sp|Q67UC7|HAK17_ORYSJ ----> Probable potassium transporter 17
Intron 1 GTAAGTTATA ... TTGTACAAAG
| Sample | Retention score (%) | Exon junction reads | 5'ss reads | 3'ss reads |
| A1 | 100 | 0 | 1 | 1 |
| A2 | 66.67 | 1 | 1 | 2 |
| A3 | 40 | 3 | 0 | 2 |
| A4 | 52 | 12 | 0 | 13 |
| A5 | 100 | 0 | 1 | 2 |
| A6 | 100 | 0 | 0 | 1 |
| A7 | 66.67 | 5 | 4 | 10 |
| A8 | 88.89 | 1 | 3 | 8 |
| A9 | 50 | 1 | 0 | 1 |
| A10 | 33.33 | 2 | 0 | 1 |
>TRINITY_DN40320_c0_g1_i4 from sample A7 / Example spliced isoformGTCTTGTTTTTGCTGAACAGTGCTCTCAGCAATGGATGGGATAAGAAATGCTGATCCTCGTATAAGTCAAAATTTGGTACTTCACGAGTAAGCTTCCTCTTTTCTCCAATCATGCTGGCCTGGGTATTATCAACTTCATTGATAGGAGTTTACAGCATCATTATTCACTATCCAGGTGTTTTCAAGGCATTTTCCCCATA
CTACATTTTTCGATTCTTTATAAGAAATGGAAAACAAGGCTGGTTGATGCTTGGTGGCGTTGTTTTATGCATAACAGGTGCAGAAGCTATGTTTGCAGATCTTGGACATTTTAACAGGATCTCTATTCAGGTGGCCTTCTTATTTGCTGTTTATCCTTCCCTGATTGTCACGTATGCTGGACAAACAGCATATCTTATCA
AGAATCCTTCTGATCATGCTGATGGATTTTACAAATTCATACCGAATGCTGTGTACTGGCCCATGTTTATAATTTCTACACTTGCAGCTATTGTCGCAAGTCAATCATTAATATCAGCATCATTTTCTGTGATCAAGCAATCTGTGGCTTTGGATTACTTTCCCCGTGTCAAGCTGGTTCACACATCACAATATAAAGAA
GGCCAAATTTACTGTCCTGAAATCAACTACATTCTCATGTTTCTTTGTCTGGTGGTAATTCTTGGTTTTCGGAGCGAAAATAAAATCGGCAACGCTTTTGGCGTTGTGGTGATTATGGTGATGCTGATTACAACTGTCTTATTGACACTGGTTATGATCATTGTTTGGAAAGCTCCTTTACCAGTTGTGCTCGTGTTCTT
CACTTGGTTTTTTATCATGGAAGGGATATATGTTTCTACTGTGCTCACTAAAGTTCCACGGGGAGGCTGGCTTCCCTTTTCAGTTTCTGTTGTACTTTCTGTTATAATGTTTAGTTGGAATCACGGCAGACAGAAAAAAATTGAGTATGAAATGACCAACAAGATGAGTTTGGGCAGTTTGGGTGCCCTTCTCTCTGACT
AGGAAATTCAGCGGGTGCCAGGACTGTGTTTCTTCTATAGCAGTATCATCCATGGTGTCCCTCCTATTGTTGGTCATTATGTAAAAAACATACGCTCCTTGCATGAGGTAATTGTATTAACAACTATAAGGTATCTCCCTGTTAAAACTGTATTACCAGATGAAAGGTTTCTTGTAAAAGGGCTGGGATATAAAGGAGTT
TACAGATGTGTTGCTCAGTATGGATACAACGATTCCTTGAATACTGAGGATGATGAATTTATGAACCAAGTTACTGATAGTCTGAACATGTATATCAAGTTTAGAGCATGTGAGGAAACAGATAAGTCTATTGATCTCTCAAAGTTGCCCTCAGAAGAATTCATGCCATCCTTTCCATCTGTTGAAGAGAATATAAGTGA
GCTGTCAAATGCAAAAGAAGCAGGGGTAGTTCATGTTCTAGGAAAAACAAGGTTCAAGATGAGAAAAAACATTAGTTGGGTTGACATGATTTTATTGGGAAGTATATATCAATTTTTACACTCAAACTGCAGGTCTTCAATGGCCGTTTTGGAGATACCACCATCAAGATCTGTTGAGATTGGCATGGTTTATGAAATTT
GAAAAAGGAAAACACATGTTACAGTGAATGCCAGATATCTGTTTAACTTTGATTGATTGGTTGTTTGAAGGAGCACAACATGTGCCTCCCAAGGAAAGTTTTATAGAACAAGGCTAAGGAAGGGAAGCCATAACATTGTTAGGTTGACTTCTTTCATCAATATGGGTGCTTCTAGTTTACAATTCAAAGAGGTTAAATAT
TTATACCACTATACCACTCCAGAATACCAAGTTATCAGCAGGGTTATGCTGACAAGACTTCTCTCCACCCTTGCCTTAAGCATTTCCATAAGTATGTTTCGTTTACTAGCTGCTGGTCATAGAGAACTGTATATGATACTTTCAGAACATCAAAGTACTGTGTAACTACCTATAAGTACGACACCGTTGTAAAGGTGTAT
TGGATTGCTTCAGCCTTCTCGTAATAAAATATCTTCAATTTTGTATTGTAAAAAGGAATCTTCTACAAGAGCCTCTTAGTAGAGAGGCATCTCATGCACTTTATACCCATCTTGGGGAACACGACTGAATAAATTTCATCAGCATGTAGGTAGAGTGCGCG
>TRINITY_DN40320_c0_g1_i6 from sample A7 / Example unspliced isoform:CGCAAAGATAAACGTGAAGAGTCCGTTCTCTCGACTTCTTCACACCCCGCAGGGCCGCAACTATATATGAACTGGTTAGTCTGATGGTCCTTCATAGACTTTTGAATCTCCATTTCACTTTACTCTAATGGTTTGGAATCACTTCTTCAACTCTGCATGCGAGCGAGCTGTTCGTTTCGCATAACAGCTAGTTAACCTAT
CGTCCAGCTCTTCTCAATGTCTCTGCATTTAGAGATAGAGTTGGAAGGCGCCGGAGTTGGATGCGGGGATGAGAAACAAGATTTATTTAGTAGCAGGAATGATGAAATCCTCGGTGAGATGAGAATGGCCAATAGAAATAGGAAATGCTACGACGAAGAGGAGGGTGTAGAAGGAGGATTTATGAATATGAAAACATGTT
TGCCTAGTGGTCATGTCCCAGGTGCTGCTGATTCGAATAGAGATCAGGCAGGAGGGACTGTGGGCATAGGGAGAACTATTTTTTTAGCATATCAAACGTTGGGAGTGGTCTATGGGGGTCTGGCCACGTCTCCATTGTACGTGTACCCGTCCATGAATTTGAAATCTCCAAACGAGGAGGATTATCTGGGAATCCTCAGC
CTTATGTTTTGGACTCTTTCTATGATTGGAGTCGTCAAATATGTCTGTATAGCCCTCCGTGCAGATGACCATGGCGAAGGTGGAACATTTGCTCTATATTCATTGCTTTGCAGGCATGCCAATGTTGGCCAACATTCGAGGAGGCTTTTGGAATCAGATGCAAAACTTTCTCATTTTAGCAAAAATAGTCATCCACATTC
AAATTTAGTGCGGGCTTTTGAAAGAAGCATGGTTGCAAGACAGGTTTTACTTTTTGTTGCTATGCTGGGCACATGTATGTTAATTGGAGATGGCATACTGACTCCTGCTATATCGGTGCTCTCAGCAATGGATGGGATAAGAAATGCTGATCCTCGTATAAGTCAAAgtaagttatacatacaactatggttcttgcatt
