NA ----> NA
Intron 1 GTTAGTACTT ... CCTGTACCAG
| Sample | Retention score (%) | Exon junction reads | 5'ss reads | 3'ss reads |
| A1 | 57.62 | 541 | 605 | 866 |
| A2 | 60.78 | 451 | 539 | 859 |
| A3 | 56.07 | 411 | 402 | 647 |
| A4 | 57.18 | 376 | 361 | 643 |
| A5 | 63.04 | 253 | 363 | 500 |
| A6 | 60.72 | 466 | 617 | 824 |
| A7 | 59.4 | 528 | 630 | 915 |
| A8 | 56.64 | 522 | 564 | 800 |
| A9 | 62.63 | 435 | 633 | 825 |
| A10 | 57.36 | 375 | 381 | 628 |
>TRINITY_DN108666_c0_g1_i4 from sample A4 / Example spliced isoformAACAGATCGGCCGCTTCTTCATGTTTGTTGGTTTGCAGAAGAAGGTCCACTTCTGTTCGTTTGTTCTCATTTGGACCGTGCAAGGTTCCCCTATATCATTGGCTGTATCTCTAGGAAGTATTATTTGAAAGAAGATCCACTTCTGTTCGTTTGTTCTCATTTGGAGCGTGCAAGGTCCCCTATATCATTGGCTGTATCCC
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CATACGATGGGTCTTTTACTCTTCGGAAGCCTTTTGGACTTTCCTTTTGCATTCGTCAGATCTGTACTAGTGGTTTCTAAAATCCAGGATATATGTACTGTTGAGTCGTCGACTCCATATAATAGCCTTCAAATGGAAGAGTGCTCTGTATGTGTATAGATGTTGCAGTATCAAATCTGTTATGTTAATACCGTTGGAGA
GTACATCCGCAGTCTGGCCATTTCTTTCAATATCTTTTGGAGAGACTTCAAATTGGCTCATTCTACTATGTTTCCACCAGGATGTGGCATGGGCTATGGTGAACAGTAGTCCCAGTATCTGTTTAGATATATTTTCTATGGTATTGTTCTTGGATGTTCAAGACGGACGCTTGCCTTCAAGCGAGGGCCATTGTTCTATT
TCTGGTTATCCTTTAGGGGGAATGTAAAGATGATATGATAATGAAGGTGCATCACTATCAATTTGGTGGGCACTTCGATGAAGGGCTTGGTAGACGTCAAAATATCATCGTCACTCTAGCTGTAATGAAATTAAGAAGGAGAGATATACCTACTTTTTCACCTCTGTATGTCTCCTGTGGTATTAATCATAAATTGGTAT
CTCCCGGTATAGGGCTTGAGAGATGCTTACCCCATGTGCCCTGTTTTTCGTCACCATGTGGATATTTTCTATCACTATTTTCTTCAAGCTAGTGTGCCGGGGTATCTTTCTAAGGTCTTCCTTCAAGCGAGCGTGTCTGGAATTTTTCTCACGTCTTCCTCAGGCGAGCGTGTCTGGAATTTGTCTCAGGTCTTCCTCAG
GCGAGCGTGTTCTTGGGTCTCTCTTCAGGCGAGAGTGTTTATTTTTTCTAAAGTCGTCAGACGGCCAAGCGTGGTTTCAGGTCTCTCTTCAGGCGAGTGTGAAAAGACTGCATATTGGCTTCCTCTACTTTACCAACCAAAGCTCCCGAATGTTTGCAGATTTCATATACCAACCAAAGCGTTGCAGATCTAATGTATTT
GGCTTTCACTTTTGCTATCTTTGGGAATGGTTATCACTCGGGATTGATTTTTGTACATTATGTAGCCTGTTCTGTATTATTTTCATGGGAGTGTCGCCATCTATTTGTCTTATATCAGCGAGCAAGTTGGAAGATACTGGAATGAGGAAGATTAGGATGAACACTATAATATATTATTGTGAGGATAATGTATTGCTGTC
