sp|Q8VZS6|GIP1_ARATH ----> GBF-interacting protein 1
Intron 1 GTATGAGTTG ... GTATGTTCAG
| Sample | Retention score (%) | Exon junction reads | 5'ss reads | 3'ss reads |
| A1 | 21.34 | 597 | 76.5 | 162 |
| A2 | 20.33 | 384 | 42.5 | 98 |
| A3 | 20.85 | 482 | 54.5 | 127 |
| A4 | 19.01 | 392 | 44 | 92 |
| A5 | 18.64 | 192 | 15.5 | 44 |
| A6 | 21.12 | 198 | 21.5 | 53 |
| A7 | 16.96 | 607 | 48 | 124 |
| A8 | 19.8 | 235 | 15.5 | 58 |
| A9 | 20.09 | 529 | 53 | 133 |
| A10 | 19.91 | 720 | 46.5 | 179 |
>TRINITY_DN113955_c1_g7_i4 from sample A1 / Example spliced isoformCCTGTATTTGCTTTCTGTGGGTTTTTTGTATTTGGGTTTTGGTTGAAAATTTTGCACTGTAATTCCTTATTATCTCACCATGAAACCAAGACAAAACCCAAGCAGTGTGGAAAAAAGGGTTTATTGTACTATCCCTCTTTTAGGTTTTTGGGTCGTGGCGTAGCGGCCTCTATAGTAAGTATAGAGCGCACAAGCGTGTT
CGGGATTTTATTTAAAAAAAACGATCAGCAAATTTTGAGGGGTTTTAGGTTTTGCAGCAGAGAAACTGTTTAGACAGTTTGTACTTGAGAGTCGCTCATACGATGTCAGCGGGATTTGAGTTTAGGTTGAAATTACAGATTATTTTCGGATCATGATCTGGATCGAAGTTATAAATGTCCGCCAATTACACGTCCCTTCC
CCATCTTTGACTCATTGACAGTTCAACTGGCGTCTGGCGTCTGGATATGGGCAAAGACTTGGCGCAAAGCTATTAAACTGATGGATTTGTTTGCCAGTGTTTCCCCCACGTGACTAGTGAATATGCTAAGCCTTACTATCTGAAGTCTTTTGCACTTGAAAATTTTAAAGTTGTTTGTTTTTCAGTTCTTTACCAAACTT
GATACATGCTATAGTGCATAAGTTCCCAATTTGCTTAAACATTTTACAGGCCCCATAAATCTATGTATATGTTTGTGTGCTGGTGTATAAATTACCATGAGCATTGAGAAGTGGATCACATTTTGGTTACTTTTTCTGAGAGTTTGAAAAGTTATTCTGTTCGACCTTTTGAGGAGAATTTCATTGTTTCCCAGTTATTC
TGGTCTATTACTTGAAGAAATAGTTATTCAGTGCCGTTATTTCTTGTATCTGTTCTCTAAAAGTTGAGACTTAGTATTTGTCTATAATGCAGATCCTTTCCATGAAGTTAAGAGGAAGCGAGACAAGCGTAAAGAGAACACAAACAGCAGAGATTCTGGAGATACTAGGTCAAGACCATCCAATCAAGGTCGGGGTGGAA
GGGGATCTGGCAGAGGAAACTATCTTCCACGCTATATCTCATATGATGCAGGTGGTGGTAGGGGATCCAATATGGCAAGGGAGAATGGGGGGCACCAAAGTGTAAACAAGGCTAGCTCAAACAGTGCCTTGTCTCCTCCCACAACTTCACAGAATGTGCAAACCAAGACAAGTTTTCCAGGAACAAGCTCTTTGCCAGCA
TCCACCAGTGGTACCTCTGTCATAGCCAATGGGTTGTCAGCAGACGCACATGCTCCACAAAACCAGGCAGGAAGCTGGAGTCCTGCTGCTGGACCAAGCTTGATGGCCGATGTCTTGAAGTCAAGTAGTGTGCAACAATCACCGACTCAACCCCCACGTGCACCTGCTTCGACTTCTGTAACTGTGCAAGGACAATCAAT
AGCTGGTTCTCAGCAGTATGTTGCTTCTGTGACTCCGACATCTGTTTCAGGGGTCTATTCGTCATCATCAGATCCTGTGCTGGTGCCAAAATTAAATTCTCGTGTTTCGGCTGCAGTTGGAACAATCAAGCGTGAAGTTGGGACTGTTGGTGCCGAGCGGGTAGTTGTTGAGCAGGCTACTGGTTCTGTTGATAACAAGC
