sp|P42739|UBIQP_ACEPE ----> Polyubiquitin (Fragment)


Intron 1 GTGAGTATGC ... GCCTTGACAG

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>TRINITY_DN41172_c0_g3_i1 from sample A7 / Example spliced isoform
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TTTTATGAAGCTAGTTTGAACTGAATCCAATCGTCATGGTGGGCATTTCTGTGGCATTGGCCGTGGAGCATCTGCCCACCGCCAGCGTCCCGTCAACAATTTCCCTGGCAGCAAAGAACCGATTCATCTTGATTCCCAATCTCGATTCCCGGTTAACAGTGAAGGCCAATATCAAGCAATTTGTCGAAGAATTCCTTTAC
ATTCCTTCCCATTTGCAGTCCCTCTCGGCTCCTCTGTTCACCAAGCTCAGCGAAAACGAGTCTGTGGAGGATCTGTATCGTAGATATGACTGTCATGCTGAGGCACATGATCCTGATCTCCATGTAGACGAAGATACCTATACATTCTGGGGTCGAGAGGCTGGCAAGAGCGTTGATTTACAGGATGGACTTACGCTGGA
AGATTATCATATCCTAGATAAAACCACCATATGTCTTAAGACACTTCCAGAACATTTGCCCAAGCAAGGTGGCCGTATATTTGTGGAGACCAAAGATGGGATTCTTCCTTTGGTAGGGGTTAGTCCTTTAACAAGGCTCTCAGAGATAAAACGAAAACTAGAGACTATGACAGGGATTCCTGCAGCTCAACAGCTCTTGT
CTTCTGTTGGTCGAGTTATGCATGATGACTTCCATATCAAAGACTTCAAAGGTTTTCATGCAATTTATGAGGGCAGTATTATTGATCTCTGTAAATCAGGGGATAGTAATCTGGACCAAGCCCATCGTCGGATGATTGTTTTCCTGAATGTTGAGGAACAAACCTTCACCCTTGTAGTACAGCCTTCTGATCTTGTTCAA
AGTATTATGAAGATGGTTGAATCCCGCACAGGAATCTCTCAGTGGCAGCAGCGTATCACATTTTCTGATTTATGTGCAAAAAAAATGAGATTCATCTTAACTTTATGGGCTTGGAGGCGACTGATGAAGCTAAAGAGAAGTCTTGAACCTTTATTTGCTGCCACCACGCTTATAGAATGAAGTTCTGAACTATGGGATGA
ACATGGAAGACATTGCAGGAGAAGAAAACCCTTGCCGAGTACTTCATCTACCCAGAGTGTACAATAGATGTGAATGTTTTCAAGAACCCACTCAAAACCCTTGCAAGATCCACTTGCAAGGCTCATCCAGAGGATGAACATTCAGGTAGAACAGATTATCTGGATGAATCTGCACCAAAGCCTGCTGCCAGAAAATTCAA
GCTGGTAAGGACACAGTCAGGGCATGTCACAGGTGTCCTTACTATCCCAGTTCTTACTACTGATAGAATATCTGACTTGAAGAGAAAAATCAAGAGATCTTTGCAGCCTTTGGTAGAAAGGAATATACTAACAGGAAGCAGTACTGCTAAGGAGCAGCAGGTTCAGAATGTTGTAGCCCCCAAAATATTTCCAGCAACAG
GGGGTGGTAAGTTTTCGATTGCCACTAATCCAGACCAACAAAGGCTTGAGAGAACTACTTCAGCCATTGAAAAGTTGCTAAAGCAAGTGTCCAGTTCAGGTTCTTTGAAAAGCCCTTCTTGTAAGAAGTCACCTCCTCAAACTCCCACTGCATACTTCACCCCTCCAGATGTGAAAGAGTATTTCTCCACCCCACCAACT
AAACTCGTACCACCCACACCAGCTTCTCCTAAAGTTTCTGATGCAGTAAAGTCCTCTTTTTTGGTTCGCAAACTATATTTTGGATCTCCAGCTGATACTGCTACATCTCAATCTCGTACTTCCGTTAAGAACCCATGCAGTCCACTTAGGCAGATTTTTCCTCCCACCAAACAATCAAGTGAAAATCAATCTGCTGCTCA
