sp|Q9LU44|SF1_ARATH ----> Splicing factor-like protein 1


Intron 1 GTATGTGCAA ... CATTGATCAG

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A10-1000



>TRINITY_DN42009_c0_g1_i11 from sample A8 / Example spliced isoform
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ATTCAGAAGGCCCCGTTCCATCTCAACCCGATCTTGAGGCCAAAAACCCTGCTGCAGCCAAGGAAGAGGAAACTGCTATAGGCGTTGTGAATACAAGAAACGGAAACGACGACGGCAAAGATGGGAGTTTGAATCCGGCTTTCTCAGAGACCACAGCAATGAAGGGGGAAGATCGGGTGCAGGGTTCGAGTCAAGCAGAA
ACGCAGGGCGCTTGTTCTGCAGAAGTGAGCAGCGGCAGGAAGCGGCGTTCCCGTTGGGGTCCTCAGACGGAAGGCGAAGGTGAAATGCAGGATAGCGCCGGGTCCGTCAGGAAACGGAAAACCCGTTGGGCTGATGAGCCGAAGCCACTTATGTGTATCCAGCTTCCAGGGTTTGTTAAAGAGTTAACTGGAGGTATGGA
ACTTGATCCCGAGGTACAGGCTTTGAATGCACGTTTAATGGATATCAGCAGATTATTACAGTCGGGGATGCCTTTAGACGACCGACCGGAGGGTGCACGGTCACCGTCTCCGGAGCCCATCTATGATAACATGGGGGTCAGAATCAATACAAGAGAATACAGAGCCCGTGAAAAGCTTACCAGAGAGAGGCAGGAGCTCA
TTTCCCAACTTATCAAGCGAAACCCGGCATTTAAGCCTCCGGCTGATTACCGCCCGCCCAAGCTTTATAAGAAACTGTTCATTCCTGTGAAGGATTTTCCGGGGTATAATTTCATCGGTCTCATTATTGGCCCCAGAGGCAACACCCAGAAAAGAATGGAGAAGGAGACCGGTGCAAAGATTGTTATAAGAGGCAAGGGC
TCTGTCAAGGAAGGTAGATTACAGCAGAAACGTGATCTGAAACCTGATCCATCCGAAAACGAGGACTTGCATGTTTTGGTTGAGGCGGAGACACAGGATGCTTTGGAGCAAGCTGCGGGCATGGTGGAGAAGCTGCTTATGCCTGTGGACGAGGGTTTGAATGAGCACAAGCGGGCACAGTTGAGAGAACTTGCGGCGCT
GAATGGAACGATACGGGATGATGAATTCTGCAGGCTTTGTGGCGAACCAGGCCATAGGCAGTATGCTTGCCCTGCAAGGCTTTTGGGTTTCAAAAGTGATGTTTTGTGTAAAATTTGTGGTGATGGTGGTCATCCGACTATTGATTGTCCAATGAAGGGCTCGGGGAAGAAGATGGATGATGAATACCAGAACTTTTTGG
CTGAATTGGGGGGTGGCGCACCTGAGTCGGTTGCAAAAATTGGTGAAAATGGTCGTCAGAATCAGACATTGTCTCTCCCTGGCCCACAGAATGGTAACCCTCCATGGAAAGAAAGCGGTGGAATGGTTTTGGGTTATAGTGGAACGCAGCAAGGTCAGCAGTCGAATAACTTTCAGTCTGTGCTGGGATCGAAATTTACA
AAGGATCACGATGATTCCAATCTGTATATAGGATACCTGCCATCTCAAATCGATGATGACGGACTCATTCGGTTGTTTGCTCCTTTTGGTGAAATTGTTGCGGTGAAGGTCATCAAGGATCGGTTAACTGGGGCAAGCAAAGGATATGGCTTTGTGAAGTTCTCTGATACTGCCTCTGCTGCACAGGCGGTGTTGCATAT
GAATGGATACCGCCTGGATGGGAGGATTATGGCAGTCAGAGTCGCAGGCAGGCCACCACAAGCTGGTTTTCCTGGAGGTGGCCAAGCCCCTATCCCTGGTTCGTATCCTGGATCAGAACCCTCTGCAGCAAGTTATTCTTCACAGCAGTTTCCTTCAGGACCACTGACTGGAAATTCAATTTCAGCAGGGAACACAATGC
CTGCTCCAGTTCCATGGGGTCCACCTGTTCCACCTCCACCTTACAATCCTTATGCACCGCCTCCACCAAGACCCAGTATGTATGGTGAAGCTTATCATCCACAGGGGGGCACTTATCCTGGACCCCCAATGCAAGGACCTCCTCCACCTGGTACAGCCCCTCAAAATTTGATGCCACCTCCACCACCATATGGGGGACCT
