NA ----> NA
Intron 1 GTAATACACA ... GTGTACAAAG
| Sample | Retention score (%) | Exon junction reads | 5'ss reads | 3'ss reads |
| A1 | 75 | 2 | 3 | 9 |
| A2 | 57.14 | 3 | 5 | 3 |
| A3 | 73.33 | 5 | 19.5 | 8 |
| A4 | 65.71 | 6 | 12 | 11 |
| A5 | 86.67 | 1 | 6 | 7 |
| A6 | 69.22 | 11 | 31.5 | 18 |
| A7 | 70.21 | 7 | 32 | 1 |
| A8 | 54.29 | 16 | 18 | 20 |
| A9 | 66.67 | 10 | 24 | 16 |
| A10 | 47.83 | 6 | 4 | 7 |
>TRINITY_DN43979_c0_g3_i2 from sample A8 / Example spliced isoformGAAAAATCGAAACCTTAACCCTAACATCGATCTATGAACATTTTCCTTCTAAAACCCTAACCCTAACAATGAATCTATGAAGACTCGGCTTCTCCATCTACTTTTGACGGCATTGTAAAGCAAGTGAGTCGATATCTTCAAAGCCATTGTGCTCGGCTGCTGTTGCTGGTTAAGTGAGGCAAATGATGCATTGCATAGTT
CAAATGAAGTCTTTGTGATTAATTGCTCAAAAGTCTTTCGCTCCTATCTGATGCCAGCACTTTTTTTTAATACTCTTAATATAGAGTGAATGTAGTGCACATAATTTCTTTTTGAGATGTGATTTATTGATCAACATATACTTTTCTTTTCTGGTTGAATAGTGGGTTTTTTCCACTCAAATTTTTCTATTGTATTGGTG
GGCAAATGATGCATTGCATAGTTCAAATGAAGTCTTTGTGATTAAATGCTCAAAAGTCTCTCGCTCCTATCTGATGCCAGCACTTTTTTCAATGCTCTTAATATAGAGGCCAACTGGAACAACGTCTTATTGACTTCTCGATCCTGAATCAAACGGAACGTTGATGAATGACAGCAGTTGTTTGGAACTCAGTTAAGGTA
AACTCCTAACGAAACCGAGATGTAGGGTTTCTTTTCCAAATGCTTTAAAATGTCTTGCAGTTATATTTTCAGATCGGCCATTGCGATATGCTGTTTTTGTGTATTGATTTTCACATCCGGACATTTGTCTTTTGATTTTTTCTTGAAATCCCTCGTAATTCCATTTTTTCGTTCTGTTCAAGCAAAAATGCCAGGACTGT
CAATAGCATAATTCACTATTTTTTTTATAACAGAGCAGTGAATATTTAAGATTTGGTTTCTGAGAAGGTCTTATTTTGATCGGAGCAAACAAATCTAATGCACCAAGAAAATTTAATGTAATTTTGTCGACAAAACGGATTAAACTTAAGTCCTGGCTTTATTTTATCTCTGACAGTACCTTGGCGATTTTTATGGAAGT
CTCGAGCCACTACGAGGTTTCTCGGTGCCAATAGCTCTTGCAACATAAGAGCACCTATGCACCAGCCTTATACATTCTGTTCACTAAAATAAACCTGTCAGTAGAAGCAGTTTGCATATGTTTCATACAGAAAAGTGGCAGGGAACTGTTATCATCAAGCTTTCTTCTGCCACCATCTCTTTTCTTGTGTAAAGTTCTTG
GCAAATTGAAAAAGCGTTATGATCTGCAGCAGCACATATGAGTTAGCCTACCCTACCTATATGTCATGTAAAGAACTGATCTAGAAGCAATACTACCTATTATGTCATGTAAAGAACTGATATAGAAGCAAAACCACCTTATATATCATGTAAAGGACTTGGCATTTGATAAAATAAATGCCCACTAAAG
>TRINITY_DN43979_c0_g3_i1 from sample A8 / Example unspliced isoform:CTGATATTTACTTTTAATGTGATATTATATTTTTCTGGTTGAATAGTGGGCTTTTTCTACTCGACTGATTCTATTGTATTGGCAGGCAAATGATGCATAGCATAGTTCAAATGAAGTCTTTGTGATTAATTGCTCAAAGTCTTTCGCTCCTATCTGATGCCAGCACTTTTTTTTAATACTCTTAATATAGAGTGAATGTA
GTGCACATAATTTCTTTTTGAGATGTGATTTATTGATCAACATATACTTTTCTTTTCTGGTTGAATAGTGGGTTTTTTCCACTCAAATTTTTCTATTGTATTGGTGGGCAAATGATGCATTGCATAGTTCAAATGAAGTCTTTGTGATTAAATGCTCAAAAGTCTCTCGCTCCTATCTGATGCCAGCACTTTTTTCAATA
CTCTGAATATGGAGGCCAACTGGAACAACGTCTTATgtaatacacataactctttttaatgatatgtgatttattgatcagcctatatttttctttaccccctttttctgattggggaatcttctggctttatattgttgaatacgaaaatattgttgattggtaactttttattctcttattttcccagcgagaactgt
ggattcatttagattattttagtggaaagtttaattgattacttcatactgtgtacaaagTGACTTCTCGATCCTGAATCAAACGGAACGTTGATGAATGACAGCAGTTGTTTGGAACTCAGTTAAGGTAAACTCCTAACGAAACCGAGATGTAGGGTTTCTTTTCCAAATGCTTTAAAATGTCTTGCAGTTATATTTTC
AGATCGGCCATTGCGATATGCTGTTTTTGTGTATTGATTTTCACATCCGGACATTTGTCTTTTGATTTTTTCTTGAAATCCCTCGTAATTCCATTTTTTCGTTCTGTTCAAGCAAAAATGCCAGGACTGTCAATAGCATAATTCACTATTTTTTTTATAACAGAGCAGTGAATATTTAAGATTTGGTTTCTGAGAAGGTC
TTATTTTGATCGGAGCAAACAAATCTAATGCACCAAGAAAATTTAATGTAATTTTGTCGACAAAACGGATTAAACTTAAGTCCTGGCTTTATTTTATCTCTGACAGTACCTTGGCGATTTTTATGGAAGTCTCGAGCCACTACGAGGTTTCTCGGTGCCAATAGCTCTTGCAACATAAGAGCACCTATGCACCAGCCTTA
TACATTCTGTTCACTAAAATAAACCTGTCAGTAGAAGCAGTTTGCATATGTTTCATACAGAAAAGTGGCAGGGAACTGTTATCATCAAGCTTTCTTCTGCCACCATCTCTTTTCTTGTGTAAAGTTCTTGGCAAATTGAAAAAGCGTTATGATCTGCAGCAGCACATATGAGTTAGCCTACCCTACCTATATGTCATGTA
AAGAACTGATCTAGAAGCAATACTACCTATTATGTCATGTAAAGAACTGATATAGAAGCAAAACCACCTTATATATCATGTAAAGGACTTGGCATTTGATAAAATAAATGCCCACTAAAG