NA ----> NA


Intron 1 GTAAAAATGT ... TGCATAACAG

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>TRINITY_DN105553_c0_g1_i7 from sample A3 / Example spliced isoform
GCCATCCTACCTGCTCACCCTCAGTGCCTCGGCTATGAAGATTTTGGCATATAAAAACAAGAAAAACCAGATCTATACTGGTAATTAGTAATATATCAGTTGTAGATTCCAAAAGCCGCGGCTCATTCGTCATTTGCCCAAATGTTTGGCTTACAACTGATATATTACTAATTACCAGTATAGATCTGGTTTTTCTTGTT
TTTATATGCCAAAATCTTCATAGCCGAGGCACTGAGGGTGAGCAGGTAGGATGGCAAACGAGGAGTTCAGTAATGTAAAGACATCAGTATGGTGGGATTTGGAGAACTGCCCGGTTCCCAGTGGAGTGAATCCTCATGCAATAGCACAGAATATAAGCACGACTCTTTCTAAGCATGATTACAAAGGTCCTATCTCCATT
AGTGCTTTTGGTGACACCCACAGCTTACCAGCAAATGTCCAGCACGCTCTCTCCAGTACTGGGATAGCCCTCAATCACGTGCCAGCAGGCATTAAAGATGCCAGTGACAAAAGGATTTTAGTTGATATGCTCTTCTGGGCAGTGGACAATTCTGCACCAGCAAACTATTTGCTTATATCTGGTGATCGTGACTTTGCTAA
TGCTCTCCATCAGCTCAGCATGAGGAGGTATAACATTCTTTTGGCTCACCCCACTCTGAACATTCCTCCCTCCCTCTCTGGCGCTGCAACAATTATCTGGCTCTGGACAAGCCTTGCAATGGGTAAGGAGGTTATGCCAATTATTAAGGATAACAAACAACTAGATAGAAAATCTGATTCCCTGGAGATGAAGAGCACTA
TGTCAAAGTTACAAGCTCCACTTAACAAGGGTGATGGGGGTGGATCATTGCCAGATTTTGATCAGGCAAATTGGCAGTTATATACACAAAATGGTGGCTTCAAGCAGTCAATGCAAAGAGCTGGGTATGCAAACAGAGAAATATATTCTGCTAATAAAACATACTGCTCTGAAACACATCTGCCAACATCTAGCTCTTTG
ATGATACGGAATATTTCTCCAATTTGTGATACTAGAGCTTCGGCACCTCCAGATTCACATGATGTAAGGCCATTACAATCACTAGAAAACTACAATAATAATAGGCTAGAGAGTAATGACCCGAAGTACAATTCTTGCATTTCAAGAACTAAACCTAACACACTTGTAAAGTTAAGCTCAGCTCCATCTCGTACAAATTT
TACACCTGCAGTAAACAATCTTCAAGCTAAAGTAGGCGCCCAACATAATCTCAATCGTAGTCGCTCTCTCCACACAAAGGCTAGTTGTTCCCCTCAAATGATGCCTTCCTATCCTCCCCAAGTGAGGCCTAACTGCCCTCCCCAAGTCATCTCTAATTTTCGTATGGAACATCATGCTGGAAATAGACAAAAGTTTCCTG
TTGAATTGAGAGCTACTGTGTCTGATTTTGACAAACTGGATATTTCTTCTGATTCACAGCATAGTCCCAGTATTCCATCTGGGAATTCTAGTTTGCTTTGTATCTCACAATTCCTTCCTTCAGAACAAACAACCCAACCTCTAGGGAGTTTAGAGGCACATATTCCACCTCAAACAGAAACTTCTAGAGATGCAACACAC
ACGTCCCCATCTAGGTTGCCACCAGCTCAACTTCCTGGATCAGATATATCTCATAGAGTTCATCTGAGGATTCTTTCTCTGGCCATGGAAACATTGAAGCAAAATATGATGGCACCAACAAAACAAAATCTTGAAGACTGTATTTGGTATAGTGAGATGCTTCATATTCCTAATTTCAATCTTCAAGAGTGCTTGGATAA
AGCTGTTGAACTAAAAGATATAGTAGTGATGAGGACAGGTGGTGTTTTTAAAATCTATCTCCCTCTTGACTCAGTTATTTGGCAGTGTGTTGATCCACTTAGCATGCATGATAGTTATCCTAAGGAACTCTGGGATGAACTCTATAAATTCCTATCTAGCCGCAAAGGACATGAAGCTATGATTCGATCCAAAAGCAGGT
ATGATGCAGCACAGGAGCTGAGGAAATCTTGCCTCAAATCTCTTTTGTTAGGACAAATCATACATATGTTGCACCTTGCCATAAACGTTAAAAAATGGTTGAGGCCACCAAATCAGGCACAATGGTCTCCATTATCCATCACCATTGGCCAGAGATCTACTGGATCAAAACCTGATGGTTATCAAGGAGGATCTCCAACC
TTTTCATAGAAGTAAGAAATAGTTGTGCAAAGGAGGCACACCATAGAGGCAAAGACTCCAGTTTTAGTTGAATGTATAAGTGCTAGTGCTAAAGATCTTGTAGAGTAGGGCATCGACAAAGGGTTCTGTGGTGTGTGTTGGTATGTTTCAGCTTCAAAGAGTTCATAACAAAGGCAGTAAGAATCATCATATTGTTTCCA