AGAAACAGGGCAGTTTGACGAGAACACATAATTGCTTCTTCTCTCTCTACATTTACCACCGAAAGCTCTCCTCTACAGAACGCTTCTCTCTCTACATTGTCCACACAGCTTTCGGTATGGTAGCAGATATATCAAACTGCTGTCTTCAACCCTTTCCTTTGGATTTCCCTTTTGGTATTGACCTAGGGTATTTTATGTGG
CCTGTTTGGTAATTGTTTGTCTCCTTGGGGCTGATATCAAATTCTTTGCTTCTTTTGAGATATTCCTCGCCCTCAAAGGGCTTGATATTGATATTGATATTGATATTATCTGTTTACATGTTTTTACCAAAGATAGTTGTAGCTATAGTATGTGACGTGTTTGAGCCATATAGTCTATCCTAGTACACGCTTTTTTCAAA
TCTGCTATGCTTTTGGTGCAAAATAATGAATGGCGATTTCCAAGTTGTGCATGTCAGTATGGTGTTTCAATTAAGGTTTTGTTCTACAAGTCTGCCAAAACCAGTTTCATTTAGAAACTATTACGAAAAGTATTGCGAAAAGTATTGTAATTGTCGGTTGTAAGCACAATAGGTGAAGAGAGTTTTATTCTGTTAGAGGC
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TCGGAAAGCTCTAATTTATTAGCTCGCTTTCCTTAATTTGGTGATGTTCTTTCTTAATTTGGA
>TRINITY_DN108666_c0_g1_i2 from sample A4 / Example unspliced isoform:AACAGATCGGCCGCTTCTTCATGTTTGTTGGTTTGCAGAAGAAGGTCCACTTCTGTTCGTTTGTTCTCATTTGGACCGTGCAAGAAGAAGATCCACTTCTGTTCGTTTGTTCTCATTTGGAGCGTGCAAGGTCCCCTATATCATTGGCTGTATCCCTTGGAAGTATTATTTGAGTCGTGCAATCTCTTCATTACCTGTTT
ATCTGGCGTATTTGTCATTTAATGGAAGGGATTATAATAGGTCACCCAATATGTTATACAGGGTTTTAGCTGTTAAAAGTAGTTGTTTTAGCAGTTTCTATGCTTTTATCTATTACCGTGTCCGATTTGAGAGATTGTTGATCCTTCTGTTGCAGTGGGATTATGCATATAAGAGGATAGTAATGCGATCACGGGGTACG
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TTTTGCATTCGTCAGATCTGTACTAGTGGTTTCTAAAATCCAGGATATATGTACTGTTGAGTCGTCGACTCCATATAATAGCCTTCAAATGGAAGAGTGCTCTGTATGTGTATAGgttagtactttggtctagatttatggttatttgtactttgttttaaacagatgacaattttgaggctggaatacaatcctgtacc
agATGTTGCAGTATCAAATCTGTTATGTTAATACCGTTGGAGAGTACATCCGCAGTCTGGCCATTTCTTTCAATATCTTTTGGAGAGACTTCAAATTGGCTCATTCTACTATGTTTCCACCAGGATGTGGCATGGGCTATGGTGAACAGTAGTCCCAGTATCTGTTTAGATATATTTTCTATGGTATTGTTCTTGGATGT
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TCACCTCTGTATGTCTCCTGTGGTATTAATCATAAATTGGTATCTCCCGGTATAGGGCTTGAGAGATGCTTACCCCATGTGCCCTGTTTTTCGTCACCATGTGGATATTTTCTATCACTATTTTCTTCAAGCTAGTGTGCCGGGGTATCTTTCTAAGGTCTTCCTTCAAGCGAGCGTGTCTGGAATTTTTCTCACGTCTT
