NA ----> NA
Intron 1 GTAACCTTGG ... TGTTTTGCAG
| Sample | Retention score (%) | Exon junction reads | 5'ss reads | 3'ss reads |
| A1 | 100 | 0 | 6 | 8 |
| A2 | 100 | 0 | 2 | 1 |
| A3 | 77.78 | 1 | 2 | 5 |
| A4 | 90.91 | 1 | 16 | 4 |
| A5 | 100 | 0 | 4 | 9 |
| A6 | 40 | 6 | 6 | 2 |
| A7 | 42.86 | 8 | 6 | 6 |
| A8 | 37.5 | 5 | 2 | 4 |
| A9 | 31.03 | 20 | 8 | 10 |
| A10 | 41.18 | 5 | 3 | 4 |
>TRINITY_DN41812_c0_g2_i4 from sample A7 / Example spliced isoformAATGTCCCTAAAATTTCGAGATACAGTAAACCCTAATTTTTCCTGCTATACCGTGTTCCTATATGTTCAAAATCAGAGACAGGTAAAATTGCCAAAACCCGTCAAATGGGAAGAGCACTCATCGTCTTTCAAGGTATGTTTTTCAGAGAAGAGCCATTAATATGCCTGAAAACAAAAGAGCAATCAATATGATTGGGAAC
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TGAGGTTTTATAAAGTGAACCAAAGGTCTTTCACTAAAGAGTTGGTCAATCGGACAGTATTCTCATCTGGTTTATATTCTTTGAGCACTCTCTCATGCAAAGGGCATAGTTCCTTTTTGCTATCTTTGTCCAGAATTCCAACTTCAATTATGTTAGTGGATTCATTAACGAGGAATCATTCGATGAATTTAGGGTATGTT
TTTTGAGAAGATAAAATTGTTTGTTTGTATTCCTACCATCTCAGGAGAACATGTTCCATGCCCACAGTGTTTTTTAATTTGGC
>TRINITY_DN41812_c0_g2_i3 from sample A7 / Example unspliced isoform:AATGTCCCTAAAATTTCGAGATACAGTAAACCCTAATTTTTCCTGCTATACCGTGTTCCTATATGTTCAAAATCAGAGACAGGTAAAATTGCCAAAACCCGTCAAATGGGAAGAGCACTCATCGTCTTTCAAGGTATGTTTTTCAGAGAAGAGCCATTAATATGCCTGAAAACAAAAGAGCAATCAATATGATTGGGAAC
AAGGAATGCTGCTGGCCCAAGCCACAGGCCAATGGTGTAAATGTATTTGTTTGCATCTGTTGGCACTGGGGAGCTATGAACTGCAGCACAACTTTATTGCGATAAAGTCCATTTAGCAAAAAGGCCGTCAAAGTCATGATCAGGGCTCCATCCCTGCTAAGGCTGCTAAGgtaaccttggtcatttttgtttgatgcccg
tcttgaccactagatcacaacccaccaaacattaacacttttatgggatgcattgatgaggaattatgttctgacagcaaacttgttttgcagAATGAAATGGGTTATCTGGTTTGTATTCCCTGAGCATCCTTTTCGTAAGCTGATTATAGATATTAGGAATTATACAAGATGCATTGATGAGGAATTATGTGCTGACT
GTCCAACTTGTTTTGCATAATGAAGTGGATTATTTGGTTTGTATTCCCCGAGCATCCTTTTGTACAATGCCTATGCCCTGTATAATTTTCTTGCTTTGCATTGATTTCTACTATATGTGTTAATGAGGTTTTATAAAGTGAACCAAAGGTCTTTCACTAAAGAGTTGGTCAATCGGACAGTATTCTCATCTGGTTTATAT
TCTTTGAGCACTCTCTCATGCAAAGGGCATAGTTCCTTTTTGCTATCTTTGTCCAGAATTCCAACTTCAATTATGTTAGTGGATTCATTAACGAGGAATCATTCGATGAATTTAGGGTATGTTTTTTGAGAAGATAAAATTGTTTGTTTGTATTCCTACCATCTCAGGAGAACATGTTCCATGCCCACAGTGTTTTTTAA
TTTGGC