sp|Q5MAU8|PPA27_ARATH ----> Probable inactive purple acid phosphatase 27
Intron 1 GTTAGAAAAG ... TATGTGACAG
| Sample | Retention score (%) | Exon junction reads | 5'ss reads | 3'ss reads |
| A1 | 25 | 3 | 0 | 2 |
| A2 | 53.33 | 7 | 5 | 11 |
| A3 | 29.41 | 6 | 4 | 1 |
| A4 | 28.57 | 5 | 2 | 2 |
| A5 | 0 | 1 | 0 | 0 |
| A6 | 33.33 | 7 | 4 | 3 |
| A7 | 33.33 | 12 | 7 | 5 |
| A8 | 20 | 20 | 3 | 7 |
| A9 | 20 | 12 | 4 | 2 |
| A10 | 25.58 | 16 | 6 | 5 |
>TRINITY_DN35363_c0_g1_i3 from sample A8 / Example spliced isoformTGTATGTTGAGACTGGAGATGTTGCTAGTCTTCCACTTTTATGTCAATATCCTCTGAAGTTCCAATTTTTGTTAGCCGATCCTGACTACTTGACCTGCAAGAAGAAACAGTGCCAGAGGTCCATAGGAAGATGGTGCATGTGGTCGACCTGTAGTGGAACTATATCTGCACGTGTTGTAAATATCAGAACCGATATCAGG
GTCATGTTTTTCGGTGGTGGTTTAGACTTTCCCTGCATCCTTGCAAACTCAGAATTATTAAAGTTTGCAAATCCAAGGGCACCACTATATGGTCATCTTTCAAGCGTGGATTCTTCATCTACTGTGATGAGGTTGACTTGGATCAGTGGTGACAGCAAGCCTCAATATGTACACTATGGAGATGGAAAGATGGCATTGTC
GACTGTGGCAACGTTTACTCCAAATGATTTGTGTGGTTCATTTGTCAATCCAGCAGTCAATTTTGGCTGGCACAATCCAGGGTTCATCCATACTGCATTGTTGGATGGTCTTTTGCCTTCAAAATCCTATGTATACAAATATGGCAGTGATGAAGTGGGATGGAGTATGACAACCAATTTTTCTACACCTCCAGCCGTTG
GTTCAAATGAGCTAACATTTATTACATATGGGGACATGGGCAAAGCAGAGCGTGATGGTTTTGGTGAGCATTACATTCAGGGATTTCCCAAATTCAGGATCATACTATGAGGGCCCAGACTCTGGTGGGGAGTGTGGAGTGCCATATGAAATGTATTTCCAAATGCCAGCGAATGGCAAGGATAAGCCTTGGTATTCCAT
TGAGCATGGGCCAGTTCACTTTACAATCATGTCAACAGAACACCCATGGGATATTGGCAGTGATCAGTTTAAATGGATGAAAGCTGATCTTGCTTCTGTGGATCGAAAGCGTACCCCATGGCTCATTTTTGCTGGTCATAGGCCACAATATTCCTCTCTTGAAGGGGGCTTCATTTTTAGTACAATAATTCCTGCTGTGG
ACATCCACTTTCGCTCAGTGATTGAACCCCTTCTCCTATTTCATCAGGTGGACCTTGCATTGTGGGGTCACGTACACAATTATGAGCGTACTTGTGCTGTGAATAACAGCCAGTGCTTGAATTATCCAACGAGGGACCATGGAGGGATTGATAATTACAGGAGTTCCATGTACTCTGCCCCAGTGCATGTCATCATTGGA
ATGTCTGGATTTGAGCTTGACTCTTTCATCACAATGGCTAAGAGCTGGAGTTTAGTACGGATATCAGAATTTGGGTATGTTAGAGTACATGCTACTACTGGAAAAATTATTGTACAGTTCAAGCTAACAGATGGGACGATAGCAGATCAATTTTCACTTAGCAGATTTTGATACAGGGAGTATGTGGATCTGATAACTAA