AGGCCATTTACAAAAAGGAACTGGATATCATGGATCAGCTAAATCAAATGGACATGACTCTGAAAATTACCCTAACCAGCCTATTGGAAGTGAGAAGAATTATTCCAATCAGCCTATTGGAAGCGAGAAGAATTATTCCAATCAGCCTGTTGGAAGTGATAAAAAAAGCATAGGTACTTGGTTTACAGAAAATATGCATA
GCCTAAAGGGACATATTCGAAGTCCTTTCACAGAAAAGTAGAGCACCTTTGACAAGCAATATTGCACTTCGCATTTAATTTGGCAACTGTGTCAGAAGAAGGTTTCATAATTTACTGTTTTCCAGTCCCTTTCACAGAGAGGTAGAGTGTATTTGAAAAGCAATATTGCAATATTGCAACTGTGTTAGAATAAAGTTTAA
TAATTTTGAAAAGCTATAAATCACTGTTCTGTGAAACAAAAATACAGCAGGCAATTGTTTCACATTTAGTGCCACAAATTTTTTGATATAAACATGTCAGGATTGGATGAGTTCTGTAACAGAGCATTGCCATTAATGTCTTTAGTTGGTGCACTGTAAAGCGTTTTCTACCTGCCAAGTAAATAATCAAAGGGAATTTC
AGTATTGTCATTTCTTCAAGTCAGCAAGAAGACATGTGCGTCCCTTATACAGCTGGCATATCACCATTGAGATACATGCCGTTGGAGTTACTTGGGCTATATAGTCCGTTAATTAGTAAAAGATAAACAGGTCTACTTATTTTCAATTGGTCTTGAGAAAGGGGATCATTTCAGATCTTCAGAAATGCAATGACAGCCTA
TTCTAATGAAAACTATTCTTTCCCTTTTCTGTCTTTATTATACTGGTTTTAGTCCCGTGTTATCTCTGCCTACTGATCTTAAGCTTGCATGCTTTAATTGGCTTTTCCTTCATATCAGTGCTCAATAAGACCTAGGTCCTAGCTGTTTGTTGTACAAAAGCAATTATAGTCAATTTGTTCATCTATTGTTCTGTATAAGA
AAAGACGCTATAATTGGAATTTCAAAGAAATGGTGTCAAGGAAGTTTAATAAGCCCTAGCTGTTTGTTGTACAAAAGCAATTATAGTCAATTTGTTCATCTATTGTTCTGTATAAGAAAAGACGCTATAATTGGAATTTCAAAGAAATGGTGTCAAGGAAGTTTAATAAGCCCTAGCTGTTTGTTGTACAAAAG


>TRINITY_DN41172_c0_g3_i2 from sample A7 / Example unspliced isoform:
AAAAATGTGACCGTTAAAGCACTCCGAGCTCGAACTTCATTGACGCCAACACACAATGCCATCCTTGATTTTCTTCTCGGTTTCTTGCTGCCTTGCCTCCGGCGCTTTTACCTTCTGTATGGGTCGCTGAATTGGTTCGGTCAATTCCAGTCAAAACACTCACCTGCGATTTCCGATCGTTTTCCGTTTAATCGCCATGG
TTTTATGAAGCTAGTTTGAACTGAATCCAATCGTCATGGTGGGCATTTCTGTGGCATTGGCCGTGGAGCATCTGCCCACCGCCAGCGTCCCGTCAACAATTTCCCTGGCAGCAAAGAACCGATTCATCTTGATTCCCAATCTCGATTCCCGGTTAACAGTGAAGGCCAATATCAAGCAATTTGTCGAAGAATTCCTTTAC
ATTCCTTCCCATTTGCAGTCCCTCTCGGCTCCTCTGTTCACCAAGCTCAGCGAAAACGAGTCTGTGGAGGATCTGTATCGTAGATATGACTGTCATGCTGAGGCACATGATCCTGATCTCCATGTAGACGAAGATACCTATACATTCTGGGGTCGAGAGGCTGGCAAGAGCGTTGATTTACAGGATGGACTTACGCTGGA
