sp|A7PZL3|PGLR_VITVI ----> Probable polygalacturonase
Intron 1 GTTCTATGCT ... TTGTTGGCAG
| Sample | Retention score (%) | Exon junction reads | 5'ss reads | 3'ss reads |
| A1 | 24.32 | 28 | 5 | 13 |
| A2 | 17.39 | 19 | 5 | 3 |
| A3 | 23.81 | 24 | 5 | 10 |
| A4 | 21.05 | 15 | 4 | 4 |
| A5 | 27.27 | 16 | 7 | 5 |
| A6 | 20 | 78 | 17 | 22 |
| A7 | 13.44 | 132 | 19 | 22 |
| A8 | 19.34 | 73 | 16 | 19 |
| A9 | 18.9 | 133 | 14 | 48 |
| A10 | 14.93 | 94 | 9 | 24 |
>TRINITY_DN40675_c0_g1_i1 from sample A6 / Example spliced isoformCCGCGGCCTTAATTTGGTCTCCCACCTCAATTTCTCTCCATTTTCCGCAGACAGCGCCTTGCTTTACGTCTCCACCCACGCATTCATCATGAATTCAAACCGTTTCACACTGTCAACGAATAATTTGTTACTTCTCTATGAAACAAACAAAAACACCATATACATCTCTTCGCCATCTTAAGAACAGAGGGATTTACAAA
TCGGCATCATATCAAACAGTACAATATCGGGATTTTGTTTGCATGGCTATTATGTATATTGATCGTTCAAAGAAGCTATGGAGATTTGTGACTTGCAGCTAATATTTTGGAGATTGCCAGGCTTTTTTATATTGATTTGCAGGCGATGATGAAGACTGATTCAAAGAAACAAGAAACATGCTCCTATGACGATGAAATAC
AGACTCTTTGCAAGCTTAAATGGGTTTCAAGGGCACCTCGGGCTTTATTTCTTCTTTTATTGACGTTGCTGGTTGTTGGACTGGTCCAAACCAAGACTGGGCTGATTCTTCCTTCGTTAGTCAATCAGTCTGAAGACTTTCAGGTTCATGGATTTTTTGAAGCAGAAGAGCGGAGTTGTTCAGATTTTGTTAGGTTGAAT
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AAAAGACGCACTCATTCTGGGATCTCAGGATCCAAATGACTGGCCTCTTATAGAGCCACTCCCATCATATGGTCGAGGCAGAGAACGACTTGGAGGAAGACATATCAGCCTTATTCATGGGGAAAATCTTGAAAATGTTGTGATTACAGGTGAAAATGGAACTATTGATGGACAGGGATCAATGTGGTGGAATATGTGGT
TCAATAAGACCCTGCAACACACAAGAGGTCACCTTGTTGAATTTGTTGATTCAGAAAATATAATAATTTCAAATGTTACATTCCTCAACTCGCCATTTTGGAATATACACCCAGTCTATTGCAGAAATGTGGTAATAAAACATGTGACCATATTGGCTCCTCTTGATGCCCCTAACACAGATGGGATTGATCCAGATTCC
AGCTCAAATGTCTGTATAGAAGACTGCTACATTCACAGTGGTGATGATCTGGTGGCAATAAAGAGTGGATGGGACGAGTATGGAATAGCTGTGGGGCGTCCAAGTTCAAACATAATTATTCGGCGAGTGTCAGGCACAACTCCAACTTGTTCTGGGATTGGAATTGGAAGTGAAATGTCAGGGGGAATAGAAGGTGTGGT
GGTAGAAAACTTGAATGTTTATAATGCATCTGCAGGTGTCAGAGTGAAGACTGATATGGGAAGAGGTGGTTATATTACCAATATCACAATCTCTAACTTAACACTGGAAAATGTCAAGATACCCATCAAGTTCACAGCTAATTCTAATGATCACCCAGATAGTAACTGGGATCCCAATGCTCTTCCACGCATCAAGGGAA
