sp|Q9XHP0|11S2_SESIN ----> 11S globulin seed storage protein 2

Intron 1 GTAACCTCTT ... AATCTGTTAG

Sample	Retention score (%)	Exon junction reads	5'ss reads	3'ss reads
A1	25.97	253.7	27.3	89
A2	20.62	258	38	67
A3	15.97	247.3	36.7	47
A4	19.03	200	21.7	47
A5	17.11	155	27.3	32
A6	16.89	2160	338	439
A7	16.56	1778	318	353
A8	19.04	1301	173	306
A9	18.78	1436	209.3	332
A10	16.54	1337	211.3	265

>TRINITY_DN48699_c1_g3_i1 from sample A7 / Example spliced isoform

GGATGATGAGAAAAGTCTGCTACGATCAGAAGCCACGTGTCTGAAAGACCACTAACAGGGCTTTACAGAAGCCACGTGTCTCAAAGCACCTAACACAGAAGCCACGTGTCCCACTTTGGTTTCAATGGGCAGTTGAACTGGACCTCTTACAGCGTGTCACATGAGCATCAGGTAGTCTATCGGAGTGTAGTCAGCAGTTT
AGCTGGACACACTCAGCTTCTCTCGGTGTTTGACTGGTACTCCTAATTTTATTTCGAGCGGATTTGTAGGAAAAAACAGTCAGTTGCCATTTTTGCATGATCGATGGAGAGATCCAGTAATCTTATTCTTATCCCTTTGGACAAGATCATATATCCCTATATATGCATGCCTTGTTTCTTGTATTTCTTCACCAGCTTCC
TGCAACAGGTTGTGTAGTTTTTTTTCCTCGAGTCTATTGTTTTTTAAGGTCTCTTGATTTCGAAGAGTTACAGAAAGCAAAGAGGCAATGGAGGCCGCACCCAAGAGAGTCTTGACCCCTGCTGAGCCCAAGAAGATCCTGAGCTCAGAAGGAGGGTCTTATTATGCATGGGCAAGTTCAGATCTCTGCATGTTAGCAGA
GGCCAAAGTTGGAGCAGCCAAGCTTCTTCTCAATTATCGTGGCCTGTCTTTGCCAAAGTATTCCGACTCTTCGAAAGTTTGCTATGTGCTTCAAGGATCTGGAGTCGCAGGGATACTTGTTCCAGAGGCAGAGTCTGAGCGGGTGGTGAAAATCCGCAAAGGGGATGCCATCGCTGTGCCGATGGGAGTGATCAGCTGGT
GGTTCAATGACAATTCTTCTGAGGTTTTGGAAATCCTATTCCTCGGAGATACATCGAAGGCCCATCGTTCTGGAGAGTTTACTGTATGTATAAATATAACCTTTATTTTTTACAAATGGCAATGATTTCAGGTTAGATTGTTTTATTGTATTCAATGATACGTTCATTCATTAATTTGTGTGTGTACAGGATTTCTACCT
GATGGGTGGCTCGAATGGGCTGTTCCATGGGTTTAGCAAGGAATTCGTATCAAGGGCATGGGATCTGAAGGAAGATAAGGTGGAGCACTTGCTCCAAAGCCAGTCCGGGACTGGAATTGTTAAGTTGAAGGAGGGAAAAAGGCTACCCACTCCCGAATCCCAAGAAGAAAAAGATGGAGACAAGCTAACGTTGGTGTTCA
ACTGCGAGGAAGCCAAATTGGACGTCGATGTGAAAAATGGAGGGCGTGTGGTCGTTGTCACCAGCGATTATCTTCCAATGTTAGAGCAAATTGGGTTGGGGGCAGACCTTGTGAAGCTTGATCCGGCAGCAATGTGTTCGCCGGGATTCTCGTCGGACTCAGCTTTCCAAGTGACATACATAGCGAGAGGCCATGGGAGA
GTTCAGGTGGTAGGAATCGATGGGGAAAGGGTGTTGGAAGTAGAGGTTAAGGCTGGTTTCTTGTTCATCGTCCCTCGCTTCTTCGTGGTCTCCAAGATTGCTGGAAACGATGGATTGGAATGGTTCTCCATTATCACCACGCCCATGCCCATCTTCTGTCACCTGGCAGGGAAAACCTCTGTGTGGAAGGCTCTCTCGAA
GGAGATTCTGACTGCTTCTTTTGATGTGGATGAAGAAATCGAAGAACACTTCCGCTCCAAACGAATGCAGGACGCCATCTTCTTCCCACGTCCCGCTAACTGAACTGAGCAGTATGCTTATAGTATAGTATTGGGAGTTAGTTTTAATTTTGCCTCGTTATAACGAATAAAGGGTTTTGTAGTAGCTTATTGGGATGGTT
ATTCCCTTAGATTTGCATAGGGAAGGGGATGTCTTTATCCTTTGTGTTGCTACATTTGAAACGAAGATTATCTTGGAAATTAATAAATTCAAATACCAAATTCTTGAAGATCTTTGGAACTCCAGTTGATGATAACATGATAAATATGAGGTGAGAAATGTCAAATTATATGGTAATTCATAAGAGGCTTGATATGTAAA
TATGCATCTGTAATTTGTTTACTGTATTGAGGATATGCACCATCTTTTTGTTTCTCTGTAAGTCCTGGTTTAATAAGTGTGATAAAAGAAAGTTTAGTTGGAGC

