sp|Q9FN03|UVR8_ARATH ----> Ultraviolet-B receptor UVR8

Intron 1 GTTTGTTTCA ... ACATCAGCAG

Sample	Retention score (%)	Exon junction reads	5'ss reads	3'ss reads
A1	17.24	24	0	5
A2	23.53	13	6	4
A3	52.63	9	2	10
A4	15.38	11	2	2
A5	37.5	5	0	3
A6	32.88	49	0	24
A7	24.19	47	0	15
A8	32.05	53	0	25
A9	20	48	0	12
A10	18.18	45	1	10

>TRINITY_DN123635_c1_g1_i4 from sample A2 / Example spliced isoform

TCCTGTTATATTCCAAGGGTTTAATGCTGCCAGCTGGTTTCGCTTCATCTGCAGGCACTGCAGCATTATTTTGGGATCTTTGCTTCTGTAGCTTTCAGTCAAGTACGTCAATATTTGTTGAATCCGGAGATTCAGCAGAGATCGCATGTTCGAATCCGACGGAAGTCGCTTCGTCCACCAGCCTGGGCGACGGAGAACAC
CGTCGATGTGGTCTGGTATTTCAGGAAATTTGTGGACGAGAATAATCGGTGCTTTAAGTGTCCGTAACTGTGTAGGACCGTATAGGTGCAGTTTAGCACCTGCGATTTCTCTTAGTTGGCTTAGGTAATAGGTACCTCGCAAGCACATGGGGGAGCAGTCATATCAGCTGGTCGTTGTATGTTAAATCTCCGTGTTTGGC
GGCGAAAAGCCTGAGCTGGCCGTTTCTATTAAAGTCCTCTAACACTCGCAGAATGCATATATGAATGAATTTTTACAAGAAAAAGTTAAATCTCATTGAAGTTTGCGCAGACTCCTAATTGTGCTGATTCGCAGTCTGCAGAGCATTATTTTCATGGGATGTTAAGGCTGCTCAGTGCTGACTGTGCTTCATTTATAGCC
GGCGCCTTGCATTTAGTATGATTCGCTTGAACAAATAGATATTTCGTGAGTTGCACGAGTTTAGGGCTGCTGCAAAAGAAAGAAGAAAAATGGAGGTAGAAGAGGCCACGAATGATGGACAGCGTCGCAAAGTTTTGCTTCTTTCAGCTGGAGCGAGCCACACGGTTGCACTTCTCGCTGGCAATGTGGTCTGCTCATGG
GGTCGTGGAGAAGATGGACAGTTAGGCCACGGGGATGCAGAAGATCGATCTATGCCCACAATTGTAAGTGCTCTTGATGGTTGTGAAATTACCTCAGTGATTTGTGGGGCCGATCATACAACAGCATATTCAGACTCAAGGCTGGTGGCTTACAGTTGGGGTTGGGGAGATTTTGGAAGGCTTGGACATGGAAACTCTAG
TGATTTATTTATTCCACACGCAATCAAGACCCTACAAGGACTTCAGATCAAGCAAATAGCATGTGGGGATTGTCATTGTCTTGCTGTTACAATAAATGGGGAGGTGCAGAGTTGGGGACGCAATCAAAATGGGCAGCTTGGTCTTGGAAACATTGAAGACTCCCTTGTGCCTCAGAAGATTCACGGTTTCCAGGGAATAG
CAGTAAAGATGGTAGCAGCGGGTGCTGAACATACAGTTGCTGTAACAGAGGATGGGAAGCTTTATGGGTGGGGCTGGGGTCGCTATGGAAACTTAGGTCTAAATGACAGAAAAGATCGGCTGGTTCCAGAGGAAGTGGCTGCTATAAATGGAGAGAAGCTAAGCATGGTAGCTTGTGGATGGCGCCACACTATTGCAATC
TCAGATTCTGGTAGTTTGTACACATATGGTTGGAGTAAGTATGGACAGCTGGGTCATGGTGATAATGAAGATCATCTTGTTCCATGCCGTGTCAAGGGCTTAAGGAATGCTCACATAACTCAGATATCTGGGGGTTGGCGACATACAATGGCTTTGGATGTAGAGGGACAACTTTATAGTTGGGGATGGAATAAGTTTGG
CCAGCTGGGTGTTGGAGATAATATTGATCACTCCAGTCCACAGAGAGTGAAGCTTGCTGCTGAAGAGAAAGTTGTACAGGTTTCTTGTGGATGGAGACATACAGTTGCAATTACAGACAATAGTAATGTATTCTCCTGGGGCAGGGGCACAAGTGGCCAGCTAGGACATGGAGACATTGTTGACAGAAATATGCCTGAAC
TCATAGAGGCCTTGAGCATGGATGGCTCAGCATGTCAGCAAATTCAAACCTCTAAAACAACAGTTCTATCAGGATCAAGTTGGATATCGCCATCAGAGAGATACGCAGTTGTCCCAGATGAAACTGGTACTGGTAAACTTTCTGCTGCCCTTGAGAGCTCTGTCACTGATGCTAGTGTTCCAGATGGTGATGTTAAGCGT
GTGCGAACAGGATAGTAAACGAATAAGCAGTGTTGCTTGTTTACTATGAAAAATGTGACTTGTTTCAGGTTATTTCTGGAAGTGTTTGTAATTATAAAACATGAGATGTATAAGACTGAATAATGCACTTGGAGTTAATCAAATATGACAGTTTTAGAGCGAATATTTATTCCCATGTGGCAAAACCTTTCAGGTGCAAG
TGATAGCACATGCATCTAAATGTACGTAAGACTTTAAACTTGCGTGCATTCATTTGGAGCTTAAGAACCAATCCTTGTGACTTTTACCAAACATTGCATGAAACTGAAGATGCTGCAAAATTTAAATTATAG

