NA ----> NA
Intron 1 GTAATGTGAT ... CTATCAACAG
| Sample | Retention score (%) | Exon junction reads | 5'ss reads | 3'ss reads |
| A1 | 73.24 | 38 | 80 | 128 |
| A2 | 70.9 | 39 | 81 | 109 |
| A3 | 73.64 | 17 | 26 | 69 |
| A4 | 78.12 | 21 | 62 | 88 |
| A5 | 72.83 | 25 | 42 | 92 |
| A6 | 59.57 | 38 | 43 | 69 |
| A7 | 70.03 | 52 | 75 | 168 |
| A8 | 57.89 | 44 | 34 | 87 |
| A9 | 59.09 | 45 | 44 | 86 |
| A10 | 67.32 | 42 | 68 | 105 |
>TRINITY_DN108666_c0_g2_i5 from sample A4 / Example spliced isoformGGGTAGTTGCCAGTAATATTTTTCAGATCTGCATCCGTAATCTTAGATTGTGAGACTTGGTGATGTTGGAAAGCAATGATCAGAAGTTGGGCCAACTTGTTCACATCCAAATACATCTCTAAAGAGGTCTGTTAAACGATTTTAAAGTTTTTGAAATTTCAGATAAGTGTAATGTTTCTTGTCCTCTAGAGGACTTGTGC
TTTAATATTCCATGCTTAGAATCTTCAACAGAGGGGAGTAGTCTTCTAAGGACAGAGTCGTTTAAGTCGTTTAAGTTTAAAAAGCCACATCGCCGCGAAACTAACAACATACATGTAAACGGTCCGTAGAAAAGTTAGTGGAATTTGGGTGTGATGGTCTGCAACGTGCCATTTAGTGATAAATGTTCAGCCGATGGGAT
TTTTACTCTTAGGGAGCCTTTTGGACTTCCGTTCTAAACTGTGACGTTGCAGTCGTACAGCATACATATAAACGGTCTGTAGGTAATGTGATCATTATTTTTTGATGTAATCTAGATTATTTTTTATTGTTTATTTTGAATTAGTTCAGTTTATAATGTATAGTATTACGAAAAACGTTACGCTTTTGAGGCATGCAGAT
CATTTTGAAGTGGCAAACAAAATCACTATCCACAGAAACGCCAGTGGAAATTGGGTGTGATGGTCTGCAATGTGCCATTTAGTGATAAATGTTCATCCGATGGGTCTTTTACTCTTCGGGAGCCTTTTATACTTCCCTTTCTAAACTTCGACGTTGCAGTCGTCAGATGTCTACCAGTGGTTTCTAAAATCCAGGGTATA
TGTACTGTTGACACCATATGATAGCCTTCAAATGGGAGAGTGCGCTGTATGTGTATATGTTAGTACTTTGGTCTAGATTATGGTTATTTCTACTTTGTTTAGAACAGATGGCAATTTTGAGGCTGGCATGTGTATTTCGTTGCAAATCCATCCCTGTTCCAGATGTTGGGGTATCGAATCTGTTGTGTTGATAGCGTTGC
AGAGTACATACTCAGTTTGGCTATTTCTTTAATATTGTTTGGAGAGACTTCAAATTGGCTCATTCTACTATGTTTTCATCAGGATGCTGCATGGGCTATGGTGATCAGTAATCCCAATAGTTGTTTAGATATATTTTCTATGGTATAGTTCTTGGGGTTCATGACAGACCGTTGCATTCAAGCGAGGGCCATTGTTCTTT
TCTCGTTATCCATTAGGGGGTATGTGAAGATGATATGATAATGAAGGTGCATCAGTATAATGTTTGTGGGCGCTTTGATGAAGGGCTTGTTTGACGTCAATATATCATCCTCATCAGTATCATGTTTGTGGGCGCTTTAATGAAGGGCTTGTTTGACGTTAAAATATCATCCTCACTCTAGCTCTAATGAAATTAACAAT
GAGAGATATAGCTACTTTTTTCACCTCTATGTGTCTCCTCTGGCATTAATCATGAATTGGTATCTCCCGTTATAGGGCTTGAGAGATGTTTACCCTATGTGCTCTGTTTTTCCTCCACATATGGACGTTTTCCATCAATATTTTATTCAAGCCAGTGTGCCGCGGTTTTTTTCAAGCGAGCGTGTCTAGAATTTCTCTCA
