sp|Q8L611|SC31B_ARATH ----> Protein transport protein SEC31 homolog B

Intron 1 GTCTGGGCAG ... TTCTTCTCAG

Sample	Retention score (%)	Exon junction reads	5'ss reads	3'ss reads
A1	14.75	185	0	32
A2	21.09	116	1	31
A3	20.64	173	0	45
A4	22.03	184	1	52
A5	24.71	64	1	21
A6	19.23	42	0	10
A7	22.14	109	0	31
A8	24.39	31	0	10
A9	19.66	94	0	23
A10	24.71	131	0	43

>TRINITY_DN121802_c0_g1_i3 from sample A2 / Example spliced isoform

TTGAAAGACAAGTAAAAAGCTAAGGCAAGAATGTTGCGAAACAAATATATATCATTTTTCTTTTTCTATCCTTCTTATCTGTCATTTTTCACTCAAATCACCAGAGAAACCCTTGCAGATCTGCTCTGTTCTGCAGCATAAACCTCTGGCAAATCCATGACTTGAATTCCCTGAATTTTTTTTTGGCTATTCAGATTCGA
ACCGCTATCTCCACAGTCTGATTCGGTGGCGATCGGGGGGAATTAGGGCAGAAGAAGGCTAGATCCTGCAAAAATGGCTGCCATAAAATCCACGTCTCGATCCGCGTCGGTGGCGTTTGCTCCTGATGCGCCCCTGTTGGCAGCGGGTACGATGGCCGGAGCCATCGACTTGTCATTCAGTTCTTTAGCCAACTTAGAGA
TCTTCAAGTTGGATTTCCAGTCCGACGATCCGGAACTCCCCGTCGTTGGAGAATGCCCGAGCAGCGAGCGGTTGAACCGGCTTTCGTGGGGGAGCGCCGGCGGTTCGTTCGGAATAATTGCCGGAGGACTGATTGATGGAAGCATCAACATCTGGAATCCAGCTGCTCTTATCAATTCGGAGGACAATGGGGATGCTCTT
ATGGCACGGCTTCAAAAACACACAGGACCCGTTCGTGGTCTGGAGTTCAATACAATTTCTACAAATTTGTTGGCCTCTGGAGCTGAGGATGGTGAGCTTTGTATCTGGGATCTTGCAAATCCTGCAGAACCTACTCATTTTCCACCATTGAAGGGTGTAGTATCAGGTGCTCAAGGGGAAGTTTCATTTTTATCTTGGAA
TCGAAAGGTTCAGCATATACTGGCATCCACTTCATATAGTGGAACAACAGTGGTTTGGGATTTAAGGCGCCAGAAACCTATCATTAGCTTTCCAGACGCAACTCGAAGACGATGCTCTGTTTTACAATGGAACCCTGATGCTTCAACACAGCTTATTGTAGCCTCCGATGATGACAACTCACCCACTTTACGGGTATGGG
ATTTGCGAAACACAATTTCTCCATTTAAGGAATTTGTAGGGCATAGCAGAGGAGTCATAGCTATGTCATGGTGCCCAAGTGATAGTTTATTCTTGCTAACTTGTGCAAAGGACAATCGCACTCTCTGCTGGGACACTGTATCTGGGGAGATAGTGTGTGAATTACCGGCCGGGGCAAATTGGAATTTTGATGTTCAATGG
TCACCAAAGATACCTGGAGTTTTATCAACATCTTCTTTTGATGGGAAAATTGGCATTTACAATATTGAGGCCTGCAGTCGAAATGTTTCTGGTGAGGCTGTGTTTGGTGGTGCTATGGCAAGTGGGGGGTCCTCAGCTCTTTTGAAGGCTCCCAAGTGGTTGGAGAGACCTGCTGGTGTGAGTTTTGGCTTTGGAGGAAA
GCTTGCTTCATTTCGTCCCAGTACAGTGGCTCAAGCTGGTGATTTTAGACGTTCTGAGGTCTTTATTCACAATCTAGTTACTGAGGACAATCTGGTTATTCGATCAAATGAATTTGAAGCTGCAATAGCAGATGGTGATAAAGCATCATTGCGGGCTTTGTGTGATAGAAAAGCCCAAGAGTCTCAGTCTGACGAAGAGA
AAGAAACATGGAACTTCCTAAGAGTCATGTTTGAAGATGAAGGCACTGCTAGAACAAAGTTACTTGATCACCTTGGATTTAAAGTGCAGCCAGAAGAGAATGCAGATATACAGGAAACTCACTCCAGCAAATTTGATGATATTGGTAGTGAAATAGCCAACACTCTTACTCTTGATGATAAATCTGAAGAAGATGTATTG
CCTCAGTTGAAAGATGGACAAGATGTTGCTTTCCCCCAAGACAATGGAGAGGATTTCTTTGACAATTTGCAGAGTCCTAAAGAAGAGCCCTCTCTTTCTCATGTGGAAAACGATTTTGTTGTAGAAAAGGATAAGGATATGGTAGTAAATAGTGCAGAGATTGAACATGAAACTGAAGACTTGACTGAGTATTCAGAGTG
