NA ----> NA
Intron 1 GCAATTTGTG ... CAATCGGAAG
| Sample | Retention score (%) | Exon junction reads | 5'ss reads | 3'ss reads |
| A1 | 74.19 | 4 | 13 | 10 |
| A2 | 75.31 | 10 | 33 | 28 |
| A3 | 64.86 | 13 | 22 | 26 |
| A4 | 58.24 | 19 | 29 | 24 |
| A5 | 87.5 | 1 | 7 | 7 |
| A6 | 75 | 2 | 6 | 6 |
| A7 | 68 | 4 | 10 | 7 |
| A8 | 84.62 | 2 | 9 | 13 |
| A9 | 78.57 | 3 | 10 | 12 |
| A10 | 77.78 | 2 | 7 | 7 |
>TRINITY_DN112588_c0_g1_i6 from sample A3 / Example spliced isoformGAGCGATTTACTTAAAATTATTTCCTCAATTTAGTCTATAAATTTGTTGCATGAAATACGCTGTAATTTAACACTTTCAAGCGAAAAATTTCTTCCGCGCTCGACTAAATCATAGTTGTCGGCTTCTGCAACGGGCGATTGAGGCCTGTACATAGATCCGACATGGAAGAAAGTCAAGAGTTTGAACCCCTGCGGCTTCG
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GATAGGGCCAGAACTGAAACAAGCTCTTTCAATGGTGTATCAAAAGGAAATAATGTCTGTAATGCTGAATGGCTGCTTGGTGTTGGTCCTAATTCCTCTCTTGCATGGTGGTCTTTGCATTGCCTTGATGATGTATCTCCTCTTCGTTGCCCATGTGTTTATTTATGGAAGCAAGGAACTGATCTTCCACTCCACAAGTC
GAAATTTCCACTGGTCAGAAGTTATTCAGATTCCCAAGCCTGTTCTGTGCTTGTCAAAGCTTTTGTTCAGCGGATTGGAAACAAGTTATCAGCTCCACCTTCATCAGCTGACTTGTTTGAGTTGCTACAAGAAAATATCTTCAGCTGGTCACGTGTATGGCCCCCAATGTTGGCTGTTGGTGGTGGAACCTCTTTTGAAA
AAACGATAGGCTCTGAAGAGAATTGCAAGAAGAGTCGATGGAGTATCGCATGTCAACAACTAAACCAAGAAGGTCACTCTGGTGAGATTATACAGGTGGCAATACATCCTGTTATTGAAGTTGAACTTGCTGCCTCCTTAGACTCCAATGGGTTTGTGCTTTTTTGGTCTTTGAGCTCGTCTCTGGAGTTTCAAATGGAG
ATTCCGACATTTATACATCCTGCATGGAAACATTCTGGACGACTGGCAGGTTGTAAAAGTTCTTTTGAATGGAAATACTGTTTTCTTACATGGATACCCCTGGTTTTAAGAGAGAAACAATTTCTCCTCCTAATTGGACATTCTCAAGGTTTTGACTGTGTTATAGTTAGAAAGGACAGTGCTGAAAAAGAAATGGCAAT
CCAGCATGAGGTGGCTTGCACTGTTCAACTTCCGGTTCCTTTGTGTGAACAAAAACTAGAATGCATTCATGCAACATTATTAACAGCGATCCCACTAGATAACTCCATAAAATATAGCATAATGGTTATTGGATTAGGAACGGGAGGTCATATTGTCTCAATGTGGATAATTAGGCTTCTTGTTCAGCATGGAAACGAGA
TTCCTCTGTCATTATGTAAAACTGGGATTGGTGCAAGTAGAGACTGTATAAGAGAAGCATCTGAAGAAGGTACTAATGAGATGAACATTGCAGAGAAGGGTTATTATATTTCAGTGGAGACATGCTTGCCAAAGTATATAAATTCCAATGATTTGGGTCTGGTTACAAGTATTGCTGTAATGCCTACAAGAAATCTTGTT
TCCTTCTGTCAACAGTCAGAGGGTTCTCTGCCTGGTTCAAGCTATAAAACACCTGCCTATGATTTTGCCACATGCCATTCTGACGGTGTTTTAAAGCTTTGGAAAATAAGTGATCCCCAAGAATCATTTATCAGATATTGTCAGACGGCAGAGGTTTCATGGCATTGCGTGGGCTGGATTAAAGTTGGTGAAGGTCCAGT
