sp|Q5NB82|NLP3_ORYSJ ----> Protein NLP3
Intron 1 GTACGTATCG ... GAAACTACAG
| Sample | Retention score (%) | Exon junction reads | 5'ss reads | 3'ss reads |
| A1 | 63.58 | 12.8 | 20 | 23 |
| A2 | 58.09 | 15.7 | 20 | 22 |
| A3 | 66.93 | 9.7 | 26 | 13 |
| A4 | 69.07 | 11.7 | 31 | 21 |
| A5 | 59.17 | 12.8 | 30 | 7 |
| A6 | 50 | 2 | 4 | 0 |
| A7 | 47.47 | 3.9 | 5 | 2 |
| A8 | -1 | 0 | 0 | 0 |
| A9 | -1 | 0 | 0 | 0 |
| A10 | 56.67 | 6.9 | 13 | 5 |
>TRINITY_DN111229_c1_g1_i3 from sample A2 / Example spliced isoformTTCAAATCTGATTCTCATATAGACAATGAGATGCTCTTGGGTGAAGAAACATTCCCAATCCATTGAAGTGGGGGCAGTGGATTTGTTAAGAGAGTACAGGGAGCCTACATTCCATTTTGTGATCCAGTCTCTCTTTCATAATTTGCACAAGTTAACCTGTCACTGCCTTAGGTCCCTTTTGTATTCCAATGCATGCTGTG
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TTAGTCCTACACTCGTGGGAAGCACCTCTTGCATTTGAAAAGTCAGTCAATGCCTGACCACTGTCCAAACATGTATCA
>TRINITY_DN111229_c1_g1_i1 from sample A2 / Example unspliced isoform:TTCAAATCTGATTCTCATATAGACAATGAGATGCTCTTGGGTGAAGAAACATTCCCAATCCATTGAAGTGGGGGCAGTGGATTTGTTAAGAGAGTACAGGGAGCCTACATTCCATTTTGTGATCCAGTCTCTCTTTCATAATTTGCACAAGTTAACCTGTCACTGCCTTAGGTCCCTTTTGTATTCCAATGCATGCTGTG
GGCACTGTTATTGTATCTGTTGGTTTTCTTATTTTAAACAGTTCATGCCACTGTTGTATGTTATATTGGTACTTCGGGAATCACATAAAGCCACCCACGACCCAGATCCCGGATTGACTTTGTGAAGTTGAAGCAGAGTACCAGATTTTGCTTGGACAAGCTCAAAGCAAAGGAGTAAGTGGGCTCCCCTCCTGCCCCTC
TTCTAGCCAGCAAGCAATGATGgtacgtatcggtctttttacataggaatgcctgattttgcaatcagaatacagagaagcagcacgtcatcgtggtgcttctgtgaaactacagGTGGGTTCGGGCTTCAGGGAGGGCTTGTTGAAGGTAATTATCAGGTGGCTGTTCTCAATCCTTGTAATTGCCATTGACTGAGTGG
CCCAACTGGGCCCTGGATTAAGAAGCAAGACATGCTCCAGGCTGTGTATTTTAGATGGGTATTGTCGAATCTCTTTAACGGTCATCACAGAATTATCAACTGAGGTGGGCATTTGTCAATCTCTGCAATTGTCATTGACGAAATGCTTCAACTAGGCTCTGGAATCAGAAGCAAACAAAATTCTGGTTGTTTTTCAGGCT
GTTCTTCAGGTGCGTTTTGTTGAATCTCTGGGGGTATAATCAGAAAATTCTCAACTGAGCTGAGTGGGTATTAATTTCCGTAGTTGTCATTGACAGACTATCAGAAGTAAAGCAGATTCTAGCCCTACGTGTGTCTTGGGGTGTGTTTTCAGGTGGGTATTGTTGAATCTCTGAGCTGTACTATCAGAAAATTGTCAACT
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AGGAGGGCCATGGATGGAAGGTTGCGAGGACATGGAATTTGCAGAATTGTCTCCCAGGTCCTCAGCTTCCCTCTTCAATGGACCATTGTTCTCAGTATTCCCTTTCACCCCTGGTTCTTCCGTTGCAGATGATCTTGAGCCTATCCAGGATCAGAATCCTGAGAACAAACGCAAAGATGAGCAGAGGAGCATGGTGAAAG
AGGACCACGCCTTTGAACCACAGCCAATTATTTCGCCATGGATATACAGTGAAATTAGCACGGCTGATACTTCTTCCCCTCATCAAGGCCAGTTTCTCGGATTGGAGGATTATCAGCATAGAAACACAAACTCTATGCCAAGCCTGCTGAGAGGACCAGACTGTGGACAGGGTCGGATTTCAGACATGCCAGAAAACACT
TTTGTGCAGTCTGATAATACTCCAAGGGAATCCTCCATTGCGGAATTGGTCACGGTATCTAGGTCTGCCGAATTTGCAAACAGAAAGTCGGAATTGGCAGTTGATGTCTGGTGTAATAATGTGAATACCTCTGATGGGTCGTCTCTTCTCAAGGAAAGGTTGTTGCGGGCACTGAGGTATATAAAGGAGTCTACTGGACA
