NA ----> NA
Intron 1 GTATGACATG ... TGCATTGTAG
| Sample | Retention score (%) | Exon junction reads | 5'ss reads | 3'ss reads |
| A1 | 25.84 | 66 | 20 | 26 |
| A2 | 21.5 | 42 | 9 | 14 |
| A3 | 21.74 | 54 | 23 | 7 |
| A4 | 26.45 | 57 | 17 | 24 |
| A5 | 23.26 | 33 | 6 | 14 |
| A6 | 28.9 | 321 | 116 | 145 |
| A7 | 29.82 | 373 | 159 | 158 |
| A8 | 31.91 | 367 | 171 | 173 |
| A9 | 32.68 | 310 | 147 | 154 |
| A10 | 29.35 | 254 | 132 | 79 |
>TRINITY_DN44440_c0_g1_i2 from sample A6 / Example spliced isoformAAAAGGTTAACTCATTCATGAACCAAAAAATTGGAAAGGGTTAAACCTTTATCCTAGCCACCCAGTAGCTATTTTTTCGAATTTTGACGAAGTTCCCGCCTCTGCACAGAACTATGGTTTAGGTTTTTTTGTTTTTTTCAATAGGATGATAAGTTTCTATAGATTCCCGTACTTTCTTTCTTATGTTTTATGTTTTTTTC
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>TRINITY_DN44440_c0_g1_i1 from sample A6 / Example unspliced isoform:AAAAGGTTAACTCATTCATGAACCAAAAAATTGGAAAGGGTTAAACCTTTATCCTAGCCACCCAGTAGCTATTTTTTCGAATTTTGACGAAGTTCCCGCCTCTGCACAGAACTATGGTTTAGGTTTTTTTGTTTTTTTCAATAGGATGATAAGTTTCTATAGATTCCCGTACTTTCTTTCTTATGTTTTATGTTTTTTTC
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CTGTTTGATTCTTGTTTACTCTGCAATGATGGAAATTCCTTAATCTGTTTGTTGCCTGTAGCTTAATCG