NA ----> NA
Intron 1 GTGTGGCCCT ... TTGATTCAAG
| Sample | Retention score (%) | Exon junction reads | 5'ss reads | 3'ss reads |
| A1 | -1 | 0 | 0 | 0 |
| A2 | -1 | 0 | 0 | 0 |
| A3 | -1 | 0 | 0 | 0 |
| A4 | -1 | 0 | 0 | 0 |
| A5 | -1 | 0 | 0 | 0 |
| A6 | 25 | 9 | 5 | 1 |
| A7 | 21.43 | 22 | 10 | 2 |
| A8 | 36.23 | 22 | 15 | 10 |
| A9 | 19.23 | 21 | 6 | 4 |
| A10 | 45.45 | 6 | 6 | 4 |
>TRINITY_DN41118_c1_g4_i3 from sample A8 / Example spliced isoformTCCCCACACTGATCCGCTGCTCATCCGCTCAGCTCCACTCCCCCACGCGGCATCCCAAAATACGGCTACCCTCCGCCCTTTTAAATTCACACCACGGCATGCCCAATATAGGGCGTAGTGGAAATCACAGCTCTGGAATTCGTCTCTGAGTTACCTTTCTTTTTGGTTTGCAAGCAATTTTCTCTTATTAAACGCTCTCC
AATTCGCCGCGGATCGCAGCTTAACAAGGTGTTGTCCTTGGGGTTTGCTGTAGTTTAGGGTTTTCGTTTCAATATCTTTTTCTCCTCGGCAAATTCTCTGGTAATGACCATTCCGAAGATGATAGCAATAACTGATATGCAATGGATGGAAATAGCCCCTGGGCGCAAGGTATGTATGGGAAGACGACGGCCTTTGGAGA
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GAAAAGTGTCGGGCGCTTTCTCTTGGAACTGGAGAGATAAAACTAATTACCAGGCTATGGAGGCTGCAAAATGGGGCTTATGGGGATGGTTAACCAAGGGTGGTAAATGTGCATTAATTGACATCTTATTGCAATTGAGTTCAGCTATGGTCGACATTCAGGCAGCAGCCTTGTTCAATAATCCAATTAACTTATGTACT
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GATTTTTGACAGATTTACTGATTTTTTTTAAAGAGCATGG
>TRINITY_DN41118_c1_g4_i1 from sample A8 / Example unspliced isoform:TCCCCACACTGATCCGCTGCTCATCCGCTCAGCTCCACTCCCCCACGCGGCATCCCAAAATACGGCTACCCTCCGCCCTTTTAAATTCACACCACGGCATGCCCAATATAGGGCGTAGTGGAAATCACAGCTCTGGAATTCGTCTCTGAGTTACCTTTCTTTTTGGTTTGCAAGCAATTTTCTCTTATTAAACGCTCTCC
AATTCGCCGCGGATCGCAGCTTAACAAGGTGTTGTCCTTGGGGTTTGCTGTAGTTTAGGGTTTTCGTTTCAATATCTTTTTCTCCTCGGCAAATTCTCTGGTAATGACCATTCCGAAGATGATAGCAATAACTGATATGCAATGGATGGAAATAGCCCCTGGGCGCAAGGTATGTATGGGAAGACGACGGCCTTTGGAGA
AACCTCTGCGGCCAATCGCGGAAGAGCACAGTCTCAGTAATGGCGAACTCATGGCCCTACTTTTCCTGCGGTTAGCGGCTTCAAAGCAGAGGGCAATAATGAAAGATTTGCATCGGCTGAGTGAACTGGCGTGTTGATATCAATCTATGGAGCCCGATACTGTAGgtgtggccctgatcttcattgtataccctaattta
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attgtatcctgggcaaaatttaaaatttaaaccatagggactgcatcttggactccatagccacccagtacttaggcacttaatatattgatgtttatgctgcctgcctaacattggatacatagccttattcaaaatcttttttgattgcatcccaataaattatggctaatggtacagaaatcattattgtctttata
tttgatttcttctaagcatatcgtagtagtatttttttatatggtaatagtaatttttgatttttttttttttaaatttttggatataacttctgcatctgtttgattcaagCATTGGAGGCTCTGGATTCAAAAGAGCAGGTGTTGGAAAAGTGTCGGGCGCTTTCTCTTGGAACTGGAGAGATAAAACTAATTACCAG
GCTATGGAGGCTGCAAAATGGGGCTTATGGGGATGGTTAACCAAGGGTGGTAAATGTGCATTAATTGACATCTTATTGCAATTGAGTTCAGCTATGGTCGACATTCAGGCAGCAGCCTTGTTCAATAATCCAATTAACTTATGTACTATTGAATCCATAGATCGCTTTATGTTTTTTGTTTACTGCGCTTTATGTTTTCT
GTTTACAATGGCTCTTTACTATGGACATGAAACATTGAAAAAGCCGGGAATGGGAATGTAATTTCATTCTCCCCAAGTTTGAAGGTTTCAGGCTTGAGCTACTAGGTAATTTTTTTAACCATGGATTATGGATTATGAGTTTGAGTTGATTTTTGACAGATTTACTGATTTTTTTTAAAGAGCATGG