AAAGGTGATTTCTTTAGCCAATGGTGGCAATAAGATTGCAACTGCAAGCTCTATTGCTGCATATGATGGTATGATTGTTAATATCTGGGATGCTGAGACCTATTTGGTGGAAGGTAATTTCATACTTGAGGACAGGATTTCTCTTCCAGGTTGTGTAACTGCCCTTGATTGGCTTGTTATAGGCAATGCCCAGTTACTGT
TGGCAGTTGCCATGCAAAATGAGATGAGAGTATATTCACAGAAGAGATATATAGCAGATACACTTACAAAGATGGGGGAAACTGAGCATTTACACGTTTGGGTTTGTATTGCATCAATTAGTACTGCATTCTATATAAAGGATCTTTTTTGGGGACCAAAAGCAATGCTTGTGCTTGTCTCCTCTAAGCTTACATGTATT
GTTAGTCAATGGGCATGTAGTGCACACAGGAAAACACAAAATGATGCTTTTCCTATTGAGTTAAATGCACATACATCTGCTTCTCTTTACTTAGGCAGTGTTAACTCAAACCACAAATCATTAAGGGATGAAGCATCCATTTCTGAATCTTCATCAGTATCCAGTAATGGAGCTGTGAATGAATGCTCAAGCATGGTCTC
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TGGTTGACAGGGAGAGAAAATACTCATGCCAATGGCTGCAGTGGTACTCTTAGTAAATCTGAAGTTGAGGGCTTCATCACAGCCCTTGAGAGATGTCCTAGAGTACCTGGCATAACAGATGGTGAGAGGATTCAACTTTTGGCATTATTAGATATATTGGCAGAAATGAGCAGTCCTTATGAAGCTTCTCAATATGAGAA
TCTTGATGATCCAGCTCGAAGGTTCTGGTTACTGGTGCGTTTTTGGCAATTGCATTTTAGATGGACAATGGGGAGAGTTGCAGCTATTGGAGAATTGATGGTGGAATCGAGGACACTAGCATGGGCATATCATTCGGATTGTCAGGATTTTCTACTTGATTTATGCCTCTCAGATGGACCATCCTGGCCTGAGATGCGAA
CTTTAGGAGTGGGATTTTGGTTTATGAATTTCGTTTCACTTCGCTCAAGGATGGAGAAACTAGCACGGGCACAATATCTGAAAAGAAAAGATCCAAAGGATTGCGCCCTGTTATATATGGCACTGAATCGACTGAATGTTTTGATGGGGCTCTTTAAGTTGAGCAAAGAAGAAAAGGATAAGCCTTTAGTTGGATTTTTG
GCACGGAATTTTCAGGAGGAAAAAAATAAAGCTGCTGCTTTAAAGAATGCCTATGTCCTAAAGGGAAGGCACCAGTTTGAGCTTGCAGTAGCGTTTTTCTTGCTTGGTGATGATCCCAGCTCTGCTGTTTCTGTTTGTGCAAAAAATTTGGGAGATGAGCAACTTGCGCTTGTTATCTGTCGTCTTTTAGAAGGTTCCAA
TGGACCACTGGCGAAAGAACTTATATTGAAGCACATTCTTCCTATTGCAGAAGAAAAGAAAGACTATTGGCTTGTAAGCTTGTTGCAGTGGATATTGGGAAATAGTGTCAAATCTTTCCAGCACTTGATTCAACCATTCACTGCATCCATAAGTACAGAACGAAGAATGCAGATGGAGGATCTTTCATCAGATTTAACTG
ATGTTATTGATGCAGCATGCCTAGATTCTAATACCGGGCAGTACTGTGCAATGCTAGCTATGAAGAACAGCTTCAAGGGAAGGATAGGGGATAGTAAGGCCATTGCTATAGCGAGGTGGGCTACTATTAAGACATCAAATGCCTTGAGAAGGTCTGGACTTCCACTTGAAGCCCTGGAGTGTCTTTCGTCTTCCACAAAT
TTCCTCTTGAAAGAAGGGTTAGAAGGGCATTCACTCCTAGGAAGTCACGAGGAATTGTTTGGACAATCTGCATCTAATACAACAACAAATATGAAATGTAATTGGATATCAGGAAGCCTAGCTGGCAAGCTGGAAAGCATGTCTAAGTTAAACTTAGCAATGCAATATATCTCAAAGCTCATAATTGAGCATCCACACTG
GGGTTACATGCACCGAGTATCCTACAAATTAATGGCTGCCACTTGTCGTGAAAATGATGAAAAGTCTCTTTACAGTCTGCACGTGGAGAAATCAGATAAAAAATTAAGTTCATGTCTTTCCATACTTGAGCAGAAGTATCTTATACAATCTTCTGATGTTCTTCATGCGCTTGCTAACTTTGCTTACCACTATGGACGGA
