sp|Q9M2J5|MCC16_ARATH ----> MATH domain and coiled-coil domain-containing protein At3g58210
Intron 1 GTAAGTCTGA ... TACCCTAGAG
| Sample | Retention score (%) | Exon junction reads | 5'ss reads | 3'ss reads |
| A1 | 65.07 | 40 | 88 | 61 |
| A2 | 66.14 | 32 | 76 | 49 |
| A3 | 69.31 | 31 | 87 | 53 |
| A4 | 75.19 | 16 | 43 | 54 |
| A5 | 66.96 | 19 | 48 | 29 |
| A6 | 57.14 | 3 | 5 | 3 |
| A7 | 63.64 | 4 | 13 | 1 |
| A8 | 100 | 0 | 0 | 2 |
| A9 | 66.67 | 2 | 6 | 2 |
| A10 | 64.29 | 10 | 26 | 10 |
>TRINITY_DN103894_c3_g1_i4 from sample A4 / Example spliced isoformTGGAAAGAAGTTAACAGGAGGAGCAGCAGCAGTGCTCAGCAGTAATTAGAGGAAGCCAAAGGCAGGGAATAACAGAGAAGAAAAACATAAACACAGAAGAAGAATCATCAACCATACTGGTAGCAGCAGCTTCAAGGCAATCACAACCCCCTTGTCACCTTTCAATGTTTCTCGAAGTTACAGATCCTCGTAACAATTCT
GCTGATTGGAGTTGTTTTGTCAGTCACCGTTTATCAGTTGTGAATCAAAGATCTGAAGAAAAATCGGTTACAAAGGAGTCTCAAAACCGTTATTCAAAGGCTGCTAAAGATTGGGGTTGGCGTGAATTTATTACCTTGACTAGTCTCTTTGACCAAGATTCAGGGTACTTGGTGCAAGACACAGTGGTCTTTTCTGCAGA
GGTTCTCATTTTAAAGGAGACCTCTATAATGCAGGAGTGCTCAGATCATGAAGTAGATTCCAATGTCTCTAGAAGTGAAGCTGGAAGAACTGTAAACAAAGGCACCTTCACATGGAAGGTTGAGAACTTTTTAGCTTTTAAAGAGATCATGGAGACAAGGAAAATCTTCAGCAAATTCTTTCAGGCTGGTGGTTGTGAGC
TACGCATAGGTGTCTACGAGTCGTTTGATACTCTATGCATATACTTGGAAAGTGACCAATCTGTTGGAACTGATCCTGATAAGAATTTCTGGGTGAGATATCGGATGGCAGTAGTGAATCAAAAACACTCTGATAAAACTGTCTGGAAGGAGTCATCCATATGTACAAAGACTTGGAATAATTCAGTTCTACAATTCATG
AAAGTCTCTGACATGCTGGATCCAGATGCAGGGTTCCTTACACGTGATACAGTTGTGTTTGTATGCGAGATTCTGGATTGTTGTCCTTGGTTCGAGTTTTCTGATCTTGAGGTAATGGTTTCAGATGATGAGCAAGATGCACTGTCAACGGATCCAGATGAGCTTATTGATTCTGATGACAGCGAAGGAATCAGCGGGGA
TGAAGAAGATATTTTCAGAAGCCTTCTTGCCAGGGCAGGTTTTCATCTTACATATGGTGATAATCCAACTCTTCTACTAGACCCATCTCAGCTGCAAGTTACATTAAGAGAAAAGTTATTGATGGATGCTGGTGCAATAGCAGCCTTTTTGACTGGTCTTCGAGTTTATTTAGATGATCCAGCCAAAGTGAAGAGGCTTC
TGCTTCCAACAAAATTGTCATCTGCTACTGGTGGGAGTAAAAGTGGTACTAAAGGAGAAAACTCATCTCCTAGTCTTATGAACTTGTTAATGGGTGTGAAGGTATTGCAACAGGCTATTGTTGACCTACTTTTAGATATAATGGTAGAATGCTGTCAGCCAACTGAAGGAAAGAAGAACAATGATATTTCTGATACAGGG
TCAAAAGATATTTTGGATGCCAATGGAAATTCTATTAGTAGAACTAACGTGGAATTACAAGGTACAACTGGAAAAAATGGCATTGCACAGAGTCCAATTGGTCAACGTTTAGATGTCAGTCTCGATGGGGCATTGCAAATGCAGGCAGTACAAAGCAGTGATTCATTGGAATCTCTGTTGGCAGGGAAAGCTGTTGTTCC
GCCTACTTCAACGGTGCCAGAATCAGGTGTACAGTACTCTTCACCAGTAAACAATGCTAACCAAATGCTAAAGCCTAAATGTCCGGAGCAGTCTGATGAGCTGTTAAGACTGATTGTCAACTCCCTGAGGGCACTGGATGGTGCTGTGCCACAAGGCTGTTTAGAACCTCGGCGGCGACCAGAATCGGCACAGAAGATTG
