NA ----> NA
Intron 1 GTATGTGTGG ... TGTATTGAAG
| Sample | Retention score (%) | Exon junction reads | 5'ss reads | 3'ss reads |
| A1 | -1 | 0 | 0 | 0 |
| A2 | 100 | 0 | 0 | 4 |
| A3 | -1 | 0 | 0 | 0 |
| A4 | -1 | 0 | 0 | 0 |
| A5 | 100 | 0 | 0 | 1 |
| A6 | 100 | 0 | 4 | 0 |
| A7 | 64.7 | 5 | 11.3 | 7 |
| A8 | 65.28 | 7 | 7.3 | 19 |
| A9 | 41.82 | 3 | 2.3 | 2 |
| A10 | 55.56 | 2 | 0 | 5 |
>TRINITY_DN41393_c2_g1_i1 from sample A8 / Example spliced isoformGGAACATTTCTCAATGTTATATAAGAAAGGCTTTTGGGCATGGTAAAGACACACCAAGAGAGAGCAAAGGCATGCTGAAGAGATTCTGAAGGAGGAGAAAGAGCTCAAATTCTTCAAAAGCAAGGGTGAAGGAAAGGAAGCTCATATCAAATGGAGGAAGGATTCACATATAATGCCACGAGAATGGAAATGAACAAATA
ATTAAGGAGGTTGATGTCTCATAGTGTCATAAGGAAGATGGTGTTGATGATGACTCCAAAAAGATTCAAATAAGCTTCAGAAATGGGTTGGACAAACCTCACTTACAAGTTCAACAAAGCAATGAAGCTTTTCTCATTACACATACGGATCAAGTATTGATAGAGAAGGAAAGCTTTGAAAAACAAATTGTGGAATCATC
ATACAGATAATGAGTTCCAAAATTTCCAGTCACAAACCTATTTATGATGAATGTGAATATTTGGATGTTAAGTTTCATAAAAGGATGGTTGTTCCAAAATGATGTGAATACTTTTCTATACCAAAATCTTTTGAAAATGCTAGTATCCAAGCGCAGGTTCTGGGTGAACAACTACATGTATGTTGTATTAATTTTGTCAA
AGAAGAAGTGTGGATTCC
>TRINITY_DN41393_c2_g1_i2 from sample A8 / Example unspliced isoform:CATCACAAGGGTTGGTAAAATGCTATAGCAGGGATTGGGATTTTTGTTGTTTAGGCAGAGCATTATAAGATCCCAATGGGCTATTGTGATTAGCAGGACCAGAGATATTCTGGAGGATTTATCACATCATATGCAGAATTTGTTTTCTTCAGTCTTTGTAGTTTCTCTCGGTCTCTCACATATTCTTTCTTTCTTGTTGA
CCTTCAAACTGCTATAACTTTCTTGTTTCAGTTATGGAAATTGAGATTGTAGACCTACTCTCAGTCTTGTTTCCATAGTTAAATTTGAATATAATACTAAGCAAAAAATTTAGTCTTAATACATGTTATTATTATGTGTTTCACTGTTTTGTATTGAGTTATGCCAAAGCTACAAGAATACTAGTTATCTTTAGTGCTTT
AATGATGGGAATTAGTACATGCTACTTTACCATTCAGTATGTAAGATTTTCATGTTCTTGAAGGCACGATTATACTTGGTTTCATGGTCATCTTTAAACTGTTGTATTCATTAAAATGCCCAACACATTTTCTTTTCATATCTGCATGTGCTAAAGAATTCCATGCCTCTTAAACATCTATGATTCATGTTTTCTTTGAA
TGTCACTGACTTCCATCCTCGCGAACATTAGTGCCTCACATCAAAACAAGATTATATTTCTGCATATGGGATAATGGTTCCCAATGGGAAGACCCAATTTTGAATGTATGAATCTGTTTGCTTTGCCCTAGTTGTATCTTTTCCTCCATCTTCTTTATTTTGTAATCATTTAAATCTGGCACTGAGTTTATAGAAGAAAG
TTGTTGCTATGGTGACTTTGGGCAGCTAGCTTGTAAGTTGATATAAGGGTTACCCACTCTAGCTCAAGATCCAACTTGAGACCTAAAGTGGGTTGTGGATGCCTTGGCATAGTTCCTCACTAGTTAGGAACATCTCAAAGAACAACATCAAATTGACGACATTGCTAGGGAACAAAGTTCAAAGGTTTGTTTCCCTTAAA
ATGGCATTGACAAAGTTCTTAGTCCTGCTAGTGAATAAGAGCAGAACAACAGGCTGCTTGATTTTAACAAGAAAAAAATGCAGTTAAAGATTTCACCAGGTGAGCCCACATTGTTTTAATGGAGAATCCAGTTGCTTCATGGGTAGCTGCAAGGTATGCTCCATTTGATTTCTCAGCTGTACTTGGTTTTCCTAATCCTA
TGCCTAACAGAGAATAATTGGAAGATTGTCTTTCTAAGTTTTGAGAAGATGATGAGGACAATACTGCTCAACATTTGAAATACTTAATTTCATTCTTACATGCATAAGCTGCGTATTCTCCATGGAAAGAGATGCTAGATGATGGTTCAAAGCATAGTAGCATAAATAGGTGTATTCTCCATGGAAAGAGATGTTAGATG
GTGGTTCAAAGCATAGTAGCATAAATAGGTGTAGGTGTAATAAGGATGCATGGAAAGAGATGCTAGACGGTGGTTCAAAGTATAGTAACATAAATTGGCGGATTCATTCTTACTAGCGGACAATTAAATTTTGAAAAATAATTGAAAAAACTTTAATTATTTAAACACTTTACTCTATTTTTGTATTTTATTCAAACTAG
ATTTTTTCATTATGTATTTTTTCTATATCAAATCTTATTCGTATCTATATTCGTACTCTAATTATGCTACCATGGCTCAAAGATTTGCCTCCTACAAATATCTCTTCATTAAAATATTCATGAGGTTATTTATCTAGTTGATATCCTCTTCAAAGATTCTTTTGACCAAGAGGTTGAATGGAAGAATTTTTACAACAATA
AGGACAAAAATGATTTTGTTGAGGAAGATGAATAAGATTGTGATATTGAAAGTCATGCAAATATATTTCACATTAGCTTTGTCGAAGATGTATTTGAGGAATTTCATGAGGATGAATTGTTGCCTCCTTTTGCAGAGAATGGAAATGAACAAATAATTAAGGAGGTTGATGTCTCATAGTGTCATAAGGAAGATGGTGTT
GATGATGACTCCAAAAAGATTCAAATAAGCTTCAGAAATGgtatgtgtggatgaatattttaatgttggtttgtctttttcttttaattccactttcagaaaagagatatatgtaaagtgtgaagagagcaatgtttataaagaagattgagcatatctatatttgggaaatgatgggtgtattgaagGGTTGGACAAAC
CTCACTTACAAGTTCAACAAAGCAATGAAGCTTTTCTCATTACACATACGGATCAAGTATTGATAGAGAAGGAAAGCTTTGAAAAACAAATTGTGGAATCATCATACAGATAATGAGTTCCAAAATTTCCAGTCACAAACCTATTTATGATGAATGTGAATATTTGGATGTTAAGTTTCATAAAAGGATGGTTGTTCCAA
AATGATGTGAATACTTTTCTATACCAAAATCTTTTGAAAATGCTAGTATCCAAGCGCAGGTTCTGGGTGAACAACTACATGTATGTTGTATTAATTTTGTCAAAGAAGAAGTGTGGATTCC