sp|Q9SXP2|FDH1_ORYSJ ----> Formate dehydrogenase 1, mitochondrial


Intron 1 GTGATGTAGT ... ACAAAACCAG

SampleRetention score (%)Exon junction reads5'ss reads3'ss reads
A171.05112034
A260.71111420
A381.4852024
A471.4392025
A573.6851315
A677.512890103
A775.11298689
A880.3207687
A975298688
A1074.86226764



>TRINITY_DN40350_c0_g1_i2 from sample A9 / Example spliced isoform
GCAAATTCCGAGCATGCGACGCAATCCTCAAATAGAGTAGTATTATTATGAAACTAATATGCCCTGCAGCAGTTGTAATTATTGGGAATATGTCAAGAAAAATCTAAAATAATATAAATTCTGGACTCTACTCCACTAGGTGGAAGATTACAGAATCTACAGGAGGGAAAAATCCATAATCTAATTAAAATGCTGAGGAT
ATACCTTACCAAATTCGATCATCCTATTTATATCAACCCATTCACTCATTCTCGTGGCCAACCCATCAGGATTGATTGGAAAAATTATTAATCCACTCCCCACTGTTACCATACGTGACCTTCTGAATTAGATTTCCTCTTTGCTCTAGTTGGAGTTTCTTGTAATGGCGAGCAAGAGAGCTGTTATATCTGCAGTCCGA
GCTGTGAGTAGAAGGCCGATCTGCTCCCCAGTCTCTTCTATGGCATCTTCTGTCAGAGAATTGCATGCACCTGCAGGGAGTAATAAAATTGTTGGAGTCTTTTATAAAGCCAATGAATATGCCTCATTGAATCCGAACTTCCTCGGGTGTGTTGAGAATGCTTTGGGGATACGAGAATGGCTTGAGTCTAATGGTCACCA
GTACATTGTGACAGATGACAAGGAAGGTCCTGACTGTGAGCTTGAAAAGCACATACCTGATGCGCATGTTTTGATTTCTACACCTTTCCACCCTGCCTATGTGACATCAGAGAGGATCAAGAAGGCAAAGAACTTAAAACTTCTTTTGACAGCTGGTATTGGTTCTGATCACATTGATCTAAATGCTGCTGCAGCAGCTG
GTGTGACTGTTGCAGAAGTTACAGGAAGTAATGTGGTGTCCGTGGCAGAAGATGAGCTAATGCGTATTCTCATATTGATGCGCAACTTTGTGCCTGGATATAAGCAAATTGTTGAGGGTGATTGGAAAGTAGCAGCTATTTCTTACAGGTCATATGATCTAGAAGGGAAAACTATCGGTACTATTGGTGCAGGGCGAATT
GGCAAAGAACTACTTAAGCGTTTGAAGCCCTTTAATTGTAATCTTCTTTACCATGACCGTCTTTCAATTGGACCCGAATTGGAAAAGGAAACTGGAGCAACATTTGAGGCAAATCTTGACGATATGCTACCTAAATGGGAATGTTTAACAAGAAGAAAATCAGCAAGATGAAGAAGGGGGTCCTGATTGTGAATAATACT
CGAGGGGCCATCATGGATGCTCAAGCAGTTGCTGATGCTTCTGCTAGTGGAAAAATTGGAGGTTACAGTGGAGATGTTTGGTTTCCTCAACCTGCTCCAAAAGATCATCCATGGCGCTACATGCCAAACCATGCCATGACTCCTCATATTTCTGGGACTACAATAGATGCACAGATAAGGTATGCAGCTGGAACAAAGGA
TATGCTTGACAGATACTTCAGGGGAGAAGATTTCCCTTCACAGAATTACATTGTGAAGGAAGGAACAATAGCCAGCCAGTACCTATAAAACTTTCATGTTGGATGCCAAAGCAGAGATGGTTGCATCATGATTCATCCACCTGCAGGCTGCTTTATCTGGAATAACAAGCAAGAGGCAGTACAGTGCTCCTTTCCTGAAA
TAAAACAATACATCAAATATTGAATTGTCAAATACATTCCTGAGACCAATGATGCTTCAAAGGATTGTCCAGGAATGAATGATAGAAGATTAGCATGCAGCTCATCATTCCATCTGGTCTGATTTTATAAACTAGTAGTATTGAATAAACAAAATCCAAAATAAATTGCGAAGTGATTTAAAGACAGTGCTTAGTCCTTT
GGGGCTATTGATTCATGAAGTTGACTTGGAGATCGCTATGCAACTTTTTTACTAGTAGAGGGAAACAAACCTTTGTTTGTGTATGGAAGGTGGATGAGCCTTTTCTGCCTTTCCTTGGTGTGGTTTTTGAATAATTCTATTTTGAAATTTCTTGATTATAAACTCTGAAAGTATCTATTGACAAGGCCGTACTCAAGTCA
TTGTTTTTCAATGGTATTTAATTTTTATTGTTTATGTAAGCTTGATTTGGTGAATATATTGTATTTGGGTAGTTTTATGTTAAATGGGGTTTCACTTAATTTGTGGACTTTTAACCTCTATGTTAACAAGGTGATATGCAAGGAGGTAGAAG