GGATGAAGATATTCAACATTCCTTAGTAGTCGGCGATTATAAGGGAGCTGTTCTGCAATGCCTGTCAGCAAACAGGATGGCTGATGCTCTTATTATTTCTCACCTGGGTGGGAGTTCTTTGTGGGAGAAAACTCGTGATGAATATTTGAAAAAAGCTGACTCGTCCTATCTCAAGGTGGTTTCTGCCATGGTCAATAATG
ATCTTACAGGCCTTGTCAACAGCAGGCCATTGAAATCTTGGAAAGAAACTCTTGCTATGCTTTGCACGTATTCACAGAGGGAGGAATGGACTGTTTTATGTGATATGCTTGCTTCTAGATTGATTTCAGCTGGCAATGTGATGGCAGCAACACTTTGCTACATATGTGCGGGGAATATTGAAAAGACAGTAGAAATATGG
TCTCGATGTCTTAAGTATGATTATGATGGGATGAGCTTTGTTGATCATTTGCAGGACTTGATGGAAAAGACTGTTGTTCTTGCTTTAGCAACTGGACAAAAGCGGGTTAGTCCCTCACTGTCAAAGTTGGTTGAGAATTATGCAGAATTGCTAGCCAGTCAAGGGCTTTTAACCACAGCTCTGGAGTATCTAAAGCTCTT
GGGCACTGAAGAATCTTCTCATGAGCTGTCTATTTTACGAGATAGAATATACCTATCCGGGACAGATAATAAGGTGGAGGCTTCACCTTTTCCTTTTGAAACTAGACAGGATCTGACAGAATCTCAGTACAATACACATCAAACTGGTTTTGGAGCACTTGAAACTCAAAAAAATTATCAGGAGAACCTACATCAAGGTT
TACCTAGTGGGTCATACAATGACAATTATCAGCCGACTGGTAATACTCATTACACAGCAGGCTACCAACCAGCACCACAACAACAACCTTCCTTCCCAAACTATTTTACTCCTGCACCGTACCCGCCAGCACCATCTCCAAATGTTTTCTATCCATCACCAGTTTCTCAAGCTCAGCAGACTAATTTTGCTCCACCTGTG
AATCAGCCAGCAACGAAAACATTTGTTCCATCTACACCACCAGTCTTGAGAAATGTAGATCAGTATCAGCCGCCTTCTTTGAACCCTCAACTCTATCAGGGAGTTTCTCCAGCTACAGTTGAAACACATCCCTACCAAACAGGAGCACCTGCATCTGTTTCACTTGGGACAACCCCAGCACAGCCATCTGTTGTTCCTAA
TTTCATGGTCCCGGGACCTGTGACTGCACCTGCAGTTGCTCCTCGAGGGTTCATGCCAGTCACAACCCCAGCTCAACACCAGCTAGGTAGTGTGAATCCTTCAGTTCAACCCCAAAGCCCTCGGGCGAGTCAGGTGCAATCTGTGCCAGCTCCAACCACACCACCACCAACAATACAAAATGTTGATACATCAAATGTGG
CAGCTGAAATTAGACCTGTAATTGGGACGTTAACAAGGCTTTACAATGAAACATCTGAAGCTCTTGGAGGGACAAAGGCAAATCCATCTAAACGGCGTGAAATAGATGATAATTCCAGAAAAATTGGGTCTCTGTTTGCAAAATTGAACTCTGGTGATATATCTCCCAATGCTGCATCTAAACTGGTGCATCTCTGCCAA
GCTCTGGACTCTAGGGACTATGCAACCGCTCTTCAAATACAGGTGGGACTGACAACGAGTGACTGGGATGAATGCAGTTTCTGGCTTGCTGCTCTTAAGCGAATGATCAAAGTAAGACAGAATATGGGATAAATTTTCTGATGGTTCTGCAGTTGGATTTAATCCAAGTGCCATTTTTACATGAGATGTGATTAGTGATT
GTGTTCAGTATTCTGTTTTTCATTGGATTTGACATTGGAGTTTCAAGGCATTCCAAGGATAGCATGTACACAAGTTGATTTTTTGCTTGCAAGTTATTGCAATTTTTGTATCTTTGGGGACATTGTACATGTCAATTTCACTGCATTTCTCTAACTCAGTATTCCTATCAAATTTAGTTTTAGCAAGCTCTCCGGGTTGA
ATCAACTAGAGGGGAATCTTCTGCAAAAGGGAGGTGCCAGAGGGATTTTGCTTTAGAAGTTGATTGTATGGAGATCATAGTGTTTTGGTTTCAATTTTTTCTTCAATCATATTCAAGTCGGAGTTTTGTAAATTTTTTTGTGAATGTTATTTTGGAGTAGTGAATTCTAATTCTGAAGTAGTCATAGCTCTAATTGTACA
GTCGATTTGTAGGTTGATTTTTGTTTTTAGGGTTCGGTGCTTTCTATCCATGTGATGCTGTGTATAATACACATTGCAGAAGATATTCTTAATTTTGGTATTTTCATTATGCATTGTAGTTCTGTCCCCCAGCAAGCAGGCCAGGCATATATATAGGTTTTTCTATTGCAATGGGGACCTACAGAAATATTGGAGAGTTG
ACTGTAATTTGTGCAACTAACCACCG