gtttgcttttcaatggaattattaagatatgattcttatttctgtttgcttgccaacggaattgttaaaatatgctagaactgagaaaaaagctatcctatgggatttaaattgtgcagccacagttgtagccctatcagctgtcaccctaatcatgttgtttcttgtacaaagATTTGGTACTTCACGAGTAAGCTTCC
TCTTTTCTCCAATCATGCTGGCCTGGGTATTATCAACTTCATTGATAGGAGTTTACAGCATCATTATTCACTATCCAGGTGTTTTCAAGGCATTTTCCCCATACTACATTTTTCGATTCTTTATAAGAAATGGAAAACAAGGCTGGTTGATGCTTGGTGGCGTTGTTTTATGCATAACAGGTATGCACTATGGCAACTTA
TGAAGCACTTAGTCTTTCCTTTTGTTTGCTTAAAAATCTTGATGCATGTATTGTGCATGCAGGTGCAGAAGCTATGTTTGCAGATCTTGGACATTTTAACAGGATCTCTATTCAGGTGGCCTTCTTATTTGCTGTTTATCCTTCCCTGATTGTCACGTATGCTGGACAAACAGCATATCTTATCAAGAATCCTTCTGATC
ATGCTGATGGATTTTACAAATTCATACCGAATGCTGTGTACTGGCCCATGTTTATAATTTCTACACTTGCAGCTATTGTCGCAAGTCAATCATTAATATCAGCATCATTTTCTGTGATCAAGCAATCTGTGGCTTTGGATTACTTTCCCCGTGTCAAGCTGGTTCACACATCACAATATAAAGAAGGCCAAATTTACTGT
CCTGAAATCAACTACATTCTCATGTTTCTTTGTCTGGTGGTAATTCTTGGTTTTCGGAGCGAAAATAAAATCGGCAACGCTTTTGGCGTTGTGGTGATTATGGTGATGCTGATTACAACTGTCTTATTGACACTGGTTATGATCATTGTTTGGAAAGCTCCTTTACCAGTTGTGCTCGTGTTCTTCACTTGGTTTTTTAT
CATGGAAGGGATATATGTTTCTACTGTGCTCACTAAAGTTCCACGGGGAGGCTGGCTTCCCTTTTCAGTTTCTGTTGTACTTTCTGTTATAATGTTTAGTTGGAATCACGGCAGACAGAAAAAAATTGAGTATGAAATGACCAACAAGATGAGTTTGGGCAGTTTGGGTGCCCTTCTCTCTGACTAGGAAATTCAGCGGG
TGCCAGGACTGTGTTTCTTCTATAGCAGTATCATCCATGGTGTCCCTCCTATTGTTGGTCATTATGTAAAAAACATACGCTCCTTGCATGAGGTAATTGTATTAACAACTATAAGGTATCTCCCTGTTAAAACTGTATTACCAGATGAAAGGTTTCTTGTAAAAGGGCTGGGATATAAAGGAGTTTACAGATGTGTTGCT
CAGTATGGATACAACGATTCCTTGAATACTGAGGATGATGAATTTATGAACCAAGTTACTGATAGTCTGAACATGTATATCAAGTTTAGAGCATGTGAGGAAACAGATAAGTCTATTGATCTCTCAAAGTTGCCCTCAGAAGAATTCATGCCATCCTTTCCATCTGTTGAAGAGAATATAAGTGAGCTGTCAAATGCAAA
AGAAGCAGGGGTAGTTCATGTTCTAGGAAAAACAAGGTTCAAGATGAGAAAAAACATTAGTTGGGTTGACATGATTTTATTGGGAAGTATATATCAATTTTTACACTCAAACTGCAGGTCTTCAATGGCCGTTTTGGAGATACCACCATCAAGATCTGTTGAGATTGGCATGGTTTATGAAATTTGAAAAAGGAAAACAC
ATGTTACAGTGAATGCCAGATATCTGTTTAACTTTGATTGATTGGTTGTTTGAAGGAGCACAACATGTGCCTCCCAAGGAAAGTTTTATAGAACAAGGCTAAGGAAGGGAAGCCATAACATTGTTAGGTTGACTTCTTTCATCAATATGGGTGCTTCTAGTTTACAATTCAAAGAGGTTAAATATTTATACCACTATACC
ACTCCAGAATACCAAGTTATCAGCAGGGTTATGCTGACAAGACTTCTCTCCACCCTTGCCTTAAGCATTTCCATAAGTATGTTTCGTTTACTAGCTGCTGGTCATAGAGAACTGTATATGATACTTTCAGAACATCAAAGTACTGTGTAACTACCTATAAGTACGACACCGTTGTAAAGGTGTATTGGATTGCTTCAGCC
TTCTCGTAATAAAATATCTTCAATTTTGTATTGTAAAAAGGAATCTTCTACAAGAGCCTCTTAGTAGAGAGGCATCTCATGCACTTTATACCCATCTTGGGGAACACGACTGAATAAATTTCATCAGCATGTAGGTAGAGTGCGCG
Intron 2 GTGGCCTTCT ... ACACTTGCAG
Found issues: Low number of reads
| Sample | Retention score (%) | Exon junction reads | 5'ss reads | 3'ss reads |
| A1 | 70 | 3 | 8 | 6 |
| A2 | 100 | 0 | 0 | 2 |
| A3 | 100 | 0 | 6 | 0 |
| A4 | 69.23 | 2 | 0 | 9 |
| A5 | 80 | 1 | 6 | 2 |
| A6 | 42.86 | 6 | 3 | 6 |
| A7 | 100 | 0 | 3 | 0 |
| A8 | 75 | 1 | 1 | 5 |
| A9 | 52.38 | 5 | 3 | 8 |
| A10 | 81.82 | 1 | 8 | 1 |
>TRINITY_DN33399_c0_g1_i4 from sample A6 / Example spliced isoformCTTCACGAGTGTTTTCAAGGCATTTTCCCCATACTACATTTTTCGATTCTTTATAAGAAATGGAAAACAAGGCTGGTTGATGCTTGGTGGCGTTGTTTTATGCATAACAGGTGCAGAAGCTATGTTTGCAGATCTTGGACATTTTAACAGGATCTCTATTCAGCTATTGTCGCAAGTCAATCATTAATATCAGCATCATT
TTCTGTGATCAAGCAATCTGTGGCTTTGGATTACTTTCCCCGTGTCAAGCTGGTTCACACATCACAATATAAAGAAGGCCAAATTTACTGTCCTGAAATCAACTACATTCTCATGTTTCTTTGTCTGGTGGTAATTCTTGGTTTTCGGAGCGAAAATAAAATCGGCAACGCTTTTGGCGTTGTGGTGATTATGGTGATGC
TGATTACAACTGTCTTATTGACACTGGTCATGATTATTGTTTGGAAAACTCCTTTACCAGTTGTGTTTGTGTTCTTCACATGCTTTTTTATTATGGAAGGGACATATGTTTCTTCTGTGCTCACCAAAGTTCCACATGGAGGCTGGCTTCCCTTTTCAATTTCTGTTGTACTTGCCGTTATAATGTTTAGTTGGAATCAT
GGAAGGCAGAAGAAAATTGAATATGAAGTGACCAACCAGATGGATTTGAGCAGCCTGGATACTCTTCTCTGTGATAAGGGAACTCAGCGAGTGCCAGGATTGTGTTTCTTCTATAGCGATATCCTCCATGGTGTTCCTCCTATTGTTGGTCATTATGTTAAAAATGTGGGTTCCTTGCATGAGGTAATTGTATTAATAAC