>TRINITY_DN123635_c1_g1_i6 from sample A2 / Example unspliced isoform:

CTTCCATACAACTTTCGGATCTGAAAAGCACGTGATATCATTTTGATATGAGTGGGATTTATTTGATCAAGGTGTTATTTACAATTTTTGTGCAACACTTTATTAATGCTCAGTTATTTGATGTATTCCAATGAGTATGCAGAAATATGCCTGAACTCATAGAGGCCTTGAGCATGGATGGCTCAGCATGTCAGCAAATT
CAAACCTCTAAAACAACAGTTCTATCAGgtttgtttcaggccttggatgagcttattgtaaatcttttgtcgacgagaaaatgagtttgtctttgtttgcatcacaatgaggtcgtatcacaatgtttaccttttcttgttttactgaaaatctgattacatcagcagGATCAAGTTGGATATCGCCATCAGAGAGATAC
GCAGTTGTCCCAGATGAAACTGGTACTGGTAAACTTTCTGCTGCCCTTGAGAGCTCTGTCACTGATGCTAGTGTTCCAGATGGTGATGTTAAGCGTGTGCGAACAGGATAGTAAACGAATAAGCAGTGTTGCTTGTTTACTATGAAAAATGTGACTTGTTTCAGGTTATTTCTGGAAGTGTTTGTAATTATAAAACATGA
GATGTATAAGACTGAATAATGCACTTGGAGTTAATCAAATATGACAGTTTTAGAGCGAATATTTATTCCCATGTGGCAAAACCTTTCAGGTGCAAGTGATAGCACATGCATCTAAATGTACGTAAGACTTTAAACTTGCGTGCATTCATTTGGAGCTTAAGAACCAATCCTTGTGACTTTTACCAAACATTGCATGAAAC
TGAAGATGCTGCAAAATTTAAATTATAG

Intron 2 GCATGTCTTT ... TAAATTGCAG

Sample	Retention score (%)	Exon junction reads	5'ss reads	3'ss reads
A1	21.46	18.3	5	5
A2	33.93	12.7	9	4
A3	50	2	2	2
A4	26.23	12.7	3	6
A5	19.53	22.7	1	10
A6	1.13	43.7	0	1
A7	12.09	83.7	12	11
A8	20.33	33.3	4	13
A9	15.31	55.3	5	15
A10	11.23	27.7	1	6

