sp|Q9SSM2|MDLL_ARATH ----> (R)-mandelonitrile lyase-like

Intron 1 GTATGTTCGA ... TAAACTGTAG

Sample	Retention score (%)	Exon junction reads	5'ss reads	3'ss reads
A1	70	3	4	10
A2	100	0	12	14
A3	100	0	12	17
A4	76.47	2	4	9
A5	75	1	1	5
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A7	62.96	5	12	5
A8	60	6	5	13
A9	66.67	5	7	13
A10	40.54	11	10	5

>TRINITY_DN43933_c3_g2_i3 from sample A8 / Example spliced isoform

CTTCGAACCTCGTGAAGCTTGTGTTGAAACTTGAAAGCCTTCAGTCGCGCACCGGCATTGACGAGCAACTCGATAATGGCCATGATGCCCTTAATACAGAGATGCAGCCAGATGTAACGCATATGCATTTAATGGCAGCATAACTATTGAATATCAACAATATATCACCATAACCATGATAAGGGTGCAAAGTCATCCAT
GCCCTTTCACCTGACCCTTCTTTCCTCCTCCTTTGTGATGAGTACAGGTGAGGCAGCCTGGCAAGTATGAAGTTATGAAGGAAGCCACTGATGTTGCTCCCAAGGAATACTATGATTATATCGTGGTTGGAGGAGGGACAGCAGGGTGCCCCTTGGCAGCAACGCTCTCGCAGAACTTTAGTGTGCTGCTTCCTGAATGA
GGGGGATAGCCATATAACAACATAAATATCACGAGGTAGAGAATTTTCACATCAATTTGGCGGTTGTTTCTCCTTCCTCGTACTATCAGGTGTTTATTTCCGAGAATGGTGTTGTGAATTCGAGAGGGAGAGTTATTGGCGGTGGGAGCTCTTTCAACGCGAGGTTTTTCAGTCACGCCAGCCGCCTGGACGTGAGAAGG
AATGGATGGGATGGAGAGCTTGTGAATTATCTTTTCCCTAGGTCGAGAAAATGGTTGCCCATAGACCTGAGATCAAGCCTTGGTAAATTGCAGTCACGGAAGCACTTCTTGAAGTGGGCGTTTCACCTTACAATGGCTTCACCTATGACCATATCTATGGAACCAAGGAGGGAGGGACTACTTTCAATAAATCGGGATAT
AGGCATACTGCGGTTGAGCTCCTGGTCTATGCCAATCCCCATAAGCTAACTATGTTATTGCATGCAACTGTGGAGCGCTTGCTCTTGTCCAAACTTTATCAAATGATGTCTTGCCTATATGGGGATTTGCTGCTATTCAAAGGCAGATTGTTTCCCACTGCCCTTCATTGTTAGCCCATTGTGTTCTATTCCTGGAGAAT
GTAGGAAGTGGTGTGGGTTAACAATTGATTGGATCATGCGTTTGAAGTGGTAGCTGAATTTGTAAATGCTCCGAGTAATGAAGGTTAGTGAATTGCAGAGGCTGCTGCCAGGAACAAAGTCTGAATAAAGTTGATCGATGCATATATTATTATATTCCCATATCGATAGGATTCAAGGACAGCTATCAGCTTATTCATTT
GGTTTGTCAGTTCACTTATGTAGGCGCATGTGAGTTGGTAAGATTGTCTGTGCTTGTCGTGTCAATAATATGGGCTGAATTTACGTCGATGGGGCTGGGTTTGTGTGTTGCATGAATTGAGGAATCCAGAAGCACCTTGTAAAATACCAGAGCATACACATACAATGCAGTCCAGTCTAATATATTCTATCTAGGTATGA
ATGTAGGCTGCAAGCTGCAACCCCACATATATCCACAGATAATGACAATTTTGCTGGACGACTTTTCAAGTTTGCTCCACATTATATTTTATTTTCTATTTGTATGCAACACGAGCAGTCTAAAACATGGGTGAATGTGGATTGCACACCACAGTTTAGCACTTTCACACCTTGTTTCAATGAATTCCCATAGCTTGTTC
TGTAATTGAGGGAGTCCTGTATGTTTGAAATGAGTTATTTGATACGCTTGATGACATTATTTAAAAAAACTCAGCTGTGGTGATTTGACCTTGGGTGCATTATAAAAATTCAAC

>TRINITY_DN43933_c3_g2_i2 from sample A8 / Example unspliced isoform:

CTTCGAACCTCGTGAAGCTTGTGTTGAAACTTGAAAGCCTTCAGTCGCGCACCGGCATTGACGAGCAACTCGATAATGGCCATGATGCCCTTAATACAGAGATGCAGCCAGATGTAACGCATATGCATTTAATGGCAGCATAACTATTGAATATCAACAATATATCACCATAACCATGATAAGGGTGCAAAGTCATCCAT
GCCCTTTCACCTGACCCTTCTTTCCTCCTCCTTTGTGATGAGTACAGGTGAGGCAGCCTGGCAAGTATGAAGTTATGAAGGAAGCCACTGATGTTGCTCCCAAGGAATACTATGATTATATCGTGGTTGGAGGAGGGACAGCAGGGTGCCCCTTGGCAGCAACGCTCTCGCAGAACTTTAGTGTGCTGCTTCCTGAATGA
GGGGGATAGCCATATAACAACATAAATATCACGAGGTAGAGAATTTTCACATCAATTTGGCGGTTGTTTCTCCTTCCTCGTACTATCAGGTGTTTATTTCCGAGAATGGTGTTGTGAATTCGAGAGGGAGAGTTATTGGCGGTGGGAGCTCTTTCAACGCGAGGTTTTTCAGTCACGCCAGCCGCCTGGACGTGAGAAGG
AATGGATGGGATGGAGAGCTTGTGAATTATCTTTTCCCTAGGTCGAGAAAATGGTTGCCCATAGACCTGAGATCAAGCCTTGGTAAATTGCAGTCACGGAAGCACTTCTTGAAGTGGGCGTTTCACCTTACAATGGCTTCACCTATGACCATATCTATGGAACCAAGGAGGGAGGGACTACTTTCAATAAATCGGGATAT
AGGCATACTGCGGTTGAGCTCCTGGTCTATGCCAATCCCCATAAGCTAACTATGTTATTGCATGCAACTGTGGAGCGCTTGCTCTTGTCCAAACgtatgttcgattgcttttttttttttttggatctatggatttataacttcctctaaccattaaaaatttggctaaatggatgaactatttctgctataaactgtag


TTTATCAAATGATGTCTTGCCTATATGGGGATTTGCTGCTATTCAAAGGCAGATTGTTTCCCACTGCCCTTCATTGTTAGCCCATTGTGTTCTATTCCTGGAGAATGTAGGAAGTGGTGTGGGTTAACAATTGATTGGATCATGCGTTTGAAGTGGTAGCTGAATTTGTAAATGCTCCGAGTAATGAAGGTTAGTGAATT
GCAGAGGCTGCTGCCAGGAACAAAGTCTGAATAAAGTTGATCGATGCATATATTATTATATTCCCATATCGATAGGATTCAAGGACAGCTATCAGCTTATTCATTTGGTTTGTCAGTTCACTTATGTAGGCGCATGTGAGTTGGTAAGATTGTCTGTGCTTGTCGTGTCAATAATATGGGCTGAATTTACGTCGATGGGG
CTGGGTTTGTGTGTTGCATGAATTGAGGAATCCAGAAGCACCTTGTAAAATACCAGAGCATACACATACAATGCAGTCCAGTCTAATATATTCTATCTAGGTATGAATGTAGGCTGCAAGCTGCAACCCCACATATATCCACAGATAATGACAATTTTGCTGGACGACTTTTCAAGTTTGCTCCACATTATATTTTATTT
TCTATTTGTATGCAACACGAGCAGTCTAAAACATGGGTGAATGTGGATTGCACACCACAGTTTAGCACTTTCACACCTTGTTTCAATGAATTCCCATAGCTTGTTCTGTAATTGAGGGAGTCCTGTATGTTTGAAATGAGTTATTTGATACGCTTGATGACATTATTTAAAAAAACTCAGCTGTGGTGATTTGACCTTGG
GTGCATTATAAAAATTCAAC

Intron 2 GTATGTTCGA ... TAAACTGTAG

Sample	Retention score (%)	Exon junction reads	5'ss reads	3'ss reads
A1	70	3	4	10
A2	100	0	12	14
A3	100	0	11	17
A4	76.47	2	4	9
A5	75	1	1	5
A6	50	8	9	7
A7	62.96	5	12	5
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A9	66.67	5	7	13
A10	40.54	11	10	5