>TRINITY_DN121802_c0_g1_i4 from sample A2 / Example unspliced isoform:

GACAACTCACCCACTTTACGGgtctgggcagcttttgttgattaatttgcattattttctggttggtccaagtgaaattaagtttgtaatatataactttctttttcatttcttctcagGTATGGGATTTGCGAAACACAATTTCTCCATTTAAGGAATTTGTAGGGCATAGCAGAGGAGTCATAGCTATGTCATGGTGC
CCAAGTGATAGTTTATTCTTGCTAACTTGTGCAAAGGACAATCGCACTCTCTGCTGGGACACTGTATCTGGGGAGATAGTGTGTGAATTACCGGCCGGGGCAAATTGGAATTTTGATGTTCAATGGTCACCAAAGATACCTGGAGTTTTATCAACATCTTCTTTTGATGGGAAAATTGGCATTTACAATATTGAGGCCTG
CAGTCGAAATGTTTCTGGTGAGGCTGTGTTTGGTGGTGCTATGGCAAGTGGGGGGTCCTCAGCTCTTTTGAAGGCTCCCAAGTGGTTGGAGAGACCTGCTGGTGTGAGTTTTGGCTTTGGAGGAAAGCTTGCTTCATTTCGTCCCAGTACAGTGGCTCAAGCTGGTGATTTTAGACGTTCTGAGGTCTTTATTCACAATC
TAGTTACTGAGGACAATCTGGTTATTCGATCAAATGAATTTGAAGCTGCAATAGCAGATGGTGATAAAGCATCATTGCGGGCTTTGTGTGATAGAAAAGCCCAAGAGTCTCAGTCTGACGAAGAGAAAGAAACATGGAACTTCCTAAGAGTCATGTTTGAAGATGAAGGCACTGCTAGAACAAAGTTACTTGATCACCTT
GGATTTAAAGTGCAGCCAGAAGAGAATGCAGATATACAGGAAACTCACTCCAGCAAATTTGATGATATTGGTAGTGAAATAGCCAACACTCTTACTCTTGATGATAAATCTGAAGAAGATGTATTGCCTCAGTTGAAAGATGGACAAGATGTTGCTTTCCCCCAAGACAATGGAGAGGATTTCTTTGACAATTTGCAGAG
TCCTAAAGAAGAGCCCTCTCTTTCTCATGTGGAAAACGATTTTGTTGTAGAAAAGGATAAGGATATGGTAGTAAATAGTGCAGAGATTGAACATGAAACTGAAGACTTGACTGAGTATTCAGAGTGGGATGAAGATATTCAACATTCCTTAGTAGTCGGCGATTATAAGGGAGCTGTTCTGCAATGCCTGTCAGCAAACA
GGATGGCTGATGCTCTTATTATTTCTCACCTGGGTGGGAGTTCTTTGTGGGAGAAAACTCGTGATGAATATTTGAAAAAAGCTGACTCGTCCTATCTCAAGGTGGTTTCTGCCATGGTCAATAATGATCTTACAGGCCTTGTCAACAGCAGGCCATTGAAATCTTGGAAAGAAACTCTTGCTATGCTTTGCACGTATTCA
CAGAGGGAGGAATGGACTGTTTTATGTGATATGCTTGCTTCTAGATTGATTTCAGCTGGCAATGTGATGGCAGCAACACTTTGCTACATATGTGCGGGGAATATTGAAAAGACAGTAGAAATATGGTCTCGATGTCTTAAGTATGATTATGATGGGATGAGCTTTGTTGATCATTTGCAGGACTTGATGGAAAAGACTGT
TGTTCTTGCTTTAGCAACTGGACAAAAGCGGGTTAGTCCCTCACTGTCAAAGTTGGTTGAGAATTATGCAGAATTGCTAGCCAGTCAAGGGCTTTTAACCACAGCTCTGGAGTATCTAAAGCTCTTGGGCACTGAAGAATCTTCTCATGAGCTGTCTATTTTACGAGATAGAATATACCTATCCGGGACAGATAATAAGG