TATCCTGTACAGGGACCTCCTCTGCCAGGTCCACCACCTCAGAGTATGCCTCCCGCTGAACCATCTCAAAGCTTGCCTCCAGGTGTGCCTCCTCATAGTTTGCCACTGCAGTCATCTTCCAATGGCAGCCAACATGGAGCTCCTCCAGGTGCAATCCCTAGTAATACTGGAAGTAATATGATGGCCATACCGCAGGTTGG
ACCTCCTGCATATCCCCCTCCACCTCAGTATCAAGGTTATTATGGTGCTCCGCCTCCTCCAAGTGCCCCAACAGGTCCTGCACAGAGTATAGGTAGTGTTCCACCTCCATGGGTAGTAAATCCTGCTCCTCCTCCTCCACCTCCTCCTCCTCCATCATCATCAGAGACAACCTATGCTGTCGAGTCAGAATATGAGAAAT
TCATGTCTGAAATGGGACAATGATTTTTCCAGCAATTCTCATGATGAACAGGGTTGATGTTTGTTGGAGGAAAGCTGACATGATTTATGTTTAGAATTCTGACACACAGACGTTTCGAAGAGTGGAAACTCATGTTATATTTAACCTTGTTTATGATGAAGAATAACTGTTGCAGAGCTATCCAACTTATGCGAGAAAGG
AGCAAATCGACTTATTGATGTAGCCTTTGAAATTTGTTGAATTTCTCTATAAATAGGTTTGAAGGGGCTTGTTTAACATTGTTTCATTGATTTAAAGTGGAATGGATGCAGAGATACTCAATTGCAGGGTTTTAACATGTTAGATTTAATGTTTTGTTACGATGCTAATCTTTTGAGCCTGCAGTTTGGCGAATATGCCC
TTGCAAATGGTTTTTATTATGAGAAGCGGTTGCCAAATGTAAATTTATTATAATTTTATCTTTTAATTTGTAGCACTAACTTGATGATTCTGGCCAGGTTTAAATTTATCCTTCAATTTGCATAAAAATAAATTCGCACTACTGTTGGAGTAGACAGGACTTGGCATGGTTGTGAGTGCATATTGGTTGATTACAATTGT
TGTTTTTGTCAGTATTGTAACTGTGATGTGCAATTTGTGCAGTTATTGTTGATATCTCTGAATATTTATTATGGCTTAGTGTTTATGACCTTAAATGTCTTTCTTAGAGGGAATGTTAAGGCCCTAACCATCACATTCATTATTAGTATATTAGTTACAGTTAAGTCTGCTTATTGGTAGGTTACATAATAAATGAGATT
CATTTGTATACTCATCCCATTTTGTCTTGTGCATTGGATACATTGTAAAAGGAGGTTGCCCCTTCAGAGAGGCTTGTTATTCATCGACTCTCTATCATTCTCAAGGCATGGAGCTACTTCTTCTTTCTGTTTTGATGCTGTTTGGGGAATTTGGTTCATAACAGGGGATATGATACATGCTTTGTTATGTGCTCACATTT
TCTATGATTTCATTGTGTTTGATTCATATCTCTAAGACAGTTGAATTTCGTATACCTTTGATAATTATATTATGTACCTGCAGTTCAATTTAACAGGACTTTAATGAGCTTCAGATTAAAGACTGATGCTACTGAGATGGAGACATCTTCATAAGCTCCAAATCTGGCACGTTATGGAAACAGGGTTGCCATTGCTTTTT
TTTCTATATCATGAATTGCATCAAAAAAGTTTTTTTAGCCCACCATTAGATGACAGTGTTTTGGAGTTGACTTTGTCTAGTTTACCTGTTGTGGATTTCATGCCTCGTCAAAATGTTTTCCAATGCTTGGCACGACATCTTCATAAGCTCTAAATCTGGCACGTTATGGAAACAGGGTTGCCATTGCATTTGTTTCTATA
TCATGAATTGCATTGAAAAGGTTTTTTTAGCCCACCATTAGATGACAATGTTTTGGAGTTGACTTTGTCTGGTTTAGCTATTCTGGATTTCATGCCTCATCAAAATGTTTTCCAGTGCCTGGCACTGTGCCATAGAGTTACAACAGGCCTCAATTAGTTCACATTCTGCTCCTCTTATTTTAATCATTTTTTTAGTTCTT
ATTTAATCATTGCATAGTCCTGTAGTGATTGCAGGGCTAGATTCATATTGGATGGGAACTTAGGAATGATCCCACGTTTCAAGTAAGTAAGGTCTGTATCTAAAAACAGTATCTACTACAAATTTTCACTGCAGACTGTGCAGTAACGCAGTTATTGAGCCCTTGTTAAATCTGATGCTTAATTTTCAAGTAGGATCACC