TTCCAGGTATGTCCCTGTTCAAACTGTATTACCAGATGAAAGGTTTCTTGTAAAAGGACTGGGATATAAAGGAGTTTACAGGTGCATTGCTCGGTATGGCTACAGTGATTCCTTCAATATTGAGGGCGATGAATTTACGGATCAAATTACTAATAATCTGGACATGTATATCAAGCTCAGTGCAGTTGAGCAAAAAGATA
AAGGATCTATCAATCTCTCAGCTTTGGATGACTTTGTATCATTTTTTCCATCTGTTCAAGAGAATATAAGTGACCTGGCAAAAGCAAAAGGAACTGGCGTAGTTCATGTTCTGGGAAAAGCAAGATTCCAGATCGGAAAAAGCGTTGGTTGTTTCGACAGGATTTTGCTGGGAAACATATATCAATTTTTACACAGAAAC
TGCAGATCTTCACTGGATGTTTTGAAATTAACACCATCAAGTTATGTTGAGATTGGTATGATTTATGAATTTGGAAAGCACAACGCGTGTTTGGGCACACGCTAGATATCTGTTCAACTTTCACTGTAATATCGCAGAATGTACCTCCTCAGGCAACATTTTTTTTTGCCAAAGACGAGGACGGGATGCCATAACATTAA
AGGTACTAGATTCACCTATTTCATTAGTACGTTTATTGCTGATTACATCTATTCGAAGACGATAGATGTTTATACCTCTATGCCCCTGCAGTATATTAATTTATATGCAAGGTTATATTTCAGAGTAACATAATTTGAATAAAGGTATGTAGAATATGGTGAAATTCAATTCAAAATTA
>TRINITY_DN33399_c0_g1_i2 from sample A6 / Example unspliced isoform:CTTCACGAGTGTTTTCAAGGCATTTTCCCCATACTACATTTTTCGATTCTTTATAAGAAATGGAAAACAAGGCTGGTTGATGCTTGGTGGCGTTGTTTTATGCATAACAGGTGCAGAAGCTATGTTTGCAGATCTTGGACATTTTAACAGGATCTCTATTCAGgtggccttcttatttgctgtttatccttccctgattg
tcacgtatgctggacaaacagcatatcttatcaagaatccttctgatcatgctgatggattttacaaattcataccgaatgctgtgtactggcccatgtttataatttctacacttgcagCTATTGTCGCAAGTCAATCATTAATATCAGCATCATTTTCTGTGATCAAGCAATCTGTGGCTTTGGATTACTTTCCCCGT
GTCAAGCTGGTTCACACATCACAATATAAAGAAGGCCAAATTTACTGTCCTGAAATCAACTACATTCTCATGTTTCTTTGTCTGGTGGTAATTCTTGGTTTTCGGAGCGAAAATAAAATCGGCAACGCTTTTGGCGTTGTGGTGATTATGGTGATGCTGATTACAACTGTCTTATTGACACTGGTCATGATTATTGTTTG
GAAAACTCCTTTACCAGTTGTGTTTGTGTTCTTCACATGCTTTTTTATTATGGAAGGGACATATGTTTCTTCTGTGCTCACCAAAGTTCCACATGGAGGCTGGCTTCCCTTTTCAATTTCTGTTGTACTTGCCGTTATAATGTTTAGTTGGAATCATGGAAGGCAGAAGAAAATTGAATATGAAGTGACCAACCAGATGG
ATTTGAGCAGCCTGGATACTCTTCTCTGTGATAAGGGAACTCAGCGAGTGCCAGGATTGTGTTTCTTCTATAGCGATATCCTCCATGGTGTTCCTCCTATTGTTGGTCATTATGTTAAAAATGTGGGTTCCTTGCATGAGGTAATTGTATTAATAACTTCCAGGTATGTCCCTGTTCAAACTGTATTACCAGATGAAAGG
TTTCTTGTAAAAGGACTGGGATATAAAGGAGTTTACAGGTGCATTGCTCGGTATGGCTACAGTGATTCCTTCAATATTGAGGGCGATGAATTTACGGATCAAATTACTAATAATCTGGACATGTATATCAAGCTCAGTGCAGTTGAGCAAAAAGATAAAGGATCTATCAATCTCTCAGCTTTGGATGACTTTGTATCATT
TTTTCCATCTGTTCAAGAGAATATAAGTGACCTGGCAAAAGCAAAAGGAACTGGCGTAGTTCATGTTCTGGGAAAAGCAAGATTCCAGATCGGAAAAAGCGTTGGTTGTTTCGACAGGATTTTGCTGGGAAACATATATCAATTTTTACACAGAAACTGCAGATCTTCACTGGATGTTTTGAAATTAACACCATCAAGTT
ATGTTGAGATTGGTATGATTTATGAATTTGGAAAGCACAACGCGTGTTTGGGCACACGCTAGATATCTGTTCAACTTTCACTGTAATATCGCAGAATGTACCTCCTCAGGCAACATTTTTTTTTGCCAAAGACGAGGACGGGATGCCATAACATTAAAGGTACTAGATTCACCTATTTCATTAGTACGTTTATTGCTGAT
TACATCTATTCGAAGACGATAGATGTTTATACCTCTATGCCCCTGCAGTATATTAATTTATATGCAAGGTTATATTTCAGAGTAACATAATTTGAATAAAGGTATGTAGAATATGGTGAAATTCAATTCAAAATTA
Intron 3 GTAAGTTATA ... AATTGTGCAG
Found issues: Low number of reads
| Sample | Retention score (%) | Exon junction reads | 5'ss reads | 3'ss reads |
| A1 | 20 | 2 | 1 | 0 |
| A2 | 60 | 1 | 1 | 2 |
| A3 | 7.69 | 6 | 0 | 1 |
| A4 | 0 | 2 | 0 | 0 |
| A5 | 33.33 | 3 | 1 | 2 |
| A6 | 0 | 2 | 0 | 0 |
| A7 | 47.83 | 6 | 4 | 7 |
| A8 | 52.38 | 5 | 3 | 8 |
| A9 | -1 | 0 | 0 | 0 |
| A10 | -1 | 0 | 0 | 0 |
>TRINITY_DN40320_c0_g1_i2 from sample A7 / Example spliced isoformCGCAAAGATAAACGTGAAGAGTCCGTTCTCTCGACTTCTTCACACCCCGCAGGGCCGCAACTATATATGAACTGGTTAGTCTGATGGTCCTTCATAGACTTTTGAATCTCCATTTCACTTTACTCTAATGGTTTGGAATCACTTCTTCAACTCTGCATGCGAGCGAGCTGTTCGTTTCGCATAACAGCTAGTTAACCTAT
CGTCCAGCTCTTCTCAATGTCTCTGCATTTAGAGATAGAGTTGGAAGGCGCCGGAGTTGGATGCGGGGATGAGAAACAAGATTTATTTAGTAGCAGGAATGATGAAATCCTCGGTGAGATGAGAATGGCCAATAGAAATAGGAAATGCTACGACGAAGAGGAGGGTGTAGAAGGAGGATTTATGAATATGAAAACATGTT
TGCCTAGTGGTCATGTCCCAGGTGCTGCTGATTCGAATAGAGATCAGGCAGGAGGGACTGTGGGCATAGGGAGAACTATTTTTTTAGCATATCAAACGTTGGGAGTGGTCTATGGGGGTCTGGCCACGTCTCCATTGTACGTGTACCCGTCCATGAATTTGAAATCTCCAAACGAGGAGGATTATCTGGGAATCCTCAGC