TGAGATACAGTGCAGAATTATTATGGATGCCAAGGGATATTTAGAAAAGAATAATATCCTTTAGGAAAACCTCTTGATAAGTTTCTTTACAGTATCTTATTTCCTGCCACAAGTTATTACACAGTTCTGTGATATTCTTAATAGTTTCTCTAATTACTAGCAGGGAGGATATTATTTTCAGCATGACAAAAGCTGAAAAA
CTGATACAAATATGTGGCTTCAAAGGTTCCAAGGTGTTGCTGCCCAAAGTAGATGAGGGCGTATGCAGTTTTCTTCTCTTTCTCAATCGAAGTTGGATTTTAGATGTGGTTCTAAATATATTATGGGGTCTTTAACCTCCAGTTTGTTTGAGGTCTTCTTATTTCCGATTTAAGGTTGGATATGACAATGTGATTTAGAA
TTCAAAATTTTTCCGGAATCCTTGTGCCCTTAGCTTCTTTCTGGAGAGCCTGGACAATTAGAAGGCAAATAACAATCTTCATTTGAAAAAGCTAATATGTTGGATATTTATTTATCCATTGGGTTCTCAGCAGGTCTTCCAGGAAGAAAGAATTTTGCAAGAAAATGGGATTTCATGTTTGGACTTGGGATTTTGTTCAC
TGTAATTTGTGTATATTGTGGTGATTATGGCCACAATGTAAAGTTGGACTGCAGGTGGTTGTGACATTACTTCTATTGAACTTTGTTGCTTCTAGTGTGGGGAATTCAGCTAGTTTGAATATTTTGTATGTAGTATACATTTCCAGTATCCAGCTGTGGCATCCATGGTATTTCAGTATTATTCAAGAAATTACAGGAGA
AATATTTTGAGGATTCTGGTAAATAGTCATCAAGATACAAATTCTGGGAAACAGACCCCCAGTTGACAGTTTCTTGACTTGGACACTTGGGACTGTAATTCAGAGATGATGGAGGCAGTGTGAGCATGAACATTCCAATTAGTCTGATTTTGTGAGCAATAGTGTCATGTTTGAGGCAGTGTAGAAATTTGGTAACATTG
CAGCTTTAATATTGAAGCCCTCTATCAACCATTTGCACAACATTTCAGTAACAATTACATGATGCTGGACTGGATGTTAGAAACATAGAACTATGTTTTTATCAGTTTGTGATATGGCAAACTATAAATACAGGGGAGAAATGTAACATGTTGGCATGAGTGGAAAGCAGGGTTACTGGTTATGGATGGATGAGTGGTAA
TTATTTTCAATTTGCTGTTGTCATTGAAGCTATAGAACGAGAGGTGGTATGGTAGGTTTCATAATCTTGAAATCAGCTGGGCAGAAGGAAATTGTGAGCATCACCAGTGAGTGTAAACAAATATTCTAGTGATTATTTGTCAGGTATGCATTTGACTAGAGGTGGTTGAACTGTTTGCTTCTCATGCTCGGACCCCTTTT
AGAGTAAATATTGTGTGCTGGAAGGGAAGGTAATTGCTTATATTCTGGTGCAGTGAATCCTAGTCTTGGACCTTTCTTTGGGTTATGATTCTGATAAAAGGAATCTCGGTTCTAATCTTCTTTCACTACAAATTGTCATAACAGGTTGATTCCTTTCAGAGGTTTGGCAGTTTGAATTTTCTTGATGGTTTACTTACAAA
CAATTGTTGATGATGTCTAGCTGTGTTCATGTCCCTGATGCAACAGAAGCCATTTTGCAGGGAATTAAGCATAAGAATATCATATGCTGGAGTTTTCCATCCATGGGTCTATCATAAAAGCACATAGGTGACAGTCGGGAGTATTCATCGTTTGAAAGATGCTGGAGTTCAATTGATGGAAATATTTTGAAATTATGAGT
TTGACAGCTCTCTACTATTTTGTCAATGGGGGTATTAGTTATTTCTTTTGCGGGAATCGATTTTTTCATTCTTGTGAATATGTACTGTGCATGATGGGGATTCTCCATTCATAAATCTAGTCTGTCACAATAGCACATAGATTACGACATTAGTGGTTAGCATTGCCATGCAGGTTTTTTTTTTTTTTAGCTGGAATCAA
TTGTCTTATTCTTGTAGGGATTTTCCATGCTTGAATCTGTATGTCTTAATAGCACATGGATTATGA


>TRINITY_DN105553_c0_g1_i10 from sample A3 / Example unspliced isoform:
CGGATACTTTTGGTGTTGGAGCCCTCGTTTGCCCACTTTAGCGCCGCCGCCTCCACATTGGGGTTAAACTCGCTGTCTATATATATCCCACATACATCCATGTAGGGCTGTTGTAGATTCCAAAAGCCGCGGCTCATTCGTCATTTGCCCAAATGTTTGGCTTACAACTGATATATTACTAATTACCAGTATAGATCTGG