TGTGTTTCTTTATCTAACCTTTTGATGGATTTTATTGGGCATAGATGGAGGTTAAAATTACCTTTGGAATTTATTTGACAGAGGTGGAGGTTTTACCTAACCTTCTAATTTTTTGATTTGATTTTAATGGAATATTTTATGGCAAGGTGACTTCTGTTGCAGCTGAGGCCTACATCACATGCGTCAACTTATTGATTTTA
TTGGTGAGATTGACTCGGGAAAAGTTATGATTCATTTATCAGAGGGCATGGAAACTTCTAGAAGGCTTAAAGGATGGCAATGCACTGTAGATGGTGGGACACGATGAAAGAGGGGGATTAAGGATATATAATAAAAATTTGAATAAGGAGGACAGTAAAAAAGCCTGACACAAGAGAAACGAAGGAACTTTACAAGGACA
TATATACTAAATTCCAAGAATTGTTTGAAAAGTTGTCCAAAATAGAAGCCTGACCTTGTTATCAGAGGTCTGGCAGCTAGAAACTAGAGCAGATGGATTACTTGCAATTTATCTTCAAAAGTAGACATAGACAAATGGTATAAGCTATGAATATCATGTGGTGGTAAAAATTGAGAAGGGAGCATACCTTGTGGCTTTGT
GGCTTGAACAAGAAACAAGTTGAGAATGGAGTAGAGTGAAGTGATAGGCCTTTGACTTGACCAATGAACAACATGAAAGATTAGTTTCTTTACCCCTTTAAGTTAAAACCTGTTCCAATGAGAGTTTCTAGCAGAACTAAAAGAAATTTTGAGAAGATCCTGGAAATCAACCCTAGAGGTGTCTGAAGCTGTATTGAAAA
TTTGCTGAAACTAGAAAATTATATTTTTCTATTTATCTATTACAGAATATTTAGACTTTCTGAAAATAACTGCAAATTTGTACAGATCTTAGCAACAGTCTCCTCAGCAAAATGAGGGTTACAAGCTATCTTAGGATTCTAGTTTTTTCCGAGTGTTTGCTTTGTTGTATCAGTATCGGTTTACATCTTCATTAGTTGTT
ACCTTCTCTTTTTGTGTCAATGTTTCTAATCTAGGAACAGTTCACGTTGAAAATTTGCAATTTTAAGC


>TRINITY_DN42009_c0_g1_i15 from sample A8 / Example unspliced isoform:
AACCAGGAAGGAGGAGAGCAAGGTTATGCGGAATACCAGAATACTACGCAATATTCAGAAGGCCCCGTTCCATACCAGAACCAGGAAGGAGGAGAGCAAGGTTATGCGGAATACCAGAATACTACGCAATATTCAGAAGGCCCCGTTCCATCTCAACCCGATCTTGAGGCCAAAAACCCTGCTGCAGCCAAGGAAGAGGA
AACTGCTATAGGCGTTGTGAATACAAGAAACGGAAACGACGACGGCAAAGATGGGAGTTTGAATCCGGCTTTCTCAGAGACCACAGCAATGAAGGGGGAAGATCGGGTGCAGGGTTCGAGTCAAGCAGAAACGCAGGGCGCTTGTTCTGCAGAAGTGAGCAGCGGCAGGAAGCGGCGTTCCCGTTGGGGTCCTCAGACGG
AAGGCGAAGGTGAAATGCAGGATAGCGCCGGGTCCGTCAGGAAACGGAAAACCCGTTGGGCTGATGAGCCGAAGCCACTTATGTGTATCCAGCTTCCAGGGTTTGTTAAAGAGTTAACTGGAGGTATGGAACTTGATCCCGAGGTACAGGCTTTGAATGCACGTTTAATGGATATCAGCAGATTATTACAGTCGGGGATG
CCTTTAGACGACCGACCGGAGGGTGCACGGTCACCGTCTCCGGAGCCCATCTATGATAACATGGGGGTCAGAATCAATACAAGAGAATACAGAGCCCGTGAAAAGCTTACCAGAGAGAGGCAGGAGCTCATTTCCCAACTTATCAAGCGAAACCCGGCATTTAAGCCTCCGGCTGATTACCGCCCGCCCAAGCTTTATAA
GAAACTGTTCATTCCTGTGAAGGATTTTCCGGGGTATAATTTCATCGGTCTCATTATTGGCCCCAGAGGCAACACCCAGAAAAGAATGGAGAAGGAGACCGGTGCAAAGATTGTTATAAGAGGCAAGGGCTCTGTCAAGGAAGGTAGATTACAGCAGAAACGTGATCTGAAACCTGATCCATCCGAAAACGAGGACTTGC
