NA ----> NA
Intron 1 GTAAGTAATG ... TCTATTTCAG
| Sample | Retention score (%) | Exon junction reads | 5'ss reads | 3'ss reads |
| A1 | 100 | 0 | 7 | 12 |
| A2 | 84.62 | 1 | 6 | 5 |
| A3 | 100 | 0 | 1 | 4 |
| A4 | 75 | 1 | 3 | 3 |
| A5 | 73.33 | 2 | 8 | 3 |
| A6 | 64.71 | 3 | 0 | 11 |
| A7 | 42.86 | 2 | 2 | 1 |
| A8 | 45.45 | 3 | 2 | 3 |
| A9 | 33.33 | 2 | 0 | 2 |
| A10 | 52.38 | 5 | 9 | 2 |
>TRINITY_DN38226_c0_g1_i3 from sample A8 / Example spliced isoformTATGGTAGCTTCTACTTTCTCCATTTATAATTTATATATATATGGATATAGTCTTGATATTTATAAAGTCAAAATCATATTTTATTTAAGAACATAATACAATATAAGTGTGGACCCTTTTTAACTATAGGGTGAACCATTCTAATGTGATATTGGTGCATTATTATAATAAACAACTTTTATATGGTTTATTGTAATAA
TATTACAATGTACCGATACTATTTTCTAACCTAAGTTCTAACTATCTAAATCTTATATGCATGCGATTATTACCAATACAAACTTTTGATTTATGTAATCATGCATTCGATGGTTAATACCATAGCGATGAAGCGATATACAATGCAATCCTGACCTTACTCTATGTATTGATAATGAACGACATTACACCAAGCATTAA
ATACGACACTGGTAAGGAAGTGATGGTTATTAATGTCGCTGCTGCATCGATCTGACAGGTTGATGGTGTCTCGTCCAAACATTAATGGTTCAGAACCAACTCTTTAGTGGAGTGTAATGCTGTCTATCCACGTTGTCAAACCACGTGAAGCCTGGTTAAAATGTGACTCACGAAATCGAACTATGCGTAGTGAACAAGCA
AATCTCCTCCGAACTGTACATGGGATTGACTCCTTGGCATGCAGCGTTGGCATTGTCGTAGCTGTTACAATAAATGAGGTATTTATGTTATGGTTGCCCGATTCTCAAAGCATCAGGCTGCCACCTTCTCGCTCGTCGATCACAATAGATCTGGGTCGTTGAATGATAAACCCTAAATTCTCGTTGGTGAAAGTCTATTT
TTACAGTGCTGGGGTTGGATCTTTGGCCTTTCCACTCAAGGGCCAATCAAAGGTCTAACATCCAAGCTTGCTGGAAAAATGAATGTCGAGGAATCCGACGTCCTGGTAAGTCTCGGGTTCATCCATAACCCTGGACTCGTCGGAGGTTAAAACTTTCTTCTCAGTAAAAGAGTTAGGTTAATCCGTAAGCAATGATAATG
TTTAGACTGATTTTTTGTGTTGCCGAGGCTTCAAGCCTGCATTGTAAACTGAAAATATTTTACAATGGCATCTTCGCCATAGTACAGCTTGCAAGCTTCGCTTTAAAGGATTGAAAGTCATTTGACTTGGTATTATAATATTGGTTTTTAGTTACAGAAGAAAAGAAATGTTGCGTTGTTCTTTTTTTTGTATTCGGTAC
TGTTAAAGTTGTTGCGAATACTGTAGTTTGACGCTCAATCTAAAGAAATGAACTTCTGTAGTTAGATTCTGGAAATAAATAAGAATGGAGA
>TRINITY_DN38226_c0_g1_i4 from sample A8 / Example unspliced isoform:TATGGTAGCTTCTACTTTCTCCATTTATAATTTATATATATATGGATATAGTCTTGATATTTATAAAGTCAAAATCATATTTTATTTAAGAACATAATACAATATAAGTGTGGACCCTTTTTAACTATAGGGTGAACCATTCTAATGTGATATTGGTGCATTATTATAATAAACAACTTTTATATGGTTTATTGTAATAA
TATTACAATGTACCGATACTATTTTCTAACCTAAGTTCTAACTATCTAAATCTTATATGCATGCGATTATTACCAATACAAACTTTTGATTTATGTAATCATGCATTCGATGGTTAATACCATAGCGATGAAGCGATATACAATGCAATCCTGACCTTACTCTATGTATTGATAATGAACGACATTACACCAAGCATTAA
