sp|Q43314|DHE1_ARATH ----> Glutamate dehydrogenase 1
Intron 1 GTAAGTATAT ... TGATGGGTAG
| Sample | Retention score (%) | Exon junction reads | 5'ss reads | 3'ss reads |
| A1 | 19.86 | 117 | 5 | 29 |
| A2 | 19.88 | 137 | 2 | 34 |
| A3 | 18.18 | 135 | 1 | 30 |
| A4 | 17.69 | 107 | 0 | 23 |
| A5 | 19.05 | 68 | 0 | 16 |
| A6 | 23.97 | 314 | 1 | 99 |
| A7 | 24.81 | 503 | 1 | 166 |
| A8 | 22.39 | 260 | 0 | 75 |
| A9 | 24.76 | 465 | 2 | 153 |
| A10 | 25.94 | 354 | 4 | 124 |
>TRINITY_DN115255_c0_g2_i1 from sample A1 / Example spliced isoformTCAAGCGACCTGATAATGCCCGAGCCTATTCGTATGCACGCTTATCCCGAATTTATAGCTTTAGCTTTGGAACAAAATAAGAATCCGTGGTTCAACTATAAAATGACAGGGCCCGGGCCCTTCGTTTCATCCATTTTCTTTCTCGCTTGTCATTGACCAGCTGAGATCTCACTGAGAATCCAGCTTCGTAACTATTTTCA
ATTTGGGTGCTCGCCCTTATATTGATTTGCCCACCATGAATGCTCTGGCTGCAACAAATCGTAATTTCAAGCAAGCAGCTCGACTTCTGGGGCTGGATTCCAAGCTTGAACGAAGTTTGCTCATTCCTTTTCGAGAGATCAAGGTTGAGTGCACCATTCCTAAAGATGATGGAACTTTAGCCTCATATGTAGGCTTTAGG
GTGCAACATGACAATGCTCGAGGACCCATGAAGGGAGGAATACGCTACCATCCAGAGGTTGATCCAGACGAGGTAAATGCCTTAGCACAACTAATGACATGGAAGTCTGCAGTAGCTAACATACCCTATGGAGGAGCAAAGGGTGGTATTGGTTGCGACCCGGGGAGTTTAAGTATCAGTGAGTTAGAGAGGCTTACTCG
TGTCTTTACTCAGAAGATCCATGACTTGATTGGAATCCACATAGATGTTCCAGCACCTGACATGGGAACTAATTCACAGACCATGGCGTGGATATTAGATGAATACTCAAAATTTCATGGATACTCACCTGCAATTGTTACTGGAAAACCTATTGATCTAGGTGGATCCCTTGGCAGGGATGCTGCAACTGGTAGAGGTG
TTATGTATGCAACAGAAGCCTTGTTGGCTGAGTATGGGAAAAGCATCTCAGATCAACGTTTTGTAATCCAGGGTTTTGGAAACGTTGGTTCCTGGGCAGCTGAACTTATCCATGAAAAGGGTGGAAAGATTATAGCAGTAAGTGATATTTCAGGAGCTATAAAGAACAGCAATGGCCTTGACCTTCCATCTTTAATGAAG
CACACAAAGACAAATGGTGTTGTTAAAGGTTTTGAAGGAGCAGATTCAGTTGATCCCAAAACTCTATTACTTGAAGATTGTGACGTGCTCATCCCTGCTGCTTTAGGTGGCGTTCTTAGTAGGGAGAATGCTAATGAAGTAAAGGCCAAATTCATAATAGAGGCAGCCAATCATCCTACAGATCCAGAAGCTGATGAGAT
TCTACACAAGAAGGGTGTTATAGTACTACCAGACATATATGCAAATTCGGGTGGTGTGACTGTCAGCTATTTTGAGTGGGTTCAGAATATCCAAGGTTTTATGTGGGATGAGGAGAAGGTGAACACCGAGCTGAAAAAGTATATGACAAGCTCTTTTCAACATCTAAAAGAAATGTGTAAGACTCATGATTGTGATCTCC