GATCTTCCTCAAGCGAGCGTGTCTGGAATTTTTCTCAGGTCTTCCTCAGGCGAGTGTGTTGATATTTTTCTTTAAGTCTTCCTCAGGCGAGCGTGTTGATATTTTTCTTCAAGTCTTCCTCAGGCGAGCGTGTTGATATATTTCCTCAGGTCTACAAACAAGCGAGCGTGTTTTCAGGTCTTTTTTCATAGTGATTATTT
TTTCCCAGGTCCTCAGACAGGCCGGCGTGGTTTAAGGTCTTCCTTCAGGCGAGCGTGAAAAGGTATTGTGTAACAGACCACATATTGATGAGGAAGCCAAGCAACAAGTTTACAGAATTCCTCTACATCACCAACTAAAGACCCCGAGTGTTTGCAGATGTCATATACCAACCAAATCGTTACCGTATGTTGCAGATATA
ATGTTTTTGGCTTTCACTTTTGCTATCTGTGGGCATGATTACTATCAGGAACGGGGCATTTTGATGTGAACTGAAGAATAACTCTACATAATTGCTTCTTCTCTTTCTACATTTATTACCGAAAGCTCTCCTCTACAGAACTGTTTCTCTCTCTACATTGTCCACACAGCTTTCGGTATGGTAGCAGATATATCAAATTG
CTGCCTTCAACCCTTGCTGTCTTCTCTTTTGGTATTGACCTAGGGTATTTTACTTGGTGTGTTTGGTAATTGTTTGTCTTCTTGGGGCTGATATCATCTACTTTTTCCTTCTATTTTTTACCTCCTAGGTTTAGTGAAATCATATGAGATATTCCTCGCCCTCAGAGGGCTTGATATTGATATTATCAATTTAGATGGTT
GTACCAAACATAGTTGTGGTGATGTATAGTATGTACCGTGTTTGAGCCATATGGTCTAGCTTTGTACTCTTTCAAATCTGTTATGCCTTTGGTGCAATATAATGAATGGCGATTTCCAAGTTTGGTTTTTTACCTCCTAGGTTTAGTGAAATCATATGAGATATTCCTCGCCCTAGAGGGCTTGATATTGATATTATCAA
TTTAGATGGTTGTACCAAACATAGTTGTGGTGATGTATAGTATGACCGTGTTTGAGCCATATGGTTTAGCTTTGTACTCTTTCAAATCTGTTATGCCTTTGGTGCAATATAATGAATGGCAATTTCCAAGTTGTGCATATCAGTTTGGTTTTTCAATTCTACAAGTCTACCAAAACGAGTTTTATTTAAAAGCTACTACG
AAAAGTATTGTAATGGTCGGTTGTAAGCATAATAGGTGAAGAGTTTTTATTCTAGTAAGTCTTTTTACCAATATGTACCTTCTAAAACAAGAATCTAATTTTCATATTTTCCCTGTAAAACTAATATAAACAGGTAGTATTTTATTTCTTAAACAAGAAGCTCTGTTTTATACAAATGGGTGGTCTTAATTATACAAAGG
TTGTGATATGCCGAATATATGAATTGAGATTAAATTCTTGAAAGATTAAGTTCTTAAACGTTTCGAGAGAATGTTGTCACATTTATTTATTTCGAGAGGTCATTTCTAATGAATTGTTGCCTGGTCATGATTTTTATCGCGGTGTCACTTCTTGGTCTGATAGTAACGATCTTTGATGTGTTAATACATGATAATACAGA
TTTAAGTTTGTAAAAGAGTCGAGCGAACGTTGACACATTTATCCTCTCTACCCAGAGAGGCCAGTTCTAATGTTAATTTTTGCAATATTGTTACGTGGTAATCGTATCTAAGCAATGACCACATGTTCTATATCGATCGCTACTATCTCTGTAATCCTCTAATTTATTGGCTCGGTTTGATAGAGGTTGGATTGTGGGAG
ATTGTAAATGTTCTCAAGTAGCAGTATGAATCTCTAAATTAGCAGCATATTTCTTTTATGGTATAATACTACTTGAAACATGTTCAACCCCATCATTTTTAGTAAGCAACGCAGATTTGTTTATAGGTGCCGTCACTTGAGAAGGTTAACAAATGTGAGCTAATTTAATTTGACTTTGGATTCCCATTCTTTTGTTAGGT