TAATTATAAGAGATGTGGTGGGTAAAGACATACATAATGCACCATCCTTCAAGGGCCTGCATAAGACTCCTTTTGTAGACATCTGCCTTTCAAATATTAAATTGGAGGGGATACCACAAGGAAGAACTGCTTGGCATTGTGAATTTGTTGAGGGTTTTTCTGCAAATGTTTCACCATCACCATGCTCAAACTTCCAAACC
CAAGATCAAACTAATGTATCTTATTGCACCATGCTTAGACATTCTTAGACTATACCACAACCTAGATATCCTTTGTCCAAGAACTTCTCTGCACAGTTTGCCTGCGCTGGAAAGGCACATGCATGCATTGCTGCAAGCAGAATTTTGGGAGATTGTATTTTTGGCCATATAGAAAATTTGCTAAATGTTAAACTTCCAAC
GGATGATTCTTCTGTTCATTTATAATCAAGTGGATAGAATTCTATATTCAGGTATCC
>TRINITY_DN40675_c0_g1_i2 from sample A6 / Example unspliced isoform:CCGCGGCCTTAATTTGGTCTCCCACCTCAATTTCTCTCCATTTTCCGCAGACAGCGCCTTGCTTTACGTCTCCACCCACGCATTCATCATGAATTCAAACCGTTTCACACTGTCAACGAATAATTTGTTACTTCTCTATGAAACAAACAAAAACACCATATACATCTCTTCGCCATCTTAAGAACAGAGGGATTTACAAA
TCGGCATCATATCAAACAGTACAATATCGGGATTTTGTTTGCATGGCTATTATGTATATTGATCGTTCAAAGAAGCTATGGAGATTTGTGACTTGCAGCTAATATTTTGGAGATTGCCAGGCTTTTTTATATTGATTTGCAGGCGATGATGAAGACTGATTCAAAGAAACAAGAAACATGCTCCTATGACGATGAAATAC
AGACTCTTTGCAAGCTTAAATGGGTTTCAAGGGCACCTCGGGCTTTATTTCTTCTTTTATTGACGTTGCTGGTTGTTGGACTGGTCCAAACCAAGACTGGGCTGATTCTTCCTTCGTTAGTCAATCAGTCTGAAGACTTTCAGGTTCATGGATTTTTTGAAGCAGAAGAGCGGAGTTGTTCAGATTTTGTTAGGTTGAAT
AGCAGAAGGAAGAAGATTGCGTCTATTGAAGAATTTGGAGGTGTGGGTGATGGGAAGACTCTGAATACCAGAGCCTTTCAGAAGGCCATTGATTATCTGAAATCATTTGCAGACAAGGGTGGGGCACAGCTTAATGTTCCTTCCGGGAGGTGGGTCACTGGCAGTTTTAATCTCACAAGCAACTTCACTCTGTACTTGGG
AAAAGACGCACTCATTCTGGGATCTCAGGATCCAAATGACTGGCCTCTTATAGAGCCACTCCCATCATATGGTCGAGGCAGAGAACGACTTGGAGGAAGACATATCAGCCTTATTCATGGGGAAAATCTTGAAAATGTTGTGATTACAGGTGAAAATGGAACTATTGATGGACAGGGATCAATGTGGTGGAATATGTGGT
TCAATAAGACCCTGCAACACACAAGAGGTCACCTTGTTGAATTTGTTGATTCAGAAAATATAATAATTTCAAATGTTACATTCCTCAACTCGCCATTTTGGAATATACACCCAGTCTATTGCAGAAATGTGGTAATAAAACATGTGACCATATTGGCTCCTCTTGATGCCCCTAACACAGATGGGATTGATCCAGgttct
atgctaggtttatctctaacatcagagcacatatacttgttggcagATTCCAGCTCAAATGTCTGTATAGAAGACTGCTACATTCACAGTGGTGATGATCTGGTGGCAATAAAGAGTGGATGGGACGAGTATGGAATAGCTGTGGGGCGTCCAAGTTCAAACATAATTATTCGGCGAGTGTCAGGCACAACTCCAACTTG
