sp|Q7XSA2|AGO1B_ORYSJ ----> Protein argonaute 1B

Intron 1 GTATCAACAA ... TTTCCTATAG

Sample	Retention score (%)	Exon junction reads	5'ss reads	3'ss reads
A1	6.77	289	1	21
A2	8.52	204	0	19
A3	11.31	251	2	32
A4	9.8	230	1	25
A5	4.51	127	0	6
A6	5.52	445	1	26
A7	4.07	448	0	19
A8	10.48	282	1	33
A9	7.38	389	1	31
A10	9.02	333	0	33

>TRINITY_DN45095_c0_g2_i5 from sample A8 / Example spliced isoform

GGGGTTTTGATTCCTCGGCTGTGGAATCCCTCGAGAAGATGATACCGGGTCGGTGCCTTATTGTGAGTTCGTTCACTGGGTTTTGATAATGGAGAAGCTGGTTAAATTATATCGAGAGTCCCATTTGGGCAGGAGGCTACCTGCATACGATGGTCGCAAGAGCCTGTACACTGCTGGGGCATTACCCTTCACCTCTAGAG
AATTTAACATCAATCTCGTTGACGAGGATGATGGAATGGGTGGACCTAGAAGAGAATGAAGTTTCAAGGTTGTTATCAAGTTTGCAGCTCGTGCTGATCTTCACCATTTAGGTCAATTTTTATCAGGGAGGAAGGAAGATGCACCCCGGGAAGCACTTCAGGTGCTAATTATTGTGTTACGAGAATTACCCACGCACAGG
TATTCGCATGTTGGGAGGTCCTTTTACTCTCCTGATTTAGGAATGAGGAAACAACTTGGGGAGGGGTTAGAGAGATGGTGTGGGTTTTACCAGAGTATCAGACCCACTCAAATGGGTTTGTCGCTCAACATTGGTTTGTTGTTGTTTCCTCGCTACCTGCCAATACTGTTTTAATTGACATTATGTGACTCATCATAACA
CTACATTTGCATCTTAAGTATCATGATACTGGAAGGGAGAAAGATTGCTTGCCACAGGCTGAGAAATGGAATATGATGAACATTAAGAAAATAGTGAATGGAGGAACAGTAAACTCTTGGTCCTGTGTGAACTTTTCTCGAAGTGTTCAGGACAGTGTTGCTCGTAGTTTTTGTCATGAGTTGGCTCAGATGTGTCAGAT
CTCTGGCATGGTATTTAATCCAGAACCTGTCATCCATATCCACGGAGCACGACCTGATCAAGTTGAGAGAGCACTGAAGACCGTGTACAAAGAGGTGACAAACAAACTTAAGGGAAAGGAATTGGAACTACTTTTTGTTATTTTTCCTGACAACAACGGTTCTTTGTATGGATATTTAAAGTGTATATGTGAAAATGATC
TTGGTTTGGTATCCCAGTGTTGTCGGACAAAACATGTCTTTAACAACTAGGATTGGTGCCTTATTCATCACCGCAGATGATCTCGTTGCTAGGAAATACCTATTCGTCTTCTTTTTTAATGAAGAGAATGCATCCACCCAGGATTCTTTGAGTGAAGATTTTTTCATGACCCAAATATGCCTCAGCTTCCATTATTCTTG
GTCCCCCATAGAATAAGAATAATGTGGGAATTCAATGTTAAGTTGGTGAAGATGAAGTCTTTAATGAATTTGATGATACATAGTGTGATAGTCATCGATGATAATGTAAAATCTAGAGTGGCAAGACAATATTTTTTAATGAATTGGTTACATGGGATGTCCTAATTAATGGA

>TRINITY_DN45095_c0_g2_i4 from sample A8 / Example unspliced isoform:

GTGTCAGATCTCTGGCATGgtatcaacaaagagtccccctggcacttgattgttgcaaagacatttcttttattgataataatagtagtaatatagacgtttgaataagcaatatgctatctagtttcctatagGTATTTAATCCAGAACCTGTCATCCATATCCACGGAGCACGACCTGATCAAGTTGAGAGAGCACTG
AAGACCGTGTACAAAGAGGTGACAAACAAACTTAAGGGAAAGGAATTGGAACTACTTTTTGTTATTTTTCCTGACAACAACGGTTCTTTGTATGGTGCGTATTGTTTCTCATTTAGAAAATAATACATGATAAATTTTTTCTCCGAGG

Intron 2 GTATTCGCAT ... GAACATTAAG

Sample	Retention score (%)	Exon junction reads	5'ss reads	3'ss reads
A1	67.4	89	214	154
A2	70.08	57	146	121
A3	64.95	75	157	121
A4	70.91	48	152	82
A5	67.94	46	101	94
A6	62.66	87	114	178
A7	62.04	93	120	184
A8	65.1	63	96	139
A9	65.38	85	129	192
A10	67.76	64	115	154