CTTATGTTTTGGACTCTTTCTATGATTGGAGTCGTCAAATATGTCTGTATAGCCCTCCGTGCAGATGACCATGGCGAAGGTGGAACATTTGCTCTATATTCATTGCTTTGCAGGCATGCCAATGTTGGCCAACATTCGAGGAGGCTTTTGGAATCAGATGCAAAACTTTCTCATTTTAGCAAAAATAGTCATCCACATTC
AAATTTAGTGCGGGCTTTTGAAAGAAGCATGGTTGCAAGACAGGTTTTACTTTTTGTTGCTATGCTGGGCACATGTATGTTAATTGGAGATGGCATACTGACTCCTGCTATATCGGTGCTCTCAGCAATGGATGGGATAAGAAATGCTGATCCTCGTATAAGTCAAACCACAGTTGTAGCCCTATCAGCTGTCACCCTAA
TCATGTTGTTTCTTGTACAAAGATTTGGTACTTCACGAGTAAGCTTCCTCTTTTCTCCAATCATGCTGGCCTGGGTATTATCAACTTCATTGATAGGAGTTTACAGCATCATTATTCACTATCCAGGTGTTTTCAAGGCATTTTCCCCATACTACATTTTTCGATTCTTTATAAGAAATGGAAAACAAGGCTGGTTGATG
CTTGGTGGCGTTGTTTTATGCATAACAGGTGCAGAAGCTATGTTTGCAGATCTTGGACATTTTAACAGGATCTCTATTCAGGTGGCCTTCTTATTTGCTGTTTATCCTTCCCTGATTGTCACGTATGCTGGACAAACAGCATATCTTATCAAGAATCCTTCTGATCATGCTGATGGATTTTACAAATTCATACCGAATGC
TGTGTACTGGCCCATGTTTATAATTTCTACACTTGCAGCTATTGTCGCAAGTCAATCATTAATATCAGCATCATTTTCTGTGATCAAGCAATCTGTGGCTTTGGATTACTTTCCCCGTGTCAAGCTGGTTCACACATCACAATATAAAGAAGGCCAAATTTACTGTCCTGAAATCAACTACATTCTCATGTTTCTTTGTC
TGGTGGTAATTCTTGGTTTTCGGAGCGAAAATAAAATCGGCAACGCTTTTGGCGTTGTGGTGATTATGGTGATGCTGATTACAACTGTCTTATTGACACTGGTTATGATCATTGTTTGGAAAGCTCCTTTACCAGTTGTGCTCGTGTTCTTCACTTGGTTTTTTATCATGGAAGGGATATATGTTTCTACTGTGCTCACT
AAAGTTCCACGGGGAGGCTGGCTTCCCTTTTCAGTTTCTGTTGTACTTTCTGTTATAATGTTTAGTTGGAATCACGGCAGACAGAAAAAAATTGAGTATGAAATGACCAACAAGATGAGTTTGGGCAGTTTGGGTGCCCTTCTCTCTGACTAGGAAATTCAGCGGGTGCCAGGACTGTGTTTCTTCTATAGCAGTATCAT
CCATGGTGTCCCTCCTATTGTTGGTCATTATGTAAAAAACATACGCTCCTTGCATGAGGTAATTGTATTAACAACTATAAGGTATCTCCCTGTTAAAACTGTATTACCAGATGAAAGGTTTCTTGTAAAAGGGCTGGGATATAAAGGAGTTTACAGATGTGTTGCTCAGTATGGATACAACGATTCCTTGAATACTGAGG
ATGATGAATTTATGAACCAAGTTACTGATAGTCTGAACATGTATATCAAGTTTAGAGCATGTGAGGAAACAGATAAGTCTATTGATCTCTCAAAGTTGCCCTCAGAAGAATTCATGCCATCCTTTCCATCTGTTGAAGAGAATATAAGTGAGCTGTCAAATGCAAAAGAAGCAGGGGTAGTTCATGTTCTAGGAAAAACA
AGGTTCAAGATGAGAAAAAACATTAGTTGGGTTGACATGATTTTATTGGGAAGTATATATCAATTTTTACACTCAAACTGCAGGTCTTCAATGGCCGTTTTGGAGATACCACCATCAAGATCTGTTGAGATTGGCATGGTTTATGAAATTTGAAAAAGGAAAACACATGTTACAGTGAATGCCAGATATCTGTTTAACTT
TGATTGATTGGTTGTTTGAAGGAGCACAACATGTGCCTCCCAAGGAAAGTTTTATAGAACAAGGCTAAGGAAGGGAAGCCATAACATTGTTAGGTTGACTTCTTTCATCAATATGGGTGCTTCTAGTTTACAATTCAAAGAGGTTAAATATTTATACCACTATACCACTCCAGAATACCAAGTTATCAGCAGGGTTATGC
TGACAAGACTTCTCTCCACCCTTGCCTTAAGCATTTCCATAAGTATGTTTCGTTTACTAGCTGCTGGTCATAGAGAACTGTATATGATACTTTCAGAACATCAAAGTACTGTGTAACTACCTATAAGTACGACACCGTTGTAAAGGTGTATTGGATTGCTTCAGCCTTCTCGTAATAAAATATCTTCAATTTTGTATTGT
AAAAAGGAATCTTCTACAAGAGCCTCTTAGTAGAGAGGCATCTCATGCACTTTATACCCATCTTGGGGAACACGACTGAATAAATTTCATCAGCATGTAGGTAGAGTGCGCG
>TRINITY_DN40320_c0_g1_i6 from sample A7 / Example unspliced isoform:CGCAAAGATAAACGTGAAGAGTCCGTTCTCTCGACTTCTTCACACCCCGCAGGGCCGCAACTATATATGAACTGGTTAGTCTGATGGTCCTTCATAGACTTTTGAATCTCCATTTCACTTTACTCTAATGGTTTGGAATCACTTCTTCAACTCTGCATGCGAGCGAGCTGTTCGTTTCGCATAACAGCTAGTTAACCTAT
CGTCCAGCTCTTCTCAATGTCTCTGCATTTAGAGATAGAGTTGGAAGGCGCCGGAGTTGGATGCGGGGATGAGAAACAAGATTTATTTAGTAGCAGGAATGATGAAATCCTCGGTGAGATGAGAATGGCCAATAGAAATAGGAAATGCTACGACGAAGAGGAGGGTGTAGAAGGAGGATTTATGAATATGAAAACATGTT
TGCCTAGTGGTCATGTCCCAGGTGCTGCTGATTCGAATAGAGATCAGGCAGGAGGGACTGTGGGCATAGGGAGAACTATTTTTTTAGCATATCAAACGTTGGGAGTGGTCTATGGGGGTCTGGCCACGTCTCCATTGTACGTGTACCCGTCCATGAATTTGAAATCTCCAAACGAGGAGGATTATCTGGGAATCCTCAGC
CTTATGTTTTGGACTCTTTCTATGATTGGAGTCGTCAAATATGTCTGTATAGCCCTCCGTGCAGATGACCATGGCGAAGGTGGAACATTTGCTCTATATTCATTGCTTTGCAGGCATGCCAATGTTGGCCAACATTCGAGGAGGCTTTTGGAATCAGATGCAAAACTTTCTCATTTTAGCAAAAATAGTCATCCACATTC
AAATTTAGTGCGGGCTTTTGAAAGAAGCATGGTTGCAAGACAGGTTTTACTTTTTGTTGCTATGCTGGGCACATGTATGTTAATTGGAGATGGCATACTGACTCCTGCTATATCGGTGCTCTCAGCAATGGATGGGATAAGAAATGCTGATCCTCGTATAAGTCAAAgtaagttatacatacaactatggttcttgcatt