TTCTGGGATTGGAATTGGAAGTGAAATGTCAGGGGGAATAGAAGGTGTGGTGGTAGAAAACTTGAATGTTTATAATGCATCTGCAGGTGTCAGAGTGAAGACTGATATGGGAAGAGGTGGTTATATTACCAATATCACAATCTCTAACTTAACACTGGAAAATGTCAAGATACCCATCAAGTTCACAGCTAATTCTAATG
ATCACCCAGATAGTAACTGGGATCCCAATGCTCTTCCACGCATCAAGGGAATAATTATAAGAGATGTGGTGGGTAAAGACATACATAATGCACCATCCTTCAAGGGCCTGCATAAGACTCCTTTTGTAGACATCTGCCTTTCAAATATTAAATTGGAGGGGATACCACAAGGAAGAACTGCTTGGCATTGTGAATTTGTT
GAGGGTTTTTCTGCAAATGTTTCACCATCACCATGCTCAAACTTCCAAACCCAAGATCAAACTAATGTATCTTATTGCACCATGCTTAGACATTCTTAGACTATACCACAACCTAGATATCCTTTGTCCAAGAACTTCTCTGCACAGTTTGCCTGCGCTGGAAAGGCACATGCATGCATTGCTGCAAGCAGAATTTTGGG
AGATTGTATTTTTGGCCATATAGAAAATTTGCTAAATGTTAAACTTCCAACGGATGATTCTTCTGTTCATTTATAATCAAGTGGATAGAATTCTATATTCAGGTATCC
Intron 2 GTTGGTAATT ... TGTCCTGCAG
| Sample | Retention score (%) | Exon junction reads | 5'ss reads | 3'ss reads |
| A1 | 25 | 60 | 33 | 7 |
| A2 | 21.15 | 41 | 17 | 5 |
| A3 | 28.12 | 46 | 24 | 12 |
| A4 | 20 | 26 | 6 | 7 |
| A5 | 16 | 21 | 4 | 4 |
| A6 | 26.21 | 114 | 56 | 25 |
| A7 | 27.63 | 220 | 115 | 53 |
| A8 | 26.56 | 141 | 72 | 30 |
| A9 | 27.17 | 185 | 96 | 42 |
| A10 | 25.76 | 170 | 75 | 43 |
>TRINITY_DN108441_c0_g1_i1 from sample A3 / Example spliced isoformCCTCAATTTCTCTCCATTTTCCGCAGACAGCGCCTTGCTTTACGTCTCCACCCACGCATTCATCATGAATTCAAACCGTTTCACACTGTCAACGAATAATTTGTTACTTCTCTATGAAACAAACAAAAACACCATATACATCTCTTCGCCATCTTAAGAACAGAGGGATTTACAAATCGGCATCATATCAAACAGTACAA
TATCGGGATTTTGTTTGCATGGCTATTATGTATATTGATCGTTCAAAGAAGCTATGGAGATTTGTGACTTGCAGCTAATATTTTGGAGATTGCCAGGCTTTTTTATATTGATTTGCAGGCGATGATGAAGACTGATTCAAAGAAACAAGAAACATGCTCCTATGACGATGAAATACAGACTCTTTGCAAGCTTAAATGGG
TTTCAAGGGCACCTCGGGCTTTATTTCTTCTTTTATTGACGTTGCTGGTTGTTGGACTGGTCCAAACCAAGACTGGGCTGATTCTTCCTTCGTTAGTCAATCAGTCTGAAGACTTTCAGGTTCATGGATTTTTTGAAGCAGAAGAGCGGAGTTGTTCAGATTTTGTTAGGTTGAATAGCAGAAGGAAGAAGATTGCGTCT
ATTGAAGAATTTGGAGGTGTGGGTGATGGGAAGACTCTGAATACCAGAGCCTTTCAGAAGGCCATTGATTATCTGAAATCATTTGCAGACAAGGGTGGGGCACAGCTTAATGTTCCTTCCGGGAGGTGGGTCACTGGCAGTTTTAATCTCACAAGCAACTTCACTCTGTACTTGGGAAAAGACGCACTCATTCTGGGATC
