sp|Q4FE45|XB33_ARATH ----> E3 ubiquitin-protein ligase XBAT33


Intron 1 GTGTGTGGCC ... TGTTTTTTAG

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A1034.7860320



>TRINITY_DN105948_c0_g1_i6 from sample A2 / Example spliced isoform
CTCTAAGTAAAATTTGACTTATTTTTCTATTTTAAACAGGTTCTTCAGCTTGGGGTTGTGTGAAGTTGGCTTTGGGAGGGCCGTTGAACGCATAAATCGGGGCCATTAAAGCACGCTTTGAGCAATTGGGTTTATTTAGAATGGGAAGAATGGTGACTGGGCCGAGTCTCAGAGTATTTTGAATTCGGGAGATCAAGTGG
GTCACTGGTGGGACATTGCTGGATGCCTCTGAAACAGCACAAGTACATTCAAAACCAGCAAAGATCTTGTGATTTGCTCTGCGACGAAGCGTTGTCCGCCGAGAAATATCGAAATAGGATCCACTAAATTTGATTAGGAGGGCCGTACACTAATTTTTTTCCCCATTGGAGTTTCCTGCATCATGGACTCGATTCAGTGA
TTTTGAGTGGTTTTTTGTAGCTTTGGACAACGTGGGTTATGTTCAGAGTTTCTTGTTAAGGGGGTTGGGGGGGTTCCACTGTACTTGTGAGTCAATGCAATAAGGATTTGAGGAGTGTGAGGGTGTTTATCTAAATGGGCAATTCTTTCGGATGCTCTGCCTCTGGTGAACGCCTGGTTTCTGCTGCGAGAGATGGGGAT
TTGGTGGAAGCTCGCATGCTGCTGGATTTCAATCCGTGTTTGGCGAGGTATTCCACCTTCGGTGGGCTGAATTCGCCTCTTCATTTCGCAGCTGCTAAGGGTCATAGTGAGATTGTGGCCTTGCTGCTGGAGCACGGAGCTGATGTGAATTCCAGGAATTACTGTGGTCAGACAGCTTTGATGCAAGCTTGCCGATATGG
ACACTGGGAGGTGGTGCAGACTCTTCTTCTGTTTAAAGCAAATGTGACTAGAGCAGATTACCTCAGTGGTAGGACAGCCTTGCATTTTGCAGCCGTGAATGGTCACACAAGATGCATCAGACTTGTTGTGGCAGATTTTGTGCCTAGTGCACCTTACCATTTGAGTATATATCCAGTTTCTGGCAACAAGGATGATACCT
CACCTGCGAGACGCCGGTTTGACCTGAATGCACTCTCCAAATTTGTGAATAGAGCAGCAGATGGTGGGATTACAGCTCTTCATATGGCTGCCCTGAATGGCCATTTTGACTGTGTACAATTGCTACTTGATCTAAATGCAAATGTGTCAGCTGTCACATTTCATTATGGCACATCAATGGACCTGATAGGAGCTGGAAGC
ACTCCTCTACACTATGCAGCATGTGGAGGAAACATACAGTGCTGTCAGATCCTGCTGGCTCGGGGTGCTAGTAGAACCACTTTGAATTGTAACGGGTGGATACCAGTTGAGGTGGCTAGAATATGGGGGCGTCATTGGCTTGAGCCACTATTAGCACCTAACTCAGATTCAGCTTTACCAACCTATGCTCCATCAAGCTT
TCTTTCACTTCCTCTTATGAGTATACTTAATATTGCAAGGGAACATGGATTACAAGCAATGGATTCTGCAAGTGAAGATAGTGAGCATTGTGCAGTTTGTTTGGAGCGTAACTGTACTGTTGCTGCTGAAGGTTGTGGTCATGAACTCTGTACGAGATGCGCTTTGTATCTTTGTTCGACAAATAATGTTACTTCCACTA
