NA ----> NA
Intron 1 GTATCAAAAT ... AGACAACAAG
| Sample | Retention score (%) | Exon junction reads | 5'ss reads | 3'ss reads |
| A1 | 48.65 | 38 | 43 | 29 |
| A2 | 36.36 | 21 | 21 | 3 |
| A3 | 44.44 | 40 | 41 | 23 |
| A4 | 35.59 | 38 | 35 | 7 |
| A5 | 41.46 | 12 | 13 | 4 |
| A6 | 40.45 | 53 | 56 | 16 |
| A7 | 41.86 | 75 | 82 | 26 |
| A8 | 41.35 | 117 | 121 | 44 |
| A9 | 38.6 | 66 | 66 | 17 |
| A10 | 35.94 | 41 | 39 | 7 |
>TRINITY_DN131580_c1_g1_i1 from sample A1 / Example spliced isoformCAGGTTAAACATTAGAAGAGCAGATTCAGCCATAACTATGATCAGATCATTATTTGGTACAGCTAACCTGTTATGAATAGTTTCTTACTTGGTTCATGGAATTCATCTCAATAGCCCAATTCAGTTTTAATTTCTCTTTTACGAGACAACAAGGTATCAAAATCATGAACAAAGATGACATTTTTCATTATCTTGTTTTT
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GGTGGGAGCACCGTGGTGGGTGGGAGTACCCATTTTGCATTAATGCTCAGTGATGCTAAGAGACTGAG
>TRINITY_DN131580_c1_g1_i4 from sample A1 / Example unspliced isoform:CAGGTTAAACATTAGAAGAGCAGATTCAGCCATAACTATGATCAGATCATTATTTGGTACAGCTAACCTGTTATGAATAGTTTCTTACTTGGTTCATGGAATTCATCTCAATAGCCCAATTCAGTTTTAATTTCTCTTTTACGAGACAACAAGgtatcaaaatcatgaacaaagatgacatttttcattatcttgttttt
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