NA ----> NA
Intron 1 GTAATGTCAT ... TGTCATGCAG
| Sample | Retention score (%) | Exon junction reads | 5'ss reads | 3'ss reads |
| A1 | 60 | 1 | 3 | 0 |
| A2 | 60 | 1 | 1 | 2 |
| A3 | 29.41 | 6 | 4 | 1 |
| A4 | 41.18 | 5 | 6 | 1 |
| A5 | 25 | 3 | 2 | 0 |
| A6 | 29.28 | 21 | 12 | 5.4 |
| A7 | 28.3 | 19 | 14 | 1 |
| A8 | 40.38 | 31 | 27 | 15 |
| A9 | 36.17 | 15 | 7 | 10 |
| A10 | 63.34 | 2.4 | 2 | 6 |
>TRINITY_DN44354_c2_g1_i1 from sample A8 / Example spliced isoformAAGGCGTGACCAGGGGTCTCCATGATACTAACCTTGACTAGTAATTGTTTTCCATACTACAATTCGTCATTTAACCTGGCCTTTTAAAGGCGTGACCAGGGGTCTCCATGATACTAACCTTGACTAGTAATTGTTTTCCATACTACAATTCGTCATTTAACCTGGCCTTTTAAAGGCGTGACCAGGGGTCTCCATCATAC
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>TRINITY_DN44354_c2_g1_i3 from sample A8 / Example unspliced isoform:AAGGCGTGACCAGGGGTCTCCATGATACTAACCTTGACTAGTAATTGTTTTCCATACTACAATTCGTCATTTAACCTGGCCTTTTAAAGGCGTGACCAGGGGTCTCCATGATACTAACCTTGACTAGTAATTGTTTTCCATACTACAATTCGTCATTTAACCTGGCCTTTTAAAGGCGTGACCAGGGGTCTCCATCATAC
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GTTTAGATTGAGCTTTGTTGTTGTCATCTGGATTCTGGACACTGGTAAGCATATTAAGCATGTCATTGCTATAAATGGCAATCAGAATCAGATAACCTTGAAAGCATACAATATTCATTTTTTAAGTATACATTGACAGGTAACACTTGGGTGTTTATTGTTGCTTGCTGTTGACCAAAGGAACATAACTACGAACCTTT
CAGTTGAGTTTATAAAGACATCTCATTCAAGGGTGTTCTTGATAGACTATTAAATAAAGCTTTCAAATTCTGTAGCTTGATACTTGCATGGCACCTATTTTCAGTAGTGTATGTCACTGTATTACA