>TRINITY_DN48699_c1_g3_i4 from sample A7 / Example unspliced isoform:

ATTTCTACCTGATGGGTGGCTCGAATGGGCTGTTCCATGGGTTTAGCAAGGAATTCGTATCAAGGGCATGGGATCTGAAGGAAGATAAGGTGGAGCACTTGCTCCAAAGCCAGTCCGGGACTGGAATTGTTAAGTTGAAGGAGGGAAAAAGGCTACCCACTCCCGAATCCCAAGAAGAAAAAGATGGAGACAAGCTAACG
TTGGTGTTCAACTGCGAGGAAGCCAAATTGGACGTCGATGTGAAAAATGGAGGGCGTGTGGTCGTTGTCACCAGCGATTATCTTCCAATGTTAGAGCAAATTGGGTTGGGGGCAGACCTTGTGAAGCTTGATCCGgtaacctctttgatcctatattaatgtttttctgtgcataggaagtaggaaggaaagaataatgc
gacattattatgtgttttgtaatctgttagGCAGCAATGTGTTCGCCGGGATTCTCGTCGGACTCAGCTTTCCAAGTGACATACATAGCGAGAGGCCATGGGAGAGTTCAGGTGGTAGGAATCGATGGGGAAAGGGTGTTGGAAGTAGAGGTTAAGGCTGGTTTCTTGTTCATCGTCCCTCGCTTCTTCGTGGTCTCCAA
GATTGCTGGAAACGATGGATTGGAATGGTTCTCCATTATCACCACGCCCATGCCCATCTTCTGTCACCTGGCAGGGAAAACCTCTGTGTGGAAGGCTCTCTCGAAGGAGATTCTGACTGCTTCTTTTGATGTGGATGAAGAAATCGAAGAACACTTCCGCTCCAAACGAATGCAGGACGCCATCTTCTTCCCACGTCCCG
CTAACTGAACTGAGCAGTATGCTTATAGTATAGTATTGGGAGTTAGTTTTAATTTTGCCTCGTTATAACGAATAAAGGGTTTTGTAGTAGCTTATTGGGATGGTTATTCCCTTAGATTTGCATAGGGAAGGGGATGTCTTTATCCTTTGTGTTGCTACATTTGAAACGAAGATTATCTTGGAAATTAATAAATTCAAATA
CCAAATTCTTGAAGATCTTTGGAACTCCAGTTGATGATAACATGATAAATATGAGGTGAGAAATGTCAAATTATATGGTAATTCATAAGAGGCTTGATATGTAAATATGCATCTGTAATTTGTTTACTGTATTGAGGATATGCACCATCTTTTTGTTTCTCTGTAAGTCCTGGTTTAATAAGTGTGATAAAAGAAAGTTT
AGTTGGAGC

Intron 2 GTATGTATAA ... GTGTGTACAG

Sample	Retention score (%)	Exon junction reads	5'ss reads	3'ss reads
A1	20.41	195	12.8	50
A2	24.35	146	11.8	47
A3	16.34	169	12	33
A4	17.33	167	12.8	35
A5	26.28	101	6.5	36
A6	21.46	1058	71.3	289
A7	21.07	839	59.3	224
A8	21.73	598	45	166
A9	21.09	767	57.3	205
A10	20.37	563	39.3	144