CTGAAGTGGAGTGTTTGCAAGGTGTGGTAGTCATTGTTTTCTTTTGTTAGTCTCTTTTTTTTGAGCATTTGTTTTTTTTTTTTTAAATGAATCTATGTTGGTAAGCAACGTAGATTTGTTTATTTATAGTTGTCGGCACTTTAGAGGGTTAACTCATGTGAGCTAATTTGACTTTGGATTCCCATACTTTTGTTAGGTCT
CAAATGGAGAGTTTGCTAAGGTGTGGTAGTCATTGTGTTCTTTTGTTACCCTCTTTTAGTTTTGAGCGTG
>TRINITY_DN108666_c0_g2_i1 from sample A4 / Example unspliced isoform:GGGTAGTTGCCAGTAATATTTTTCAGATCTGCATCCGTAATCTTAGATTGTGAGACTTGGTGATGTTGGAAAGCAATGATCAGAAGTTGGGCCAACTTGTTCACATCCAAATACATCTCTAAAGAGGTCTGTTAAACGATTTTAAAGTTTTTGAAATTTCAGATAAGTGTAATGTTTCTTGTCCTCTAGAGGACTTGTGC
TTTAATATTCCATGCTTAGAATCTTCAACAGAGGGGAGTAGTCTTCTAAGGACAGAGTCGTTTAAGTCGTTTAAGTTTAAAAAGCCACATCGCCGCGAAACTAACAACATACATGTAAACGGTCCGTAGgtaatgtgattgttaatctttgattttatgtaaattcattttttagtgtttattgagtatagtatgtcgaa
aacgttatgctgttgaggcatgtagatcattttgaagttgcaaacaaattcactatcaacagAAAAGTTAGTGGAATTTGGGTGTGATGGTCTGCAACGTGCCATTTAGTGATAAATGTTCAGCCGATGGGATTTTTACTCTTAGGGAGCCTTTTGGACTTCCGTTCTAAACTGTGACGTTGCAGTCGTACAGCATACAT
ATAAACGGTCTGTAGGTAATGTGATCATTATTTTTTGATGTAATCTAGATTATTTTTTATTGTTTATTTTGAATTAGTTCAGTTTATAATGTATAGTATTACGAAAAACGTTACGCTTTTGAGGCATGCAGATCATTTTGAAGTGGCAAACAAAATCACTATCCACAGAAACGCCAGTGGAAATTGGGTGTGATGGTCTG
CAATGTGCCATTTAGTGATAAATGTTCATCCGATGGGTCTTTTACTCTTCGGGAGCCTTTTATACTTCCCTTTCTAAACTTCGACGTTGCAGTCGTCAGATGTCTACCAGTGGTTTCTAAAATCCAGGGTATATGTACTGTTGACACCATATGATAGCCTTCAAATGGGAGAGTGCGCTGTATGTGTATATGTTAGTACT
TTGGTCTAGATTATGGTTATTTCTACTTTGTTTAGAACAGATGGCAATTTTGAGGCTGGCATGTGTATTTCGTTGCAAATCCATCCCTGTTCCAGATGTTGGGGTATCGAATCTGTTGTGTTGATAGCGTTGCAGAGTACATACTCAGTTTGGCTATTTCTTTAATATTGTTTGGAGAGACTTCAAATTGGCTCATTCTA
CTATGTTTTCATCAGGATGCTGCATGGGCTATGGTGATCAGTAATCCCAATAGTTGTTTAGATATATTTTCTATGGTATAGTTCTTGGGGTTCATGACAGACCGTTGCATTCAAGCGAGGGCCATTGTTCTTTTCTCGTTATCCATTAGGGGGTATGTGAAGATGATATGATAATGAAGGTGCATCAGTATAATGTTTGT
GGGCGCTTTGATGAAGGGCTTGTTTGACGTCAATATATCATCCTCATCAGTATCATGTTTGTGGGCGCTTTAATGAAGGGCTTGTTTGACGTTAAAATATCATCCTCACTCTAGCTCTAATGAAATTAACAATGAGAGATATAGCTACTTTTTTCACCTCTATGTGTCTCCTCTGGCATTAATCATGAATTGGTATCTCC
CGTTATAGGGCTTGAGAGATGTTTACCCTATGTGCTCTGTTTTTCCTCCACATATGGACGTTTTCCATCAATATTTTATTCAAGCCAGTGTGCCGCGGTTTTTTTCAAGCGAGCGTGTCTAGAATTTCTCTCAGATCTTCCTCAAGCGAGCGTGTCTGGAATTTTTCTCAGGTCTTCCTCAGGCGAGTGTGTTGATATTT
