sp|Q9STF9|THA8L_ARATH ----> Protein THYLAKOID ASSEMBLY 8-like, chloroplastic


Intron 1 GTATCCTTTT ... CCAATATCAG

SampleRetention score (%)Exon junction reads5'ss reads3'ss reads
A161.5218.54019
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A963.42109.5251128
A1056.818615274



>TRINITY_DN97379_c0_g1_i2 from sample A4 / Example spliced isoform
TCATCATCAACCGAAGTGCGCTCGAGTTCGTACCGAATTTTGTTTCCCTGATTGAGCAATGGGCACGCTCGGGTATCTTACAAGTTTTTCATTTCAAACCCATGCAGTGGCCACGGTTTGGCTCTGTAAATGTAAGGATAAAGTTCAGGGTTTCGAGACAGGAGAAAGGTTAGTGGAAATTTCTAGAAGGATTGACGGGT
TGCAGTGGTGGAAGCGAAGGCATAATGTATGTAGTTTGAGATCGAGCCAAAGCCGGGGACCCTTATGGAGAGGAAGGGTTCTCAACAATGACTCAATGCAAGCCGTGCAGGCCATGAAAAGGGCCAAAGGTGACCCGGATAAGATTGACAGGATTATTGAGACGAGAGTTTCTCGACTGGTGAAGGTGGATATCTTGGCC
GTGCTTAAAGAGCTTCAAAGACAAGATGAATGCCATTTGGCCCTCAGAGTATTTGATGTTGTACGCAAGGAAGTGTGGTACAAACCAGATTTGTTCCTTTATGCTGCTATGATAAGAACGCTGAAAAGAAGTAACCTAATTGAAAAAATCAAGCCACTTTTTGCTGAACTGGAGAAAGAATGCCTTCAACCCGATACAAG
GGCTTTCACCCATCTCCTTTCTACCTTTTTACGAGTGGGCCTGCCTCAAAATGCAATGGAGACCTATTATTTAATGAAGCAATCAGGATGTAAAATGGAAGAATACACATTTAAAGTGTTAATCAATGGTCTTCAGAGTCTCGGAGAGCTTGATCTTGCAGTTGCTATAAGTAAAGAATATAATCAATTTTTGGATGGTC
ATATGGGTTTTTTAGAAGATGGTACACAGGGTACTTTAATAACTTAAACTCCTGAATCTTGTATTACGGTCCATCTCTTTCCTTCTTGGGAGGAAGGATCATTGAACTCAACAAGTCAGTCTCCATGTGGGCAGGTATCTAATCCTTGAGAGAAAGGGGAAACAGATACATTAGTTGATCTTACAATTGTAACATGGGAG
TCTGGACGTTTTCTAACATGTGAGATCAGTTGTACACGGCAGCAATGGGGATGATGGATGATTGTGTGAAACTTTGTTTTCATTGCTCTATAAAACATGTATTTTTAACCAGAAAAAAAGATTTATCTGGGAAGAAATTCCATCGCCATTTAGAATATATTTCTTGACCCTGACCTAAACCTTATACGTCTTGGCCAAGG
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TTGCACGGTGAGTACAAATGTTTGGCAAATTGTAACAATGATGTACCCCTCTAACTGCGCTGATGTGG


>TRINITY_DN97379_c0_g1_i1 from sample A4 / Example unspliced isoform:
TCATCATCAACCGAAGTGCGCTCGAGTTCGTACCGAATTTTGTTTCCCTGATTGAGCAATGGGCACGCTCGGGTATCTTACAAGTTTTTCATTTCAAACCCATGCAGTGGCCACGGTTTGGCTCTGTAAATGTAAGGATAAAGTTCAGGGTTTCGAGACAGGAGAAAGGTTAGTGGAAATTTCTAGAAGGATTGACGGGT
TGCAGTGGTGGAAGCGAAGGCATAATGTATGTAGTTTGAGATCGAGCCAAAGCCGGGGACCCTTATGGAGAGGAAGGGTTCTCAACAATGACTCAATGCAAGCCGTGCAGGCCATGAAAAGGGCCAAAGGTGACCCGGATAAGATTGACAGGATTATTGAGACGAGAGTTTCTCGACTGGTGAAGGTGGATATCTTGGCC
GTGCTTAAAGAGCTTCAAAGACAAGATGAATGCCATTTGGCCCTCAGAGTATTTGATGTTGTACGCAAGGAAGTGTGGTACAAACCAGATTTGTTCCTTTATGCTGCTATGATAAGAACGCTGAAAAGAAGTAACCTAATTGAAAAAATCAAGCCACTTTTTGCTGAACTGGAGAAAGAATGCCTTCAACCCGATACAAG
GGCTTTCACCCATCTCCTTTCTACCTTTTTACGAGTGGGCCTGCCTCAAAATGCAATGGAGACCTATTATTTAATGAAGCAATCAGGATGTAAAATGGAAGAATACACATTTAAAGTGTTAATCAATGGTCTTCAGAGTCTCGGAGAGCTTGATCTTGCAGTTGCTATAAGTAAAGAATATAATCAATTTTTGGATGGTC
ATATGGGTTTTTTAGAAGATGGTACACAGGGTACTTTAATAACTTAAACTCCTGAATCTTGTATTACGGTCCATCTCTTTCCTTCTTGGGAGGAAGGATCATTGAACTCAACAAGTCAGTCTCCATGTGGGCAGGTATCTAATCCTTGAGAGAAAGGGGAAACAGATACATTAGTTGATCTTACAATTGTAACATGGGAG
TCTGGACGTTTTCTAACATGTGAGATCAGTTGTACACGGCAGCAATGGGGATGATGGATGATTGTGTGAAACTTTGTTTTCATTGCTCTATAAAACATGTATTTTTAACCAGAAAAAAAGATTTATCTGGGAAGAAATTCCATCGCCATTTAGAATATATTTCTTGACCCTGACCTAAACCTTgtatccttttagttcaa
atttcctatgaagtgtttttaaatggttccagattccgtcaaaatgatgttaatatggaattcagaaacaaactatctttagctgccaatatcagATACGTCTTGGCCAAGGCTACCAGTTTTAAACAGCGGAATCAATCTGCATTAAGGAGTTCTTACGTTACTTACTTCAACAGGCACATTAGAATCACCAATAGTAT
CCAACAGATGCAGATTTATCAGAAGCTTTCAAGCAGAGCTTCATCGCACATAATATATAACTTGTCAAATCTAAAGCTCTACTCTTGGGCCATTTGTTTAAACATTCTATATTTGCACGGTGAGTACAAATGTTTGGCAAATTGTAACAATGATGTACCCCTCTAACTGCGCTGATGTGG