ATACGACACTGGTAAGGAAGTGATGGTTATTAATGTCGCTGCTGCATCGATCTGACAGGTTGATGGTGTCTCGTCCAAACATTAATGGTTCAGAACCAACTCTTTAGTGGAGTGTAATGCTGTCTATCCACGTTGTCAAACCACGTGAAGCCTGGTTAAAATGTGACTCACGAAATCGAACTATGCGTAGTGAACAAGCA
AATCTCCTCCGAACTGTACATGGGATTGACTCCTTGGCATGCAGCGTTGGCATTGTCGTAGCTGTTACAATAAATGAGGTATTTATGTTATGGTTGCCCGATTCTCAAAGCATCAGGCTGCCACCTTCTCGCTCGTCGATCACAATAGATCTGGGTCGTTGAATGATAAACCCTAAATTCTCGTTgtaagtaatgctgga
gggtttcttagtcttcactttcacattttggagttagagtgtgaggccgacacgctgctaaaacttagggttagcaagtttgcttggagtttggaacccgcaacctctgcattattttaatggtgttttgcagacctgtaagtgaatgcttagtagttgataccacgaccttggtgtggtttctatttcagGGTGAAAGT
CTATTTTTACAGTGCTGGGGTTGGATCTTTGGCCTTTCCACTCAAGGGCCAATCAAAGGTCTAACATCCAAGCTTGCTGGAAAAATGAATGTCGAGGAATCCGACGTCCTGGTAAGTCTCGGGTTCATCCATAACCCTGGACTCGTCGGAGGTTAAAACTTTCTTCTCAGTAAAAGAGTTAGGTTAATCCGTAAGCAATG
ATAATGTTTAGACTGATTTTTTGTGTTGCCGAGGCTTCAAGCCTGCATTGTAAACTGAAAATATTTTACAATGGCATCTTCGCCATAGTACAGCTTGCAAGCTTCGCTTTAAAGGATTGAAAGTCATTTGACTTGGTATTATAATATTGGTTTTTAGTTACAGAAGAAAAGAAATGTTGCGTTGTTCTTTTTTTTGTATT
CGGTACTGTTAAAGTTGTTGCGAATACTGTAGTTTGACGCTCAATCTAAAGAAATGAACTTCTGTAGTTAGATTCTGGAAATAAATAAGAATGGAGA
Intron 2 GTATTTATGT ... TCTATTTCAG
| Sample | Retention score (%) | Exon junction reads | 5'ss reads | 3'ss reads |
| A1 | 63.64 | 6 | 9 | 12 |
| A2 | 100 | 0 | 6 | 5 |
| A3 | 100 | 0 | 6 | 4 |
| A4 | 52 | 6 | 10 | 3 |
| A5 | 81.82 | 1 | 6 | 3 |
| A6 | 68.42 | 3 | 2 | 11 |
| A7 | 42.86 | 2 | 2 | 1 |
| A8 | 37.93 | 9 | 8 | 3 |
| A9 | 38.46 | 4 | 3 | 2 |
| A10 | 100 | 0 | 11 | 2 |
>TRINITY_DN38226_c0_g1_i2 from sample A8 / Example spliced isoformTATGGTAGCTTCTACTTTCTCCATTTATAATTTATATATATATGGATATAGTCTTGATATTTATAAAGTCAAAATCATATTTTATTTAAGAACATAATACAATATAAGTGTGGACCCTTTTTAACTATAGGGTGAACCATTCTAATGTGATATTGGTGCATTATTATAATAAACAACTTTTATATGGTTTATTGTAATAA
TATTACAATGTACCGATACTATTTTCTAACCTAAGTTCTAACTATCTAAATCTTATATGCATGCGATTATTACCAATACAAACTTTTGATTTATGTAATCATGCATTCGATGGTTAATACCATAGCGATGAAGCGATATACAATGCAATCCTGACCTTACTCTATGTATTGATAATGAACGACATTACACCAAGCATTAA
ATACGACACTGGTAAGGAAGTGATGGTTATTAATGTCGCTGCTGCATCGATCTGACAGGTTGATGGTGTCTCGTCCAAACATTAATGGTTCAGAACCAACTCTTTAGTGGAGTGTAATGCTGTCTATCCACGTTGTCAAACCACGTGAAGCCTGGTTAAAATGTGACTCACGAAATCGAACTATGCGTAGTGAACAAGCA