CTTTTGTTCTGGAGAGGTCTCCTAAACATTTGCAGCCAGATTTGATTTCGCTGGTGCCAAAACTTGTGGATGCATCTGAGCATTCGCTGGCTGCATATGCATTGTTAAACCAACTTCGCAAAACAGATGCAGAACCAGCTTTATGGCTACCTGTACTGGGTGCACTCAGTCAGCTGGAGATCGGCAACGAGGTGTGGGAA
CAAGTATTGTGTGAAGGTCTTGGAATGCTGTTGGTTTACGACGATGAGTCTCTTACTGCTGTTATAAGTACTATTTTCAAGGCTGCATCTGGGTGTCAACAAGTACCTCAAGCGGCAGGAGCAGTCCGTGGTAGACTGAAGAAGTTAGGAGCTGGTGTGTCTCCTCAGATTCTAGATTGTCTAAGAAACATAGTTGCTAG
TCAGGCAGATGTCGCTGAAGCTCTACTGAGAGACATTGATTCTGATAGTGAAAAAGGTGAAAACGATTTCACAGAACCCACATCCATTGATGTGGTTGCTGATAACGAGAGTAGAGGTGCCGCAGGAAAATTACAGTTGACAGCAGAGCATGTGGCAAATGCATGTTGGCGTCTTGCAGATGTGTACATTCTTGTAGAGT
TATTATTGGTACCTTCTCTTAGAGAAAAAGCACAGCATGTGTTTGAGAGAGCTATTGCTCGTGGGGCATTTGGGGAAAGGTCAATAGCAATGTTCATAGAAAGACGACATTCACAGAGGCCAATTATAGATTTCAGATGTAATGTTTCAGATAATCAGAGTTCACAGGCCTTTAGTACAGATTCTTCCGTTCAGCCCTTG
CCTGAAGAGGATGAGGACTTCCCTGCTGTGCTTGGACTTGCTGAAGTGTTGATGCTCAGTAGGGACACTCGAGTGAGAGAATTTGTGAGTACTTTGTATGCAGTAATGTTTAAAGTATATCAAAATGAGGGTTATCGGGATCGGATGTTGAGGGGACTAGTTGAGTGTGCAAGCAGAAACACAAATGGTCATCATGAAAT
GGACCTTGGCATGGATATTCTGGCATTTCTTTTACGAGAAGAGGAAGGAACTGCAAGACCTGTATTAAGCATGATGCACGAGGCAGCTCAACTCGCCAATGTTGATCGAGCTGCTATGTGGCAGCGGTTGTGCGTGAGTGAAGAAGAATTAATTCGGGTTCGTGAAGATAGACAAGATGAAATTGCTAATATCAGTAAAG
AAAATGTGCTTCTATCCCAAAGATTAGCTGATGCTGCAATGGCACAAGCACATCTCAAGGCTGAAATGAAGGCTGAACTGGAAAAATTTTCACGGGAGAAAAGGGATCTTTCAGAACGCTTGCAAGAAGCAGAAAATCAACTAGAGTGGGTTCGATCAGAGCGAGCTGAAGAAATTGCTAAGTTAGCTGCTGATAGGAAG
GTCCTTCAGGACAATTTGCGTGATGCAGAAACACAGCTTACACAACTGAAGACTCGTAAACGTGACGAATTAAAGAGGGTTGTCAAAGAGAAAAATGCACTTGCCGAGAGGCTAAAAAGTGCAGAGTCTGCAAGGAAAAGATTTGATGAAGAGCTGAAACGATTTGCAACAGAAACTGTAACCCGAGAAGAAGTGCGACA
ATCATTGGAAAATGAGGTAAAACGTCTTAGACAAACAGTTGGACAGACTGAAGGAGGCCTAAGAGAGAAAGAAGATCAGATTATGCGATGCGAAAATTATATTGATGGGTTGGAGTCAAAATTAAATGCATGCCAGGGATACATTCAATCTTTGGAAGCATCTCTACAAGAAGAGATGTCTCGTCATGCTCCACTTTATG
GAGCTGGTTTGGAAGCTCTTTCGATGAGTGAACTGGATACGATTATCAGGATACATGAAGAGGGGCTTAGACAAGTCCGCACTGTTCAACAACAGCGGAATGGAGGAAATGATATGTTACTAATAAACTTGGATCCATTGGCGAGTCATGCACCAGTTATTCCACCACTGAGCTTGTACGGCACACCTCCTTCGGTGGCT
GTGGGAATGCCATCAATAATTGTAAATGGTCCCGGGATTCACAATAATGGTCATCTGAATGGCACTGTTGGTCCATGGTTTTCTTCAGCTTGAGAAATTGGTGTCTGTCACATATTTATTTTCTTGATGGGTTGATTAAATTGCTCAGCATCAGGTAATACAAATTTATCTGTTCTTGCTTTTGTAATTTACACATGAAA
TTGGTATGAAGCCTTAGAAGGCGGCTGTGGTTTTCAAGAAAATAAACAGCTCAAATGTATATTTCTTGATTTCCAAGAGTTAATTGTAAATTGGCAAGAGAGCCAACATATTTGTAAAATCAGCATTTTGGAATGGGGCTTGTTTTATGTGAAGTTACGTAAGAAAAGCACCCCATGATCGTTGGAGCATATGGCGGTAG
