sp|P18025|TBB1_MAIZE ----> Tubulin beta-1 chain


Intron 1 GTGAGATATT ... TGGCTTGCAG

SampleRetention score (%)Exon junction reads5'ss reads3'ss reads
A11000134.8130
A298.93192.394
A394.475.383.898
A498.88186.591
A5100026.340
A687.41376.5101
A792.789.7111.5137.3
A889.89863.779.3
A986.6816.392.8120
A1095.724.7101.8107.7



>TRINITY_DN38793_c3_g1_i3 from sample A6 / Example spliced isoform
CCAGTTTGCAGATTCGGGGTTTTATGGAAATGTGGGGGTGTTTTTGGGTGCCGACCTCCATGACCCCTAATTTGGAAATTGGTGAGATACTTGACATTCAGGGGGGCAATGCGGCAACTAGATTGGCTCCAAGTTTTGAGAGGTGGTATGTGAAGAACATGTGATCGATCCCATTGGGAGATATCAGGGCACTTCAGATC
TACAACTCGAAAGGGTCATTGTTTACTCCAATAAAGCGAGCTACGAGAGTTTTCTGCCCCATGCTATTCTCATGGATCTAGAGCCTGGTACCATGGACAACGTGAGGATTGGGCCTTATGGTCAGGTCTTCAGGCCTGATAACTTCGTTTTTGGTCAGTCCAGGGCTAGAAACAACTGGGCCAAGGGGAATTATACCGAA
GGAGCTGAGCTCATCGATTCTGTGCTTGATGTCATTGGCAGATGCAAAGACACATAGGTTTAGAGAGGGTTCTGAAGAAATGTGGGCTTTGGCCTGCTCCAGCACAGATAGTGACGCTATTATAATTTTAATTGAACATGCTTGCAAGAAAATTGGTTAAAATAGTGACGCTATTATAATATCTACAGTGTACACCCTTG
CTTGAGAATGTGTAATCTAACGAGAGTACTAAATAAACCAAGTGAATCATAGAGAAATGCAAGCTAAGTTTTTGGTCATGATCTGCAGTTGAAATATTAAGTACTAACTTAATGGTGTTTGTCTGCAGGCTACATTGATTGGTTATGCAAATACAACTGGTTTTCCTATCATTGATTAGATTTACAGATGCATTTGTAGA
TCCTTCAGACACAAGATAGAAGTCAGTGAAATTTGAATATTTCTAATTTTTTCTATCTCATTGTTAGCCGTGAATTCTGAGGGGTTTGCCATTGTGGAATTCCTTTCTTTGTGGAATTTAAGAAGTGTTGATTCTTGTTAAAGTCCAGTGTCATGCATTCTCAACTTATTCTATTTACAAGCACGTGTAAGAGCTTGTAA
GATTACCTTGATGTTTCATCTGCTATACACCATCTCCATAGGCGGGGCCTGTAGTAGAAACATCAAACAACAGCTCTTTCCAATGGATTCATCAACTTTGAAGCGTCAATAATATCGTCAAGGAAAGCTCTCTACTTCTAAAGCATGTTAGCACGTGATCTTAAGTTTTA


