sp|Q8L4P8|CKB11_ORYSJ ----> Cyclin-dependent kinase B1-1

Intron 1 GTTAAGATTT ... CATGCAACAG

Sample	Retention score (%)	Exon junction reads	5'ss reads	3'ss reads
A1	11.09	1114	5	139
A2	8.64	952	4	90
A3	10.08	928	6	104
A4	9.41	799	8	83
A5	7.55	465	1	38
A6	9.51	8984	7	944
A7	8.89	8227	19	803
A8	10.05	7925	27	885
A9	10.72	8548	19	1026
A10	8.61	6635	9	625

>TRINITY_DN44087_c0_g1_i1 from sample A8 / Example spliced isoform

TATTAAGACACCACGAAAACACAAACGGGTGGAATTCACGCAAGCCTAACGGTAAAAAAATTCAAAACGACCATTCGGGGCCGCTCCAATCTATAGGTATCCGTTTATCTCCACTTATATATGCCCTCTGCTTTCGTATAAACCTTGTAGAACCCTCTGCCCTGCAAAATCCTTGTTCTCTTATTTTCTCCGGATCGATC
CATATCTCTGTGCTCTAAACAAATCAAAGCAATGGACTCATATGAGAAACTGGAGAAGGTGGGAGAAGGAACCTATGGGAAGGTGTACAAGGCCAAGGACAAGAAAACAGGGAAACTGGTCGCCCTTAAAAAGACCAGGCTAGAGAACGATGGTGAGGGAATTCCTCCAACTGCTCTCCGTGAGATTTCTCTCCTGCAGA
TGCTTTCTCAAGATATGCACATTGTAAGGCTGTTGGATGTGGAACACACTGAGAACAAGAAGGGGAAGACCCTTCTGTACTTGGTTTTTGAATTCATGGATTCTGATCTCAAGAAGCACATCGACGGTTATCGCCGCAGCCACACAAAAATGCCTCCCGAGGTTATCAAGAGCTTCATGTACCAGTTGTGTCAGGGGGTT
GCTTACTGCCACAGTCGCGGTGTGATGCACAGGGACTTGAAGCCTCACAACCTGCTGGTGGACAAGCAAATGGGTGTGATAAAAATAGCAGATCTTGGCCTGGGAAGGGCTTTCACAGTTCCTATCAAGAAGTACACTCACGAGATTGTGACCCTTTGGTACAGGGCTCCTGAAGTGCTCTTGGGGGCTACTCACTATTC
CACACCTGTTGACATTTGGTCTGTTGGCTGTATATTTGCTGAAATGTCCAGAATGCATGCTCTGTTCACTGGAGATTCTGAAGTACAACAACTTATGAGCATTTTCAAGTTTTTAGGAACTCCTAATGAAGAAGTATGGCCAGGAGTGACTAAATTGAAGGACTGGCATATCTATCCAGAGTGGAGGCCTCAAGATATAA
GTCGTGCTGTTCCAGACATGGAACCAAGTGGTGTAGATCTGTTGACTAAAATGCTGGTTTATGAGCCATCGAAGAGAATCTCAGCTAAGAAGGCATTGCAACATCCTTATTTTGACGACCTGGATAAATCTCAATTCTGAGATTCCATTTAAGGATTTAGCCAATTCAGGATAGTATGCATGTGTCGCTGTTATATTTGT
TGGTTTCTGCTTTGGGAATTTTGGAAATGTTCCATTTTCTGAGATTTGATCTCTGCCCATATAATTGTTTTGATTTGTTTGCACAAGCAAACGAGCAGTGTTCGGCTTAATTTCAGACCCCAAATATTGTATTCCCACACTTGGGAGCTTGTCTTTAATATTTGAGTTCAGATTTATCTCTGCTCTTCTGTTTGAAAATA
ATTTTAGAAAATCCAAAGTTGAGGTGGATGGCATCTGGATGTTTTTTATGTTGAGAAAGGCATGGCCATAAGTAATAGATAGTTAAATAGAGTCAGTGCCCTATATGACTTTCTTAAATGATATTTATATCTCTTGTTATTTAACAAAGTATCTGTTCATGCTATTTGAAATTAATTTTAAAAATTTCAGTGAAACATC