TGGAGGCTTCACCTTTTCCTTTTGAAACTAGACAGGATCTGACAGAATCTCAGTACAATACACATCAAACTGGTTTTGGAGCACTTGAAACTCAAAAAAATTATCAGGAGAACCTACATCAAGGTTTACCTAGTGGGTCATACAATGACAATTATCAGCCGACTGGTAATACTCATTACACAGCAGGCTACCAACCAGCA
CCACAACAACAACCTTCCTTCCCAAACTATTTTACTCCTGCACCGTACCCGCCAGCACCATCTCCAAATGTTTTCTATCCATCACCAGTTTCTCAAGCTCAGCAGACTAATTTTGCTCCACCTGTGAATCAGCCAGCAACGAAAACATTTGTTCCATCTACACCACCAGTCTTGAGAAATGTAGATCAGTATCAGCCGCC
TTCTTTGAACCCTCAACTCTATCAGGGAGTTTCTCCAGCTACAGTTGAAACACATCCCTACCAAACAGGAGCACCTGCATCTGTTTCACTTGGGACAACCCCAGCACAGCCATCTGTTGTTCCTAATTTCATGGTCCCGGGACCTGTGACTGCACCTGCAGTTGCTCCTCGAGGGTTCATGCCAGTCACAACCCCAGCTC
AACACCAGCTAGGTAGTGTGAATCCTTCAGTTCAACCCCAAAGCCCTCGGGCGAGTCAGGTGCAATCTGTGCCAGCTCCAACCACACCACCACCAACAATACAAAATGTTGATACATCAAATGTGGCAGCTGAAATTAGACCTGTAATTGGGACGTTAACAAGGCTTTACAATGAAACATCTGAAGCTCTTGGAGGGACA
AAGGCAAATCCATCTAAACGGCGTGAAATAGATGATAATTCCAGAAAAATTGGGTCTCTGTTTGCAAAATTGAACTCTGGTGATATATCTCCCAATGCTGCATCTAAACTGGTGCATCTCTGCCAAGCTCTGGACTCTAGGGACTATGCAACCGCTCTTCAAATACAGGTGGGACTGACAACGAGTGACTGGGATGAATG
CAGTTTCTGGCTTGCTGCTCTTAAGCGAATGATCAAAGTAAGACAGAATATGGGATAAATTTTCTGATGGTTCTGCAGTTGGATTTAATCCAAGTGCCATTTTTACATGAGATGTGATTAGTGATTGTGTTCAGTATTCTGTTTTTCATTGGATTTGACATTGGAGTTTCAAGGCATTCCAAGGATAGCATGTACACAAG
TTGATTTTTTGCTTGCAAGTTATTGCAATTTTTGTATCTTTGGGGACATTGTACATGTCAATTTCACTGCATTTCTCTAACTCAGTATTCCTATCAAATTTAGTTTTAGCAAGCTCTCCGGGTTGAATCAACTAGAGGGGAATCTTCTGCAAAAGGGAGGTGCCAGAGGGATTTTGCTTTAGAAGTTGATTGTATGGAGA
TCATAGTGTTTTGGTTTCAATTTTTTCTTCAATCATATTCAAGTCGGAGTTTTGTAAATTTTTTTGTGAATGTTATTTTGGAGTAGTGAATTCTAATTCTGAAGTAGTCATAGCTCTAATTGTACAGTCGATTTGTAGGTTGATTTTTGTTTTTAGGGTTCGGTGCTTTCTATCCATGTGATGCTGTGTATAATACACAT
TGCAGAAGATATTCTTAATTTTGGTATTTTCATTATGCATTGTAGTTCTGTCCCCCAGCAAGCAGGCCAGGCATATATATAGGTTTTTCTATTGCAATGGGGACCTACAGAAATATTGGAGAGTTGACTGTAATTTGTGCAACTAACCACCG