>TRINITY_DN38793_c3_g1_i5 from sample A6 / Example unspliced isoform:
CCAGTTTGCAGATTCGGGGTTTTATGGAAATGTGGGGGTGTTTTTGGGTGCCGACCTCCATGACCCCTAATTTGGAAATTGGTGAGATACTTGACATTCAGGGGGGCAATGCGGCAACTAGATTGGCTCCAAGTTTTGAGAGGTGGTATGTGAAGAACATGTGATCGATCCCATTGGGAGATATCAGGGCACTTCAGATC
TACAACTCGAAAGGGTCATTGTTTACTCCAATAAAGCGAGCTACGAGAGTTTTCTGCCCCATGCTATTCTCATGGATCTAGAGCCTGGTACCATGGACAACGTGAGGATTGGGCCTTATGGTCAGGTCTTCAGGCCTGATAACTTCGTTTTTGGTCAGTCCAGGGCTAGAAACAACTGGGCCAAGGGGAATTATACCGAA
GGAGCTGAGCTCATCGATTCTGTGCTTGATGTCATTGGTAAGGAGGCCGAGATCTGTGATTTTCTCCAAGGGTTTTAAGTGTGTCACTCGTTGGGAGAAGGTACTGGATCTAGGATGTGAACTCTCTTGATCTACATCACCTGTAGTCGGAGGTTTCCTGGTCAGTTGAACTCAGATTTGAGAAAGCTGGTAGTGAATCC
GATCCCCATCCCCTGTCTTCATTTTTCCATAGTGTGACTTTCCACCTTAACCTCCCGTGGATCCCAACTTTACAGAGCACTCATAGTCCCTGAGATGACCCAGCAAATGTGGGATGCCAAGAAAATGATGTGTGCTGCAGATAGTTTCCCAGCGAGGATGCCTGTTATGAAGGGGCATGTAGCTTAGCGATGAAGCAACC
CATCAACCAGGCGCAAGTCCTGGGTTCAATTCCTAGCCTGTCAAATTTTCAACATATATTTAAAAAATGCAGATGCAAAGACACATAGGTTTAGAGAGGGTTCTGAAGAAATGTGGGCTTTGgtgagatatttatggaattgatgagaataacgtagaaagcattgttagagaagacaaagttgacattttagtggagct
gacaagtcatacagctaataacaagcttgggttgatggcttgcag
GCCTGCTCCAGCACAGATAGTGACGCTATTATAATTTTAATTGAACATGCTTGCAAGAAAATTGGTTAAAATAGTGACGCTATTATAATATCTACAGTGTACACCCTTGCTTGAGAATGTGTAATCTAACGAGAGTACTAAATAAACCAAGTGAA
TCATAGAGAAATGCAAGCTAAGTTTTTGGTCATGATCTGCAGTTGAAATATTAAGTACTAACTTAATGGTGTTTGTCTGCAGGCTACATTGATTGGTTATGCAAATACAACTGGTTTTCCTATCATTGATTAGATTTACAGATGCATTTGTAGATCCTTCAGACACAAGATAGAAGTCAGTGAAATTTGAATATTTCTAA
TTTTTTCTATCTCATTGTTAGCCGTGAATTCTGAGGGGTTTGCCATTGTGGAATTCCTTTCTTTGTGGAATTTAAGAAGTGTTGATTCTTGTTAAAGTCCAGTGTCATGCATTCTCAACTTATTCTATTTACAAGCACGTGTAAGAGCTTGTAAGATTACCTTGATGTTTCATCTGCTATACACCATCTCCATAGGCGGG
GCCTGTAGTAGAAACATCAAACAACAGCTCTTTCCAATGGATTCATCAACTTTGAAGCGTCAATAATATCGTCAAGGAAAGCTCTCTACTTCTAAAGCATGTTAGCACGTGATCTTAAGTTTTA




Intron 2 GCCTGCTCCA ... TTGTCTGCAG

SampleRetention score (%)Exon junction reads5'ss reads3'ss reads
A160103
A2223.611
A310005.20
A4100010
A533.33202
A642.71712.412
A749.037.69.65
A843.0410.688
A948.61216.26
A1035.9794.65