ATGTTTTGGTTGAGGCGGAGACACAGGATGCTTTGGAGCAAGCTGCGGGCATGGTGGAGAAGCTGCTTATGCCTGTGGACGAGGGTTTGAATGAGCACAAGCGGGCACAGTTGAGAGAACTTGCGGCGCTGAATGGAACGATACGGGATGATGAATTCTGCAGGCTTTGTGGCGAACCAGGCCATAGGCAGTATGCTTGC
CCTGCAAGGCTTTTGGGTTTCAAAAGTGATGTTTTGTGTAAAATTTGTGGTGATGGTGGTCATCCGACTATTGATTGTCCAATGAAGGGCTCGGGGAAGAAGATGGATGATGAATACCAGAACTTTTTGGCTGAATTGGGGGGTGGCGCACCTGAGTCGGTTGCAAAAATTGGTGAAAATGGTCGTCAGAATCAGACATT
GTCTCTCCCTGGCCCACAGAATGGTAACCCTCCATGGAAAGAAAGCGGTGGAATGGTTTTGGGTTATAGTGGAACGCAGCAAGGTCAGCAGTCGAATAACTTTCAGTCTGTGCTGGGATCGAAATTTACAAAGGATCACGATGATTCCAATCTGTATATAGGATACCTGCCATCTCAAATCGATGATGACGGACTCATTC
GGTTGTTTGCTCCTTTTGGTGAAATTGTTGCGGTGAAGGTCATCAAGGATCGGTTAACTGGGGCAAGCAAAGGATATGGCTTTGTGAAGTTCTCTGATACTGCCTCTGCTGCACAGGCGGTGTTGCATATGAATGGATACCGCCTGGATGGGAGGATTATGGCAGTCAGAGTCGCAGGCAGGCCACCACAAGCTGGTTTT
CCTGGAGGTGGCCAAGCCCCTATCCCTGGTTCGTATCCTGGATCAGAACCCTCTGCAGCAAGTTATTCTTCACAGCAGTTTCCTTCAGGACCACTGACTGGAAATTCAATTTCAGCAGGGAACACAATGCCTGCTCCAGTTCCATGGGGTCCACCTGTTCCACCTCCACCTTACAATCCTTATGCACCGCCTCCACCAAG
ACCCAGTATGTATGGTGAAGCTTATCATCCACAGGGGGGCACTTATCCTGGACCCCCAATGCAAGGACCTCCTCCACCTGGTACAGCCCCTCAAAATTTGATGCCACCTCCACCACCATATGGGGGACCTTATCCTGTACAGGGACCTCCTCTGCCAGGTCCACCACCTCAGAGTATGCCTCCCGCTGAACCATCTCAAA
GCTTGCCTCCAGGTGTGCCTCCTCATAGTTTGCCACTGCAGTCATCTTCCAATGGCAGCCAACATGGAGCTCCTCCAGGTGCAATCCCTAGTAATACTGGAAGTAATATGATGGCCATACCGCAGGTTGGACCTCCTGCATATCCCCCTCCACCTCAGTATCAAGGTTATTATGGTGCTCCGCCTCCTCCAAGTGCCCCA
ACAGGTCCTGCACAGAGTATAGGTAGTGTTCCACCTCCATGGGTAGTAAATCCTGCTCCTCCTCCTCCACCTCCTCCTCCTCCATCATCATCAGAGACAACCTATGCTGTCGAGTCAGAATATGAGAAATTCATGTCTGAAATGGGACAATGATTTTTCCAGCAATTCTCATGATGAACAGGGTTGATGTTTGTTGGAGG
AAAGCTGACATGATTTATGTTTAGAATTCTGACACACAGACGTTTCGAAGAGTGGAAACTCATGTTATATTTAACCTTGTTTATGATGAAGAATAACTGTTGCAGAGCTATCCAACTTATGCGAGAAAGGAGCAAATCGACTTATTGATGTAGCCTTTGAAATTTGTTGAATTTCTCTATAAATAGGTTTGAAGGGGCTT
GTTTAACATTGTTTCATTGATTTAAAGTGGAATGGATGCAGAGATACTCAATTGCAGGGTTTTAACATGTTAGATTTAATGTTTTGTTACGATGCTAATCTTTTGAGCCTGCAGTTTGGCGAATATGCCCTTGCAAATGGTTTTTATTATGAGAAGCGGTTGCCAAATGTAAATTTATTATAATTTTATCTTTTAATTTG
TAGCACTAACTTGATGATTCTGGCCAGGTTTAAATTTATCCTTCAATTTGCATAAAAATAAATTCGCACTACTGTTGGAGTAGACAGGACTTGGCATGGTTGTGAGTGCATATTGGTTGATTACAATTGTTGTTTTTGTCAGTATTGTAACTGTGATGTGCAATTTGTGCAGTTATTGTTGATATCTCTGAATATTTATT
