATGGGGAATGCAGAGAGCGTGTTGGAAGGGGAGCGTGAAGTTTGTGGATATGTACTCTTTCACGGTGGAAGGTTCCATTGAGGAGGCAAATATAATGAATGAGGTTAGACGGAGGGTAAAAGAACAGGGCTGTGTTTGGTGGGAGACAGAGGTCTCCAAAGGGG
TAGATTGGTATCTGCAGCCTCATTATCATTATCATTACTATTACCACTGGGACGGAGGAAGCTTTGTGTCTTCCTTTTCTATTTCAACTCTAACTAATACTCTTCTTCTCAAGAGGCTCATAAGGCAGGGGATTCCGTCAGTGTTGAGGCCCAAGTTATGGCTCTCTGCATCTGGGGCTGCTAAAAAGCGTTCTACTGTC
CCGCACAGCTACTATCAGGATCTCATTCAGGCAGTTGAAGGCATGGTCACCCCTGCTACTCTCCAGATTGATCAAGATCTTGCTCGTACTTTTCCAACCCACCCGTGGTTGGATACTGAAGAGGGACATTCTTCTCTGCGAAGAGTGCTTGTTGCTTACTCTTTTCGTGACTCTCGTGTTGGGTATTGTCAAGGGCTAAA
TTATGTTGCTGCATTATTATTGTTAGTCATGAAAACTGAAGAGGATGCATTTTGGATGCTGGCTGTGCTTTTGGAGAATGTTTTGTTTAAAGACTGTTATGCAGACAATTTGTCTGGATGCCATGTTGAACAAAGGGTCCTTAAGGACTTCCTTGCAAAAATGTGGCCTAGTATTGCTACTCATTTGGAGAGTATAAATT
TTGATGTCTCTATTGTGGCAACAGAATGGTTTCTCTGTCTGTTTGCAAAGAGCTTGCCATCCGAGACTGCGATGCGCATATGGGATATCCTTTTCAATGAGGGTGCCCATATTCTATTTAGGGTCGCCTTAGCTATATTCAAGATAAATGAGGACCAGCTGCTGGCTGCCAACCACGTTGGGGATATTATTAGAATTTTG
CATCATACTACACATCATGCATTTGACCCAGATGCACTGTTGAAGgtagcatttgagaagattggttctgttaccacaaattgtataacaaggcattgtaaaaagcagCAAGCTGCAGTCATGGCAGAGTTGGAGCAGAGATCAAGGCGACTTAACTCATTGGATAGGGGGCAGCCACGCCCATGTTAAAATTAATAATT
TTTTAACAAAGATGTATATCTATGTATGCTTTTTTGTGTTTGCAAGGCGTGATAATTGATGCGTCCCGTCCTCGAAGAGGCACTATAAATCAAATTGTAGTATTGTTCAAACATAAAGCATGCCCTCTCATGTTTTCTACTTCTAGCCTTCTGCTTAAGGCTATCAAGAGGGAAAAGCACAGTTTTTTTATCTCATGTAA
ATCTACTTCTAAGTTCTGGGGCGAAGCTGAGTTTAGTCACACTCATATTTGGTAGAAGCTGAGTTTAGTCTCACTCATATTTGGTAACATGTATTTGGCCATCGCTCTCAGAGATGGTATGGAAATAAAGTTGAGAAACGAAAGTGTAGACTAAGCTTATTGTATTGGCTTTGTTTTTAGCATTGTGTGCACATGTATTG
TTCAAACATAAAGCATGCCCTTTCATATTTTCTACTTGTAGCCTTCTGCTTAAGGCTATCAAGAGGGAAAAGCACAGTTTTTTTATCTCATGTAAATCTACTTCTAAGTTCTGGGGCGAAGCTGAGTTTAGTCACACTCATATTTGGTAGAAGCTGAGTTTAGTCTCACTCATATTTGGTAACATGTATTTGGCCATCGC
TCTCAGAGATGGTATGGAAATAAAGTTGAGAAACGAAAGTGTAGACTAAGCTTATTGTATTGGCTTTGCTTTTAGCATTGTGTGCACATGTGAACAATAAATAGTATGGTATATTG