>TRINITY_DN40350_c0_g1_i1 from sample A9 / Example unspliced isoform:
GCAAATTCCGAGCATGCGACGCAATCCTCAAATAGAGTAGTATTATTATGAAACTAATATGCCCTGCAGCAGTTGTAATTATTGGGAATATGTCAAGAAAAATCTAAAATAATATAAATTCTGGACTCTACTCCACTAGGTGGAAGATTACAGAATCTACAGGAGGGAAAAATCCATAATCTAATTAAAATGCTGAGGAT
ATACCTTACCAAATTCGATCATCCTATTTATATCAACCCATTCACTCATTCTCGTGGCCAACCCATCAGGATTGATTGGAAAAATTATTAATCCACTCCCCACTGTTACCATACGTGACCTTCTGAATTAGATTTCCTCTTTGCTCTAGTTGGAGTTTCTTGTAATGGCGAGCAAGAGAGCTGTTATATCTGCAGTCCGA
GCTGTGAGTAGAAGGCCGATCTGCTCCCCAGTCTCTTCTATGGCATCTTCTGTCAGAGAATTGCATGCACCTGCAGGGAGTAATAAAATTGTTGGAGTCTTTTATAAAGCCAATGAATATGCCTCATTGAATCCGAACTTCCTCGGGTGTGTTGAGAATGCTTTGGGGATACGAGAATGGCTTGAGTCTAATGGTCACCA
GTACATTGTGACAGATGACAAGGAAGGTCCTGACTGTGAGCTTGAAAAGCACATACCTGATGCGCATGTTTTGATTTCTACACCTTTCCACCCTGCCTATGTGACATCAGAGAGGATCAAGAAGGCAAAGAACTTAAAACTTCTTTTGACAGCTGGTATTGGTTCTGATCACATTGATCTAAATGCTGCTGCAGCAGCTG
GTGTGACTGTTGCAGAAGTTACAGGAAGTAATGTGGTGTCCGTGGCAGAAGATGAGCTAATGCGTATTCTCATATTGATGCGCAACTTTGTGCCTGGATATAAGCAAATTGTTGAGGGTGATTGGAAAGTAGCAGCTATTTCTTACAGGTCATATGATCTAGAAGGGAAAACTATCGGTACTATTGGTGCAGGGCGAATT
GGCAAAGAACTACTTAAGCGTTTGAAGCCCTTTAATTGTAATCTTCTTTACCATGACCGTCTTTCAATTGGACCCGAATTGGAAAAGGAAACTGGAGCAACATTTGAGGCAAATCTTGACGATATGCTACCTAAATgtgatgtagttgtcattaatatgcctctttctgacaaaaccagGGGAATGTTTAACAAGAAGAA
AATCAGCAAGATGAAGAAGGGGGTCCTGATTGTGAATAATGCTCGAGGAGCCATCATGGATGCTCAAGCAGTTGCTGATGCTTCTGCAAGTGGACAAATTGGAGGTTACAGTGGAGATGTTTGGTTTCCTCAACCTGCTCCAAAAGATCATCCATGGCGCTACATGCCAAACCATGCCATGACTCCTCATATTTCTGGGA
CTACAATAGATGCACAGATAAGGTATGCAGCTGGAACAAAGGATATGCTTGACAGATACTTCAGGGGAGAAGATTTCCCTTCACAGAATTACATTGTGAAGGAAGGAACAATAGCCAGCCAGTACCTATAAAACTTTCATGTTGGATGCCAAAGCAGAGATGGTTGCATCATGATTCATCCACCTGCAGGCTGCTTTATC
TGGAATAACAAGCAAGAGGCAGTACAGTGCTCCTTTCCTGAAATAAAACAATACATCAAATATTGAATTGTCAAATACATTCCTGAGACCAATGATGCTTCAAAGGATTGTCCAGGAATGAATGATAGAAGATTAGCATGCAGCTCATCATTCCATCTGGTCTGATTTTATAAACTAGTAGTATTGAATAAACAAAATCC
AAAATAAATTGCGAAGTGATTTAAAGACAGTGCTTAGTCCTTTGGGGCTATTGATTCATGAAGTTGACTTGGAGATCGCTATGCAACTTTTTTACTAGTAGAGGGAAACAAACCTTTGTTTGTGTATGGAAGGTGGATGAGCCTTTTCTGCCTTTCCTTGGTGTGGTTTTTGAATAATTCTATTTTGAAATTTCTTGATT
ATAAACTCTGAAAGTATCTATTGACAAGGCCGTACTCAAGTCATTGTTTTTCAATGGTATTTAATTTTTATTGTTTATGTAAGCTTGATTTGGTGAATATATTGTATTTGGGTAGTTTTATGTTAAATGGGGTTTCACTTAATTTGTGGACTTTTAACCTCTATGTTAACAAGGTGATATGCAAGGAGGTAGAAG



