sp|Q9FXA2|PABP8_ARATH ----> Polyadenylate-binding protein 8

Intron 1 GTAGGTAATT ... TTTTGTGCAG

Sample	Retention score (%)	Exon junction reads	5'ss reads	3'ss reads
A1	19.8	162	11	40
A2	20.34	94	8	24
A3	16.36	184	15.5	36
A4	21.28	74	5	20
A5	18	82	6.5	18
A6	17.63	1205	91.5	258
A7	18.99	1335	94.5	313
A8	18.79	1167	84.5	270
A9	18.46	1727	113.5	391
A10	19.68	1306	78	320

>TRINITY_DN37396_c0_g1_i1 from sample A7 / Example spliced isoform

AAGAGAAGTAAAGAGCTAAATACCCAGTTCTAGGCAGAGCCCGGTGTTCGATCCTCAGACAGTACGATTATCATCAGCTCAACCCCCCTACGTAGAGTAGAGCATCCTGCAATCAGAATGGCAGCAGGGATTCCAGATGCTACGGTGTATATTGGGAACTTGGATGAGAAGGTGGATGAGAAAATCCTGTATGAGATAAT
GGTCCAGGCAGGGCCCCTGGTAAATGTGCACATTCCAAGAGACTCTGATACCAAGAAACAGAGAGGTTATGGATTTGCAGAGTACACAACGGAGTCCAACGCTCAGTATGCAGTCAGATTGTTTTCTGGTTTAGTTTGTCTTCATAACAGGCCTCTTCGCTTTCAGATATCTGGTCAAGGCGCAGCCCTGCAGCAGCCAT
CGCCGAAGCCGCAGCAGCCATCGCCGAAGCCAATGCAATTTACACAGATACGTCCAAGCCCACAAAATGCAAATCCTCATAGGGCTTTTTCCAGGTCGCCATCTGCTTCCCCTGCTGGTTCAGGCTACTCATCTGGCAAAACTTGTAACAGCCCCGCTGAGAGAAAGAAGACTGCTCCTTATAAAAAGTCACCCCTGTCA
AATAATCCCACTGTTGCAGATCCATCGAGATGCAGCGCTCATTTGACAGCAATCGATCGCCTGGGTTTTAGATCCCCTCTTCCTGGAACTAGATACTCGTACGCATCTCCTTCGTATTAGCTTCAACTGCTGTTGCAGATTCACACTTAGTTCACTTACTGTATTACTAGTTTCTTCAATAGTTAGCTTGTCAGCTTTTC
ATGGAGTTGATTCATTCAGTTGGGGAGGATTTCGAATGAAAGTAGTATCTTCGGGTGGTATTTCAAAAATCCCATTTGTCATACAGCCTTGAGGAAGTTGTTGGGAATCATCCTACACGATTATAAGCTGCCACAGGTTACAGATCAATGCCAATCTGGATTATACTAGGTGCTTGAGTGGGATTTAATTTACTGGTGTT
TTGGTGGTTGGATTACCTTTGTCTTCCTTTTGTATTTTGAAAATGAGCATTTTCAACATATACAACATTAAACACAATGAAGCTCAACAGAGTCCATTTAATGGTGTAACAACAATAAGTTAAACAAAGTAAATTTCATGGTATACTTGACAAAGGGGAC

>TRINITY_DN37396_c0_g1_i2 from sample A7 / Example unspliced isoform:

ATAACAGGCCTCTTCGCTTTCAGgtaggtaattatgattctgggcatttctgtattccttttctcagcagatataaatatgggcttgggtatctctgtactgcaaatatggtcttgggcatctctaattgtcagcatatgtgcattctgtagcccagtaattgaacccatattggtttcttaatgtatacactcagaaat
ccatcttagcccaagttccgttatgtgtcctagctagctagctaggagggttccgttatgtgtcctagctagctagctaggagggttggtcttgaagggtcttacctgatttagctctgctaaggcaagcaatgtcttcaaagatcttacttgagcccagttaaggtgcttgtcatgagctcaagctcaactcatgcagg
taaggtcctgaataaaatggttataaacttgtacttgagctgagataaggtcctgatagggtcttggtatcaaattccatattaaatttcttgagatgaacacttcaagaaatatgatgatctctcggtctttgtaaatatgattttggcatctctgtatttgtttggtcagtatatgcccagttaaggtgcttgtcatg
agttcaagttcaactcaacttatacttgagctgagataaggtcctaataggatcttggtctcaaattccttactaaatttctttagttggacacttcacgaaatatgatacctctcagtctttgtaaatatgatcttggcatctctgctatgatacctcacagtctttgtaaatatgatcttggcatctctgttatgata
cctttcagtctttgtaaatgtgatcttggcatctctgtatttgtttgctcagtatatgtgcattctacagcccagtagtcaaacccttgctttcttttataatatacacaagttaacacagagatccatctaaatccaaggtctgttacacattctacctaaacgagctaggaagattgatcttgcatggtcctgagctg
gctctgctaaggccggtaatgacttgaaagatcttacttgaactcagttaaggtccctgtccggagcttgagttcaactcatgcaggcaatgtcctggttgtgatcagctaaggtcctcactaggtcttagtatcgaattcctcattaactgggtacaacaacatcgagattgacacatcaagggctgtgtaacatatat
tcagggctaagatgtaattgtgctaattttgtgcagATATCTGGTCAAGGCGCAGCCCTGCAGCAGCCATCGCCGAAGCCGCAGCAGCCATCGCCGAAGCCAATGCAATTTACACAGATACGTCCAAGCCCACAAAATGCAAATCCTCATAGGGCTTTTTCCAGGTCGCCATCTGCTTCCCCTGCTGGTTCAGGCTACTC
ATCTGGTAAATCATATGCTCAGCCTTTATAGTATTAGCTATAGCAGTGTGTTTTTCTTTTGTCACATCTGTTTGAAACATTTTTTTCTGTATTTTTTCTCAGGCAAAACTTGTAACAGCCCG

Intron 2 GTAAATCATA ... TTTTTCTCAG

Sample	Retention score (%)	Exon junction reads	5'ss reads	3'ss reads
A1	7.5	108	10.5	9
A2	11.05	81	12.5	10.5
A3	9.32	162	15	17.3
A4	5.96	81	12	5.3
A5	8.23	73	9.5	6.8
A6	12.8	1190	145	183.8
A7	12.65	1190	129.5	180.8
A8	11.85	1273	143.5	178.8
A9	11.85	1799	200.5	253
A10	13.28	1241	134.5	200.3

>TRINITY_DN37396_c0_g1_i1 from sample A7 / Example spliced isoform

AAGAGAAGTAAAGAGCTAAATACCCAGTTCTAGGCAGAGCCCGGTGTTCGATCCTCAGACAGTACGATTATCATCAGCTCAACCCCCCTACGTAGAGTAGAGCATCCTGCAATCAGAATGGCAGCAGGGATTCCAGATGCTACGGTGTATATTGGGAACTTGGATGAGAAGGTGGATGAGAAAATCCTGTATGAGATAAT
GGTCCAGGCAGGGCCCCTGGTAAATGTGCACATTCCAAGAGACTCTGATACCAAGAAACAGAGAGGTTATGGATTTGCAGAGTACACAACGGAGTCCAACGCTCAGTATGCAGTCAGATTGTTTTCTGGTTTAGTTTGTCTTCATAACAGGCCTCTTCGCTTTCAGATATCTGGTCAAGGCGCAGCCCTGCAGCAGCCAT
CGCCGAAGCCGCAGCAGCCATCGCCGAAGCCAATGCAATTTACACAGATACGTCCAAGCCCACAAAATGCAAATCCTCATAGGGCTTTTTCCAGGTCGCCATCTGCTTCCCCTGCTGGTTCAGGCTACTCATCTGGCAAAACTTGTAACAGCCCCGCTGAGAGAAAGAAGACTGCTCCTTATAAAAAGTCACCCCTGTCA
AATAATCCCACTGTTGCAGATCCATCGAGATGCAGCGCTCATTTGACAGCAATCGATCGCCTGGGTTTTAGATCCCCTCTTCCTGGAACTAGATACTCGTACGCATCTCCTTCGTATTAGCTTCAACTGCTGTTGCAGATTCACACTTAGTTCACTTACTGTATTACTAGTTTCTTCAATAGTTAGCTTGTCAGCTTTTC
ATGGAGTTGATTCATTCAGTTGGGGAGGATTTCGAATGAAAGTAGTATCTTCGGGTGGTATTTCAAAAATCCCATTTGTCATACAGCCTTGAGGAAGTTGTTGGGAATCATCCTACACGATTATAAGCTGCCACAGGTTACAGATCAATGCCAATCTGGATTATACTAGGTGCTTGAGTGGGATTTAATTTACTGGTGTT
TTGGTGGTTGGATTACCTTTGTCTTCCTTTTGTATTTTGAAAATGAGCATTTTCAACATATACAACATTAAACACAATGAAGCTCAACAGAGTCCATTTAATGGTGTAACAACAATAAGTTAAACAAAGTAAATTTCATGGTATACTTGACAAAGGGGAC

