NA ----> NA


Intron 1 GTTAGTACTT ... CCTGTACCAG

SampleRetention score (%)Exon junction reads5'ss reads3'ss reads
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A962.63435633825
A1057.36375381628



>TRINITY_DN108666_c0_g1_i4 from sample A4 / Example spliced isoform
AACAGATCGGCCGCTTCTTCATGTTTGTTGGTTTGCAGAAGAAGGTCCACTTCTGTTCGTTTGTTCTCATTTGGACCGTGCAAGGTTCCCCTATATCATTGGCTGTATCTCTAGGAAGTATTATTTGAAAGAAGATCCACTTCTGTTCGTTTGTTCTCATTTGGAGCGTGCAAGGTCCCCTATATCATTGGCTGTATCCC
TTGGAAGTATTATTTGAGTCGTGCAATCTCTTCATTACCTGTTTATCTGGCGTATTTGTCATTTAATGGAAGGGATTATAATAGGTCACCCAATATGTTATACAGGGTTTTAGCTGTTAAAAGTAGTTGTTTTAGCAGTTTCTATGCTTTTATCTATTACCGTGTCCGATTTGAGAGATTGTTGATCCTTCTGTTGCAGT
GGGATTATGCATATAAGAGGATAGTAATGCGATCACGGGGTACGCACAGATTTCTCCTGCAAATCTTTCAACACTGGAGATCCGAGCGTTAATGTGACAGTAGGGATGCATATCTTGTAGTAGGGAATTTTTATGTTTTGGTTAAGTATTAGTAGATTTGATCATTTATTCATCTTTTAGGTAGTTTGCCAATGATATTG
TTCAGATCTGCAACCGTAAGCTTACATTGTGAAAATTGAGAGACTTGGTGATGTTGGAAAGCAATGATCAGAATTTGGGCCAACTTGTTTACTTCCAAATACATCTCTCAAGAGGTCTGTTGAACGTTTTTAAAGTTTCTGAAATTTTAGATGTGTAGTGTTTCTTGTCCTCTAGAGGACTTGTGCTTTAATATTCCATG
CCTAGTATTCTCAGAGGGGAGAATTCGTAATATGCCATGCCTAATATTCTCAGAGGGGAGAATTCGTTTAAAGACAGATTCGTTAAGTAATTTTTTCCAACGAGCCAAGTCTAGAAAGCCACGACGCCGTGAAACCAACAGCATACATGTAAACGGTCCGTAGGTAATGTGATCTTTATTCTTTGATGTAGTCTAGATTC
TTTTTTATTGTTTATTTTTAATGAGATCTGTATATTATGTATAGTATGTCGAAAAACATTATGCTGTTTAGGCATGCAGATCAACGTTGTGCGGTTGAGGCATGCAGATCATTTCGGAGTGGCAAACAAATCACTATCAACAGAAAAGCTGGTGGAAATTGGGTGTGATGGTCTGAACGTGTGATTTAGTGATAATTGTT
CATACGATGGGTCTTTTACTCTTCGGAAGCCTTTTGGACTTTCCTTTTGCATTCGTCAGATCTGTACTAGTGGTTTCTAAAATCCAGGATATATGTACTGTTGAGTCGTCGACTCCATATAATAGCCTTCAAATGGAAGAGTGCTCTGTATGTGTATAGATGTTGCAGTATCAAATCTGTTATGTTAATACCGTTGGAGA
GTACATCCGCAGTCTGGCCATTTCTTTCAATATCTTTTGGAGAGACTTCAAATTGGCTCATTCTACTATGTTTCCACCAGGATGTGGCATGGGCTATGGTGAACAGTAGTCCCAGTATCTGTTTAGATATATTTTCTATGGTATTGTTCTTGGATGTTCAAGACGGACGCTTGCCTTCAAGCGAGGGCCATTGTTCTATT
TCTGGTTATCCTTTAGGGGGAATGTAAAGATGATATGATAATGAAGGTGCATCACTATCAATTTGGTGGGCACTTCGATGAAGGGCTTGGTAGACGTCAAAATATCATCGTCACTCTAGCTGTAATGAAATTAAGAAGGAGAGATATACCTACTTTTTCACCTCTGTATGTCTCCTGTGGTATTAATCATAAATTGGTAT