Intron 2 GTATTCTTAG ... TTTTCTACAG

SampleRetention score (%)Exon junction reads5'ss reads3'ss reads
A16.672802
A24.444302
A319.053438
A413.464517
A501600
A68.21123011
A75.9311107
A88.757307
A912.5119017
A1013.5989014



>TRINITY_DN106644_c0_g1_i1 from sample A3 / Example spliced isoform
CTACTCCACTAGGTGCAAGATTACAGAATCTACAGGAGGGAAAAATCCATAATCTAATTAAAATGCTGAGGATATACCTTACCAAATTCGATCATCCTATTTATATCAACCCATTCACTCATTCTCGTGGCCAACCCATCAGGATTGATTGGAAAAATTATTAATCCACTCCCCACTGTTACCATACGTGACCTTCTGAA
TTAGATTTCCTCTTTGCTCTAGTTGGAGTTTCTTGTAATGGCGAGCAAGAGAGCTGTTATATCTGCAGTCCGAGCTGTGAGTAGAAGGCCGATCTGCTCCCCAGTCTCTTCTATGGCATCTTCTGTCAGAGAATTGCATGCACCTGCAGGGAGTAATAAAATTGTTGGAGTCTTTTATAAAGCCAATGAATATGCCTCAT
TGAATCCGAACTTCCTCGGGTGTGTTGAGAATGCTTTGGGGATACGAGAATGGCTTGAGTCTAATGGTCACCAGTACATTGTGACAGATGACAAGGAAGGTCCTGACTGTGAGCTTGAAAAGCACATACCTGATGCGCATGTTTTGATTTCTACACCTTTCCACCCTGCCTATGTGACATCAGAGAGGATCAAGAAGGCA
AAGAACTTAAAACTTCTTTTGACAGCTGGTATTGGTTCTGATCACATTGATCTAAATGCTGCTGCAGCAGCTGGTGTGACTGTTGCAGAAGTTACAGGAAGTAATGTGGTGTCCGTGGCAGAAGATGAGCTAATGCGTATTCTCATATTGATGCGCAACTTTGTGCCTGGATATAAGCAAATTGTTGAGGGTGATTGGAA
AGTAGCAGCTATTTCTTACAGGTCATATGATCTAGAAGGGAAAACTATCGGTACTATTGGTGCAGGGCGAATTGGCAAAGAACTACTTAAGCGTTTGAAGCCCTTTAATTGTAATCTTCTTTACCATGACCGTCTTTCAATTGGACCCGAATTGGAAAAGGAAACTGGAGCAACATTTGAGGCAAATCTTGATGATATGC
TACCTAAATGTGATGTAGTTGTCATTAATATGCCTCTTTCTGACAAAACCAGGGGAATGTTTAACAAGGAGAAAATCAGCAAGATGAAGAAGGGGGTCCTGATTGTGAATAATGCTCGAGGGGCCATCATGGATGCTCAAGCAGTTGCTGATGCTTCTGCAAGTGGACAAATTGGAGGTTACAGTGGAGATGTTTGGTTT
CCTCAACCTGCTCCAAAAGATCATCCATGGCGCTACATGCCAAACCATGCCATGACTCCTCATATTTCTGGGACTACAATAGATGCACAGATAAGGTATGCAGCTGGAACAAAGGATATGCTTGACAGATACTTCAGGGGAGAAGATTTCCCTTCACAGAATTACATTGTGAAGGAAGGAACAATAGCCAGCCAGTACCT
ATAAAACTTTCATGTTGGATGCCAAAGCAGAGATGGTTGCATCATGATTCATCCACCTGCAGGCTGCTTTATCTGGAATAACAAGCAAGAGGCAGTACAGTGCTCCTTTCCTGAAATAAAACAATACATCAAATATTGAATTGTCAAATACATTCCTGAGACCAATGATGCTTCAAAGGATTGTCCAGGAATGAATGATA
GAAGATTAGCATGCAGCTCATCATTCCATCTGGTCTGATTTTATAAACTAGTAGTATTGAATAAACAAAATCCAAAATAAATTGCGAAGTGATTTAAAGACAGTGCTTAGTCCTTTGGGGCTATTGATTCATGAAGTTGACTTGGAGATCGCTATGCAACTTTTTTACTAGTAGAGGGAAACAAACCTTTGTTTGTGTAT
GGAAGGTGGATGAGCCTTTTCTGCCTTTCCTTGGTGTGGTTTTTGAATAATTCTATTTTGAAATTTCTTGATTATAAACTCTGAAAGTATCTATTGACAAGGCCGTACTCAAGTCATTGTTTTTCAATGGTATTTAATTTTTATTGTTTATGTAAGCTTGATTTGGTGAATATATTGTATTTGGGTAGTTTTATGTTAAA
TGGGC


