sp|Q6AT26|CESA1_ORYSJ ----> Probable cellulose synthase A catalytic subunit 1 [UDP-forming]
Intron 1 GTAACATTGC ... TGATCTGCAG
| Sample | Retention score (%) | Exon junction reads | 5'ss reads | 3'ss reads |
| A1 | 29.27 | 29 | 7 | 17 |
| A2 | 27.27 | 16 | 4 | 8 |
| A3 | 26.88 | 34 | 8 | 17 |
| A4 | 25.53 | 35 | 11 | 13 |
| A5 | 28 | 9 | 4 | 3 |
| A6 | 20.75 | 42 | 11 | 11 |
| A7 | 21.37 | 46 | 11 | 14 |
| A8 | 24.66 | 55 | 15 | 21 |
| A9 | 25 | 48 | 9 | 23 |
| A10 | 26.58 | 29 | 7 | 14 |
>TRINITY_DN46126_c1_g1_i1 from sample A8 / Example spliced isoformGTTTTGGTTCATTTTATCAAGTGGTATTGTGAGGAGAAGGGTCTCAATAGTTATGCACAGACTGGTGTAGATTGGGGATGTGAGTGCAATGTGGGATGAAATGGCTTCTACCCACCACCGCAAAAACATGGGAAACATTGCTTGAGATTGCATAACATAAAGACATTGGGAACAGGAGATTACACTCAAATTCAGACCAT
GGAGGCTAGTGCTGGTATGATTGCAGGTTCTCACAAGAGGAACGAGCTGGTTTTGATTCGCCATGACGCGGAAGTTGGTCCGAAGCCTTTGAAGCACTCGAGCAGCCAAGTATGCCAGATTTGTGGAGATAATGTTGGTGTGACAGCAGATGGGGAGCTCTTTGTGGCGTGCAATGAGTGTGCGTTCCCAGTTTGTAGGC
CTTGCTATGAATATGAGCGTAAGGATGGAAACCAGTCTTGTCCTCAATGCAAGACCAGATACAAGAGGCATAAAGGGAGTCCAAGAGTGGAAGGAGACGAGGAAGAAGATGACGTTGATGATTTGGAGAATGAGTTTAACTACACTCACGGTGGAAGAGATGGCAGGCAACAGAGGGCAGAAGCAATGATGCAGTGGCAG
ATGCATGGGCGAGGGGAGGAGATAGATTCTGTTACCTCTTCAAGACAGGATCCCCAGACTCAAGTTCCTCTTCTCACAAACGGTCAACCGGTCTCTGGGGAGTTTCCCGATGTCTCCCCTGAGCACGTGCAAGTCAATGGTAGTGGAGATGGAAAGCGTGTTCATTCAGTCCCTTATGCTGATCCGAATCAACCAGTGCA
AGTAAGGATTGTGGACCCTTCAAAGGACTTGAATTCTTATGGAGTCGGAAATGTGGACTGGAAAGAGAGAGTAGAAAGCTGGAAGCTTAAACAAGAAAAAAATATGCTTCAAATGACAAGTGGAGGTAGATATGCTGATGGCAAAGGAGACATGGAGGGCACTGGTTCCAATGGGGAAGACCTCCCAATGGTTGATGACG
CACGACAACCTCTGAACAAGATTGTGCCTCTCCCTTCAACCAAGCTCACTCCGTACAGGATTGTGATTATTCTTCGGCTCATAATTGTGGGAGTTTTCTTTCAATACCGAGTATCGACGCCTGTGAATGATGCATATCCACTGTGGTTGGTCTCAGTTATATGTGAGGTCTGGTTTGCTACGTCATGGATTCTTGACCAG