gtttgcttttcaatggaattattaagatatgattcttatttctgtttgcttgccaacggaattgttaaaatatgctagaactgagaaaaaagctatcctatgggatttaaattgtgcagCCACAGTTGTAGCCCTATCAGCTGTCACCCTAATCATGTTGTTTCTTGTACAAAGATTTGGTACTTCACGAGTAAGCTTCC
TCTTTTCTCCAATCATGCTGGCCTGGGTATTATCAACTTCATTGATAGGAGTTTACAGCATCATTATTCACTATCCAGGTGTTTTCAAGGCATTTTCCCCATACTACATTTTTCGATTCTTTATAAGAAATGGAAAACAAGGCTGGTTGATGCTTGGTGGCGTTGTTTTATGCATAACAGGTATGCACTATGGCAACTTA
TGAAGCACTTAGTCTTTCCTTTTGTTTGCTTAAAAATCTTGATGCATGTATTGTGCATGCAGGTGCAGAAGCTATGTTTGCAGATCTTGGACATTTTAACAGGATCTCTATTCAGGTGGCCTTCTTATTTGCTGTTTATCCTTCCCTGATTGTCACGTATGCTGGACAAACAGCATATCTTATCAAGAATCCTTCTGATC
ATGCTGATGGATTTTACAAATTCATACCGAATGCTGTGTACTGGCCCATGTTTATAATTTCTACACTTGCAGCTATTGTCGCAAGTCAATCATTAATATCAGCATCATTTTCTGTGATCAAGCAATCTGTGGCTTTGGATTACTTTCCCCGTGTCAAGCTGGTTCACACATCACAATATAAAGAAGGCCAAATTTACTGT
CCTGAAATCAACTACATTCTCATGTTTCTTTGTCTGGTGGTAATTCTTGGTTTTCGGAGCGAAAATAAAATCGGCAACGCTTTTGGCGTTGTGGTGATTATGGTGATGCTGATTACAACTGTCTTATTGACACTGGTTATGATCATTGTTTGGAAAGCTCCTTTACCAGTTGTGCTCGTGTTCTTCACTTGGTTTTTTAT
CATGGAAGGGATATATGTTTCTACTGTGCTCACTAAAGTTCCACGGGGAGGCTGGCTTCCCTTTTCAGTTTCTGTTGTACTTTCTGTTATAATGTTTAGTTGGAATCACGGCAGACAGAAAAAAATTGAGTATGAAATGACCAACAAGATGAGTTTGGGCAGTTTGGGTGCCCTTCTCTCTGACTAGGAAATTCAGCGGG
TGCCAGGACTGTGTTTCTTCTATAGCAGTATCATCCATGGTGTCCCTCCTATTGTTGGTCATTATGTAAAAAACATACGCTCCTTGCATGAGGTAATTGTATTAACAACTATAAGGTATCTCCCTGTTAAAACTGTATTACCAGATGAAAGGTTTCTTGTAAAAGGGCTGGGATATAAAGGAGTTTACAGATGTGTTGCT
CAGTATGGATACAACGATTCCTTGAATACTGAGGATGATGAATTTATGAACCAAGTTACTGATAGTCTGAACATGTATATCAAGTTTAGAGCATGTGAGGAAACAGATAAGTCTATTGATCTCTCAAAGTTGCCCTCAGAAGAATTCATGCCATCCTTTCCATCTGTTGAAGAGAATATAAGTGAGCTGTCAAATGCAAA
AGAAGCAGGGGTAGTTCATGTTCTAGGAAAAACAAGGTTCAAGATGAGAAAAAACATTAGTTGGGTTGACATGATTTTATTGGGAAGTATATATCAATTTTTACACTCAAACTGCAGGTCTTCAATGGCCGTTTTGGAGATACCACCATCAAGATCTGTTGAGATTGGCATGGTTTATGAAATTTGAAAAAGGAAAACAC
ATGTTACAGTGAATGCCAGATATCTGTTTAACTTTGATTGATTGGTTGTTTGAAGGAGCACAACATGTGCCTCCCAAGGAAAGTTTTATAGAACAAGGCTAAGGAAGGGAAGCCATAACATTGTTAGGTTGACTTCTTTCATCAATATGGGTGCTTCTAGTTTACAATTCAAAGAGGTTAAATATTTATACCACTATACC
ACTCCAGAATACCAAGTTATCAGCAGGGTTATGCTGACAAGACTTCTCTCCACCCTTGCCTTAAGCATTTCCATAAGTATGTTTCGTTTACTAGCTGCTGGTCATAGAGAACTGTATATGATACTTTCAGAACATCAAAGTACTGTGTAACTACCTATAAGTACGACACCGTTGTAAAGGTGTATTGGATTGCTTCAGCC
TTCTCGTAATAAAATATCTTCAATTTTGTATTGTAAAAAGGAATCTTCTACAAGAGCCTCTTAGTAGAGAGGCATCTCATGCACTTTATACCCATCTTGGGGAACACGACTGAATAAATTTCATCAGCATGTAGGTAGAGTGCGCG
Intron 4 GTATGCACTA ... GTGCATGCAG
Found issues: Low number of reads
| Sample | Retention score (%) | Exon junction reads | 5'ss reads | 3'ss reads |
| A1 | 0 | 3 | 0 | 0 |
| A2 | -1 | 0 | 0 | 0 |
| A3 | -1 | 0 | 0 | 0 |
| A4 | 100 | 0 | 1 | 1 |
| A5 | 0 | 1 | 0 | 0 |
| A6 | 33.33 | 2 | 1 | 1 |
| A7 | 40 | 3 | 2 | 2 |
| A8 | 27.27 | 4 | 3 | 0 |
| A9 | 33.33 | 1 | 0 | 1 |
| A10 | 36.84 | 6 | 2 | 5 |
>TRINITY_DN40320_c0_g1_i2 from sample A7 / Example spliced isoformCGCAAAGATAAACGTGAAGAGTCCGTTCTCTCGACTTCTTCACACCCCGCAGGGCCGCAACTATATATGAACTGGTTAGTCTGATGGTCCTTCATAGACTTTTGAATCTCCATTTCACTTTACTCTAATGGTTTGGAATCACTTCTTCAACTCTGCATGCGAGCGAGCTGTTCGTTTCGCATAACAGCTAGTTAACCTAT
CGTCCAGCTCTTCTCAATGTCTCTGCATTTAGAGATAGAGTTGGAAGGCGCCGGAGTTGGATGCGGGGATGAGAAACAAGATTTATTTAGTAGCAGGAATGATGAAATCCTCGGTGAGATGAGAATGGCCAATAGAAATAGGAAATGCTACGACGAAGAGGAGGGTGTAGAAGGAGGATTTATGAATATGAAAACATGTT
TGCCTAGTGGTCATGTCCCAGGTGCTGCTGATTCGAATAGAGATCAGGCAGGAGGGACTGTGGGCATAGGGAGAACTATTTTTTTAGCATATCAAACGTTGGGAGTGGTCTATGGGGGTCTGGCCACGTCTCCATTGTACGTGTACCCGTCCATGAATTTGAAATCTCCAAACGAGGAGGATTATCTGGGAATCCTCAGC
CTTATGTTTTGGACTCTTTCTATGATTGGAGTCGTCAAATATGTCTGTATAGCCCTCCGTGCAGATGACCATGGCGAAGGTGGAACATTTGCTCTATATTCATTGCTTTGCAGGCATGCCAATGTTGGCCAACATTCGAGGAGGCTTTTGGAATCAGATGCAAAACTTTCTCATTTTAGCAAAAATAGTCATCCACATTC