AGATTATCATATCCTAGATAAAACCACCATATGTCTTAAGACACTTCCAGAACATTTGCCCAAGCAAGGTGGCCGTATATTTGTGGAGACCAAAGATGGGATTCTTCCTTTGGTAGGGGTTAGTCCTTTAACAAGGCTCTCAGAGATAAAACGAAAACTAGAGACTATGACAGGGATTCCTGCAGCTCAACAGCTCTTGT
CTTCTGTTGGTCGAGTTATGCATGATGACTTCCATATCAAAGACTTCAAAGGTTTTCATGCAATTTATGAGGGCAGTATTATTGATCTCTGTAAATCAGGGGATAGTAATCTGGACCAAGCCCATCGTCGGATGATTGTTTTCCTGAATGTTGAGGAACAAACCTTCACCCTTGTAGTACAGCCTTCTGATCTTGTTCAA
AGTATTATGAAGATGGTTGAATCCCGCACAGGAATCTCTCAGTGGCAGCAGCGTATCACATTTTCTGgtgagtatgcagacatatgtagctttcctctttatctttaatcatccttttataaataactgtcaccattgcacatagaaaatgtactaaaaggctgcagcgaaaaatgctgattagaacatcacatgggaga
taatttcttggttatcttaggaaatttctggagtcacttctattaaaaactgttgcaagcccaccgatgaaaggtttcttttcatattgatttacagtgttttacaaagtaacatcacatgggagataatttcttgattatctttggaaatttctggagtcacttctattaaaactgttgcaagcccacagataaaaggt
tgccctttcatattgatttacagtgttttacaaagtccgttatttatatttaataagatgcttggttttgtcacttctattaaaactgttgcaagcccacagataaaaggttgcttttcatattgatttacagtgttttacaaagtctgttatttgtatttaataagatgcttggttttcctccaaattattttacaata
tttgctgagagaagccttataggtctgaaaaactctagaaatctttcataaaaccacaaccaatgtcttgccttgacag
ATTTATGTGCAAAAAAAATGAGATTCATCTTAACTTTATGGGCTTGGAGGCGACTGATGAAGCTAAAGAGAAGTCTTGAACCTTTATTTGCTGCCACCACGCTTATAGAATGAAGTTCTGA
ACTATGGGATGAACATGGAAGACATTGCAGGAGAAGAAAACCCTTGCCGAGTACTTCATCTACCCAGAGTGTACAATAGATGTGAATGTTTTCAAGAACCCACTCAAAACCCTTGCAAGATCCACTTGCAAGGCTCATCCAGAGGATGAACATTCAGGTAGAACAGATTATCTGGATGAATCTGCACCAAAGCCTGCTGC
CAGAAAATTCAAGCTGGTAAGGACACAGTCAGGGCATGTCACAGGTGTCCTTACTATCCCAGTTCTTACTACTGATAGAATATCTGACTTGAAGAGAAAAATCAAGAGATCTTTGCAGCCTTTGGTAGAAAGGAATATACTAACAGGAAGCAGTACTGCTAAGGAGCAGCAGGTTCAGAATGTTGTAGCCCCCAAAATAT
TTCCAGCAACAGGGGGTGGTAAGTTTTCGATTGCCACTAATCCAGACCAACAAAGGCTTGAGAGAACTACTTCAGCCATTGAAAAGTTGCTAAAGCAAGTGTCCAGTTCAGGTTCTTTGAAAAGCCCTTCTTGTAAGAAGTCACCTCCTCAAACTCCCACTGCATACTTCACCCCTCCAGATGTGAAAGAGTATTTCTCC
ACCCCACCAACTAAACTCGTACCACCCACACCAGCTTCTCCTAAAGTTTCTGATGCAGTAAAGTCCTCTTTTTTGGTTCGCAAACTATATTTTGGATCTCCAGCTGATACTGCTACATCTCAATCTCGTACTTCCGTTAAGAACCCATGCAGTCCACTTAGGCAGATTTTTCCTCCCACCAAACAATCAAGTGAAAATCA