CTGTAGGTCCTCCTGGGTCCATATCTTGCCCTCTTTGCCGTCAGGGTATTGTATCCTTTGTAAAATTACCTGGATCTCCCTCAAAGGAGTTGAAGTTGAATATTGCACTTGGATTATGCACTCAATGTGCATCAGACACTTGTGATCCAGATTCACCATCTAGTTCAGTATGTAAATCGGAGTTTCGGAGAAATAGAGTC
TCTCCTGTATCTTCAGAATCATTTTGCACTGTCTCCTGCAGTCCATTCCCATCTGTTAGCCTACCCTTGTGTGCATGCAACAACGAACCTGGCCCTTCACTTGAAGCCAGACAGGAAACGGAGAGTTCTCGGCAATCACAGCCACCTGTACATGATGCCTCTGCTGCAGATTCAGTTTCCTCTTTGGAACGTGTACTTGA
TTCCTCTCTTGAACAGAAAGAGGCAGTTAGCCCAAGGGTTGACAAAGCAAGCTGCTCAAAGATATTGTTTTGGGGCAGGAAGAATAGCCATAGAGAAAAGCCTGGAGAACAACCTTGCAACACTGAAATAAGCGTTTGACATATTACATATGTTGTGGTTGTCAAATATTTGTGACTAATGATCCACCATTGGTTGTATT
CTATTCCGTTCTTTGTAATTTGAATTCATTTTTTATGGCTTGGCAGAAGTTCCCCGATGACTTCTAAAATTAGAGGAAAAGTGCGCCTTTGACATGGTTCTTGCCAAATCTTATCGATACAACCAGCTTTGTTTATCATTTGATCTACTGGTTATAAAACTGGCGTTTTGATTCACGCTGTTAATTATTGTGTGGTGCAA
ATTTCTTTCTGTGGTGCTCGTCTTGGAGGAAGCTACCAGTTGGCAGCAGAATACATGCAACTGATGCTTTACAGGCAATTAAGATGGTATCTTCAGATTGACTTCTTCACTACCATGATTGTGTGATTTGGCTTCCATAAGCTTCTTGTTCCCGGCAAACACAGAATGCACAGAGATGGTTATCTAATACTGCCATTGAC
ATTTGTGATCAACTGAATGATGATAAAGTAAAGGACATGTACAAGTATTTGTAACTTGTACAGGGGCAATGTATCTTTTATCTATACGAGTGCTGCTTTTCTAGAGTGAATTCAAGTTCTATGTCAGATCATGTATGAGAAAATTTCATCCGGGCACTCTTTTTAGTGAGCAGAAAGGCAGTGCTACTGTAAGAGATGGA
ATTGCATTTTATCGATTTTTCTTAGTTTGGCCAGAACTACTCAGTGTGGATGATATTGTCAGGAGTTCTGTATCATCTTGTTTGTTTTTGGTAGTCCTCTTCTTGGTCTGTCCAGAAAGTGGAGGATTTCGGCTGTTGCAATCTGGTTGGTATTCAACCTTTAATTGATTATGGTGAACTAGGAAGAATAATTCATTCTT
TTGTATTTATTCTCAAGATGGAGTTATTGACCTAATATAATAGGCACATAACAAGGTCAATTATCATCATTCACGAAGTAGAAATATAGGTCATCCTGAGTTCAGATATTTTCTGTATCCATTTATCAACATGCTTCTTTTGTGCATGGCTACCATGTATGTGTAATGTATCAAAATGAAACCTTTTATGTGGTTTTATG
GTGTTTTGAAGAAAAATAAGCTATTCAAATAATTTAAGTAGGCATTCCAAG


>TRINITY_DN105948_c0_g1_i4 from sample A2 / Example unspliced isoform:
GACTAGAGCAGATTACCTCAGTGGTAGGACAGCCTTGCATTTTGCAGCCGTGAATGGTCACACAAGATGCATCAGACTTGTTGTGGCAGATTTTGTGCCTAGTGCACCTTACCATTTGAGTATATATCCAGTTTCTGGCAACAAGGATGATACCTCACCTGCGAGACGCCGGTTTGACCTGAATGCACTCTCCAAATTTG
TGAATAGAGCAGCAGATGGTGGGATTACAGCTCTTCATATGGCTGCCCTGAATGGCCATTTTGACTGTGTACAATTGCTACTTGATCTAAATGCAAATGTGTCAGCTGTCACATTTCATTATGGCACATCAATGGACCTGATAGgtgtgtggcctatcaaattgttaaaatgagagatgatagtttttaagtctgcttat
ctgttcatttcaaagttgatgaaaccctaattttaatcagacttctaatgtgagctatattaatggattaacatgttttttagGAGCTGGAAGCAC



Intron 2 GTATCTCGAA ... TCTCCTGCAG

SampleRetention score (%)Exon junction reads5'ss reads3'ss reads
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A823.8124510
A919.1940712
A1015.79961323



>TRINITY_DN108432_c2_g1_i2 from sample A3 / Example spliced isoform
CTCTAAGTAAAATTTGACTTATTTTTCTATTTTAAACAGGTTCTTCAGCTTGGGGTTGTGTGAAGTTGGCTTTGGGAGGGCCGTTGAACGCATAAATCGGGGCCATTAAAGCACGCTTTGAGCAATTGGGTTTATTTAGAATGGGAAGAATGGTGACTGGGCCGAGTCTCAGAGTATTTTGAATTCGGGAGATCAAGTGG
GTCACTGGTGGGACATTGCTGGATGCCTCTGAAACAGCACAAGTACATTCAAAACCAGCAAAGATCTTGTGATTTGCTCTGCGACGAAGCGTTGTCCGCCGAGAAATATCGAAATAGGATCCACTAAATTTGATTAGGAGGGCCGTACACTAATTTTTTTCCCCATTGGAGTTTCCTGCATCATGGACTCGATTCAGTGA
TTTTGAGTGGTTTTTTGTAGCTTTGGACAACGTGGGTTATGTTCAGAGTTTCTTGTTAAGGGGGTTGGGGGGGTTCCACTGTACTTGTGAGTCAATGCAATAAGGATTTGAGGAGTGTGAGGGTGTTTATCTAAATGGGCAATTCTTTCGGATGCTCTGCCTCTGGTGAACGCCTGGTTTCTGCTGCGAGAGATGGGGAT
TTGGTGGAAGCTCGCATGCTGCTGGATTTCAATCCGTGTTTGGCGAGGTATTCCACCTTCGGTGGGCTGAATTCGCCTCTTCATTTCGCAGCTGCTAAGGGTCATAGTGAGATTGTGGCCTTGCTGCTGGAGCACGGAGCTGATGTGAATTCCAGGAATTACTGTGGTCAGACAGCTTTGATGCAAGCTTGCCGATATGG
ACACTGGGAGGTGGTGCAGACTCTTCTTCTGTTTAAAGCAAATGTGACTAGAGCAGATTACCTCAGTGGTAGGACAGCCTTGCATTTTGCAGCCGTGAATGGTCACACAAGATGCATCAGACTTGTTGTGGCAGATTTTGTGCCTAGTGCACCTTACCATTTGAGTATATATCCAGTTTCTGGCAACAAGGATGATACCT
CACCTGCGAGACGCCGGTTTGACCTGAATGCACTCTCCAAATTTGTGAATAGAGCAGCAGATGGTGGGATTACAGCTCTTCATATGGCTGCCCTGAATGGCCATTTTGACTGTGTACAATTGCTACTTGATCTAAATGCAAATGTGTCAGCTGTCACATTTCATTATGGCACATCAATGGACCTGATAGGAGCTGGAAGC