Intron 2 GTGAGAAAAT ... GGATAAACAG

SampleRetention score (%)Exon junction reads5'ss reads3'ss reads
A111.761504
A20300
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A50200
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A920.5529213
A1018.522255



>TRINITY_DN39960_c0_g1_i5 from sample A9 / Example spliced isoform
GAAAGATATAAATTTAATTTATTAAAGTGAAGTCATGCTCCAAACTTCAACGAGTGGATGTGGAAATATATAAATTTCGAACGGCTAGTTGAAACGGCCGGCTACTATGAGAGCAAGCCCTTTGTTTGCCAAGAACACTCCGTAACATTATTCCGGGTTCCACTTGATGGTCTGTGTGATGTAATGACAATGTTGGGAAC
AAGGAAACCAGTAGATGGGAATTTTCCTCAAGACAGATGGGGAATGCAGAGAGCGTGTTGGAAGGGGAGCGTGAAGTTTGTGGATATGTACTCTTTCACGGTGGAAGGTTCCATTGAGGAGGCAAATATAATGAATGAGGTTAGACGGAGGGTAAAAGAACAGGGCTGTGTTTGGTGGGAGACAGAGGTCTCCAAAGGGG
TAGATTGGTATCTGCAGCCTCATTATCATTATCATTACTATTACCACTGGGACGGAGGAAGCTTTGTGTCTTCCTTTTCTATTTCAACTCTAACTAATACTCTTCTTCTCAAGAGGCTCATAAGGCAGGGGATTCCGTCAGTGTTGAGGCCCAAGTTATGGCTCTCTGCATCTGGGGCTGCTAAAAAGCGTTCTACTGTC
CCGCACAGCTACTATCAGGATCTCATTCAGGCAGTTGAAGGCATGGTCACCCCTGCTACTCTCCAGATTGATCAAGATCTTGCTCGTACTTTTCCAACCCACCCGTGGTTGGATACTGAAGAGGGACATTCTTCTCTGCGAAGAGTGCTTGTTGCTTACTCTTTTCGTGACTCTCGTGTTGGGTATTGTCAAGGGCTAAA
TTATGTTGCTGCATTATTATTGTTAGTCATGAAAACTGAAGAGGATGCATTTTGGATGCTGGCTGTGCTTTTGGAGAATGTTTTGTTTAAAGACTGTTATGCAGACAATTTGTCTGGATGCCATGTTGAACAAAGGGTCCTTAAGGACTTCCTTGCAAAAATGTGGCCTAGTATTGCTACTCATTTGGAGAGTATAAATT
TTGATGTCTCTATTGTGGCAACAGAATGGTTTCTCTGTCTGTTTGCAAAGAGCTTGCCATCCGAGACTGCGATGCGCATATGGGATATCCTTTTCAATGAGGGTGCCCATATTCTATTTAGGGTCGCCTTAGCTATATTCAAGATAAATGAGGACCAGCTGCTGGCTGCCAACCACGTTGGGGATATTATTAGAATTTTG
CATCATACTACACATCATGCATTTGACCCAGATGCACTGTTGAAGGTAGCATTTGAGAAGATTGGTTCTGTTACCACAAATTGTATAACAAGGCATTGTAAAAAGCAGCAAGCTGCAGTCATGGCAGAGTTGGAGCAGAGATCAAGGCGACTTAACTCATTGGATAGGGGGCAGCCACGCCCATGTTAAAATTAATAATT
TTTTAACAAAGATGTATATCTATGTATGCTTTTTTGTGTTTGCAAGGCGTGATAATTGATGCGTCCCGTCCTCGAAGAGGCACTATAAATCAAATTGTAGTATTGTTCAAACATAAAGCATGCCCTCTCATGTTTTCTACTTCTAGCCTTCTGCTTAAGGCTATCAAGAGGGAAAAGCACAGTTTTTTTATCTCATGTAA