ATGGCTTAGTGTTTATGACCTTAAATGTCTTTCTTAGAGGGAATGTTAAGGCCCTAACCATCACATTCATTATTAGTATATTAGTTACAGTTAAGTCTGCTTATTGGTAGGTTACATAATAAATGAGATTCATTTGTATACTCATCCCATTTTGTCTTGTGCATTGGATACATTGTAAAAGGAGGTTGCCCCTTCAGAGA
GGCTTGTTATTCATCGACTCTCTATCATTCTCAAGGCATGGAGCTACTTCTTCTTTCTGTTTTGATGCTGTTTGGGGAATTTGGTTCATAACAGGGGATATGATACATGCTTTGTTATGTGCTCACATTTTCTATGATTTCATTGTGTTTGATTCATATCTCTAAGACAGTTGAATTTCGTATACCTTTGATAATTATAT
TATGTACCTGCAGTTCAATTTAACAGGACTTTAATGAGCTTCAGATTAAAGACTGATGCTACTGAGATGGAGACATCTTCATAAGCTCCAAATCTGGCACGTTATGGAAACAGGGTTGCCATTGCTTTTTTTTCTATATCATGAATTGCATCAAAAAAGTTTTTTTAGCCCACCATTAGATGACAGTGTTTTGGAGTTGA
CTTTGTCTAGTTTACCTGTTGTGGATTTCATGCCTCGTCAAAATGTTTTCCAATGCTTGGCACGACATCTTCATAAGCTCTAAATCTGGCACGTTATGGAAACAGGGTTGCCATTGCATTTGTTTCTATATCATGAATTGCATTGAAAAGGTTTTTTTAGCCCACCATTAGATGACAATGTTTTGGAGTTGACTTTGTCT
GGTTTAGCTATTCTGGATTTCATGCCTCATCAAAATGTTTTCCAGTGCCTGGCACTGTGCCATAGAGTTACAACAGGCCTCAATTAGTTCACATTCTGCTCCTCTTATTTTAATCATTTTTTTAGTTCTTATTTAATCATTGCATAGTCCTGTAGTGATTGCAGGGCTAGATTCATATTGGATGGGAACTTAGGAATGAT
CCCACGTTTCAAGTAAGTAAGGTCTGTATCTAAAAACAGTATCTACTACAAATTTTCACTGCAGACTGTGCAGTAACGCAGTTATTGAGCCCTTGTTAAATCTGATGCTTAATTTTCAAGTAGGATCACCTGTGTTTCTTTATCTAACCTTTTGATGGATTTTATTGGGCATAGATGGAGGTTAAAATTACCTTTGGAAT
TTATTTGACAGAGGTGGAGGTTTTACCTAACCTTCTAATTTTTTGATTTGATTTTAATGGAATATTTTATGGCAAGGTGACTTCTGTTGCAGCTGAGGCCTACATCACATGCGTCAACTTATTGATTTTATTGGTGAGATTGACTCGGGAAAAGTTATGATTCATTTATCAGAgtatgtgcaacctttcagggccagcta
ttattgttcatcttacattttattgcaagtttggctgtaaacattggtcattgatcag
GGGCATGGAAACTTCTAGAAGGCTTAAAGGATGGCAATGCACTGTAGATGGTGGGACACGATGAAAGAGGGGGATTAAGGATATATAATAAAAATTTGAATAAGGAGGACAGTAAAAAAGCCTGACACAAGAGAAACGAAGG
AACTTTACAAGGACATATATACTAAATTCCAAGAATTGTTTGAAAAGTTGTCCAAAATAGAAGCCTGACCTTGTTATCAGAGGTCTGGCAGCTAGAAACTAGAGCAGATGGATTACTTGCAATTTATCTTCAAAAGTAGACATAGACAAATGGTATAAGCTATGAATATCATGTGGTGGTAAAAATTGAGAAGGGAGCAT
ACCTTGTGGCTTTGTGGCTTGAACAAGAAACAAGTTGAGAATGGAGTAGAGTGAAGTGATAGGCCTTTGACTTGACCAATGAACAACATGAAAGATTAGTTTCTTTACCCCTTTAAGTTAAAACCTGTTCCAATGAGAGTTTCTAGCAGAACTAAAAGAAATTTTGAGAAGATCCTGGAAATCAACCCTAGAGGTGTCTG
AAGCTGTATTGAAAATTTGCTGAAACTAGAAAATTATATTTTTCTATTTATCTATTACAGAATATTTAGACTTTCTGAAAATAACTGCAAATTTGTACAGATCTTAGCAACAGTCTCCTCAGCAAAATGAGGGTTACAAGCTATCTTAGGATTCTAGTTTTTTCCGAGTGTTTGCTTTGTTGTATCAGTATCGGTTTACA