TTTCCTAAATGGATGCCCATTAATCGAGAAACCTATCTTGACAGGCTTTCTTTGAGGTTTGACAGAGAAGGAGAGCCATCTCAGTTGGCCGGTGTTGATATTTTTGTTAGTACAGTGGACCCTCTAAAGGAGCCTCCTCTTGTCACAGCAAATACTGTTCTGTCAATCCTTGCTGTGGATTATCCTGTTGATAAAGTTTC
ATGCTATGTTTCTGATGATGGAGCAGCAATGTTGACTTTTGAAACTCTTTCAGAAACTTCAGAATTTGCAAGGAAGTGGGTGCCATTTTGCAAAAAGTACAGTATCGAGCCCAGGGCTCCAGAATCCTATTTTGCCCTGAAGATTGATTATTTGAAGGATAAAGTACAGCCAACCTTTGTGAAAGAACGCAGAGCAATGA
AGAGGGAATATGAAGAGTACAAGATCCGAATTAATGCTCTTGTGGCCAAAGCACAAAAAGTGCCTGAGGAGGGATGGACCATGCAAGATGGGACTCCATGGCCAGGCAACAACACTCGAGACCATCCTGGGATGATCCAGGTATTCTTAGGTCATAGTGGGGGCGTTGACAATGATGGCAATGAATTACCACGGTTAGTT
TATGTATCCCGTGAAAAGAGGCCTGGTTTCCAACACCACAAGAAAGCTGGTGCAATGAATGCATTGGTCCGAGTTTCTGCTGTCCTCACAAATGGCCTCTTTCTCTTGAATCTTGACTGTGATCATTATATAAACAACAGCAAAGCTCTTCGTGAGGCAATGTGTTTTCTAATGGATCCTGCTCTTGGGAAGAAAACTTG
CTATGTACAGTTCCCTCAGAGATTTGATGGTATTGATCGAAATGATCGATATGCTAATCGCAACACTGTGTTCTTTGATATCACCTTGAGAGGTTTTGATGGCATCCAAGGGCCTGTCTATGTGGGTACAGGGTGCTGTTTTAATAGACAAGCACTCTATGGTTATGACCCTGTTCTCAGTGAGAAGGATCTTGAACCAG
CATGTTTTCTGAGATGCTGCTGGGGATCTAGAAAGAAGAGCAAAAGGGCAAACAAAAGGTTTGATGATGATAAGAAGAGAACCAAGCGAACTGAATCTACCATACCCATCTTTAGTTTGGAAGACATAGAAGAGGGTGTCGAAGGATTTGACGATGAGAAATCATTGCTCATGTCCCAAAGGAGCTTAGAGAAAAGGTTT
GGTCAATCACCAGTTTTTATCCAATCTACTCTCATGGAAAATGGCGGTCTTCCACAGTCTGCCAATCCTGCTTCTTTATTGAAAGAAGCTATTCATGTTATCAGTTGTGGATATGAAGACAAGTCCGAATGGGGAAAAGAGATTGGGTGGATTTATGGTTCTGTCACTGAAGATATTTTGACTGGGTTTAAAATGCATGC
TCGAGGCTGGATTTCAATCTATTGCATGCCTGCACGTCCCGCATTCAAAGGATCTGCACCAATCAATCTTTCAGATCGTTTGAATCAAGTGCTCCGATGGGCCCTTGGTTCTGTTGAAATTCTACTGAGCAGGCATTGTCCAATTTGGTATGGCTACACTGGAAGATTGAAACCATTGCAGAGGCTGGCATACATCAACA
CCATAGTTTATCCTCTCACATCCCTGCCATTGGTTGCATATTGTACCCTGCCAGCTGTTTGTCTTCTTACAGGGAAGTTTATCATTCCTGAGATTAGCAACTTTGCAAGTGTATTCTTTATATTATATTTTATTTCCATTTTTACAACTGCTATTCTAGAGCTACGCTGGAGTGGGGTTGGCATCGATGAATGGTGGAGG