AGTTCATTATTTTTCTCTTTTATAAGATTTCAGAGGAACCATATTTACAAGATGTTTGCATTGATGTATGCAAAATTCAACAACATTAGAATTTGGGGTTTGATATATTCATCCAGTCCATACGTCCACTGTAACAGGTTTTCCGTTCAATGCCTTTTGAAGCAGTAATGTAGGTATTCTTTTCTACATCTTTGCTGAAG
AACACTTGGAGATGCAATAGACAAAATTGTCTCGATGGTCTCCCGAAACATGTTTTATTCATCTAACAATGATGTTGCTGTCAAAATTTTCAATCAACTGTTTCCAGTAAGCAATTGAAGGGTTTGCTTGTATCATTCGCTGTGAAAGGTGACTATGACATCTTGAAACGGAGGAGAGTCAATTGGGGCTTTGCTGAAAC
TGATAAATGCATGTAATAGACAGTGGAGCTCTATTTCTGAGATGAGTTTACTAGATGCAAAGAACCTGGATTGTGTTTTAATAGATCTTATATTATGATCTATTAAGTGCTGAGACGGATAAAAAACACCAGATACAAACTTAAATTTGTTTCTATACCCTTCTCAACCGCTTAATAGATCCTGATTTAAGATCTTTTAT
AGTGTATTTATAGTTGTAAAAAATGAGGTAAGATAAATAACATGTCTTTTCTTCGAAATTATGGTAATTAAGAGAAAGAATACATTGC
>TRINITY_DN103894_c3_g1_i1 from sample A4 / Example unspliced isoform:TGGAAAGAAGTTAACAGGAGGAGCAGCAGCAGTGCTCAGCAGTAATTAGAGGAAGCCAAAGGCAGGGAATAACAGAGAAGAAAAACATAAACACAGAAGAAGAATCATCAACCATACTGGTAGCAGCAGCTTCAAgtaagtctgatagaaaacaatttttttaatctcaaacacccattaattttttccctcgttttttc
aaaaccactttgctgggggcctcgattatttcaataattttgccacaaaaatctccacacctgctgcaattcaacaagatccaatataacctaagaggcattatcatcggtggccggtcacatgcattttatcaatcaatgcgagggtttctgcagctctgagtcagtggggggttattgattttggagactcagctttt
attatttttagggcagtgggtcatattatatttagggatgaagcaggtcgaggagctggcggcgtcttcgtctgggggtttggataattcattggcattgaacagccggatagagaaaacagtggccagaggaggggaaactgcagaggaacccagagaaggggggcaggagaatgtgtttgtggagaggagaggggatt
actgtgcagtctgcaggtggaatattgcgcagtttagcagggtaaaggccagggcattgtggagtcggtattttgaagtggggggttatgattgcaggcttctcgtgtatccccggggcgactcacaggcgcttccagggtatctttccatctatttgcaggtgatggatccccgaggatcggcttcgtcgaaatgggat
tgttttgctagctacagattgattgtggtgaatcagcgcgacgaggcgaagtcgatacagcgtgattcctggcatcggttttccaccaagaagaagtcccatggctggtgtgactttacacccagctcgacagtcctggatcccaaggctggtttccttctgaatgacacgatcgttgtcttggcggagattcttgtcct
acatgagtctgtgacgttctccagggagaatgaattgcagccgattgccggccccatgccagaggtcctgagtgggaagttcttgtggaaggtgcacaatttgtctctgtttaaggagatgatcaagacgcagaagatcatgagccctgtgtttccggccggggaatgcaatctgcggctcagtgtgtaccaatcgtctg
ttaatggcatcgattatctgtcgatgtgcttggagagcaaggataccgataagtctgttgttacagagcggagctgttggtgtctctttcgcatgtccgttctgaatcagcgagctgggatgaaccatatgcatcgggattcctatggccgattcgcaggggacaataagagtggtgacaatacgagccttggatggaac
gattacatgctaatgacagattttgtatctccagagatgggttatttggtggatgacactgctgttttcagcgcttcatttcatgtcatcaaggagtccagtggctttactagaaaccttggaaccgtaggtggaagaagcaatgtcagaaaatcagatggtcatcaagggaaatttacatggagaattgagaatttcac
aaggttaaaagacatccttaagaaaaggaaaataacgggcctatgtgtcaagagtaggcgatttcaggttggcaaccgcgactgccgtcttattgtgtaccctagagGGCAATCACAACCCCCTTGTCACCTTTCAATGTTTCTCGAAGTTACAGATCCTCGTAACAATTCTGCTGATTGGAGTTGTTTTGTCAGTCACC