AACTCTCCTGGCACAGGTTTGGGTACCAGTTAAAAGGGGAAGTAAATTTGTTCTTACTACCAGTGGACAGCCCTTTGTCCTGGATTCTCGCAATGATAAGCTCACGGACTTTAGGACTGTATCCTTGAATTATGTTTTCTCTGCCGAGGAGGATTCTGATGAGTTACTTGGACTTCCAGGCCGAGTTTTCCTAAAGAAAA
CACCTGAATGGACACCAAATGTGCAGTATTATAGCAGCAATGAATACCCTCGTGTATTTCATGCCGAACACTACAATGTCCGCGGTACTCTTGCCCTTCCTGTGTTTGAATCGGAAAATCATTCTTGCGTTGGTGTTGTAGAACTCATCATGACCACCCAGAAGGTCCACTATGCACCCGAGTTTGAAAAAGTTTGCAAA
GCACTTCAGGCTGTTAATTTGAAGAGTTCAGAAGTTTTGGAGCGCCCAAAGTTGCTGATACCTGTCGAAAGCCGTCAAGCTGTTCTACCTGAGATTTTAGAGGTGTTGATTGCAGTATGTGAGACACACAAGTTACCGTTAGCTCAAACTTGGGTGCCATGCAAGCATCGTAACATTGTTGCTGGTGGCAGTAGCAAGAA
GGGAAGCTGTATAGGTAATGATTTCCATTATGGTGGGCAAGTTTGCATGTCTACAATAGGCGAGGCATGCTATGGGACTGATCCTGACATGCTGGAATTTCAAGAGGCGTGCTCTGAGCAACATCTTTTAAAAGGGCAAGGTGTTCCTGGAAAGGCGTTTGCATCCAATCAACCATATTTTTCAGACAATGTATCAACTT
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AGTTTACGGACTGTATCAGACAAGGAGCTACAGGAGGAAATAAATTTAGAAAACACCGAAGGGTTTTCAAGTGGAAGAGTTGATCCCCAAGTTGAGGTTCAGGGTGGAGAGTCTCCAGACCTTTCGAATGAATTTCAAGAGGTGGAAACTTCTCCAAGGATTGCCCATATTCAAAGCCGAGAGTGGAAACAACAAGGTCC
TATGCATCAAACTTTGCAAATTTCAGATGGAGGTGATAGAAGTCAAAGGCAAATAATGCAACAACCTGTAGCAAGATCACCTTCTGCTATCAACTATCAGAAAAAACATCTATGTCATGATAAATTGGCCATATTTGACCAAAAGCAGTATCAGTCAGATTCTGTTCAATCACTTGGAAAAGGTGTTTCTTCTTTTTCTG
TTCAGGAGAACATGAATACCAGCAAGGGACTGGAAAAGAGGCGAGGTAAAGTAGAGAAAAGTATCAGCTTGCCAGTTCTTCAGCAGTATTTTGCGGGAAGCCTGAAAGATGCTGCAAAAAGCATTGGTGTGTGTCCAACTACATTGAAAAGAATCTGTAGGCAGCATGGAATCCCCAGGTGGCCTTCACGCAAGATCAGC
AAGGTGAACCGTTCCCTAAAGAAATTGCAAGGAGTGATTGAATCAGTACAGGGTGTAGAGGGGGCATTTAAAATTGGCTCCTTCACAAGTGCACTCTCTCCAACTGCTATACCAAATTTATGGACTGCTGATATAAAAGGTGAAACTAGTCATATGGCCAACGTAGCTCCACCTCATAGTCATGAAGAAACTTTCTATGA
TAAAACTTCTCCTGGAATGTATTGTTCTGTGCCCGAGAAATTATCGAATTCTCAAAACTTATCAGTAGCTGATTTAGCTGTGAGTCTGCCTTCATTATTAGTGTGTAAAGAGAAAATGGGTGATCATGTTCATCCCAAAGTGTTTACTCATGAAGGGCATGCAGTCGCTTTTGAAGGCCTATCTTCACAGGAGGAAGAAT
GTCATATAAACAATGTACAAGGCACAGCTAAGAGATTTGTTGGGTCAAAAGGGTTTGGATCGCTCACAGGCACCTCTGGGACACCTAAATCTTCAGAGTGTAGCCAAAGCTCAAGCTCAAGTCATCCTTGGTCAACTCAAGCTGAACCAAATGATCCAGTCACATCTGCATGTGTCAGTCCACAAACTTTTAAAGAGAAT
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AAATCAAGGTGCTAGTTTGATTGTAAAGAACAGAAGTGATCAAGGATCAGAAAATATAAGTCCAGCAGGTAGATTGCAAACGGGTAGAATCATTCAAGATGAGAGCATGTTAACGATAGTGAAAGCAACATATAAAGAGGATACTATTCGTTTCAAATTGTTTCCACACATGGGCTTTCAAGAACTTTGTGAGGAGGTGG
CAAAGCGATTCCAGTTGGAGTCGGGTACAATTAATCTGAGGTATTTAGATGATGATCTTGAGTGGGTTTTGCTAACTTGCGATGCAGATTTGTTTGAGTGCATTGACATCTTGAAATCGTCGGGTGGACGTACAGTTAAGCTTTCAGTTCAAGATGTATCTCCGAACATTGGAAGCTCCTGCGGGAGCAATGGAGGATTG
TGAATGACTAGGTCATAACATTCTAGTGTCAATTCTTCAAAGATTTGAGCCTAATGGTTCAATTTTCTTTCAAATTGTACACTTCTTTTGTGGTTAGTCCTACACTCGTGGGAAGCACCTCTTGCATTTGAAAAGTCAGTCAATGCCTGACCACTGTCCAAACATGTATCA