>TRINITY_DN44087_c0_g1_i3 from sample A8 / Example unspliced isoform:

CTGTTGGCTGTATATTTGGTAAGCTTTTATAGAAAGTTTACTTAGATGTTTCGATTTGCTTTTTATGAGTACAACTGTTTAGACACATGTCTACTAGGCCATCTGATCTGCGGAAGGTTTTTGTTTTTGCAGCTGAAATGTCCAGAATGCATGCTCTGTTCACTGGAGATTCTGAAGTACAACAACTTATGAGCATTTTC
AAgttaagatttcaccaaaaaagagatatcctatctttgtttataggccttcatttctgatgcacagtacccttttgctataaaattttaatctttgcatgcaacagGTTTTTAGGAACTCCTAATGAAGAAGTATGGCCAGGAGTGACTAAATTGAAGGACTGGCATATCTATCCAGAGTGGAGGCCTCAAGATATAAG
TCGTGCTGTTCCAGACATGGAACCAAGTGGTGTAGATCTGTTGACTAAAATGCTGGTTTATGAGCCATCGAAGAGAATCTCAGCTAAGAAGGCATTGCAACATCCTTATTTTGACGACCTGGATAAATCTCAATTCTGAGATTCCATTTAAGGATTTAGCCAATTCAGGATAGTATGCATGTGTCGCTGTTATATTTGTT
GGTTTCTGCTTTGGGAATTTTGGAAATGTTCCATTTTCTGAGATTTGATCTCTGCCCATATAATTGTTTTGATTTGTTTGCACAAGCAAACGAGCAGTGTTCGGCTTAATTTCAGACCCCAAATATTGTATTCCCACACTTGGGAGCTTGTCTTTAATATTTGAGTTCAGATTTATCTCTGCTCTTCTGTTTGAAAATAA
TTTTAGAAAATCCAAAGTTGAGGTGGATGGCATCTGGATGTTTTTTATGTTGAGAAAGGCATGGCCATAAGTAATAGATAGTTAAATAGAGTCAGTGCCCTATATGACTTTCTTAAATGATATTTATATCTCTTGTTATTTAACAAAGTATCTGTTCATGCTATTTGAAATTAATTTTAAAAATTTCAGTGAAACATC

Intron 2 GTAAGAGTCC ... TGTTTTGCAG

Sample	Retention score (%)	Exon junction reads	5'ss reads	3'ss reads
A1	15.42	661	141	100
A2	14.56	466.5	85	74
A3	16.23	506	108	88
A4	12.79	450	79	53
A5	12.43	222	36	27
A6	14.34	5391.5	872	934
A7	15.2	4865	788	956
A8	15.93	5179	811	1151
A9	14.86	4965	795	938
A10	14.33	3787	582	685