TCTTTTTCTGGCATCGTCTATTACATTCTGCTATTTATCCAGAAGTTCCACAAGAGAGACTTCAGATTTCCAAGACTCCTAGCACATTTCCTGCTGCACCTGAACTCCTGCAAAAAGCTATAGAAGAAACTTGTTATGTGCTTGCTCGTGTTGTTCTGTCTTGTGGTTATAATACGTCTGCATTGAAAGGAGTCTCATTT
TTTTGGAGTACGCCAAGAGACGGTGAATCCGATTGTCATCAGTGGTATATGAGTTTCATGGAGATGGTGTACTTTTCTTATGACTTGAAACTCCTGGCATATTCTGTGACCAATGAAGGATCTCATTCAGACGGGAAGCAACAAAAACTTTTAAAGTTTCTTGACCTTTTGATGTTGAGTATGTGTGTTGCTGTTACCTG
GTTAAAAAGGGATGCAAGGGCACTACTTATGATGATCAAATCCACTAGGTTGGCTGATAGATATAGTTCTTCAGGACAGTTTGATATGAAGGCATGGTATAAGCAGTTGTTTTCCCTTATAGATCCGTCACAGAAAAATGCAATGGGAGGTAATGCAGTTAAAACTTTTAATGTGGACCCTGAGCAAACAAATGGTAAAA
ACAACAAACACAGTGTGCAGTTAATTCCAACAGATGGCAAGTGGAGGCTTGTTGGAGTTTGTCTCTGGGTTCATCTGATGTCTTTTGTCAAAAAAGAGTTATCTGTCTATTCATATTCTGCGAGTGATTCTTTTGGGAAGGCAGACACAGATTTGGTGATTGGTGGCATGAATCTGGAGCATTTGGAAAGGTCATTGTTG
AGTGCCTTAGCCGTTGTTTCTGCTGGCCTAAAAAGACAGTTTGCATGGTACTTGAGGCAAAGCTTAAACACGATGCCTCAAAACCCTATTTTGATCTGGTTATGGTCCATGGATTCTTTTGTGAAAAATGAAACTCAAATCAATGCTTTGGCATTCTGCACTCCTGATAGGCACAATGATTTGGAATTTGGAAAGGACAA
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AGGATAGCATTGAGAATCGCATCATAGAGAATCAGAGAGATTCAGAAAGTAAGAAGGCAAATATTTCTAGAATTAAGTCAATGGAATCAGAAGGGAGGAGTTTAACATCTGATGGTCAAAGTATTCCGGATAACATCTCTTTTCAGAGGCCAAAGGAAATATTACGTAAAAGTGGAGAGTTGTTTGAGGGGCTTATCTAT
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ATCGGGGAAGGACTTAAGTCGAGGTGTATCTTTTGGTATTCCTGGCTATGCCGGCATTGGAGCAATGAGCTTGGGCTGGGGTGAATGGGAAGACTTTGAGGGATTTGTTGATCCTCCTGCTACAGTGGAAAATGTAAGCACGAGGGCACTGGCCAGTCATCCATTGAGGCCTCTATTTCTCGTCGGTTCGAGTAACACAC
ATGTTTATCTTTGGGAGTTTGGCAAAGTGACAGCAACTGCAACTTATGGTGTTCTACCGGCTGCAAATATTCCTCCTCCTTATGCACTTGCATCAGTATCAGCTGTGCAATTTGAACGCTTTGGACACAGGTTTGCCACTGCTGCATTGGATGGCACAGTTTGTGCATGGCAACTTGAAGTGGGAGGGAGAAGCAACGTT
CGACCCACAGAATCTTCTCTTTGTTTTCATCAACATGCAGCAGATGTAGCCTTTGTTGGTGCCAGTGGATCTATACTTGCTGCGACAGGTTTCAGTTCAAATGGTGTCAATATGGTTGTATGGGACACTCTGGCTCCCCCAAGCACTTCTCGTGCTTCAATTGTATGCCATGAAGGTGGTGCTCGTTCTCTAGCTGTGTT
TGATCATGATATAGGAAGTGGATCTATATCTCCTTTAATTGTCACAGGGGGAAAGTCAGGTGATATTGGAGTGCATGACTTTCGCTTCATTGCTACTGGTAAAACCAAGCGTCATAGGCAAATAAAGGAAGAAAATAAGCTTCCATCTTCACCTCTAAAAGACACCTCTAAAAAAGAGGCATATGGCCCATCCAAAAAGT