>TRINITY_DN37396_c0_g1_i2 from sample A7 / Example unspliced isoform:

ATAACAGGCCTCTTCGCTTTCAGGTAGGTAATTATGATTCTGGGCATTTCTGTATTCCTTTTCTCAGCAGATATAAATATGGGCTTGGGTATCTCTGTACTGCAAATATGGTCTTGGGCATCTCTAATTGTCAGCATATGTGCATTCTGTAGCCCAGTAATTGAACCCATATTGGTTTCTTAATGTATACACTCAGAAAT
CCATCTTAGCCCAAGTTCCGTTATGTGTCCTAGCTAGCTAGCTAGGAGGGTTCCGTTATGTGTCCTAGCTAGCTAGCTAGGAGGGTTGGTCTTGAAGGGTCTTACCTGATTTAGCTCTGCTAAGGCAAGCAATGTCTTCAAAGATCTTACTTGAGCCCAGTTAAGGTGCTTGTCATGAGCTCAAGCTCAACTCATGCAGG
TAAGGTCCTGAATAAAATGGTTATAAACTTGTACTTGAGCTGAGATAAGGTCCTGATAGGGTCTTGGTATCAAATTCCATATTAAATTTCTTGAGATGAACACTTCAAGAAATATGATGATCTCTCGGTCTTTGTAAATATGATTTTGGCATCTCTGTATTTGTTTGGTCAGTATATGCCCAGTTAAGGTGCTTGTCATG
AGTTCAAGTTCAACTCAACTTATACTTGAGCTGAGATAAGGTCCTAATAGGATCTTGGTCTCAAATTCCTTACTAAATTTCTTTAGTTGGACACTTCACGAAATATGATACCTCTCAGTCTTTGTAAATATGATCTTGGCATCTCTGCTATGATACCTCACAGTCTTTGTAAATATGATCTTGGCATCTCTGTTATGATA
CCTTTCAGTCTTTGTAAATGTGATCTTGGCATCTCTGTATTTGTTTGCTCAGTATATGTGCATTCTACAGCCCAGTAGTCAAACCCTTGCTTTCTTTTATAATATACACAAGTTAACACAGAGATCCATCTAAATCCAAGGTCTGTTACACATTCTACCTAAACGAGCTAGGAAGATTGATCTTGCATGGTCCTGAGCTG
GCTCTGCTAAGGCCGGTAATGACTTGAAAGATCTTACTTGAACTCAGTTAAGGTCCCTGTCCGGAGCTTGAGTTCAACTCATGCAGGCAATGTCCTGGTTGTGATCAGCTAAGGTCCTCACTAGGTCTTAGTATCGAATTCCTCATTAACTGGGTACAACAACATCGAGATTGACACATCAAGGGCTGTGTAACATATAT
TCAGGGCTAAGATGTAATTGTGCTAATTTTGTGCAGATATCTGGTCAAGGCGCAGCCCTGCAGCAGCCATCGCCGAAGCCGCAGCAGCCATCGCCGAAGCCAATGCAATTTACACAGATACGTCCAAGCCCACAAAATGCAAATCCTCATAGGGCTTTTTCCAGGTCGCCATCTGCTTCCCCTGCTGGTTCAGGCTACTC
ATCTGgtaaatcatatgctcagcctttatagtattagctatagcagtgtgtttttcttttgtcacatctgtttgaaacatttttttctgtattttttctcagGCAAAACTTGTAACAGCCCG