TCTTCATTAGTTGTTACCTTCTCTTTTTGTGTCAATGTTTCTAATCTAGGAACAGTTCACGTTGAAAATTTGCAATTTTAAGC




Intron 2 GTATGCTTGC ... GATTTGGCAG

SampleRetention score (%)Exon junction reads5'ss reads3'ss reads
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A825.851522482
A922.45952134
A1030.43481626



>TRINITY_DN42009_c0_g1_i17 from sample A8 / Example spliced isoform
TCAGGAAGGAGGAGAGCAAGGGTGTGCAGAATACCAGAAAAAAGATTCCGGTCAGTATTACGTGCCATACCAGAATCAGGAAGGAGGAGAGCAAGGGTGTGCAGAATACCAGAAAAAAGATTTCGGTCAGGATTACGTGCCATACCAGAACCAGGAAGGAGGAGAGCAAGGTTATGCGGAATACCAGAATACTACGCAAT
ATTCAGAAGGCCCCGTTCCATCTCAACCCGATCTTGAGGCCAAAAACCCTGCTGCAGCCAAGGAAGAGGAAACTGCTATAGGCGTTGTGAATACAAGAAACGGAAACGACGACGGCAAAGATGGGAGTTTGAATCCGGCTTTCTCAGAGACCACAGCAATGAAGGGGGAAGATCGGGTGCAGGGTTCGAGTCAAGCAGAA
ACGCAGGGCGCTTGTTCTGCAGAAGTGAGCAGCGGCAGGAAGCGGCGTTCCCGTTGGGGTCCTCAGACGGAAGGCGAAGGTGAAATGCAGGATAGCGCCGGGTCCGTCAGGAAACGGAAAACCCGTTGGGCTGATGAGCCGAAGCCACTTATGTGTATCCAGCTTCCAGGGTTTGTTAAAGAGTTAACTGGAGGTATGGA
ACTTGATCCCGAGGTACAGGCTTTGAATGCACGTTTAATGGATATCAGCAGATTATTACAGTCGGGGATGCCTTTAGACGACCGACCGGAGGGTGCACGGTCACCGTCTCCGGAGCCCATCTATGATAACATGGGGGTCAGAATCAATACAAGAGAATACAGAGCCCGTGAAAAGCTTACCAGAGAGAGGCAGGAGCTCA
TTTCCCAACTTATCAAGCGAAACCCGGCATTTAAGCCTCCGGCTGATTACCGCCCGCCCAAGCTTTATAAGAAACTGTTCATTCCTGTGAAGGATTTTCCGGGGTATAATTTCATCGGTCTCATTATTGGCCCCAGAGGCAACACCCAGAAAAGAATGGAGAAGGAGACCGGTGCAAAGATTGTTATAAGAGGCAAGGGC
TCTGTCAAGGAAGGTAGATTACAGCAGAAACGTGATCTGAAACCTGATCCATCCGAAAACGAGGACTTGCATGTTTTGGTTGAGGCGGAGACACAGGATGCTTTGGAGCAAGCTGCGGGCATGGTGGAGAAGCTGCTTATGCCTGTGGACGAGGGTTTGAATGAGCACAAGCGGGCACAGTTGAGAGAACTTGCGGCGCT
GAATGGAACGATACGGGATGATGAATTCTGCAGGCTTTGTGGCGAACCAGGCCATAGGCAGTATGCTTGCCCTGCAAGGCTTTTGGGTTTCAAAAGTGATGTTTTGTGTAAAATTTGTGGTGATGGTGGTCATCCGACTATTGATTGTCCAATGAAGGGCTCGGGGAAGAAGATGGATGATGAATACCAGAACTTTTTGG
CTGAATTGGGGGGTGGCGCACCTGAGTCGGTTGCAAAAATTGGTGAAAATGGTCGTCAGAATCAGACATTGTCTCTCCCTGGCCCACAGAATGGTAACCCTCCATGGAAAGAAAGCGGTGGAATGGTTTTGGGTTATAGTGGAACGCAGCAAGGTCAGCAGTCGAATAACTTTCAGTCTGTGCTGGGATCGAAATTTACA
AAGGATCACGATGATTCCAATCTGTATATAGGATACCTGCCATCTCAAATCGATGATGACGGACTCATTCGGTTGTTTGCTCCTTTTGGTGAAATTGTTGCGGTGAAGGTCATCAAGGATCGGTTAACTGGGGCAAGCAAAGGATATGGCTTTGTGAAGTTCTCTGATACTGCCTCTGCTGCACAGGCGGTGTTGCATAT
