NA ----> NA
Intron 1 GTGAAGGTAT ... GTCCCTCCAG
| Sample | Retention score (%) | Exon junction reads | 5'ss reads | 3'ss reads |
| A1 | 77.14 | 4 | 6 | 21 |
| A2 | 41.18 | 5 | 2 | 5 |
| A3 | 75.76 | 4 | 9 | 16 |
| A4 | 90 | 1 | 7 | 11 |
| A5 | 55.56 | 4 | 8 | 2 |
| A6 | 74.36 | 5 | 9 | 20 |
| A7 | 69.62 | 12 | 24 | 31 |
| A8 | 83.05 | 5 | 22 | 27 |
| A9 | 69.41 | 13 | 21 | 38 |
| A10 | 85.71 | 4 | 17 | 31 |
>TRINITY_DN43875_c0_g1_i1 from sample A7 / Example spliced isoformGGGAAAAGGAGAAAAAGATTAGCGGTCACTGCCAGAAAATCAGAACAGTAGCAAAAAGGAGGTGGAACGTTGCGCTAAAATATCTGACATGCCACTTGTCCCCAAGAGTTTCAGCATTAAAACCTCTCCAACTCCTCTGCTACGCATACACAATGACTGTGGATGGGTATTAGCGAACGATAATGCAGAGACCATGGCAG
TAAAAAGCAAGGTGCTGCACTGCCACCGACAGCAATAATTGGCGCCACTGGTTCGAATGCAAATTATTTGACAGTCAGCTACCCAATTGATCGATTCAGTTTCTCAAAAAGTTGTATTGTCTCAATTTCTGTTTTTCAGGCTTGACGGCTTTTCATTATGGATCAAGTTTCTATCAGTGCAAGTCAATTTCATGCACTTA
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TGAACAAAAATCACACGGCCTTTGTTACTGGAGTTATCGAAGTCAACAAAAGAAGTGTTATCGAAGTCTACTCAATAAAAAGCTCGAAGGGAATACATCACAGTTCTTGGATTGAAAAGTTTGGCATGATTGGTGCCTTGACATATTCTATCAAATGTACAGAATATGCTGACCACAATCCAAATTATTGTCTTAAAAGA
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AGAAACAGTAAGGCTCTAGAAGAATTTCTTGATGCCCAAATTTTAGCAACGTGCTTATCAAATTCTGGTCG
>TRINITY_DN43875_c0_g1_i2 from sample A7 / Example unspliced isoform:GGGAAAAGGAGAAAAAGATTAGCGGTCACTGCCAGAAAATCAGAACAGTAGCAAAAAGGAGGTGGAACGTTGCGCTAAAATATCTGACATGCCACTTGTCCCCAAGAGTTTCAGCATTAAAACCTCTCCAACTCCTCTGCTACGCATACACAATGACTGTGGATGGGTATTAGCGAACGATAATGCAGAGACCATGGCAG
TAAAAAGCAAGGTGCTGCACTGCCACCGACAGCAATAATTGGCGCCACTGGTTCGAATGCAAATTATTTGACAGTCAGCTACCCAATTGATCGATTCAGTTTCTCAAAAAGTTGTATTGTCTCAATTTCTGTTTTTCAGGCTTGACGGCTTTTCATTATGGATCAAGTTTCTATCAGTGCAAGTCAATTTCATGCACTTA
CCATACAAAATGTCAAGATGGTTCAACCAGgtgaaggtatcaatttatggttttttggaatgctggttacattaaaagcgctaggaaatgaaacgggtgattcttattcactctatgaactaatggtccctccagGGTGGAGTATTCCAAAACATATTCGCACGCAGGAAGATGAGACTTACTACATGCTTGATGGTGAA
TTGGTGTGGATTATTGGAGAACAAGAACTTCCTGCTACAAAGGGTTCATTTCTTCATCTTCCTCGATTTGTTCCACATACGTTTGAAAATAAAACAAATAAAACAGCATACATGCTGTGCACATGTGCTCCTGGTGGTTTTGAGAAATATTTCCTGGATGTTGCAAAAATGGTAACAGCTTCAGAAAATGTGCTCCTTGA
ACATAGCAATTATGAAATTAATCTGGCTTTTAAGATGGCTGAGGAGTACGGACTTGTTTTTGTTGGTCATCAAAAGAGCACAGAGGAATGACAAGATGATATTGTTGAACAAAAATCACACGGCCTTTGTTACTGGAGTTATCGAAGTCAACAAAAGAAGTGTTATCGAAGTCTACTCAATAAAAAGCTCGAAGGGAATA
CATCACAGTTCTTGGATTGAAAAGTTTGGCATGATTGGTGCCTTGACATATTCTATCAAATGTACAGAATATGCTGACCACAATCCAAATTATTGTCTTAAAAGAAGCACAGATGGACCATACTTTTTTGTAATATTCCAAAAGATGAAATTTTAAGTTGTCAAATGAAAGGATGGACGTGTATTTGGTTAGTGAATTGA
GGAAATTCTGTAGGTGGTAGAAAAGAAGGTAATGGAAAGACTCAAGTAATACTTCTGAAATGTATATTTGTGGTGAACAAGTAATTGTCTAACATATTTTCCTTGAGAAACAGTAAGGCTCTAGAAGAATTTCTTGATGCCCAAATTTTAGCAACGTGCTTATCAAATTCTGGTCG