>TRINITY_DN123984_c8_g1_i1 from sample A1 / Example spliced isoform

TTTGGGTAGGGAGAGAAGCTAAGCATGGTAGCTTGTGGGTGGCGCCACACTATTGCAATCTCAGATTCTGGTAGTTTGTACACATATGGTTGGAGTAAGTATGGACAGCTGGGTCATGGTGATAATGAAGATCATCTTGTTCCATGCCGTGTCAAGGGCTTAAGGAATGCTCACATAACTCAGATATCTGGGGGTTGGCG
ACATACAATGGCTTTGGATGTAGAGGGACAACTTTATAGTTGGGGATGGAATAAGTTTGGCCAGCTGGGTGTTGGAGATAATATTGATCACTCCAGTCCACAGAGAGTGAAGCTTGCTGCTGAAAAGAAAGTTGTACAGGTTTCTTGTGGATGGAGACATACAGTTGCAATTACAGACAATAGTAATGTATTCTCCTGGG
GCAGGGGCACAAGTGGCCAGCTAGGACATGGAGACATTGTTGACAGGATAATATTGATCACTCCAGTCCACAGAGAGTGAAGCTTGCTGCTGAAGAGAAAGTTGTACAGGTTTCTTGTGGATGGAGACATACAGTTGCAATTACAGACAATAGTAATGTATTCTCCTGGGGCAGGGGCACAAGTGGCCAGCTAGGACATG
GAGACATTGTTGACAGAAATATGCCTGAACTCATAGAGGCCTTGAGCATGGATGGCTCAGCATGTCAGCAAATTCAAACCTCTAAAACAACAGTTCTATCAGGATCAAGTTGGATATCGCCATCAGAGAGATATGCAGTTGTCCCAGATGAAACTTGGGCGGAAAAGTGAGTTTTAAAGGATGCGGGCTCCCTTTTTTGT
GGTTCATTTGGATACTACAGCCAGGGAGAGGAGAGCCAAGGAGACTAGGAGAACTTTTAGTTTGCCCAAGGAGGA

>TRINITY_DN123984_c8_g1_i6 from sample A1 / Example unspliced isoform:

TTTGGGTAGGGAGAGAAGCTAAGCATGGTAGCTTGTGGGTGGCGCCACACTATTGCAATCTCAGATTCTGGTAGTTTGTACACATATGGTTGGAGTAAGTATGGACAGCTGGGTCATGGTGATAATGAAGATCATCTTGTTCCATGCCGTGTCAAGGGCTTAAGGAATGCTCACATAACTCAGATATCTGGGGGTTGGCG
ACATACAATGGCTTTGGATGTAGAGGGACAACTTTATAGTTGGGGATGGAATAAGTTTGGCCAGCTGGGTGTTGGAGATAATATTGATCACTCCAGTCCACAGAGAGTGAAGCTTGCTGCTGAAAAGgcatgtcttttgtgtgtgttcattgatgttgtgttgacaggatattgtaggcaccaatggcttgtattccatt
atgtggtggctacttgattaattcttctggtttgcttatttctccctggactttctggttagaaggttaactttgtactgttattcaaaagctaacgaattagatcatttaaattgcagAAAGTTGTACAGGTTTCTTGTGGATGGAGACATACAGTTGCAATTACAGACAATAGTAATGTATTCTCCTGGGGCAGGGGC
ACAAGTGGCCAGCTAGGACATGGAGACATTGTTGACAGGTGAAGCCAAATGCTAATATGCACATTTATATGTTTCTTTCCATCTATAGGTAGAATTTTCCCATTCGATATTAGATGTCTTGAACTGAATCCTTCTAAGTGTGAAGAAAAGGCCACACATTATCAATAGAAATCTCTGTGAGATAATATTGATCACTCCAG
TCCACAGAGAGTGAAGCTTGCTGCTGAAGAGAAAGTTGTACAGGTTTCTTGTGGATGGAGACATACAGTTGCAATTACAGACAATAGTAATGTATTCTCCTGGGGCAGGGGCACAAGTGGCCAGCTAGGACATGGAGACATTGTTGACAGAAATATGCCTGAACTCATAGAGGCCTTGAGCATGGATGGCTCAGCATGTC
AGCAAATTCAAACCTCTAAAACAACAGTTCTATCAGGATCAAGTTGGATATCGCCATCAGAGAGATATGCAGTTGTCCCAGATGAAACT