CCTCAGGCGAGCGTGTCTGGAATTTGTCTCAGGTCTTCCTCAGGCGAGCGTGTTCTTGGGTCTCTCTTCAGGCGAGAGTGTTTATTTTTTCTAAAGTCGTCAGACGGCCAAGCGTGGTTTCAGGTCTCTCTTCAGGCGAGTGTGAAAAGACTGCATATTGGCTTCCTCTACTTTACCAACCAAAGCTCCCGAATGTTTGC
AGATTTCATATACCAACCAAAGCGTTGCAGATCTAATGTATTTGGCTTTCACTTTTGCTATCTTTGGGAATGGTTATCACTCGGGATTGATTTTTGTACATTATGTAGCCTGTTCTGTATTATTTTCATGGGAGTGTCGCCATCTATTTGTCTTATATCAGCGAGCAAGTTGGAAGATACTGGAATGAGGAAGATTAGGA
TGAACACTATAATATATTATTGTGAGGATAATGTATTGCTGTCAGAAACAGGGCAGTTTGACGAGAACACATAATTGCTTCTTCTCTCTCTACATTTACCACCGAAAGCTCTCCTCTACAGAACGCTTCTCTCTCTACATTGTCCACACAGCTTTCGGTATGGTAGCAGATATATCAAACTGCTGTCTTCAACCCTTTCC
TTTGGATTTCCCTTTTGGTATTGACCTAGGGTATTTTATGTGGCCTGTTTGGTAATTGTTTGTCTCCTTGGGGCTGATATCAAATTCTTTGCTTCTTTTGAGATATTCCTCGCCCTCAAAGGGCTTGATATTGATATTGATATTGATATTATCTGTTTACATGTTTTTACCAAAGATAGTTGTAGCTATAGTATGTGACG
TGTTTGAGCCATATAGTCTATCCTAGTACACGCTTTTTTCAAATCTGCTATGCTTTTGGTGCAAAATAATGAATGGCGATTTCCAAGTTGTGCATGTCAGTATGGTGTTTCAATTAAGGTTTTGTTCTACAAGTCTGCCAAAACCAGTTTCATTTAGAAACTATTACGAAAAGTATTGCGAAAAGTATTGTAATTGTCGG
TTGTAAGCACAATAGGTGAAGAGAGTTTTATTCTGTTAGAGGCGTTTTACAGATATGTTCCCTGTAATACAAGAATCTAATTTTCATATTGTCTTTGCAAAACTAATATAAACAGGTAGAATTTTAATTGTTAAACAAGAATCTGTGTTTATACACCACACTAGGGTGGTCTAATTATCTAAGCAATGACCACATGTTCT
ATATCCATTGCTACAAGCCATCTGACTTTATTTTTATTGCTTATCGGAAAGCTCTAATTTATTAGCTCGCTTTCCTTAATTTGGTGATGTTCTTTCTTAATTTGGA
Intron 2 GTAATGTGAT ... TGCTGTTTAG
| Sample | Retention score (%) | Exon junction reads | 5'ss reads | 3'ss reads |
| A1 | 63.44 | 497 | 848 | 877 |
| A2 | 65.18 | 378 | 613 | 802 |
| A3 | 61.62 | 345 | 483 | 625 |
| A4 | 67.74 | 266 | 484 | 633 |
| A5 | 69.33 | 188 | 372 | 478 |
| A6 | 64.78 | 262 | 427 | 537 |
| A7 | 61.54 | 374 | 530 | 667 |
| A8 | 57.59 | 377 | 423 | 601 |
| A9 | 61.5 | 324 | 428 | 607 |
| A10 | 63.65 | 239 | 379 | 458 |
>TRINITY_DN108666_c0_g1_i3 from sample A4 / Example spliced isoformAACAGATCGGCCGCTTCTTCATGTTTGTTGGTTTGCAGAAGAAGGTCCACTTCTGTTCGTTTGTTCTCATTTGGACCGTGCAAGGTTCCCCTATATCATTGGCTGTATCTCTAGGAAGTATTATTTGAAAGAAGATCCACTTCTGTTCGTTTGTTCTCATTTGGAGCGTGCAAGGTCCCCTATATCATTGGCTGTATCCC