ACTCCTCTACACTATGCAGCATGTGGAGGAAACATACAGTGCTGTCAGATCCTGCTGGCTCGGGGTGCTAGTAGAACCACTTTGAATTGTAACGGGTGGATACCAGTTGAGGTGGCTAGAATATGGGGGCGTCATTGGCTTGAGCCACTATTAGCACCTAACTCAGATTCAGCTTTACCAACCTATGCTCCATCAAGCTT
TCTTTCACTTCCTCTTATGAGTATACTTAATATTGCAAGGGAACATGGATTACAAGCAATGGATTCTGCAAGTGAAGATAGTGAGCATTGTGCAGTTTGTTTGGAGCGTAACTGTACTGTTGCTGCTGAAGGTTGTGGTCATGAACTCTGTACGAGATGCGCTTTGTATCTTTGTTCGACAAATAATGTTACTTCCACTA
CTGTAGGTCCTCCTGGGTCCATATCTTGCCCTCTTTGCCGTCAGGGTATTGTATCCTTTGTAAAATTACCTGGATCTCCCTCAAAGGAGTTGAAGTTGAATATTGCACTTGGATTATGCACTCAATGTGCATCAGACACTTGTGATCCAGATTCACCATCTAGTTCAGTATGTAAATCGGAGTTTCGGAGAAATAGAGTC
TCTCCTGTATCTTCAGAATCATTTTGCACTGTCTCCTGCAGTCCATTCCCATCTGTTAGCCTACCCTTGTGTGCATGCAACAACGAACCTGGCCCTTCACTTGAAGCCAGACAGGAAACGGAGAGTTCTCGGCAATCACAGCCACCTGTACATGATGCCTCTGCTGCAGATTCAGTTTCCTCTTTGGAACGTGTACTTGA
TTCCTCTCTTGAACAGAAAGAGGCAGTTAGCCCAAGGGTTGACAAAGCAAGCTGCTCAAAGATATTGTTTTGGGGCAGGAAGAATAGCCATAGAGAAAAGCCTGGAGAACAACCTTGCAACACTGAAATAAGCGTTTGACATATTACATATGTTGTGGTTGTCAAATATTTGTGACTAATGATCCACCATTGGTTGTATT
CTATTCCGTTCTTTGTAATTTGAATTCATTTTTTATGGCTTGGCAGAAGTTCCCCGATGACTTCTAAAATTAGAGGAAAAGTGCGCCTTTGACATGGTTCTTGCCAAATCTTATCGATACAACCAGCTTTGTTTATCATTTGATCTACTGGTTATAAAACTGGCGTTTTGATTCACGCTGTTAATTATTGTGTGGTGCAA
ATTTCTTTCTGTGGTGCTCGTCTTGGAGGAAGCTACCAGTTGGCAGCAGAATACATGCAACTGATGCTTTACAGGCAATTAAGATGGTATCTTCAGATTGACTTCTTCACTACCATGATTGTGTGATTTGGCTTCCATAAGCTTCTTGTTCCCGGCAAACACAGAATGCACAGAGATGGTTATCTAATACTGCCATTGAC
ATTTGTGATCAACTGAATGATGATAAAGTAAAGGACATGTACAAGTATTTGTAACTTGTACAGGGGCAATGTATCTTTTATCTATACGAGTGCTGCTTTTCTAGAGTGAATTCAAGTTCTATGTCAGATCATGTATGAGAAAATTTCATCCGGGCACTCTTTTTAGTGAGCAGAAAGGCAGTGCTACTGTAAGAGATGGA
ATTGCATTTTATCGATTTTTCTTAGTTTGGCCAGAACTACTCAGTGTGGATGATATTGTCAGGAGTTCTGTATCATCTTGTTTGTTTTTGGTAGTCCTCTTCTTGGTCTGTCCAGAAAGTGGAGGATTTCGGCTGTTGCAATCTGGTTGGTATTCAACCTTTAATTGATTATGGTGAACTAGGAAGAATAATTCATTCTT