AATGAGCAATTTTGGGTGATTGGAGGTGTATCGGCACATCTGTTTGCTGTCTTTCAAGGGTTACTGAAAGTTCTAGCAGGGATTGACACAAACTTTACTGTCACATCAAAGTCTTCAGATGAGGATGGCGAATTTGCTGAGCTATATGTTTTCAAGTGGACCAGTCTGCTCATCCCTCCGACTACTTTGCTGGTGGTAAA
TCTTGTTGGTGTAGTAGCAGGTGTTTCCCAAGCTATTAACAGTGGTTATCAATCATGGGGTCCCCTATTTGGAAAACTGTTTTTCTCTCTGTGGGTGATAGTCCATCTTTATCCCTTCCTCAAGGGATTAATGGGTCGCCAGAACCGGACACCCACAATCGTCATTGTTTGGTCAATTCTTCTTGCATCCATATTCTCCC
TGCTATGGGTGAGGATAGATCCTTTCACATCAAGCACAACATCAAGTGCACAACAATGTGGTATAAATTGCTAAATACCCTGCTGGTAGTGTTCATTAGCAGCAAATAAGGAGGAACTAGAAGCACTTATTTGAGGGTCAAAAATGTCTCAAATTCGTTTGTATCATCTGTAGATAATAAATATTGAGAGGGAGGGGCTT
TAAGCATATTGCTTTCTAGCTTGGTTCCAGCATAGGGACTGAACCTTGTACTTTGTCTTTCATTGATAGTTAAGATTGTACGATGCAGTTTGTTCTGTATTTGAAGTAAGACAGCTGAGATTTACTCGGAGTCATGCCTATTGCAGAATTGATCTGATGCGACAGAATAGTAGGCAATGGTTTGATATTGAAGAATGCTT
TTTTCGAAAGACTTATTCATTTTAAGTGACAACCCTGTTATGATCAAGATTTCTGGCATCTCTTAGTTGATATATATATATATATATCTCCGAGGTATATATATCTGAGGTGGTCAATATCAAATAACTGATTGTCATGTAGGAGACTGGCAGTTATTAAGACTTTAGGCATACAAGTGCCTATGAAAATAGTAAACGTA
CGTTGATTGTTCATTTCATAAATTACAATTATAACTATGTTCTGGAATCATGACCCTGTTTTTGACGACTGCTTTGCATTCAAACTTCAAATTGTAAGTTATGCAGTGCATTAAGTGACATTCGAATTTTGAGCTACCCTCGTGTCATGTATATTTGAGATCCGTTTTAAAATTTCTTGTTCCAGGC
>TRINITY_DN46126_c1_g1_i6 from sample A8 / Example unspliced isoform:GTTTTGGTTCATTTTATCAAGTGGTATTGTGAGGAGAAGGGTCTCAATAGTTATGCACAGACTGGTGTAGATTGGGGATGTGAGTGCAATGTGGGATGAAATGGCTTCTACCCACCACCGCAAAAACATGGGAAACATTGCTTGAGATTGCATAACATAAAGACATTGGGAACAGGAGATTACACTCAAATTCAGACCAT
GGAGGCTAGTGCTGGTATGATTGCAGGTTCTCACAAGAGGAACGAGCTGGTTTTGATTCGCCATGACGCGGAAGTTGGTCCGAAGCCTTTGAAGCACTCGAGCAGCCAAGTATGCCAGATTTGTGGAGATAATGTTGGTGTGACAGCAGATGGGGAGCTCTTTGTGGCGTGCAATGAGTGTGCGTTCCCAGTTTGTAGGC
CTTGCTATGAATATGAGCGTAAGGATGGAAACCAGTCTTGTCCTCAATGCAAGACCAGATACAAGAGGCATAAAGGGAGTCCAAGAGTGGAAGGAGACGAGGAAGAAGATGACGTTGATGATTTGGAGAATGAGTTTAACTACACTCACGGTGGAAGAGATGGCAGGCAACAGAGGGCAGAAGCAATGATGCAGTGGCAG