GAATGGGAGCTTTTACACTTGGAGTCAATCGTGTTGCTCGTGCCACTCTCCTAAGAGGTTGGGAAGCTTAAAATAGAGCCAGTGACAAACATCAAATTCCTTTCTTCATGTTTCACAGTTTCAATAATTCAATCTGCTTCGTGTCAACCACATTGTATTTCATTTTGGCCAGATATTATCTGGAATATCATATTGTTGCT
TAGCAAAATTATCAGTCTTTATGATATGATATTCACTGGTACCGGTTTACAATTCGAGGATCCATTTTTTTTATAGTTAGCTAACACATTTTGGGGGGCCTAAAATAACATCCTCTATTGTTATGGGCTCGAGTTGGCTGATTTCTCAGGATCCTTTTACTTTTGAAGAAATAACTGCATGTTTTGATCCCCACAAAAGA
AGTTATTGCTTAACAATTTTACCATACCAATTGGAACATTAGAATCATAAAAACAAATATCAGACTCCAATTTGTTTGCAAGG
>TRINITY_DN115255_c0_g2_i2 from sample A1 / Example unspliced isoform:GCTCGATATCCACTATGCTTACACAGTTGATGTGAACAGACCATGGCGTGGATATTAGATGAATACTCAAAATTTCATGGATACTCACCTGCAATTGTTACTGGAAAACCTATTgtaagtatataaaactttattccaaaatacctcaccaacctcttgtcatcttgagtatgttatgatttacataactttttcatgtt
agaaagattcttttgtgatgggtagGATCTAGGTGGATCCCTTGGCAGGGATGCTGCAACTGGTAGAGGTGTTATGTATGCAACAGAAGCCTTGTTGGCTGAGTATGGGAAAAGCATCTCAGATCAACGTTTTGTAATCCAGGGTTTTGGAAACGTTGGTTCCTGGGCAGCTGAACTTATCCATGAAAAGGGTGGAAAGA
TTATAGCAGTAAGTGATATTTCAGGAGCTATAAAGAACAGCAATGGCCTTGACCTTCCATCTTTAATGAAGCACACAAAGACAAATGGTGTTGTTAAAGGTTTTGAAGGAGCAGATTCAGTTGATCCCAAAACTCTATTACTTGAAGATTGTGACGTGCTCATCCCTGCTGCTTTAGGTGGCGTTCTTAGTAGGGAGAAT
GCTAATGAAGTAAAGGCCAAATTCATAATAGAGGCAGCCAATCATCCTACAGATCCAGAAGCTGATGAGATTCTACACAAGAAGGGTGTTATAGTACTACCAGACATATATGCAAATTCGGGTGGTGTGACTGTCAGCTATTTTGAGTGGGTTCAGAATATCCAAGGTTTTATGTGGGATGAGGAGAAGGTGAACACCGA
GCTGAAAAAGTATATGACAAGCTCTTTTCAACATCTAAAAGAAATGTGTAAGACTCATGATTGTGATCTCCGAATGGGAGCTTTTACACTTGGAGTCAATCGTGTTGCTCGTGCCACTCTCCTAAGAGGTTGGGAAGCTTAAAATAGAGCCAGTGACAAACATCAAATTCCTTTCTTCATGTTTCACAGTTTCAATAATT
CAATCTGCTTCGTGTCAACCACATTGTATTTCATTTTGGCCAGATATTATCTGGAATATCATATTGTTGCTTAGCAAAATTATCAGTCTTTATGATATGATATTCACTGGTACCGGTTTACAATTCGAGGATCCATTTTTTTTATAGTTAGCTAACACATTTTGGGGGGCCTAAAATAACATCCTCTATTGTTATGGGCT
CGAGTTGGCTGATTTCTCAGGATCCTTTTACTTTTGAAGAAATAACTGCATGTTTTGATCCCCACAAAAGAAGTTATTGCTTAACAATTTTACCATACCAATTGGAACATTAGAATCATAAAAACAAATATCAGACTCCAATTTGTTTGCAAGG
