sp|Q9SY02|PP301_ARATH ----> Pentatricopeptide repeat-containing protein At4g02750
Intron 1 GTATGCGCTA ... ATTATTGCAG
Found issues: Low number of reads
| Sample | Retention score (%) | Exon junction reads | 5'ss reads | 3'ss reads |
| A1 | 38.46 | 8 | 6 | 4 |
| A2 | 42.86 | 6 | 9 | 0 |
| A3 | 50 | 4 | 4 | 4 |
| A4 | 52.94 | 4 | 5 | 4 |
| A5 | 25 | 3 | 2 | 0 |
| A6 | 46.67 | 4 | 5 | 2 |
| A7 | 42.86 | 2 | 2 | 1 |
| A8 | 0 | 2 | 0 | 0 |
| A9 | 30.43 | 8 | 6 | 1 |
| A10 | 40 | 3 | 2 | 2 |
>TRINITY_DN43645_c7_g1_i2 from sample A6 / Example spliced isoformCAAAGAGGTACCAATGAATGGAACTTCGGATGTTTTGTATTCTGGTAATCAAAGAGGCATTTGGACAGACTTCTACAACTATTGTTGCCTGTTGCAGGACTGTATTTATGGGAAAAAGGTTGCAGAGGGCAAGGGATTGCATGCCCACATGATCAAACATGTATTCGAACCAGACGTTTTTCTGAGCACAAAACTTGTCA
TTTTTTATGCCAAGTGTGGAAATTTGGAGGATGCACGCCAACTGTTTGACAAAATGCCTGAACGAAATTCCGTTTCATGGAATACTCTGCTTGCAGAATACACTCGGCATGGGTTGGAGGAGGAGGCTATACATCTTTTTGGGCAAATGGGAGAGGCAAACATGACGCCGGATGAGTTTTCTCTTGGAAGTGTTCTCAAG
GTTATGTGCAGCAAGGGAATTGTAAGGAGGCCTTGGATCTCTTTTGTAGAATGCCTTGGTCTGGCATCAAGCCCAACAAGGTCACATTTCGTACTGTCTTAAAGGCATGTGCTGGATTAGGAAACCTAGAGCAGGGAAAGCAGATCCATGCTCAGATGGTTATAAATGGATTTAAGTTAGATTTAATTTTAGGGAATGGC
CTCACTGACATGTATGCGAAGTGTGGAAGCCTCCACGATGCGCGCCTTGTATACAAGATAATGTGTGAAAGGGATGTGGTTTCATGTAATACAATGATTGCAGGATATGCCCAACAAGGGCATGGCGAGGAAGCTATGAAACTCCTCTCTGAAATGCAAATGATAGGAATTCAACCCGATAGTTTCACCTTTGCTAGTGC
TATTGGTGCCTGTGCTAGCTTGGCATCTATGGAACAGGGGAAGCAGGTCCATGCTTGCATAATTAGAAGTGGCTTTGTATCAGATGTTGTGCTGGGTAGTACCCTTGTTGACATGTATGCTAAATGTGGGAGCATAGAGGAGGCACGACAAGTGTTTGACTTCATACCCCAGAGGGATGTGGTATTATGGACTGTGATTG
TTACAGCCTATGGCAAGCACGGATTCGGCAAAGAGGTTCTCCGACTCTTTGAAGAAATGAAGCAATCAGGCTTGAACCCTGACGATGTCACCTTCTTGGCTGTTCTGACTGCTTGCAGCCATTCAGGTCTCGTGAATGAAGGTTGGCATTATTTCAATAGCATGACTCAAGATCACTGTATTGCACCAAGAGCAGGGCAT
TATGCCTGTATGGTTGACCTCCTTGGCCGTGCTGGGTGTTTGGATGAAGCACACGATTTTATCAAGAAAATGCCATTTAGACCTAATGTTACTGTTTGGGGATCCTTACTCGGTGCCTGTCAAGTCCATGGCAATATGGAGCTAGGAAAAGTTGCTGCAGAACACCTTTTTGAGTTAGATCCCCAAAATGCTGGAAATTA
TGTCGTGTTGTCAAATGTTTATGCCACAGCTGGCAAGTGGGGGGACATAATAAAGTTGAGGAAAGCAATGAATGACACAGGTATAAAGAAGGAACCTGGATGCAGTTGGATTGAGATAAAGAGCAGGGTACATGTATTCCCTGTAGGAGATAGATCACATCCACAAATACAGGAGATCTATGCCATGTTGCAAAAGCTAG
CTTGGCAGATGAAAGAAGCTGGGTATTTACCTGAAACAAACTTTATATTGAATGATACGGAAGAACAATAGAATACATAAAATGCTACATGATTGGTGGATGCTTGCCATTGTAGTTGTGATTGTTACCATACAAACTTAGACAATGATCGAAATAGTCAAGAGTTGTTATGCTTGCAATGACATAATCAGAAACTGTTA
TGCAATTATTATGTTCATTCCAGTGTTAGACTGGCAAGCCACAGCTGTATTAAGGGTTTCCCGCTGCTGACATCATTCCAAGGTGGATCTGTGTTCGAGATTTTGGCCCATGCATTGGTTGCTAGTAGCATACCCTCCAAGTTATTGATTCCAATACACACAAATCTGGTGTTTGTGGGGATTGAATGTAGCAATTGTTG
