NA ----> NA

Intron 1 GTTTGAGATG ... TTGCATGCAG

Sample	Retention score (%)	Exon junction reads	5'ss reads	3'ss reads
A1	82.11	11	39	62
A2	79.78	9	41	30
A3	81.05	9	45	32
A4	86.67	4	30	22
A5	80	4	23	9
A6	72.69	31	88	77
A7	82.35	12	74	38
A8	76.16	18	53	62
A9	76.32	18	68	48
A10	77.97	13	62	30

>TRINITY_DN43757_c5_g1_i3 from sample A9 / Example spliced isoform

GTGGTGGAAGCAGGTCCTAAGATGGATGGATTATTGTACGCGATTCATTGGAATTCTTCCCTTCTGTGCCTCCTCTTTATTGAGGTATAAAGCAGGGTTGTTATTCCTTGAATCAGGGATCAAATCCCCAGGGACATGTTCACCCCTAGTGGGCCAACATGCCTATATAAGTGGTCAGTTTATTCTGATTGGGGCCAGGT
GGAAAGATATTGGTGAGTTTGGTGGAATAGATACCCCCAGTTGCAGCTACTTAACTGACGTGAAGTGTGCCTCCAAGGGAATCGAACTATCAACAACTGCAAGCAAGACTCCATAATTTTTAGTTTAGAATGAGATTGCCTTTCTGCAGTTTATGACTGAGCCATCTATTCTTCAATTGATTCATGCATAACCAAAGGAT
TATGCAGTGATGCATTTATTCAACTCTCATAGGTCATTCACAAACTTATTATAGATTAATTCAATAATATAAGAAAAGGTATGAGTTCTTGTTGACACCTCAACATGTCCCTCTCCAGACAAGGGCTCTCTTTACACATTGGATGTAAATTTTTAAAATTTTCTCTACCCATTGATCTACTTTTGTTGTCATTTGTTTGG
ACATTAATATAATTATCTTATCTTATCTTATCTTATCT

>TRINITY_DN43757_c5_g1_i1 from sample A9 / Example unspliced isoform:

GTGGTGGAAGCAGGTCCTAAGATGGATGGATTATTGTACGCGATTCATTGGAATTCTTCCCTTCTGTGCCTCCTCTTTATTGAGGTATAAAGCAGGGTTGTTATTCCTTGAATCAGGGATCAAATCCCCAGGGACATGTTCACCCCTAGTGGGCCAACATGCCTATATAAGTGGTCAGTTTATTCTGATTGGGGCCAGGT
GGAAAGATATTGGTGAGTTTGGTGGAATAGATACCCCCCAGTTGCAGCTACTTAACTGACGTGAAGgtttgagatgtactcacttcattgtaataaattctcatattggggaaaattgcccacttgcttgtgttgactggaagtgtccataaaaaaaattgttctcatagggtattcagacttcagaggatgctttttcc
aaaagtgtcaaaatattttgtgtttgcatgcagTGTGCCTCCAAGGGAATCGAACTATCAACAACTGCAAGCAAGACTCCATAATTTTTAGTTTAGAATGAGATTGCCTTTCTGCAGTTTATGACTGAGCCATCTATTCTTCAATTGATTCATGCATAACCAAAGGATTATGCAGTGATGCATTTATTCAACTCTCATAG
GTCATTCACAAACTTATTATAGATTAATTCAATAATATAAGAAAAGGTATGAGTTCTTGTTGACACCTCAACATGTCCCTCTCCAGACAAGGGCTCTCTTTACACATTGGATGTAAATTTTTAAAATTTTCTCTACCCATTGATCTACTTTTGTTGTCATTTGTTTGGACATTAATATAATTATCTTATCTTATCTTATC
TTATCT