AATCTCCTCCGAACTGTACATGGGATTGACTCCTTGGCATGCAGCGTTGGCATTGTCGTAGCTGTTACAATAAATGAGGGTGAAAGTCTATTTTTACAGTGCTGGGGTTGGATCTTTGGCCTTTCCACTCAAGGGCCAATCAAAGGTCTAACATCCAAGCTTGCTGGAAAAATGAATGTCGAGGAATCCGACGTCCTGGT
AAGTCTCGGGTTCATCCATAACCCTGGACTCGTCGGAGGTTAAAACTTTCTTCTCAGTAAAAGAGTTAGGTTAATCCGTAAGCAATGATAATGTTTAGACTGATTTTTTGTGTTGCCGAGGCTTCAAGCCTGCATTGTAAACTGAAAATATTTTACAATGGCATCTTCGCCATAGTACAGCTTGCAAGCTTCGCTTTAAA
GGATTGAAAGTCATTTGACTTGGTATTATAATATTGGTTTTTAGTTACAGAAGAAAAGAAATGTTGCGTTGTTCTTTTTTTTGTATTCGGTACTGTTAAAGTTGTTGCGAATACTGTAGTTTGACGCTCAATCTAAAGAAATGAACTTCTGTAGTTAGATTCTGGAAATAAATAAGAATGGAGA
>TRINITY_DN38226_c0_g1_i4 from sample A8 / Example unspliced isoform:TATGGTAGCTTCTACTTTCTCCATTTATAATTTATATATATATGGATATAGTCTTGATATTTATAAAGTCAAAATCATATTTTATTTAAGAACATAATACAATATAAGTGTGGACCCTTTTTAACTATAGGGTGAACCATTCTAATGTGATATTGGTGCATTATTATAATAAACAACTTTTATATGGTTTATTGTAATAA
TATTACAATGTACCGATACTATTTTCTAACCTAAGTTCTAACTATCTAAATCTTATATGCATGCGATTATTACCAATACAAACTTTTGATTTATGTAATCATGCATTCGATGGTTAATACCATAGCGATGAAGCGATATACAATGCAATCCTGACCTTACTCTATGTATTGATAATGAACGACATTACACCAAGCATTAA
ATACGACACTGGTAAGGAAGTGATGGTTATTAATGTCGCTGCTGCATCGATCTGACAGGTTGATGGTGTCTCGTCCAAACATTAATGGTTCAGAACCAACTCTTTAGTGGAGTGTAATGCTGTCTATCCACGTTGTCAAACCACGTGAAGCCTGGTTAAAATGTGACTCACGAAATCGAACTATGCGTAGTGAACAAGCA
AATCTCCTCCGAACTGTACATGGGATTGACTCCTTGGCATGCAGCGTTGGCATTGTCGTAGCTGTTACAATAAATGAGgtatttatgttatggttgcccgattctcaaagcatcaggctgccaccttctcgctcgtcgatcacaatagatctgggtcgttgaatgataaaccctaaattctcgttgtaagtaatgctgga
gggtttcttagtcttcactttcacattttggagttagagtgtgaggccgacacgctgctaaaacttagggttagcaagtttgcttggagtttggaacccgcaacctctgcattattttaatggtgttttgcagacctgtaagtgaatgcttagtagttgataccacgaccttggtgtggtttctatttcagGGTGAAAGT
CTATTTTTACAGTGCTGGGGTTGGATCTTTGGCCTTTCCACTCAAGGGCCAATCAAAGGTCTAACATCCAAGCTTGCTGGAAAAATGAATGTCGAGGAATCCGACGTCCTGGTAAGTCTCGGGTTCATCCATAACCCTGGACTCGTCGGAGGTTAAAACTTTCTTCTCAGTAAAAGAGTTAGGTTAATCCGTAAGCAATG
ATAATGTTTAGACTGATTTTTTGTGTTGCCGAGGCTTCAAGCCTGCATTGTAAACTGAAAATATTTTACAATGGCATCTTCGCCATAGTACAGCTTGCAAGCTTCGCTTTAAAGGATTGAAAGTCATTTGACTTGGTATTATAATATTGGTTTTTAGTTACAGAAGAAAAGAAATGTTGCGTTGTTCTTTTTTTTGTATT
CGGTACTGTTAAAGTTGTTGCGAATACTGTAGTTTGACGCTCAATCTAAAGAAATGAACTTCTGTAGTTAGATTCTGGAAATAAATAAGAATGGAGA