>TRINITY_DN48699_c1_g3_i2 from sample A7 / Example spliced isoform

GGATGATGAGAAAAGTCTGCTACGATCAGAAGCCACGTGTCTGAAAGACCACTAACAGGGCTTTACAGAAGCCACGTGTCTCAAAGCACCTAACACAGAAGCCACGTGTCCCACTTTGGTTTCAATGGGCAGTTGAACTGGACCTCTTACAGCGTGTCACATGAGCATCAGGTAGTCTATCGGAGTGTAGTCAGCAGTTT
AGCTGGACACACTCAGCTTCTCTCGGTGTTTGACTGGTACTCCTAATTTTATTTCGAGCGGATTTGTAGGAAAAAACAGTCAGTTGCCATTTTTGCATGATCGATGGAGAGATCCAGTAATCTTATTCTTATCCCTTTGGACAAGATCATATATCCCTATATATGCATGCCTTGTTTCTTGTATTTCTTCACCAGCTTCC
TGCAACAGGTTGTGTAGTTTTTTTTCCTCGAGTCTATTGTTTTTTAAGGTCTCTTGATTTCGAAGAGTTACAGAAAGCAAAGAGGCAATGGAGGCCGCACCCAAGAGAGTCTTGACCCCTGCTGAGCCCAAGAAGATCCTGAGCTCAGAAGGAGGGTCTTATTATGCATGGGCAAGTTCAGATCTCTGCATGTTAGCAGA
GGCCAAAGTTGGAGCAGCCAAGCTTCTTCTCAATTATCGTGGCCTGTCTTTGCCAAAGTATTCCGACTCTTCGAAAGTTTGCTATGTGCTTCAAGGATCTGGAGTCGCAGGGATACTTGTTCCAGAGGCAGAGTCTGAGCGGGTGGTGAAAATCCGCAAAGGGGATGCCATCGCTGTGCCGATGGGAGTGATCAGCTGGT
GGTTCAATGACAATTCTTCTGAGGTTTTGGAAATCCTATTCCTCGGAGATACATCGAAGGCCCATCGTTCTGGAGAGTTTACTGATTTCTACCTGATGGGTGGCTCGAATGGGCTGTTCCATGGGTTTAGCAAGGAATTCGTATCAAGGGCATGGGATCTGAAGGAAGATAAGGTGGAGCACTTGCTCCAAAGCCAGTCC
GGGACTGGAATTGTTAAGTTGAAGGAGGGAAAAAGGCTACCCACTCCCGAATCCCAAGAAGAAAAAGATGGAGACAAGCTAACGTTGGTGTTCAACTGCGAGGAAGCCAAATTGGACGTCGATGTGAAAAATGGAGGGCGTGTGGTCGTTGTCACCAGCGATTATCTTCCAATGTTAGAGCAAATTGGGTTGGGGGCAGA
CCTTGTGAAGCTTGATCCGGCAGCAATGTGTTCGCCGGGATTCTCGTCGGACTCAGCTTTCCAAGTGACATACATAGCGAGAGGCCATGGGAGAGTTCAGGTGGTAGGAATCGATGGGGAAAGGGTGTTGGAAGTAGAGGTTAAGGCTGGTTTCTTGTTCATCGTCCCTCGCTTCTTCGTGGTCTCCAAGATTGCTGGAA
ACGATGGATTGGAATGGTTCTCCATTATCACCACGCCCATGCCCATCTTCTGTCACCTGGCAGGGAAAACCTCTGTGTGGAAGGCTCTCTCGAAGGAGATTCTGACTGCTTCTTTTGATGTGGATGAAGAAATCGAAGAACACTTCCGCTCCAAACGAATGCAGGACGCCATCTTCTTCCCACGTCCCGCTAACTGAACT
GAGCAGTATGCTTATAGTATAGTATTGGGAGTTAGTTTTAATTTTGCCTCGTTATAACGAATAAAGGGTTTTGTAGTAGCTTATTGGGATGGTTATTCCCTTAGATTTGCATAGGGAAGGGGATGTCTTTATCCTTTGTGTTGCTACATTTGAAACGAAGATTATCTTGGAAATTAATAAATTCAAATACCAAATTCTTG
AAGATCTTTGGAACTCCAGTTGATGATAACATGATAAATATGAGGTGAGAAATGTCAAATTATATGGTAATTCATAAGAGGCTTGATATGTAAATATGCATCTGTAATTTGTTTACTGTATTGAGGATATGCACCATCTTTTTGTTTCTCTGTAAGTCCTGGTTTAATAAGTGTGATAAAAGAAAGTTTAGTTGGAGC

>TRINITY_DN48699_c1_g3_i1 from sample A7 / Example unspliced isoform:

GGATGATGAGAAAAGTCTGCTACGATCAGAAGCCACGTGTCTGAAAGACCACTAACAGGGCTTTACAGAAGCCACGTGTCTCAAAGCACCTAACACAGAAGCCACGTGTCCCACTTTGGTTTCAATGGGCAGTTGAACTGGACCTCTTACAGCGTGTCACATGAGCATCAGGTAGTCTATCGGAGTGTAGTCAGCAGTTT
AGCTGGACACACTCAGCTTCTCTCGGTGTTTGACTGGTACTCCTAATTTTATTTCGAGCGGATTTGTAGGAAAAAACAGTCAGTTGCCATTTTTGCATGATCGATGGAGAGATCCAGTAATCTTATTCTTATCCCTTTGGACAAGATCATATATCCCTATATATGCATGCCTTGTTTCTTGTATTTCTTCACCAGCTTCC
TGCAACAGGTTGTGTAGTTTTTTTTCCTCGAGTCTATTGTTTTTTAAGGTCTCTTGATTTCGAAGAGTTACAGAAAGCAAAGAGGCAATGGAGGCCGCACCCAAGAGAGTCTTGACCCCTGCTGAGCCCAAGAAGATCCTGAGCTCAGAAGGAGGGTCTTATTATGCATGGGCAAGTTCAGATCTCTGCATGTTAGCAGA
GGCCAAAGTTGGAGCAGCCAAGCTTCTTCTCAATTATCGTGGCCTGTCTTTGCCAAAGTATTCCGACTCTTCGAAAGTTTGCTATGTGCTTCAAGGATCTGGAGTCGCAGGGATACTTGTTCCAGAGGCAGAGTCTGAGCGGGTGGTGAAAATCCGCAAAGGGGATGCCATCGCTGTGCCGATGGGAGTGATCAGCTGGT
GGTTCAATGACAATTCTTCTGAGGTTTTGGAAATCCTATTCCTCGGAGATACATCGAAGGCCCATCGTTCTGGAGAGTTTACTgtatgtataaatataacctttattttttacaaatggcaatgatttcaggttagattgttttattgtattcaatgatacgttcattcattaatttgtgtgtgtacagGATTTCTACCT
GATGGGTGGCTCGAATGGGCTGTTCCATGGGTTTAGCAAGGAATTCGTATCAAGGGCATGGGATCTGAAGGAAGATAAGGTGGAGCACTTGCTCCAAAGCCAGTCCGGGACTGGAATTGTTAAGTTGAAGGAGGGAAAAAGGCTACCCACTCCCGAATCCCAAGAAGAAAAAGATGGAGACAAGCTAACGTTGGTGTTCA
ACTGCGAGGAAGCCAAATTGGACGTCGATGTGAAAAATGGAGGGCGTGTGGTCGTTGTCACCAGCGATTATCTTCCAATGTTAGAGCAAATTGGGTTGGGGGCAGACCTTGTGAAGCTTGATCCGGCAGCAATGTGTTCGCCGGGATTCTCGTCGGACTCAGCTTTCCAAGTGACATACATAGCGAGAGGCCATGGGAGA
GTTCAGGTGGTAGGAATCGATGGGGAAAGGGTGTTGGAAGTAGAGGTTAAGGCTGGTTTCTTGTTCATCGTCCCTCGCTTCTTCGTGGTCTCCAAGATTGCTGGAAACGATGGATTGGAATGGTTCTCCATTATCACCACGCCCATGCCCATCTTCTGTCACCTGGCAGGGAAAACCTCTGTGTGGAAGGCTCTCTCGAA
GGAGATTCTGACTGCTTCTTTTGATGTGGATGAAGAAATCGAAGAACACTTCCGCTCCAAACGAATGCAGGACGCCATCTTCTTCCCACGTCCCGCTAACTGAACTGAGCAGTATGCTTATAGTATAGTATTGGGAGTTAGTTTTAATTTTGCCTCGTTATAACGAATAAAGGGTTTTGTAGTAGCTTATTGGGATGGTT
ATTCCCTTAGATTTGCATAGGGAAGGGGATGTCTTTATCCTTTGTGTTGCTACATTTGAAACGAAGATTATCTTGGAAATTAATAAATTCAAATACCAAATTCTTGAAGATCTTTGGAACTCCAGTTGATGATAACATGATAAATATGAGGTGAGAAATGTCAAATTATATGGTAATTCATAAGAGGCTTGATATGTAAA
TATGCATCTGTAATTTGTTTACTGTATTGAGGATATGCACCATCTTTTTGTTTCTCTGTAAGTCCTGGTTTAATAAGTGTGATAAAAGAAAGTTTAGTTGGAGC

Intron 3 GTATGTAAAT ... GTATATGCAG

Sample	Retention score (%)	Exon junction reads	5'ss reads	3'ss reads
A1	8.51	215	0	20
A2	14.04	251	2	41
A3	10.1	249.3	0	28
A4	11.5	192.3	0	25
A5	10.55	178	0	21
A6	14.78	2953	1	512
A7	12.84	2342	6	345
A8	14.59	1844.3	0	315
A9	13.47	1631	3	254
A10	13.78	1258	0	201