Intron 2 GTAATGCACT ... CTGGTAACAG

Sample	Retention score (%)	Exon junction reads	5'ss reads	3'ss reads
A1	14.29	288	0	48
A2	15.38	209	3	38
A3	16.23	253	0	49
A4	17.68	256	0	55
A5	14.96	108	2	19
A6	16.09	73	0	14
A7	9.13	189	0	19
A8	12.82	34	0	5
A9	12.22	158	0	22
A10	13.08	199.3	0	30

>TRINITY_DN110389_c0_g2_i2 from sample A5 / Example spliced isoform

GCTAGCTATCTGAAAGTTCCTGCAGTCAATTCCATTATATGTGATGTCTTGGCAGTTGAGAATTTTTGTGTACAGTTTAAATGTTATATTTATAATGTTGAATTTTTAATGATCATTTTTATCTTCAAGGTTCTCTTTAAAACCTGGATAGTATGTTTTTTACTCTTGATTGATAATAGTGTTTTCCTTGCAGTTCGGAG
GACAATGGGGATGCTCTTATGGCACGGCTTCAAAAACACACAGGACCCGTGGGTCTTTTTATTTCCTCATTTATTCGTAGTTGGGGATGTAGGTTTTTTATTAATTTTATTTGCGAACAGTGCAATAGTTTTCTCAACTTCTTGTTTACAGGTTCGTGGTCTGGAGTTCAATACAATTTCTACAAATTTGTTGGCCTCTG
GAGCTGAGGATGGTGAGCTTTGTATCTGGGATCTTGCAAATCCTGCAGAACCTACTCATTTTCCACCATTGAAGGGTGTAGTATCAGGTGCTCAAGGGGAAGTTTCATTTTTATCTTGGAATCGAAAGGTTCAGCATATACTGGCATCCACTTCATATAGTGGAACAACAGTGGTTTGGGATTTAAGGCGCCAGAAACCT
ATCATTAGCTTTCCAGACGCAACTCGAAGACGATGCTCTGTTTTACAATGGAACCCTGATGCTTCAACACAGCTTATTGTAGCCTCCGATGATGACAACTCACCCACTTTACGGGTATGGGATTTGCGAAACACAATTTCTCCATTTAAGGAATTTGTAGGGCATAGCAGAGGAGTCATAGCTATGTCATGGTGCCCAAG
TGATAGTTTGTTCTTGCTAACTTGTGCAAAGGACAATCGCACTCTCTGCTGGGACACTGTATCTGGGGAGATAGTGTGTGAATTACCGGCCGGGGCAAATTGGAATTTTGATGTTCAATGGTCACCAAAGATACCTGGAGTTTTATCAACATCTTCTTTTGATGGGAAAATTGGCATT

>TRINITY_DN110389_c0_g2_i4 from sample A5 / Example unspliced isoform:

AGGCGCCAGAAACCTATCATTAGgtaatgcacttgttaatcaggcgtaatctcaagtaaaagctttggcttgctgataatgtgcatataaggtttggttgatattttggtagcttcagttcttaattctgaggaactgacacttccatcctgtttctggtaacagCTTTCCAGACGCAACTCGAAGACGATGCTCTGTTT
TACAATGGAACCCTGATGCTTCAACACAGCTTATTGTAGCCTCCGATGATGACAACTCACCCACTTTACGGGTATGGGATTTGCGAAACACAATTTCTCCATTTAAGGAATTTGTAGGGCATAGCAGAGGAGTCATAGCTATGTCATGGTGCCCAAGTGATAGTTTGTTCTTGCTAACTTGTGCAAAGGACAATCGCACT
CTCTGCTGGGACACTGTATCTGGGGAGATAGTGTGTGAATTACCGGCCGGGGCAAATTGGAATTTTGATGTTCAATGGTCACCAAAGATACCTGGAGTTTTATCAACATCTTCTTTTGATGGGAAAATTGGCATTTACAATATTGAGGTAAGATAATCTAGTTTGTTAATGTTGATTTAGGGAATTTTTTCATGATGAGA
AAATGACTCATTTTTATATTTTATAAATTTTAAGCTACTCTTCAATATTCCAACTTGATTGTCCAGGTTGGTGTAATTATGGGCACAAGTCATTTTTCTTTTGGGTCAGGAC

Intron 3 GTGGGTCTTT ... TTGTTTACAG

Sample	Retention score (%)	Exon junction reads	5'ss reads	3'ss reads
A1	29.93	302	0	129
A2	23.17	189	4	57
A3	22.34	292	2	84
A4	22.76	224	0	66
A5	25.88	126	3	44
A6	17.53	58	0	12.3
A7	24.41	223	0	72
A8	23.08	50	0	15
A9	21.15	179	0	48
A10	21.79	201	0	56