GGCTGAAAAATTGGTATTTCATCTGATTCTATCATTTCAATGGTAGTGCAATTTTTTTTGGAATTCATTCGTGAAATTTAGATTTATATATCACCATTTATGGTGACTTGGTGGAAGGATTCAGGAGTTGGTATTGTTCTATTGTTGCTGTGATGCTGTATTTGGCATTTACAAGCTTATTGTGACCGATGTTATCAGAA
CCGGAACTGAACCCAGCCAAGGGCCAGG
>TRINITY_DN43645_c7_g1_i1 from sample A6 / Example unspliced isoform:CAAAGAGGTACCAATGAATGGAACTTCGGATGTTTTGTATTCTGGTAATCAAAGAGGCATTTGGACAGACTTCTACAACTATTGTTGCCTGTTGCAGGACTGTATTTATGGGAAAAAGGTTGCAGAGGGCAAGGGATTGCATGCCCACATGATCAAACATGTATTCGAACCAGACGTTTTTCTGAGCACAAAACTTGTCA
TTTTTTATGCCAAGTGTGGAAATTTGGAGGATGCACGCCAACTGTTTGACAAAATGCCTGAACGAAATTCCGTTTCATGGAATACTCTGCTTGCAGAATACACTCGGCATGGGTTGGAGGAGGAGGCTATACATCTTTTTGGGCAAATGGGAGAGGCAAACATGACGCCGGATGAGTTTTCTCTTGGAAGTGTTCTCAAG
gtatgcgctagcttagtaacactagaacttggaaagcaagtccacgcccacgtcatcagaagtgggtttagatttaatgttgttcttatgactgctcttgttgacttgtatgcaaaatgcaaatgtatggaggaggcacgccgagtgtttgatgaaacgtctctgagagatttggtgtcctggactgccattattgcagG
TTATGTGCAGCAAGGGAATTGTAAGGAGGCCTTGGATCTCTTTTGTAGAATGCCTTGGTCTGGCATCAAGCCCAACAAGGTCACATTTCGTACTGTCTTAAAGGCATGTGCTGGATTAGGAAACCTAGAGCAGGGAAAGCAGATCCATGCTCAGATGGTTATAAATGGATTTAAGTTAGATTTAATTTTAGGGAATGGCC
TCACTGACATGTATGCGAAGTGTGGAAGCCTCCACGATGCGCGCCTTGTATACAAGATAATGTGTGAAAGGGATGTGGTTTCATGTAATACAATGATTGCAGGATATGCCCAACAAGGGCATGGCGAGGAAGCTATGAAACTCCTCTCTGAAATGCAAATGATAGGAATTCAACCCGATAGTTTCACCTTTGCTAGTGCT
ATTGGTGCCTGTGCTAGCTTGGCATCTATGGAACAGGGGAAGCAGGTCCATGCTTGCATAATTAGAAGTGGCTTTGTATCAGATGTTGTGCTGGGTAGTACCCTTGTTGACATGTATGCTAAATGTGGGAGCATAGAGGAGGCACGACAAGTGTTTGACTTCATACCCCAGAGGGATGTGGTATTATGGACTGTGATTGT
TACAGCCTATGGCAAGCACGGATTCGGCAAAGAGGTTCTCCGACTCTTTGAAGAAATGAAGCAATCAGGCTTGAACCCTGACGATGTCACCTTCTTGGCTGTTCTGACTGCTTGCAGCCATTCAGGTCTCGTGAATGAAGGTTGGCATTATTTCAATAGCATGACTCAAGATCACTGTATTGCACCAAGAGCAGGGCATT
ATGCCTGTATGGTTGACCTCCTTGGCCGTGCTGGGTGTTTGGATGAAGCACACGATTTTATCAAGAAAATGCCATTTAGACCTAATGTTACTGTTTGGGGATCCTTACTCGGTGCCTGTCAAGTCCATGGCAATATGGAGCTAGGAAAAGTTGCTGCAGAACACCTTTTTGAGTTAGATCCCCAAAATGCTGGAAATTAT
GTCGTGTTGTCAAATGTTTATGCCACAGCTGGCAAGTGGGGGGACATAATAAAGTTGAGGAAAGCAATGAATGACACAGGTATAAAGAAGGAACCTGGATGCAGTTGGATTGAGATAAAGAGCAGGGTACATGTATTCCCTGTAGGAGATAGATCACATCCACAAATACAGGAGATCTATGCCATGTTGCAAAAGCTAGC
TTGGCAGATGAAAGAAGCTGGGTATTTACCTGAAACAAACTTTATATTGAATGATACGGAAGAACAATAGAATACATAAAATGCTACATGATTGGTGGATGCTTGCCATTGTAGTTGTGATTGTTACCATACAAACTTAGACAATGATCGAAATAGTCAAGAGTTGTTATGCTTGCAATGACATAATCAGAAACTGTTAT
GCAATTATTATGTTCATTCCAGTGTTAGACTGGCAAGCCACAGCTGTATTAAGGGTTTCCCGCTGCTGACATCATTCCAAGGTGGATCTGTGTTCGAGATTTTGGCCCATGCATTGGTTGCTAGTAGCATACCCTCCAAGTTATTGATTCCAATACACACAAATCTGGTGTTTGTGGGGATTGAATGTAGCAATTGTTGG
GCTGAAAAATTGGTATTTCATCTGATTCTATCATTTCAATGGTAGTGCAATTTTTTTTGGAATTCATTCGTGAAATTTAGATTTATATATCACCATTTATGGTGACTTGGTGGAAGGATTCAGGAGTTGGTATTGTTCTATTGTTGCTGTGATGCTGTATTTGGCATTTACAAGCTTATTGTGACCGATGTTATCAGAAC
CGGAACTGAACCCAGCCAAGGGCCAGG