TTTTTCTTGTTTTTATATGCCAAAATCTTCATAGCCGAGGCACTGAGGGTGAGCAGGTAGGATGGCAAACGAGGAGTTCAGTAATGTAAAGACATCAGTATGGTGGGATTTGGAGAACTGCCCGGTTCCCAGTGGAGTGAATCCTCATGCAATAGCACAGAATATAAGCACGACTCTTTCTAAGCATGATTACAAAGGTC
CTATCTCCATTAGTGCTTTTGGTGACACCCACAGCTTACCAGCAAATGTCCAGCACGCTCTCTCCAGTACTGGGATAGCCCTCAATCACGTGCCAGCAGGCATTAAAGATGCCAGTGACAAAAGGATTTTAGTTGATATGCTCTTCTGGGCAGTGGACAATTCTGCACCAGCAAACTATTTGCTTATATCTGGTGATCGT
GACTTTGCTAATGCTCTCCATCAGCTCAGCATGAGGAGGTATAACATTCTTTTGGCTCACCCCACTCTGAACATTCCTCCCTCCCTCTCTGGCGCTGCAACAATTATCTGGCTCTGGACAAGCCTTGCAATGGGTAAGGAGGTTATGCCAATTATTAAGGATAACAAACAACTAGATAGAAAATCTGATTCCCTGGAGAT
GAAGAGCACTATGTCAAAGTTACAAGCTCCACTTAACAAGGGTGATGGGGGTGGATCATTGCCAGATTTTGATCAGGCAAATTGGCAGTTATATACACAAAATGGTGGCTTCAAGCAGTCAATGCAAAGAGCTGGGTATGCAAACAGAGAAATATATTCTGCTAATAAAACATACTGCTCTGAAACACATCTGCCAACAT
CTAGCTCTTTGATGATACGGAATATTTCTCCAATTTGTGATACTAGAGCTTCGGCACCTCCAGATTCACATGATGTAAGGCCATTACAATCACTAGAAAACTACAATAATAATAGGCTAGAGAGTAATGACCCGAAGTACAATTCTTGCATTTCAAGAACTAAACCTAACACACTTGTAAAGTTAAGCTCAGCTCCATCT
CGTACAAATTTTACACCTGCAGTAAACAATCTTCAAGCTAAAGTAGGCGCCCAACATAATCTCAATCGTAGTCGCTCTCTCCACACAAAGGCTAGTTGTTCCCCTCAAATGATGCCTTCCTATCCTCCCCAAGTGAGGCCTAACTGCCCTCCCCAAGTCATCTCTAATTTTCGTATGGAACATCATGCTGGAAATAGACA
AAAGTTTCCTGTTGAATTGAGAGCTACTGTGTCTGATTTTGACAAACTGGATATTTCTTCTGATTCACAGCATAGTCCCAGTATTCCATCTGGGAATTCTAGTTTGCTTTGTATCTCACAATTCCTTCCTTCAGAACAAACAACCCAACCTCTAGGGAGTTTAGAGGCACATATTCCACCTCAAACAGAAACTTCTAGAG
ATGCAACACACACGTCCCCATCTAGGTTGCCACCAGCTCAACTTCCTGGATCAGATATATCTCATAGAGTTCATCTGAGGATTCTTTCTCTGGCCATGGAAACATTGAAGCAAAATATGATGGCACCAACAAAACAAAATCTTGAAGACTGTATTTGGTATAGTGAGATGCTTCATATTCCTAATTTCAATCTTCAAGAG
TGCTTGGATAAAGCTGTTGAACTAAAAGATATAGTAGTGATGAGGACAGGTGGTGTTTTTAAAATCTATCTCCCTCTTGACTCAGTTATTTGGCAGTGTGTTGATCCACTTAGCATGCATGATAGTTATCCTAAGGAACTCTGGGATGAACTCTATAAATTCCTATCTAGCCGCAAAGGACATGAAGCTATGATTCGATC
CAAAAGCAGGTATGATGCAGCACAGGAGCTGAGGAAATCTTGCCTCAAATCTCTTTTGTTAGGACAAATCATACATATGTTGCACCTTGCCATAAACGTTAAAAAATGGTTGAGGCCACCAAATCAGGCACAATGGTCTCCATTATCCATCACCATTGGCCAGAGATCTACTGGATCAAAACCTGATGGTTATCAAGGAG
GATCTCCAACCTTTTCATAGAAGTAAGAAATAGTTGTGCAAAGGAGGCACACCATAGAGGCAAAGACTCCAGTTTTAGTTGAATGTATAAGTGCTAGTGCTAAAGATCTTGTAGAGTAGGGCATCGACAAAGGGTTCTGTGGTGTGTGTTGGTATGTTTCAGCTTCAAAGAGTTCATAACAAAGGCAGTAAGAATCATCA
TATTGTTTCCATGAGATACAGTGCAGAATTATTATGGATGCCAAGGGATATTTAGAAAAGAATAATATCCTTTAGGAAAACCTCTTGATAAGTTTCTTTACAGTATCTTATTTCCTGCCACAAGTTATTACACAGTTCTGTGATATTCTTAATAGTTTCTCTAATTACTAGCAGGGAGGATATTATTTTCAGCATGACAA
AAGCTGAAAAACTGATACAAATATGTGGCTTCAAAGGTTCCAAGGTGTTGCTGCCCAAAGTAGATGAGGGCGTATGCAGTTTTCTTCTCTTTCTCAATCGAAGTTGGATTTTAGATGTGGTTCTAAATATATTATGGGGTCTTTAACCTCCAGTTTGTTTGAGGTCTTCTTATTTCCGATTTAAGGTTGGATATGACAAT
