NA ----> NA

Intron 1 GTATGCCATG ... AGCAGGATAG

Sample	Retention score (%)	Exon junction reads	5'ss reads	3'ss reads
A1	56.25	7	9	3.3
A2	27.27	8	3	2.7
A3	0	2	0	0.3
A4	38.89	11	7	0
A5	25	6	2	0
A6	43.9	23	18	2.7
A7	30.43	16	7	2.7
A8	26.81	20	7.3	1.3
A9	35	13	7	0.7
A10	40	3	2	0.3

>TRINITY_DN72073_c0_g1_i2 from sample A2 / Example spliced isoform

GCGGGTTCGCAGGGGATGCTCTTCCTGTAGCGCGAGCCATGGCTTCTGTTGTCGACTGTTTAATATCACATCCCAATGTTCTGAATGCTGCAATGCTTTACTGGCCAATGCCAAATACACTGTATGTAGAAGGTTATGCCCTTGATAGGTTTGCTGAAGGATTATGGGGACTTCAACCTGTACATCAGAACAAGGTTGGA
CTAGTTCTGGATGCTGGAATTGAAGAGGATTTGCGGGTACGGCATCTGCAAGTGGCTGATGCTGCTCAAGCATCTTTAGGTCTACCTGTAGTGGAATGTATAACAACAGACGTTCCTTTGCAGGTTGAAAAATGGGTTGATGCACAAACTGGGCAGTCAACAGGACGGCTTGGATATCCTGATTCCTTGCTGAGGGCAGT
GGATACTCTGGTCAATCGTGCAAATGTGAATGCCATTGCAGTTGTTGGCCGGTTTCCAGATGATAGCTTGGATGAACTGGAGGATTACCGACAAGGGAAGGGAGTTGATGTCTTGGCAGGGGTAGAAGCTATAATAAGCCATCTTATTGTCCAGGAGTTCCACATTCCTTGTGCACATGCTCCTGCATTGTTGCCTCTCC
CTTTAGATCCATTAGTTTCTCCTAGGTCTGCTGCAGAAGAGATTGGATATACCTTCTTGCCTTGTGTACTTTCTGGTCTAAGTAGGGCACCCCAATATGTGGTCCAAAAAGAGGAATCTCCTCATAAGGTCTCGAGGCATAGCTGTATATGGGCCAGTGATGTCGACAGTGTTGTTGTTCCAATTGATGCTTGTGGTGGG
GCTGGAACTCTTGCCTTTGGCAAAAAAGCAGGCTCTATGCCACTAGTGATTGCAGTTGAGGAGAATGAAACAGTTCTCAATGACACTCCTGAAAAGCTAGAACTTAATGTGGTGAGAGTTGCAAACTATTGGGAAGCATTGGGTGTCATTGCTGCCCATAAGTCAGGAATAGATCCTCAATCTCTTCGCAGAGATGGAGT
GAAACACATCAAATGCTCACCCTCTTTATCAAGGAGGGATAGTTTTCCAAATTACAGATTACAGAATTATCCTGC

>TRINITY_DN72073_c0_g1_i1 from sample A2 / Example unspliced isoform:

TTGTACTATCTATTATATGTTAGATATATCGGCTAAAAGATGTGAATAAAATTATATGTGTTTTGCAGGTTGAAAAATGGGTTGATGCACAAACTGGGCAGTCAACAGGACGGCTTGGATATCCTGATTCCTTGCTGAGGGCAGTGGATACTCTGGTCAATCGTGCAAATGTGAATGCCATTGCAGTTGTTGGCCGGTTT
CCAGATGATAGCTTGGATGAACTGGAGGATTACCGACAAGGGAAGGGAGTTGATGTCTTGGCAGGGGTAGAAGCTATAATAAGCCATCTTATTGTCCAGGAGTTCCACATTCCTTGTGCACATGCTCCTGCATTGTTGCCTCTCCCTTTAGATCCATTAGTTTCTCCTAGGTCTGCTGCAGAAGAGATTGGATATACCTT
CTTGCCTTGTGTACTTTCTGGTCTAAGTAGGGCACCCCAATATGTGGTCCAAAAAGAGGAATCTCCTCATAAGGTCTCGAGGCATAGCTGTATATGGGCCAGTGATGTCGACAGTGTTGTTGTTCCAATTGATGCTTGTGGTGGGGCTGGAACTCTTGCCTTTGGCAAAAAAGCAGGCTCTATGCCACTAGTGATTGCAG
TTGAGGAGAATGAAACAGTTCTCAATGACACTCCTGAAAAGCTAGAACTTAATGTGgtatgccatgtcatactgttgatctctaactgaaattgagagatttagcaggatagGTGAGAGTTGCAA