CTCCCGGTATAGGGCTTGAGAGATGCTTACCCCATGTGCCCTGTTTTTCGTCACCATGTGGATATTTTCTATCACTATTTTCTTCAAGCTAGTGTGCCGGGGTATCTTTCTAAGGTCTTCCTTCAAGCGAGCGTGTCTGGAATTTTTCTCACGTCTTCCTCAGGCGAGCGTGTCTGGAATTTGTCTCAGGTCTTCCTCAG
GCGAGCGTGTTCTTGGGTCTCTCTTCAGGCGAGAGTGTTTATTTTTTCTAAAGTCGTCAGACGGCCAAGCGTGGTTTCAGGTCTCTCTTCAGGCGAGTGTGAAAAGACTGCATATTGGCTTCCTCTACTTTACCAACCAAAGCTCCCGAATGTTTGCAGATTTCATATACCAACCAAAGCGTTGCAGATCTAATGTATTT
GGCTTTCACTTTTGCTATCTTTGGGAATGGTTATCACTCGGGATTGATTTTTGTACATTATGTAGCCTGTTCTGTATTATTTTCATGGGAGTGTCGCCATCTATTTGTCTTATATCAGCGAGCAAGTTGGAAGATACTGGAATGAGGAAGATTAGGATGAACACTATAATATATTATTGTGAGGATAATGTATTGCTGTC
AGAAACAGGGCAGTTTGACGAGAACACATAATTGCTTCTTCTCTCTCTACATTTACCACCGAAAGCTCTCCTCTACAGAACGCTTCTCTCTCTACATTGTCCACACAGCTTTCGGTATGGTAGCAGATATATCAAACTGCTGTCTTCAACCCTTTCCTTTGGATTTCCCTTTTGGTATTGACCTAGGGTATTTTATGTGG
CCTGTTTGGTAATTGTTTGTCTCCTTGGGGCTGATATCAAATTCTTTGCTTCTTTTGAGATATTCCTCGCCCTCAAAGGGCTTGATATTGATATTGATATTGATATTATCTGTTTACATGTTTTTACCAAAGATAGTTGTAGCTATAGTATGTGACGTGTTTGAGCCATATAGTCTATCCTAGTACACGCTTTTTTCAAA
TCTGCTATGCTTTTGGTGCAAAATAATGAATGGCGATTTCCAAGTTGTGCATGTCAGTATGGTGTTTCAATTAAGGTTTTGTTCTACAAGTCTGCCAAAACCAGTTTCATTTAGAAACTATTACGAAAAGTATTGCGAAAAGTATTGTAATTGTCGGTTGTAAGCACAATAGGTGAAGAGAGTTTTATTCTGTTAGAGGC
GTTTTACAGATATGTTCCCTGTAATACAAGAATCTAATTTTCATATTGTCTTTGCAAAACTAATATAAACAGGTAGAATTTTAATTGTTAAACAAGAATCTGTGTTTATACACCACACTAGGGTGGTCTAATTATCTAAGCAATGACCACATGTTCTATATCCATTGCTACAAGCCATCTGACTTTATTTTTATTGCTTA
TCGGAAAGCTCTAATTTATTAGCTCGCTTTCCTTAATTTGGTGATGTTCTTTCTTAATTTGGA


>TRINITY_DN108666_c0_g1_i2 from sample A4 / Example unspliced isoform:
AACAGATCGGCCGCTTCTTCATGTTTGTTGGTTTGCAGAAGAAGGTCCACTTCTGTTCGTTTGTTCTCATTTGGACCGTGCAAGAAGAAGATCCACTTCTGTTCGTTTGTTCTCATTTGGAGCGTGCAAGGTCCCCTATATCATTGGCTGTATCCCTTGGAAGTATTATTTGAGTCGTGCAATCTCTTCATTACCTGTTT
ATCTGGCGTATTTGTCATTTAATGGAAGGGATTATAATAGGTCACCCAATATGTTATACAGGGTTTTAGCTGTTAAAAGTAGTTGTTTTAGCAGTTTCTATGCTTTTATCTATTACCGTGTCCGATTTGAGAGATTGTTGATCCTTCTGTTGCAGTGGGATTATGCATATAAGAGGATAGTAATGCGATCACGGGGTACG