>TRINITY_DN44087_c0_g1_i3 from sample A8 / Example spliced isoform

CTGTTGGCTGTATATTTGGTAAGCTTTTATAGAAAGTTTACTTAGATGTTTCGATTTGCTTTTTATGAGTACAACTGTTTAGACACATGTCTACTAGGCCATCTGATCTGCGGAAGGTTTTTGTTTTTGCAGCTGAAATGTCCAGAATGCATGCTCTGTTCACTGGAGATTCTGAAGTACAACAACTTATGAGCATTTTC
AAGTTAAGATTTCACCAAAAAAGAGATATCCTATCTTTGTTTATAGGCCTTCATTTCTGATGCACAGTACCCTTTTGCTATAAAATTTTAATCTTTGCATGCAACAGGTTTTTAGGAACTCCTAATGAAGAAGTATGGCCAGGAGTGACTAAATTGAAGGACTGGCATATCTATCCAGAGTGGAGGCCTCAAGATATAAG
TCGTGCTGTTCCAGACATGGAACCAAGTGGTGTAGATCTGTTGACTAAAATGCTGGTTTATGAGCCATCGAAGAGAATCTCAGCTAAGAAGGCATTGCAACATCCTTATTTTGACGACCTGGATAAATCTCAATTCTGAGATTCCATTTAAGGATTTAGCCAATTCAGGATAGTATGCATGTGTCGCTGTTATATTTGTT
GGTTTCTGCTTTGGGAATTTTGGAAATGTTCCATTTTCTGAGATTTGATCTCTGCCCATATAATTGTTTTGATTTGTTTGCACAAGCAAACGAGCAGTGTTCGGCTTAATTTCAGACCCCAAATATTGTATTCCCACACTTGGGAGCTTGTCTTTAATATTTGAGTTCAGATTTATCTCTGCTCTTCTGTTTGAAAATAA
TTTTAGAAAATCCAAAGTTGAGGTGGATGGCATCTGGATGTTTTTTATGTTGAGAAAGGCATGGCCATAAGTAATAGATAGTTAAATAGAGTCAGTGCCCTATATGACTTTCTTAAATGATATTTATATCTCTTGTTATTTAACAAAGTATCTGTTCATGCTATTTGAAATTAATTTTAAAAATTTCAGTGAAACATC

>TRINITY_DN44087_c0_g1_i4 from sample A8 / Example unspliced isoform:

TATTAAGACACCACGAAAACACAAACGGGTGGAATTCACGCAAGCCTAACGGTAAAAAAATTCAAAACGACCATTCGGGGCCGCTCCAATCTATAGGTATCCGTTTATCTCCACTTATATATGCCCTCTGCTTTCGTATAAACCTTGTAGAACCCTCTGCCCTGCAAAATCCTTGTTCTCTTATTTTCTCCGGATCGATC
CATATCTCTGTGCTCTAAACAAATCAAAGCAATGGACTCATATGAGAAACTGGAGAAGGTGGGAGAAGGAACCTATGGGAAGGTGTACAAGGCCAAGGACAAGAAAACAGGGAAACTGGTCGCCCTTAAAAAGACCAGGCTAGAGAACGATGGTGAGGGAATTCCTCCAACTGCTCTCCGTGAGATTTCTCTCCTGCAGA
TGCTTTCTCAAGATATGCACATTGTAAGGCTGTTGGATGTGGAACACACTGAGAACAAGAAGGGGAAGACCCTTCTGTACTTGGTTTTTGAATTCATGGATTCTGATCTCAAGAAGCACATCGACGGTTATCGCCGCAGCCACACAAAAATGCCTCCCGAGGTTATCAAGAGCTTCATGTACCAGTTGTGTCAGGGGGTT
GCTTACTGCCACAGTCGCGGTGTGATGCACAGGGACTTGAAGCCTCACAACCTGCTGGTGGACAAGCAAATGGGTGTGATAAAAATAGCAGATCTTGGCCTGGGAAGGGCTTTCACAGTTCCTATCAAGAAGTACACTCACGAGATTGTGACCCTTTGGTACAGGGCTCCTGAAGTGCTCTTGGGGGCTACTCACTATTC
CACACCTGTTGACATTTGGTCTGTTGGCTGTATATTTGCTGAAATGTCCAGAATGCATGCTCTGTTCACTGGAGATTCTGAAGTACAACAACTCATGAGCATTTTCAAGTTTTTAGGAACTCCTAATGAAGAAGTATGGCCAGGAGTGACTAAATTGAAGGACTGGCATATCTATCCAGAGTGGAGGCCTCAAGATATAA
GTCGTGCTGTTCCAGACATGGAACCAAGTGGTGTAGATCTGTTGACTgtaagagtccttaatctgtattcttgtcctttaattctttgtttctttaccattttgtaggaatagtagagtaagtaaacttgaattcatgtgttttgcagAAAATGCTGGTTTATGAGCCATCGAAGAGAATCTCAGCTAAGAAGGCATTGC
AACATCCTTATTTTGACGACCTGGATAAATCTCAATTCTGAGATTCCATTTAAGGATTTAGCCAATTCAGGATAGTATGCATGTGTCGCTGTTATATTTGTTGGTTTCTGCTTTGGGAATTTTGGAAATGTTCCATTTTCTGAGATTTGATCTCTGCCCATATAATTGTTTTGATTTGTTTGCACAAGCAAACGAGCAGT
GTTCGGCTTAATTTCAGACCCCAAATATTGTATTCCCACACTTGGGAGCTTGTCTTTAATATTTGAGTTCAGATTTATCTCTGCTCTTCTGTTTGAAAATAATTTTAGAAAATCCAAAGTTGAGGTGGATGGCATCTGGATGTTTTTTATGTTGAGAAAGGCATGGCCATAAGTAATAGATAGTTAAATAGAGTCAGTGC
CCTATATGACTTTCTTAAATGATATTTATATCTCTTGTTATTTAACAAAGTATCTGTTCATGCTATTTGAAATTAATTTTAAAAATTTCAGTGAAACATC