Intron 2 GTCTTTTCTA ... ATGTGAACAG
| Sample | Retention score (%) | Exon junction reads | 5'ss reads | 3'ss reads |
| A1 | 31.34 | 252 | 115 | 4 |
| A2 | 30.65 | 301 | 133 | 0 |
| A3 | 30.63 | 351 | 155 | 1 |
| A4 | 28.86 | 244 | 99 | 1 |
| A5 | 34.21 | 150 | 78 | 1 |
| A6 | 32.28 | 640 | 305 | 0 |
| A7 | 33.09 | 1005 | 497 | 0 |
| A8 | 33.09 | 455 | 225 | 0 |
| A9 | 33.82 | 908 | 464 | 2 |
| A10 | 35.98 | 845 | 475 | 4 |
>TRINITY_DN41512_c0_g1_i1 from sample A10 / Example spliced isoformCAATTGCCTAAGCACATCCACGCTCTTTTTATTTCATTAATTATATTCATAATTTGTTCCTGACCCCTCTGTCCTTCCAAGCGACCTGATAATGCCCGAGCCTATTCGTATGCACGCTTATCCCGAATTTATAGCTTTAGCTTTGGAACAAAATAAGAATCCGTGGTTCAACTATAAAATGACAGGGCCCGGGCCCTTCG
TTTCATCCATTTTCTTTCTCGCTTGTCATTGACCAGCTGAGATCTCACTGAGAATCCAGCTTCGTAACTATTTTCAATTTGGGTGCTCGCCCTTATATTGATTTGCCCACCATGAATGCTCTGGCTGCAACAAATCGTAATTTCAAGCAAGCAGCTCGACTTCTGGGGCTGGATTCCAAGCTTGAACGAAGTTTGCTCAT
TCCTTTTCGAGAGATCAAGGTTGAGTGCACCATTCCTAAAGATGATGGAACTTTAGCCTCATATGTAGGCTTTAGGGTGCAACATGACAATGCTCGAGGACCCATGAAGGGAGGAATACGCTACCATCCAGAGGTTGATCCAGACGAGGTAAATGCCTTAGCACAACTAATGACATGGAAGTCTGCAGTAGCTAACATAC
CCTATGGAGGAGCAAAGGGTGGTATTGGTTGCGACCCGGGGAGTTTAAGTATCAGTGAGTTAGAGAGGCTTACTCGTGTCTTTACTCAGAAGATCCATGACTTGATTGGAATCCACATAGATGTTCCAGCACCTGACATGGGAACTAATTCACAGACCATGGCGTGGATATTAGATGAATACTCAAAATTTCATGGATAC
TCACCTGCAATTGTTACTGGAAAACCTATTGATCTAGGTGGATCCCTTGGCAGGGATGCTGCAACTGGTAGAGGTGTTATGTATGCAACAGAAGCCTTGTTGGCTGAGTATGGGAAAAGCATCTCAGATCAACGTTTTGTAATCCAGGGTTTTGGAAACGTTGGTTCCTGGGCAGCTGAACTTATCCATGAAAAGGGTGG
AAAGATTATAGCAGTAAGTGATATTTCAGGAGCTATAAAGAACAGCAATGGCCTTGACCTTCCATCTTTAATGAAGCACACAAAGACAAATGGTGTTGTTAAAGGTTTTGAAGGAGCAGATTCAGTTGATCCCAAAACTCTATTACTTGAAGATTGTGACGTGCTCATCCCTGCTGCTTTAGGTGGCGTTCTTAGTAGGG
AGAATGCTAATGAAGTAAAGGCCAAATTCATAATAGAGGCAGCCAATCATCCTACAGATCCAGAAGCTGATGAGATTCTACACAAGAAGGGTGTTATAGTACTACCAGACATATATGCAAATTCGGGTGGTGTGACTGTCAGCTATTTTGAGTGGGTTCAGAATATCCAAGGTTTTATGTGGGATGAGGAGAAGGTGAAC