CACAGATTTCTCCTGCAAATCTTTCAACACTGGAGATCCGAGCGTTAATGTGACAGTAGGGATGCATATCTTGTAGTAGGGAATTTTTATGTTTTGGTTAAGTATTAGTAGATTTGATCATTTATTCATCTTTTAGGTAGTTTGCCAATGATATTGTTCAGATCTGCAACCGTAAGCTTACATTGTGAAAATTGAGAGAC
TTGGTGATGTTGGAAAGCAATGATCAGAATTTGGGCCAACTTGTTTACTTCCAAATACATCTCTCAAGAGGTCTGTTGAACGTTTTTAAAGTTTCTGAAATTTTAGATGTGTAGTGTTTCTTGTCCTCTAGAGGACTTGTGCTTTAATATTCCATGCCTAGTATTCTCAGAGGGGAGAATTCGTAATATGCCATGCCTAA
TATTCTCAGAGGGGAGAATTCGTTTAAAGACAGATTCGTTAAGTAATTTTTTCCAACGAGCCAAGTCTAGAAAGCCACGACGCCGTGAAACCAACAGCATACATGTAAACGGTCCGTAGGTAATGTGATCTTTATTCTTTGATGTAGTCTAGATTCTTTTTTATTGTTTATTTTTAATGAGATCTGTATATTATGTATAG
TATGTCGAAAAACATTATGCTGTTTAGGCATGCAGATCAACGTTGTGCGGTTGAGGCATGCAGATCATTTCGGAGTGGCAAACAAATCACTATCAACAGAAAAGCTGGTGGAAATTGGGTGTGATGGTCTGAACGTGTGATTTAGTGATAATTGTTCATACGATGGGTCTTTTACTCTTCGGAAGCCTTTTGGACTTTCC
TTTTGCATTCGTCAGATCTGTACTAGTGGTTTCTAAAATCCAGGATATATGTACTGTTGAGTCGTCGACTCCATATAATAGCCTTCAAATGGAAGAGTGCTCTGTATGTGTATAGgttagtactttggtctagatttatggttatttgtactttgttttaaacagatgacaattttgaggctggaatacaatcctgtacc
ag
ATGTTGCAGTATCAAATCTGTTATGTTAATACCGTTGGAGAGTACATCCGCAGTCTGGCCATTTCTTTCAATATCTTTTGGAGAGACTTCAAATTGGCTCATTCTACTATGTTTCCACCAGGATGTGGCATGGGCTATGGTGAACAGTAGTCCCAGTATCTGTTTAGATATATTTTCTATGGTATTGTTCTTGGATGT
TCAAGACGGACGCTTGCCTTCAAGCGAGGGCCATTGTTCTATTTCTGGTTATCCTTTAGGGGGAATGTAAAGATGATATGATAATGAAGGTGCATCACTATCAATTTGGTGGGCACTTCGATGAAGGGCTTGGTAGACGTCAAAATATCATCGTCACTCTAGCTGTAATGAAATTAAGAAGGAGAGATATACCTACTTTT
TCACCTCTGTATGTCTCCTGTGGTATTAATCATAAATTGGTATCTCCCGGTATAGGGCTTGAGAGATGCTTACCCCATGTGCCCTGTTTTTCGTCACCATGTGGATATTTTCTATCACTATTTTCTTCAAGCTAGTGTGCCGGGGTATCTTTCTAAGGTCTTCCTTCAAGCGAGCGTGTCTGGAATTTTTCTCACGTCTT
CCTCAGGCGAGCGTGTCTGGAATTTGTCTCAGGTCTTCCTCAGGCGAGCGTGTTCTTGGGTCTCTCTTCAGGCGAGAGTGTTTATTTTTTCTAAAGTCGTCAGACGGCCAAGCGTGGTTTCAGGTCTCTCTTCAGGCGAGTGTGAAAAGACTGCATATTGGCTTCCTCTACTTTACCAACCAAAGCTCCCGAATGTTTGC
AGATTTCATATACCAACCAAAGCGTTGCAGATCTAATGTATTTGGCTTTCACTTTTGCTATCTTTGGGAATGGTTATCACTCGGGATTGATTTTTGTACATTATGTAGCCTGTTCTGTATTATTTTCATGGGAGTGTCGCCATCTATTTGTCTTATATCAGCGAGCAAGTTGGAAGATACTGGAATGAGGAAGATTAGGA