GTTTATCAGTTGTGAATCAAAGATCTGAAGAAAAATCGGTTACAAAGGAGTCTCAAAACCGTTATTCAAAGGCTGCTAAAGATTGGGGTTGGCGTGAATTTATTACCTTGACTAGTCTCTTTGACCAAGATTCAGGGTACTTGGTGCAAGACACAGTGGTCTTTTCTGCAGAGGTTCTCATTTTAAAGGAGACCTCTATA
ATGCAGGAGTGCTCAGATCATGAAGTAGATTCCAATGTCTCTAGAAGTGAAGCTGGAAGAACTGTAAACAAAGGCACCTTCACATGGAAGGTTGAGAACTTTTTAGCTTTTAAAGAGATCATGGAGACAAGGAAAATCTTCAGCAAATTCTTTCAGGCTGGTGGTTGTGAGCTACGCATAGGTGTCTACGAGTCGTTTGA
TACTCTATGCATATACTTGGAAAGTGACCAATCTGTTGGAACTGATCCTGATAAGAATTTCTGGGTGAGATATCGGATGGCAGTAGTGAATCAAAAACACTCTGATAAAACTGTCTGGAAGGAGTCATCCATATGTACAAAGACTTGGAATAATTCAGTTCTACAATTCATGAAAGTCTCTGACATGCTGGATCCAGATG
CAGGGTTCCTTACACGTGATACAGTTGTGTTTGTATGCGAGATTCTGGATTGTTGTCCTTGGTTCGAGTTTTCTGATCTTGAGGTAATGGTTTCAGATGATGAGCAAGATGCACTGTCAACGGATCCAGATGAGCTTATTGATTCTGATGACAGCGAAGGAATCAGCGGGGATGAAGAAGATATTTTCAGAAGCCTTCTT
GCCAGGGCAGGTTTTCATCTTACATATGGTGATAATCCAACTCTTCTACTAGACCCATCTCAGCTGCAAGTTACATTAAGAGAAAAGTTATTGATGGATGCTGGTGCAATAGCAGCCTTTTTGACTGGTCTTCGAGTTTATTTAGATGATCCAGCCAAAGTGAAGAGGCTTCTGCTTCCAACAAAATTGTCATCTGCTAC
TGGTGGGAGTAAAAGTGGTACTAAAGGAGAAAACTCATCTCCTAGTCTTATGAACTTGTTAATGGGTGTGAAGGTATTGCAACAGGCTATTGTTGACCTACTTTTAGATATAATGGTAGAATGCTGTCAGCCAACTGAAGGAAAGAAGAACAATGATATTTCTGATACAGGGTCAAAAGATATTTTGGATGCCAATGGAA
ATTCTATTAGTAGAACTAACGTGGAATTACAAGGTACAACTGGAAAAAATGGCATTGCACAGAGTCCAATTGGTCAACGTTTAGATGTCAGTCTCGATGGGGCATTGCAAATGCAGGCAGTACAAAGCAGTGATTCATTGGAATCTCTGTTGGCAGGGAAAGCTGTTGTTCCGCCTACTTCAACGGTGCCAGAATCAGGT
GTACAGTACTCTTCACCAGTAAACAATGCTAACCAAATGCTAAAGCCTAAATGTCCGGAGCAGTCTGATGAGCTGTTAAGACTGATTGTCAACTCCCTGAGGGCACTGGATGGTGCTGTGCCACAAGGCTGTTTAGAACCTCGGCGGCGACCAGAATCGGCACAGAAGATTGCTTTTGTTCTGGAGAGGTCTCCTAAACA
TTTGCAGCCAGATTTGATTTCGCTGGTGCCAAAACTTGTGGATGCATCTGAGCATTCGCTGGCTGCATATGCATTGTTAAACCAACTTCGCAAAACAGATGCAGAACCAGCTTTATGGCTACCTGTATGATTGATCCATCGATTTATGTAGTTTTCTATTAAATTTGTATTTCGTACAATCCACTGCTTGAAAATATGTC
CTTCCTTGAATGTGAAGATAAATCAACCACTTTACCTTTTCTTATTTGACAGTTGCAAATCATTTGTTGTTGTAGGTACTGGGTGCACTCAGTCAGCTGGAGATCGGCAACGAGGTGTGGGAACAAGTATTGTGTGAAGGTCTTGGAATGCTGTTGGTTTACGACGATGAGTCTCTTACTGCTGTTATAAGTACTATTTT
CAAGGCTGCATCTGGGTGTCAACAAGTACCTCAAGCGGCAGGAGCAGTCCGTGGTAGACTGAAGAAGTTAGGAGCTGGTGTGTCTCCTCAGATTCTAGATTGTCTAAGAAACATAGTTGCTAGTCAGGCAGATGTCGCTGAAGCTCTACTGAGAGACATTGATTCTGATAGTGAAAAAGGTGAAAACGATTTCACAGAAC
CCACATCCATTGATGTGGTTGCTGATAACGAGAGTAGAGGTGCCGCAGGAAAATTACAGTTGACAGCAGAGCATGTGGCAAATGCATGTTGGCGTCTTGCAGATGTGTACATTCTTGTAGAGTTATTATTGGTACCTTCTCTTAGAGAAAAAGCACAGCATGTGTTTGAGAGAGCTATTGCTCGTGGGGCATTTGGGGAA