ATCTGCTGCTCAAGGCCATTTACAAAAAGGAACTGGATATCATGGATCAGCTAAATCAAATGGACATGACTCTGAAAATTACCCTAACCAGCCTATTGGAAGTGAGAAGAATTATTCCAATCAGCCTATTGGAAGCGAGAAGAATTATTCCAATCAGCCTGTTGGAAGTGATAAAAAAAGCATAGGTACTTGGTTTACAG
AAAATATGCATAGCCTAAAGGGACATATTCGAAGTCCTTTCACAGAAAAGTAGAGCACCTTTGACAAGCAATATTGCACTTCGCATTTAATTTGGCAACTGTGTCAGAAGAAGGTTTCATAATTTACTGTTTTCCAGTCCCTTTCACAGAGAGGTAGAGTGTATTTGAAAAGCAATATTGCAATATTGCAACTGTGTTAG
AATAAAGTTTAATAATTTTGAAAAGCTATAAATCACTGTTCTGTGAAACAAAAATACAGCAGGCAATTGTTTCACATTTAGTGCCACAAATTTTTTGATATAAACATGTCAGGATTGGATGAGTTCTGTAACAGAGCATTGCCATTAATGTCTTTAGTTGGTGCACTGTAAAGCGTTTTCTACCTGCCAAGTAAATAATC
AAAGGGAATTTCAGTATTGTCATTTCTTCAAGTCAGCAAGAAGACATGTGCGTCCCTTATACAGCTGGCATATCACCATTGAGATACATGCCGTTGGAGTTACTTGGGCTATATAGTCCGTTAATTAGTAAAAGATAAACAGGTCTACTTATTTTCAATTGGTCTTGAGAAAGGGGATCATTTCAGATCTTCAGAAATGC
AATGACAGCCTATTCTAATGAAAACTATTCTTTCCCTTTTCTGTCTTTATTATACTGGTTTTAGTCCCGTGTTATCTCTGCCTACTGATCTTAAGCTTGCATGCTTTAATTGGCTTTTCCTTCATATCAGTGCTCAATAAGACCTAGGTCCTAGCTGTTTGTTGTACAAAAGCAATTATAGTCAATTTGTTCATCTATTG
TTCTGTATAAGAAAAGACGCTATAATTGGAATTTCAAAGAAATGGTGTCAAGGAAGTTTAATAAGCCCTAGCTGTTTGTTGTACAAAAGCAATTATAGTCAATTTGTTCATCTATTGTTCTGTATAAGAAAAGACGCTATAATTGGAATTTCAAAGAAATGGTGTCAAGGAAGTTTAATAAGCCCTAGCTGTTTGTTGTA
CAAAAG




Intron 2 GTGAGAATTC ... TCAATCACAG

SampleRetention score (%)Exon junction reads5'ss reads3'ss reads
A127.7499238
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A1034.53380178



>TRINITY_DN113115_c0_g1_i2 from sample A1 / Example spliced isoform
GTCTAACTAGTTACAACACTTAGATGTCAACTTGTTTTAAGGACTTTCATAAATACCAATATGACCGTTGCTAAAAATGTGACCGTTAAAGCACTCCGAGCTCGAACTTCATTGACGCCAACACACAATGCCATCCTTGATTTTCTTCTCGGTTTCTTGCTGCCTTGCCTCCGGCGCTTTTACCTTCTGTATGGGTCGCT
GAATTGGTTCGGTCAATTCCAGTCAAAACACTCACCTGCGATTTCCGATCGTTTTCCGTTTAATCGCCATGGTTTTATGAAGCTAGTTTGAACTGAATCCAATCGTCATGGTGGGCATTTCTGTGGCATTGGCCGTGGAGCATCTGCCCACCGCCAGCGTCCCGTCAACAATTTCCCTGGCAGCAAAGAACCGATTCATC
TTGATTCCCAATCTCGATTCCCGGTTAACAGTGAAGGCCAATATCAAGCAATTTGTCGAAGAATTCCTTTACATTCCTTCCCATTTGCAGTCCCTCTCGGCTCCTCTGTTCACCAAGCTCAGCGAAAACGAGTCTGTGGAGGATCTGTATCGTAGATATGACTGTCATGCTGAGGCACATGATCCTGATCTCCATGTAGA