GAATGGATACCGCCTGGATGGGAGGATTATGGCAGTCAGAGTCGCAGGCAGGCCACCACAAGCTGGTTTTCCTGGAGGTGGCCAAGCCCCTATCCCTGGTTCGTATCCTGGATCAGAACCCTCTGCAGCAAGTTATTCTTCACAGCAGTTTCCTTCAGGACCACTGACTGGAAATTCAATTTCAGCAGGGAACACAATGC
CTGCTCCAGTTCCATGGGGTCCACCTGTTCCACCTCCACCTTACAATCCTTATGCACCGCCTCCACCAAGACCCAGTATGTATGGTGAAGCTTATCATCCACAGGGGGGCACTTATCCTGGACCCCCAATGCAAGGACCTCCTCCACCTGGTACAGCCCCTCAAAATTTGATGCCACCTCCACCACCATATGGGGGACCT
TATCCTGTACAGGGACCTCCTCTGCCAGGTCCACCACCTCAGAGTATGCCTCCCGCTGAACCATCTCAAAGCTTGCCTCCAGGTGTGCCTCCTCATAGTTTGCCACTGCAGTCATCTTCCAATGGCAGCCAACATGGAGCTCCTCCAGGTGCAATCCCTAGTAATACTGGAAGTAATATGATGGCCATACCGCAGGTTGG
ACCTCCTGCATATCCCCCTCCACCTCAGTATCAAGGTTATTATGGTGCTCCGCCTCCTCCAAGTGCCCCAACAGGTCCTGCACAGAGTATAGGTAGTGTTCCACCTCCATGGGTAGTAAATCCTGCTCCTCCTCCTCCACCTCCTCCTCCTCCATCATCATCAGAGACAACCTATGCTGTCGAGTCAGAATATGAGAAAT
TCATGTCTGAAATGGGACAATGATTTTTCCAGCAATTCTCATGATGAACAGGGTTGATGTTTGTTGGAGGAAAGCTGACATGATTTATGTTTAGAATTCTGACACACAGACGTTTCGAAGAGTGGAAACTCATGTTATATTTAACCTTGTTTATGATGAAGAATAACTGTTGCAGAGCTATCCAACTTATGCGAGAAAGG
AGCAAATCGACTTATTGATGTAGCCTTTGAAATTTGTTGAATTTCTCTATAAATAGGTTTGAAGGGGCTTGTTTAACATTGTTTCATTGATTTAAAGTGGAATGGATGCAGAGATACTCAATTGCAGGGTTTTAACATGTTAGATTTAATGTTTTGTTACGATGCTAATCTTTTGAGCCTGCAGTTTGGCGAATATGCCC
TTGCAAATGGTTTTTATTATGAGAAGCGGTTGCCAAATGTAAATTTATTATAATTTTATCTTTTAATTTGTAGCACTAACTTGATGATTCTGGCCAGGTTTAAATTTATCCTTCAATTTGCATAAAAATAAATTCGCACTACTGTTGGAGTAGACAGGACTTGGCATGGTTGTGAGTGCATATTGGTTGATTACAATTGT
TGTTTTTGTCAGTATTGTAACTGTGATGTGCAATTTGTGCAGTTATTGTTGATATCTCTGAATATTTATTATGGCTTAGTGTTTATGACCTTAAATGTCTTTCTTAGAGGGAATGTTAAGGCCCTAACCATCACATTCATTATTAGTATATTAGTTACAGTTAAGTCTGCTTATTGGTAGGTTACATAATAAATGAGATT
CATTTGTATACTCATCCCATTTTGTCTTGTGCATTGGATACATTGTAAAAGGAGGTTGCCCCTTCAGAGAGGCTTGTTATTCATCGACTCTCTATCATTCTCAAGGCATGGAGCTACTTCTTCTTTCTGTTTTGATGCTGTTTGGGGAATTTGGTTCATAACAGGGGATATGATACATGCTTTGTTATGTGCTCACATTT
TCTATGATTTCATTGTGTTTGATTCATATCTCTAAGACAGTTGAATTTCGTATACCTTTGATAATTATATTATGTACCTGCAGTTCAATTTAACAGGACTTTAATGAGCTTCAGATTAAAGACTGATGCTACTGAGATGGAGACATCTTCATAAGCTCCAAATCTGGCACGTTATGGAAACAGGGTTGCCATTGCTTTTT
TTTCTATATCATGAATTGCATCAAAAAAGTTTTTTTAGCCCACCATTAGATGACAGTGTTTTGGAGTTGACTTTGTCTAGTTTACCTGTTGTGGATTTCATGCCTCGTCAAAATGTTTTCCAATGCTTGGCACGACATCTTCATAAGCTCTAAATCTGGCACGTTATGGAAACAGGGTTGCCATTGCATTTGTTTCTATA