TTCTTTAAGTCTTCCTCAGGCGAGCGTGTTGATATTTTTCTTCAAGTCTTCCTCAGGCGAGCGTGTTGATATATTTCCTCAGGTCTACAAACAAGCGAGCGTGTTTTCAGGTCTTTTTTCATAGTGATTATTTTTTCCCAGGTCCTCAGACAGGCCGGCGTGGTTTAAGGTCTTCCTTCAGGCGAGCGTGAAAAGGTATT
GTGTAACAGACCACATATTGATGAGGAAGCCAAGCAACAAGTTTACAGAATTCCTCTACATCACCAACTAAAGACCCCGAGTGTTTGCAGATGTCATATACCAACCAAATCGTTACCGTATGTTGCAGATATAATGTTTTTGGCTTTCACTTTTGCTATCTGTGGGCATGATTACTATCAGGAACGGGGCATTTTGATGT
GAACTGAAGAATAACTCTACATAATTGCTTCTTCTCTTTCTACATTTATTACCGAAAGCTCTCCTCTACAGAACTGTTTCTCTCTCTACATTGTCCACACAGCTTTCGGTATGGTAGCAGATATATCAAATTGCTGCCTTCAACCCTTGCTGTCTTCTCTTTTGGTATTGACCTAGGGTATTTTACTTGGTGTGTTTGGT
AATTGTTTGTCTTCTTGGGGCTGATATCATCTACTTTTTCCTTCTATTTTTTACCTCCTAGGTTTAGTGAAATCATATGAGATATTCCTCGCCCTCAGAGGGCTTGATATTGATATTATCAATTTAGATGGTTGTACCAAACATAGTTGTGGTGATGTATAGTATGTACCGTGTTTGAGCCATATGGTCTAGCTTTGTAC
TCTTTCAAATCTGTTATGCCTTTGGTGCAATATAATGAATGGCGATTTCCAAGTTTGGTTTTTTACCTCCTAGGTTTAGTGAAATCATATGAGATATTCCTCGCCCTAGAGGGCTTGATATTGATATTATCAATTTAGATGGTTGTACCAAACATAGTTGTGGTGATGTATAGTATGACCGTGTTTGAGCCATATGGTTT
AGCTTTGTACTCTTTCAAATCTGTTATGCCTTTGGTGCAATATAATGAATGGCAATTTCCAAGTTGTGCATATCAGTTTGGTTTTTCAATTCTACAAGTCTACCAAAACGAGTTTTATTTAAAAGCTACTACGAAAAGTATTGTAATGGTCGGTTGTAAGCATAATAGGTGAAGAGTTTTTATTCTAGTAAGTCTTTTTA
CCAATATGTACCTTCTAAAACAAGAATCTAATTTTCATATTTTCCCTGTAAAACTAATATAAACAGGTAGTATTTTATTTCTTAAACAAGAAGCTCTGTTTTATACAAATGGGTGGTCTTAATTATACAAAGGTTGTGATATGCCGAATATATGAATTGAGATTAAATTCTTGAAAGATTAAGTTCTTAAACGTTTCGAG
AGAATGTTGTCACATTTATTTATTTCGAGAGGTCATTTCTAATGAATTGTTGCCTGGTCATGATTTTTATCGCGGTGTCACTTCTTGGTCTGATAGTAACGATCTTTGATGTGTTAATACATGATAATACAGATTTAAGTTTGTAAAAGAGTCGAGCGAACGTTGACACATTTATCCTCTCTACCCAGAGAGGCCAGTTC
TAATGTTAATTTTTGCAATATTGTTACGTGGTAATCGTATCTAAGCAATGACCACATGTTCTATATCGATCGCTACTATCTCTGTAATCCTCTAATTTATTGGCTCGGTTTGATAGAGGTTGGATTGTGGGAGATTGTAAATGTTCTCAAGTAGCAGTATGAATCTCTAAATTAGCAGCATATTTCTTTTATGGTATAAT
ACTACTTGAAACATGTTCAACCCCATCATTTTTAGTAAGCAACGCAGATTTGTTTATAGGTGCCGTCACTTGAGAAGGTTAACAAATGTGAGCTAATTTAATTTGACTTTGGATTCCCATTCTTTTGTTAGGTCTGAAGTGGAGTGTTTGCAAGGTGTGGTAGTCATTGTTTTCTTTTGTTAGTCTCTTTTTTTTGAGCA
TTTGTTTTTTTTTTTTTAAATGAATCTATGTTGGTAAGCAACGTAGATTTGTTTATTTATAGTTGTCGGCACTTTAGAGGGTTAACTCATGTGAGCTAATTTGACTTTGGATTCCCATACTTTTGTTAGGTCTCAAATGGAGAGTTTGCTAAGGTGTGGTAGTCATTGTGTTCTTTTGTTACCCTCTTTTAGTTTTGAGC
