sp|Q948X8|MTNA_TOBAC ----> Methylthioribose-1-phosphate isomerase

Intron 1 GTGGTGAAAC ... GCATGAGCAG

Sample	Retention score (%)	Exon junction reads	5'ss reads	3'ss reads
A1	23.53	65	0	20
A2	12.07	51	0	7
A3	25.45	41	0	14
A4	17.54	47	0	10
A5	25	21	0	7
A6	22.22	126	1	36
A7	16.28	144	0	28
A8	16.67	175	0	35
A9	17.86	207	0	45
A10	22.92	111	0	33

>TRINITY_DN45261_c2_g1_i1 from sample A6 / Example spliced isoform

GGATCAGATGGGTTTGCAAATACTATACATTCATTCGCATTTATTTGTTCCATTCTGGCGTCCAGACAACGTGAGCCTAATTAGTCTCGACTCTCGAGTGACTGAGACGCTAGGCCAAAGGCCAAAGTTCCTTCATCTTCATCGTCAGCACTTGTTTAAACAAAACCTGACAGCTTGACTGACGAAGTTAAATATTTGTA
GGCAGACATTTGGATTCCAACATCCAAGTCTAAAGAAACAATCCTCCAAGAGCCTCAAACCCCGCTGAAGATCTCCAAAATGGCCGCTGAATTGAAGCAAAACGGGGAGGAGAATACTCTGCAGTCAATTCGATATTCGAGGGGTCGCTTGCAGCTTCTGGACCAGAGAAAGCTACCCCATGATTCGGTTTATATTGACA
TTCAAGATTCTACAGCAGGATGGCATGCTATACACGATATGGTGGTTCGCGGTGCACCTGCAATTGCTATATCAGCTGCGCTTTCACTAGCAGTAGAGGTTGCTAATTTGGGTCCTGTGGATTGGAGTGTGAACGATGCTATCTCATTTTTGCAAAAGCGTTTAGAATTCCTTGTTTCTAGCCGTCCAACAGCAGTCAAT
CTGTCAGATGCTGCCACAAAGTTGAATGATGTGGTGTTAAAGGCAACCAATGATATGTCCAAACCTGAAACTATTTTTCAGGCATATATTGAAGCTGCTGAAGTTATGCTTATAGATGATATCAATTCCAACAAAGCAATTGGTTCAAATGGGGCAAAGTTTATCCTAAGTCAAACCCAAAAGTGTCACAACCTTCATGT
TTTGACTCATTGCAACACAGGAAGCCTTGCAACAGCTGGATATGGTACTGCCCTTGGTGTCATTCGTGCCTTACATGCAGACGGATTGCTGGAAACTGCTTTTTGCACAGAAACCCGACCATATAACCAGGGGTCGAGGCTTACTGCATATGAACTGATCCATGATCATATACCAGCAGTGCTTATAGCAGATTCTGCAG
CTGCTGCATTACAAAAATCAGGTCGCGTGGATGCAATAGTTGTTGGGGCAGACAGAATTGCTGAAAATGGTGATACAGCCAACAAGATAGGAACATATAATCTGGCACTATCAGCTTTCCACCATGGTATACCGTTTTATGTAGCTGCTCCTTTGACCTCAGTTGATCTGTCTCTTTCCTCTGGTGAGAAAATAATAATT
GAGGAGAGGTCACCAAAGGAATTAACTCATGCTCTTGGAGGCCAAGGGCAGCAGGTAGCTCCATCTGGGATCTCTGTTTGGAACCCTGCATTTGATGTCACTCCTGCAAATCTTATTACAGCTATTATTACTGAAAAGGGTGTCATTACAAAGAAGGATGCAAGCACTACTTTTGACATAAAGGGATTTGTAGAGAGTTT
AACAGTACCTTTGACAAAGGAAACAAACATATGATGACTGCTTAATGTAATATTTCAAGCACTTTTAAACTCATTTTTTCAAAGAGGAGGAATGTATCAGAGACTTGACAATAGCAGCTTGTTAGTCATAAGTAGCAATATTGAGAAGCACTACTCTTCTTACAATTGCTAATGTTATGTGAAATTTCCAGAGTGCTGTA
GAATGTAGAATGCAAAGCATTCAAAAAGGTTACTCAACATTTTCTGGGTATTTGTTATTTTTGATTGGTATACATTCTCTCTTTCACATTTGAGGTCCAACTTACAACTCTGTGCATATGTTGTGACCCTGTTCACTAGATCTAGAGGGTTGTTGATTGGGATTTAATGACAAGTTCCATGATCAACTCAATAACTCCAC
ACTTGTAAAAGAGAGAGAGACATCAAGAATATATGGAAGGTAATCAAAATTAC