TCAGGATCCAAATGACTGGCCTCTTATAGAGCCACTCCCATCATATGGTCGAGGCAGAGAACGACTTGGAGGAAGACATATCAGCCTTATTCATGGGGAAAATCTTGAAAATGTTGTGATTACAGGTGAAAATGGAACTATTGATGGACAGGGATCAATGTGGTGGAATATGTGGTTCAATAAGACCCTGCAACACACAA
GAGGTCACCTTGTTGAATTTGTTGATTCAGAAAATATAATAATTTCAAATGTTACATTCCTCAACTCGCCATTTTGGAATATACACCCAGTCTATTGCAGAAATGTGGTAATAAAACATGTGACCATATTGGCTCCTCTTGATGCCCCTAACACAGATGGGATTGATCCAGATTCCAGCTCAAATGTCTGTATAGAAGAC
TGCTACATTCACAGTGGTGATGATCTGGTGGCAATAAAGAGTGGATGGGACGAGTATGGAATAGCTGTGGGGCGTCCAAGTTCAAACATAATTATTCGGCGAGTGTCAGGCACAACTCCAACTTGTTCTGGGATTGGAATTGGAAGTGAAATGTCAGGGGGAATAGAAGGTGTGGTGGTAGAAAACTTGAATGTTTATAA
TGCATCTGCAGGTGTCAGAGTGAAGACTGATATGGGAAGAGGTGGTTATATTACCAATATCACAATCTCTAACTTAACACTGGAAAATGTCAAGATACCCATCAAGTTCACAGCTAATTCTAATGATCACCCAGATAGTAACTGGGATCCCAATGCTCTTCCACGCATCAAGGGAATAATTATAAGAGATGTGGTGGGTA
AAGACATACATAATGCACCATCCTTCAAGGGCCTGCATAAGACTCCTTTTGTAGACATCTGCCTTTCAAATATTAAATTGGAGGGGATACCACAAGGAAGAACTGCTTGGCATTGTGAATTTGTTGAGGGTTTTTCTGCAAATGTTTCACCATCACCATGCTCAAACTTCCAAACCCAAGATCAAACTAATGTATCTTAT
TGCACCATGCTTAGACATTCTTAGACTATACCACAACCTAGATATCCTTTGTCCAAGAACTTCTCTGCACAGTTTGCCTGCGCTGGAAAGGCACATGCATGCATTGCTGCAAGCAGAATTTTGGGAGATTGTATTTTTGGCCATATAGAAAATTTGCTAAATGTTAAACTTCCAACGGATGATTCTTCTGTTCATTTATA
ATCAAGTGGATAGAATTCTATATTCAGGTATCCACCTTATCAAATATTTATACAGTTTTTTTATTGAGAATGGTTAGTGATTACAATACTATTTACTAATCTAATCTCCATGTTAATGGGCTTTAATATATATATATTTAAAAAATAAAATAAAAAATAGTTAAATTTTGTGTAGAAATTTTCCAAATTGTTGAGTTTTA
ATGCA
>TRINITY_DN108441_c0_g1_i2 from sample A3 / Example unspliced isoform:CCTCAATTTCTCTCCATTTTCCGCAGACAGCGCCTTGCTTTACGTCTCCACCCACGCATTCATCATGAATTCAAACCGTTTCACACTGTCAACGAATAATTTGTTACTTCTCTATGAAACAAACAAAAACACCATATACATCTCTTCGCCATCTTAAGAACAGAGGGATTTACAAATCGGCATCATATCAAACAGTACAA
TATCGGGATTTTGTTTGCATGGCTATTATGTATATTGATCGTTCAAAGAAGCTATGGAGATTTGTGACTTGCAGCTAATATTTTGGAGATTGCCAGGCTTTTTTATATTGATTTGCAGGCGATGATGAAGACTGATTCAAAGAAACAAGAAACATGCTCCTATGACGATGAAATACAGACTCTTTGCAAGCTTAAATGGG