GTG
Intron 2 GTAATGTGAT ... AGGCATGCAG
| Sample | Retention score (%) | Exon junction reads | 5'ss reads | 3'ss reads |
| A1 | 64.86 | 67 | 112 | 135.5 |
| A2 | 69.22 | 45 | 72 | 130.5 |
| A3 | 65.3 | 32 | 54 | 66.5 |
| A4 | 74.02 | 27 | 51.5 | 102.5 |
| A5 | 62.91 | 38 | 54.5 | 74.5 |
| A6 | 56.98 | 33 | 35 | 52.5 |
| A7 | 61.02 | 91 | 122 | 163 |
| A8 | 54.45 | 55 | 39 | 92.5 |
| A9 | 58.83 | 60 | 68 | 103.5 |
| A10 | 61.34 | 72 | 85 | 143.5 |
>TRINITY_DN108666_c0_g2_i3 from sample A4 / Example spliced isoformGGGTAGTTGCCAGTAATATTTTTCAGATCTGCATCCGTAATCTTAGATTGTGAGACTTGGTGATGTTGGAAAGCAATGATCAGAAGTTGGGCCAACTTGTTCACATCCAAATACATCTCTAAAGAGGTCTGTTAAACGATTTTAAAGTTTTTGAAATTTCAGATAAGTGTAATGTTTCTTGTCCTCTAGAGGACTTGTGC
TTTAATATTCCATGCTTAGAATCTTCAACAGAGGGGAGTAGTCTTCTAAGGACAGAGTCGTTTAAGTCGTTTAAGTTTAAAAAGCCACATCGCCGCGAAACTAACAACATACATGTAAACGGTCCGTAGGTAATGTGATTGTTAATCTTTGATTTTATGTAAATTCATTTTTTAGTGTTTATTGAGTATAGTATGTCGAA
AACGTTATGCTGTTGAGGCATGTAGATCATTTTGAAGTTGCAAACAAATTCACTATCAACAGAAAAGTTAGTGGAATTTGGGTGTGATGGTCTGCAACGTGCCATTTAGTGATAAATGTTCAGCCGATGGGATTTTTACTCTTAGGGAGCCTTTTGGACTTCCGTTCTAAACTGTGACGTTGCAGTCGTACAGCATACAT
ATAAACGGTCTGTAGATCATTTTGAAGTGGCAAACAAAATCACTATCCACAGAAACGCCAGTGGAAATTGGGTGTGATGGTCTGCAATGTGCCATTTAGTGATAAATGTTCATCCGATGGGTCTTTTACTCTTCGGGAGCCTTTTATACTTCCCTTTCTAAACTTCGACGTTGCAGTCGTCAGATGTCTACCAGTGGTTT
CTAAAATCCAGGGTATATGTACTGTTGACACCATATGATAGCCTTCAAATGGGAGAGTGCGCTGTATGTGTATATGTTAGTACTTTGGTCTAGATTATGGTTATTTCTACTTTGTTTAGAACAGATGGCAATTTTGAGGCTGGCATGTGTATTTCGTTGCAAATCCATCCCTGTTCCAGATGTTGGGGTATCGAATCTGT
TGTGTTGATAGCGTTGCAGAGTACATACTCAGTTTGGCTATTTCTTTAATATTGTTTGGAGAGACTTCAAATTGGCTCATTCTACTATGTTTTCATCAGGATGCTGCATGGGCTATGGTGATCAGTAATCCCAATAGTTGTTTAGATATATTTTCTATGGTATAGTTCTTGGGGTTCATGACAGACCGTTGCATTCAAGC
GAGGGCCATTGTTCTTTTCTCGTTATCCATTAGGGGGTATGTGAAGATGATATGATAATGAAGGTGCATCAGTATAATGTTTGTGGGCGCTTTGATGAAGGGCTTGTTTGACGTCAATATATCATCCTCATCAGTATCATGTTTGTGGGCGCTTTAATGAAGGGCTTGTTTGACGTTAAAATATCATCCTCACTCTAGCT
CTAATGAAATTAACAATGAGAGATATAGCTACTTTTTTCACCTCTATGTGTCTCCTCTGGCATTAATCATGAATTGGTATCTCCCGTTATAGGGCTTGAGAGATGTTTACCCTATGTGCTCTGTTTTTCCTCCACATATGGACGTTTTCCATCAATATTTTATTCAAGCCAGTGTGCCGCGGTTTTTTTCAAGCGAGCGT