>TRINITY_DN106644_c0_g1_i2 from sample A3 / Example unspliced isoform:
GAACTACTTAAGCGTTTGAAGgtattcttaggacctattatgttgcaaacttttaaaaatcagtgataaatcatatgcatgctgcttgtttcaaaatttcactctaagaatgaacattacaagtcgaattgacatacctttgtggtttttttctacagCCCTTTAATTGTAATCTTCTTTACCATGACCGTCTTTCAATT
GGACCCGAATTGGAAAAGGAAACTGGAGCAACATTTGAGGCAAATCTTGATGATATGCTACCTAAATGTGATGTAGTTGTCATTAATATGCCTCTTTCTGACAAAACCAGGGGAATGTTTAACAAGGAGAAAATCAGCAAGATGAAGAAGGGGGTCCTGATTGTGAATAATGCTCGAGGGGCCATCATGGATGCTCAAGC
AGTTGCTGATGCTTCTGCAAGTGGACAAATTGGAGGTTACAGTGGAGATGTTTGGTTTCCTCAACCTGCTCCAAAAGATCATCCATGGCGCTACATGCCAAACCATGCCATGACTCCTCATATTTCTGGGACTACAATAGATGCACAGATAAGGTATGCAGCTGGAACAAAGGATATGCTTGACAGATACTTCAGGGGAG
AAGATTTCCCTTCACAGAATTACATTGTGAAGGAAGGAACAATAGCCAGCCAGTACCTATAAAACTTTCATGTTGGATGCCAAAGCAGAGATGGTTGCATCATGATTCATCCACCTGCAGGCTGCTTTATCTGGAATAACAAGCAAGAGGCAGTACAGTGCTCCTTTCCTGAAATAAAACAATACATCAAATATTGAATT
GTCAAATACATTCCTGAGACCAATGATGCTTCAAAGGATTGTCCAGGAATGAATGATAGAAGATTAGCATGCAGCTCATCATTCCATCTGGTCTGATTTTATAAACTAGTAGTATTGAATAAACAAAATCCAAAATAAATTGCGAAGTGATTTAAAGACAGTGCTTAGTCCTTTGGGGCTATTGATTCATGAAGTTGACT
TGGAGATCGCTATGCAACTTTTTTACTAGTAGAGGGAAACAAACCTTTGTTTGTGTATGGAAGGTGGATGAGCCTTTTCTGCCTTTCCTTGGTGTGGTTTTTGAATAATTCTATTTTGAAATTTCTTGATTATAAACTCTGAAAGTATCTATTGACAAGGCCGTACTCAAGTCATTGTTTTTCAATGGTATTTAATTTTT
ATTGTTTATGTAAGCTTGATTTGGTGAATATATTGTATTTGGGTAGTTTTATGTTAAATGGGC