>TRINITY_DN38793_c3_g1_i2 from sample A6 / Example spliced isoform
CCAGTTTGCAGATTCGGGGTTTTATGGAAATGTGGGGGTGTTTTTGGGTGCCGACCTCCATGACCCCTAATTTGGAAATTGGTGAGATACTTGACATTCAGGGGGGCAATGCGGCAACTAGATTGGCTCCAAGTTTTGAGAGGTGGTATGTGAAGAACATGTGATCGATCCCATTGGGAGATATCAGGGCACTTCAGATC
TACAACTCGAAAGGGTCATTGTTTACTCCAATAAAGCGAGCTACGAGAGTTTTCTGCCCCATGCTATTCTCATGGATCTAGAGCCTGGTACCATGGACAACGTGAGGATTGGGCCTTATGGTCAGGTCTTCAGGCCTGATAACTTCGTTTTTGGTCAGTCCAGGGCTAGAAACAACTGGGCCAAGGGGAATTATACCGAA
GGAGCTGAGCTCATCGATTCTGTGCTTGATGTCATTGGCAGATGCAAAGACACATAGGTTTAGAGAGGGTTCTGAAGAAATGTGGGCTTTGGCTACATTGATTGGTTATGCAAATACAACTGGTTTTCCTATCATTGATTAGATTTACAGATGCATTTGTAGATCCTTCAGACACAAGATAGAAGTCAGTGAAATTTGAA
TATTTCTAATTTTTTCTATCTCATTGTTAGCCGTGAATTCTGAGGGGTTTGCCATTGTGGAATTCCTTTCTTTGTGGAATTTAAGAAGTGTTGATTCTTGTTAAAGTCCAGTGTCATGCATTCTCAACTTATTCTATTTACAAGCACGTGTAAGAGCTTGTAAGATTACCTTGATGTTTCATCTGCTATACACCATCTCC
ATAGGCGGGGCCTGTAGTAGAAACATCAAACAACAGCTCTTTCCACTGGATTCATCACCTTTGAAGCGTCAATAATATCGTCAAGGAAAGCTCTCTACTTCTAAAGCATGTTAGCACGTGATCTTAAGTTTTA


>TRINITY_DN38793_c3_g1_i3 from sample A6 / Example unspliced isoform:
CCAGTTTGCAGATTCGGGGTTTTATGGAAATGTGGGGGTGTTTTTGGGTGCCGACCTCCATGACCCCTAATTTGGAAATTGGTGAGATACTTGACATTCAGGGGGGCAATGCGGCAACTAGATTGGCTCCAAGTTTTGAGAGGTGGTATGTGAAGAACATGTGATCGATCCCATTGGGAGATATCAGGGCACTTCAGATC
TACAACTCGAAAGGGTCATTGTTTACTCCAATAAAGCGAGCTACGAGAGTTTTCTGCCCCATGCTATTCTCATGGATCTAGAGCCTGGTACCATGGACAACGTGAGGATTGGGCCTTATGGTCAGGTCTTCAGGCCTGATAACTTCGTTTTTGGTCAGTCCAGGGCTAGAAACAACTGGGCCAAGGGGAATTATACCGAA
GGAGCTGAGCTCATCGATTCTGTGCTTGATGTCATTGGCAGATGCAAAGACACATAGGTTTAGAGAGGGTTCTGAAGAAATGTGGGCTTTGgcctgctccagcacagatagtgacgctattataattttaattgaacatgcttgcaagaaaattggttaaaatagtgacgctattataatatctacagtgtacacccttg
cttgagaatgtgtaatctaacgagagtactaaataaaccaagtgaatcatagagaaatgcaagctaagtttttggtcatgatctgcagttgaaatattaagtactaacttaatggtgtttgtctgcag
GCTACATTGATTGGTTATGCAAATACAACTGGTTTTCCTATCATTGATTAGATTTACAGATGCATTTGTAGA
TCCTTCAGACACAAGATAGAAGTCAGTGAAATTTGAATATTTCTAATTTTTTCTATCTCATTGTTAGCCGTGAATTCTGAGGGGTTTGCCATTGTGGAATTCCTTTCTTTGTGGAATTTAAGAAGTGTTGATTCTTGTTAAAGTCCAGTGTCATGCATTCTCAACTTATTCTATTTACAAGCACGTGTAAGAGCTTGTAA
GATTACCTTGATGTTTCATCTGCTATACACCATCTCCATAGGCGGGGCCTGTAGTAGAAACATCAAACAACAGCTCTTTCCAATGGATTCATCAACTTTGAAGCGTCAATAATATCGTCAAGGAAAGCTCTCTACTTCTAAAGCATGTTAGCACGTGATCTTAAGTTTTA