Intron 3 GTAAGCTTTT ... GTTTTTGCAG

Sample	Retention score (%)	Exon junction reads	5'ss reads	3'ss reads
A1	0.23	1284.5	0	3
A2	0.57	1041.5	2	6
A3	0.65	1067.5	3	7
A4	0.32	947	0	3
A5	0	557	0	0
A6	0.1	9897.5	4	10
A7	0.09	9057.5	0	8
A8	0.16	8337	3	13
A9	0.12	9369	0	11
A10	0.07	7352.5	0	5

>TRINITY_DN44087_c0_g1_i4 from sample A8 / Example spliced isoform

TATTAAGACACCACGAAAACACAAACGGGTGGAATTCACGCAAGCCTAACGGTAAAAAAATTCAAAACGACCATTCGGGGCCGCTCCAATCTATAGGTATCCGTTTATCTCCACTTATATATGCCCTCTGCTTTCGTATAAACCTTGTAGAACCCTCTGCCCTGCAAAATCCTTGTTCTCTTATTTTCTCCGGATCGATC
CATATCTCTGTGCTCTAAACAAATCAAAGCAATGGACTCATATGAGAAACTGGAGAAGGTGGGAGAAGGAACCTATGGGAAGGTGTACAAGGCCAAGGACAAGAAAACAGGGAAACTGGTCGCCCTTAAAAAGACCAGGCTAGAGAACGATGGTGAGGGAATTCCTCCAACTGCTCTCCGTGAGATTTCTCTCCTGCAGA
TGCTTTCTCAAGATATGCACATTGTAAGGCTGTTGGATGTGGAACACACTGAGAACAAGAAGGGGAAGACCCTTCTGTACTTGGTTTTTGAATTCATGGATTCTGATCTCAAGAAGCACATCGACGGTTATCGCCGCAGCCACACAAAAATGCCTCCCGAGGTTATCAAGAGCTTCATGTACCAGTTGTGTCAGGGGGTT
GCTTACTGCCACAGTCGCGGTGTGATGCACAGGGACTTGAAGCCTCACAACCTGCTGGTGGACAAGCAAATGGGTGTGATAAAAATAGCAGATCTTGGCCTGGGAAGGGCTTTCACAGTTCCTATCAAGAAGTACACTCACGAGATTGTGACCCTTTGGTACAGGGCTCCTGAAGTGCTCTTGGGGGCTACTCACTATTC
CACACCTGTTGACATTTGGTCTGTTGGCTGTATATTTGCTGAAATGTCCAGAATGCATGCTCTGTTCACTGGAGATTCTGAAGTACAACAACTCATGAGCATTTTCAAGTTTTTAGGAACTCCTAATGAAGAAGTATGGCCAGGAGTGACTAAATTGAAGGACTGGCATATCTATCCAGAGTGGAGGCCTCAAGATATAA
GTCGTGCTGTTCCAGACATGGAACCAAGTGGTGTAGATCTGTTGACTGTAAGAGTCCTTAATCTGTATTCTTGTCCTTTAATTCTTTGTTTCTTTACCATTTTGTAGGAATAGTAGAGTAAGTAAACTTGAATTCATGTGTTTTGCAGAAAATGCTGGTTTATGAGCCATCGAAGAGAATCTCAGCTAAGAAGGCATTGC
AACATCCTTATTTTGACGACCTGGATAAATCTCAATTCTGAGATTCCATTTAAGGATTTAGCCAATTCAGGATAGTATGCATGTGTCGCTGTTATATTTGTTGGTTTCTGCTTTGGGAATTTTGGAAATGTTCCATTTTCTGAGATTTGATCTCTGCCCATATAATTGTTTTGATTTGTTTGCACAAGCAAACGAGCAGT
GTTCGGCTTAATTTCAGACCCCAAATATTGTATTCCCACACTTGGGAGCTTGTCTTTAATATTTGAGTTCAGATTTATCTCTGCTCTTCTGTTTGAAAATAATTTTAGAAAATCCAAAGTTGAGGTGGATGGCATCTGGATGTTTTTTATGTTGAGAAAGGCATGGCCATAAGTAATAGATAGTTAAATAGAGTCAGTGC
CCTATATGACTTTCTTAAATGATATTTATATCTCTTGTTATTTAACAAAGTATCTGTTCATGCTATTTGAAATTAATTTTAAAAATTTCAGTGAAACATC