TTGTATTTATTCTCAAGATGGAGTTATTGACCTAATATAATAGGCACATAACAAGGTCAATTATCATCATTCACGAAGTAGAAATATAGGTCATCCTGAGTTCAGATATTTTCTGTATCCATTTATCAACATGCTTCTTTTGTGCATGGCTACCATGTATGTGTAATGTATCAAAATGAAACCTTTTATGTGGTTTTATG
GTGTTTTGAAGAAAAAT


>TRINITY_DN108432_c2_g1_i1 from sample A3 / Example unspliced isoform:
CTCTAAGTAAAATTTGACTTATTTTTCTATTTTAAACAGGTTCTTCAGCTTGGGGTTGTGTGAAGTTGGCTTTGGGAGGGCCGTTGAACGCATAAATCGGGGCCATTAAAGCACGCTTTGAGCAATTGGGTTTATTTAGAATGGGAAGAATGGTGACTGGGCCGAGTCTCAGAGTATTTTGAATTCGGGAGATCAAGTGG
GTCACTGGTGGGACATTGCTGGATGCCTCTGAAACAGCACAAGTACATTCAAAACCAGCAAAGATCTTGTGATTTGCTCTGCGACGAAGCGTTGTCCGCCGAGAAATATCGAAATAGGATCCACTAAATTTGATTAGGAGGGCCGTACACTAATTTTTTTCCCCATTGGAGTTTCCTGCATCATGGACTCGATTCAGTGA
TTTTGAGTGGTTTTTTGTAGCTTTGGACAACGTGGGTTATGTTCAGAGTTTCTTGTTAAGGGGGTTGGGGGGGTTCCACTGTACTTGTGAGTCAATGCAATAAGGATTTGAGGAGTGTGAGGGTGTTTATCTAAATGGGCAATTCTTTCGGATGCTCTGCCTCTGGTGAACGCCTGGTTTCTGCTGCGAGAGATGGGGAT
TTGGTGGAAGCTCGCATGCTGCTGGATTTCAATCCGTGTTTGGCGAGGTATTCCACCTTCGGTGGGCTGAATTCGCCTCTTCATTTCGCAGCTGCTAAGGGTCATAGTGAGATTGTGGCCTTGCTGCTGGAGCACGGAGCTGATGTGAATTCCAGGAATTACTGTGGTCAGACAGCTTTGATGCAAGCTTGCCGATATGG
ACACTGGGAGGTGGTGCAGACTCTTCTTCTGTTTAAAGCAAATGTGACTAGAGCAGATTACCTCAGTGGTAGGACAGCCTTGCATTTTGCAGCCGTGAATGGTCACACAAGATGCATCAGACTTGTTGTGGCAGATTTTGTGCCTAGTGCACCTTACCATTTGAGTATATATCCAGTTTCTGGCAACAAGGATGATACCT
CACCTGCGAGACGCCGGTTTGACCTGAATGCACTCTCCAAATTTGTGAATAGAGCAGCAGATGGTGGGATTACAGCTCTTCATATGGCTGCCCTGAATGGCCATTTTGACTGTGTACAATTGCTACTTGATCTAAATGCAAATGTGTCAGCTGTCACATTTCATTATGGCACATCAATGGACCTGATAGGAGCTGGAAGC
ACTCCTCTACACTATGCAGCATGTGGAGGAAACATACAGTGCTGTCAGATCCTGCTGGCTCGGGGTGCTAGTAGAACCACTTTGAATTGTAACGGgtatctcgaattcagaacccaaacattctatttataaattgatcagctattctatatacatttcattagtggaatggtcattgagtgtcttgattgtttatgttg
caccaacataggtttgtttgtcttctcctgcagGTGGATACCAGTTGAGGTGGCTAGAATATGGGGGCGTCATTGGCTTGAGCCACTATTAGCACCTAACTCAGATTCAGCTTTACCAACCTATGCTCCATCAAGCTTTCTTTCACTTCCTCTTATGAGTATACTTAATATTGCAAGGGAACATGGATTACAAGCAATGG