Intron 3 GTAGTGAATC ... AACTTTACAG

SampleRetention score (%)Exon junction reads5'ss reads3'ss reads
A153.85361
A275142
A3100021
A4100032
A5-1000
A659.14193718
A77562016
A876.47276
A960.78102110
A1063.648235



>TRINITY_DN45576_c0_g3_i1 from sample A10 / Example spliced isoform
CGGGGTTTTATGGAAATGTGGGGGTGTTTTTGGGTGCCGACCTCCATGACCCCTAATTTGGAAATTGGTGAGATACTTGACATTCAGGGGGGCAATGCGGCAACTAGATTGGCTCCAAGTTTTGAGAGGTGGTATGTGAAGAACATGTGATCGATCCCATTGGGAGATATCAGGGCACTTCAGATCTACAACTCGAAAGG
GTCATTGTTTACTCCAATAAAGCGAGCTACGAGAGTTTTCTGCCCCATGCTATTCTCATGGATCTAGAGCCTGGTACCATGGACAACGTGAGGATTGGGCCTTATGGTCAGGTCTTCAGGCCTGATAACTTCGTTTTTGGTCAGTCCAGGGCTAGAAACAACTGGGCCAAGGGGAATTATACCGAAGGAGCTGAGCTCAT
CGATTCTGTGCTTGATGTCATTGGTAAGGAGGCCGAGATCTGTGATTTTCTCCAAGGGTTTTAAGTGTGTCACTCGTTGGGAGAAGCTACTGGATCTAGGATGTGAACTCTCTTGATCTACATCACCTGTAGCCGGAGGTTTCCTGGTCAGTTGAACTCAGATTTGAGAAAGCTGAGCACTCATAGTCCCTGAGATGACC
CAGCAAATGTGGGATGCCAAGAAAATGATGTGTGCTGCAGATAGTTTCCCAGCGAGGATGCCTGTTATGAAGGGGCATGTAGCTTAGTGATGAAGCAACCCATCAACCAGGCGCAAGTCCTGGGTTCAATTCCTAGCCTGTCAAATTTTCAACATATATTTAAAAAATGCAGATGCAAAGACACATAGGTTTAGAGAGGG
TTCTGAAGAAATGTGGGCTTTGG


>TRINITY_DN45576_c0_g3_i4 from sample A10 / Example unspliced isoform:
CGGGGTTTTATGGAAATGTGGGGGTGTTTTTGGGTGCCGACCTCCATGACCCCTAATTTGGAAATTGGTGAGATACTTGACATTCAGGGGGGCAATGCGGCAACTAGATTGGCTCCAAGTTTTGAGAGGTGGTATGTGAAGAACATGTGATCGATCCCATTGGGAGATATCAGGGCACTTCAGATCTACAACTCGAAAGG
GTCATTGTTTACTCCAATAAAGCGAGCTACGAGAGTTTTCTGCCCCATGCTATTCTCATGGATCTAGAGCCTGGTACCATGGACAACGTGAGGATTGGGCCTTATGGTCAGGTCTTCAGGCCTGATAACTTCGTTTTTGGTCAGTCCAGGGCTAGAAACAACTGGGCCAAGGGGAATTATACCGAAGGAGCTGAGCTCAT
CGATTCTGTGCTTGATGTCATTGGTAAGGAGGCCGAGATCTGTGATTTTCTCCAAGGGTTTTAAGTGTGTCACTCGTTGGGAGAAGCTACTGGATCTAGGATGTGAACTCTCTTGATCTACATCACCTGTAGCCGGAGGTTTCCTGGTCAGTTGAACTCAGATTTGAGAAAGCTGgtagtgaatccgatccccatcccct
gtcttcatttttccatagtgtgactttccaccttaacctcccgtggatcccaactttacag
AGCACTCATAGTCCCTGAGATGACCCAGCAAATGTGGGATGCCAAGAAAATGATGTGTGCTGCAGATAGTTTCCCAGCGAGGATGCCTGTTATGAAGGGGCATGTAGCTTAGTGATGAAGCAACCCATCAACCAGGCGC
AAGTCCTGGGTTCAATTCCTAGCCTGTCAAATTTTCAACATATATTTAAAAAATGCAGATGCAAAGACACATAGGTTTAGAGAGGGTTCTGAAGAAATGTGGGCTTTGGTAAGATATTTATGGAATTGATGAGAATAACGTAGAAAGCATTGTTAGAGAAGACAAAGTTGACATTTTAGTGGAGCTGACAAGTCATACAG
CTAATAACAAGCTTGGGTTGATGGCTTGCAGGCCTGCTCCAGCACAGATAGTGACGCTATTATAATTTTAATTGAACATGCTTGCATGAAAATTGGTTAAAATAGTGACGCTATTATAATATCTACAGTGTACACCCTTGCTTGAGAATGTGTAATCTAACGAGAGTACTAAATAAACCAAGTGAATCATAGAGAAATGC
AAGCTAAGTTTTTGGTCATGATCTGCAGTTGAAATATTAAGTACTAACTTAATGGTGTTTGTCTGCAGGCTACATTGATTGGTTATGCAAATACAACTGGTTTTCCTATCATTGATTAGATTTACAGATGCATTTGTAGATCCTTCAGACACAAGATAGAAGTCAGTGAAATTTGAATATTTCTAATTTTTTCTATCTCA
TTGTTAGCCGTGAATTCTGAGGGGTTTGCCATTGTGGAATTCCTTTCTTTGTGGAATTTAAGAAGTGTTGATTCTTGTTAAAGTCCAGTGTCATGCATTCTCAACTTATTCTATTTACAAGCACGTGTAAGAGCTTGTAAGATTACCTTGATGTTTCATCTGCTATACACCATCTCCATAGGCGGGGCCTGTAGTAGAAA
CATCAAACAACAGCTCTTTCCACTGGATTCATCACCTTTGAAGCGTCAATAATATCGTCAAGGAAAGCTCTCTACTTTTAAAGCATGTTAGCA