>TRINITY_DN45261_c2_g1_i3 from sample A6 / Example unspliced isoform:

TTGACTCATTGCAACACAGGAAGgtggtgaaactcctgaaatatgcttgatgcttgatgtatgtattttcttattctctttttatgatgatcatccaacttgctaatgtgttagtgcatgagcagCCTTGCAACAGCTGGATATGGTACTGCCCTTGGTGTCATTCGTGCCTTACATGCAGACGGATTGCTGGAAACTGC
TTTTTGCACAGAAACCCGACCATATAACCAGGGGTCGAGGCTTACTGCATATGAACTGATCCATGATCATATACCAGCAGTGCTTATAGCAGATTCTGCAGCTGCTGCATTACAAAAATCAGGTCGCGTGGATGCAATAGTTGTTGGGGCAGACAGAATTGCTGAAAATGGTGATACAGCCAACAAGATAGGAACATATA
ATCTGGCACTATCAGCTTTCCACCATGGTATACCGTTTTATGTAGCTGCTCCTTTGACCTCAGTTGATCTGTCTCTTTCCTCTGGTGAGAAAATAATAATTGAGGAGAGGTCACCAAAGGAATTAACTCATGCTCTTGGAGGCCAAGGGCAGCAGGTAGCTCCATCTGGGATCTCTGTTTGGAACCCTGCATTTGATGTC
ACTCCTGCAAATCTTATTACAGCTATTATTACTGAAAAGGGTGTCATTACAAAGAAGGATGCAAGCACTACTTTTGACATAAAGGGATTTGTAGAGAGTTTAACAGTACCTTTGACAAAGGAAACAAACATATGATGACTGCTTAATGTAATATTTCAAGCACTTTTAAACTCATTTTTTCAAAGAGGAGGAATGTATCA
GAGACTTGACAATAGCAGCTTGTTAGTCATAAGTAGCAATATTGAGAAGCACTACTCTTCTTACAATTGCTAATGTTATGTGAAATTTCCAGAGTGCTGTAGAATGTAGAATGCAAAGCATTCAAAAAGGTTACTCAACATTTTCTGGGTATTTGTTATTTTTGATTGGTATACATTCTCTCTTTCACATTTGAGGTCCA
ACTTACAACTCTGTGCATATGTTGTGACCCTGTTCACTAGATCTAGAGGGTTGTTGATTGGGATTTAATGACAAGTTCCATGATCAACTCAATAACTCCACACTTGTAAAAGAGAGAGAGACATCAAGAATATATGGAAGGTAATCAAAATTAC

Intron 2 GTATGCTCAT ... TTGTCAATAG

Sample	Retention score (%)	Exon junction reads	5'ss reads	3'ss reads
A1	23.71	74	21	25
A2	20.86	55	10	19
A3	27.04	58	32	11
A4	29.09	39	16	16
A5	23.4	18	2	9
A6	25.98	218	49	104
A7	25.08	248	51	115
A8	21.82	243.5	44	92
A9	24.77	246	46	116
A10	23.54	229	41	100

