sp|Q9MUU8|RK36_MESVI ----> Large ribosomal subunit protein bL36c


Intron 1 GTCTAGCTTC ... GGTTTTGCAG

SampleRetention score (%)Exon junction reads5'ss reads3'ss reads
A170.17614.58
A272.924111
A373.756172
A480140
A581.2514.50
A67533101.814
A769.333581.813
A862.753560.513
A967.782452.512
A1068.632453.88



>TRINITY_DN40780_c0_g3_i5 from sample A6 / Example spliced isoform
GAGGACTTTGATGTAATATATATCCTCGGTCCTCATATTATTTAGAGCAGCGGTCGGGTATTTGTCAGTTCAGTGACAACAGGAGACGGAGTACGGTGGAGTGAGAGAGGGAGGAAAGCACCAGGCTTGTATTTGTCAGTTGCAGATTGCAAGTCATGAAGGTGAGGTCATCAGTGAAGAAGCTGTGTGAGTTCTGCAGA
TCCGTAAAACGTCGTGGAAAGGTTTATATCTTATGCACTTCCAATCCCAAACATAAGCAGCGCCAAGGAATGTCGACACTTGCATATCAAGGTCCACTGTCTCCTATGTCTTTGGAAAGTAGCTGTAAGAAAGAAATTTCTGGTGCTGAAAGTGGTGGCAAAGGGTTGCTAAGTGATTTATTTTATGATCATTGCTTGAT
ATGACCTTACACCTGTGAGGTGCATTTGGCTCTCAACAACTGGGTTAAGCAACCCAATCATGTGTTGAGATGACAAGCAGTTTCATTCTTGTTCAGGGTGAGCAGTCATACATTTGTTCTAGCATGCTTCATGTGCAGAATTTGGTGTGGTTAACAGAGTTATTTTTCAGAAAGATGAGAAATGCCCAGGCAAACATGTG
CACACTGAACATCCAATTCTTGCTTTAACACACTTGGTCCTTTGACGTTGTTTCTATATGTGTCTATGCATTGGGGATGCATTTTTCATATTAACTATTTGATTTTCTTGGGTGAGGAGACATTGGGTTATCTATTGCACAAAAGGTAAAACGAGGATGGCAGTTTTCAGGATATATTTAAGTTCTTATTTCCTTTCTTA
ATATTGATGGTTTGCCAGTGTTGGCGGGAGGTTCTATACTAGTATATTTAGTTTTGAAGTAAACTGCTGAGTAGTGAAGTTCTTATTCAAATTCTGGTCACATATATATTTTATTCGTAGTAATGGCCATACGTTGTGGATCAGAAAGGTTAATAGGAATGTTAACAGAAGATATATACATGAATAGTTTAACTTGTTTG
AGAGGCAGTTCATGCCTTTCCTTGAAAAGGATCATCTGCAAATGAGGTTTGTTGGATATGGCTTCTCTTTTAAGACTAAAATATGATAAAAATATTTCAGGGGTGATTTTAAGATGTAATGTCATTATATGTTGCTTCTGCAG


>TRINITY_DN40780_c0_g3_i3 from sample A6 / Example unspliced isoform:
GGCATGGCTTTGTAAATTTTCTGTGTCCAATTTTGTTTTATATCTTTTTGATTAGCTGTTACGCTGGGTATTGTAAAGGCCAAGCTGCTTATATAGGTTGTATTCTCCATAAATGCATGGTGTAAATAAGTGCATAGGCAGGCCGGCATGTAAAGGTGCAATGGCATAAATAGTACTACTGTAGAGTTCATCCTGTGGCA
ATGTCCATGCTTTCTTATTTATTGTTCTGCCTGATTCTGTAGTGATTTCTCATATTAAAGATGAATCTCAATTTTGTTGCTTGCTTAAAATTGGCTTTGGTTTCTGCAGGTCTTTGGAAAGTAGCTGTAAGAAAGAAATTTCTGGTGCTGAAAGTGGTGGCAAAGgtctagcttcagttctttcaaattcatgaaagatg
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tcataaacaggtgcactttcttcaaataatgatatttaccgttctctctttcaaatgatgtatgtagttgatttagtcttggtggacaccgggaatagataatttgggcttactacatactctaaactgccctgtacttaaatttgtaatacaaagatcttggacaatagaagaaagcatggttgcattggtacttctat
cccctcaggccttttctgtagctgccatacctgcatcctgatgagctcctcctttacaatggaaaattgtcatacccccatacctgtaacctgtagttcagaaatttcttatccttattgtacccatactaatactgatactcacacccagatgtacccatgcaacatggcaattgagtgaaatgtgacaatgtcaggat
cttgcttctaattgacatctttggtgactttcacacccaaaactgatctagtggcacatggttggctgttgggttttgcag
GGTTGCTAAGTGATTTATTTTATGATCATTGCTTGATATGACCTTACACCTGTGAGGTGCATTTGGCTCTCAACAACTGGGTTAAGCAACCCAATCATGTGTTGAGATGACAAGCAGTT
TCATTCTTGTTCAGGGTGAGCAGTCATACATTTGTTCTAGCATGCTTCATGTGCAGAATTTGGTGTGGTTAACAGAGTTATTTTTCAGAAAGATGAGAAATGCCCAGGCAAACATGTGCACACTGAACATCCAATTCTTGCTTTAACACACTTGGTCCTTTGACGTTGTTTCTATATGTGTCTATGCATTGGGGATGCAT
TTTTCATATTAACTATTTGATTTTCTTGGGTGAGGAGACATTGGGTTATCTATTGCACAAAAGGTAAAACGAGGATGGCAGTTTTCAGGATATATTTAAGTTCTTATTTCCTTTCTTAATATTGATGGTTTGCCAGTGTTGGCGGGAGGTTCTATACTAGTATATTTAGTTTTGAAGTAAACTGCTGAGTAGTGAAGTTC
TTATTCAAATTCTGGTCACATATATATTTTATTCGTAGTAATGGCCATACGTTGTGGATCAGAAAGGTTAATAGGAATGTTAACAGAAGATATATACATGAATAGTTTAACTTGTTTGAGAGGCAGTTCATGCCTTTCCTTGAAAAGGATCATCTGCAAATGAGGTTTGTTGGATATGGCTTCTCTTTTAAGACTAAAAT
ATGATAAAAATATTTCAGGGGTGATTTTAAGATGTAATGTCATTATATGTTGCTTCTGCAG