NA ----> NA
Intron 1 GTCAGATATC ... ATTATTGCAG
| Sample | Retention score (%) | Exon junction reads | 5'ss reads | 3'ss reads |
| A1 | 100 | 0 | 1 | 1 |
| A2 | 55.56 | 2 | 5 | 0 |
| A3 | 100 | 0 | 1 | 0 |
| A4 | 100 | 0 | 1 | 0 |
| A5 | 33.33 | 1 | 1 | 0 |
| A6 | 55.56 | 18 | 32 | 13 |
| A7 | 50 | 9 | 12 | 6 |
| A8 | 64.1 | 7 | 9 | 16 |
| A9 | 48.15 | 7 | 9 | 4 |
| A10 | 70 | 3 | 9 | 5 |
>TRINITY_DN34773_c0_g1_i2 from sample A6 / Example spliced isoformACCTGGTCGAACAGAAAAGTATTGGCCTTTATTTGCTATGGCAGGGGGAATTGGCGCTGTGGTTGCATGGGCTTTGCTGTCGATTCTTTGCACCCGAGCAAATCAGACTATGAAAGTTTCTGTGCATAGTTTAACCACATATCTAGCAGTTATCAGTGTGTTCTGTTTCTGGGACAAGCAGATATTCTGGGGCATTGCAT
TTGCCATAGCAACAGTTCTGCAATTTATGTATGTAATGTCAGTTATGGACAGGTTTCCATTCACAATGTTGGTGTTAAGAAAGGCCGTGAAGATGGTATGGAGTCTTCCTGAAGTCTTGAGGGTGTCTTATGTATTTATGGCAATTATGCTTTTGTGGATGGTGATCTGGTCTTTTGGAGTAGCTGGTGTGATTGCTTCA
AGCATGGGTAATGGTGTACGCTGGTGGCTTCTTGTGGTGCTTTCGATCAGTCTTTTTTGGACGGGTGCTGTTCTATGCAATACAGTTCATGTTATAGTGGCTGGCATGGTTGCCCTTGTTCTTATGCATGGGGATCGGGGAGCTTCATCAATGCCACCAAAACCGTTGTTGAGATCTCTTCGTCATGCTGTGACCACTTC
ATTAGGCAGTATCTGTTATGGCTCTCTTTTCACAGCTGCTATTCGGACCTTGCGCTGGGAGATCAGAGGCATCCGATCACAGATTGGCAACAATGAGTGTCTACTATGTTGTGTAGATTTTTTGTTTAACCTGGTTGAGACCCTTGTCAGGTTTTTCAACAAATATGCTTATGTAAAGGTAGCTGTGTATGGTAATTCCT
TCAATCATTCTGCACGGGATGCATGGGAATTATTTCAGTCCACTGGGATTGAGGCTCTTATTGCTTATGACTGTTCTGGAGCTGTGCTCCTGATGGGGACTATTCTGGGAGGACTTATTACTGGAACATGTGTGGGGATATGGACCTGGTTTAAGAGGAGTGATCGAGTGCTGATGGCTGGTTCTACAGCTATGCTGATG
GGAATGATTCTAGTTGGTTTGACGTTGGTGGTAGTGGAAAGTGCTGTAACGTCCATCTACATTTGCTATGCAGAAGATCCTTCATTGATAAGCAGATGGGATGAGGAATTTTACAACCAAATGTCTGAAGCACTGCGTGAACGACTACAGCATAGAAGTTTGCGAAGCAGAGATGTCCTGTCTATGGTTGTAATTCAACG
TATTTGCCCTGTTGCTTCTTTGGGAACTCTATTTCTGGATATTGATTTTATTGAGCTGATCAATGGAATTATGGTTTCTTTGTTTTGTGTCTAAATTTTCTAACAAAGCATCAGAAGTAATAAAGATGATAATCACAATCCTGAAAAAAATAATGGTAGTATATTCATGTAAATACTCAGCATGTTAAAATATTAAAATA
TTGGAGGTCGGGATAAAGTATAACCATTGATGAGTGACGTGCGCTTTAAAGTACC
>TRINITY_DN34773_c0_g1_i1 from sample A6 / Example unspliced isoform:ACCTGGTCGAACAGAAAAGTATTGGCCTTTATTTGCTATGGCAGGGGGAATTGGCGCTGTGGTTGCATGGGCTTTGCTGTCGATTCTTTGCACCCGAGCAAATCAGACTATGAAAGTTTCTGTGCATAGTTTAACCACATATCTAGCAGTTATCAGTGTGTTCTGTTTCTGGGACAAGCAGATATTCTGGGGCATTGCAT
TTGCCATAGCAACAGTTCTGCAATTTATGTATGTAATGTCAGTTATGGACAGGTTTCCATTCACAATGTTGGTGTTAAGAAAGGCCGTGAAGATGGTATGGAGTCTTCCTGAAGTCTTGAGGGTGTCTTATGTATTTATGGCAATTATGCTTTTGTGGATGGTGATCTGGTCTTTTGGAGTAGCTGGTGTGATTGCTTCA
AGCATGGGTAATGGTGTACGCTGGTGGCTTCTTGTGGTGCTTTCGATCAGTCTTTTTTGGACGGGTGCTGTTCTATGCAATACAGTTCATGTTATAGTGGCTGGCATGGTTGCCCTTGTTCTTATGCATGGGGATCGGGGAGCTTCATCAATGCCACCAAAACCGTTGTTGAGATCTCTTCGTCATGCTGTGACCACTTC
ATTAGGCAGTATCTGTTATGGCTCTCTTTTCACAGCTGCTATTCGGACCTTGCGCTGGGAGATCAGAGGCATCCGATCACAGATTGGCAACAATGAGTGTCTACTATGTTGTGTAGATTTTTTGTTTAACCTGGTTGAGACCCTTGTCAGGTTTTTCAACAAATATGCTTATGTAAAGGTAGCTGTGTATGGTAATTCCT
TCAATCATTCTGCACGGGATGCATGGGAATTATTTCAGTCCACTGGGATTGAGGCTCTTATTGCTTATGACTGTTCTGGAGCTGTGCTCCTGATGGGGACTATTCTGGGAGGACTTATTACTGGAACATGTGTGGGGATATGGACCTGGTTTAAGAGGAGTGATCGAGTGCTGATGGCTGGTTCTACAGCTATGCTGATG
GGAATGATTCTAGTTGGTTTGACGTTGGTGGTAGTGGAAAGTGCTGTAACGTCCATCTACATTTGCTATGCAGAAGATCCTTCATTGATAAGCAGATGGGATGAGGAATTTTACAACCAAATGTCTGAAGCACTGCGTGAACGACTACAGCATAGAAGTTTGCGAAGCAGAGATGTCCTGTCTATGGTTGTAATTCAACg
tcagatatctgtacccaatcctgtgtagttgatttaagtttgcatttgactgcaagtcttattgtcattgttaccgtcaggacattcatgctaatgatttacattattgcagGTATTTGCCCTGTTGCTTCTTTGGGAACTCTATTTCTGGATATTGATTTTATTGAGCTGATCAATGGAATTATGGTTTCTTTGTTTTG
TGTCTAAATTTTCTAACAAAGCATCAGAAGTAATAAAGATGATAATCACAATCCTGAAAAAAATAATGGTAGTATATTCATGTAAATACTCAGCATGTTAAAATATTAAAATATTGGAGGTCGGGATAAAGTATAACCATTGATGAGTGACGTGCGCTTTAAAGTACC