ATCTACTTCTAAGTTCTGGGGCGAAGCTGAGTTTAGTCACACTCATATTTGGTAGAAGCTGAGTTTAGTCTCACTCATATTTGGTAACATGTATTTGGCCATCGCTCTCAGAGATGGTATGGAAATAAAGTTGAGAAACGAAAGTGTAGACTAAGCTTATTGTATTGGCTTTGTTTTTAGCATTGTGTGCACATGTATTG
TTCAAACATAAAGCATGCCCTTTCATATTTTCTACTTGTAGCCTTCTGCTTAAGGCTATCAAGAGGGAAAAGCACAGTTTTTTTATCTCATGTAAATCTACTTCTAAGTTCTGGGGCGAAGCTGAGTTTAGTCACACTCATATTTGGTAGAAGCTGAGTTTAGTCTCACTCATATTTGGTAACATGTATTTGGCCATCGC
TCTCAGAGATGGTATGGAAATAAAGTTGAGAAACGAAAGTGTAGACTAAGCTTATTGTATTGGCTTTGCTTTTAGCATTGTGTGCACATGTGAACAATAAATAGTATGGTATATTG


>TRINITY_DN39960_c0_g1_i1 from sample A9 / Example unspliced isoform:
ATTTGAAGGTAATAAACAGTAGGCTGTTCATTTTCCTCTGTTTCCAGCATTTCTTCCACAAAATATAGTTTTCGATTTGACTAGAAAATAAGTAATAAAAAACTTCTGGCTGCCAATGGGCTCACGAATGTTTTCTGCAATAACAGATAAATGAGGACCAGCTGCTGGCTGCCAACCACGTTGGGGATATTATTAGAATT
TTGCATCATACTACACATCATGCATTTGACCCAGATGCACTGTTGAAGgtgagaaaatagcattcctgttgtgcatcattcctacaattttttctccagctattatttcctgatacaaggttatgaaaagtatatacagtactgttcgtattcaatttatgtagatcaatacaaaagcagtatattgttgaatggataaa
cag
GTAGCATTTGAGAAGATTGGTTCTGTTACCACAAATTGTATAACAAGGCATTGTAAAAAGCAGCAAGCTGCAGTCATGGCAGAGTTGGAGCAGAGATCAAGGCGACTTAACTCATTGGATAGGGGGCAGCCACGCCCATGTTAAAATTAATAATTTTTTAACAAAGATGTATATCTATGTATGCTTTTTTGTGTTTG
CAAGGCGTGATAATTGATGCGTCCCGTCCTCGAAGAGGCACTATAAATCAAATTGTAGTATTGTTCAAACATAAAGCATGCCCTCTCATGTTTTCTACTTCTAGCCTTCTGCTTAAGGCTATCAAGAGGGAAAAGCACAGTTTTTTTATCTCATGTAAATCTACTTCTAAGTTCTGGGGCGAAGCTGAGTTTAGTCACAC
TCATATTTGGTAGAAGCTGAGTTTAGTCTCACTCATATTTGGTAACATGTATTTGGCCATCGCTCTCAGAGATGGTATGGAAATAAAGTTGAGAAACGAAAGTGTAGACTAAGCTTATTGTATTGGCTTTGTTTTTAGCATTGTGTGCACATGTATTGTTCAAACATAAAGCATGCCCTTTCATATTTTCTACTTGTAGC
CTTCTGCTTAAGGCTATCAAGAGGGAAAAGCACAGTTTTTTTATCTCATGTAAATCTACTTCTAAGTTCTGGGGCGAAGCTGAGTTTAGTCACACTCATATTTGGTAGAAGCTGAGTTTAGTCTCACTCATATTTGGTAACATGTATTTGGCCATCGCTCTCAGAGATGGTATGGAAATAAAGTTGAGAAACGAAAGTGT
