sp|F4INA9|RECG_ARATH ----> ATP-dependent DNA helicase homolog RECG, chloroplastic
Intron 1 GTGGACTGTT ... CTTAATCCAG
| Sample | Retention score (%) | Exon junction reads | 5'ss reads | 3'ss reads |
| A1 | 43.75 | 9 | 8 | 6 |
| A2 | 50 | 3 | 3 | 3 |
| A3 | 42.86 | 10 | 9 | 6 |
| A4 | 53.19 | 11 | 10 | 15 |
| A5 | 33.33 | 2 | 0 | 2 |
| A6 | 45.45 | 3 | 2 | 3 |
| A7 | 50 | 1 | 1 | 1 |
| A8 | 45.45 | 3 | 3 | 2 |
| A9 | 41.18 | 10 | 4 | 10 |
| A10 | 48.15 | 7 | 6 | 7 |
>TRINITY_DN125323_c0_g1_i5 from sample A1 / Example spliced isoformTTGGGGTTATTGTACCAAAGGTATGCAGTGGCAGGCACATATATCAAAACTGGCGGTTTGCCCGAGAAGTCAACAGGGCTTGAAGTTGGAAGTATTGGTGTAGATAAATGGTCACAACTGACTTTGAAAGTGCTGAAATCACTTCCTTTTGCACTTACCAGTGCTCAGTTGAAAGCAGTTTCGGAAATCATTTGGGACCT
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GCAAGCTCATTTTGCAGCATTGGACATTCTTGAACAGCACCCTTGCTTGGACAACGTACCCATGCTCAAAGCCGAAATCAGTATGCGACATCCTCTCAATTCACTTGGTGCATAGGCTTCCTTGGAGCTAGTTTGTAAATCTGCAATTGTTGGCAAAGTGGGATGACAACTACGAAGTAGTTTCTCTACTTTGTATTCCA
GTTATATTGGTTTTTGGGAGAATCATTTTGTAGCCCATGTACAGCTTTGTACCATGTTTAGAGCCATGTGTTAAACAAAATTGTTATTTCTTCATCATTCTTCAGGTAATGGAAAATGTCATTTCGATATTCAAAGGGAAAG
>TRINITY_DN125323_c0_g1_i7 from sample A1 / Example unspliced isoform:GACAAGTTGAAGAAGTAGAGGGGGAACATTTTCCTTCAACTGCTCTCCTCGTGGTTTGCAACGGCACTGGTTTGGATCAGGCTACCACTGGAAGGATTATCGTATCTTTTCCACAAAATTAACATTTCGCCCATGGTTTTGTTGAATAGAAGGTCCCTGGCGTCAGAATAAAGGCCATTCGTTAACTGCAGGGCGTAGTA
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GGAACAAAAGGGAAGGTTTAGTAGCAAGGCTTGCACAGTTATGGCCAAGTCAGGTGCAAATGGCATTAAGTTGGAAGATGGGCAATTGGTTGCAAATAAGACATTCTTTGCTCCACATGTTCTTGTCATGTCCGCCACTCCAATTCCTAGGACCCTGGCTTTAGCTCTTCATGGAAATATGTCACTCAGTAAGATAAATG
AACTTCCGCCAGGTCGAATTCCTGTGAAAACACGTGCTCTCCATGGCAACAAAAAGGGTCTCATTAAAACCTATGAGATGGTCCAGAAAGAGCTTGACAGTGGGGGAAGAGTTTTTCTTGTTTACCCAGCAATAGATGAAAGTGAACAGCTTCCAGAACTTCATGCAGCTGCTGCAGAAATAAAGAAAATATCTGAAGTC
TTTAAGGGTTATAAATGTGGCCTTCTCCATGGTCGTATGAAATCTACTGAAAAAGAAGAAGCAATTCAACAGTTTAAAGAAGGAAAGACACAAGTTTTGCTCTCAACCCAAGTGGTTGAGGTTGGAATTGACATTCCGGAGGCAACAATGATGGTAGTTATGAATGCTGAGAGATTTGGATTAGCACAACTGCATCAGTT
CAGAGGTCGTGTTGGAAGGGGCACTGGGAAATCTTCTTGTATACTTGTCTCATCCTCTGTGCATGCATTACCACGGTTGAAAATATTGCAGCAGTCAATGGATGGCTTTGAATTGGCAGAAGCAGACCTCCATCTCCGTGGCCCTGGAAGCTTGCTTGGCACACGACAGTCAGGACACCTTCCAGAATTTTCTATTGCTC
GGCTTCAGACTGATGGTGATATTCTTGAGCAAGCTCATTTTGCAGCATTGGACATTCTTGAACAGCACCCTTGCTTGGACAACGTACCCATGCTCAAAGCCGAAATCAGTATGCGACATCCTCTCAATTCACTTGGTGCATAGGCTTCCTTGGAGCTAGTTTGTAAATCTGCAATTGTTGGCAAAGTGGGATGACAACTA
CGAAGTAGTTTCTCTACTTTGTATTCCAGTTATATTGGTTTTTGGGAGAATCATTTTGTAGCCCATGTACAGCTTTGTACCATGTTTAGAGCCATGTGTTAAACAAAATTGTTATTTCTTCATCATTCTTCAGGTAATGGAAAATGTCATTTCGATATTCAAAGGGAAAG