CTGCTGCATCCAGTTTCTCAAATACTTTGCAAATAACACAATCTGACATGTCTGATGCAGTTGATTCAGAAGTGAAGGTATCCGAAAATGAAATTTCTGCTTCAACAACTGTACATTCATTTTCACAGGAGCGTGTTGTGAGTAAGTCTCAAACAAAAGATGGGGATCACTTTTCTGATACACAGCCCCAAGTATCCACT
TCAGCCCCAACAGGATATTCCATGAGCAGATCTTCAGTTATGGCTAATCATCACTACATCAGGCCTCAGCAACTTATCGGATCTCAGAAAGCAGTAGGACCTAACAAGGAATGGAAGCCAAAACCAACAAATCAAAATTTGGTACCTAGTCCTGGAATAATTGGCACATCCACTGTTAGCAACAGTACGTCTGAAGTTAG
CAGGTCACCTTCTCCAGCTGCAAAATCAACTTTGGAAGATGCATCTTCCAAATTGCAGAAAAATATGGAAGAGTTGAATGTTAGGGATGAGCAGCATGTAATCATACCAAATCATCTTCAAGTTCCCGAGGCAGAACGTACAGGTCTTAGTTTTGGAAGCTTCGATGCAAATTTTGATGCAAACTTTGGAACTAGTTACA
GTGCAACCTATGGCAATGATGATGATAGTGACAAGAGCTCCACTCCACTGTCCGAAGAGTCTCAAGTGCCAGAGGAAACAGTTGAAGAACCTTCTTCAAGCATATCAAACACTTCTCCAGTTATTCCAAATGAGGAATATCCACATCACCAACGAACATCTGTGACCTCGGTAGACAATCTATCTCCTGCTAATGATTTG
ACAGTCTCTACGAATCCGACAATAGTTTCTTCACAATCCGATCCTTCCAAACCAGATGTGGTGGTTCAGCCAGGTCCTCAGTATTCTCTTGTTCAGACTGCTCCAAATTATTCAGGTATTAGTTTGATGCCACAGATGATCAATAGCCAGTACCCATCTTATGAACATGCAGAGACCCAACTACGTGATGCTTCTCGGCT
TCCCTTTGTGCAACCGACTTATGATCCCTCCACAAGCTACTATACTCCAATTTACAGACCTGGTTCAGATGGAGATGCTCGTTTCTCTCAACTTCTTGGATCGACTGCTGCCAGCAAATACAGTGGAAATGTTACAATATTATCAGGTCAAAGTGTGCCATCATCACAGGAGAGTGGGAACTCCATGGTACTCTCTAATG
CAGGTCCCACAGCATTAGGAACCCAAGCGGCTGGACTTGTGCAGACAACAATAGCATTGCCTCAGCAGCCAATGCCCATGTTTCGTCAGCCTACTGGTGTACATATTTCACACTATCCTCCCAACTATGTCCCATACCATCAATTTTTTTCACCCTTTTATCTTCCATCCCCAACAATGCATAATATTGTAGGCAATAGT
GGCTTTCCCCAGCTTCCTGCTGGTAGCTCATATCCTGCTGCTGCAGGTAGCTCATACCCCCCAGCTGCTGCTGCTGGCAACTCGTACCCCCCAGCTGCTGCTCCAGTAAAATACTCACTGTCACAGTATAAGCCTGGTAATGCTAGTGGGAATTCTCCTCATATTGGCGTTCCTGCAGGTTATGGTAGCTATACAGCAGC
TCCATCAGGATATAGTGGAAGTCCTTCTGTGACTGCAGGTAATGCGTCGGGCTGTGATGATATTGGAGGATCTCAGTATAAAGAAAATAATGTATACATTGCTGGTCAACAGGGTGAAGGATCTACAGTATGGTTTCAGGGACCTCCTAGAGATATTTCTGGAATGCAAGCAAATTCATACTATAACTTGCCGCCACCTC
AGGGGCAGCACATGGCATTCACACATGCACAGGCTGGGCATGCAACATATGCTGGATTGTATCATCCTACTCAGTCTGGGCCAGCTCCAAATGCACATCCACTGCTTCAACAAACACAAACATTGGGGGGAGCTGTTGGTGTTGTTGGTGCTCAGGCAGGGGTTTATCAGCAGCCACAACGTGCTCAACTGAACTGGGCC
AATAGTTACTGACATGCCAGAACGATTCACTCTGTTGGCTAGACTGGGTATACTGTATTATTTGCAAGCGTGCTCAGATGGCCAGGATGCAGAGTTCATGTTCCGAGCCAGGTTGTATTCCGGACATGAGTGTACATAAAGTTTGGACCTCTAGGTTGTGAGAGAATTGATTAATTGGAAATATCTGCTGTAGTCATTGG
