sp|Q9FJD0|VP26A_ARATH ----> Vacuolar protein sorting-associated protein 26A

Intron 1 GTAAGTGTTT ... TTTGCTCCAG

Sample	Retention score (%)	Exon junction reads	5'ss reads	3'ss reads
A1	30.43	8	4	3
A2	33.33	1	1	0
A3	0	1	0	0
A4	0	1	0	0
A5	-1	0	0	0
A6	5.88	32	1	3
A7	20	6	0	3
A8	36.36	14	6	10
A9	0	10	0	0
A10	14.29	3	1	0

>TRINITY_DN83305_c0_g1_i1 from sample A1 / Example spliced isoform

AATGCTCTGGTAATCTTTTAAACCCGAATGGTAGAATAAATTCTTTCGGGATTAGTCAACAAAAAGTACATTACTTGAATATGCCTAATGGGTGCTCGACAATATCTCATATATGATTTCCCTCACAGAAGACCTAAACGAGAGATCCAGAACAACAGCTGTATCATAATTTTGATTTGTTTTATGACAATGATGTAATT
CCTTTTATTTGATGAACACATGTTAACTTCTTTTGCCCTTTTTTTGTTGTTTAGTTTATTTGAAACCAAATTTATTAAATGTTGACATTTCTGGCTATTTGAGAGTGTGTATGCAGCTCATTCTCTATCGAATTTGAACTTCAAGTCATTGTAAGTTTTGTGTCTGAACTGTCAAAGTTTTATTCACAACCTGAGTTGAC
CACTTCAAGACCATGGGTGGCTTTTCAAAATATACCTCTTAGACTTGTCCGTGCAGAAAGAGAATATGACGCATGAGCACAGATTCATGATTCCAATGGTATGAAACGTTAAGTAGATTTGGTAACATGCTTCCATATATTGTTGAAATTGTTAGCAAGTATTGTTGTTGAATTTATTATTTCTTTGGGTATATTTATGA
AGCTTTGTGTTATATAAATCTATTTGGAAATGCATATTTGATTAACAATGAAAGCGCTAATGATTAATAGTGAATCACTCGGGCAAATATTTGTTACATTAGTAAAAGTCAAATATTACTGGAGACAATTGTAACCGACAGTTGTAACCGATGGAAGGAATTAAAAACTTTAATTTTGTACATTTTTTTTGAGAAAATGG
CCA

>TRINITY_DN83305_c0_g1_i2 from sample A1 / Example unspliced isoform:

AATGCTCTGGTAATCTTTTAAACCCGAATGGTAGAATAAATTCTTTCGGGATTAGTCAACAAAAAGTACATTACTTGAATATGCCTAATGGGTGCTCGACAATATCTCATATATGATTTCCCTCACAGAAGACCTAAACGAGAGATCCAGAACAACAGCTGTATCATAATTTTGATTTGTTTTATGACAATGATGTAATT
CCTTTTATTTGATGAACACATGTTAACTTCTTTTGCCCTTTTTTTGTTGTTTAGTTTATTTGAAACCAAATTTATTAAATGTTGACATTTCTGGCTATTTGAGAGTGTGTATGCAGCTCATTCTCTATCGAATTTGAACTTCAAGTCATTGTAAGTTTTGTGTCTGAACTGTCAAAGTTTTATTCACAACCTGAGTTGAC
CACTTCAAGACCATGGgtaagtgtttatgaaaccatgtacctccaagattaacaatgaatatctatcatgtgatagttaaaataatgcaccgttgtattctttattttattgcttgtttttttaattgattattttgaaatgcttggaatgtactttgctccagGTGGCTTTTCAAAATATACCTCTTAGACTTGTCCGT
GCAGAAAGAGAATATGACGCATGAGCACAGATTCATGATTCCAATGGTATGAAACGTTAAGTAGATTTGGTAACATGCTTCCATATATTGTTGAAATTGTTAGCAAGTATTGTTGTTGAATTTATTATTTCTTTGGGTATATTTATGAAGCTTTGTGTTATATAAATCTATTTGGAAATGCATATTTGATTAACAATGAA
AGCGCTAATGATTAATAGTGAATCACTCGGGCAAATATTTGTTACATTAGTAAAAGTCAAATATTACTGGAGACAATTGTAACCGACAGTTGTAACCGATGGAAGGAATTAAAAACTTTAATTTTGTACATTTTTTTTGAGAAAATGGCCA