Intron 4 GTGAGATATT ... TTGTCTGCAG

SampleRetention score (%)Exon junction reads5'ss reads3'ss reads
A199.241131.33
A295.983.890.81
A3100081.90
A4100084.30
A592.53225.22
A680.051975.712
A793.347.8109.55
A885.0110.861.88
A987.551391.36
A1090.761098.55



>TRINITY_DN38793_c3_g1_i2 from sample A6 / Example spliced isoform
CCAGTTTGCAGATTCGGGGTTTTATGGAAATGTGGGGGTGTTTTTGGGTGCCGACCTCCATGACCCCTAATTTGGAAATTGGTGAGATACTTGACATTCAGGGGGGCAATGCGGCAACTAGATTGGCTCCAAGTTTTGAGAGGTGGTATGTGAAGAACATGTGATCGATCCCATTGGGAGATATCAGGGCACTTCAGATC
TACAACTCGAAAGGGTCATTGTTTACTCCAATAAAGCGAGCTACGAGAGTTTTCTGCCCCATGCTATTCTCATGGATCTAGAGCCTGGTACCATGGACAACGTGAGGATTGGGCCTTATGGTCAGGTCTTCAGGCCTGATAACTTCGTTTTTGGTCAGTCCAGGGCTAGAAACAACTGGGCCAAGGGGAATTATACCGAA
GGAGCTGAGCTCATCGATTCTGTGCTTGATGTCATTGGCAGATGCAAAGACACATAGGTTTAGAGAGGGTTCTGAAGAAATGTGGGCTTTGGCTACATTGATTGGTTATGCAAATACAACTGGTTTTCCTATCATTGATTAGATTTACAGATGCATTTGTAGATCCTTCAGACACAAGATAGAAGTCAGTGAAATTTGAA
TATTTCTAATTTTTTCTATCTCATTGTTAGCCGTGAATTCTGAGGGGTTTGCCATTGTGGAATTCCTTTCTTTGTGGAATTTAAGAAGTGTTGATTCTTGTTAAAGTCCAGTGTCATGCATTCTCAACTTATTCTATTTACAAGCACGTGTAAGAGCTTGTAAGATTACCTTGATGTTTCATCTGCTATACACCATCTCC
ATAGGCGGGGCCTGTAGTAGAAACATCAAACAACAGCTCTTTCCACTGGATTCATCACCTTTGAAGCGTCAATAATATCGTCAAGGAAAGCTCTCTACTTCTAAAGCATGTTAGCACGTGATCTTAAGTTTTA