GCATGTTTGGGAACCTACAGAGAGTAAGCACTTCTCCCATATTTCTGGGCTCATATGGCTCCGCTGGTTTCATCTTAGACTTTCTTTTATTTAGTTGACAGGCATATGTGCAGGGTTTTAACTATGGTTAAGTAACGGTTCATGCTGTTTCATCTAGGAAGCATGAATCCAAGGTAAGCATGAACGAGTGGGTTTTGATT
ATACTCCACAATCTTAACCCTGTAGAATGAATTTTGACAATAGCTCCAGTTTATTGACCTGTTGTAAGTGCTGCAAGGTAATTCACCAGTTACTGAATTCATTGGAGGAACTTCAGCTTTATAGATGTCATATTGGATTGAATAGGGTCATTTTATACTTTTAATCTGTAATTCTTGTTTGGTCTCTGTCAATATAAGAT
TCTTTTCTAATCACGTTTTCTTATGTTATCCTTAAGAACTAAGTTCTGCACCAACATTAGTTATGTAAAATGCAACTATGCGATAATGGAGAGGAAAAACAGCAAAAAACTTGCTCATGCTTGGGACCTCAGCCCAACACCCATAAGTTGGTTCTCTCAGGTGCTTCTGATGATTAAATCCTTGCGATACTTTTCAGCAA
GTTGTTTTTAGGGTGATACTTTTCAGCAAGTTGTTTTTAGGGTTATGCTTATTGCAGCCTTTTAAACTAGAATTATTGTGGGACTAACCACAATTGCTGGGCATGTTTGTGATTCACCAAATAATATAGTGGTGTCCGTGTAACTATGCTCATCGATCTTGCACTGCCAGGGTTGTCTTGACTCTTTGAATGCTTATATT
TGTAATTTTGCCTCTGGTATACGTAATGTTTTTATAGATGAAAGCAAATGAAAGGCAAAGGAATCCTTTCTAACAAAAAAGAGAAATTCCTCTAGAATATGCGGAAATTGGCACA
>TRINITY_DN113955_c1_g7_i3 from sample A1 / Example unspliced isoform:GAGCTGCTCAACATTTGCGCAGATATTTGTTGGGCAGTGTTTCTCTTATGTATTGTATGGCCATAGGCCAATTGTTTTTTAACCACAGGATGGACAAAGATGGCCACATGTGAGTGTATTGAACAAAAAGCTCTGATACCACTTGTAAGCAACCTGATTATGTTAGATCATCCATACATTCCTGACAATTGAAATACTGA
GTAATTTACACGATACAAAATAGTGTTCATTTTAGGATTGGAAGGAGCATAACCCTTCCAATAGACACAGTAAGTAATAAGGTTTACATTTATATTTCTATGGTGCATATATCATTATATGGTTGGTATATTACACTCTGGAGTAATTAAATTAATTCAGTAAATTCACATTACAATGCAGGGTGGACCTGATGCATTGA
TATTGCCTTTTCAAGAATTAACTGGACTTTCCACTATTTCGTTTTTGTTTAATTTTCAAAGCATTTTAACAACCTGTGGCACCAATGAACAACCTCACCCAAAATCTAATAGATGCTGGCTACTGTGATAAACATGCCCTTGCTCATTGGTTTTAATACTGCAAAATATTTGACATCTAGCATACATTGCTGCATATTCT
CTTCAGCAGAACACAAACAGCAGAGATTCTGGAGATACTAGGTCAAGACCATCCAATCAAGGTCGGGGTGGAAGGGGATCTGGCAGAGGAAACTATCTTCCACGCTATATCTCATATGgtatgagttgtgttttttttatacgaggtttatggtgttgactcgttgttagccaaatgtgatttctttaatcttaacacta
aagggaaaaaatagaatattcacacattaatagaagacattgcagattgaatgtatacaattctttgtatgttcagATGCAGGTGGTGGTAGGGGATCCAATATGGCAAGGGAGAATGGGGGGCACCAAAGTGTAAACAAGGCTAGCTCAAACAGTGCCTTGTCTCCTCCCACAACTTCACAGAATGTGCAAACCAAGAC