GTCTAGAATTTCTCTCAGATCTTCCTCAAGCGAGCGTGTCTGGAATTTTTCTCAGGTCTTCCTCAGGCGAGTGTGTTGATATTTTTCTTTAAGTCTTCCTCAGGCGAGCGTGTTGATATTTTTCTTCAAGTCTTCCTCAGGCGAGCGTGTTGATATATTTCCTCAGGTCTACAAACAAGCGAGCGTGTTTTCAGGTCTTT
TTTCATAGTGATTATTTTTTCCCAGGTCCTCAGACAGGCCGGCGTGGTTTAAGGTCTTCCTTCAGGCGAGCGTGAAAAGGTATTGTGTAACAGACCACATATTGATGAGGAAGCCAAGCAACAAGTTTACAGAATTCCTCTACATCACCAACTAAAGACCCCGAGTGTTTGCAGATGTCATATACCAACCAAATCGTTAC
CGTATGTTGCAGATATAATGTTTTTGGCTTTCACTTTTGCTATCTGTGGGCATGATTACTATCAGGAACGGGGCATTTTGATGTGAACTGAAGAATAACTCTACATAATTGCTTCTTCTCTTTCTACATTTATTACCGAAAGCTCTCCTCTACAGAACTGTTTCTCTCTCTACATTGTCCACACAGCTTTCGGTATGGTA
GCAGATATATCAAATTGCTGCCTTCAACCCTTGCTGTCTTCTCTTTTGGTATTGACCTAGGGTATTTTACTTGGTGTGTTTGGTAATTGTTTGTCTTCTTGGGGCTGATATCATCTACTTTTTCCTTCTATTTTTTACCTCCTAGGTTTAGTGAAATCATATGAGATATTCCTCGCCCTCAGAGGGCTTGATATTGATAT
TATCAATTTAGATGGTTGTACCAAACATAGTTGTGGTGATGTATAGTATGTACCGTGTTTGAGCCATATGGTCTAGCTTTGTACTCTTTCAAATCTGTTATGCCTTTGGTGCAATATAATGAATGGCGATTTCCAAGTTTGGTTTTTTACCTCCTAGGTTTAGTGAAATCATATGAGATATTCCTCGCCCTAGAGGGCTT
GATATTGATATTATCAATTTAGATGGTTGTACCAAACATAGTTGTGGTGATGTATAGTATGACCGTGTTTGAGCCATATGGTTTAGCTTTGTACTCTTTCAAATCTGTTATGCCTTTGGTGCAATATAATGAATGGCAATTTCCAAGTTGTGCATATCAGTTTGGTTTTTCAATTCTACAAGTCTACCAAAACGAGTTTT
ATTTAAAAGCTACTACGAAAAGTATTGTAATGGTCGGTTGTAAGCATAATAGGTGAAGAGTTTTTATTCTAGTAAGTCTTTTTACCAATATGTACCTTCTAAAACAAGAATCTAATTTTCATATTTTCCCTGTAAAACTAATATAAACAGGTAGTATTTTATTTCTTAAACAAGAAGCTCTGTTTTATACAAATGGGTGG
TCTTAATTATACAAAGGTTGTGATATGCCGAATATATGAATTGAGATTAAATTCTTGAAAGATTAAGTTCTTAAACGTTTCGAGAGAATGTTGTCACATTTATTTATTTCGAGAGGTCATTTCTAATGAATTGTTGCCTGGTCATGATTTTTATCGCGGTGTCACTTCTTGGTCTGATAGTAACGATCTTTGATGTGTTA
ATACATGATAATACAGATTTAAGTTTGTAAAAGAGTCGAGCGAACGTTGACACATTTATCCTCTCTACCCAGAGAGGCCAGTTCTAATGTTAATTTTTGCAATATTGTTACGTGGTAATCGTATCTAAGCAATGACCACATGTTCTATATCGATCGCTACTATCTCTGTAATCCTCTAATTTATTGGCTCGGTTTGATAG
AGGTTGGATTGTGGGAGATTGTAAATGTTCTCAAGTAGCAGTATGAATCTCTAAATTAGCAGCATATTTCTTTTATGGTATAATACTACTTGAAACATGTTCAACCCCATCATTTTTAGTAAGCAACGCAGATTTGTTTATAGGTGCCGTCACTTGAGAAGGTTAACAAATGTGAGCTAATTTAATTTGACTTTGGATTC