AGGTCAATAGCAATGTTCATAGAAAGACGACATTCACAGAGGCCAATTATAGATTTCAGATGTAATGTTTCAGATAATCAGAGTTCACAGGCCTTTAGTACAGATTCTTCCGTTCAGCCCTTGCCTGAAGAGGATGAGGACTTCCCTGCTGTGCTTGGACTTGCTGAAGTGTTGATGCTCAGTAGGGACACTCGAGTGAG
AGAATTTGTGAGTACTTTGTATGCAGTAATGTTTAAAGTATATCAAAATGAGGGTTATCGGGATCGGATGTTGAGGGGACTAGTTGAGTGTGCAAGCAGAAACACAAATGGTCATCATGAAATGGACCTTGGCATGGATATTCTGGCATTTCTTTTACGAGAAGAGGAAGGAACTGCAAGACCTGTATTAAGCATGATGC
ACGAGGCAGCTCAACTCGCCAATGTTGATCGAGCTGCTATGTGGCAGCGGTTGTGCGTGAGTGAAGAAGAATTAATTCGGGTTCGTGAAGATAGACAAGATGAAATTGCTAATATCAGTAAAGAAAATGTGCTTCTATCCCAAAGATTAGCTGATGCTGCAATGGCACAAGCACATCTCAAGGCTGAAATGAAGGCTGAA
CTGGAAAAATTTTCACGGGAGAAAAGGGATCTTTCAGAACGCTTGCAAGAAGCAGAAAATCAACTAGAGTGGGTTCGATCAGAGCGAGCTGAAGAAATTGCTAAGTTAGCTGCTGATAGGAAGGTCCTTCAGGACAATTTGCGTGATGCAGAAACACAGCTTACACAACTGAAGACTCGTAAACGTGACGAATTAAAGAG
GGTTGTCAAAGAGAAAAATGCACTTGCCGAGAGGCTAAAAAGTGCAGAGTCTGCAAGGAAAAGATTTGATGAAGAGCTGAAACGATTTGCAACAGAAACTGTAACCCGAGAAGAAGTGCGACAATCATTGGAAAATGAGGTAAAACGTCTTAGACAAACAGTTGGACAGACTGAAGGAGGCCTAAGAGAGAAAGAAGATC
AGATTATGCGATGCGAAAATTATATTGATGGGTTGGAGTCAAAATTAAATGCATGCCAGGGATACATTCAATCTTTGGAAGCATCTCTACAAGAAGAGATGTCTCGTCATGCTCCACTTTATGGAGCTGGTTTGGAAGCTCTTTCGATGAGTGAACTGGATACGATTATCAGGATACATGAAGAGGGGCTTAGACAAGTC
CGCACTGTTCAACAACAGCGGAATGGAGGAAATGATATGTTACTAATAAACTTGGATCCATTGGCGAGTCATGCACCAGTTATTCCACCACTGAGCTTGTACGGCACACCTCCTTCGGTGGCTGTGGGAATGCCATCAATAATTGTAAATGGTCCCGGGATTCACAATAATGGTCATCTGAATGGCACTGTTGGTCCATG
GTTTTCTTCAGCTTGAGAAATTGGTGTCTGTCACATATTTATTTTCTTGATGGGTTGATTAAATTGCTCAGCATCAGGTAATACAAATTTATCTGTTCTTGCTTTTGTAATTTACACATGAAATTGGTATGAAGCCTTAGAAGGCGGCTGTGGTTTTCAAGAAAATAAACAGCTCAAATGTATATTTCTTGATTTCCAAG
AGTTAATTGTAAATTGGCAAGAGAGCCAACATATTTGTAAAATCAGCATTTTGGAATGGGGCTTGTTTTATGTGAAGTTACGTAAGAAAAGCACCCCATGATCGTTGGAGCATATGGCGGTAGAGTTCATTATTTTTCTCTTTTATAAGATTTCAGAGGAACCATATTTACAAGATGTTTGCATTGATGTATGCAAAATT
CAACAACATTAGAATTTGGGGTTTGATATATTCATCCAGTCCATACGTCCACTGTAACAGGTTTTCCGTTCAATGCCTTTTGAAGCAGTAATGTAGGTATTCTTTTCTACATCTTTGCTGAAGAACACTTGGAGATGCAATAGACAAAATTGTCTCGATGGTCTCCCGAAACATGTTTTATTCATCTAACAATGATGTTG
CTGTCAAAATTTTCAATCAACTGTTTCCAGTAAGCAATTGAAGGGTTTGCTTGTATCATTCGCTGTGAAAGGTGACTATGACATCTTGAAACGGAGGAGAGTCAATTGGGGCTTTGCTGAAACTGATAAATGCATGTAATAGACAGTGGAGCTCTATTTCTGAGATGAGTTTACTAGATGCAAAGAACCTGGATTGTGTT
TTAATAGATCTTATATTATGATCTATTAAGTGCTGAGACGGATAAAAAACACCAGATACAAACTTAAATTTGTTTCTATACCCTTCTCAACCGCTTAATAGATCCTGATTTAAGATCTTTTATAGTGTATTTATAGTTGTAAAAAATGAGGTAAGATAAATAACATGTCTTTTCTTCGAAATTATGGTAATTAAGAGAAA