AATAATTGTTGTCTTCTAGAAGTTCTTTGATAAGATCTAGGGATCTAGTTGATAACTGTGCCTTAATTTGGTTTGCATTCCGAATCCTGGTCTTGTATTCTCAACTTTTGTATGCTTCATGCTTTTGTTGAATAATGTGCTCTTGATTCAACATAGGTTCAATGTTACTAATCAGCCCCTGTACACCAGGAAGGATGCTA
CTAAGTTCTGTTACTGATTCTATTGGCAGAGATTATGGTAATTCTGCAATAGAAGACAGATGTTTAGTAGTTAGGAATAATTCCATAGGAATTCACCAATTACAAATTTTCTTCTACACTTAAATTTTTCCATTGGATCATGCTGCATTCCAAAACTTAAGGTTAATATCTTGTGGATTACGATTAGGATTGTATCTCAA
TTAAGTGAAAGTTTTAGAGCACTTTTATAACGGAAACAAGTAAAAAATTGAGTGTTTTCTTGCTAAACACTTGAGATAAGGTTGACATAACAATGCTATCATAGAGTGAGTGCTTAAGGATATTTGGTTTCTTATTATAAACAGGAAGCAAGGATATTATATGATTTATTGCAAG
>TRINITY_DN35363_c0_g1_i1 from sample A8 / Example unspliced isoform:ATACTATGAGGGCCCAGACTCTGGTGGGGAGTGTGGAGTGCCATATGAAATGTATTTCCAAATGCCAGCGAATGGCAAGGATAAGCCTTGGTATTCCATTGAGCATGGGCCAGTTCACTTTACAATCATGTCAACAGAACACCCATGGGATATTGGCAGTGATCAGTTTAAATGGATGAAAGCTGATCTTGCTTCTGTGG
ATCGAAAGCGTACCCCATGGCTCATTTTTGCTGGgttagaaaagctttgatatataacatagcagttgaaaatgtgctgtttgatatgtgacagTCATAGGCCACAATATTCCTCTCTTGAAGGGGGCTTCATTTTTAGTACAATAATTCCTGCTGTGGACATCCACTTTCGCTCAGTGATTGAACCCCTTCTCCTATTT
CATCAGGTGGACCTTGCATTGTGGGGTCACGTACACAATTATGAGCGTACTTGTGCTGTGAATAACAGCCAGTGCTTGAATTATCCAACGAGGGACCATGGAGGGATTGATAATTACAGGAGTTCCATGTACTCTGCCCCAGTGCATGTCATCATTGGAATGTCTGGATTTGAGCTTGACTCTTTCATCACAATGGCTAA
GAGCTGGAGTTTAGTACGGATATCAGAATTTGGGTATGTTAGAGTACATGCTACTACTGGAAAAATTATTGTACAGTTCAAGCTAACAGATGGGACGATAGCAGATCAATTTTCACTTAGCAGATTTTGATACAGGGAGTATGTGGATCTGATAACTAAAATAATTGTTGTCTTCTAGAAGTTCTTTGATAAGATCTAGG
GATCTAGTTGATAACTGTGCCTTAATTTGGTTTGCATTCCGAATCCTGGTCTTGTATTCTCAACTTTTGTATGCTTCATGCTTTTGTTGAATAATGTGCTCTTGATTCAACATAGGTTCAATGTTACTAATCAGCCCCTGTACACCAGGAAGGATGCTACTAAGTTCTGTTACTGATTCTATTGGCAGAGATTATGGTAA
TTCTGCAATAGAAGACAGATGTTTAGTAGTTAGGAATAATTCCATAGGAATTCACCAATTACAAATTTTCTTCTACACTTAAATTTTTCCATTGGATCATGCTGCATTCCAAAACTTAAGGTTAATATCTTGTGGATTACGATTAGGATTGTATCTCAATTAAGTGAAAGTTTTAGAGCACTTTTATAACGGAAACAAGT