CCATTCTTTTGTTAGGTCTGAAGTGGAGTGTTTGCAAGGTGTGGTAGTCATTGTTTTCTTTTGTTAGTCTCTTTTTTTTGAGCATTTGTTTTTTTTTTTTTAAATGAATCTATGTTGGTAAGCAACGTAGATTTGTTTATTTATAGTTGTCGGCACTTTAGAGGGTTAACTCATGTGAGCTAATTTGACTTTGGATTCCC
ATACTTTTGTTAGGTCTCAAATGGAGAGTTTGCTAAGGTGTGGTAGTCATTGTGTTCTTTTGTTACCCTCTTTTAGTTTTGAGCGTG
>TRINITY_DN108666_c0_g2_i5 from sample A4 / Example unspliced isoform:GGGTAGTTGCCAGTAATATTTTTCAGATCTGCATCCGTAATCTTAGATTGTGAGACTTGGTGATGTTGGAAAGCAATGATCAGAAGTTGGGCCAACTTGTTCACATCCAAATACATCTCTAAAGAGGTCTGTTAAACGATTTTAAAGTTTTTGAAATTTCAGATAAGTGTAATGTTTCTTGTCCTCTAGAGGACTTGTGC
TTTAATATTCCATGCTTAGAATCTTCAACAGAGGGGAGTAGTCTTCTAAGGACAGAGTCGTTTAAGTCGTTTAAGTTTAAAAAGCCACATCGCCGCGAAACTAACAACATACATGTAAACGGTCCGTAGAAAAGTTAGTGGAATTTGGGTGTGATGGTCTGCAACGTGCCATTTAGTGATAAATGTTCAGCCGATGGGAT
TTTTACTCTTAGGGAGCCTTTTGGACTTCCGTTCTAAACTGTGACGTTGCAGTCGTACAGCATACATATAAACGGTCTGTAGgtaatgtgatcattattttttgatgtaatctagattattttttattgtttattttgaattagttcagtttataatgtatagtattacgaaaaacgttacgcttttgaggcatgcagAT
CATTTTGAAGTGGCAAACAAAATCACTATCCACAGAAACGCCAGTGGAAATTGGGTGTGATGGTCTGCAATGTGCCATTTAGTGATAAATGTTCATCCGATGGGTCTTTTACTCTTCGGGAGCCTTTTATACTTCCCTTTCTAAACTTCGACGTTGCAGTCGTCAGATGTCTACCAGTGGTTTCTAAAATCCAGGGTATA
TGTACTGTTGACACCATATGATAGCCTTCAAATGGGAGAGTGCGCTGTATGTGTATATGTTAGTACTTTGGTCTAGATTATGGTTATTTCTACTTTGTTTAGAACAGATGGCAATTTTGAGGCTGGCATGTGTATTTCGTTGCAAATCCATCCCTGTTCCAGATGTTGGGGTATCGAATCTGTTGTGTTGATAGCGTTGC
AGAGTACATACTCAGTTTGGCTATTTCTTTAATATTGTTTGGAGAGACTTCAAATTGGCTCATTCTACTATGTTTTCATCAGGATGCTGCATGGGCTATGGTGATCAGTAATCCCAATAGTTGTTTAGATATATTTTCTATGGTATAGTTCTTGGGGTTCATGACAGACCGTTGCATTCAAGCGAGGGCCATTGTTCTTT
TCTCGTTATCCATTAGGGGGTATGTGAAGATGATATGATAATGAAGGTGCATCAGTATAATGTTTGTGGGCGCTTTGATGAAGGGCTTGTTTGACGTCAATATATCATCCTCATCAGTATCATGTTTGTGGGCGCTTTAATGAAGGGCTTGTTTGACGTTAAAATATCATCCTCACTCTAGCTCTAATGAAATTAACAAT
GAGAGATATAGCTACTTTTTTCACCTCTATGTGTCTCCTCTGGCATTAATCATGAATTGGTATCTCCCGTTATAGGGCTTGAGAGATGTTTACCCTATGTGCTCTGTTTTTCCTCCACATATGGACGTTTTCCATCAATATTTTATTCAAGCCAGTGTGCCGCGGTTTTTTTCAAGCGAGCGTGTCTAGAATTTCTCTCA
GATCTTCCTCAAGCGAGCGTGTCTGGAATTTTTCTCAGGTCTTCCTCAGGCGAGTGTGTTGATATTTTTCTTTAAGTCTTCCTCAGGCGAGCGTGTTGATATTTTTCTTCAAGTCTTCCTCAGGCGAGCGTGTTGATATATTTCCTCAGGTCTACAAACAAGCGAGCGTGTTTTCAGGTCTTTTTTCATAGTGATTATTT