GAATACATTGC
Intron 2 GTATGATTGA ... GTTGTTGTAG
| Sample | Retention score (%) | Exon junction reads | 5'ss reads | 3'ss reads |
| A1 | 17.42 | 64 | 22 | 5 |
| A2 | 18.45 | 42 | 8 | 11 |
| A3 | 17.57 | 61 | 16 | 10 |
| A4 | 23.46 | 62 | 21 | 17 |
| A5 | 24.24 | 25 | 13 | 3 |
| A6 | 12 | 11 | 1 | 2 |
| A7 | 12.94 | 37 | 7 | 4 |
| A8 | 21.74 | 9 | 3 | 2 |
| A9 | 18.64 | 24 | 8 | 3 |
| A10 | 13.04 | 20 | 3 | 3 |
>TRINITY_DN103894_c3_g1_i7 from sample A4 / Example spliced isoformTGGAAAGAAGTTAACAGGAGGAGCAGCAGCAGTGCTCAGCAGTAATTAGAGGAAGCCAAAGGCAGGGAATAACAGAGAAGAAAAACATAAACACAGAAGAAGAATCATCAACCATACTGGTAGCAGCAGCTTCAAGTAAGTCTGATAGAAAACAATTTTTTTAATCTCAAACACCCATTAATTTTTTCCCTCGTTTTTTC
AAAACCACTTTGCTGGGGGCCTCGATTATTTCAATAATTTTGCCACAAAAATCTCCACACCTGCTGCAATTCAACAAGATCCAATATAACCTAAGAGGCATTATCATCGGTGGCCGGTCACATGCATTTTATCAATCAATGCGAGGGTTTCTGCAGCTCTGAGTCAGTGGGGGGTTATTGATTTTGGAGACTCAGCTTTT
ATTATTTTTAGGGCAGTGGGTCATATTATATTTAGGGATGAAGCAGGTCGAGGAGCTGGCGGCGTCTTCGTCTGGGGGTTTGGATAATTCATTGGCATTGAACAGCCGGATAGAGAAAACAGTGGCCAGAGGAGGGGAAACTGCAGAGGAACCCAGAGAAGGGGGGCAGGAGAATGTGTTTGTGGAGAGGAGAGGGGATT
ACTGTGCAGTCTGCAGGTGGAATATTGCGCAGTTTAGCAGGGTAAAGGCCAGGGCATTGTGGAGTCGGTATTTTGAAGTGGGGGGTTATGATTGCAGGCTTCTCGTGTATCCCCGGGGCGACTCACAGGCGCTTCCAGGGTATCTTTCCATCTATTTGCAGGTGATGGATCCCCGAGGATCGGCTTCGTCGAAATGGGAT
TGTTTTGCTAGCTACAGATTGATTGTGGTGAATCAGCGCGACGAGGCGAAGTCGATACAGCGTGATTCCTGGCATCGGTTTTCCACCAAGAAGAAGTCCCATGGCTGGTGTGACTTTACACCCAGCTCGACAGTCCTGGATCCCAAGGCTGGTTTCCTTCTGAATGACACGATCGTTGTCTTGGCGGAGATTCTTGTCCT
ACATGAGTCTGTGACGTTCTCCAGGGAGAATGAATTGCAGCCGATTGCCGGCCCCATGCCAGAGGTCCTGAGTGGGAAGTTCTTGTGGAAGGTGCACAATTTGTCTCTGTTTAAGGAGATGATCAAGACGCAGAAGATCATGAGCCCTGTGTTTCCGGCCGGGGAATGCAATCTGCGGCTCAGTGTGTACCAATCGTCTG
TTAATGGCATCGATTATCTGTCGATGTGCTTGGAGAGCAAGGATACCGATAAGTCTGTTGTTACAGAGCGGAGCTGTTGGTGTCTCTTTCGCATGTCCGTTCTGAATCAGCGAGCTGGGATGAACCATATGCATCGGGATTCCTATGGCCGATTCGCAGGGGACAATAAGAGTGGTGACAATACGAGCCTTGGATGGAAC
GATTACATGCTAATGACAGATTTTGTATCTCCAGAGATGGGTTATTTGGTGGATGACACTGCTGTTTTCAGCGCTTCATTTCATGTCATCAAGGAGTCCAGTGGCTTTACTAGAAACCTTGGAACCGTAGGTGGAAGAAGCAATGTCAGAAAATCAGATGGTCATCAAGGGAAATTTACATGGAGAATTGAGAATTTCAC
AAGGTTAAAAGACATCCTTAAGAAAAGGAAAATAACGGGCCTATGTGTCAAGAGTAGGCGATTTCAGGTTGGCAACCGCGACTGCCGTCTTATTGTGTACCCTAGAGGGCAATCACAACCCCCTTGTCACCTTTCAATGTTTCTCGAAGTTACAGATCCTCGTAACAATTCTGCTGATTGGAGTTGTTTTGTCAGTCACC