>TRINITY_DN38455_c0_g1_i2 from sample A6 / Example spliced isoform

GTTCGAACCTCGTGAAGCTTGTGTTGAAACTTGAAAGCCTTCAGTCGCGCACCGGCATTGACGAGCAACTCGATAATGGCCATGATGCCCTTAATACAGAGATGCAGCCAGATGTAACGCATATGCATTTAATGGCAGCATAACTATTGAATATCAACAATATATCACCATAACCATGATAAGGGTGCAAAGTCATCCAT
GCCCTTTCACCTGACCCTTCTTTCCTCCTCCTTTGTGATGAGTACAGGTGAGGCAGCCTGGCAAGTATGAAGTTATGAAGGAAGCCACTGATGTTGCTCCCAAGGAATACTATGATTATATCGTGGTTGGAGGAGGGACAGCAGGGTGCCCCTTGGCAGCAACGCTCTCGCAGAACTTTAGTGTGCTGCTTCCTGAATGA
GGGGGATAGCCATATAACAACATAAATATCACGAGGTAGAGAATTTTCACATCAATTTGGCGGTTGTTTCTCCTTCCTCGTACTATCAGGTGTTTATTTCCGAGAATGGTGTTGTGAATTCGAGAGGGAGAGTTATTGGCGGTGGGAGCTCTTTCAACGCGAGGTTTTTCAGTCACGCCAGCCGCCTGGACGTGAGAAGG
AATGGATGGGATGGAGAGCTTGTGAATTATCTTTTCCCTAGGTCGAGAAAATGGTTGCCCATAGACCTGAGATCAAGCCTTGGTAAATTGCAGTCACGGAAGCACTTCTTGAAGTGGGCGTTTCACCTTACAATGGCTTCACCTATGACCATATCTATGGAACCAAGGAGGGAGGGACTACTTTCAATAAATCGGGATAT
AGGCATACTGCGGTTGAGCTCCTGGTCTATGCCAATCCCCATAAGCTAACTATGTTATTGCATGCAACTGTGGAGCGCTTGCTCTTGTCCAAACTTTATCAAATGATGTCTTGCCTATATGGGGATTTGCTGCTATTCAAAGGCAGATTGTTTCCCACTGCCCTTCATTGTTAGCCCATTGTGTTCTATTCCTGGAGAAT
GTAGGAAGTGGTGTGGGTTAACAATTGATTGGATCATGCGTTTGAAGTGGTAGCTGAATTTGTAAATGCTCCGAGTAATGAAGGTTAGTGAATTGCAGAGGCTGCTGCCAGGAACAAAGTCTGAATAAAGTTGATCGATGCATATATTATTATATTCCCATATCGATAGGATTCAAGGACAGCTATCAGCTTATTCATTT
GGTTTGTCAGTTCACTTATGTAGGCGCATGTGAGTTGGTAAGATTGTCTGTGCTTGTCGTGTCAATAATATGGGCTGAATTTACGTCGATGGGGCTGGGTTTGTGTGTTGCATGAATTGAGGAATCCAGAAGCACCTTGTAAAATACCAGAGCATACACATACAATGCAGTCCAGTCTAATATATTCTATCTAGGTATGA
ATGTAGGCTGCAAGCTGCAACCCCACATATATCCACAGATAATGACAATTTTGCTGGACGACTTTTCAAGTTTGCTCCACATTATATTTTATTTTCTATTTGTATGCAACACGAGCAGTCTAAAACATGGGTGAATGTGGATTGCACACCACAGTTTAGCACTTTCACACCTTGTTTCAATGAATTCCCATAGCTTGTTC
TGTAATTGAGGGAGTCCTGTATGTTTGAAATGAGTTATTTGATACGCTTGATGACATTATTTAAAAAAACTCAGCTGTGGTGATTTGACCTTGGGTGCATTATAAAAATTCAAC

>TRINITY_DN38455_c0_g1_i1 from sample A6 / Example unspliced isoform:

GTTCGAACCTCGTGAAGCTTGTGTTGAAACTTGAAAGCCTTCAGTCGCGCACCGGCATTGACGAGCAACTCGATAATGGCCATGATGCCCTTAATACAGAGATGCAGCCAGATGTAACGCATATGCATTTAATGGCAGCATAACTATTGAATATCAACAATATATCACCATAACCATGATAAGGGTGCAAAGTCATCCAT
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AATGGATGGGATGGAGAGCTTGTGAATTATCTTTTCCCTAGGTCGAGAAAATGGTTGCCCATAGACCTGAGATCAAGCCTTGGTAAATTGCAGTCACGGAAGCACTTCTTGAAGTGGGCGTTTCACCTTACAATGGCTTCACCTATGACCATATCTATGGAACCAAGGAGGGAGGGACTACTTTCAATAAATCGGGATAT
AGGCATACTGCGGTTGAGCTCCTGGTCTATGCCAATCCCCATAAGCTAACTATGTTATTGCATGCAACTGTGGAGCGCTTGCTCTTGTCCAAACgtatgttcgattgctttttttttttttttggatctatggatttataacttcctctaaccattaaaaatttggctaaatggatgaactatttctgctataaactgta
gTTTATCAAATGATGTCTTGCCTATATGGGGATTTGCTGCTATTCAAAGGCAGATTGTTTCCCACTGCCCTTCATTGTTAGCCCATTGTGTTCTATTCCTGGAGAATGTAGGAAGTGGTGTGGGTTAACAATTGATTGGATCATGCGTTTGAAGTGGTAGCTGAATTTGTAAATGCTCCGAGTAATGAAGGTTAGTGAAT
TGCAGAGGCTGCTGCCAGGAACAAAGTCTGAATAAAGTTGATCGATGCATATATTATTATATTCCCATATCGATAGGATTCAAGGACAGCTATCAGCTTATTCATTTGGTTTGTCAGTTCACTTATGTAGGCGCATGTGAGTTGGTAAGATTGTCTGTGCTTGTCGTGTCAATAATATGGGCTGAATTTACGTCGATGGG
GCTGGGTTTGTGTGTTGCATGAATTGAGGAATCCAGAAGCACCTTGTAAAATACCAGAGCATACACATACAATGCAGTCCAGTCTAATATATTCTATCTAGGTATGAATGTAGGCTGCAAGCTGCAACCCCACATATATCCACAGATAATGACAATTTTGCTGGACGACTTTTCAAGTTTGCTCCACATTATATTTTATT
TTCTATTTGTATGCAACACGAGCAGTCTAAAACATGGGTGAATGTGGATTGCACACCACAGTTTAGCACTTTCACACCTTGTTTCAATGAATTCCCATAGCTTGTTCTGTAATTGAGGGAGTCCTGTATGTTTGAAATGAGTTATTTGATACGCTTGATGACATTATTTAAAAAAACTCAGCTGTGGTGATTTGACCTTG
GGTGCATTATAAAAATTCAAC

Intron 3 GTATGTTCGA ... TAAACTGTAG

Sample	Retention score (%)	Exon junction reads	5'ss reads	3'ss reads
A1	70	3	4	10
A2	100	0	12	14
A3	100	0	11	17
A4	76.47	2	4	9
A5	75	1	1	5
A6	48.39	8	9	6
A7	62.96	5	12	5
A8	60	6	5	13
A9	66.67	5	7	13
A10	40.54	11	10	5

>TRINITY_DN41933_c0_g2_i3 from sample A10 / Example spliced isoform

GTGGACAATATGTAGTACTTAACACTGCATATATTAATGACTTCGAACCTGCAGCTTCGAACCTCGTGAAGCTTGTGTTGAAACTTGAAAGCCTTCAGTCGCGCACCGGCATTGACGAGCAACTCGATAATGGCCATGATGCCCTTAATACAGAGATGCAGCCAGATGTAACGCATATGCATTTAATGGCAGCATAACTA
TTGAATATCAACAATATATCACCATAACCATGATAAGGGTGCAAAGTCATCCATGCCCTTTCACCTGACCCTTCTTTCCTCCTCCTTTGTGATGAGTACAGGTGAGGCAGCCTGGCAAGTATGAAGTTATGAAGGAAGCCACTGATGTTGCTCCCAAGGAATACTATGATTATATCGTGGTTGGAGGAGGGACAGCAGGG
TGCCCCTTGGCAGCAACGCTCTCGCAGAACTTTAGTGTGCTGCTTCCTGAATGAGGGGGATAGCCATATAACAACATAAATATCACGAGGTAGAGAATTTTCACATCAATTTGGCGGTTGTTTCTCCTTCCTCGTACTATCAGGTGTTTATTTCCGAGAATGGTGTTGTGAATTCGAGAGGGAGAGTTATTGGCGGTGGG
AGCTCTTTCAACGCGAGGTTTTTCAGTCACGCCAGCCGCCTGGACGTGAGAAGGAATGGATGGGATGGAGAGCTTGTGAATTATCTTTTCCCTAGGTCGAGAAAATGGTTGCCCATAGACCTGAGATCAAGCCTTGGTAAATTGCAGTCACGGAAGCACTTCTTGAAGTGGGCGTTTCACCTTACAATGGCTTCACCTAT
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TTATTATATTCCCATATCGATAGGATTCAAGGACAGCTATCAGCTTATTCATTTGGTTTGTCAGTTCACTTATGTAGGCGCATGTGAGTTGGTAAGATTGTCTGTGCTTGTCGTGTCAATAATATGGGCTGAATTTACGTCGATGGGGCTGGGTTTGTGTGTTGCATGAATTGAGGAATCCAGAAGCACCTTGTAAAATA
CCAGAGCATACACATACAATGCAGTCCAGTCTAATATATTCTATCTAGGTATGAATGTAGGCTGCAAGCTGCAACCCCACATATATCCACAGATAATGACAATTTTGCTGGACGACTTTTCAAGGTTGCTCCGCATTATATTTTATTTTCTGTTTGTATGCAACATGAGCAGTCTAAAATATGGGTAAGTGTGGATTGCA
CACCACAGTTTAGCATTTTCACGTCTCGTTTCAATGAATTCCCATAGCTTATTCTGTAATTGAGGGAGTTCTGTTTGTTTGAAACGAGTTATCTGATATGCTTGATGATATTATTTAAAAACACTCAGCTGGTGATTTTACCTTGGGTGCATTAAAAAAATTCAACCTCACCTTTTAAAGAACCCTTTGATAAAAAAATT
CAACCTCACCTTTTAAAGAACCCTTTGATAAAAAAATTCAACCTCACCTTT