TGAACACTATAATATATTATTGTGAGGATAATGTATTGCTGTCAGAAACAGGGCAGTTTGACGAGAACACATAATTGCTTCTTCTCTCTCTACATTTACCACCGAAAGCTCTCCTCTACAGAACGCTTCTCTCTCTACATTGTCCACACAGCTTTCGGTATGGTAGCAGATATATCAAACTGCTGTCTTCAACCCTTTCC
TTTGGATTTCCCTTTTGGTATTGACCTAGGGTATTTTATGTGGCCTGTTTGGTAATTGTTTGTCTCCTTGGGGCTGATATCAAATTCTTTGCTTCTTTTGAGATATTCCTCGCCCTCAAAGGGCTTGATATTGATATTGATATTGATATTATCTGTTTACATGTTTTTACCAAAGATAGTTGTAGCTATAGTATGTGACG
TGTTTGAGCCATATAGTCTATCCTAGTACACGCTTTTTTCAAATCTGCTATGCTTTTGGTGCAAAATAATGAATGGCGATTTCCAAGTTGTGCATGTCAGTATGGTGTTTCAATTAAGGTTTTGTTCTACAAGTCTGCCAAAACCAGTTTCATTTAGAAACTATTACGAAAAGTATTGCGAAAAGTATTGTAATTGTCGG
TTGTAAGCACAATAGGTGAAGAGAGTTTTATTCTGTTAGAGGCGTTTTACAGATATGTTCCCTGTAATACAAGAATCTAATTTTCATATTGTCTTTGCAAAACTAATATAAACAGGTAGAATTTTAATTGTTAAACAAGAATCTGTGTTTATACACCACACTAGGGTGGTCTAATTATCTAAGCAATGACCACATGTTCT
ATATCCATTGCTACAAGCCATCTGACTTTATTTTTATTGCTTATCGGAAAGCTCTAATTTATTAGCTCGCTTTCCTTAATTTGGTGATGTTCTTTCTTAATTTGGA




Intron 2 GTAATGTGAT ... TGCTGTTTAG

SampleRetention score (%)Exon junction reads5'ss reads3'ss reads
A163.44497848877
A265.18378613802
A361.62345483625
A467.74266484633
A569.33188372478
A664.78262427537
A761.54374530667
A857.59377423601
A961.5324428607
A1063.65239379458



>TRINITY_DN108666_c0_g1_i3 from sample A4 / Example spliced isoform
AACAGATCGGCCGCTTCTTCATGTTTGTTGGTTTGCAGAAGAAGGTCCACTTCTGTTCGTTTGTTCTCATTTGGACCGTGCAAGGTTCCCCTATATCATTGGCTGTATCTCTAGGAAGTATTATTTGAAAGAAGATCCACTTCTGTTCGTTTGTTCTCATTTGGAGCGTGCAAGGTCCCCTATATCATTGGCTGTATCCC
TTGGAAGTATTATTTGAGTCGTGCAATCTCTTCATTACCTGTTTATCTGGCGTATTTGTCATTTAATGGAAGGGATTATAATAGGTCACCCAATATGTTATACAGGGTTTTAGCTGTTAAAAGTAGTTGTTTTAGCAGTTTCTATGCTTTTATCTATTACCGTGTCCGATTTGAGAGATTGTTGATCCTTCTGTTGCAGT
GGGATTATGCATATAAGAGGATAGTAATGCGATCACGGGGTACGCACAGATTTCTCCTGCAAATCTTTCAACACTGGAGATCCGAGCGTTAATGTGACAGTAGGGATGCATATCTTGTAGTAGGGAATTTTTATGTTTTGGTTAAGTATTAGTAGATTTGATCATTTATTCATCTTTTAGGTAGTTTGCCAATGATATTG