GTTTATCAGTTGTGAATCAAAGATCTGAAGAAAAATCGGTTACAAAGGAGTCTCAAAACCGTTATTCAAAGGCTGCTAAAGATTGGGGTTGGCGTGAATTTATTACCTTGACTAGTCTCTTTGACCAAGATTCAGGGTACTTGGTGCAAGACACAGTGGTCTTTTCTGCAGAGGTTCTCATTTTAAAGGAGACCTCTATA
ATGCAGGAGTGCTCAGATCATGAAGTAGATTCCAATGTCTCTAGAAGTGAAGCTGGAAGAACTGTAAACAAAGGCACCTTCACATGGAAGGTTGAGAACTTTTTAGCTTTTAAAGAGATCATGGAGACAAGGAAAATCTTCAGCAAATTCTTTCAGGCTGGTGGTTGTGAGCTACGCATAGGTGTCTACGAGTCGTTTGA
TACTCTATGCATATACTTGGAAAGTGACCAATCTGTTGGAACTGATCCTGATAAGAATTTCTGGGTGAGATATCGGATGGCAGTAGTGAATCAAAAACACTCTGATAAAACTGTCTGGAAGGAGTCATCCATATGTACAAAGACTTGGAATAATTCAGTTCTACAATTCATGAAAGTCTCTGACATGCTGGATCCAGATG
CAGGGTTCCTTACACGTGATACAGTTGTGTTTGTATGCGAGATTCTGGATTGTTGTCCTTGGTTCGAGTTTTCTGATCTTGAGATGATGAGCAAGATGCACTGTCAACGGATCCAGATGAGCTTATTGATTCTGATGACAGCGAAGGAATCAGCGGGGATGAAGAAGATATTTTCAGAAGCCTTCTTGCCAGGGCAGGTT
TTCATCTTACATATGGTGATAATCCAACTCTTCTACTAGACCCATCTCAGCTGCAAGTTACATTAAGAGAAAAGTTATTGATGGATGCTGGTGCAATAGCAGCCTTTTTGACTGGTCTTCGAGTTTATTTAGATGATCCAGCCAAAGTGAAGAGGCTTCTGCTTCCAACAAAATTGTCATCTGCTACTGGTGGGAGTAAA
AGTGGTACTAAAGGAGAAAACTCATCTCCTAGTCTTATGAACTTGTTAATGGGTGTGAAGGTATTGCAACAGGCTATTGTTGACCTACTTTTAGATATAATGGTAGAATGCTGTCAGCCAACTGAAGGAAAGAAGAACAATGATATTTCTGATACAGGGTCAAAAGATATTTTGGATGCCAATGGAAATTCTATTAGTAG
AACTAACGTGGAATTACAAGGTACAACTGGAAAAAATGGCATTGCACAGAGTCCAATTGGTCAACGTTTAGATGTCAGTCTCGATGGGGCATTGCAAATGCAGGCAGTACAAAGCAGTGATTCATTGGAATCTCTGTTGGCAGGGAAAGCTGTTGTTCCGCCTACTTCAACGGTGCCAGAATCAGGTGTACAGTACTCTT
CACCAGTAAACAATGCTAACCAAATGCTAAAGCCTAAATGTCCGGAGCAGTCTGATGAGCTGTTAAGACTGATTGTCAACTCCCTGAGGGCACTGGATGGTGCTGTGCCACAAGGCTGTTTAGAACCTCGGCGGCGACCAGAATCGGCACAGAAGATTGCTTTTGTTCTGGAGAGGTCTCCTAAACATTTGCAGCCAGAT
TTGATTTCGCTGGTGCCAAAACTTGTGGATGCATCTGAGCATTCGCTGGCTGCATATGCATTGTTAAACCAACTTCGCAAAACAGATGCAGAACCAGCTTTATGGCTACCTGTACTGGGTGCACTCAGTCAGCTGGAGATCGGCAACGAGGTGTGGGAACAAGTATTGTGTGAAGGTCTTGGAATGCTGTTGGTTTACGA
CGATGAGTCTCTTACTGCTGTTATAAGTACTATTTTCAAGGCTGCATCTGGGTGTCAACAAGTACCTCAAGCGGCAGGAGCAGTCCGTGGTAGACTGAAGAAGTTAGGAGCTGGTGTGTCTCCTCAGATTCTAGATTGTCTAAGAAACATAGTTGCTAGTCAGGCAGATGTCGCTGAAGCTCTACTGAGAGACATTGATT
CTGATAGTGAAAAAGGTGAAAACGATTTCACAGAACCCACATCCATTGATGTGGTTGCTGATAACGAGAGTAGAGGTGCCGCAGGAAAATTACAGTTGACAGCAGAGCATGTGGCAAATGCATGTTGGCGTCTTGCAGATGTGTACATTCTTGTAGAGTTATTATTGGTACCTTCTCTTAGAGAAAAAGCACAGCATGTG
TTTGAGAGAGCTATTGCTCGTGGGGCATTTGGGGAAAGGTCAATAGCAATGTTCATAGAAAGACGACATTCACAGAGGCCAATTATAGATTTCAGATGTAATGTTTCAGATAATCAGAGTTCACAGGCCTTTAGTACAGATTCTTCCGTTCAGCCCTTGCCTGAAGAGGATGAGGACTTCCCTGCTGTGCTTGGACTTGC