AAGTTTTCCAGGAACAAGCTCTTTGCCAGCATCCACCAGTGGTACCTCTGTCATAGCCAATGGGTTGTCAGCAGACGCACATGCTCCACAAAACCAGGCAGGAAGCTGGAGTCCTGCTGCTGGACCAAGCTTGATGGCCGATGTCTTGAAGTCAAGTAGTGTGCAACAATCACCGACTCAACCCCCACGTGCACCTGCTT
CGACTTCTGTAACTGTGCAAGGACAATCAATAGCTGGTTCTCAGCAGTATGTTGCTTCTGTGACTCCGACATCTGTTTCAGGGGTCTATTCGTCATCATCAGATCCTGTGCTGGTGCCAAAATTAAATTCTCGTGTTTCGGCTGCAGTTGGAACAATCAAGCGTGAAGTTGGGACTGTTGGTGCCGAGCGGGTAGTTGTT
GAGCAGGCTACTGGTTCTGTTGATAACAAGCCTGCTGCATCCAGTTTCTCAAATACTTTGCAAATAACACAATCTGACATGTCTGATGCAGTTGATTCAGAAGTGAAGGTATCCGAAAATGAAATTTCTGCTTCAACAACTGTACATTCATTTTCACAGGAGCGTGTTGTGAGTAAGTCTCAAACAAAAGATGGGGATCA
CTTTTCTGATACACAGCCCCAAGTATCCACTTCAGCCCCAACAGGATATTCCATGAGCAGATCTTCAGTTATGGCTAATCATCACTACATCAGGCCTCAGCAACTTATCGGATCTCAGAAAGCAGTAGGACCTAACAAGGAATGGAAGCCAAAACCAACAAATCAAAATTTGGTACCTAGTCCTGGAATAATTGGCACAT
CCACTGTTAGCAACAGTACGTCTGAAGTTAGCAGGTCACCTTCTCCAGCTGCAAAATCAACTTTGGAAGATGCATCTTCCAAATTGCAGAAAAATATGGAAGAGTTGAATGTTAGGGATGAGCAGCATGTAATCATACCAAATCATCTTCAAGTTCCCGAGGCAGAACGTACAGGTCTTAGTTTTGGAAGCTTCGATGCA
AATTTTGATGCAAACTTTGGAACTAGTTACAGTGCAACCTATGGCAATGATGATGATAGTGACAAGAGCTCCACTCCACTGTCCGAAGAGTCTCAAGTGCCAGAGGAAACAGTTGAAGAACCTTCTTCAAGCATATCAAACACTTCTCCAGTTATTCCAAATGAGGAATATCCACATCACCAACGAACATCTGTGACCTC
GGTAGACAATCTATCTCCTGCTAATGATTTGACAGTCTCTACGAATCCGACAATAGTTTCTTCACAATCCGATCCTTCCAAACCAGATGTGGTGGTTCAGCCAGGTCCTCAGTATTCTCTTGTTCAGACTGCTCCAAATTATTCAGGTATTAGTTTGATGCCACAGATGATCAATAGCCAGTACCCATCTTATGAACATG
CAGAGACCCAACTACGTGATGCTTCTCGGCTTCCCTTTGTGCAACCGACTTATGATCCCTCCACAAGCTACTATACTCCAATTTACAGACCTGGTTCAGATGGAGATGCTCGTTTCTCTCAACTTCTTGGATCGACTGCTGCCAGCAAATACAGTGGAAATGTTACAATATTATCAGGTCAAAGTGTGCCATCATCACAG
GAGAGTGGGAACTCCATGGTACTCTCTAATGCAGGTCCCACAGCATTAGGAACCCAAGCGGCTGGACTTGTGCAGACAACAATAGCATTGCCTCAGCAGCCAATGCCCATGTTTCGTCAGCCTACTGGTGTACATATTTCACACTATCCTCCCAACTATGTCCCATACCATCAATTTTTTTCACCCTTTTATCTTCCATC
CCCAACAATGCATAATATTGTAGGCAATAGTGGCTTTCCCCAGCTTCCTGCTGGTAGCTCATATCCTGCTGCTGCAGGTAGCTCATACCCCCCAGCTGCTGCTGCTGGCAACTCGTACCCCCCAGCTGCTGCTCCAGTAAAATACTCACTGTCACAGTATAAGCCTGGTAATGCTAGTGGGAATTCTCCTCATATTGGCG
TTCCTGCAGGTTATGGTAGCTATACAGCAGCTCCATCAGGATATAGTGGAAGTCCTTCTGTGACTGCAGGTAATGCGTCGGGCTGTGATGATATTGGAGGATCTCAGTATAAAGAAAATAATGTATACATTGCTGGTCAACAGGGTGAAGGATCTACAGTATGGTTTCAGGGACCTCCTAGAGATATTTCTGGAATGCAA