TTGGAAGTATTATTTGAGTCGTGCAATCTCTTCATTACCTGTTTATCTGGCGTATTTGTCATTTAATGGAAGGGATTATAATAGGTCACCCAATATGTTATACAGGGTTTTAGCTGTTAAAAGTAGTTGTTTTAGCAGTTTCTATGCTTTTATCTATTACCGTGTCCGATTTGAGAGATTGTTGATCCTTCTGTTGCAGT
GGGATTATGCATATAAGAGGATAGTAATGCGATCACGGGGTACGCACAGATTTCTCCTGCAAATCTTTCAACACTGGAGATCCGAGCGTTAATGTGACAGTAGGGATGCATATCTTGTAGTAGGGAATTTTTATGTTTTGGTTAAGTATTAGTAGATTTGATCATTTATTCATCTTTTAGGTAGTTTGCCAATGATATTG
TTCAGATCTGCAACCGTAAGCTTACATTGTGAAAATTGAGAGACTTGGTGATGTTGGAAAGCAATGATCAGAATTTGGGCCAACTTGTTTACTTCCAAATACATCTCTCAAGAGGTCTGTTGAACGTTTTTAAAGTTTCTGAAATTTTAGATGTGTAGTGTTTCTTGTCCTCTAGAGGACTTGTGCTTTAATATTCCATG
CCTAGTATTCTCAGAGGGGAGAATTCGTAATATGCCATGCCTAATATTCTCAGAGGGGAGAATTCGTTTAAAGACAGATTCGTTAAGTAATTTTTTCCAACGAGCCAAGTCTAGAAAGCCACGACGCCGTGAAACCAACAGCATACATGTAAACGGTCCGTAGGCATGCAGATCAACGTTGTGCGGTTGAGGCATGCAGA
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TCGACTCCATATAATAGCCTTCAAATGGAAGAGTGCTCTGTATGTGTATAG
>TRINITY_DN108666_c0_g1_i2 from sample A4 / Example unspliced isoform:AACAGATCGGCCGCTTCTTCATGTTTGTTGGTTTGCAGAAGAAGGTCCACTTCTGTTCGTTTGTTCTCATTTGGACCGTGCAAGAAGAAGATCCACTTCTGTTCGTTTGTTCTCATTTGGAGCGTGCAAGGTCCCCTATATCATTGGCTGTATCCCTTGGAAGTATTATTTGAGTCGTGCAATCTCTTCATTACCTGTTT
ATCTGGCGTATTTGTCATTTAATGGAAGGGATTATAATAGGTCACCCAATATGTTATACAGGGTTTTAGCTGTTAAAAGTAGTTGTTTTAGCAGTTTCTATGCTTTTATCTATTACCGTGTCCGATTTGAGAGATTGTTGATCCTTCTGTTGCAGTGGGATTATGCATATAAGAGGATAGTAATGCGATCACGGGGTACG
CACAGATTTCTCCTGCAAATCTTTCAACACTGGAGATCCGAGCGTTAATGTGACAGTAGGGATGCATATCTTGTAGTAGGGAATTTTTATGTTTTGGTTAAGTATTAGTAGATTTGATCATTTATTCATCTTTTAGGTAGTTTGCCAATGATATTGTTCAGATCTGCAACCGTAAGCTTACATTGTGAAAATTGAGAGAC
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TTTTGCATTCGTCAGATCTGTACTAGTGGTTTCTAAAATCCAGGATATATGTACTGTTGAGTCGTCGACTCCATATAATAGCCTTCAAATGGAAGAGTGCTCTGTATGTGTATAGGTTAGTACTTTGGTCTAGATTTATGGTTATTTGTACTTTGTTTTAAACAGATGACAATTTTGAGGCTGGAATACAATCCTGTACC
