sp|O22287|GMPP1_ARATH ----> Mannose-1-phosphate guanylyltransferase 1

Intron 1 GTTAACACAC ... CTGCTTGCAG

Sample	Retention score (%)	Exon junction reads	5'ss reads	3'ss reads
A1	23.64	42	15	11
A2	14.53	50	12	5
A3	21.9	41	13	10
A4	23.81	72	26	19
A5	18.42	31	10	4
A6	19.82	89	19	25
A7	20.33	98	36	14
A8	16.31	59	12	11
A9	18.52	88	23	17
A10	17.61	124	33	20

>TRINITY_DN106854_c0_g1_i7 from sample A4 / Example spliced isoform

ATAAAACTGAAGACCCGAGGCTTGGAATTGTTGTGTGACGCCAATGCCATGCGGTCACTTTTGGTCATGGTTTCGATTTCGATAGAAAGATGTGAGTGTGCTCTTCCTCCTATGGAACAATAATCAGTTATGAATCGGGAGGGCCCGTGGCTGTCATACAAACCCTCGATTCAACCTTGGCTCTGCGAGTCTGCGTTGTT
TGCTGCTGTGGTTTTTGGAGAGCACCATAGAGTGCTGACACAGTGACACTAATCTCGGCGCTCTGGTCCTGCTACCAGCCTATACATTACTCCAGTCGCAGAAGCTGTCCATTAAAATGCTTCGTTGAGGTAATACATTCTTTTCTGGGTTTAAAAGCCAATACTATTTTCTCTGGTTGTAATTTTGTAGCCATTTATGA
TAATAACATACTGCGTTTTGTGGTGGTGTAACAGGAGGGAACTCATAGCAGCAGTTGGAGGACATCTACCTGGAAGGGGGCATCTACCCTAGCGTTACCAGCGTTGCTTTGGACCCTGGTAAGACCTGGGGTCCCGAATTTCCCTCCCTTTTTTATATGCATTCGAGCTATGTTGGTTCATTTACTGAACAATTCCGGAT
ACTTTTAATCCTCCTGGCATTTCTTCATGTATTCGAGCTACTTTGCTAGATTTGCAGATTCTTTACTCAATAGGATTCGCATCAACTCCACCACCCTCTTTGTTTACAAAGTTATTTTATGGGCATATTAGAATCCATCTTTGCCCTATCTACCATTTGGGCATAATAGGATCCATCTGCACCAGGCTTTCTGTGTCTCT
GCTCACCTGGGCATAAACATATTTCACTCAGAACCAATAAATTTCAATATTTTTCCATAACTTGCAGAGGGTTATTGTATTTGGGCAGATACCATGAAGGCCTTAATCCTTGTGGGCGGTTTTGGAACAAGGCTACGCCCACTTACTCTGAGCCTTCCCAAACCTCTTGTGGATTTTGCTAACAAACCCATGATTCTGCA
CCAGATTGAAGCTCTCAAGGAAGCGGGGGTGGATGATGTTATGTTGGCTGTCAATTATCAACCTGAGTGTATGATGAAGTTTTTGACCGAATTTGAAGCCAAATTGGGTATCCGAATCCAATGCTCACGAGAAATTGAGCCTTTGGGCACTGCTGGTCCATTGGCTTTAGCCAGGGACAAGCTTATTGATGGTTCGGGGC
AGCCAGTTTTTGTATTGAACAGCGATGTAATCTGCGAGTTTCCATTGAAGGAGATGGTAGAGTTTCACAAATCACATGGTGCAGAAGCCTCTGTAATGGTCACAAGGGTATGTGCTTTGAATTCTTTGCATTTATGTTCTTACATTTTGGTGAGAGTACATCTTCTTCCTGTTCTTCCCTTTGTATTTCATTAAGAGTTC

>TRINITY_DN106854_c0_g1_i3 from sample A4 / Example unspliced isoform:

AGAGGGTTATTGTATTTGGGCAGATACCATGAAGGCCTTAATCCTTGTGGGCGGTTTTGGAACAAGGCTACGCCCACTTACTCTGAGCCTTCCCAAACCTCTTGTGGATTTTGCTAACAAACCCATGATTCTGCACCAGgttaacacaccacctctatggatttggttgactgaaatgggagtttatgcaactgggttat
ccaatttcatccatatgtttttgtttctgcttgcagATTGAAGCTCTCAAGGAAGCGGGGGTGGATGATGTTATGTTGGCTGTCAATTATCAACCTGAGTGTATGATGAAGTTTTTGACCGAATTTGAAGCCAAATTGGGTATCCGAATCCAATGCTCACGAGAAATTGAGCCTTTGGGCACTGCTGGTCCATTGGCTTT
AGCCAGGGACAAGCTTATTGATGGTTCGGGGCAGCCAGTTTTTGTATTGAACAGCGATGTAATCTGCGAGTTTCCATTGAAGGAGATGGTAGAGTTTCACAAATCACATGGTGCAGAAGCCTCTGTAATGGTCACAAGGGTGGATGAGCCATCTAAATATGGTGTAGTGGTGCTCGATGAGGAGACTAGAAGAGTGAAGA
GATTTGTTGAGAAGCCCCAGATGTTTGTAGGTAACAAGATCAATGCAGGGATCTA