NA ----> NA
Intron 1 GTTAGTATCT ... TATTTTGCAG
| Sample | Retention score (%) | Exon junction reads | 5'ss reads | 3'ss reads |
| A1 | 18.18 | 324 | 3 | 72 |
| A2 | 22.6 | 250 | 3 | 73 |
| A3 | 19.95 | 325 | 0 | 81 |
| A4 | 21.51 | 197 | 2 | 54 |
| A5 | 16.54 | 106 | 1 | 21 |
| A6 | 21.43 | 1067 | 1 | 291 |
| A7 | 20.92 | 1172 | 1 | 310 |
| A8 | 21.63 | 1127 | 0 | 311 |
| A9 | 21.8 | 1202 | 2 | 335 |
| A10 | 20.77 | 931 | 0 | 244 |
>TRINITY_DN44107_c0_g4_i2 from sample A6 / Example spliced isoformGCGGATGATCGGAATTTGGAAAACCGATGACAGAGAGCGCATGTGGGAGTCGGGCGGAGAGGGATGGAATTTGACGGGCAAATTGCCCGTCAAATACGGTGAGAAATTTGCTTAATCGTCACAAATCTTCAATCAAATGCTGAAAACGTCTTAGAAAATGGTTGAAACCGTGGATTGGATTTGAAATTCCAACGAACAAC
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GCCAAGCCCTGCATGAATGGTCAGTGATCTCCAGGCCGAAATCTCCTCTTGGTAGTTCTATCAGGCGTTGATTTCAAAATGTTGCTCCGTAGTTCATCCACCCCTGCGCTGAATTCTCTCATTGGGATTCAAGCAGAATCAGAATTGAATTCGCACAGGTCTGTTCAGTTAACCCAATTACATGTTGCAGGTAATGGCGA
TGGCAAGTGGTCTCATCATGATGTACAGACCAGAATCGGAAGGACCCTGTCTGAAGCTGATTTACATAAGCCCATATCATCTAATGGTAATGGTAGTCCTAGTAGGCTGGGGCTAAAGAGAGGGTCTGGTTCTATGGACCTCTGTAGAAATCTCTGTACAGAAAGTTTTCTGAGCAACTGCTTATTGGAGGAGGCTCCGG
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GAGGTTCTTGCAGGAGATCCAGCATGATCTCAAAAAAGCTGAGGAATATTATGAGAGGGCCATACTAGCCAGTCCGGGTGATGGAGATATCCTCTCTCTTTATGCCAATCTAATATGGGAGGTTTACAAAGATGCACCTCGTGCGGAATCCTACTTTGATCAAGCTGTTGAAGCTGCTCCAGATGGCTGCAATGTTCTGG
GATCATATGCCTATTTCCTATGGAATACAGAAGATGATGAAGAGGATCAGGATACTTTTCAGCATCAGAAAATGGTACCCACAACATATTTTGGTACTGCGAGTATCGCAGCTACCTGATCACATCAGCGCCCTAATTGGAATTTGGCTTAAATGAACAGAGCCATTATATTTGCCAAGCCACTCTGAGTTTGCCATGAT
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TCTCCTTGGTAGCAGTGGTAATCTACCAGAGACATGGACTGCCCTTGCAGGGGTAAGTGAATGGGAGAAAAATTGATTGGACTTTTAATATGAAAGGGGGGTTAGCCGAAGAAGAATTGGTTCATCTGAGGCTGTAAATGTTTTTTGTGCTGTAAATGTTTTTTGTAATGGTTCCTGGATGCAAATTAGATGGCCTGTAG
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>TRINITY_DN44107_c0_g4_i1 from sample A6 / Example unspliced isoform:GTTGAAGCTGCTCCAGATGGCTGgttagtatctttactttctctctattgatttatccaattatctccattctcgtgtatcgtttttattcttaaatatcccccagttttcacatgcattgctttgtttggattgtatggtattaagtctagagattcatagctgaggatttggtgggttgtcagtatgatgtttctata
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TCAGGATACTTTTCAGCATCAGAAAATGGTACCCACAACATATTTTGGTACTGCGAGTATCGCAGCTACCTGATCACATCAGCGCCCTAATTGGAATTTGGCTTAAATGAACAGAGCCATTATATTTGCCAAGCCACTCTGAGTTTGCCATGATCAGTGCTGCAGCTCAGATTTAGTCTGCCATGATCAGTGCTGCAGCT
CAGATTTTGGTTGTTACAGAATCATCCCTTTATGCATAAATGGTATGCCTAGATGATCTTTGTAGGCATCATTCGAAAAATATTTCAATTGGGAGGTTCGTGTATGTGATATGGCTCTGCACTATGTGAAGCTACAAGGGATGTTTTCTGATGATCTCCTTGGTAGCAGTGGTAATCTACCAGAGACATGGACTGCCCTT
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GGTTCAGAGCTTTCAAACTCCGGTGAAAATAGGCGCTTAACAAGCATGGAATTATATAAAATTTTGCTAAAAAATCATACAATGTCATGTAACATTTTTTTATGAACGAAATGGGTGCCGAGTTTGTTGGTTTG