>TRINITY_DN121802_c0_g1_i3 from sample A2 / Example spliced isoform

TTGAAAGACAAGTAAAAAGCTAAGGCAAGAATGTTGCGAAACAAATATATATCATTTTTCTTTTTCTATCCTTCTTATCTGTCATTTTTCACTCAAATCACCAGAGAAACCCTTGCAGATCTGCTCTGTTCTGCAGCATAAACCTCTGGCAAATCCATGACTTGAATTCCCTGAATTTTTTTTTGGCTATTCAGATTCGA
ACCGCTATCTCCACAGTCTGATTCGGTGGCGATCGGGGGGAATTAGGGCAGAAGAAGGCTAGATCCTGCAAAAATGGCTGCCATAAAATCCACGTCTCGATCCGCGTCGGTGGCGTTTGCTCCTGATGCGCCCCTGTTGGCAGCGGGTACGATGGCCGGAGCCATCGACTTGTCATTCAGTTCTTTAGCCAACTTAGAGA
TCTTCAAGTTGGATTTCCAGTCCGACGATCCGGAACTCCCCGTCGTTGGAGAATGCCCGAGCAGCGAGCGGTTGAACCGGCTTTCGTGGGGGAGCGCCGGCGGTTCGTTCGGAATAATTGCCGGAGGACTGATTGATGGAAGCATCAACATCTGGAATCCAGCTGCTCTTATCAATTCGGAGGACAATGGGGATGCTCTT
ATGGCACGGCTTCAAAAACACACAGGACCCGTTCGTGGTCTGGAGTTCAATACAATTTCTACAAATTTGTTGGCCTCTGGAGCTGAGGATGGTGAGCTTTGTATCTGGGATCTTGCAAATCCTGCAGAACCTACTCATTTTCCACCATTGAAGGGTGTAGTATCAGGTGCTCAAGGGGAAGTTTCATTTTTATCTTGGAA
TCGAAAGGTTCAGCATATACTGGCATCCACTTCATATAGTGGAACAACAGTGGTTTGGGATTTAAGGCGCCAGAAACCTATCATTAGCTTTCCAGACGCAACTCGAAGACGATGCTCTGTTTTACAATGGAACCCTGATGCTTCAACACAGCTTATTGTAGCCTCCGATGATGACAACTCACCCACTTTACGGGTATGGG
ATTTGCGAAACACAATTTCTCCATTTAAGGAATTTGTAGGGCATAGCAGAGGAGTCATAGCTATGTCATGGTGCCCAAGTGATAGTTTATTCTTGCTAACTTGTGCAAAGGACAATCGCACTCTCTGCTGGGACACTGTATCTGGGGAGATAGTGTGTGAATTACCGGCCGGGGCAAATTGGAATTTTGATGTTCAATGG
TCACCAAAGATACCTGGAGTTTTATCAACATCTTCTTTTGATGGGAAAATTGGCATTTACAATATTGAGGCCTGCAGTCGAAATGTTTCTGGTGAGGCTGTGTTTGGTGGTGCTATGGCAAGTGGGGGGTCCTCAGCTCTTTTGAAGGCTCCCAAGTGGTTGGAGAGACCTGCTGGTGTGAGTTTTGGCTTTGGAGGAAA
GCTTGCTTCATTTCGTCCCAGTACAGTGGCTCAAGCTGGTGATTTTAGACGTTCTGAGGTCTTTATTCACAATCTAGTTACTGAGGACAATCTGGTTATTCGATCAAATGAATTTGAAGCTGCAATAGCAGATGGTGATAAAGCATCATTGCGGGCTTTGTGTGATAGAAAAGCCCAAGAGTCTCAGTCTGACGAAGAGA
AAGAAACATGGAACTTCCTAAGAGTCATGTTTGAAGATGAAGGCACTGCTAGAACAAAGTTACTTGATCACCTTGGATTTAAAGTGCAGCCAGAAGAGAATGCAGATATACAGGAAACTCACTCCAGCAAATTTGATGATATTGGTAGTGAAATAGCCAACACTCTTACTCTTGATGATAAATCTGAAGAAGATGTATTG
CCTCAGTTGAAAGATGGACAAGATGTTGCTTTCCCCCAAGACAATGGAGAGGATTTCTTTGACAATTTGCAGAGTCCTAAAGAAGAGCCCTCTCTTTCTCATGTGGAAAACGATTTTGTTGTAGAAAAGGATAAGGATATGGTAGTAAATAGTGCAGAGATTGAACATGAAACTGAAGACTTGACTGAGTATTCAGAGTG
GGATGAAGATATTCAACATTCCTTAGTAGTCGGCGATTATAAGGGAGCTGTTCTGCAATGCCTGTCAGCAAACAGGATGGCTGATGCTCTTATTATTTCTCACCTGGGTGGGAGTTCTTTGTGGGAGAAAACTCGTGATGAATATTTGAAAAAAGCTGACTCGTCCTATCTCAAGGTGGTTTCTGCCATGGTCAATAATG