GCAAATTCATACTATAACTTGCCGCCACCTCAGGGGCAGCACATGGCATTCACACATGCACAGGCTGGGCATGCAACATATGCTGGATTGTATCATCCTACTCAGTCTGGGCCAGCTCCAAATGCACATCCACTGCTTCAACAAACACAAACATTGGGGGGAGCTGTTGGTGTTGTTGGTGCTCAGGCAGGGGTTTATCA
GCAGCCACAACGTGCTCAACTGAACTGGGCCAATAGTTACTGACATGCCAGAACGATTCACTCTGTTGGCTAGACTGGGTATACTGTATTATTTGCAAGCGTGCTCAGATGGCCAGGATGCAGAGTTCATGTTCCGAGCCAGGTTGTATTCCGGACATGAGTGTACATAAAGTTTGGACCTCTAGGTTGTGAGAGAATTG
ATTAATTGGAAATATCTGCTGTAGTCATTGGGCATGTTTGGGAACCTACAGAGAGTAAGCACTTCTCCCATATTTCTGGGCTCATATGGCTCCGCTGGTTTCATCTTAGACTTTCTTTTATTTAGTTGACAGGCATATGTGCAGGGTTTTAACTATGGTTAAGTAACGGTTCATGCTGTTTCATCTAGGAAGCATGAATC
CAAGGTAAGCATGAACGAGTGGGTTTTGATTATACTCCACAATCTTAACCCTGTAGAATGAATTTTGACAATAGCTCCAGTTTATTGACCTGTTGTAAGTGCTGCAAGGTAATTCACCAGTTACTGAATTCATTGGAGGAACTTCAGCTTTATAGATGTCATATTGGATTGAATAGGGTCATTTTATACTTTTAATCTGT
AATTCTTGTTTGGTCTCTGTCAATATAAGATTCTTTTCTAATCACGTTTTCTTATGTTATCCTTAAGAACTAAGTTCTGCACCAACATTAGTTATGTAAAATGCAACTATGCGATAATGGAGAGGAAAAACAGCAAAAAACTTGCTCATGCTTGGGACCTCAGCCCAACACCCATAAGTTGGTTCTCTCAGGTGCTTCTG
ATGATTAAATCCTTGCGATACTTTTCAGCAAGTTGTTTTTAGGGTGATACTTTTCAGCAAGTTGTTTTTAGGGTTATGCTTATTGCAGCCTTTTAAACTAGAATTATTGTGGGACTAACCACAATTGCTGGGCATGTTTGTGATTCACCAAATAATATAGTGGTGTCCGTGTAACTATGCTCATCGATCTTGCACTGCCA
GGGTTGTCTTGACTCTTTGAATGCTTATATTTGTAATTTTGCCTCTGGTATACGTAATGTTTTTATAGATGAAAGCAAATGAAAGGCAAAGGAATCCTTTCTAACAAAAAAGAGAAATTCCTCTAGAATATGCGGAAATTGGCACA
Intron 2 GTAACTGTTT ... TATTCTCCAG
| Sample | Retention score (%) | Exon junction reads | 5'ss reads | 3'ss reads |
| A1 | 22.07 | 166 | 0 | 47 |
| A2 | 20.61 | 104 | 0 | 27 |
| A3 | 22.32 | 174 | 3 | 50 |
| A4 | 16.28 | 108 | 0 | 21 |
| A5 | 22.22 | 70 | 0 | 20 |
| A6 | 25.29 | 387 | 0 | 131 |
| A7 | 22.94 | 561 | 0 | 167 |
| A8 | 22.17 | 460 | 0 | 131 |
| A9 | 23.4 | 550 | 1 | 168 |
| A10 | 16.48 | 451 | 1 | 89 |
>TRINITY_DN120197_c0_g5_i2 from sample A3 / Example spliced isoformCCTGGCTTTGGCGACCCTGGCTAGTTGTTGATTTAGCAGATATATAAATTTGGCAGAGAGAGAAGACGAAGGGTATAACAGATAAAAAGAGAAAACGAAGGTCTTCTTATTATTCATTCATTCTTCACTTTTTCTTCTTTTTATCGGGCGAGCTCGGTTTTGTGCCTTCGTGGGGATAGGCTTTTGCCTCCGTCGGTGCA
GTGGTGCAGTGGAAGAGAGGGAGGGTAAACATCTTGGAATCCTGTATATTAACAGATGGCGGGGTTTGCTTCCTAGTTCGAAACAAATCTTCTGCTGAACGGTCTCCTGCAGCATTTTGGGTTCGGAAAAAACCCTTCGGAAGGGTGGGTTGCGTTGGAAGAGAGGGGGTTATAATACGAGGCACATCGAAAATGAGTGG
