NA ----> NA
Intron 1 GTTGTTTATT ... TGATTTCAAG
| Sample | Retention score (%) | Exon junction reads | 5'ss reads | 3'ss reads |
| A1 | 80.33 | 6 | 28 | 21 |
| A2 | 76.67 | 7 | 20 | 26 |
| A3 | 84.31 | 4 | 24 | 19 |
| A4 | 70.91 | 8 | 14 | 25 |
| A5 | 86.67 | 1 | 6 | 7 |
| A6 | 81.82 | 2 | 10 | 8 |
| A7 | 100 | 0 | 24 | 12 |
| A8 | 90.91 | 1 | 13 | 7 |
| A9 | 77.78 | 2 | 7 | 7 |
| A10 | 77.78 | 1 | 5 | 2 |
>TRINITY_DN133800_c0_g1_i1 from sample A1 / Example spliced isoformCTTATTATAATTCAATTTTCACAGTTATTCAAGATCATCATAATCTGGTTGTTTATAGCTTTGAATGGATGTGTGAGTTGGTTGTTAATGGATGTGTACGTCTTTGTAGTGATCCTATCAATTTATTAAGTGGTGCACATAAACTTATTTTGACGCACGTCTTTGTTAGTTGTTGGGTAAATGTTTGGGCTGCTTAATGA
TATCTGCTTATAATTTTAATTTTTAGGTTTTGTAAGGGATGATTGATATTTTATGCATGTATGTAACTTTTATTACTTTCATCTTTTGATTTCAGAATATATTTTGGGCGGATATTTAACCAATAAGTTTTTATTGAGATGGGTAATACCCTGCTCCATCCTACTTGAGCTTAGATGGATGACACCCTGCTCCATCCTCC
TTGTGATTAGATAGCCACAGCTCCATCGTCCTTGTTAGATTAATTTAATTTGAACTCTTTGGGAAGAGGAAATACATGGATGAGGCCTTCTCGTAGAAGAAAAATCCAAAATTAAATGTCATCTAAAGAAAATTTGAAATTATAGAGGCAGTTTACTGACTCGGAGACTATGATTTTGATTTCAAGTAGAACACCAAAAA
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AAATTGCGTAGAGGAAATACATGGATGAGGCCTTCTAGTAGAAGAAAAATCCAAAATTAAAAGTCATCGAAAGAAGATTTGACATTATATAGAGGCAATTTACTGACTAGTAATTCGATTTCATGTAGGACCACAAAAAAACAAAATTAGAGGCCATCACTATAATGAAGTAATCACTATAATGAAGTATTAGAAGATTC
TGCAACAAAATTAGACGCCATCACTATAATAAATGATCAAAATATTCTGCAACAAAATTAGAGGCCATCACTA
>TRINITY_DN133800_c0_g1_i9 from sample A1 / Example unspliced isoform:CTTATCTTATATATGTTTTCTTTTGTGTCTAGTCGCGTCTGCCTGTTTTCTGCTAAATTTGCTCGGATCCGTGTATATAATTTCAAACAATTTAATGCATCTTGATATTCAAGATTGCTTATTATAATTCAATTTTCACAGTTATTCAAGATCATCATAATCTGgttgtttattataatgcagattgatttcaagGTTGT
TTATAGCTTTGAATGGATGTGTGAGTTGGTTGTTAATGGATGTGTACGTCTTTGTAGTGATCCTATCAATTTATTAAGTGGTGCACATAAACTTATTTTGACGCACGTCTTTGTTAGTTGTTGGGTAAATGTTTGGGCTGCTTAATGATATCTGCTTATAATTTTAATTTTTAGGTTTTGTAAGGGATGATTGATATTTT
ATGCATGTATGTAACTTTTATTACTTTCATCTTTTGATTTCAGAATATATTTTGGGCGGATATTTAACCAATAAGTTTTTATTGAGATGGGTAATACCCTGCTCCATCCTACTTGAGCTTAGATGGATGACACCCTGCTCCATCCTCCTTGTGATTAGATAGCCACAGCTCCATCGTCCTTGTTAGATTAATTTAATTTG
AACTCTTTGGGAAGAGGAAATACATGGATGAGGCCTTCTCGTAGAAGAAAAATCCAAAATTAAATGTCATCTAAAGAAAATTTGAAATTATATAGAGGCAGTTTAGTGACTTGGAGATTATGATTTTGATTTCAAGTAGAACACCAAAAAATCAAAGTTAGAGGCCATCACTATAATGAAATATTAGAAGATTCTACACG
CACTCATTTATGGGTTGTTTTTCTCTTTTGAAAATTTTTCAACACCGTGCCTTTGGAGAGTGGGTTTAACGAAAAACAAAATCATGTGAAATTGCGTAGAGGAAATACATGGATGAGGCCTTCTAGTAGAAGAAAAATCCAAAATTAAAAGTCATCGAAAGAAGATTTGACATTATATAGAGGCAATTTACTGACTAGTA
ATTCGATTTCATGTAGGACCACAAAAAAACAAAATTAGAGGCCATCACTATAATGAAGTAATCACTATAATGAAGTATTAGAAGATTCTGCAACAAAATTAGACGCCATCACTATAATAAATGATCAAAATATTCTGCAACAAAATTAGAGGCCATCACTA