sp|B1VKC1|PSBB_CRYJA ----> Photosystem II CP47 reaction center protein

Intron 1 GTATGCTAGT ... GGCGTTGCAG

Sample	Retention score (%)	Exon junction reads	5'ss reads	3'ss reads
A1	85.71	1	6	0
A2	80	3	12	0
A3	57.14	9	12	1
A4	-1	0	0	0
A5	87.5	1	7	0
A6	58.93	22.4	32	15.8
A7	63.83	31.2	55	3.6
A8	61.33	27	42.6	21.2
A9	62.23	13.6	22	11.6
A10	83.14	8	39	8

>TRINITY_DN42356_c2_g2_i2 from sample A6 / Example spliced isoform

GGGCCCAGCATTGCTTGTCGAGGATCCGTGAGGCGAAAGCGAAAATGACAGCGTTCTCAAGATACGGCCCCTTCCTGCCGCCCGCGGTGGGCGGACCGAATAAGAAGCCTTTGGAAAAGCCGGAACGTGGCGAGAGATTACATGTAATGTAGCCAGCGATAGATGAATTATATGTAATGTAGCCACCTGAGCTCTTGTTC
GATTCTCATGGGCTCTACTACTTCAACGTCCCAGTAGTTTCGAACCCTAATAATTGGGTGGCTTCTGTAATTAATTGGGTTTTTTAACGGACACGGGAATAATGTCTACCAGCGGGAGCGGCAGGGTGGCGGCGCTGGCGACCCTGGCGGAAGGACCGGTGGAGGAATTGTGCGATTATTTGGAAGAGGAGGAGGGGCGC
TGGAAATGGAATGCCGCTGCCAAGTGTTCCTTGTTACCGTCGTCGTTGTTGATATTAAGACAACATAATAATAGTAATGGCAAGTTCTCAGTCGACTCGCGGCTTCTGCTGGGCGTTATGGCATGCCCGCTCTGCCCCGTGTCCGTTTCTTCCTGCTCCTCCGCTGTTCCTGATGATGCCTCCTTTCCTCCTCGCATTTC
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GTATTTCCATGGATTTCTTTATTCCTCCAGCTGAGATCAGAAAGGGATCAGCCGGTGGGGATCCCTCCGAGTTAACCAATGGGAAGTTTGGAAATCGAAAGGCTTGGCAAGACTCTCTTGGGAAATTGAAATAGCGATCTACTTATATAAATTTCTTTATGAAATTTGCATGAAGCTTTGTTTGGTGTAAAATACAGGCG
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ATTAACCAGCACTGTATTGTTTGAACTGGGCATTTATGGGCTGGTTTGGGTATAAGATTTAATTAGTTATCTCTGCTTTTTCAATGGCTCTCTACGAATTATCAACGTTTGATTCATCCAAGCCCGTTCCACGGAAAAAAGGTTGATCGGAGGAATAACTTCTCACCCCGTCCATGCAATGGACGGCTGGTAGGGGCGGT
CGGCTGTGGCCGTCCCTACCCCAGATCGAACCCATGACTTGTGCTCTTGAGGCTTTTAAGCCATGTGCTCGCGCCGGCTCATCTACCGA

>TRINITY_DN42356_c2_g2_i1 from sample A6 / Example unspliced isoform:

GGGCCCAGCATTGCTTGTCGAGGATCCGTGAGGCGAAAGCGAAAATGACAGCGTTCTCAAGATACGGCCCCTTCCTGCCGCCCGCGGTGGGCGGACCGAATAAGAAGCCTTTGGAAAAGCCGGAACGTGGCGAGAGATTACATGTAATGTAGCCAGCGATAGATGAATTATATGTAATGTAGCCACCTGAGCTCTTGTTC
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TAGCTACCAGTTAAAAAAAAAAATGGTATCATAGAGATCAACATTACTGCAGCTATGTTATGAGCACACAGTGGAAGACACTAGTTTACTCTTAAGAAGTTCTCTCTCCTTTTGTATTGGGCCAGAATACATACTTATAGTTATAATGCAAGTTTGTGACAAAATTGATACTGAAGACCAAAATAGATCTTCAGCTTATT
GCAGACTTGCCTAGAACAACATTCCTCAGATGATCAGAAGAGAATGGATAAAAAGATAGATTAATTCTCAAATGAGGACAGCTAAAAATACTGGCCAAACCCTCTGTCTCTGGCCATTCTATCTTACAACTGTAACAAGTTTAAGTAAGAGTACATGTACAAAACATTTGTAAATTTCTGTGTGAGACAAATGAAAAATT
TGAAGCAAAAACGATTAAATATAGGTTCTACATAACTGATACTTGTTTTCATTTAGGACTATTTGTTTTTCCACTGTCCAGACGCTTGAAAGGGTTGGAAATAGTGCTGGCGTAAAGATACATTGGATTCTGCTCCTTATCTAAGGAAGGCCGACTCCTTTTCTCGAATTTTGACAAATGTGCCCGTTTCGGTGTATGCA
ATTAACCAGCACTGTATTGTTTGAACTGGGCATTTATGGGCTGGTTTGGGTATAAGATTTAATTAGTTATCTCTGCTTTTTCAATGGCTCTCTACGAATTATCAACGTTTGATTCATCCAAGCCCGTTCCACGGAAAAAAGgtatgctagttatacctcttatgactcatttgggaaaggattcacgaagtggatggagc
gtcataggaaaaactgtaactaatcctggtatttagagttatgaagatatacaggcacatatcgtgttttctggcttgtgggtttagcatgtatttggcattgggtatattctgtgatgttcttcaaagtcaacaaaaaaatttggaattcatttattattctcatgaaaatttggaattcatttattattctcatgggc
tgcttgttttgtatttggagcttttcatataacgagtttgtatggtcatagaatatggaaaattacaaccaataattccggcgtggggcgttgcagGTTGATCGGAGGAATAACTTCTCACCCCGTCCATGCAATGGACGGCTGGTAGGGGCGGTCGGCTGTGGCCGTCCCTACCCCAGATCGAACCCATGACTTGTGCT
CTTGAGGCTTTTAAGCCATGTGCTCGCGCCGGCTCATCTACCGA