ATGCATGGGCGAGGGGAGGAGATAGATTCTGTTACCTCTTCAAGACAGGATCCCCAGACTCAAGTTCCTCTTCTCACAAACGGTCAACCGGTCTCTGGGGAGTTTCCCGATGTCTCCCCTGAGCACGTGCAAGTCAATGGTAGTGGAGATGGAAAGCGTGTTCATTCAGTCCCTTATGCTGATCCGAATCAACCAGTGCA
AGTAAGGATTGTGGACCCTTCAAAGGACTTGAATTCTTATGGAGTCGGAAATGTGGACTGGAAAGAGAGAGTAGAAAGCTGGAAGCTTAAACAAGAAAAAAATATGCTTCAAATGACAAGTGGAGGTAGATATGCTGATGGCAAAGGAGACATGGAGGGCACTGGTTCCAATGGGGAAGACCTCCCAATGGTTGATGACG
CACGACAACCTCTGAACAAGATTGTGCCTCTCCCTTCAACCAAGCTCACTCCGTACAGGATTGTGATTATTCTTCGGCTCATAATTGTGGGAGTTTTCTTTCAATACCGAGTATCGACGCCTGTGAATGATGCATATCCACTGTGGTTGGTCTCAGTTATATGTGAGGTCTGGTTTGCTACGTCATGGATTCTTGACCAG
TTTCCTAAATGGATGCCCATTAATCGAGAAACCTATCTTGACAGGCTTTCTTTGAGGTTTGACAGAGAAGGAGAGCCATCTCAGTTGGCCGGTGTTGATATTTTTGTTAGTACAGTGGACCCTCTAAAGGAGCCTCCTCTTGTCACAGCAAATACTGTTCTGTCAATCCTTGCTGTGGATTATCCTGTTGATAAAGTTTC
ATGCTATGTTTCTGATGATGGAGCAGCAATGTTGACTTTTGAAACTCTTTCAGAAACTTCAGAATTTGCAAGGAAGTGGGTGCCATTTTGCAAAAAGTACAGTATCGAGCCCAGGGCTCCAGAATCCTATTTTGCCCTGAAGATTGATTATTTGAAGGATAAAGTACAGCCAACCTTTGTGAAAGAACGCAGAGCAATGA
AGAGGGAATATGAAGAGTACAAGATCCGAATTAATGCTCTTGTGGCCAAAGCACAAAAAGTGCCTGAGGAGGGATGGACCATGCAAGATGGGACTCCATGGCCAGGCAACAACACTCGAGACCATCCTGGGATGATCCAGGTATTCTTAGGTCATAGTGGGGGCGTTGACAATGATGGCAATGAATTACCACGGTTAGTT
TATGTATCCCGTGAAAAGAGGCCTGGTTTCCAACACCACAAGAAAGCTGGTGCAATGAATGCATTGGTCCGAGTTTCTGCTGTCCTCACAAATGGCCTCTTTCTCTTGAATCTTGACTGTGATCATTATATAAACAACAGCAAAGCTCTTCGTGAGGCAATGTGTTTTCTAATGGATCCTGCTCTTGGGAAGAAAACTTG
CTATGTACAGTTCCCTCAGAGATTTGATGGTATTGATCGAAATGATCGATATGCTAATCGCAACACTGTGTTCTTTGATATCACCTTGAGAGGTTTTGATGGCATCCAAGGGCCTGTCTATGTGGGTACAGGGTGCTGTTTTAATAGACAAGCACTCTATGGTTATGACCCTGTTCTCAGTGAGAAGGATCTTGAACCAG
CATGTTTTCTGAGATGCTGCTGGGGATCTAGAAAGAAGAGCAAAAGGGCAAACAAAAGGTTTGATGATGATAAGAAGAGAACCAAGCGAACTGAATCTACCATACCCATCTTTAGTTTGGAAGACATAGAAGAGGGTGTCGAAGGATTTGACGATGAGAAATCATTGCTCATGTCCCAAAGGAGCTTAGAGAAAAGGTTT
GGTCAATCACCAGTTTTTATCCAATCTACTCTCATGGAAAATGGCGGTCTTCCACAGTCTGCCAATCCTGCTTCTTTATTGAAAGAAGCTATTCATGTTATCAGTTGTGGATATGAAGACAAGTCCGAATGGGGAAAAGAGATTGGGTGGATTTATGGTTCTGTCACTGAAGATATTTTGACTGGGTTTAAAATGCATGC