AAATTTAGTGCGGGCTTTTGAAAGAAGCATGGTTGCAAGACAGGTTTTACTTTTTGTTGCTATGCTGGGCACATGTATGTTAATTGGAGATGGCATACTGACTCCTGCTATATCGGTGCTCTCAGCAATGGATGGGATAAGAAATGCTGATCCTCGTATAAGTCAAACCACAGTTGTAGCCCTATCAGCTGTCACCCTAA
TCATGTTGTTTCTTGTACAAAGATTTGGTACTTCACGAGTAAGCTTCCTCTTTTCTCCAATCATGCTGGCCTGGGTATTATCAACTTCATTGATAGGAGTTTACAGCATCATTATTCACTATCCAGGTGTTTTCAAGGCATTTTCCCCATACTACATTTTTCGATTCTTTATAAGAAATGGAAAACAAGGCTGGTTGATG
CTTGGTGGCGTTGTTTTATGCATAACAGGTGCAGAAGCTATGTTTGCAGATCTTGGACATTTTAACAGGATCTCTATTCAGGTGGCCTTCTTATTTGCTGTTTATCCTTCCCTGATTGTCACGTATGCTGGACAAACAGCATATCTTATCAAGAATCCTTCTGATCATGCTGATGGATTTTACAAATTCATACCGAATGC
TGTGTACTGGCCCATGTTTATAATTTCTACACTTGCAGCTATTGTCGCAAGTCAATCATTAATATCAGCATCATTTTCTGTGATCAAGCAATCTGTGGCTTTGGATTACTTTCCCCGTGTCAAGCTGGTTCACACATCACAATATAAAGAAGGCCAAATTTACTGTCCTGAAATCAACTACATTCTCATGTTTCTTTGTC
TGGTGGTAATTCTTGGTTTTCGGAGCGAAAATAAAATCGGCAACGCTTTTGGCGTTGTGGTGATTATGGTGATGCTGATTACAACTGTCTTATTGACACTGGTTATGATCATTGTTTGGAAAGCTCCTTTACCAGTTGTGCTCGTGTTCTTCACTTGGTTTTTTATCATGGAAGGGATATATGTTTCTACTGTGCTCACT
AAAGTTCCACGGGGAGGCTGGCTTCCCTTTTCAGTTTCTGTTGTACTTTCTGTTATAATGTTTAGTTGGAATCACGGCAGACAGAAAAAAATTGAGTATGAAATGACCAACAAGATGAGTTTGGGCAGTTTGGGTGCCCTTCTCTCTGACTAGGAAATTCAGCGGGTGCCAGGACTGTGTTTCTTCTATAGCAGTATCAT
CCATGGTGTCCCTCCTATTGTTGGTCATTATGTAAAAAACATACGCTCCTTGCATGAGGTAATTGTATTAACAACTATAAGGTATCTCCCTGTTAAAACTGTATTACCAGATGAAAGGTTTCTTGTAAAAGGGCTGGGATATAAAGGAGTTTACAGATGTGTTGCTCAGTATGGATACAACGATTCCTTGAATACTGAGG
ATGATGAATTTATGAACCAAGTTACTGATAGTCTGAACATGTATATCAAGTTTAGAGCATGTGAGGAAACAGATAAGTCTATTGATCTCTCAAAGTTGCCCTCAGAAGAATTCATGCCATCCTTTCCATCTGTTGAAGAGAATATAAGTGAGCTGTCAAATGCAAAAGAAGCAGGGGTAGTTCATGTTCTAGGAAAAACA
AGGTTCAAGATGAGAAAAAACATTAGTTGGGTTGACATGATTTTATTGGGAAGTATATATCAATTTTTACACTCAAACTGCAGGTCTTCAATGGCCGTTTTGGAGATACCACCATCAAGATCTGTTGAGATTGGCATGGTTTATGAAATTTGAAAAAGGAAAACACATGTTACAGTGAATGCCAGATATCTGTTTAACTT
TGATTGATTGGTTGTTTGAAGGAGCACAACATGTGCCTCCCAAGGAAAGTTTTATAGAACAAGGCTAAGGAAGGGAAGCCATAACATTGTTAGGTTGACTTCTTTCATCAATATGGGTGCTTCTAGTTTACAATTCAAAGAGGTTAAATATTTATACCACTATACCACTCCAGAATACCAAGTTATCAGCAGGGTTATGC
TGACAAGACTTCTCTCCACCCTTGCCTTAAGCATTTCCATAAGTATGTTTCGTTTACTAGCTGCTGGTCATAGAGAACTGTATATGATACTTTCAGAACATCAAAGTACTGTGTAACTACCTATAAGTACGACACCGTTGTAAAGGTGTATTGGATTGCTTCAGCCTTCTCGTAATAAAATATCTTCAATTTTGTATTGT
AAAAAGGAATCTTCTACAAGAGCCTCTTAGTAGAGAGGCATCTCATGCACTTTATACCCATCTTGGGGAACACGACTGAATAAATTTCATCAGCATGTAGGTAGAGTGCGCG
>TRINITY_DN40320_c0_g1_i6 from sample A7 / Example unspliced isoform:CGCAAAGATAAACGTGAAGAGTCCGTTCTCTCGACTTCTTCACACCCCGCAGGGCCGCAACTATATATGAACTGGTTAGTCTGATGGTCCTTCATAGACTTTTGAATCTCCATTTCACTTTACTCTAATGGTTTGGAATCACTTCTTCAACTCTGCATGCGAGCGAGCTGTTCGTTTCGCATAACAGCTAGTTAACCTAT
CGTCCAGCTCTTCTCAATGTCTCTGCATTTAGAGATAGAGTTGGAAGGCGCCGGAGTTGGATGCGGGGATGAGAAACAAGATTTATTTAGTAGCAGGAATGATGAAATCCTCGGTGAGATGAGAATGGCCAATAGAAATAGGAAATGCTACGACGAAGAGGAGGGTGTAGAAGGAGGATTTATGAATATGAAAACATGTT
TGCCTAGTGGTCATGTCCCAGGTGCTGCTGATTCGAATAGAGATCAGGCAGGAGGGACTGTGGGCATAGGGAGAACTATTTTTTTAGCATATCAAACGTTGGGAGTGGTCTATGGGGGTCTGGCCACGTCTCCATTGTACGTGTACCCGTCCATGAATTTGAAATCTCCAAACGAGGAGGATTATCTGGGAATCCTCAGC
CTTATGTTTTGGACTCTTTCTATGATTGGAGTCGTCAAATATGTCTGTATAGCCCTCCGTGCAGATGACCATGGCGAAGGTGGAACATTTGCTCTATATTCATTGCTTTGCAGGCATGCCAATGTTGGCCAACATTCGAGGAGGCTTTTGGAATCAGATGCAAAACTTTCTCATTTTAGCAAAAATAGTCATCCACATTC
AAATTTAGTGCGGGCTTTTGAAAGAAGCATGGTTGCAAGACAGGTTTTACTTTTTGTTGCTATGCTGGGCACATGTATGTTAATTGGAGATGGCATACTGACTCCTGCTATATCGGTGCTCTCAGCAATGGATGGGATAAGAAATGCTGATCCTCGTATAAGTCAAAGTAAGTTATACATACAACTATGGTTCTTGCATT
GTTTGCTTTTCAATGGAATTATTAAGATATGATTCTTATTTCTGTTTGCTTGCCAACGGAATTGTTAAAATATGCTAGAACTGAGAAAAAAGCTATCCTATGGGATTTAAATTGTGCAGCCACAGTTGTAGCCCTATCAGCTGTCACCCTAATCATGTTGTTTCTTGTACAAAGATTTGGTACTTCACGAGTAAGCTTCC