AAAAAATTGAGTGTTTTCTTGCTAAACACTTGAGATAAGGTTGACATAACAATGCTATCATAGAGTGAGTGCTTAAGGATATTTGGTTTCTTATTATAAACAGGAAGCAAGGATATTATATGATTTATTGCAAG
Intron 2 GTACGCATTT ... CATTATGCAG
| Sample | Retention score (%) | Exon junction reads | 5'ss reads | 3'ss reads |
| A1 | 11.76 | 15 | 4 | 0 |
| A2 | 28.57 | 10 | 5 | 3 |
| A3 | 26.83 | 15 | 9 | 2 |
| A4 | 14.29 | 9 | 0 | 3 |
| A5 | -1 | 0 | 0 | 0 |
| A6 | 21.43 | 33 | 15 | 3 |
| A7 | 19.23 | 21 | 8 | 2 |
| A8 | 17.86 | 23 | 7 | 3 |
| A9 | 12.28 | 25 | 2 | 5 |
| A10 | 24.44 | 17 | 6 | 5 |
>TRINITY_DN105529_c0_g1_i5 from sample A2 / Example spliced isoformATGAGGTTGACTTGGATCAGTGGTGACAGCAAGCCTCAATATGTACACTATGGAGATGGAAAGATGGCATTGTCGACTGTGGCAACGTTTACTCCAAATGATTTGTGTGGTTCATTTGTCAATCCAGCAGTCAATTTTGGCTGGCACAATCCAGGGTTCATCCATACTGCATTGTTGGATGGTCTTTTGCCTTCAAAATC
CTATGTATACAAATATGGCAGTGATGAAGTGGGATGGAGTATGACAACCAATTTTTCTACACCTCCAGCCGTTGGTTCAAATGAGCTAACATTTATTACATATGGGGACATGGGCAAAGCAGAGCGTGATGGTTTTGGTGAGCATTACATTCAGCCTGGAGCGTTGCAGGTGATAGATGCAGTTGGAAGGGAAGTGCATG
CAGGGAAGATAGATTTGATTCTTCACACAGGAGATATTAGCTATGCAACAGGATTTCTGGCCGAATGGGATTTCTTTCTTGAAATGATTGGTCCAGTTGCCTCTCGAGTGCCATACATGACTGCAATTGGAAATCATGAAAGGGATTTCCCAAATTCAGGATCATACTATGAGGGCCCAGACTCTGGTGGGGAGTGTGGA
GTGCCATATGAAATGTATTTCCAAATGCCAGCGAATGGCAAGGATAAGCCTTGGTATTCCATTGAGCATGGGCCAGTTCACTTTACAATCATGTCAACAGAACACCCATGGGATATTGGCAGTGATCAGTTTAAATGGATGAAAGCTGATCTTGCTTCTGTGGATCGAAAGCGTACCCCATGGCTCATTTTTGCTGGGTT
AGAAAAGCTTTGATATATAACATAGCAGTTGAAAATGTGCTGTTTGATATGTGACAGTCATAGGCCACAATATTCCTCTCTTGAAGGGGGCTTCATTTTTAGTACAATAATTCCTGCTGTGGACATCCACTTTCGCTCAGTGATTGAACCCCTTCTCCTATTTCATCAGGTGGACCTTGCATTGTGGGGTCACGTACACA
ATTATGAGCGTACTTGTGCTGTGAATAACAGCCAGTGCTTGAATTATCCAACGAGGGACCATGGAGGGATTGATAATTACAGGAGTTCCATGTACTCTGCCCCAGTGCATGTCATCATTGGAATGTCTGGATTTGAGCTTGACTCTTTCATCACAATGGCTAAGAGCTGGAGTTTAGTACGGATATCAGAATTTGGGTAT
GTTAGAGTACATGCTACTACTGGAAAAATTATTGTACAGTTCAAGCTAACAGATGGGACGATAGCAGATCAATTATCACTTAGCAGATTTTGATACAGGGAGTATGTGGATCTGATAACTA