Intron 3 GTGATTACAA ... TTGTATGCAG

Sample	Retention score (%)	Exon junction reads	5'ss reads	3'ss reads
A1	13.85	168	0	27
A2	16.78	119	2	24
A3	16.48	218	0	43
A4	12.58	139	0	20
A5	17.47	137	1	29
A6	16.76	993	0	200
A7	16.12	1280	0	246
A8	16.7	898	0	180
A9	15.05	1941	2	344
A10	14.94	1520	0	267

>TRINITY_DN34124_c0_g1_i1 from sample A9 / Example spliced isoform

GTCTAATCACAGCAGTTACCTTAAATAAATATCATTATATATATATTTTAAATGAATTCCAAATCAAGAGAAGTAAAGAGCTAAATACCCAGTTCTAGGCAGAGCCCGGTGTTCGATCCTCAGACAGTACGATTATCATCAGCTCAACCCCCCTACGTAGAGTAGAGCATCCTGCAATCAGAATGGCAGCAGGGATTCCA
GATGCTACGGTGTATATTGGGAACTTGGATGAGAAGGTGGATGAGAAAATCCTGTATGAGATAATGGTCCAGGCAGGGCCCCTGGTAAATGTGCACATTCCAAGAGACTCTGATACCAAGAAACAGAGAGGTTATGGATTTGCAGAGTACACAACGGAGTCCAACGCTCAGTATGCAGTCAGATTGTTTTCTGGTTTAGT
TTGTCTTCATAACAGGCCTCTTCGCTTTCAGATATCTGGTCAAGGCGCAGCCCTGCAGCAGCCATCGCCGAAGCCGCAGCAGCCATCGCCGAAGCCAATGCAATTTACACAGATACGTCCAAGCCCACAAAATGCAAATCCTCATAGGGCTTTTTCCAGGTCGCCATCTGCTTCCCCTGCTGGTTCAGGCTACTCATCTG
GCAAAACTTGTAACAGCCCCGCTGAGAGAAAGAAGACTGCTCCTTATAAAAAGTCACCCCTGTCAAATAATCCCACTGTTGCAGATCCATCGAGATGCAGCGCTCATTTGACAGCAATCGATCGCCTGGGTTTTAGATCCCCTCTTCCTGGAACTAGATACTCGTACGCATCTCCTTCGTATTAGCTTCAACTGCTGTTG
CAGATTCACACTTAGTTCACTTACTGTATTACTAGTTTCTTCAATAGTTAGCTTGTCAGCTTTTCATGGAGTTGATTCATTCAGTTGGGGAGGATTTCGAATGAAAGTAGTATCTTCGGGTGGTATTTCAAAAATCCCATTTGTCATACAGCCTTGAGGAAGTTGTTGGGAATCATCCTACACGATTATAAGCTGCCACA
GGTTACAGATCAATGCCAATCTGGATTATACTAGGTGCTTGAGTGGGATTTAATTTACTGGTGTTTTGGTGGTTGGATTACCTTTGTCTTCCTTTTGTATTTTGAAAATGAGCATTTTCAACATATACAACATTAAACACAATGAAGCTCAACAGAGTCCATTTAATGGTGTAACAACAATAAGTTAAACAAAGTAAATT
TCATGGTATACTTGACAAAGG

>TRINITY_DN34124_c0_g1_i2 from sample A9 / Example unspliced isoform:

CCAGATGCTACGGTGTATATTGgtgattacaataagcccataacgcaattgttcttcaattttattcaatcctctgtttcagaaaaatgtaatggttctttatagtttctttcactattgtcccttaatggttgacattgtatgcagGGAACTTGGATGAGAAGGTGGATGAGAAAATCCTGTATGAGATAATGGTCCAG
GCAGGGCCCCTGGTAAATGTGCACATTCCAAGAGACTCTGATACCAAGAAACAGAGAGGTTATGGATTTGCAGAGTACACAACGGAGTCCAACGCTCAGTATGCAGTCAGATTGTTTTCTGGTTTAGTTTGTCTTCATAACAGGCCTCTTCGCTTTCAGGTAGGTAATTATGATTCTGGGCATTTCTGTATTCCTTTTCT
CAGCAGATATAAATATGGGCTTGGGTATCTCTGTACTGCAAATATGGTCTTGGGCATCTCTAATTGTCAGCATATGTGCATTCTGTAGCCCAGTAATTGAACCCATATTGGTTTCTTAATGTATACACTCAGAAATCCATCTTAGCCCAAGTTCCGTTATGTGTCCTAGCTAGCTAGCTAGGAGGGTTCCGTTATGTGTC
CTAGCTAGCTAGCTAGGAGGGTTGGTCTTGAAGGGTCTTACCTGATTTAGCTCTGCTAAGGCAAGCAATGTCTTCAAAGATCTTACTTGAGCCCAGTTAAGGTGCTTGTCATGAGCTCAAGCTCAACTCATGCAGGTAAGGTCCTGAATAAAATGGTTATAAACTTGTACTTGAGCTGAGATAAGGTCCTGATAGGGTCT
TGGTATCAAATTCCATATTAAATTTCTTGAGATGAACACTTCAAGAAATATGATGATCTCTCGGTCTTTGTAAATATGATTTTGGCATCTCTGTATTTGTTTGGTCAGTATATGCCCAGTTAAGGTGCTTGTCATGAGTTCAAGTTCAACTCAACTTATACTTGAGCTGAGATAAGGTCCTAATAGGATCTTGGTCTCAA
ATTCCTTACTAAATTTCTTTAGTTGGACACTTCACGAAATATGATACCTCTCAGTCTTTGTAAATATGATCTTGGCATCTCTGCTATGATACCTCACAGTCTTTGTAAATATGATCTTGGCATCTCTGTTATGATACCTTTCAGTCTTTGTAAATGTGATCTTGGCATCTCTGTATTTGTTTGCTCAGTATATGTGCATT
CTACAGCCCAGTAGTCAAACCCTTGCTTTCTTTTATAATATACACAAGTTAACACAGAGATCCATCTAAATCCAAGGTCTGTTACACATTCTACCTAAACGAGCTAGGAAGATTGATCTTGCATGGTCCTGAGCTGGCTCTGCTAAGGCCGGTAATGACTTGAAAGATCTTACTTGAACTCAGTTAAGGTCCCTGTCCGG
AGCTTGAGTTCAACTCATGCAGGCAATGTCCTGGTTGTGATCAGCTAAGGTCCTCACTAGGTCTTAGTATCGAATTCCTCATTAACTGGGTACAACAACATCGAGATTGACACATCAAGGGCTGTGTAACATATATTCAGGGCTAAGATGTAATTGTGCTAATTTTGTGCAGATATCTGGTCAAGGCGCAGCCCTGCAGC
AGCCATCGCCGAAGCCGCAGCAGCCATCGCCGAAGCCAATGCAATTTACACAGATACGTCCAAGCCCACAAAATGCAAATCCTCATAGGGCTTTTTCCAGGTCGCCATCTGCTTCCCCTGCTGGTTCAGGCTACTCATCTGGTAAATCATATGCTCAGCCTTTATAGTATTAGCTATAGCAGTGTGTTTTTCTTTTGTCA
CATCTGTTTGAAACATTTTTTTCTGTATTTTTTCTCAGGCAAAACTTGTAACAGCCCCGCTGAGAGAAAGAAGACTGCTCCTTATAAAAAGTCACCCCTGTCAAATAATCCCACTGTTGCAGATCCATCGAGATGCAGCGCTCATTTGACAGCAATCGATCGCCTGGGTTTTAGATCCCCTCTTCCTGGAACTAGATACT
CGTACGCATCTCCTTCGTATTAGCTTCAACTGCTGTTGCAGATTCACACTTAGTTCACTTACTGTATTACTAGTTTCTTCAATAGTTAGCTTGTCAGCTTTTCATGGAGTTGATTCATTCAGTTGGGGAGGATTTCGAATGAAAGTAGTATCTTCGGGTGGTATTTCAAAAATCCCATTTGTCATACAGCCTTGAGGAAG
TTGTTGGGAATCATCCTACACGATTATAAGCTGCCACAGGTTACAGATCAATGCCAATCTGGATTATACTAGGTGCTTGAGTGGGATTTAATTTACTGGTGTTTTGGTGGTTGGATTACCTTTGTCTTCCTTTTGTATTTTGAAAATGAGCATTTTCAACATATACAACATTAAACACAATGAAGCTCAACAGAGTCCAT
TTAATGGTGTAACAACAATAAGTTAAACAAAGTAAATTTCATGGTATACTTGACAAAGG