TTTCCCAGGTCCTCAGACAGGCCGGCGTGGTTTAAGGTCTTCCTTCAGGCGAGCGTGAAAAGGTATTGTGTAACAGACCACATATTGATGAGGAAGCCAAGCAACAAGTTTACAGAATTCCTCTACATCACCAACTAAAGACCCCGAGTGTTTGCAGATGTCATATACCAACCAAATCGTTACCGTATGTTGCAGATATA
ATGTTTTTGGCTTTCACTTTTGCTATCTGTGGGCATGATTACTATCAGGAACGGGGCATTTTGATGTGAACTGAAGAATAACTCTACATAATTGCTTCTTCTCTTTCTACATTTATTACCGAAAGCTCTCCTCTACAGAACTGTTTCTCTCTCTACATTGTCCACACAGCTTTCGGTATGGTAGCAGATATATCAAATTG
CTGCCTTCAACCCTTGCTGTCTTCTCTTTTGGTATTGACCTAGGGTATTTTACTTGGTGTGTTTGGTAATTGTTTGTCTTCTTGGGGCTGATATCATCTACTTTTTCCTTCTATTTTTTACCTCCTAGGTTTAGTGAAATCATATGAGATATTCCTCGCCCTCAGAGGGCTTGATATTGATATTATCAATTTAGATGGTT
GTACCAAACATAGTTGTGGTGATGTATAGTATGTACCGTGTTTGAGCCATATGGTCTAGCTTTGTACTCTTTCAAATCTGTTATGCCTTTGGTGCAATATAATGAATGGCGATTTCCAAGTTTGGTTTTTTACCTCCTAGGTTTAGTGAAATCATATGAGATATTCCTCGCCCTAGAGGGCTTGATATTGATATTATCAA
TTTAGATGGTTGTACCAAACATAGTTGTGGTGATGTATAGTATGACCGTGTTTGAGCCATATGGTTTAGCTTTGTACTCTTTCAAATCTGTTATGCCTTTGGTGCAATATAATGAATGGCAATTTCCAAGTTGTGCATATCAGTTTGGTTTTTCAATTCTACAAGTCTACCAAAACGAGTTTTATTTAAAAGCTACTACG
AAAAGTATTGTAATGGTCGGTTGTAAGCATAATAGGTGAAGAGTTTTTATTCTAGTAAGTCTTTTTACCAATATGTACCTTCTAAAACAAGAATCTAATTTTCATATTTTCCCTGTAAAACTAATATAAACAGGTAGTATTTTATTTCTTAAACAAGAAGCTCTGTTTTATACAAATGGGTGGTCTTAATTATACAAAGG
TTGTGATATGCCGAATATATGAATTGAGATTAAATTCTTGAAAGATTAAGTTCTTAAACGTTTCGAGAGAATGTTGTCACATTTATTTATTTCGAGAGGTCATTTCTAATGAATTGTTGCCTGGTCATGATTTTTATCGCGGTGTCACTTCTTGGTCTGATAGTAACGATCTTTGATGTGTTAATACATGATAATACAGA
TTTAAGTTTGTAAAAGAGTCGAGCGAACGTTGACACATTTATCCTCTCTACCCAGAGAGGCCAGTTCTAATGTTAATTTTTGCAATATTGTTACGTGGTAATCGTATCTAAGCAATGACCACATGTTCTATATCGATCGCTACTATCTCTGTAATCCTCTAATTTATTGGCTCGGTTTGATAGAGGTTGGATTGTGGGAG
ATTGTAAATGTTCTCAAGTAGCAGTATGAATCTCTAAATTAGCAGCATATTTCTTTTATGGTATAATACTACTTGAAACATGTTCAACCCCATCATTTTTAGTAAGCAACGCAGATTTGTTTATAGGTGCCGTCACTTGAGAAGGTTAACAAATGTGAGCTAATTTAATTTGACTTTGGATTCCCATTCTTTTGTTAGGT
CTGAAGTGGAGTGTTTGCAAGGTGTGGTAGTCATTGTTTTCTTTTGTTAGTCTCTTTTTTTTGAGCATTTGTTTTTTTTTTTTTAAATGAATCTATGTTGGTAAGCAACGTAGATTTGTTTATTTATAGTTGTCGGCACTTTAGAGGGTTAACTCATGTGAGCTAATTTGACTTTGGATTCCCATACTTTTGTTAGGTCT
CAAATGGAGAGTTTGCTAAGGTGTGGTAGTCATTGTGTTCTTTTGTTACCCTCTTTTAGTTTTGAGCGTG