AGATGTTGCAGTATCAAATCTGTTATGTTAATACCGTTGGAGAGTACATCCGCAGTCTGGCCATTTCTTTCAATATCTTTTGGAGAGACTTCAAATTGGCTCATTCTACTATGTTTCCACCAGGATGTGGCATGGGCTATGGTGAACAGTAGTCCCAGTATCTGTTTAGATATATTTTCTATGGTATTGTTCTTGGATGT
TCAAGACGGACGCTTGCCTTCAAGCGAGGGCCATTGTTCTATTTCTGGTTATCCTTTAGGGGGAATGTAAAGATGATATGATAATGAAGGTGCATCACTATCAATTTGGTGGGCACTTCGATGAAGGGCTTGGTAGACGTCAAAATATCATCGTCACTCTAGCTGTAATGAAATTAAGAAGGAGAGATATACCTACTTTT
TCACCTCTGTATGTCTCCTGTGGTATTAATCATAAATTGGTATCTCCCGGTATAGGGCTTGAGAGATGCTTACCCCATGTGCCCTGTTTTTCGTCACCATGTGGATATTTTCTATCACTATTTTCTTCAAGCTAGTGTGCCGGGGTATCTTTCTAAGGTCTTCCTTCAAGCGAGCGTGTCTGGAATTTTTCTCACGTCTT
CCTCAGGCGAGCGTGTCTGGAATTTGTCTCAGGTCTTCCTCAGGCGAGCGTGTTCTTGGGTCTCTCTTCAGGCGAGAGTGTTTATTTTTTCTAAAGTCGTCAGACGGCCAAGCGTGGTTTCAGGTCTCTCTTCAGGCGAGTGTGAAAAGACTGCATATTGGCTTCCTCTACTTTACCAACCAAAGCTCCCGAATGTTTGC
AGATTTCATATACCAACCAAAGCGTTGCAGATCTAATGTATTTGGCTTTCACTTTTGCTATCTTTGGGAATGGTTATCACTCGGGATTGATTTTTGTACATTATGTAGCCTGTTCTGTATTATTTTCATGGGAGTGTCGCCATCTATTTGTCTTATATCAGCGAGCAAGTTGGAAGATACTGGAATGAGGAAGATTAGGA
TGAACACTATAATATATTATTGTGAGGATAATGTATTGCTGTCAGAAACAGGGCAGTTTGACGAGAACACATAATTGCTTCTTCTCTCTCTACATTTACCACCGAAAGCTCTCCTCTACAGAACGCTTCTCTCTCTACATTGTCCACACAGCTTTCGGTATGGTAGCAGATATATCAAACTGCTGTCTTCAACCCTTTCC
TTTGGATTTCCCTTTTGGTATTGACCTAGGGTATTTTATGTGGCCTGTTTGGTAATTGTTTGTCTCCTTGGGGCTGATATCAAATTCTTTGCTTCTTTTGAGATATTCCTCGCCCTCAAAGGGCTTGATATTGATATTGATATTGATATTATCTGTTTACATGTTTTTACCAAAGATAGTTGTAGCTATAGTATGTGACG
TGTTTGAGCCATATAGTCTATCCTAGTACACGCTTTTTTCAAATCTGCTATGCTTTTGGTGCAAAATAATGAATGGCGATTTCCAAGTTGTGCATGTCAGTATGGTGTTTCAATTAAGGTTTTGTTCTACAAGTCTGCCAAAACCAGTTTCATTTAGAAACTATTACGAAAAGTATTGCGAAAAGTATTGTAATTGTCGG
TTGTAAGCACAATAGGTGAAGAGAGTTTTATTCTGTTAGAGGCGTTTTACAGATATGTTCCCTGTAATACAAGAATCTAATTTTCATATTGTCTTTGCAAAACTAATATAAACAGGTAGAATTTTAATTGTTAAACAAGAATCTGTGTTTATACACCACACTAGGGTGGTCTAATTATCTAAGCAATGACCACATGTTCT
ATATCCATTGCTACAAGCCATCTGACTTTATTTTTATTGCTTATCGGAAAGCTCTAATTTATTAGCTCGCTTTCCTTAATTTGGTGATGTTCTTTCTTAATTTGGA