>TRINITY_DN105529_c0_g1_i11 from sample A2 / Example unspliced isoform:TTTTGAGCCCAATTATTTATTTCATGATCATACGTGTATATTTTGATCTGGAGCTCCACACCATATCCTGGATAAAATCCCAGAGGCCTGAAGCCTACATTCCATAAGCCAGAAGGCCGCATTTCATATTCAAAGGAAATCTCTGATGGGTCAGCATCGTATTTCATCAACAAACATGCATAAGTTCAGTGCATTCATGT
TTCTTCTGATTGTTTGCTCTCAATCCGTTGCCATAAGAGATGGGGGCAGGGGGAGCAGTGGGTATGAAAGGAATACAATGCATACAAAGATGAAGAAGAACTCATTTGGGTCAATTCCGAGAAGGAAGCTTTTGAGCTGTCCAGACTTCAATCCGTATTTGAAGTTATCTGTGAATCCTCCCGGGCCATTAAAGGACGTT
CAGGAGCTGAATATAACAATCACTGGAGTCCACACGCCCCTTGCAAGTGACTGGATTGCTATTCTTTCACCCTATCCTGTCAAATGAGGTTGACTTGGATCAGTGGTGACAGCAAGCCTCAATATGTACACTATGGAGATGGAAAGATGGCATTGTCGACTGTGGCAACGTTTACTCCAAATGATTTGTGTGGTTCATTT
GTCAATCCAGCAGTCAATTTTGGCTGGCACAATCCAGGGTTCATCCATACTGCATTGTTGGATGGTCTTTTGCCTTCAAAATCCTATGTATACAAATATGGCAGTGATGAAGTGGGATGGAGTATGACAACCAATTTTTCTACACCTCCAGCCGTTGGTTCAAATGAGCTAACATTTATTACATATGGGGACATGGGCAA
AGCAGAGCGTGATGGTTTTGGTGAGCATTACATTCAGCCTGGAGCGTTGCAGGTGATAGATGCAGTTGGAAGGGAAGTGCATGCAGGGAAGATAGATTTGATTCTTCACACAGGAGATATTAGCTATGCAACAGGATTTCTGGCCGAATGGGATTTCTTTCTTGAAATGATTGGTCCAGTTGCCTCTCGAGTGCCATACA
TGACTGCAATTGGAAATCATGAAAGGGATTTCCCAAATTCAGGATCATACTATGAGGGCCCAGACTCTGGTGGGGAGTGTGGAGTGCCATATGAAATGTATTTCCAAATGCCAGCGAATGGCAAGGATAAGCCTTGGTATTCCATTGAGCATGGGCCAGTTCACTTTACAATCATGTCAACAGAACACCCATGGGATATT
GGCAGTGATCAGTTTAAATGGATGAAAGCTGATCTTGCTTCTGTGGATCGAAAGCGTACCCCATGGCTCATTTTTGCTGGTCATAGGCCACAATATTCCTCTCTTGAAGGGGGCTTCATTTTTAGTACAATAATTCCTGCTGTGGACATCCACTTTCGCTCAGTGATTGAACCCCTTCTCCTATTTCATCAGGTGGACCT
TGCATTGTGGGGTCACGTACACAATTATGAGCGTACTTGTGCTGTGAATAACAGCCAGTGCTTGAATTATCCAACGAGGGACCATGGAGGGATTGATAATTACAGGAGTTCCATGTACTCTGCCCCAGTGCATGTCATCATTGGAATGTCTGGATTTGAGCTTGACTCTTTCATCACAATGgtacgcatttatagccgag
gaatcctttatctacagatgtattgagattgtaggaaaatctaattgctttagttcaacattatgcagGCTAAGAGCTGGAGTTTAGTACGGATATCAGAATTTGGGTATGTTAGAGTACATGCTACTACTGGAAAAATTATTGTACAGTTCAAGCTAACAGATGGGACGATAGCAGATCAATTATCACTTAGCAGATTT
TGATACAGGGAGTATGTGGATCTGATAACTA