GTGATTTAGAATTCAAAATTTTTCCGGAATCCTTGTGCCCTTAGCTTCTTTCTGGAGAGCCTGGACAATTAGAAGGCAAATAACAATCTTCATTTGAAAAAGCTAATATGTTGGATATTTATTTATCCATTGGGTTCTCAGCAGGTCTTCCAGGAAGAAAGAATTTTGCAAGAAAATGGGATTTCATGTTTGGACTTGGG
ATTTTGTTCACTGTAATTTGTGTATATTGTGGTGATTATGGCCACAATGTAAAGTTGGACTGCAGGTGGTTGTGACATTACTTCTATTGAACTTTGTTGCTTCTAGTGTGGGGAATTCAGCTAGTTTGAATATTTTGTATGTAGTATACATTTCCAGTATCCAGCTGTGGCATCCATGGTATTTCAGTATTATTCAAGAA
ATTACAGGAGAAATATTTTGAGGATTCTGGTAAATAGTCATCAAGATACAAATTCTGGGAAACAGACCCCCAGTTGACAGTTTCTTGACTTGGACACTTGGGACTGTAATTCAGAGATGATGGAGGCAGTGTGAGCATGAACATTCCAATTAGTCTGATTTTGTGAGCAATAGTGTCATGTTTGAGGCAGTGTAGAAATT
TGGTAACATTGCAGCTTTAATATTGAAGCCCTCTATCAACCATTTGCACAACATTTCAGTAACAATTACATGATGCTGGACTGGATGTTAGAAACATAGAACTATGTTTTTATCAGTTTGTGATATGGCAAACTATAAATACAGGGGAGAAATGTAACATGTTGGCATGAGTGGAAAGCAGGGTTACTGGTTATGGATGG
ATGAGTGGTAATTATTTTCAATTTGCTGTTGTCATTGAAGCTATAGAACGAGAGGTGGTATGGTAGGTTTCATAATCTTGAAATCAGCTGGGCAGAAGGAAATTGTGAGCATCACCAGTGAGTGTAAACAAATATTCTAGTGATTATTTGTCAGGTATGCATTTGACTAGAGGTGGTTGAACTGTTTGCTTCTCATGCTC
GGACCCCTTTTAGAGTAAATATTGTGTGCTGGAAGGGAAGGTAATTGCTTATATTCTGGTGCAGTGAATCCTAGTCTTGGACCTTTCTTTGGGTTATGATTCTGATAAAAGGAATCTCGGTTCTAATCTTCTTTCACTACAAATTGTCATAACAGGTTGATTCCTTTCAGAGGTTTGGCAGTTTGAATTTTCTTGATGGT
TTACTTACAAACAATTGTTGATGATGTCTAGCTGTGTTCATGTCCCTGATGCAACAGAAGCCATTTTGCAGGGAATTAAGCATAAGAATATCATATGCTGgtaaaaatgttttttacaaatgatttataatgcattttgaatttggactgataggtgacccataaaattttgaaactcctcgtcaatctgatgataattt
ttgagaggttgaattgcattaggaacaagaataaagttttgcaatgcttccacatgattaaaacttactgtggtgcacaatttatgttgcaacctaaaagttgcctacaataggatggtgcgatgttcccattcttatgatgctaaaattggtctacagtttaaaggtcatcgtcattctggaaggaagctgcattattt
aaatttggtctgtctgagcttagtcaatagaaatatggttgcacgcgtcaaattcttactacttatatatattgatggaatcagttgtcttgttcttatataaatacactgcatgatagggattttgatataattcaggtctgtcacaatagtacatggataattacattaatggttagaacttagcattaccaagctgg
ttatatttttcttgttggaatcaattgtaattgttgtgaatacaatattgtgcataacag
GAGTTTTCCATCCATGGGTCTATCATAAAAGCACATAGGTGACAGTCGGGAGTATTCATCGTTTGAAAGATGCTGGAGTTCAATTGATGGAAATATTTTGAAATTATGAGTTTGACAGCTCTCTACTATTTTGTCAATGG
GGGTATTAGTTATTTCTTTTGCGGGAATCGATTTTTTCATTCTTGTGAATATGTACTGTGCATGATGGGGATTCTCCATTCATAAATCTAGTCTGTCACAATAGCACATAGATTACGACATTAGTGGTTAGCATTGCCATGCAGGTTTTTTTTTTTTTTAGCTGGAATCAATTGTCTTATTCTTGTAGGGATTTTCCATG
CTTGAATCTGTATGTCTTAATAGCACATGGATTATGA




Intron 2 GTATGGCAAA ... GAAATTGCAG

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>TRINITY_DN118094_c5_g1_i1 from sample A1 / Example spliced isoform