TGAAGTGTTGATGCTCAGTAGGGACACTCGAGTGAGAGAATTTGTGAGTACTTTGTATGCAGTAATGTTTAAAGTATATCAAAATGAGGGTTATCGGGATCGGATGTTGAGGGGACTAGTTGAGTGTGCAAGCAGAAACACAAATGGTCATCATGAAATGGACCTTGGCATGGATATTCTGGCATTTCTTTTACGAGAAG
AGGAAGGAACTGCAAGACCTGTATTAAGCATGATGCACGAGGCAGCTCAACTCGCCAATGTTGATCGAGCTGCTATGTGGCAGCGGTTGTGCGTGAGTGAAGAAGAATTAATTCGGGTTCGTGAAGATAGACAAGATGAAATTGCTAATATCAGTAAAGAAAATGTGCTTCTATCCCAAAGATTAGCTGATGCTGCAATG
GCACAAGCACATCTCAAGGCTGAAATGAAGGCTGAACTGGAAAAATTTTCACGGGAGAAAAGGGATCTTTCAGAACGCTTGCAAGAAGCAGAAAATCAACTAGAGTGGGTTCGATCAGAGCGAGCTGAAGAAATTGCTAAGTTAGCTGCTGATAGGAAGGTCCTTCAGGACAATTTGCGTGATGCAGAAACACAGCTTAC
ACAACTGAAGACTCGTAAACGTGACGAATTAAAGAGGGTTGTCAAAGAGAAAAATGCACTTGCCGAGAGGCTAAAAAGTGCAGAGTCTGCAAGGAAAAGATTTGATGAAGAGCTGAAACGATTTGCAACAGAAACTGTAACCCGAGAAGAAGTGCGACAATCATTGGAAAATGAGGTAAAACGTCTTAGACAAACAGTTG
GACAGACTGAAGGAGGCCTAAGAGAGAAAGAAGATCAGATTATGCGATGCGAAAATTATATTGATGGGTTGGAGTCAAAATTAAATGCATGCCAGGGATACATTCAATCTTTGGAAGCATCTCTACAAGAAGAGATGTCTCGTCATGCTCCACTTTATGGAGCTGGTTTGGAAGCTCTTTCGATGAGTGAACTGGATACG
ATTATCAGGATACATGAAGAGGGGCTTAGACAAGTCCGCACTGTTCAACAACAGCGGAATGGAGGAAATGATATGTTACTAATAAACTTGGATCCATTGGCGAGTCATGCACCAGTTATTCCACCACTGAGCTTGTACGGCACACCTCCTTCGGTGGCTGTGGGAATGCCATCAATAATTGTAAATGGTCCCGGGATTCA
CAATAATGGTCATCTGAATGGCACTGTTGGTCCATGGTTTTCTTCAGCTTGAGAAATTGGTGTCTGTCACATATTTATTTTCTTGATGGGTTGATTAAATTGCTCAGCATCAGGTAATACAAATTTATCTGTTCTTGCTTTTGTAATTTACACATGAAATTGGTATGAAGCCTTAGAAGGCGGCTGTGGTTTTCAAGAAA
ATAAACAGCTCAAATGTATATTTCTTGATTTCCAAGAGTTAATTGTAAATTGGCAAGAGAGCCAACATATTTGTAAAATCAGCATTTTGGAATGGGGCTTGTTTTATGTGAAGTTACGTAAGAAAAGCACCCCATGATCGTTGGAGCATATGGCGGTAGAGTTCATTATTTTTCTCTTTTATAAGATTTCAGAGGAACCA
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ATGTCTTTTCTTCGAAATTATGGTAATTAAGAGAAAGAATACATTGC
>TRINITY_DN103894_c3_g1_i1 from sample A4 / Example unspliced isoform:TGGAAAGAAGTTAACAGGAGGAGCAGCAGCAGTGCTCAGCAGTAATTAGAGGAAGCCAAAGGCAGGGAATAACAGAGAAGAAAAACATAAACACAGAAGAAGAATCATCAACCATACTGGTAGCAGCAGCTTCAAGTAAGTCTGATAGAAAACAATTTTTTTAATCTCAAACACCCATTAATTTTTTCCCTCGTTTTTTC
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CGCACTGTTCAACAACAGCGGAATGGAGGAAATGATATGTTACTAATAAACTTGGATCCATTGGCGAGTCATGCACCAGTTATTCCACCACTGAGCTTGTACGGCACACCTCCTTCGGTGGCTGTGGGAATGCCATCAATAATTGTAAATGGTCCCGGGATTCACAATAATGGTCATCTGAATGGCACTGTTGGTCCATG
GTTTTCTTCAGCTTGAGAAATTGGTGTCTGTCACATATTTATTTTCTTGATGGGTTGATTAAATTGCTCAGCATCAGGTAATACAAATTTATCTGTTCTTGCTTTTGTAATTTACACATGAAATTGGTATGAAGCCTTAGAAGGCGGCTGTGGTTTTCAAGAAAATAAACAGCTCAAATGTATATTTCTTGATTTCCAAG
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