TCTTTTCTCCAATCATGCTGGCCTGGGTATTATCAACTTCATTGATAGGAGTTTACAGCATCATTATTCACTATCCAGGTGTTTTCAAGGCATTTTCCCCATACTACATTTTTCGATTCTTTATAAGAAATGGAAAACAAGGCTGGTTGATGCTTGGTGGCGTTGTTTTATGCATAACAGgtatgcactatggcaactta
tgaagcacttagtctttccttttgtttgcttaaaaatcttgatgcatgtattgtgcatgcagGTGCAGAAGCTATGTTTGCAGATCTTGGACATTTTAACAGGATCTCTATTCAGGTGGCCTTCTTATTTGCTGTTTATCCTTCCCTGATTGTCACGTATGCTGGACAAACAGCATATCTTATCAAGAATCCTTCTGATC
ATGCTGATGGATTTTACAAATTCATACCGAATGCTGTGTACTGGCCCATGTTTATAATTTCTACACTTGCAGCTATTGTCGCAAGTCAATCATTAATATCAGCATCATTTTCTGTGATCAAGCAATCTGTGGCTTTGGATTACTTTCCCCGTGTCAAGCTGGTTCACACATCACAATATAAAGAAGGCCAAATTTACTGT
CCTGAAATCAACTACATTCTCATGTTTCTTTGTCTGGTGGTAATTCTTGGTTTTCGGAGCGAAAATAAAATCGGCAACGCTTTTGGCGTTGTGGTGATTATGGTGATGCTGATTACAACTGTCTTATTGACACTGGTTATGATCATTGTTTGGAAAGCTCCTTTACCAGTTGTGCTCGTGTTCTTCACTTGGTTTTTTAT
CATGGAAGGGATATATGTTTCTACTGTGCTCACTAAAGTTCCACGGGGAGGCTGGCTTCCCTTTTCAGTTTCTGTTGTACTTTCTGTTATAATGTTTAGTTGGAATCACGGCAGACAGAAAAAAATTGAGTATGAAATGACCAACAAGATGAGTTTGGGCAGTTTGGGTGCCCTTCTCTCTGACTAGGAAATTCAGCGGG
TGCCAGGACTGTGTTTCTTCTATAGCAGTATCATCCATGGTGTCCCTCCTATTGTTGGTCATTATGTAAAAAACATACGCTCCTTGCATGAGGTAATTGTATTAACAACTATAAGGTATCTCCCTGTTAAAACTGTATTACCAGATGAAAGGTTTCTTGTAAAAGGGCTGGGATATAAAGGAGTTTACAGATGTGTTGCT
CAGTATGGATACAACGATTCCTTGAATACTGAGGATGATGAATTTATGAACCAAGTTACTGATAGTCTGAACATGTATATCAAGTTTAGAGCATGTGAGGAAACAGATAAGTCTATTGATCTCTCAAAGTTGCCCTCAGAAGAATTCATGCCATCCTTTCCATCTGTTGAAGAGAATATAAGTGAGCTGTCAAATGCAAA
AGAAGCAGGGGTAGTTCATGTTCTAGGAAAAACAAGGTTCAAGATGAGAAAAAACATTAGTTGGGTTGACATGATTTTATTGGGAAGTATATATCAATTTTTACACTCAAACTGCAGGTCTTCAATGGCCGTTTTGGAGATACCACCATCAAGATCTGTTGAGATTGGCATGGTTTATGAAATTTGAAAAAGGAAAACAC
ATGTTACAGTGAATGCCAGATATCTGTTTAACTTTGATTGATTGGTTGTTTGAAGGAGCACAACATGTGCCTCCCAAGGAAAGTTTTATAGAACAAGGCTAAGGAAGGGAAGCCATAACATTGTTAGGTTGACTTCTTTCATCAATATGGGTGCTTCTAGTTTACAATTCAAAGAGGTTAAATATTTATACCACTATACC
ACTCCAGAATACCAAGTTATCAGCAGGGTTATGCTGACAAGACTTCTCTCCACCCTTGCCTTAAGCATTTCCATAAGTATGTTTCGTTTACTAGCTGCTGGTCATAGAGAACTGTATATGATACTTTCAGAACATCAAAGTACTGTGTAACTACCTATAAGTACGACACCGTTGTAAAGGTGTATTGGATTGCTTCAGCC
TTCTCGTAATAAAATATCTTCAATTTTGTATTGTAAAAAGGAATCTTCTACAAGAGCCTCTTAGTAGAGAGGCATCTCATGCACTTTATACCCATCTTGGGGAACACGACTGAATAAATTTCATCAGCATGTAGGTAGAGTGCGCG
Intron 5 GTATGGCTCA ... TGTGCTACAG
| Sample | Retention score (%) | Exon junction reads | 5'ss reads | 3'ss reads |
| A1 | 14.29 | 6 | 1 | 1 |
| A2 | 7.69 | 12 | 1 | 1 |
| A3 | 33.33 | 4 | 1 | 3 |
| A4 | 0 | 5 | 0 | 0 |
| A5 | -1 | 0 | 0 | 0 |
| A6 | 0 | 3 | 0 | 0 |
| A7 | 25 | 3 | 1 | 1 |
| A8 | 27.27 | 4 | 1 | 2 |
| A9 | 37.5 | 5 | 3 | 3 |
| A10 | 14.29 | 9 | 0 | 3 |
>TRINITY_DN36019_c0_g1_i5 from sample A9 / Example spliced isoformCTCCTGCTATATCGGTGCTCTCAGCAATGGATGGGATAAGAAATGCTGATCCTCGTATAAGTCAAAATTTGGTACTTCACGAGTAAGCTTCCTCTTTTCTCCAATCATGCTGGCCTGGGTATTATCAACTTCATTGATAGGAGTTTACAGCATCATTATTCACTATCCAGGTGTTTTCAAGGCATTTTCCCCATACTACA
TTTTTCGATTCTTTATAAGAAATGGAAAACAAGGCTGGTTGATGCTTGGTGGCGTTGTTTTATGCATAACAGGTGCAGAAGCTATGTTTGCAGATCTTGGACATTTTAACAGGATCTCTATTCAGGTGGCCTTCTTATTTGCTGTTTATCCTTCCCTGATTGTCACGTATGCTGGACAAACAGCATATCTTATCAAGAAT
CCTTCTGATCATGCTGATGGATTTTACAAATTCATACCGAATGCTGTGTACTGGCCCATGTTTATAATTTCTACACTTGCAGCTATTGTCGCAAGTCAATCATTAATATCAGCATCATTTTCTGTGATCAAGCAATCTGTGGCTTTGGATTACTTTCCCCGTGTCAAGCTGGTTCACACATCACAATATAAAGAAGGCCA
AATTTACTGTCCTGAAATCAACTACATTCTCATGTTTCTTTGTCTGGTGGTAATTCTTGGTTTTCGGAGCGAAAATAAAATCGGCAACGCTTTTGGCGTTGTGGTGATTATGGTGATGCTGATTACAACTGTCTTATTGACACTGGTTATGATCATTGTTTGGAAAGCTCCTTTACCAGTTGTGCTCGTGTTCTTCACTT
GGTTTTTTATCATGGAAGGGATATATGTTTCTACTGTGCTCACTAAAGTTCCACGGGGAGGCTGGCTTCCCTTTTCAGTTTCTGTTGTACTTTCTGTTATAATGTTTAGTTGGAATCACGGCAGACAGAAAAAAATTGAGTATGAAATGACCAACAAGATGAGTTTGGGCAGTTTGGGTGCCCTTCTCTCTGACTAGGAA