CACCGTGAGAACCGGTGGCGCGGTTTCGATTCCGGCCAGTGTTCGAAAAATCATACAAGATATAAAAGAAATAGCAGGGAATCACTCGGATGACGAGATATACGCAATGCTAAAGGAATGTAATATGGATCCCAATGAGACGGCTCAGAAGCTGCTCTATCAAGATCCTTTCCATGAAGTTAAGAGGAAGCGAGACAAGC
GTAAAGAGCAGAACACAAACAGCAGAGATTCTGGAGATACTAGGTCAAGACCATCCAATCAAGGTCGGGGTGGAAGGGGATCTGGCAGAGGAAGCTATCTTCCACGCTATATCTCATATGATGCAGGTGGTGGTAGGGGATCCAATATGGCAAGGGAGAATGGGGGGCACCAAAGTGTAAACAAGGCTAGCTCAAACAGT
GCCTTGTCTCCTCCCACAACTTCACAGAATGTGCAAACCAAGACAAGTTTTCCAGGAACAAGCTCTTTGCCAGCATCCACCAGTGGTACCTCTGTCATAGCCAATGGGTTGTCAGCAGACGCACATGCTCCACAAAACCAGGCAGGAAGCTGGAGTCCTGCTGCTGGACCAAGCTTGATGGCCGATGTCTTGAAGTCAAG
TAGTGTGCAACAATCACCGACTCAACCCCCACGTGCACCTGCTTCGACTTCTGTAACTGTGCAAGGACAATCAATAGCTGGTTCTCAGCAGTATGTTGCTTCTGTGACTCCGACATCTGTTTCAGGGGTCTATTCGTCATCATCAGATCCTGTGCTGGTGCCAAAATTAAATTCTCGTGTTTCGGCTGCAGTTGGAACAA
TCAAGCGTGAAGTTGGGACTGTTGGTGCCGAGCGGGTAGTTGTTGAGCAGGCTACTGGTTCTGTTGATAACAAGCCTGCTGCATCCAGTTTCTCAAATACTTTGCAAATAACACAATCTGACATGTCTGATGCAGTTGATTCAGAAGTGAAGGTATCCGAAAATGAAATTTCTGCTTCAACAACTGTACATTCATTTTCA
CAGGAGCGTGTTGTGAGTAAGTCTCAAACAAAAGATGGGGATCACTTTTCTGATACACAGCCCCAAGTATCCACTTCAGCCCCAACAGGATATTCCATGAGCAGATCTTCAGTTATGGCTAATCATCACTACATCAGGCCTCAGCAACTTATCGGATCTCAGAAAGCAGTAGGACCTAACAAGGAATGGAAGCCAAAACC
AACAAATCAAAATTTGGTACCTAGTCCTGGAATAATTGGCACATCCACTGTTAGCAACAGTACGTCTGAAGTTAGCAGGTCACCTTCTCCAGCTGCAAAATCAACTTTGGAAGATGCATCTTCCAAATTGCAGAAAAATATGGAAGAGTTGAATGTTAGGGATGAGCAGCATGTAATCATACCAAATCATCTTCAAGTTC
CCGAGGCAGAACGTACAGGTCTTAGTTTTGGAAGCTTCGATGCAAATTTTGATGCAAACTTTGGAACTAGTTACAGTGCAACCTATGGCAATGATGATGATAGTGACAAGAGCTCCACTCCACTGTCCGAAGAGTCTCAAGTGCCAGAGGAAACAGTTGAAGAACCTTCTTCAAGCATATCAAACACTTCTCCAGTTATT
CCAAATGAGGAATATCCACATCACCAACGAACATCTGTGACCTCGGTAGACAATCTATCTCCTGCTAATGATTTGACAGTCTCTACGAATCCGACAATAGTTTCTTCACAATCCGATCCTTCCAAACCAGATGTGGTGGTTCAGCCAGGTCCTCAGTATTCTCTTGTTCAGACTGCTCCAAATTATTCAGGTATTAGTTT
GATGCCACAGATGATCAATAGCCAGTACCCATCTTATGAACATGCAGAGACCCAACTACGTGATGCTTCTCGGCTTCCCTTTGTGCAACCGACTTATGATCCCTCCACAAGCTACTATACTCCAATTTACAGACCTGGTTCAGATGGAGATGCTCGTTTCTCTCAACTTCTTGGATCGACTGCTGCCAGCAAATACAGTG