CGAAGATACCTATACATTCTGGGGTCGAGAGGCTGGCAAGAGCGTTGATTTACAGGATGGACTTACGCTGGAAGATTATCATATCCTAGATAAAACCACCATATGTCTTAAGACACTTCCAGAACATTTGCCCAAGCAAGGTGGCCGTATATTTGTGGAGACCAAAGATGGGATTCTTCCTTTGGTAGGGGTTAGTCCTT
TAACAAGGCTCTCAGAGATAAAACGAAAACTAGAGACTATGACAGGGATTCCTGCAGCTCAACAGCTCTTGTCTTCTGTTGGTCGAGTTATGCATGATGACTTCCATATCAAAGACTTCAAAGGTTTTCATGCAATTTATGAGGGCAGTATTATTGATCTCTGTAAATCAGGGGATAGTAATCTGGACCAAGCCCATCGT
CGGATGATTGTTTTCCTGAATGTTGAGGAACAAACCTTCACCCTTGTAGTACAGCCTTCTGATCTTGTTCAAAGTATTATGAAGATGGTTGAATCCCGCACAGGAATCTCTCAGTGGCAGCAGCGTATCACATTTTCTGGGAAGACATTGCAGGAGAAGAAAACCCTTGCCGAGTACTTCATCTACCCAGAGTGTACAAT
AGATGTGAATGTTTTCAAGAACCCACTCAAAACCCTTGCAAGATCCACTTGCAAGGCTCATCCAGAGGATGAACATTCAGGTAGAACAGATTATCTGGATGAATCTGCACCAAAGCCTGCTGCCAGAAAATTCAAGCTGGTAAGGACACAGTCAGGGCATGTCACAGGTGTCCTTACTATCCCAGTTCTTACTACTGATA
GAATATCTGACTTGAAGAGAAAAATCAAGAGATCTTTGCAGCCTTTGGTAGAAAGGAATATACTAACAGGAAGCAGTACTGCTAAGGAGCATCAGGTTCAGAATGTTGTAGCCCCCAAAATATTTCCAGCAACAGGGGGTGGTAAGTTTTCGATTGCCACTAATCCAGACCAACAAAGGCTTGAGAGAACTACTTCAGCC
ATTGAAAAGTTGCTAAAGCAAGTGTCCAGTTCAGGTTCTTTGAAAAGCCCTTCTTGTAAGAAGTCACCTCCTCAAACTCCCACTGCATACTTCACCCCTCCAGATGTGAAAGAGTATTTCTCCACCCCACCAACTAAACTCGTACCACCCACACCAGCTTCTCCTAAAGTTTCTGATGCAGTAAAGTCCTCTTTTTTGGT
TCGCAAACTATATTTTGGATCTCCAGCTGATACTGCTACATCTCAATCTCGTACTTCCGTTAAGAACCCATGCAGTCCACTTAGGCAGATTTTTCCTCCGACCAAACAATCAAGTGAAAATCAATCTGCTGCTCAAGGCCATTTACAAAAAGGAACTGGATATCATGGATCAGCTAAATCAAATGGACATGACTCTGAAA
ATTACCCTAACCAGCCTATTGGAAGTGAGAAGAATTATTCCAATCAGCCTATTGGAAGCGAGAAGAATTATTCCAATCAGCCTGTTGGAAGTGATAAAAAAAGCATAGGTACTTGGTTTACAGAAAATATGCATAGCCTAAAGGGACATATTCGAAGTCCTTTCACAGAAAAGTAGAGCACCTTTGACAAGCAATATTGC
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TTAGTGCCACAAATTTTTTGATATAAACATGTCAGGATTGGATGAGTTCTGTAACAGAGCATTGCCATTAATGTCTTTAGTTGGTGCACTGTAAAGCGTTTTCTACCTGCCAAGTAAATAATCAAAGGGAATTTCAGTATTGTCATTTCTTCAAGTCAGCAAGAAGACATGTGCGTCCCTTATACAGCTGGCATATCACC
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>TRINITY_DN113115_c0_g1_i1 from sample A1 / Example unspliced isoform:
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agcatgtaggctcttagggtaactataagatttgaacttctgcaggctactagtatatttgaccactatttttttctcttacctactcaatcacag
GGGATAGTAATCTGGACCAAGCCCATCGTCGGATGATTGTTTTCCTGAATGTTGAGGAACAAACCTTCACCCTTGTAGTACAGCCTTCTGATCTTGTTCAAAGT
ATTATGAAGATGGTTGAATCCCGCACAGGAATCTCTCAGTGGCAGCAGCGTATCACATTTTCTGGGAAGACATTGCAGGAGAAGAAAACCCTTGCCGAGTACTTCATCTACCCAGAGTGTACAATAGATGTGAATGTTTTCAAGAACCCACTCAAAACCCTTGCAAGATCCACTTGCAAGGCTCATCCAGAGGATGAACA
TTCAGGTAGAACAGATTATCTGGATGAATCTGCACCAAAGCCTGCTGCCAGAAAATTCAAGCTGGTAAGGACACAGTCAGGGCATGTCACAGGTGTCCTTACTATCCCAGTTCTTACTACTGATAGAATATCTGACTTGAAGAGAAAAATCAAGAGATCTTTGCAGCCTTTGGTAGAAAGGAATATACTAACAGGAAGCA
GTACTGCTAAGGAGCATCAGGTTCAGAATGTTGTAGCCCCCAAAATATTTCCAGCAACAGGGGGTGGTAAGTTTTCGATTGCCACTAATCCAGACCAACAAAGGCTTGAGAGAACTACTTCAGCCATTGAAAAGTTGCTAAAGCAAGTGTCCAGTTCAGGTTCTTTGAAAAGCCCTTCTTGTAAGAAGTCACCTCCTCAA
ACTCCCACTGCATACTTCACCCCTCCAGATGTGAAAGAGTATTTCTCCACCCCACCAACTAAACTCGTACCACCCACACCAGCTTCTCCTAAAGTTTCTGATGCAGTAAAGTCCTCTTTTTTGGTTCGCAAACTATATTTTGGATCTCCAGCTGATACTGCTACATCTCAATCTCGTACTTCCGTTAAGAACCCATGCAG
TCCACTTAGGCAGATTTTTCCTCCGACCAAACAATCAAGTGAAAATCAATCTGCTGCTCAAGGCCATTTACAAAAAGGAACTGGATATCATGGATCAGCTAAATCAAATGGACATGACTCTGAAAATTACCCTAACCAGCCTATTGGAAGTGAGAAGAATTATTCCAATCAGCCTATTGGAAGCGAGAAGAATTATTCCA
ATCAGCCTGTTGGAAGTGATAAAAAAAGCATAGGTACTTGGTTTACAGAAAATATGCATAGCCTAAAGGGACATATTCGAAGTCCTTTCACAGAAAAGTAGAGCACCTTTGACAAGCAATATTGCACTTCGCATTTAATTTGGCAACTGTGTCAGAAGAAGGTTTCATAATTTACTGTTTTCCAGTCCCTTTCACAGAGA
GGTAGAGTGTATTTGAAAAGCAATATTGCAATATTGCAACTGTGTTAGAATAAAGTTTAATAATTTTGAAAAGCTATAAATCACTGTTCTGTGAAACAAAAATACAGCAGGCAATTGTTTCACATTTAGTGCCACAAATTTTTTGATATAAACATGTCAGGATTGGATGAGTTCTGTAACAGAGCATTGCCATTAATGTC
TTTAGTTGGTGCACTGTAAAGCGTTTTCTACCTGCCAAGTAAATAATCAAAGGGAATTTCAGTATTGTCATTTCTTCAAGTCAGCAAGAAGACATGTGCGTCCCTTATACAGCTGGCATATCACCATTGAGATACATGCCATTGGAGTTACTTGGGCTATATAGTCCGTTAATTAGTAAAAGATAAACAGGTCTACTTAT
TTTCAATTGGTCTTGAGAAAGGGGATCATTTCAAATCTTCAGAAATGCAATGACAGCCTATTCTAATGAAAACTATTCTTTCC