AGACTAAGCTTATTGTATTGGCTTTGCTTTTAGCATTGTGTGCACATGTGAACAATAAATAGTATGGTATATTG




Intron 3 GTGAGAAAAT ... TAAAAAGCAG

SampleRetention score (%)Exon junction reads5'ss reads3'ss reads
A158.33507
A2-1000
A358.33507
A450323
A5-1000
A674.2991126
A743.4813810
A868.2913728
A960.6113220
A1071.43255



>TRINITY_DN39960_c0_g1_i3 from sample A9 / Example spliced isoform
GAAAGATATAAATTTAATTTATTAAAGTGAAGTCATGCTCCAAACTTCAACGAGTGGATGTGGAAATATATAAATTTCGAACGGCTAGTTGAAACGGCCGGCTACTATGAGAGCAAGCCCTTTGTTTGCCAAGAACACTCCGTAACATTATTCCGGGTTCCACTTGATGGTCTGTGTGATGTAATGACAATGTTGGGAAC
AAGGAAACCAGTAGATGGGAATTTTCCTCAAGACAGATGGGGAATGCAGAGAGCGTGTTGGAAGGGGAGCGTGAAGTTTGTGGATATGTACTCTTTCACGGTGGAAGGTTCCATTGAGGAGGCAAATATAATGAATGAGGTTAGACGGAGGGTAAAAGAACAGGGCTGTGTTTGGTGGGAGACAGAGGTCTCCAAAGGGG
TAGATTGGTATCTGCAGCCTCATTATCATTATCATTACTATTACCACTGGGACGGAGGAAGCTTTGTGTCTTCCTTTTCTATTTCAACTCTAACTAATACTCTTCTTCTCAAGAGGCTCATAAGGCAGGGGATTCCGTCAGTGTTGAGGCCCAAGTTATGGCTCTCTGCATCTGGGGCTGCTAAAAAGCGTTCTACTGTC
CCGCACAGCTACTATCAGGATCTCATTCAGGCAGTTGAAGGCATGGTCACCCCTGCTACTCTCCAGATTGATCAAGATCTTGCTCGTACTTTTCCAACCCACCCGTGGTTGGATACTGAAGAGGGACATTCTTCTCTGCGAAGAGTGCTTGTTGCTTACTCTTTTCGTGACTCTCGTGTTGGGTATTGTCAAGGGCTAAA
TTATTGCTGCATTATTATTGTTAGTCATGAAAACTGAAGAGGATGCATTTTGGATGCTGGCTGTGCTTTTGGAGAATGTTTTGTTTAAAGACTGTTATGCAGACAATTTGTCTGGATGCCATGTTGAACAAAGGGTCCTTAAGGACTTCCTTGCAAAAATGTGGCCTAGTATTGCTACTCATTTGGAGAGTATAAATTTT
GATGTCTCTATTGTGGCAACAGAATGGTTTCTCTGTCTGTTTGCAAAGAGCTTGCCATCCGAGACTGCGATGCGCATATGGGATATCCTTTTCAATGAGGGTGCCCATATTCTATTTAGGGTCGCCTTAGCTATATTCAAGATAAATGAGGACCAGCTGCTGGCTGCCAACCACGTTGGGGATATTATTAGAATTTTGCA
TCATACTACACATCATGCATTTGACCCAGATGCACTGTTGAAGCAAGCTGCAGTCATGGCAGAGTTGGAGCAGAGATCAAGGCGACTTAACTCATTGGATAGGGGGCAGCCACGCCCATGTTAAAATTAATAATTTTTTAACAAAGATGTATATCTATGTATGCTTTTTTGTGTTTGCAAGGCGTGATAATTGATGCGTC
CCGTCCTCGAAGAGGCACTATAAATCAAATTGTAGTATTGTTCAAACATAAAGCATGCCCTCTCATGTTTTCTACTTCTAGCCTTCTGCTTAAGGCTATCAAGAGGGAAAAGCACAGTTTTTTTATCTCATGTAAATCTACTTCTAAGTTCTGGGGCGAAGCTGAGTTTAGTCACACTCATATTTGGTAGAAGCTGAGTT