ATTCAGCGGGTGCCAGGACTGTGTTTCTTCTATAGCAGTATCATCCATGGTGTCCCTCCTATTGTTGGTCATTATGTAAAAAACATACGCTCCTTGCATGAGGTAATTGTATTAACAACTATAAGGTATCTCCCTGTTAAAACTGTATTACCAGATGAAAGGTTTCTTGTAAAAGGGCTGGGATATAAAGGAGTTTACAG
ATGTGTTGCTCAGTATGGATACAACGATTCCTTGAATACTGAGGATGATGAATTTATGAACCAAGTTACTGATAGTCTGAACATGTATATCAAGTTTAGAGCATGTGAGGAAACAGATAAGTCTATTGATCTCTCAAAGTTGCCCTCAGAAGAATTCATGCCATCCTTTCCATCTGTTGAAGAGAATATAAGTGAGCTGT
CAAATGCAAAAGAAGCAGGGGTAGTTCATGTTCTAGGAAAAACAAGGTTCAAGATGAGAAAAAACATTAGTTGGGTTGACATGATTTTATTGGGAAGTATATATCAATTTTTACACTCAAACTGCAGGTCTTCAATGGCCGTTTTGGAGATACCACCATCAAGATCTGTTGAGATTGGCATGGTTTATGAAATTTGAAAA
AGGAAAACACATGTTACAGTGAATGCCAGATATCTGTTTAACTTTGATTGATTGGTTGTTTGAAGGAGCACAACATGTGCCTCCCAAGGAAAGTTTTATAGAACAAGGCTAAGGAAGGGAAGCCATAACATTGTTAGGTTGACTTCTTTCATCAATATGGGTGCTTCTAGTTTACAATTCAAAGAGGTTAAATATTTATA
CCACTATACCACTCCAGAATACCAAGTTATCAGCAGGGTTATGCTGACAAGACTTCTCTCCACCCTTGCCTTAAGCATTTCCATAAGTATGTTTCGTTTACTAGCTGCTGGTCATAGAGAACTGTATATGATACTTTCAGAACATCAAAGTACTGTGTAACTACCTATAAGTACGACACCGTTGTAAAGGTGTATTGGAT
TGCTTCAGCCTTCTCGTAATAAAATATCTTCAATTTTGTATTGTAAAAAGGAATCTTCTACAAGAGCCTCTTAGTAGAGAGGCATCTCATGCACTTTATACCCATCTTGGGGAACACGACTGAATAAATTTCATCAGCATGTAGGTAGAGTGCGCTAATTTATGCAGAAATTCGTCAATTTTACTGGACAATATTCTTTC
CAAAATTGTGTAGAAAGGTAAAAAAACAAATTCAATGTCTGTACAGAATAGCTTAGCAGAATTCAAA
>TRINITY_DN36019_c0_g1_i1 from sample A9 / Example unspliced isoform:CTCCTGCTATATCGGTGCTCTCAGCAATGGATGGGATAAGAAATGCTGATCCTCGTATAAGTCAAAATTTGGTACTTCACGAGTAAGCTTCCTCTTTTCTCCAATCATGCTGGCCTGGGTATTATCAACTTCATTGATAGGAGTTTACAGCATCATTATTCACTATCCAGGTGTTTTCAAGGCATTTTCCCCATACTACA
TTTTTCGATTCTTTATAAGAAATGGAAAACAAGGCTGGTTGATGCTTGGTGGCGTTGTTTTATGCATAACAGGTGCAGAAGCTATGTTTGCAGATCTTGGACATTTTAACAGGATCTCTATTCAGGTGGCCTTCTTATTTGCTGTTTATCCTTCCCTGATTGTCACGTATGCTGGACAAACAGCATATCTTATCAAGAAT
CCTTCTGATCATGCTGATGGATTTTACAAATTCATACCGAATGCTGTGTACTGGCCCATGTTTATAATTTCTACACTTGCAGCTATTGTCGCAAGTCAATCATTAATATCAGCATCATTTTCTGTGATCAAGCAATCTGTGGCTTTGGATTACTTTCCCCGTGTCAAGCTGGTTCACACATCACAATATAAAGAAGGCCA
AATTTACTGTCCTGAAATCAACTACATTCTCATGTTTCTTTGTCTGGTGGTAATTCTTGGTTTTCGGAGCGAAAATAAAATCGGCAACGCTTTTGgtatggctcacttctcttatctattctgtctgttcagagtgggtagaaggatttatgaaaacaataaactttctgcttgactgcaactaattcttgtgctacagG
CGTTGTGGTGATTATGGTGATGCTGATTACAACTGTCTTATTGACACTGGTTATGATCATTGTTTGGAAAGCTCCTTTACCAGTTGTGCTCGTGTTCTTCACTTGGTTTTTTATCATGGAAGGGATATATGTTTCTACTGTGCTCACTAAAGTTCCACGGGGAGGCTGGCTTCCCTTTTCAGTTTCTGTTGTACTTTCTG
TTATAATGTTTAGTTGGAATCACGGCAGACAGAAAAAAATTGAGTATGAAATGACCAACAAGATGAGTTTGGGCAGTTTGGGTGCCCTTCTCTCTGACTAGGAAATTCAGCGGGTGCCAGGACTGTGTTTCTTCTATAGCAGTATCATCCATGGTGTCCCTCCTATTGTTGGTCATTATGTAAAAAACATACGCTCCTTG
CATGAGGTAATTGTATTAACAACTATAAGGTATCTCCCTGTTAAAACTGTATTACCAGATGAAAGGTTTCTTGTAAAAGGGCTGGGATATAAAGGAGTTTACAGATGTGTTGCTCAGTATGGATACAACGATTCCTTGAATACTGAGGATGATGAATTTATGAACCAAGTTACTGATAGTCTGAACATGTATATCAAGTT
TAGAGCATGTGAGGAAACAGATAAGTCTATTGATCTCTCAAAGTTGCCCTCAGAAGAATTCATGCCATCCTTTCCATCTGTTGAAGAGAATATAAGTGAGCTGTCAAATGCAAAAGAAGCAGGGGTAGTTCATGTTCTAGGAAAAACAAGGTTCAAGATGAGAAAAAACATTAGTTGGGTTGACATGATTTTATTGGGAA
GTATATATCAATTTTTACACTCAAACTGCAGGTCTTCAATGGCCGTTTTGGAGATACCACCATCAAGATCTGTTGAGATTGGCATGGTTTATGAAATTTGAAAAAGGAAAACACATGTTACAGTGAATGCCAGATATCTGTTTAACTTTGATTGATTGGTTGTTTGAAGGAGCACAACATGTGCCTCCCAAGGAAAGTTT
TATAGAACAAGGCTAAGGAAGGGAAGCCATAACATTGTTAGGTTGACTTCTTTCATCAATATGGGTGCTTCTAGTTTACAATTCAAAGAGGTTAAATATTTATACCACTATACCACTCCAGAATACCAAGTTATCAGCAGGGTTATGCTGACAAGACTTCTCTCCACCCTTGCCTTAAGCATTTCCATAAGTATGTTTCG
TTTACTAGCTGCTGGTCATAGAGAACTGTATATGATACTTTCAGAACATCAAAGTACTGTGTAACTACCTATAAGTACGACACCGTTGTAAAGGTGTATTGGATTGCTTCAGCCTTCTCGTAATAAAATATCTTCAATTTTGTATTGTAAAAAGGAATCTTCTACAAGAGCCTCTTAGTAGAGAGGCATCTCATGCACTT
TATACCCATCTTGGGGAACACGACTGAATAAATTTCATCAGCATGTAGGTAGAGTGCGCTAATTTATGCAGAAATTCGTCAATTTTACTGGACAATATTCTTTCCAAAATTGTGTAGAAAGGTAAAAAAACAAATTCAATGTCTGTACAGAATAGCTTAGCAGAATTCAAA