sp|Q5QMN3|RH20_ORYSJ ----> DEAD-box ATP-dependent RNA helicase 20

Intron 1 GTACAGTTGC ... TCTCTGCTAG

Sample	Retention score (%)	Exon junction reads	5'ss reads	3'ss reads
A1	37.98	178	109	7
A2	32.83	133	65	8
A3	29.69	161	68	1
A4	29.17	102	42	2
A5	27.19	83	31	3
A6	21.22	750	202	35
A7	23.08	650	195	22
A8	18.36	773.5	174	26
A9	21.98	685	193	29
A10	22.75	438	129	19

>TRINITY_DN44349_c0_g1_i3 from sample A6 / Example spliced isoform

AAACTTCGTATGGATGGATGACTAGCACTATCAATTCATGGAGATAAAATCCAAGCCGAGAGAGACTGGGTCTTATCAGAATTTAGGGCTGGCAAGAGCCTTATTATGACTGCTACAGATGTTGTTGCACGAGGCTTGGATGTTAAGGACATAAAATGCGTTATAAACTATGATTTTCCTGGCTCCATGGAGGATTATGT
GCATCGTATTGGTCGTACTGGCCGAGCAGGTGCCAAGGGAAAGGCATATACATCACCGCTGCAAATGCAAGGTTTGCCAAAGATCTCATAAAAATCCTTCAAGAAGCAGGGCAATCTATTAGCCCCAGTTTGGCTGAAATGGGTCGTAGCTCCGCAGCTAGTGGAGGTTATGGAGGGTTTCGGGACCGTGGAAGAGGTTC
TGGAAATATGCCATGGGGAAGATAGAGCTATTCCTGTCTTCTATGCAAATGATGGATGATAGGTCGTTGTGTCCTGTTAAGCGGTTCATTTAAATATTCTGTAACATAATAATTTTGAAATTAAGCGGTTCATTTATAGATCTGTATTTATTTGGGTGACTCATTATTTATGTTTGCAAATTTAGCAATGTTGTCGTTTG
ATGCATTTGATTGATTGCGTTATCATTATTTTTAATGCAATTGCATTCAATAATGTTAATTGGGATTTTAAATAGATTTATCCAAGTTCAAAAACCCATTACCTGACAGGACGAAAACACTATAATAATACACATCAGTTTTAATGCTCG

>TRINITY_DN44349_c0_g1_i4 from sample A6 / Example unspliced isoform:

GGTGGATATGCGCAACATGGGTGTTAGTGAGGAAGCCCTCTTTCTTTACTACCAAATGTTGTGGTGCTAAGAAATTAAACCCTATAGAGACACATTTATGAGCACTCTTGGGATAGGTACTGGTCTAGCCTTCATTGAAAGGGGTAACCTAACGAAGTCCATACCCACATTATTAGAATTGGGACTAACTCAGAAATAGT
GCTGGAGAATGCACTTATTGACATGTTTGCCAAATGTGCGAGTATGGAGGATGCATGCAAAGTGTTTGACATAATGCTTCGAAGGGATGTGGTTTCCTGGACTGCGATTATTGTAGCGTATGCACATGCGGGTCAGGGAGAGAAGGTTGTTGCATGCTTCTCTGAAATGCAAGTCTCAGATACCAAGCCCAATCAGTTCA
CTATTTCCTGTGATCTCAAGGCATGTTCGGCTACATCGTCTCTTGAATAGGATGTTAAGGACATAAAATGCGTTATAAACTATGATTTTCCTGGCTCCATGGAGGATTATGTGCATCGTATTGGTCGTACTGGCCGAGCAGGTGCCAAGGGAAAGGCATATACATCACCGCTGCAAATGCAAGGTTTGCCAAAGATCTCA
TAAAAATCCTTCAAGAAGCAGGGCAATCTATTAGCCCCAGTTTGGCTGAAATGGGTCGTAGCTCCGCAGCTAGTGGAGgtacagttgcaggcctcgctctattgttttgacataagattggtgtttcttttaataattcatcattggatagatggatgtttagctgactacataattctctgctagGTTATGGAGGGTTT
CGGGACCGTGGAAGAGGTTCTGGAAATATGCCATGGGGAAGATAGAGCTA