TCGAGGCTGGATTTCAATCTATTGCATGCCTGCACGTCCCGCATTCAAAGGATCTGCACCAATCAATCTTTCAGATCGTTTGAATCAAGTGCTCCGATGGGCCCTTGGTTCTGTTGAAATTCTACTGAGCAGGCATTGTCCAATTTGGTATGGCTACACTGGAAGATTGAAACCATTGCAGAGGCTGGCATACATCAACA
CCATAGTTTATCCTCTCACATCCCTGCCATTGGTTGCATATTGTACCCTGCCAGCTGTTTGTCTTCTTACAGGGAAGTTTATCATTCCTGAGgtaacattgccaacctttactcaccccttgtatcttttttatttcagatgagtcattgtagtcttttagatgttttttggattttgtacttgtgtaaagtttcacatg
ccccccctgacttttctctttattctgatctgcagATTAGCAACTTTGCAAGTGTATTCTTTATATTATATTTTATTTCCATTTTTACAACTGCTATTCTAGAGCTACGCTGGAGTGGGGTTGGCATCGATGAATGGTGGAGGAATGAGCAATTTTGGGTGATTGGAGGTGTATCGGCACATCTGTTTGCTGTCTTTCAA
GGGTTACTGAAAGTTCTAGCAGGGATTGACACAAACTTTACTGTCACATCAAAGTCTTCAGATGAGGATGGCGAATTTGCTGAGCTATATGTTTTCAAGTGGACCAGTCTGCTCATCCCTCCGACTACTTTGCTGGTGGTAAATCTTGTTGGTGTAGTAGCAGGTGTTTCCCAAGCTATTAACAGTGGTTATCAATCATG
GGGTCCCCTATTTGGAAAACTGTTTTTCTCTCTGTGGGTGATAGTCCATCTTTATCCCTTCCTCAAGGGATTAATGGGTCGCCAGAACCGGACACCCACAATCGTCATTGTTTGGTCAATTCTTCTTGCATCCATATTCTCCCTGCTATGGGTGAGGATAGATCCTTTCACATCAAGCACAACATCAAGTGCACAACAAT
GTGGTATAAATTGCTAAATACCCTGCTGGTAGTGTTCATTAGCAGCAAATAAGGAGGAACTAGAAGCACTTATTTGAGGGTCAAAAATGTCTCAAATTCGTTTGTATCATCTGTAGATAATAAATATTGAGAGGGAGGGGCTTTAAGCATATTGCTTTCTAGCTTGGTTCCAGCATAGGGACTGAACCTTGTACTTTGTC
TTTCATTGATAGTTAAGATTGTACGATGCAGTTTGTTCTGTATTTGAAGTAAGACAGCTGAGATTTACTCGGAGTCATGCCTATTGCAGAATTGATCTGATGCGACAGAATAGTAGGCAATGGTTTGATATTGAAGAATGCTTTTTTCGAAAGACTTATTCATTTTAAGTGACAACCCTGTTATGATCAAGATTTCTGGC
ATCTCTTAGTTGATATATATATATATATATCTCCGAGGTATATATATCTGAGGTGGTCAATATCAAATAACTGATTGTCATGTAGGAGACTGGCAGTTATTAAGACTTTAGGCATACAAGTGCCTATGAAAATAGTAAACGTACGTTGATTGTTCATTTCATAAATTACAATTATAACTATGTTCTGGAATCATGACCCT
GTTTTTGACGACTGCTTTGCATTCAAACTTCAAATTGTAAGTTATGCAGTGCATTAAGTGACATTCGAATTTTGAGCTACCCTCGTGTCATGTATATTTGAGATCCGTTTTAAAATTTCTTGTTCCAGGC