TTCAGATCTGCAACCGTAAGCTTACATTGTGAAAATTGAGAGACTTGGTGATGTTGGAAAGCAATGATCAGAATTTGGGCCAACTTGTTTACTTCCAAATACATCTCTCAAGAGGTCTGTTGAACGTTTTTAAAGTTTCTGAAATTTTAGATGTGTAGTGTTTCTTGTCCTCTAGAGGACTTGTGCTTTAATATTCCATG
CCTAGTATTCTCAGAGGGGAGAATTCGTAATATGCCATGCCTAATATTCTCAGAGGGGAGAATTCGTTTAAAGACAGATTCGTTAAGTAATTTTTTCCAACGAGCCAAGTCTAGAAAGCCACGACGCCGTGAAACCAACAGCATACATGTAAACGGTCCGTAGGCATGCAGATCAACGTTGTGCGGTTGAGGCATGCAGA
TCATTTCGGAGTGGCAAACAAATCACTATCAACAGAAAAGCTGGTGGAAATTGGGTGTGATGGTCTGAACGTGTGATTTAGTGATAATTGTTCATACGATGGGTCTTTTACTCTTCGGAAGCCTTTTGGACTTTCCTTTTGCATTCGTCAGATCTGTACTAGTGGTTTCTAAAATCCAGGATATATGTACTGTTGAGTCG
TCGACTCCATATAATAGCCTTCAAATGGAAGAGTGCTCTGTATGTGTATAG


>TRINITY_DN108666_c0_g1_i2 from sample A4 / Example unspliced isoform:
AACAGATCGGCCGCTTCTTCATGTTTGTTGGTTTGCAGAAGAAGGTCCACTTCTGTTCGTTTGTTCTCATTTGGACCGTGCAAGAAGAAGATCCACTTCTGTTCGTTTGTTCTCATTTGGAGCGTGCAAGGTCCCCTATATCATTGGCTGTATCCCTTGGAAGTATTATTTGAGTCGTGCAATCTCTTCATTACCTGTTT
ATCTGGCGTATTTGTCATTTAATGGAAGGGATTATAATAGGTCACCCAATATGTTATACAGGGTTTTAGCTGTTAAAAGTAGTTGTTTTAGCAGTTTCTATGCTTTTATCTATTACCGTGTCCGATTTGAGAGATTGTTGATCCTTCTGTTGCAGTGGGATTATGCATATAAGAGGATAGTAATGCGATCACGGGGTACG
CACAGATTTCTCCTGCAAATCTTTCAACACTGGAGATCCGAGCGTTAATGTGACAGTAGGGATGCATATCTTGTAGTAGGGAATTTTTATGTTTTGGTTAAGTATTAGTAGATTTGATCATTTATTCATCTTTTAGGTAGTTTGCCAATGATATTGTTCAGATCTGCAACCGTAAGCTTACATTGTGAAAATTGAGAGAC
TTGGTGATGTTGGAAAGCAATGATCAGAATTTGGGCCAACTTGTTTACTTCCAAATACATCTCTCAAGAGGTCTGTTGAACGTTTTTAAAGTTTCTGAAATTTTAGATGTGTAGTGTTTCTTGTCCTCTAGAGGACTTGTGCTTTAATATTCCATGCCTAGTATTCTCAGAGGGGAGAATTCGTAATATGCCATGCCTAA
TATTCTCAGAGGGGAGAATTCGTTTAAAGACAGATTCGTTAAGTAATTTTTTCCAACGAGCCAAGTCTAGAAAGCCACGACGCCGTGAAACCAACAGCATACATGTAAACGGTCCGTAGgtaatgtgatctttattctttgatgtagtctagattcttttttattgtttatttttaatgagatctgtatattatgtatag
tatgtcgaaaaacattatgctgtttag
GCATGCAGATCAACGTTGTGCGGTTGAGGCATGCAGATCATTTCGGAGTGGCAAACAAATCACTATCAACAGAAAAGCTGGTGGAAATTGGGTGTGATGGTCTGAACGTGTGATTTAGTGATAATTGTTCATACGATGGGTCTTTTACTCTTCGGAAGCCTTTTGGACTTTCC
TTTTGCATTCGTCAGATCTGTACTAGTGGTTTCTAAAATCCAGGATATATGTACTGTTGAGTCGTCGACTCCATATAATAGCCTTCAAATGGAAGAGTGCTCTGTATGTGTATAGGTTAGTACTTTGGTCTAGATTTATGGTTATTTGTACTTTGTTTTAAACAGATGACAATTTTGAGGCTGGAATACAATCCTGTACC