>TRINITY_DN102412_c4_g1_i5 from sample A4 / Example spliced isoform

ATTCAACCTCAAAAAAACGTGGAATCCCCACTCACATCATCCATGCGTGTATCCGACCTGGGATTAGGATCAGATGGGTTTGCAAATACTATACATTCATTCGCATTTATTTGTTCCATTCTGGCGTCCAGACAACGTGAGCCTAATTAGTCTCGACTCTCGAGTGACTGAGACGCTAGGCCAAAGGCCAAAGTTCCTTC
ATCTTCATCGTCAGCACTTGTTTAAACAAAACCTGACAGCTTGACTGACGAAGTTAAATATTTGTAGGCAGACATTTGGATTCCAACATCCAAGTCTAAAGAAACAATCCTCCAAGAGCCTCAAACCCCGCTGAAGATCTCCAAAATGGCCGCTGAATTGAAGCAAAACGGGGAGGAGAATACTCTGCAGTCAATTCGAT
ATTCGAGGGGTCGCTTGCAGCTTCTGGACCAGAGAAAGCTACCCCATGATTCGGTTTATATTGACATTCAAGATTCTACAGCAGGATGGCATGCTATACACGATATGGTGGTTCGCGGTGCACCTGCAATTGCTATATCAGCTGCGCTTTCACTAGCAGTAGAGGTTGCTAATTTGGGTCCTGTGGATTGGAGTGTGAAC
GATGCTATCTCATTTTTGCAAAAGCGTTTAGAATTCCTTGTTTCTAGCCGTCCAACAGCAGTCAATCTGTCAGATGCTGCCACAAAGTTGAATGATGTGGTGTTAAAGGCAACCAATGATATGTCCAAACCTGAAACTATTTTTCAGGCATATATTGAAGCTGCTGAAGTTATGCTTATAGATGATATCAATTCCAACAA
AGCAATTGGTTCAAATGGGGCAAAGTTTATCCTAAGTCAAACCCAAAAGTGTCACAACCTTCATGTTTTGACTCATTGCAACACAGGAAGCCTTGCAACAGCTGGATATGGTACTGCCCTTGGTGTCATTCGTGCCTTACATGCAGACGGATTGCTGGAAACTGCTTTTTGCACAGAAACCCGACCATATAACCAGGGGT
CGAGGCTTACTGCATATGAACTGATCCATGATCATATACCAGCAGTGCTTATAGCAGATTCTGCAGCTGCTGCATTACAAAAATCAGGTCGCGTGGATGCAATAGTTGTTGGGGCAGACAGAATTGCTGAAAATGGTGATACAGCCAACAAGATAGGAACATATAATCTGGCACTATCAGCTTTCCACCATGGTATACCG
TTTTATGTAGCTGCTCCTTTGACCTCAGTTGATCTGTCTCTTTCCTCTGGTGAGAAAATAATAATTGAGGAGAGGTCACCAAAGGAATTAACTCATGCTCTTGGAGGCCAAGGGCAGCAGGTAGCTCCATCTGGGATCTCTGTTTGGAACCCTGCATTTGATGTCACTCCTGCAAATCTTATTACAGCTATTATTACTGA
AAAGGGTGTCATTACAAAGAAGGATGCAAGCACTACTTTTGACATAAAGGGATTTGTAGAGAGTTTAACAGTACCTTTGACAAAGGAAACAAACATATGATGACTGCTTAATGTAATATTTCAAGCACTTTTAAACTCATTTTTTCAAAGAGGAGGAATGTATCAGAGACTTGACAATAGCAGCTTGTTAGTCATAAGTA
GCAATATTGAGAAGCACTACTCTTCTTACAATTGCTAATGTTATGTGAAATTTCCAGAGTGCTGTAGAATGTAGAATGCAAAGCATTCAAAAAGGTTACTCAACATTTTCTGGGTATTTGTTATTTTTGATTGGTAACTTTCTGTATTTCTAATTGGCCCGTAGGATGATCCTTTGAACATTAATCAATATGCTCCTTTT
ATTCTGCTACATTTCTAAGTCCGGTTCACTTTTTGAATTATACCTTCCTGAAGGAAAGATAATTGGTAAATCT

>TRINITY_DN102412_c4_g1_i4 from sample A4 / Example unspliced isoform:

ATTCAACCTCAAAAAAACGTGGAATCCCCACTCACATCATCCATGCGTGTATCCGACCTGGGATTAGGATCAGATGGGTTTGCAAATACTATACATTCATTCGCATTTATTTGTTCCATTCTGGCGTCCAGACAACGTGAGCCTAATTAGTCTCGACTCTCGAGTGACTGAGACGCTAGGCCAAAGGCCAAAGTTCCTTC
ATCTTCATCGTCAGCACTTGTTTAAACAAAACCTGACAGCTTGACTGACGAAGTTAAATATTTGTAGGCAGACATTTGGATTCCAACATCCAAGTCTAAAGAAACAATCCTCCAAGAGCCTCAAACCCCGCTGAAGATCTCCAAAATGGCCGCTGAATTGAAGCAAAACGGGGAGGAGAATACTCTGCAGTCAATTCGAT
ATTCGAGGGGTCGCTTGCAGCTTCTGGACCAGAGAAAGCTACCCCATGATTCGGTTTATATTGACATTCAAGATTCTACAGCAGGATGGCATGCTATACACGATATGGTGGTTCGCGGTGCACCTGCAATTGCTATATCAGCTGCGCTTTCACTAGCAGTAGAGGTTGCTAATTTGGGTCCTGTGGATTGGAGTGTGAAC
GATGCTATCTCATTTTTGCAAAAGCGTTTAGAATTCCTTGTTTCTAGCCGTCCAACAGCAGTCAATCTGTCAGATGCTGCCACAAAGTTGAATGATGTGGTGTTAAAGGCAACCAATGATATGTCCAAACCTGAAACTATTTTTCAGGCATATATTGAAGCTGCTGAAGTTATGCTTATAGATGATATCAATTCCAACAA
AGCAATTGGTTCAAATGGGGCAAAGTTTATCCTAAGTCAAACCCAAAAGTGTCACAACCTTCATGTTTTGACTCATTGCAACACAGGAAGCCTTGCAACAGCTGGATATGGTACTGCCCTTGGTGTCATTCGTGCCTTACATGCAGACGGATTGCTGGAAACTGCTTTTTGCACAGAAACCCGACCATATAACCAGGGGT
CGAGGCTTACTGCATATGAACTGATCCATGATCATATACCAGCAGTGCTTATAGCAGATTCTGCAGCTGCTGCATTACAAAAATCAGGTCGCGTGGATGCAATAGTTGTTGGGGCAGACAGAATTGCTGAAAATGgtatgctcatagaaatgttgatataatattgtaatctcttcttgtaggttattttaaattgaaac
ttttgacctggatcagatcaagatgttcagtagagtattattcaactaaattcaaagggcaaatacctactcccagttaacatatgctaacttaataccatattgtcaatagGTGATACAGCCAACAAGATAGGAACATATAATCTGGCACTATCAGCTTTCCACCATGGTATACCGTTTTATGTAGCTGCTCCTTTGAC
CTCAGTTGATCTGTCTCTTTCCTCTGGTGAGAAAATAATAATTGAGGAGAGGTCACCAAAGGAATTAACTCATGCTCTTGGAGGCCAAGGGCAGCAGGTAGCTCCATCTGGGATCTCTGTTTGGAACCCTGCATTTGATGTCACTCCTGCAAATCTTATTACAGCTATTATTACTGAAAAGGGTGTCATTACAAAGAAGG
ATGCAAGCACTACTTTTGACATAAAGGGATTTGTAGAGAGTTTAACAGTACCTTTGACAAAGGAAACAAACATATGATGACTGCTTAATGTAATATTTCAAGCACTTTTAAACTCATTTTTTCAAAGAGGAGGAATGTATCAGAGACTTGACAATAGCAGCTTGTTAGTCATAAGTAGCAATATTGAGAAGCACTACTCT
TCTTACAATTGCTAATGTTATGTGAAATTTCCAGAGTGCTGTAGAATGTAGAATGCAAAGCATTCAAAAAGGTTACTCAACATTTTCTGGGTATTTGTTATTTTTGATTGGTAACTTTCTGTATTTCTAATTGGCCCGTAGGATGATCCTTTGAACATTAATCAATATGCTCCTTTTATTCTGCTACATTTCTAAGTCCG
GTTCACTTTTTGAATTATACCTTCCTGAAGGAAAGATAATTGGTAAATCT