sp|Q9LKA4|UBA2C_ARATH ----> UBP1-associated protein 2C

Intron 1 GTAAGCCCTA ... TTGTGAATAG

Sample	Retention score (%)	Exon junction reads	5'ss reads	3'ss reads
A1	38.34	119.5	84.5	62
A2	32.66	149.5	74.5	69
A3	36.27	138	120	34
A4	36.16	119.5	106	25
A5	35.92	65.5	55.5	17
A6	32.56	594	366	201
A7	32.45	731	392	306
A8	33.53	586	327	257
A9	33.51	726.5	449	274
A10	33.7	583.5	364	221

>TRINITY_DN116075_c2_g1_i6 from sample A2 / Example spliced isoform

AGAACATTAACATGCGCTCGGCTTAAAGACACTTTAAATAGTGTTGCCTATTACCCTTCATAATTGGAGGCTATTTCATTGTCAGCACGGCAGGATATGGAGCGCTAGAACGGAAATCATATATCGAACGAGTACCCATTAAAACCGTCCGCTAAGTTATTGATCTCGGCCATGGTCTTCTGCAAATCGGGAGCAAATCC
TTAGCATCTGCCCATGATAAAACCTCGGGTTAATTTGTTGTAATCAGAATTTATGGCCAGGATAGCTACCGCAGCTGTTAAACTTCAAGATATTGCCAAGACTGGCAATGTGGCTGAAGCTGTTGTAAAAGTAAAGAAAACTGCTAAGATTGTTGACAACATAGTTGCTACCTCAAGTATTAACATGAAGATGCAGAGTG
GAGAGGAACAAAATAGGATGCCTTTAAAGGAAGTAGTTGCAGATTGTGCAAGGCGCTGGTTTCAAGATAGTTTGAAGGAAGCTAAAGCTGGTGATACAGGAATGCAAGTTCTTGTTGGGCAAATGTATTGCAGTGGCTATGGTGTTCACCGCGATGTACAAAGGGGAAAAGCATGGTTTCAGAAAGCTGCAAAGTCTCGA
TCACGGGTCATGAGTTTAATAACAAAGCGACCAGGGTACAATGCGAGTGAGTCAGATTCAGATGATCATAAGGATCACCCAAAGTAATAGAAATAATGAGAGATATGATATAAATAAGTCAGTGACTCAATAATGATTTACATGCATTTAAATCTTATACTATGGGCTCTTCCCTTTTTTAAGAAATAAAGATTTTGTTT
TCACCTCATTCATGAACCAAACTACTATTTTCCATTATTTGCTATTTTCCTGGAAACCCTGGTTCACAGAGTCATACAGTTATAATTTTCACCTTTAAACGAAACTGAAATAAACTTTTTTCTTTATATTTGCAGCAAATGTTGCTGTGTGACAGTCACACATGTTATTTCAATTACATATTGTGTTGACTTTATAGTTC
C

>TRINITY_DN116075_c2_g1_i7 from sample A2 / Example unspliced isoform:

AGAACATTAACATGCGCTCGGCTTAAAGACACTTTAAATAGTGTTGCCTATTACCCTTCATAATTGGAGGCTATTTCATTGTCAGCACGGCAGGATATGGAGCGCTAGAACGGAAATCATATATCGAACGAGTACCCATTAAAACCGTCCGCTAAGTTATTGATCTCGGCCATGGTCTTCTGCAAATCGGGAGCAAATCC
TTAGCATCTGCCCATGATAAAACCTCGGgtaagccctaattctagggttttctacttcagcaatttgtttgtttttgctgtctttcctttgctgcgaatctgttgttgttgatggatgcgacgaggatgaagaattcccgcagagaaaattactgaagatccgaagttctttcatcaatttaatggcaatttggaaaaag
ccagaaagtggattctaggccttctgattcatttccttctcaagctatcaatgaatacatgtttgcaagagtttgtgaatagGTTAATTTGTTGTAATCAGAATTTATGGCCAGGATAGCTACCGCAGCTGTTAAACTTCAAGATATTGCCAAGACTGGCAATGTGGCTGAAGCTGTTGTAAAAGTAAAGAAAACTGCTA
AGATTGTTGACAACATAGTTGCTACCTCAAGTATTAACATGAAGATGCAGAGTGGAGAGGAACAAAATAGGATGCCTTTAAAGGAAGTAGTTGCAGATTGTGCAAGGCGCTGGTTTCAAGATAGTTTGAAGGAAGCTAAAGCTGGTGATACAGGAATGCAAGTTCTTGTTGGGCAAATGTATTGCAGTGGCTATGGTGTT
CACCGCGATGTACAAAGGGGAAAAGCATGGTTTCAGAAAGCTGCAAAGTCTCGATCACGGGTCATGAGTTTAATAACAAAGCGACCAGGGTACAATGCGAGTGAGTCAGATTCAGATGATCATAAGGATCACCCAAAGTAATAGAAATAATGAGAGATATGATATAAATAAGTCAGTGACTCAATAATGATTTACATGCA
TTTAAATCTTATACTATGGGCTCTTCCCTTTTTTAAGAAATAAAGATTTTGTTTTCACCTCATTCATGAACCAAACTACTATTTTCCATTATTTGCTATTTTCCTGGAAACCCTGGTTCACAGAGTCATACAGTTATAATTTTCACCTTTAAACGAAACTGAAATAAACTTTTTTCTTTATATTTGCAGCAAATGTTGCT
GTGTGACAGTCACACATGTTATTTCAATTACATATTGTGTTGACTTTATAGTTCC