TCATGAATTGCATTGAAAAGGTTTTTTTAGCCCACCATTAGATGACAATGTTTTGGAGTTGACTTTGTCTGGTTTAGCTATTCTGGATTTCATGCCTCATCAAAATGTTTTCCAGTGCCTGGCACTGTGCCATAGAGTTACAACAGGCCTCAATTAGTTCACATTCTGCTCCTCTTATTTTAATCATTTTTTTAGTTCTT
ATTTAATCATTGCATAGTCCTGTAGTGATTGCAGGGCTAGATTCATATTGGATGGGAACTTAGGAATGATCCCACGTTTCAAGTAAGTAAGGTCTGTATCTAAAAACAGTATCTACTACAAATTTTCACTGCAGACTGTGCAGTAACGCAGTTATTGAGCCCTTGTTAAATCTGATGCTTAATTTTCAAGTAGGATCACC
TGTGTTTCTTTATCTAACCTTTTGATGGATTTTATTGGGCATAGATGGAGGTTAAAATTACCTTTGGAATTTATTTGACAGAGGTGGAGGTTTTACCTAACCTTCTAATTTTTTGATTTGATTTTAATGGAATATTTTATGGCAAGGTGACTTCTGTTGCAGCTGAGGCCTACATCACATGCGTCAACTTATTGATTTTA
TTGGTGAGATTGACTCGGGAAAAGTTATGATTCATTTATCAGAGTATGTGCAACCTTTCAGGGCCAGCTATTATTGTTCATCTTACATTTTATTGCAAGTTTGGCTGTAAACATTGGTCATTGATCAGGGGCATGGAAACTTCTAGAAGGCTTAAAGGATGGCAATGCACTGTAGATGGTGGGACACGATGAAAGAGGGG
GATTAAGGATATATAATAAAAATTTGAATAAGGAGGACAGTAAAAAAGCCTGACACAAGAGAAACGAAGGAACTTTACAAGGACATATATACTAAATTCCAAGAATTGTTTGAAAAGTTGTCCAAAATAGAAGCCTGACCTTGTTATCAGAGGTCTGGCAGCTAGAAACTAGAGCAGATGGATTACTTGCAATTTATCTT
CAAAAGTAGACATAGACAAATGGTATAAGCTATGAATATCATGTGGTGGTAAAAATTGAGAAGGGAGCATACCTTGTGGCTTTGTGGCTTGAACAAGAAACAAGTTGAGAATGGAGTAGAGTGAAGTGATAGGCCTTTGACTTGACCAATGAACAACATGAAAGATTAGTTTCTTTACCCCTTTAAGTTAAAACCTGTTC
CAATGAGAGTTTCTAGCAGAACTAAAAGAAATTTTGAGAAGATCCTGGAAATCAACCCTAGAGGTGTCTGAAGCTGTATTGAAAATTTGCTGAAACTAGAAAATTATATTTTTCTATTTATCTATTACAGAATATTTAGACTTTCTGAAAATAACTGCAAATTTGTACAGATCTTAGCAACAGTCTCCTCAGCAAAATGA
GGGTTACAAGCTATCTTAGGATTCTAGTTTTTTCCGAGTGTTTGCTTTGTTGTATCAGTATCGGTTTACATCTTCATTAGTTGTTACCTTCTCTTTTTGTGTCAATGTTTCTAATCTAGGAACAGTTCACGTTGAAAATTTGCAATTTTAAGC


>TRINITY_DN42009_c0_g1_i8 from sample A8 / Example unspliced isoform:
TCAGGAAGGAGGAGAGCAAGGGTGTGCAGAATACCAGAAAAAAGATTCCGGTCAGTATTACGTGCCATACCAGAATCAGGAAGGAGGAGAGCAAGGGTGTGCAGAATACCAGAAAAAAGATTTCGGTCAGGATTACGTGCCATACCAGAACCAGGAAGGAGGAGAGCAAGGTTATGCGGAATACCAGAATACTACGCAAT
ATTCAGAAGGCCCCGTTCCATCTCAACCCGATCTTGAGGCCAAAAACCCTGCTGCAGCCAAGGAAGAGGAAACTGCTATAGGCGTTGTGAATACAAGAAACGGAAACGACGACGGCAAAGATGGGAGTTTGAATCCGGCTTTCTCAGAGACCACAGCAATGAAGGGGGAAGATCGGGTGCAGGGTTCGAGTCAAGCAGAA
ACGCAGGGCGCTTGTTCTGCAGAAGTGAGCAGCGGCAGGAAGCGGCGTTCCCGTTGGGGTCCTCAGACGGAAGGCGAAGGTGAAATGCAGGATAGCGCCGGGTCCGTCAGGAAACGGAAAACCCGTTGGGCTGATGAGCCGAAGCCACTTATGTGTATCCAGCTTCCAGGGTTTGTTAAAGAGTTAACTGGAGGTATGGA
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