ATCTTACAGGCCTTGTCAACAGCAGGCCATTGAAATCTTGGAAAGAAACTCTTGCTATGCTTTGCACGTATTCACAGAGGGAGGAATGGACTGTTTTATGTGATATGCTTGCTTCTAGATTGATTTCAGCTGGCAATGTGATGGCAGCAACACTTTGCTACATATGTGCGGGGAATATTGAAAAGACAGTAGAAATATGG
TCTCGATGTCTTAAGTATGATTATGATGGGATGAGCTTTGTTGATCATTTGCAGGACTTGATGGAAAAGACTGTTGTTCTTGCTTTAGCAACTGGACAAAAGCGGGTTAGTCCCTCACTGTCAAAGTTGGTTGAGAATTATGCAGAATTGCTAGCCAGTCAAGGGCTTTTAACCACAGCTCTGGAGTATCTAAAGCTCTT
GGGCACTGAAGAATCTTCTCATGAGCTGTCTATTTTACGAGATAGAATATACCTATCCGGGACAGATAATAAGGTGGAGGCTTCACCTTTTCCTTTTGAAACTAGACAGGATCTGACAGAATCTCAGTACAATACACATCAAACTGGTTTTGGAGCACTTGAAACTCAAAAAAATTATCAGGAGAACCTACATCAAGGTT
TACCTAGTGGGTCATACAATGACAATTATCAGCCGACTGGTAATACTCATTACACAGCAGGCTACCAACCAGCACCACAACAACAACCTTCCTTCCCAAACTATTTTACTCCTGCACCGTACCCGCCAGCACCATCTCCAAATGTTTTCTATCCATCACCAGTTTCTCAAGCTCAGCAGACTAATTTTGCTCCACCTGTG
AATCAGCCAGCAACGAAAACATTTGTTCCATCTACACCACCAGTCTTGAGAAATGTAGATCAGTATCAGCCGCCTTCTTTGAACCCTCAACTCTATCAGGGAGTTTCTCCAGCTACAGTTGAAACACATCCCTACCAAACAGGAGCACCTGCATCTGTTTCACTTGGGACAACCCCAGCACAGCCATCTGTTGTTCCTAA
TTTCATGGTCCCGGGACCTGTGACTGCACCTGCAGTTGCTCCTCGAGGGTTCATGCCAGTCACAACCCCAGCTCAACACCAGCTAGGTAGTGTGAATCCTTCAGTTCAACCCCAAAGCCCTCGGGCGAGTCAGGTGCAATCTGTGCCAGCTCCAACCACACCACCACCAACAATACAAAATGTTGATACATCAAATGTGG
CAGCTGAAATTAGACCTGTAATTGGGACGTTAACAAGGCTTTACAATGAAACATCTGAAGCTCTTGGAGGGACAAAGGCAAATCCATCTAAACGGCGTGAAATAGATGATAATTCCAGAAAAATTGGGTCTCTGTTTGCAAAATTGAACTCTGGTGATATATCTCCCAATGCTGCATCTAAACTGGTGCATCTCTGCCAA
GCTCTGGACTCTAGGGACTATGCAACCGCTCTTCAAATACAGGTGGGACTGACAACGAGTGACTGGGATGAATGCAGTTTCTGGCTTGCTGCTCTTAAGCGAATGATCAAAGTAAGACAGAATATGGGATAAATTTTCTGATGGTTCTGCAGTTGGATTTAATCCAAGTGCCATTTTTACATGAGATGTGATTAGTGATT
GTGTTCAGTATTCTGTTTTTCATTGGATTTGACATTGGAGTTTCAAGGCATTCCAAGGATAGCATGTACACAAGTTGATTTTTTGCTTGCAAGTTATTGCAATTTTTGTATCTTTGGGGACATTGTACATGTCAATTTCACTGCATTTCTCTAACTCAGTATTCCTATCAAATTTAGTTTTAGCAAGCTCTCCGGGTTGA
ATCAACTAGAGGGGAATCTTCTGCAAAAGGGAGGTGCCAGAGGGATTTTGCTTTAGAAGTTGATTGTATGGAGATCATAGTGTTTTGGTTTCAATTTTTTCTTCAATCATATTCAAGTCGGAGTTTTGTAAATTTTTTTGTGAATGTTATTTTGGAGTAGTGAATTCTAATTCTGAAGTAGTCATAGCTCTAATTGTACA
GTCGATTTGTAGGTTGATTTTTGTTTTTAGGGTTCGGTGCTTTCTATCCATGTGATGCTGTGTATAATACACATTGCAGAAGATATTCTTAATTTTGGTATTTTCATTATGCATTGTAGTTCTGTCCCCCAGCAAGCAGGCCAGGCATATATATAGGTTTTTCTATTGCAATGGGGACCTACAGAAATATTGGAGAGTTG
ACTGTAATTTGTGCAACTAACCACCG