>TRINITY_DN41933_c0_g2_i2 from sample A10 / Example unspliced isoform:

GTGGACAATATGTAGTACTTAACACTGCATATATTAATGACTTCGAACCTGCAGCTTCGAACCTCGTGAAGCTTGTGTTGAAACTTGAAAGCCTTCAGTCGCGCACCGGCATTGACGAGCAACTCGATAATGGCCATGATGCCCTTAATACAGAGATGCAGCCAGATGTAACGCATATGCATTTAATGGCAGCATAACTA
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AGCTCTTTCAACGCGAGGTTTTTCAGTCACGCCAGCCGCCTGGACGTGAGAAGGAATGGATGGGATGGAGAGCTTGTGAATTATCTTTTCCCTAGGTCGAGAAAATGGTTGCCCATAGACCTGAGATCAAGCCTTGGTAAATTGCAGTCACGGAAGCACTTCTTGAAGTGGGCGTTTCACCTTACAATGGCTTCACCTAT
GACCATATCTATGGAACCAAGGAGGGAGGGACTACTTTCAATAAATCGGGATATAGGCATACTGCGGTTGAGCTCCTGGTCTATGCCAATCCCCATAAGCTAACTATGTTATTGCATGCAACTGTGGAGCGCTTGCTCTTGTCCAAACgtatgttcgattgcttttttttttttttttggatctatggatttataacttc
ctctaaccattaaaaatttggctaaatggatgaactatttctgctataaactgtagTTTATCAAATGATGTCTTGCCTATATGGGGATTTGCTGCTATTCAAAGGCAGATTGTTTCCCACTGCCCTTCATTGTTAGCCCATTGTGTTCTATTCCTGGAGAATGTAGGAAGTGGTGTGGGTTAACAATTGATTGGATCATG
CGTTTGAAGTGGTAGCTGAATTTGTAAATGCTCCGAGTAATGAAGGTTAGTGAATTGCAGAGGCTGCTGCCAGGAACAAAGTCTGAATAAAGTTGATCGATGCATATATTATTATATTCCCATATCGATAGGATTCAAGGACAGCTATCAGCTTATTCATTTGGTTTGTCAGTTCACTTATGTAGGCGCATGTGAGTTGG
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ATAATGACAATTTTGCTGGACGACTTTTCAAGGTTGCTCCGCATTATATTTTATTTTCTGTTTGTATGCAACATGAGCAGTCTAAAATATGGGTAAGTGTGGATTGCACACCACAGTTTAGCATTTTCACGTCTCGTTTCAATGAATTCCCATAGCTTATTCTGTAATTGAGGGAGTTCTGTTTGTTTGAAACGAGTTAT
CTGATATGCTTGATGATATTATTTAAAAACACTCAGCTGGTGATTTTACCTTGGGTGCATTAAAAAAATTCAACCTCACCTTTTAAAGAACCCTTTGATAAAAAAATTCAACCTCACCTTTTAAAGAACCCTTTGATAAAAAAATTCAACCTCACCTTT