ACCGAGCTGAAAAAGTATATGACAAGCTCTTTTCAACATCTAAAAGAAATGTGTAAGACTCATGATTGTGATCTCCGAATGGGAGCTTTTACACTTGGAGTCAATCGTGTTGCTCGTGCCACTCTCCTAAGAGGTTGGGAAGCTTAAAATAGAGCCAGTGACAAACATCAAATTCCTTTCTTCATGTTTCACAGTTTCAA
TAATTCAATCTGCTTCGTGTCAACCACATTGTATTTCATTTTGGCCAGATATTATCTGGAATATCATATTGTTGCTTAGCAAAATTATCAGTCTTTATGATATGATATTCACTGGTACCGGTTTACAATTCGAGGATCCATTTTTTTTATAGTTAGCTAACACATTTTGGGGGGCCTAAAATAACATCCTCTATTGTTAT
GGGCTCGAGTTGGCTGATTTCTCAGGATCCTTTTACTTTTGAAGAAATAACTGCATGTTTTGATCCCCACAAAAGAAGTTATTGCTTAACAATTTTACCATACCAATTGGAACATTAGAATCATAAAAACAAATATCAGACTCCAATTTGTTTGCAAGGATCTCACTGGCGAGGCATGCTTTATCTCTATCTTGAATTTG
TGCTGTCTTCAGTTCCTTTTTAAGGATTCAATTACTTTTTGATGATTTATGCCCCCCTTAATCTTTACTGGATGTTTGTCTGTCTTTTGATGGATTGACCCTTCTCTTGTGTGGATGGGGTGGACATAGCCATATTTATAAAATTTTAATCCTATTTTGAAA
>TRINITY_DN41512_c0_g1_i2 from sample A10 / Example unspliced isoform:CAATTGCCTAAGCACATCCACGCTCTTTTTATTTCATTAATTATATTCATAATTTGTTCCTGACCCCTCTGTCCTTCCAAGCGACCTGATAATGCCCGAGCCTATTCGTATGCACGCTTATCCCGAATTTATAGCTTTAGCTTTGGAACAAAATAAGAATCCGTGGTTCAACTATAAAATGACAGGGCCCGGGCCCTTCG
TTTCATCCATTTTCTTTCTCGCTTGTCATTGACCAGCTGAGATCTCACTGAGAATCCAGCTTCGTAACTATTTTCAATTTGGGTGCTCGCCCTTATATTGATTTGCCCACCATGAATGCTCTGGCTGCAACAAATCGTAATTTCAAGCAAGCAGCTCGACTTCTGGGGCTGGATTCCAAGCTTGAACGAAGTTTGCTCAT
TCCTTTTCGAGAGATCAAGGTTGAGTGCACCATTCCTAAAGATGATGGAACTTTAGCCTCATATGTAGGCTTTAGGGTGCAACATGACAATGCTCGAGGACCCATGAAGGGAGGAATACGCTACCATCCAGAGGTTGATCCAGACGAGGTAAATGCCTTAGCACAACTAATGACATGGAAGTCTGCAGTAGCTAACATAC
CCTATGGAGGAGCAAAGGGTGGTATTGGTTGCGACCCGGGGAGTTTAAGTATCAGTGAGTTAGAGAGGCTTACTCGTGTCTTTACTCAGAAGATCCATGACTTGATTGGAATCCACATAGATGTTCCAGCACCTGACATGGGAACTAATTCACAGgtcttttctatattttctatgcaaagagttagttttattagcttt
gagattctctagttatttttgctcgatatccactatgcttacacagttgatgtgaacagACCATGGCGTGGATATTAGATGAATACTCAAAATTTCATGGATACTCACCTGCAATTGTTACTGGAAAACCTATTGTAAGTATATAAAACTTTATTCCAAAATACCTCACC