ATTCTGCAAGTGAAGATAGTGAGCATTGTGCAGTTTGTTTGGAGCGTAACTGTACTGTTGCTGCTGAAGGTTGTGGTCATGAACTCTGTACGAGATGCGCTTTGTATCTTTGTTCGACAAATAATGTTACTTCCACTACTGTAGGTCCTCCTGGGTCCATATCTTGCCCTCTTTGCCGTCAGGGTATTGTATCCTTTGTA
AAATTACCTGGATCTCCCTCAAAGGAGTTGAAGTTGAATATTGCACTTGGATTATGCACTCAATGTGCATCAGACACTTGTGATCCAGATTCACCATCTAGTTCAGTATGTAAATCGGAGTTTCGGAGAAATAGAGTCTCTCCTGTATCTTCAGAATCATTTTGCACTGTCTCCTGCAGTCCATTCCCATCTGTTAGCCT
ACCCTTGTGTGCATGCAACAACGAACCTGGCCCTTCACTTGAAGCCAGACAGGAAACGGAGAGTTCTCGGCAATCACAGCCACCTGTACATGATGCCTCTGCTGCAGATTCAGTTTCCTCTTTGGAACGTGTACTTGATTCCTCTCTTGAACAGAAAGAGGCAGTTAGCCCAAGGGTTGACAAAGCAAGCTGCTCAAAGA
TATTGTTTTGGGGCAGGAAGAATAGCCATAGAGAAAAGCCTGGAGAACAACCTTGCAACACTGAAATAAGCGTTTGACATATTACATATGTTGTGGTTGTCAAATATTTGTGACTAATGATCCACCATTGGTTGTATTCTATTCCGTTCTTTGTAATTTGAATTCATTTTTTATGGCTTGGCAGAAGTTCCCCGATGACT
TCTAAAATTAGAGGAAAAGTGCGCCTTTGACATGGTTCTTGCCAAATCTTATCGATACAACCAGCTTTGTTTATCATTTGATCTACTGGTTATAAAACTGGCGTTTTGATTCACGCTGTTAATTATTGTGTGGTGCAAATTTCTTTCTGTGGTGCTCGTCTTGGAGGAAGCTACCAGTTGGCAGCAGAATACATGCAACT
GATGCTTTACAGGCAATTAAGATGGTATCTTCAGATTGACTTCTTCACTACCATGATTGTGTGATTTGGCTTCCATAAGCTTCTTGTTCCCGGCAAACACAGAATGCACAGAGATGGTTATCTAATACTGCCATTGACATTTGTGATCAACTGAATGATGATAAAGTAAAGGACATGTACAAGTATTTGTAACTTGTACA
GGGGCAATGTATCTTTTATCTATACGAGTGCTGCTTTTCTAGAGTGAATTCAAGTTCTATGTCAGATCATGTATGAGAAAATTTCATCCGGGCACTCTTTTTAGTGAGCAGAAAGGCAGTGCTACTGTAAGAGATGGAATTGCATTTTATCGATTTTTCTTAGTTTGGCCAGAACTACTCAGTGTGGATGATATTGTCAG
GAGTTCTGTATCATCTTGTTTGTTTTTGGTAGTCCTCTTCTTGGTCTGTCCAGAAAGTGGAGGATTTCGGCTGTTGCAATCTGGTTGGTATTCAACCTTTAATTGATTATGGTGAACTAGGAAGAATAATTCATTCTTTTGTATTTATTCTCAAGATGGAGTTATTGACCTAATATAATAGGCACATAACAAGGTCAATT
ATCATCATTCACGAAGTAGAAATATAGGTCATCCTGAGTTCAGATATTTTCTGTATCCATTTATCAACATGCTTCTTTTGTGCATGGCTACCATGTATGTGTAATGTATCAAAATGAAACCTTTTATGTGGTTTTATGGTGTTTTGAAGAAAAAT