>TRINITY_DN48368_c7_g4_i1 from sample A7 / Example spliced isoform

GGGCTTTGTATAATTTTTTTCCTTCAGGTTGCAGGATCAAGAGTTCATGACTTGATGTTTGTCATGGTAGATTCCTCGACCGTGGAATCCCTTGAGAAGATGATATAGGGTCTTTGCTTTATTCAAAGTTCGTTCACGGGGTTTTGATTCCTCGGCTGTGGAATCCCTCGAGAAGATGATACCGGGTCGGTGCCTTATTG
TGAGTTCGTTCACTGGGTTTTGATAATGGAGAAGCTGGTTAAATTATATCGAGAGTCCCATTTGGGTAGGAGGATAACTGCATACGATGGTCGCAAGAGCCTGTACACCGCTGGGGCACTACCCTTCACCTCTAGATAATTTAACATCAATCTCGTTGACGAGGATGATGGAATGGGTGGACCTAGAAGAGAATGAAGTT
TCAAGGTTGTTATCAAGTTTGCAGCTCGTGCTGATCTTCACCATTTAGGTCAATTTTTATCAGGGAGGAAGGAAGATGCACCCCGGGAAGCACTTCAGGTGCTAATTATTGTGTTACGAGAATTACCCACGCACAGAAAATAGTGAATGGAGGAACAGTAAACTCTTGGTCCTGTGTGAACTTTTCTCGAAGTGTTCAGG
ACAGTGTTGCTCGTAGTTTTTGTCATGAGTTGGCTCAGATGTGTCAGATCTCTGGCATGGTATTTAATCCAGAACCTGTCATCCATATCCACGGAGCACGACCTGATCAAGTTGAGAGAGCGCTGAAGACTGTGTACAAAGAAGTGACAAGCAAACTTAAGGGAAAGGAATTGGAACTGCTTGTTGTTATTTTGCCTGAC
AACAATGGTTCTTTGTATGGAGATTTAAAGCGTATATGTGAAACTGATCTTGGTTTGGTATCCCAGTGTTGTCTGACAAAACATGTCTTTAAAATGAGCAAACAGTATCTTGCAAATGTTGCTCTTAAAATTAATGTAAAGGTTGGTGGAAGAAACACTGTCTTAGTTGATGCCCTGTCAAGGAGGATACCGTTGGTCAG
TGATAAACCTACAATAATCTTTGGAGCAGATGTAACCCATCCACACCCTGGAGAGGATTCGAGTCCATCAATCGCTGCTGTTGTAGCTTCTCAAGATTGGCCTGAAGTCACTAAGTATGCAGGATTAGTTTGTGCCCAAGCACATCGTCAAGAACTTATTCAAGATCTTTATAAATTCTGGCAGGATCCTGTGCGAGGCA
CTTTAACTGGAGGCATGATAAAGGAATTGTTGATATCCTTCCGAAGGAATACAGGGCACAAGCCGGAGCGTA

>TRINITY_DN48368_c7_g4_i3 from sample A7 / Example unspliced isoform:

GGGCTTTGTATAATTTTTTTCCTTCAGGTTGCAGGATCAAGAGTTCATGACTTGATGTTTGTCATGGTAGATTCCTCGACCGTGGAATCCCTTGAGAAGATGATATAGGGTCTTTGCTTTATTCAAAGTTCGTTCACGGGGTTTTGATTCCTCGGCTGTGGAATCCCTCGAGAAGATGATACCGGGTCGGTGCCTTATTG
TGAGTTCGTTCACTGGGTTTTGATAATGGAGAAGCTGGTTAAATTATATCGAGAGTCCCATTTGGGTAGGAGGATAACTGCATACGATGGTCGCAAGAGCCTGTACACCGCTGGGGCACTACCCTTCACCTCTAGATAATTTAACATCAATCTCGTTGACGAGGATGATGGAATGGGTGGACCTAGAAGAGAATGAAGTT
TCAAGGTTGTTATCAAGTTTGCAGCTCGTGCTGATCTTCACCATTTAGGTCAATTTTTATCAGGGAGGAAGGAAGATGCACCCCGGGAAGCACTTCAGGTGCTAATTATTGTGTTACGAGAATTACCCACGCACAGgtattcgcatgttgggaggtccttttactctcctgatttaggaatgaggaaacaacttggggag
gggttagagagctggcgtgggttttaccagagtatcagacccactcaaatgggtttgtcgctcaacattggtttgttgttgtttcctcgctacctgccaatactgttttaattgacattatgtgactcatcataacactacatttgcatcttaagtatcatgatactggaagggagaaagattgcttgccacaggctgag
aaatggaatatgatgaacattaagAAAATAGTGAATGGAGGAACAGTAAACTCTTGGTCCTGTGTGAACTTTTCTCGAAGTGTTCAGGACAGTGTTGCTCGTAGTTTTTGTCATGAGTTGGCTCAGATGTGTCAGATCTCTGGCATGGTATTTAATCCAGAACCTGTCATCCATATCCACGGAGCACGACCTGATCAAGT
TGAGAGAGCGCTGAAGACTGTGTACAAAGAAGTGACAAGCAAACTTAAGGGAAAGGAATTGGAACTGCTTGTTGTTATTTTGCCTGACAACAATGGTTCTTTGTATGGAGATTTAAAGCGTATATGTGAAACTGATCTTGGTTTGGTATCCCAGTGTTGTCTGACAAAACATGTCTTTAAAATGAGCAAACAGTATCTTG
CAAATGTTGCTCTTAAAATTAATGTAAAGGTTGGTGGAAGAAACACTGTCTTAGTTGATGCCCTGTCAAGGAGGATACCGTTGGTCAGTGATAAACCTACAATAATCTTTGGAGCAGATGTAACCCATCCACACCCTGGAGAGGATTCGAGTCCATCAATCGCTGCTGTTGTAGCTTCTCAAGATTGGCCTGAAGTCACT
AAGTATGCAGGATTAGTTTGTGCCCAAGCACATCGTCAAGAACTTATTCAAGATCTTTATAAATTCTGGCAGGATCCTGTGCGAGGCACTTTAACTGGAGGCATGATAAAGGAATTGTTGATATCCTTCCGAAGGAATACAGGGCACAAGCCGGAGCGTA