GAAATGTTACAATATTATCAGGTCAAAGTGTGCCATCATCACAGGAGAGTGGGAACTCCATGGTACTCTCTAATGCAGGTCCCACAGCATTAGGAACCCAAGCGGCTGGACTTGTGCAGACAACAATAGCATTGCCTCAGCAGCCAATGCCCATGTTTCGTCAGCCTACTGGTGTACATATTTCACACTATCCTCCCAAC
TATGTCCCATACCATCAATTTTTTTCACCCTTTTATCTTCCATCCCCAACAATGCATAATATTGTAGGCAATAGTGGCTTTCCCCAGCTTCCTGCTGGTAGCTCATATCCTGCTGCTGCAGGTAGCTCATACCCCCCAGCTGCTGCTGCTGGCAACTCGTACCCCCCAGCTGCTGCTCCAGTAAAATACTCACTGTCACA
GTATAAGCCTGGTAATGCTAGTGGGAATTCTCCTCATATTGGCGTTCCTGCAGGTTATGGTAGCTATACAGCAGCTCCATCAGGATATAGTGGAAGTCCTTCTGTGACTGCAGGTAATGCGTCGGGCTGTGATGATATTGGAGGATCTCAGTATAAAGAAAATAATGTATACATTGCTGGTCAACAGGGTGAAGGATCTA
CAGTATGGTTTCAGGGACCTCCTAGAGATATTTCTGGAATGCAAGCAAATTCATACTATAACTTGCCGCCACCTCAGGGGCAGCACATGGCATTCACACATGCACAGGCTGGGCATGCAACATATGCTGGATTGTATCATCCTACTCAGTCTGGGCCAGCTCCAAATGCACATCCACTGCTTCAACAAACACAAACATTG
GGGGGAGCTGTTGGTGTTGTTGGTGCTCAGGCAGGGGTTTATCAGCAGCCACAACGTGCTCAACTGAACTGGGCCAATAGTTACTGACATGCCAGAACGATTCACTCTGTTGGCTAGACTGGGTATACTGTATTATTTGCAAGCGTGCTCAGATGGCCAGGATGCAGAGTTCATGTTCCGAGCCAGGTTGTATTCCGGAC
ATGAGTGTACATAAAGTTTGGACCTCTAGGTTGTGAGAGAATTGATTAATTGGAAATATCTGCTGTAGTCATTGGGCATGTTTGGGAACCTACAGAGAGTAAGCACTTCTCCCATATTTCTGGGCTCATATGGCTCCGCTGGTTTCATCTTAGACTTTCTTTTATTTAGTTGACAGGCATATGTGCAGGGTTTTAACTAT
GGTTAAGTAACGGTTCATGCTGTTTCATCTAGGAAGCATGAATCCAAGGTAAGCATGAACGAGTGGGTTTTGATTATACTCCACAATCTTAACCCTGTAGAATGAATTTTGACAATAGCTCCAGTTTATTGACCTGTTGTAAGTGCTGCAAGGTAATTCACCAGTTACTGAATTCATTGGAGGAACTTCAGCTTTATAGA
TGTCATATTGGATTGAATAGGGTCATTTTATACTTTTAATCTGTAATTCTTGTTTGGTCTCTGTCAATATAAGATTCTTTTCTAATCACGTTTTCTTATGTTATCCTTAAGAACTAAGTTCTGCACCAACATTAGTTATGTAAAATGCAACTATGCGATAATGGAGAGGAAAAACAGCAAAAAACTTGCTCATGCTTGGG
ACCTCAGCCCAACACCCATAAGTTGGTTCTCTCAGGTGCTTCTGATGATTAAATCCTTGCGATACTTTTCAGCAAGTTGTTTTTAGGGTGATACTTTTCAGCAAGTTGTTTTTAGGGTTATGCTTATTGCAGCCTTTTAAACTAGAATTATTGTGGGACTAACCACAATTGCTGGGCATGTTTGTGATTCACCAAATAAT
ATAGTGGTGTCCGTGTAACTATGCTCATCGATCTTGCACTGCCAGGGTTGTCTTGACTCTTTGAATGCTTATATTTGTAATTTTGCCTCTGGTATACGTAATGTTTTTATAGATGAAAGCAAATGAAAGGCAAAGGAATCCTTTCTAACAAAAAAGAGAAATTCCTCTAGAATATGCGGAAATTGGCACAATGTTGTAAT
AGTTGGCAATTAAAATGCATATTCCATATCGGGCTGCTAATAAATCTTAAAGGTGGCCTTTATTGACATGTCATTGTAGCGGTTC