TTGGGGAACAGAATACGAATGGAATGCTTTGGTACATACCAAAGGCACACCAAGGAAGTATTACAAGGACATCAGTTATTCCTGGGACAAGCTTATTTTTGACGGGCAGTAAAGATGGAGATGTCAAGCTCTGGGATGTGAAAAAGTTTGAACTCATTCATCATTGGCCAAAAGTTCATGACAAACACACCTTCCTTCAA
CCCAATTCAAGAGGATTTGGTGGAGTTGTACGGGCTGCAGTGACAGACATCCAAGTCTTTCCATATGGCTTCCTCACCTGTGGCGGAGATGGTGCAGTAAAATTATTTCAGCATGTAAATCAAATTTCTAATAAGCAAACATGACAATCCAACATGCAGGCAGTTCACATAAATCTATGGTGAAAAATCTTGAATTCTTA
ACAGGAACTCTCATGCTCAAGGGATAAAGAGGACAAACACCACTAATTCTTTTGCCCTGAATTTATCTACTACTAATCAGGACAAGCAGTAATCAGGCTGAAGCTTAATGTATTTGAACTTTGAAGTCGATCTGATTAAGAAGTGGTGCAATTAAACCAAAGCAACTAACCACCTCTATGCATGACCTTGAGTTGTATCT
GGGTTAAAAGAAGCAAGTGAGGAGTTCAGGGTTATTCCAAAAGTCAGAAATAAATTTTGAAAGGTCCTTTTTTAAAATGGTGGTGGAAGGATCTTCTTTAATAAATATCAGTCATAAGATGCAATGCATTTGTAGATTATGATACTACAGCAGAGACATCCAATGAGAGGTTAAATTAGAGGCATCTTGTATGAAATGAG
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TGTATTCACTTTGTATCGAATGATCCATGCTTCATATTTGGGAGCTTGTTTTATCATGGGTGAAAATTAAATCGAGCTGATGTATCTACATAGATTTCTTCCTCTTCCAGCCTATCAAGATGTTAAATTTTACATTTACCTTATTCAATGGTTCAATAGTAATCTTGCTGTCACATATTTGAAGTGTATGGTCAACAAAC
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CATAGATCAGCTGTCACATGAAGCATGAAACCAGATATGTATGGCAG
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GTGGACCCTGAGCAAACAAATGGTAAAAACAACAAACACAGTGTGCAGTTAATTCCAACAGATGGCAAGTGGAGGCTTGTTGGAGTTTGTCTCTGGGTTCATCTGATGTCTTTTGTCAAAAAAGAGTTATCTGTCTATTCATATTCTGCGAGTGATTCTTTTGGGAAGGCAGACACAGATTTGGTGATTGGTGGCATGAA
TCTGGAGCATTTGGAAAGGTCATTGTTGAGTGCCTTAGCCGTTGTTTCTGCTGGCCTAAAAAGACAGTTTGCATGGTACTTGAGGCAAAGCTTAAACACGATGCCTCAAAACCCTATTTTGATCTGGTTATGGTCCATGGATTCTTTTGTGAAAAATGAAACTCAAATCAATGCTTTGGCATTCTGCACTCCTGATAGGC
ACAATGATTTGGAATTTGGAAAGGACAATAATTCTTTTTTACATCAAGGAGTTGACACTCTACTGACAGTTGAAAACAATAATCAATGGCTTGAAGAACTTTGTCAGTTTCTGGTAATTCAGAAAGTGGTTTTGTCAGTTCTTACATCTGAAGGGTTTACAGAGTTTGAACATAGAAACAGTGGAGACATTACTAACACC
ACTCATAGTGAAAAAGATTTAATGATCGAGGATAGCATTGAGAATCGCATCATAGAGAATCAGAGAGATTCAGAAAGTAAGAAGGCAAATATTTCTAGAATTAAGTCAATGGAATCAGAAGGGAGGAGTTTAACATCTGATGGTCAAAGTATTCCGGATAACATCTCTTTTCAGAGGCCAAAGGAAATATTACGTAAAAG
TGGAGAGTTGTTTGAGgcaatttgtgttaattcctgcgatccaaaacaaatggtggttgcaagcaatcggaagGGGCTTATCTATCTTAACTTGACTACTGAAGATCCATACGTTGAGTCACTTGAATACTTATGGTCAGAAGCTGAATGGCCATGGAATGGATGGGCTGGAACAGAATCTACTCCTGTGCCTACATTTG