TAGTCTCACTCATATTTGGTAACATGTATTTGGCCATCGCTCTCAGAGATGGTATGGAAATAAAGTTGAGAAACGAAAGTGTAGACTAAGCTTATTGTATTGGCTTTGTTTTTAGCATTGTGTGCACATGTATTGTTCAAACATAAAGCATGCCCTTTCATATTTTCTACTTGTAGCCTTCTGCTTAAGGCTATCAAGAG
GGAAAAGCACAGTTTTTTTATCTCATGTAAATCTACTTCTAAGTTCTGGGGCGAAGCTGAGTTTAGTCACACTCATATTTGGTAGAAGCTGAGTTTAGTCTCACTCATATTTGGTAACATGTATTTGGCCATCGCTCTCAGAGATGGTATGGAAATAAAGTTGAGAAACGAAAGTGTAGACTAAGCTTATTGTATTGGCT
TTGCTTTTAGCATTGTGTGCACATGTGAACAATAAATAGTATGGTATATTG


>TRINITY_DN39960_c0_g1_i1 from sample A9 / Example unspliced isoform:
ATTTGAAGGTAATAAACAGTAGGCTGTTCATTTTCCTCTGTTTCCAGCATTTCTTCCACAAAATATAGTTTTCGATTTGACTAGAAAATAAGTAATAAAAAACTTCTGGCTGCCAATGGGCTCACGAATGTTTTCTGCAATAACAGATAAATGAGGACCAGCTGCTGGCTGCCAACCACGTTGGGGATATTATTAGAATT
TTGCATCATACTACACATCATGCATTTGACCCAGATGCACTGTTGAAGgtgagaaaatagcattcctgttgtgcatcattcctacaattttttctccagctattatttcctgatacaaggttatgaaaagtatatacagtactgttcgtattcaatttatgtagatcaatacaaaagcagtatattgttgaatggataaa
caggtagcatttgagaagattggttctgttaccacaaattgtataacaaggcattgtaaaaagcag
CAAGCTGCAGTCATGGCAGAGTTGGAGCAGAGATCAAGGCGACTTAACTCATTGGATAGGGGGCAGCCACGCCCATGTTAAAATTAATAATTTTTTAACAAAGATGTATATCTATGTATGCTTTTTTGTGTTTG
CAAGGCGTGATAATTGATGCGTCCCGTCCTCGAAGAGGCACTATAAATCAAATTGTAGTATTGTTCAAACATAAAGCATGCCCTCTCATGTTTTCTACTTCTAGCCTTCTGCTTAAGGCTATCAAGAGGGAAAAGCACAGTTTTTTTATCTCATGTAAATCTACTTCTAAGTTCTGGGGCGAAGCTGAGTTTAGTCACAC
TCATATTTGGTAGAAGCTGAGTTTAGTCTCACTCATATTTGGTAACATGTATTTGGCCATCGCTCTCAGAGATGGTATGGAAATAAAGTTGAGAAACGAAAGTGTAGACTAAGCTTATTGTATTGGCTTTGTTTTTAGCATTGTGTGCACATGTATTGTTCAAACATAAAGCATGCCCTTTCATATTTTCTACTTGTAGC
CTTCTGCTTAAGGCTATCAAGAGGGAAAAGCACAGTTTTTTTATCTCATGTAAATCTACTTCTAAGTTCTGGGGCGAAGCTGAGTTTAGTCACACTCATATTTGGTAGAAGCTGAGTTTAGTCTCACTCATATTTGGTAACATGTATTTGGCCATCGCTCTCAGAGATGGTATGGAAATAAAGTTGAGAAACGAAAGTGT
AGACTAAGCTTATTGTATTGGCTTTGCTTTTAGCATTGTGTGCACATGTGAACAATAAATAGTATGGTATATTG