>TRINITY_DN44087_c0_g1_i3 from sample A8 / Example unspliced isoform:

CTGTTGGCTGTATATTTGgtaagcttttatagaaagtttacttagatgtttcgatttgctttttatgagtacaactgtttagacacatgtctactaggccatctgatctgcggaaggtttttgtttttgcagCTGAAATGTCCAGAATGCATGCTCTGTTCACTGGAGATTCTGAAGTACAACAACTTATGAGCATTTTC
AAGTTAAGATTTCACCAAAAAAGAGATATCCTATCTTTGTTTATAGGCCTTCATTTCTGATGCACAGTACCCTTTTGCTATAAAATTTTAATCTTTGCATGCAACAGGTTTTTAGGAACTCCTAATGAAGAAGTATGGCCAGGAGTGACTAAATTGAAGGACTGGCATATCTATCCAGAGTGGAGGCCTCAAGATATAAG
TCGTGCTGTTCCAGACATGGAACCAAGTGGTGTAGATCTGTTGACTAAAATGCTGGTTTATGAGCCATCGAAGAGAATCTCAGCTAAGAAGGCATTGCAACATCCTTATTTTGACGACCTGGATAAATCTCAATTCTGAGATTCCATTTAAGGATTTAGCCAATTCAGGATAGTATGCATGTGTCGCTGTTATATTTGTT
GGTTTCTGCTTTGGGAATTTTGGAAATGTTCCATTTTCTGAGATTTGATCTCTGCCCATATAATTGTTTTGATTTGTTTGCACAAGCAAACGAGCAGTGTTCGGCTTAATTTCAGACCCCAAATATTGTATTCCCACACTTGGGAGCTTGTCTTTAATATTTGAGTTCAGATTTATCTCTGCTCTTCTGTTTGAAAATAA
TTTTAGAAAATCCAAAGTTGAGGTGGATGGCATCTGGATGTTTTTTATGTTGAGAAAGGCATGGCCATAAGTAATAGATAGTTAAATAGAGTCAGTGCCCTATATGACTTTCTTAAATGATATTTATATCTCTTGTTATTTAACAAAGTATCTGTTCATGCTATTTGAAATTAATTTTAAAAATTTCAGTGAAACATC