>TRINITY_DN120197_c0_g5_i4 from sample A3 / Example unspliced isoform:AAAGTGTGCCATCATCACAGGAGgtaactgtttcaaccttgaccttctgggtttgctgtatgatatctgagtaatagtcaagagtatgaaaatgatactgatcatgaatttattttattctccagAGTGGGAACTCCATGGTACTCTCTAATGCAGGTCCCACAGCATTAGGAACCCAAGCGGCTGGACTTGTGCAGACA
ACAATAGCATTGCCTCAGCAGCCAATGCCCATGTTTCGTCAGCCTACTGGTGTACATATTTCACACTATCCTCCCAACTATGTCCCATACCATCAATTTTTTTCACCCTTTTATCTTCCATCCCCAACAATGCATAATATTGTAGGCAATAGTGGCTTTCCCCAGCTTCCTGCTGGTAGCTCATATCCTGCTGCTGCAGG
TAGCTCATACCCCCCAGCTGCTGCTGCTGGCAACTCGTACCCCCCAGCTGCTGCTCCAGTAAAATACTCACTGTCACAGTATAAGCCTGGTAATGCTAGTGGGAATTCTCCTCATATTGGCGTTCCTGCAGGTTATGGTAGCTATACAGCAGCTCCATCAGGATATAGTGGAAGTCCTTCTGTGACTGCAGGTAATGCGT
CGGGCTGTGATGATATTGGAGGATCTCAGTATAAAGAAAATAATGTATACATTGCTGGTCAACAGGGTGAAGGATCTACAGTATGGTTTCAGGGACCTCCTAGAGATATTTCTGGAATGCAAGCAAATTCATACTATAACTTGCCGCCACCTCAGGGGCAGCACATGGCATTCACACATGCACAGGCTGGGCATGCAACA
TATGCTGGATTGTATCATCCTACTCAGTCTGGGCCAGCTCCAAATGCACATCCACTGCTTCAACAAACACAAACATTGGGGGGAGCTGTTGGTGTTGTTGGTGCTCAGGCAGGGGTTTATCAGCAGCCACAACGTGCTCAACTGAACTGGGCCAATAGTTACTGACATGCCAGAACGATTCACTCTGTTGGCTAGACTGG
GTATACTGTATTATTTGCAAGCGTGCTCAGATGGCCAGGATGCAGAGTTCATGTTCCGAGCCAGGTTGTATTCCGGACATGAGTGTACATAAAGTTTGGACCTCTAGGTTGTGAGAGAATTGATTAATTGGAAATATCTGCTGTAGTCATTGGGCATGTTTGGGAACCTACAGAGAGTAAGCACTTCTCCCATATTTCTG
GGCTCATATGGCTCCGCTGGTTTCATCTTAGACTTTCTTTTATTTAGTTGACAGGCATATGTGCAGGGTTTTAACTATGGTTAAGTAACGGTTCATGCTGTTTCATCTAGGAAGCATGAATCCAAGGTAAGCATGAACGAGTGGGTTTTGATTATACTCCACAATCTTAACCCTGTAGAATGAATTTTGACAATAGCTCC
AGTTTATTGACCTGTTGTAAGTGCTGCAAGGTAATTCACCAGTTACTGAATTCATTGGAGGAACTTCAGCTTTATAGATGTCATATTGGATTGAATAGGGTCATTTTATACTTTTAATCTGTAATTCTTGTTTGGTCTCTGTCAATATAAGATTCTTTTCTAATCACGTTTTCTTATGTTATCCTTAAGAACTAAGTTCT
GCACCAACATTAGTTATGTAAAATGCAACTATGCGATAATGGAGAGGAAAAACAGCAAAAAACTTGCTCATGCTTGGGACCTCAGCCCAACACCCATAAGTTGGTTCTCTCAGGTGCTTCTGATGATTAAATCCTTGCGATACTTTTCAGCAAGTTGTTTTTAGGGTGATACTTTTCAGCAAGTTGTTTTTAGGGTTATG
CTTATTGCAGCCTTTTAAACTAGAATTATTGTGGGACTAACCACAATTGCTGGGCATGTTTGTGATTCACCAAATAATATAGTGGTGTCCGTGTAACTATGCTCATCGATCTTGCACTGCCAGGGTTGTCTTGACTCTTTGAATGCTTATATTTGTAATTTTGCCTCTGGTATACGTAATGTTTTTATAGATGAAAGCAA
ATGAAAGGCAAAGGAATCCTTTCTAACAAAAAAGAGAAATTCCTCTAGAATATGCGGAAATTGGCACAATGTTGTAATAGTTGGCAATTAAAATGCATATTCCATATCGGGCTGCTAATAAATCTTAAAGGTGGCCTTTATTGACATGTCATTGTAGCGGTTC