ATTATTCTGAGTTTGGTGTTTAAGAAAATGTGGATTCTGCATTTAGTTCTAAAAAAGTTAATACACAGTTGGGTAGGATGGCAAACGAGGAGTTCAGTAATGTAAAGACATCAGTATGGTGGGATTTGGAGAACTGCCCGGTTCCCAGTGGAGTGAATCCTCATGCAATAGCACAGAATATAAGCACGACTCTTTCTAAG
CATGATTACAAAGGTCCTATCTCCATTAGTGCTTTTGGTGACACCCACAGCTTACCAGCAAATGTCCAGCACGCTCTCTCCAGTACTGGGATAGCCCTCAATCACGTGCCAGCAGGCATTAAAGATGCCAGTGACAAAAGGATTTTAGTTGATATGCTCTTCTGGGCAGTGGACAATTCTGCACCAGCAAACTATTTGCT
TATATCTGGTGATCGTGACTTTGCTAATGCTCTCCATCAGCTCAGCATGAGGAGGTATAACATTCTTTTGGCTCACCCCACTCTGAACATTCCTCCCTCCCTCTCTGGCGCTGCAACAATTATCTGGCTCTGGACAAGCCTTGCAATGGGTAAGGAGGTTATGCCAATTATTAAGGATAACAAACAACTAGATAGAAAAT
CTGATTCCCTGGAGATGAAGAGCACTATGTCAAAGTTACAAGCTCCACTTAACAAGGGTGATGGGGGTGGATCATTGCCAGATTTTGATCAGGCAAATTGGCAGTTATATACACAAAATGGTGGCTTCAAGCAGTCAATGCAAAGAGCTGGGTATGCAAACAGAGAAATATATTCTGCTAATAAAACATACTGCTCTGAA
ACACATCTGCCAACATCTAGCTCTTTGATGATACGGAATATTTCTCCAATTTGTGATACTAGAGCTTCGGCACCTCCAGATTCACATGATGTAAGGCCATTACAATCACTAGAAAACTACAATAATAATAGGCTAGAGAGTAATGACCCGAAGTACAATTCTTGCATTTCAAGAACTAAACCTAACACACTTGTAAAGTT
AAGCTCAGCTCCATCTCGTACAAATTTTACACCTGCAGTAAACAATCTTCAAGCTAAAGTAGGCGCCCAACATAATCTCAATCGTAGTCGCTCTCTCCACACAAAGGCTAGTTGTTCCCCTCAAATGATGCCTTCCTATCCTCCCCAAGTGAGGCCTAACTGCCCTCCCCAAGTCATCTCTAATTTTCGTATGGAACATC
ATGCTGGAAATAGACAAAAGTTTCCTGTTGAATTGAGAGCTACTGTGTCTGATTTTGACAAACTGGATATTTCTTCTGATTCACAGCATAGTCCCAGTATTCCATCTGGGAATTCTAGTTTGCTTTGTATCTCACAATTCCTTCCTTCAGAACAAACAACCCAACCTCTAGGGAGTTTAGAGGCACATATTCCACCTCAA
ACAGAAACTTCTAGAGATGCAACACACACGTCCCCATCTAGGTTGCCACCAGCTCAACTTCCTGGATCAGATATATCTCATAGAGTTCATCTGAGGATTCTTTCTCTGGCCATGGAAACATTGAAGCAAAATATGATGGCACCAACAAAACAAAATCTTGAAGACTGTATTTGGTATAGTGAGATGCTTCATATTCCTAA
TTTCAATCTTCAAGAGTGCTTGGATAAAGCTGTTGAACTAAAAGATATAGTAGTGATGAGGACAGGTGGTGTTTTTAAAATCTATCTCCCTCTTGACTCAGTTATTTGGCAGTGTGTTGATCCACTTAGCATGCATGATAGTTATCCTAAGGAACTCTGGGATGAACTCTATAAATTCCTATCTAGCCGCAAAGGACATG
AAGCTATGATTCGATCCAAAAGCAGGTATGATGCAGCACAGGAGCTGAGGAAATCTTGCCTCAAATCTCTTTTGTTAGGACAAATCATACATATGTTGCACCTTGCCATAAACGTTAAAAAATGGTTGAGGCCACCAAATCAGGCACAATGGTCTCCATTATCCATCACCATTGGCCAGAGATCTACTGGATCAAAACCT
GATGGTTATCAAGGAGGATCTCCAACCTTTTCATAGAAGTAAGAAATAGTTGTGCAAAGGAGGCACACCATAGAGGCAAAGACTCCAGTTTTAGTTGAATGTATAAGTGCTAGTGCTAAAGATCTTGTAGAGTAGGGCATCGACAAAGGGTTCTGTGGTGTGTGTTGGTATGTTTCAGCTTCAAAGAGTTCATAACAAAG
GCAGTAAGAATCATCATATTGTTTCCATGAGATACAGTGCAGAATTATTATGGATGCCAAGGGATATTTAGAAAAGAATAATATCCTTTAGGAAAACCTCTTGATAAGTTTCTTTACAGTATCTTATTTCCTGCCACAAGTTATTACACAGTTCTGTGATATTCTTAATAGTTTCTCTAATTACTAGCAGGGAGGATATT