AGATGTTGCAGTATCAAATCTGTTATGTTAATACCGTTGGAGAGTACATCCGCAGTCTGGCCATTTCTTTCAATATCTTTTGGAGAGACTTCAAATTGGCTCATTCTACTATGTTTCCACCAGGATGTGGCATGGGCTATGGTGAACAGTAGTCCCAGTATCTGTTTAGATATATTTTCTATGGTATTGTTCTTGGATGT
TCAAGACGGACGCTTGCCTTCAAGCGAGGGCCATTGTTCTATTTCTGGTTATCCTTTAGGGGGAATGTAAAGATGATATGATAATGAAGGTGCATCACTATCAATTTGGTGGGCACTTCGATGAAGGGCTTGGTAGACGTCAAAATATCATCGTCACTCTAGCTGTAATGAAATTAAGAAGGAGAGATATACCTACTTTT
TCACCTCTGTATGTCTCCTGTGGTATTAATCATAAATTGGTATCTCCCGGTATAGGGCTTGAGAGATGCTTACCCCATGTGCCCTGTTTTTCGTCACCATGTGGATATTTTCTATCACTATTTTCTTCAAGCTAGTGTGCCGGGGTATCTTTCTAAGGTCTTCCTTCAAGCGAGCGTGTCTGGAATTTTTCTCACGTCTT
CCTCAGGCGAGCGTGTCTGGAATTTGTCTCAGGTCTTCCTCAGGCGAGCGTGTTCTTGGGTCTCTCTTCAGGCGAGAGTGTTTATTTTTTCTAAAGTCGTCAGACGGCCAAGCGTGGTTTCAGGTCTCTCTTCAGGCGAGTGTGAAAAGACTGCATATTGGCTTCCTCTACTTTACCAACCAAAGCTCCCGAATGTTTGC
AGATTTCATATACCAACCAAAGCGTTGCAGATCTAATGTATTTGGCTTTCACTTTTGCTATCTTTGGGAATGGTTATCACTCGGGATTGATTTTTGTACATTATGTAGCCTGTTCTGTATTATTTTCATGGGAGTGTCGCCATCTATTTGTCTTATATCAGCGAGCAAGTTGGAAGATACTGGAATGAGGAAGATTAGGA
TGAACACTATAATATATTATTGTGAGGATAATGTATTGCTGTCAGAAACAGGGCAGTTTGACGAGAACACATAATTGCTTCTTCTCTCTCTACATTTACCACCGAAAGCTCTCCTCTACAGAACGCTTCTCTCTCTACATTGTCCACACAGCTTTCGGTATGGTAGCAGATATATCAAACTGCTGTCTTCAACCCTTTCC
TTTGGATTTCCCTTTTGGTATTGACCTAGGGTATTTTATGTGGCCTGTTTGGTAATTGTTTGTCTCCTTGGGGCTGATATCAAATTCTTTGCTTCTTTTGAGATATTCCTCGCCCTCAAAGGGCTTGATATTGATATTGATATTGATATTATCTGTTTACATGTTTTTACCAAAGATAGTTGTAGCTATAGTATGTGACG
TGTTTGAGCCATATAGTCTATCCTAGTACACGCTTTTTTCAAATCTGCTATGCTTTTGGTGCAAAATAATGAATGGCGATTTCCAAGTTGTGCATGTCAGTATGGTGTTTCAATTAAGGTTTTGTTCTACAAGTCTGCCAAAACCAGTTTCATTTAGAAACTATTACGAAAAGTATTGCGAAAAGTATTGTAATTGTCGG
TTGTAAGCACAATAGGTGAAGAGAGTTTTATTCTGTTAGAGGCGTTTTACAGATATGTTCCCTGTAATACAAGAATCTAATTTTCATATTGTCTTTGCAAAACTAATATAAACAGGTAGAATTTTAATTGTTAAACAAGAATCTGTGTTTATACACCACACTAGGGTGGTCTAATTATCTAAGCAATGACCACATGTTCT
ATATCCATTGCTACAAGCCATCTGACTTTATTTTTATTGCTTATCGGAAAGCTCTAATTTATTAGCTCGCTTTCCTTAATTTGGTGATGTTCTTTCTTAATTTGGA