>TRINITY_DN48699_c1_g3_i4 from sample A7 / Example spliced isoform

ATTTCTACCTGATGGGTGGCTCGAATGGGCTGTTCCATGGGTTTAGCAAGGAATTCGTATCAAGGGCATGGGATCTGAAGGAAGATAAGGTGGAGCACTTGCTCCAAAGCCAGTCCGGGACTGGAATTGTTAAGTTGAAGGAGGGAAAAAGGCTACCCACTCCCGAATCCCAAGAAGAAAAAGATGGAGACAAGCTAACG
TTGGTGTTCAACTGCGAGGAAGCCAAATTGGACGTCGATGTGAAAAATGGAGGGCGTGTGGTCGTTGTCACCAGCGATTATCTTCCAATGTTAGAGCAAATTGGGTTGGGGGCAGACCTTGTGAAGCTTGATCCGGTAACCTCTTTGATCCTATATTAATGTTTTTCTGTGCATAGGAAGTAGGAAGGAAAGAATAATGC
GACATTATTATGTGTTTTGTAATCTGTTAGGCAGCAATGTGTTCGCCGGGATTCTCGTCGGACTCAGCTTTCCAAGTGACATACATAGCGAGAGGCCATGGGAGAGTTCAGGTGGTAGGAATCGATGGGGAAAGGGTGTTGGAAGTAGAGGTTAAGGCTGGTTTCTTGTTCATCGTCCCTCGCTTCTTCGTGGTCTCCAA
GATTGCTGGAAACGATGGATTGGAATGGTTCTCCATTATCACCACGCCCATGCCCATCTTCTGTCACCTGGCAGGGAAAACCTCTGTGTGGAAGGCTCTCTCGAAGGAGATTCTGACTGCTTCTTTTGATGTGGATGAAGAAATCGAAGAACACTTCCGCTCCAAACGAATGCAGGACGCCATCTTCTTCCCACGTCCCG
CTAACTGAACTGAGCAGTATGCTTATAGTATAGTATTGGGAGTTAGTTTTAATTTTGCCTCGTTATAACGAATAAAGGGTTTTGTAGTAGCTTATTGGGATGGTTATTCCCTTAGATTTGCATAGGGAAGGGGATGTCTTTATCCTTTGTGTTGCTACATTTGAAACGAAGATTATCTTGGAAATTAATAAATTCAAATA
CCAAATTCTTGAAGATCTTTGGAACTCCAGTTGATGATAACATGATAAATATGAGGTGAGAAATGTCAAATTATATGGTAATTCATAAGAGGCTTGATATGTAAATATGCATCTGTAATTTGTTTACTGTATTGAGGATATGCACCATCTTTTTGTTTCTCTGTAAGTCCTGGTTTAATAAGTGTGATAAAAGAAAGTTT
AGTTGGAGC

>TRINITY_DN48699_c1_g3_i3 from sample A7 / Example unspliced isoform:

TCTCCATTATCACCACGCCCATgtatgtaaatctacatgtatttttacaagcacatcaggttttgattagttagatggataaacatgaatggatttaatataaaattattgggtttgagactgactagtgaactggatgcatgtatatgcagGCCCATCTTCTGTCACCTGGCAGGGAAAACCTCTGTGTGGAAGGCTCT
CTCGAAGGAGATTCTGACTGCTTCTTTTGATGTGGATGAAGAAATCGAAGAACACTTCCGCTCCAAACGAATGCAGGACGCCATCTTCTTCCCACGTCCCGCTAACTGAACTGAGCAGTATGCTTATAGTATAGTATTGGGAGTTAGTTTTAATTTTGCCTCGTTATAACGAATAAAGGGTTTTGTAGTAGCTTATTGGG
ATGGTTATTCCCTTAGATTTGCATAGGGAAGGGGATGTCTTTATCCTTTGTGTTGCTACATTTGAAACGAAGATTATCTTGGAAATTAATAAATTCAAATACCAAATTCTTGAAGATCTTTGGAACTCCAGTTGATGATAACATGATAAATATGAGGTGAGAAATGTCAAATTATATGGTAATTCATAAGAGGCTTGATA
TGTAAATATGCATCTGTAATTTGTTTACTGTATTGAGGATATGCACCATCTTTTTGTTTCTCTGTAAGTCCTGGTTTAATAAGTGTGATAAAAGAAAGTTTAGTTGGAGC