ATTTTCAGCATGACAAAAGCTGAAAAACTGATACAAATATGTGGCTTCAAAGGTTCCAAGGTGTTGCTGCCCAAAGTAGATGAGGGCGTATGCAGTTTTCTTCTCTTTCTCAATCGAAGTTGGATTTTAGATGTGGTTCTAAATATATTATGGGGTCTTTAACCTCCAGTTTGTTTGAGGTCTTCTTATTTCCGATTTAA
GGTTGGATATGACAATGTGATTTAGAATTCAAAATTTTTCCGGAATCCTTGTGCCCTTAGCTTCTTTCTGGAGAGCCTGGACAATTAGAAGGCAAATAACAATCTTCATTTGAAAAAGCTAATATGTTGGATATTTATTTATCCATTGGGTTCTCAGCAGGTCTTCCAGGAAGAAAGAATTTTGCAAGAAAATGGGATTT
CATGTTTGGACTTGGGATTTTGTTCACTGTAATTTGTGTATATTGTGGTGATTATGGCCACAATGTAAAGTTGGACTGCAGGTGGTTGTGACATTACTTCTATTGAACTTTGTTGCTTCTAGTGTGGGGAATTCAGCTAGTTTGAATATTTTGTATGTAGTATACATTTCCAGTATCCAGCTGTGGCATCCATGGTATTT
CAGTATTATTCAAGAAATTACAGGAGAAATATTTTGAGGATTCTGGTAAATAGTCATCAAGATACAAATTCTGGGAAACAGACCCCCAGTTGACAGTTTCTTGACTTGGACACTTGGGACTGTAATTCAGAGATGATGGAGGCAGTGTGAGCATGAACATTCCAATTAGTCTGATTTTGTGAGCAATAGTGTCATGTTTG
AGGCAGTGTAGAAATTTGGTAACATTGCAGCTTTAATATTGAAGCCCTCTATCAACCATTTGCACAACATTTCAGTAACAATTACATGATGCTGGACTGGATGTTAGAAACATAGAACTATGTTTTTATCAGTTTGTGATATGGCAAACTATAAATACAGGGGAGAAATGTAACATGTTGGCATGAGTGGAAAGCAGGGT
TACTGGTTATGGATGGATGAGTGGTAATTATTTTCAATTTGCTGTTGTCATTGAAGCTATAGAACGAGAGGTGGTATGGTAGGTTTCATAATCTTGAAATCAGCTGGGCAGAAGGAAATTGTGAGCATCACCAGTGAGTGTAAACAAATGTTCTAGTGATTATTTGTCAGGTATGCATTTGACTAGAGGTGGTTGAACTG
TTTGCTTCTCATGCTCGGACCCCTTTTAGAGTAAATATTGTGTGCTGGAAGGGAAGGTAATTGCTTATATTCTGGTGCAGTGAATCCTAGTCTTGGACCTTTCTTTGGGTTATGATTCTGATAAAAGGAATCTCGGTTCTAATCTTCTTTCACTACAAATTGTCATAACAGGTTGATTCCTTTCAGAGGTTTGGCAGTTT
GAATTTTCTTGATGGTTTACTTACAAACAATTGTTGATGATGTCTAGCTGTGTTCATGTCCCTGATGCAACAGAAGCCATTTTGCAGGGAATTAAGCATAAGAATATCATATGCTGGTAAAAATGTTTTTTACAAATGATTTATAATGCATTTTGAATTTGGACTGATAGGTGACCCATAAAATTTTGAAACTCCTCGTC
AATCTGATGATAATTTTTGAGAGGTTGAATTGCATTAGGAACAAGAATAAAGTTTTGCAATGCTTCCACATGATTAAAACTTACTGTGGTGCACAATTTATGTTGCAACCTAAAAGTTGCCTACAATAGGATGGTGCGATGTTCCCATTCTTATGATGCTAAAATTGGTCTACAGTTTAAAGGTCATCGTCATTCTGGAA
GGAAGCTGCATTATTTAAATTTGGTCTGTCTGAGCTTAGTCAATAGAAATATGGTTGCACGCGTCAAATTCTTACTACTTATATATATTGATGGAATCAGTTGTCTTGTTCTTATATAAATACACTGCATGATAGGGATTTTGATATAATTCAGGTCTGTCACAATAGTACATGGATAATTACATTAATGGTTAGAACTT
AGCATTACCAAGCTGGTTATATTTTTCTTGTTGGAATCAATTGTAATTGTTGTGAATACAATATTGTGCATAACAGGAGTTTTCCATCCATGGGTCTATCATAAAAGCACATAGGTGACAGTCGGGAGTATTCATCGTTTGAAAGATGCTGGAGTTCAATTGATGGAAATATTTTGAAATTATGAGTTTGACAGCTCTCT
ACTATTTTGTCAATGGGGGTATTAGTTATTTCTTTTGCGGGAATCGATTTTTTCATTCTTGTGAATATGTACTGTGCATGATGGGGATTCTCCATTCATAAATCTAGTCTGTCACAATAGCACATAGATTACGACATTAGTGGTTAGCATTGCCATGCAGGTTTTTTTTTTTTTTTAGCTGGAATCAATTGTCTTATTCT
TGTAGGGATTTTCCATGCTTGAATCTGTATGTCTTAATAGCACATGGATTATGACATTTTCCTCTTTTTCCTCTTTTGAAAGAGTGCTTTAAATTTCTTTTGTCCAGCTTCACTTGATGGAAAGGTGGTTGCATTGTTAAAAATGTAGCTTGAGCAGGAACTTCTTGCATAGGCGAGGTGTAAATGTGCGAGAAGTTCGA