TATCACCAGGGGTGGGGCTTGGAAGCAGAGAAGGTTCACACCTTGGTTTGGGGGGAGCTACAGTTGGATTAGGCACATTGCCAAAATCGGGGAAGGACTTAAGTCGAGGTGTATCTTTTGGTATTCCTGGCTATGCCGGCATTGGAGCAATGAGCTTGGGCTGGGGTGAATGGGAAGACTTTGAGGGATTTGTTGATCCT
CCTGCTACAGTGGAAAATGTAAGCACGAGGGCACTGGCCAGTCATCCATTGAGGCCTCTATTTCTCGTCGGTTCGAGTAACACACATGTTTATCTTTGGGAGTTTGGCAAAGTGACAGCAACTGCAACTTATGGTGTTCTACCGGCTGCAAATATTCCTCCTCCTTATGCACTTGCATCAGTATCAGCTGTGCAATTTGA
ACGCTTTGGACACAGGTTTGCCACTGCTGCATTGGATGGCACAGTTTGTGCATGGCAACTTGAAGTGGGAGGGAGAAGCAACGTTCGACCCACAGAATCTTCTCTTTGTTTTCATCAACATGCAGCAGATGTAGCCTTTGTTGGTGCCAGTGGATCTATACTTGCTGCGACAGGTTTCAGTTCAAATGGTGTCAATATGG
TTGTATGGGACACTCTGGCTCCCCCAAGCACTTCTCGTGCTTCAATTGTATGCCATGAAGGTGGTGCTCGTTCTCTAGCTGTGTTTGATCATGATATAGGAAGTGGATCTATATCTCCTTTAATTGTCACAGGGGGAAAGTCAGGTGATATTGGAGTGCATGACTTTCGCTTCATTGCTACTGGTAAAACCAAGCGTCAT
AGGCAAATAAAGGAAGAAAATAAGCTTCCATCTTCACCTCTAAAAGACACCTCTAAAAAAGAGGCATATGGCCCATCCAAAAAGTTTGGGGAACAGAATACGAATGGAATGCTTTGGTACATACCAAAGGCACACCAAGGAAGTATTACAAGGACATCAGTTATTCCTGGGACAAGCTTATTTTTGACGGGCAGTAAAGA
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TAAATCAAATTTCTAATAAGCAAACATGACAATCCAACATGCAGGCAGTTCACATAAATCTATGGTGAAAAATCTTGAATTCTTAACAGGAACTCTCATGCTCAAGGGATAAAGAGGACAAACACCACTAATTCTTTTGCCCTGAATTTATCTACTACTAATCAGGACAAGCAGTAATCAGGCTGAAGCTTAATGTATTT
GAACTTTGAAGTCGATCTGATTAAGAAGTGGTGCAATTAAACCAAAGCAACTAACCACCTCTATGCATGACCTTGAGTTGTATCTGGGTTAAAAGAAGCAAGTGAGGAGTTCAGGGTTATTCCAAAAGTCAGAAATAAATTTTGAAAGGTCCTTTTTTAAAATGGTGGTGGAAGGATCTTCTTTAATAAATATCAGTCAT
AAGATGCAATGCATTTGTAGATTATGATACTACAGCAGAGACATCCAATGAGAGGTTAAATTAGAGGCATCTTGTATGAAATGAGAAAGGGAGTAGCATAGTCTTCTTCGTCATGAGAAGATTTCTATCACAAGGAAATGTATCATTCAATTATTTCCAACTCTTTTGACAGAGGTTCTTTTGCACCAAAGCAACAGGTA
GTCAAAACATATGTAACACATCTGATAGAAGACCAAGGAGTAAGAGAGGAGCAGAAGAAATTGTACTTTATTCACTAGAGTACAGTGTATTCACTTTGTATCGAATGATCCATGCTTCATATTTGGGAGCTTGTTTTATCATGGGTGAAAATTAAATCGAGCTGATGTATCTACATAGATTTCTTCCTCTTCCAGCCTAT
CAAGATGTTAAATTTTACATTTACCTTATTCAATGGTTCAATAGTAATCTTGCTGTCACATATTTGAAGTGTATGGTCAACAAACCATTGACCTGATCTTAAGACAATCAAAGCTCTCTCCTTCATATTTTGGGAGGATTGCATTGGAGGATCTGCCAATTTGGAAATTTTATGAAGGTAGAATAGGACACAGGCCAATT
AGATGCTGAAGGAAAGAGAATACAGAGACATGTTCTTTAAGTGCCCCAATACGCAGGCCATTTTTTTGTGAATGTCTTCGACCAACATAGATCAGCTGTCACATGAAGCATGAAACCAGATATGTATGGCAG