TTTCAAGGGCACCTCGGGCTTTATTTCTTCTTTTATTGACGTTGCTGGTTGTTGGACTGGTCCAAACCAAGACTGGGCTGATTCTTCCTTCGTTAGTCAATCAGTCTGAAGACTTTCAGGTTCATGGATTTTTTGAAGCAGAAGAGCGGAGTTGTTCAGATTTTGTTAGGTTGAATAGCAGAAGGAAGAAGATTGCGTCT
ATTGAAGAATTTGGAGGTGTGGGTGATGGGAAGACTCTGAATACCAGAGCCTTTCAGAAGGCCATTGATTATCTGAAATCATTTGCAGACAAGGGTGGGGCACAGCTTAATGTTCCTTCCGGGAGGTGGGTCACTGGCAGTTTTAATCTCACAAGCAACTTCACTCTGTACTTGGGAAAAGACGCACTCATTCTGGGATC
TCAGGATCCAAATGACTGGCCTCTTATAGAGCCACTCCCATCATATGGTCGAGGCAGAGAACGACTTGGAGGAAGACATATCAGCCTTATTCATGGGGAAAATCTTGAAAATGTTGTGATTACAGGTGAAAATGGAACTATTGATGGACAGGGATCAATGTGGTGGAATATGTGGTTCAATAAGACCCTGCAACACACAA
GAGGTCACCTTGTTGAATTTGTTGATTCAGAAAATATAATAATTTCAAATGTTACATTCCTCAACTCGCCATTTTGGAATATACACCCAGTCTATTGCAGgttggtaattactaattttgcttttgggtatgaaagttaggcaagttaagggttgtttttcatttgtacttgtttgcaatacgaatacattccaatagat
gccattcttattcacagcgtttttgctacatattgtcctgcagAAATGTGGTAATAAAACATGTGACCATATTGGCTCCTCTTGATGCCCCTAACACAGATGGGATTGATCCAGATTCCAGCTCAAATGTCTGTATAGAAGACTGCTACATTCACAGTGGTGATGATCTGGTGGCAATAAAGAGTGGATGGGACGAGTAT
GGAATAGCTGTGGGGCGTCCAAGTTCAAACATAATTATTCGGCGAGTGTCAGGCACAACTCCAACTTGTTCTGGGATTGGAATTGGAAGTGAAATGTCAGGGGGAATAGAAGGTGTGGTGGTAGAAAACTTGAATGTTTATAATGCATCTGCAGGTGTCAGAGTGAAGACTGATATGGGAAGAGGTGGTTATATTACCAA
TATCACAATCTCTAACTTAACACTGGAAAATGTCAAGATACCCATCAAGTTCACAGCTAATTCTAATGATCACCCAGATAGTAACTGGGATCCCAATGCTCTTCCACGCATCAAGGGAATAATTATAAGAGATGTGGTGGGTAAAGACATACATAATGCACCATCCTTCAAGGGCCTGCATAAGACTCCTTTTGTAGACA
TCTGCCTTTCAAATATTAAATTGGAGGGGATACCACAAGGAAGAACTGCTTGGCATTGTGAATTTGTTGAGGGTTTTTCTGCAAATGTTTCACCATCACCATGCTCAAACTTCCAAACCCAAGATCAAACTAATGTATCTTATTGCACCATGCTTAGACATTCTTAGACTATACCACAACCTAGATATCCTTTGTCCAAG
AACTTCTCTGCACAGTTTGCCTGCGCTGGAAAGGCACATGCATGCATTGCTGCAAGCAGAATTTTGGGAGATTGTATTTTTGGCCATATAGAAAATTTGCTAAATGTTAAACTTCCAACGGATGATTCTTCTGTTCATTTATAATCAAGTGGATAGAATTCTATATTCAGGTATCCACCTTATCAAATATTTATACAGTT
TTTTTATTGAGAATGGTTAGTGATTACAATACTATTTACTAATCTAATCTCCATGTTAATGGGCTTTAATATATATATATTTAAAAAATAAAATAAAAAATAGTTAAATTTTGTGTAGAAATTTTCCAAATTGTTGAGTTTTAATGCA