AATAACTTTTAGTTCGAGAAAACCTTTTAGTGACCATTGAGTTAAACTGGAAAATAATAAAATCATTTCACTTAATAAATGGAAAATAATATCATCATTTCACTTAATAAATAAAAGTGGAAGTTTAAATTCATTTGATCTCTTAGTTTTAGAAATCTTAATGAATGCTTTAGAGTTTTTATAATACTAGTGAATTGGAT
TTGATATAATCTTTAGCCATACATTTCATTGTTGAGATAAGGTGGTTGCTAGGATTAAGGAGATTAATGGAGATTGATTGCTAAAATCAAGGAGTTGGTTAGAATCAAGAAAGTTGGTTGCTAAAATTGATGAGATTCT


>TRINITY_DN118094_c5_g1_i6 from sample A1 / Example unspliced isoform:
ATTATTCTGAGTTTGGTGTTTAAGAAAATGTGGATTCTGCATTTAGTTCTAAAAAAGTTAATACACAGTTGGgtatggcaaattttcatttatcgattttgttagagctacaaagatggggatctgatggtgggtatgactcaattggggttgaaattgcagGTAGGATGGCAAACGAGGAGTTCAGTAATGTAAAGACA
TCAGTATGGTGGGATTTGGAGAACTGCCCGGTTCCCAGTGGAGTGAATCCTCATGCAATAGCACAGAATATAAGCACGACTCTTTCTAAGCATGATTACAAAGGTCCTATCTCCATTAGTGCTTTTGGTGACACCCACAGCTTACCAGCAAATGTCCAGCACGCTCTCTCCAGTACTGGGATAGCCCTCAATCACGTGCC
AGCAGGCATTAAAGATGCCAGTGACAAAAGGATTTTAGTTGATATGCTCTTCTGGGCAGTGGACAATTCTGCACCAGCAAACTATTTGCTTATATCTGGTGATCGTGACTTTGCTAATGCTCTCCATCAGCTCAGCATGAGGAGGTATAACATTCTTTTGGCTCACCCCACTCTGAACATTCCTCCCTCCCTCTCTGGCG
CTGCAACAATTATCTGGCTCTGGACAAGCCTTGCAATGGGTAAGGAGGTTATGCCAATTATTAAGGATAACAAACAACTAGATAGAAAATCTGATTCCCTGGAGATGAAGAGCACTATGTCAAAGTTACAAGCTCCACTTAACAAGGGTGATGGGGGTGGATCATTGCCAGATTTTGATCAGGCAAATTGGCAGTTATAT
ACACAAAATGGTGGCTTCAAGCAGTCAATGCAAAGAGCTGGGTATGCAAACAGAGAAATATATTCTGCTAATAAAACATACTGCTCTGAAACACATCTGCCAACATCTAGCTCTTTGATGATACGGAATATTTCTCCAATTTGTGATACTAGAGCTTCGGCACCTCCAGATTCACATGATGTAAGGCCATTACAATCACT
AGAAAACTACAATAATAATAGGCTAGAGAGTAATGACCCGAAGTACAATTCTTGCATTTCAAGAACTAAACCTAACACACTTGTAAAGTTAAGCTCAGCTCCATCTCGTACAAATTTTACACCTGCAGTAAACAATCTTCAAGCTAAAGTAGGCGCCCAACATAATCTCAATCGTAGTCGCTCTCTCCACACAAAGGCTA
GTTGTTCCCCTCAAATGATGCCTTCCTATCCTCCCCAAGTGAGGCCTAACTGCCCTCCCCAAGTCATCTCTAATTTTCGTATGGAACATCATGCTGGAAATAGACAAAAGTTTCCTGTTGAATTGAGAGCTACTGTGTCTGATTTTGACAAACTGGATATTTCTTCTGATTCACAGCATAGTCCCAGTATTCCATCTGGG
AATTCTAGTTTGCTTTGTATCTCACAATTCCTTCCTTCAGAACAAACAACCCAACCTCTAGGGAGTTTAGAGGCACATATTCCACCTCAAACAGAAACTTCTAGAGATGCAACACACACGTCCCCATCTAGGTTGCCACCAGCTCAACTTCCTGGATCAGATATATCTCATAGAGTTCATCTGAGGATTCTTTCTCTGGC
CATGGAAACATTGAAGCAAAATATGATGGCACCAACAAAACAAAATCTTGAAGACTGTATTTGGTATAGTGAGATGCTTCATATTCCTAATTTCAATCTTCAAGAGTGCTTGGATAAAGCTGTTGAACTAAAAGATATAGTAGTGATGAGGACAGGTGGTGTTTTTAAAATCTATCTCCCTCTTGACTCAGTTATTTGGC
AGTGTGTTGATCCACTTAGCATGCATGATAGTTATCCTAAGGAACTCTGGGATGAACTCTATAAATTCCTATCTAGCCGCAAAGGACATGAAGCTATGATTCGATCCAAAAGCAGGTATGATGCAGCACAGGAGCTGAGGAAATCTTGCCTCAAATCTCTTTTGTTAGGACAAATCATACATATGTTGCACCTTGCCATA