>TRINITY_DN38793_c3_g1_i5 from sample A6 / Example unspliced isoform:
CCAGTTTGCAGATTCGGGGTTTTATGGAAATGTGGGGGTGTTTTTGGGTGCCGACCTCCATGACCCCTAATTTGGAAATTGGTGAGATACTTGACATTCAGGGGGGCAATGCGGCAACTAGATTGGCTCCAAGTTTTGAGAGGTGGTATGTGAAGAACATGTGATCGATCCCATTGGGAGATATCAGGGCACTTCAGATC
TACAACTCGAAAGGGTCATTGTTTACTCCAATAAAGCGAGCTACGAGAGTTTTCTGCCCCATGCTATTCTCATGGATCTAGAGCCTGGTACCATGGACAACGTGAGGATTGGGCCTTATGGTCAGGTCTTCAGGCCTGATAACTTCGTTTTTGGTCAGTCCAGGGCTAGAAACAACTGGGCCAAGGGGAATTATACCGAA
GGAGCTGAGCTCATCGATTCTGTGCTTGATGTCATTGGTAAGGAGGCCGAGATCTGTGATTTTCTCCAAGGGTTTTAAGTGTGTCACTCGTTGGGAGAAGGTACTGGATCTAGGATGTGAACTCTCTTGATCTACATCACCTGTAGTCGGAGGTTTCCTGGTCAGTTGAACTCAGATTTGAGAAAGCTGGTAGTGAATCC
GATCCCCATCCCCTGTCTTCATTTTTCCATAGTGTGACTTTCCACCTTAACCTCCCGTGGATCCCAACTTTACAGAGCACTCATAGTCCCTGAGATGACCCAGCAAATGTGGGATGCCAAGAAAATGATGTGTGCTGCAGATAGTTTCCCAGCGAGGATGCCTGTTATGAAGGGGCATGTAGCTTAGCGATGAAGCAACC
CATCAACCAGGCGCAAGTCCTGGGTTCAATTCCTAGCCTGTCAAATTTTCAACATATATTTAAAAAATGCAGATGCAAAGACACATAGGTTTAGAGAGGGTTCTGAAGAAATGTGGGCTTTGgtgagatatttatggaattgatgagaataacgtagaaagcattgttagagaagacaaagttgacattttagtggagct
gacaagtcatacagctaataacaagcttgggttgatggcttgcaggcctgctccagcacagatagtgacgctattataattttaattgaacatgcttgcaagaaaattggttaaaatagtgacgctattataatatctacagtgtacacccttgcttgagaatgtgtaatctaacgagagtactaaataaaccaagtgaa
tcatagagaaatgcaagctaagtttttggtcatgatctgcagttgaaatattaagtactaacttaatggtgtttgtctgcag
GCTACATTGATTGGTTATGCAAATACAACTGGTTTTCCTATCATTGATTAGATTTACAGATGCATTTGTAGATCCTTCAGACACAAGATAGAAGTCAGTGAAATTTGAATATTTCTAA
TTTTTTCTATCTCATTGTTAGCCGTGAATTCTGAGGGGTTTGCCATTGTGGAATTCCTTTCTTTGTGGAATTTAAGAAGTGTTGATTCTTGTTAAAGTCCAGTGTCATGCATTCTCAACTTATTCTATTTACAAGCACGTGTAAGAGCTTGTAAGATTACCTTGATGTTTCATCTGCTATACACCATCTCCATAGGCGGG
GCCTGTAGTAGAAACATCAAACAACAGCTCTTTCCAATGGATTCATCAACTTTGAAGCGTCAATAATATCGTCAAGGAAAGCTCTCTACTTCTAAAGCATGTTAGCACGTGATCTTAAGTTTTA