>TRINITY_DN121802_c0_g1_i2 from sample A2 / Example unspliced isoform:

TTTAAATGTTATATTTATAATGTTGAATTTTTAATGATCATTTTTATCTTCAAGGTTCTCTTTAAAACCTGGATAGTATGTTTTTTACTCTTGATTGATAATAGTGTTTTCCTTGCAGTTCGGAGGACAATGGGGATGCTCTTATGGCACGGCTTCAAAAACACACAGGACCCgtgggtctttttatttcctcatttatt
cgtagttggggatgtaggttttttattaattttatttgcgaacagtgcaatagttttctcaacttcttgtttacagGTTCGTGGTCTGGAGTTCAATACAATTTCTACAAATTTGTTGGCCTCTGGAGCTGAGGATGGTGAGCTTTGTATCTGGGATCTTGCAAATCCTGCAGAACCTACTCATTTTCCACCATTGAAGG
GTGTAGTATCAGGTGCTCAAGGGGAAGTTTCATTTTTATCTTGGAATCGAAAGGTTCAGCATATACTGGCATCCACTTCATATAGTGGAACAACAGTGGTTTGGGATTTAAGGCGCCAGAAACCTATCATTAGCTTTCCAGACGCAACTCGAAGACGATGCTCTGTTTTACAATGGAACCCTGATGCTTCAACACAGCTT
ATTGTAGCCTCCGATGATGACAACTCACCCACTTTACGGGTATGGGATTTGCGAAACACAATTTCTCCATTTAAGGAATTTGTAGGGCATAGCAGAGGAGTCATAGCTATGTCATGGTGCCCAAGTGATAGTTTATTCTTGCTAACTTGTGCAAAGGACAATCGCACTCTCTGCTGGGACACTGTATCTGGGGAGATAGT
GTGTGAATTACCGGCCGGGGCAAATTGGAATTTTGATGTTCAATGGTCACCAAAGATACCTGGAGTTTTATCAACATCTTCTTTTGATGGGAAAATTGGCATTTACAATATTGAGGCCTGCAGTCGAAATGTTTCTGGTGAGGCTGTGTTTGGTGGTGCTATGGCAAGTGGGGGGTCCTCAGCTCTTTTGAAGGCTCCCA
AGTGGTTGGAGAGACCTGCTGGTGTGAGTTTTGGCTTTGGAGGAAAGCTTGCTTCATTTCGTCCCAGTACAGTGGCTCAAGCTGGTGATTTTAGACGTTCTGAGGTCTTTATTCACAATCTAGTTACTGAGGACAATCTGGTTATTCGATCAAATGAATTTGAAGCTGCAATAGCAGATGGTGATAAAGCATCATTGCGG
GCTTTGTGTGATAGAAAAGCCCAAGAGTCTCAGTCTGACGAAGAGAAAGAAACATGGAACTTCCTAAGAGTCATGTTTGAAGATGAAGGCACTGCTAGAACAAAGTTACTTGATCACCTTGGATTTAAAGTGCAGCCAGAAGAGAATGCAGATATACAGGAAACTCACTCCAGCAAATTTGATGATATTGGTAGTGAAAT
AGCCAACACTCTTACTCTTGATGATAAATCTGAAGAAGATGTATTGCCTCAGTTGAAAGATGGACAAGATGTTGCTTTCCCCCAAGACAATGGAGAGGATTTCTTTGACAATTTGCAGAGTCCTAAAGAAGAGCCCTCTCTTTCTCATGTGGAAAACGATTTTGTTGTAGAAAAGGATAAGGATATGGTAGTAAATAGTG
CAGAGATTGAACATGAAACTGAAGACTTGACTGAGTATTCAGAGTGGGATGAAGATATTCAACATTCCTTAGTAGTCGGCGATTATAAGGGAGCTGTTCTGCAATGCCTGTCAGCAAACAGGATGGCTGATGCTCTTATTATTTCTCACCTGGGTGGGAGTTCTTTGTGGGAGAAAACTCGTGATGAATATTTGAAAAAA
GCTGACTCGTCCTATCTCAAGGTGGTTTCTGCCATGGTCAATAATGATCTTACAGGCCTTGTCAACAGCAGGCCATTGAAATCTTGGAAAGAAACTCTTGCTATGCTTTGCACGTATTCACAGAGGGAGGAATGGACTGTTTTATGTGATATGCTTGCTTCTAGATTGATTTCAGCTGGCAATGTGATGGCAGCAACACT
TTGCTACATATGTGCGGGGAATATTGAAAAGACAGTAGAAATATGGTCTCGATGTCTTAAGTATGATTATGATGGGATGAGCTTTGTTGATCATTTGCAGGACTTGATGGAAAAGACTGTTGTTCTTGCTTTAGCAACTGGACAAAAGCGGGTTAGTCCCTCACTGTCAAAGTTGGTTGAGAATTATGCAGAATTGCTAG
CCAGTCAAGGGCTTTTAACCACAGCTCTGGAGTATCTAAAGCTCTTGGGCACTGAAGAATCTTCTCATGAGCTGTCTATTTTACGAGATAGAATATACCTATCCGGGACAGATAATAAGGTGGAGGCTTCACCTTTTCCTTTTGAAACTAGACAGGATCTGACAGAATCTCAGTACAATACACATCAAACTGGTTTTGGA
GCACTTGAAACTCAAAAAAATTATCAGGAGAACCTACATCAAGGTTTACCTAGTGGGTCATACAATGACAATTATCAGCCGACTGGTAATACTCATTACACAGCAGGCTACCAACCAGCACCACAACAACAACCTTCCTTCCCAAACTATTTTACTCCTGCACCGTACCCGCCAGCACCATCTCCAAATGTTTTCTATCC
ATCACCAGTTTCTCAAGCTCAGCAGACTAATTTTGCTCCACCTGTGAATCAGCCAGCAACGAAAACATTTGTTCCATCTACACCACCAGTCTTGAGAAATGTAGATCAGTATCAGCCGCCTTCTTTGAACCCTCAACTCTATCAGGGAGTTTCTCCAGCTACAGTTGAAACACATCCCTACCAAACAGGAGCACCTGCAT
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