AACGTTAAAAAATGGTTGAGGCCACCAAATCAGGCACAATGGTCTCCATTATCCATCACCATTGGCCAGAGATCTACTGGATCAAAACCTGATGGTTATCAAGGAGGATCTCCAACCTTTTCATAGAAGTAAGAAATAGTTGTGCAAAGGAGGCACACCATAGAGGCAAAGACTCCAGTTTTAGTTGAATGTATAAGTGC
TAGTGCTAAAGATCTTGTAGAGTAGGGCATCGACAAAGGGTTCTGTGGTGTGTGTTGGTATGTTTCAGCTTCAAAGAGTTCATAACAAAGGCAGTAAGAATCATCATATTGTTTCCATGAGATACAGTGCAGAATTATTATGGATGCCAAGGGATATTTAGAAAAGAATAATATCCTTTAGGAAAACCTCTTGATAAGTT
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CAATCGAAGTTGGATTTTAGATGTGGTTCTAAATATATTATGGGGTCTTTAACCTCCAGTTTGTTTGAGGTCTTCTTATTTCCGATTTAAGGTTGGATATGACAATGTGATTTAGAATTCAAAATTTTTCCGGAATCCTTGTGCCCTTAGCTTCTTTCTGGAGAGCCTGGACAATTAGAAGGCAAATAACAATCTTCATT
TGAAAAAGCTAATATGTTGGATATTTATTTATCCATTGGGTTCTCAGCAGGTCTTCCAGGAAGAAAGAATTTTGCAAGAAAATGGGATTTCATGTTTGGACTTGGGATTTTGTTCACTGTAATTTGTGTATATTGTGGTGATTATGGCCACAATGTAAAGTTGGACTGCAGGTGGTTGTGACATTACTTCTATTGAACTT
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TATGATTCTGATAAAAGGAATCTCGGTTCTAATCTTCTTTCACTACAAATTGTCATAACAGGTTGATTCCTTTCAGAGGTTTGGCAGTTTGAATTTTCTTGATGGTTTACTTACAAACAATTGTTGATGATGTCTAGCTGTGTTCATGTCCCTGATGCAACAGAAGCCATTTTGCAGGGAATTAAGCATAAGAATATCAT
ATGCTGGTAAAAATGTTTTTTACAAATGATTTATAATGCATTTTGAATTTGGACTGATAGGTGACCCATAAAATTTTGAAACTCCTCGTCAATCTGATGATAATTTTTGAGAGGTTGAATTGCATTAGGAACAAGAATAAAGTTTTGCAATGCTTCCACATGATTAAAACTTACTGTGGTGCACAATTTATGTTGCAACC
TAAAAGTTGCCTACAATAGGATGGTGCGATGTTCCCATTCTTATGATGCTAAAATTGGTCTACAGTTTAAAGGTCATCGTCATTCTGGAAGGAAGCTGCATTATTTAAATTTGGTCTGTCTGAGCTTAGTCAATAGAAATATGGTTGCACGCGTCAAATTCTTACTACTTATATATATTGATGGAATCAGTTGTCTTGTT
CTTATATAAATACACTGCATGATAGGGATTTTGATATAATTCAGGTCTGTCACAATAGTACATGGATAATTACATTAATGGTTAGAACTTAGCATTACCAAGCTGGTTATATTTTTCTTGTTGGAATCAATTGTAATTGTTGTGAATACAATATTGTGCATAACAGGAGTTTTCCATCCATGGGTCTATCATAAAAGCAC
ATAGGTGACAGTCGGGAGTATTCATCGTTTGAAAGATGCTGGAGTTCAATTGATGGAAATATTTTGAAATTATGAGTTTGACAGCTCTCTACTATTTTGTCAATGGGGGTATTAGTTATTTCTTTTGCGGGAATCGATTTTTTCATTCTTGTGAATATGTACTGTGCATGATGGGGATTCTCCATTCATAAATCTAGTCT
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CACTTGATGGAAAGGTGGTTGCATTGTTAAAAATGTAGCTTGAGCAGGAACTTCTTGCATAGGCGAGGTGTAAATGTGCGAGAAGTTCGAAATAACTTTTAGTTCGAGAAAACCTTTTAGTGACCATTGAGTTAAACTGGAAAATAATAAAATCATTTCACTTAATAAATGGAAAATAATATCATCATTTCACTTAATAA
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CCATCTGGGAATTCTAGTTTGCTTTGTATCTCACAATTCCTTCCTTCAGAACAAACAACCCAACCTCTAGGGAGTTTAGAGGCACATATTCCACCTCAAACAGAAACTTCTAGAGATGCAACACACACGTCCCCATCTAGGTTGCCACCAGCTCAACTTCCTGGATCAGATATATCTCATAGAGTTCATCTGAGGATTCT
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